第三章 多聚核苷酸与核酸

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生物化学第三章核酸PPT课件

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DNA与RNA结构差异
五碳糖不同
DNA中的五碳糖是脱氧核糖,而 RNA中的五碳糖是核糖。
碱基不同
DNA中的碱基包括腺嘌呤(A) 、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T) 和胞嘧啶(C),而RNA中的碱 基包括腺嘌呤(A)、鸟嘌呤( G)、尿嘧啶(U)和胞嘧啶(C
)。
空间结构不同
DNA通常是双链结构,而RNA 通常是单链结构。
核酸药物设计思路及前景展望
核酸药物设计思路
核酸药物是一类以核酸为靶点的药物,通过 特异性地与核酸结合,调节基因表达或抑制 病原体复制,从而达到治疗疾病的目的。设 计核酸药物时需要考虑靶点选择、药物稳定 性、特异性、安全性等因素。
前景展望
随着基因组学和生物信息学的发展,越来越 多的疾病相关基因和靶点被发现,为核酸药 物的研发提供了广阔的空间。未来,核酸药 物有望在肿瘤、遗传性疾病、病毒感染等领 域发挥重要作用,成为一类重要的治疗药物 。同时,随着技术的不断进步和成本的降低 ,核酸药物的研发和应用将更加普及和便捷
DNA拓扑异构酶的作用
拓扑异构酶能够改变DNA的超螺旋状态,从而调节DNA的拓扑结构和功能。拓扑异构酶 在DNA复制、转录、修复和重组等过程中发挥重要作用。
RNA结构与性质
03
tRNA三叶草结构特点
01
02
03
三叶草二级结构
由DHU环、反密码环、 TΨC环、额外环和可接受 茎组成,形似三叶草。
反密码环
人类基因组计划与意义
1 2 3
人类基因组计划的目标
破译人类全部遗传信息,解读人类基因组所蕴含 的生命奥秘。
研究成果及应用
揭示了人类基因组的组成、结构和功能,为医学 、生物技术和制药等领域提供了重要的科学基础 。

核酸基础

核酸基础

§3-2
核酸的结构
第三章 核酸
一、核酸是通过3′,5′磷酸二酯键的多聚体,它的基本单位是核苷酸.
化学组成:核酸→核苷酸→磷酸+戊糖+含氮碱
NH2 N N P OH2 C O N
NH2 N N N N H
碱基
N
OH
H
核苷酸
HOH2C
O
OH
H3PO4
磷酸 核 酸
OH
H
戊糖
第三章 核酸
1. 含氮碱:
N N H
磷含量及紫外吸收值然后算出摩尔磷吸光系数。
(P)=A/cL
=30.98A/WL 一般天然DNA的(P)为6600,RNA为7700~7800。由于 单链核苷酸的(P)比双链的要高,所以核酸发生变性时, (P)升高,故称增色效应;复性时(P)降低,称为减色 效应。
四、核酸的变性、复性与杂交
拖尾序列和尾巴
帽子 前导序列 编码序列 拖尾序列
尾巴
蛋白质
5′—端有帽子,其结构如图
A-A-A-A-A-A-AA ……
功能:保护作用,参与蛋白质合成起始
3′—端有尾巴(多聚A200左右个核苷酸)是转录后在经poly(A)聚合酶作用添加上 去的。 功能:保护作用;
O HN H2 N N
CH3 N+ O N O CH2O P OH OH OH O O P OH O O P OH O P OH2 C 碱基 O
、稀有碱基
见表13-2(解释)
HOH2C
O
OH
HOH2C
O
OH
OH
OH
OH
H
—D—核糖
—D—脱氧核糖
第三章 核酸
3.核苷酸

第三章核酸的化学

第三章核酸的化学
胸腺嘧啶(T) 尿嘧啶(U)
DNA特有
RNA特有
O
O
C
C
HN C CH3 HN CH
C CH ON
C CH ON
H
H
3、磷酸:DNA、RNA均有
HO OH
RNA(AMP)
HO OH
H
DNA(dAMP)
两类核酸的基本化学组成比较
组成成分 DNA
腺嘌呤(A) 嘌呤碱 鸟嘌呤(G)
碱基
嘧啶碱
胞嘧啶 (C) 胸腺嘧啶(T)
NH2
N
N
~ ~ O
O- P O-
O O- P
O-
O O- P
O-
NN OCH2 O
HH
H
H
OH OH 三磷酸腺苷 (ATP)
AMP ADP
ATP
1、腺苷三磷酸(ATP)
▪ 主要功能: 提供能量
能量储存
AMP
能量释放
能量储存
ADP
能量释放
AMP ADP ATP
ATP
2、环苷酸
▪ 主要功能:细胞内信号传导过程中的重 要信息分子。
➢ 1952年,Hershey和Chase利用病毒完成更有说服力的“噬菌体” 实验。
➢ 1953年J.D.Watson和F.Crick提出DNA的双螺旋结构,20世纪自 然科学最伟大的成就之一。
1990年 美国启动人类基因组计划(HGP)
一、核酸的发现和研究简史
➢ 1953年J.D.Watson和F.Crick提出DNA的双螺旋结 构,20世纪自然科学最伟大的成就之一。
RNA:NTP
三磷酸腺苷酸ATP 三磷酸鸟苷酸 GTP 三磷酸胞苷酸 CTP 三磷酸尿苷酸 UTP

第三章 核酸化学

第三章  核酸化学


rRNA的功能 参与组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所。

思考题:


体内有哪些重要的核苷酸?各有何作用?
DNA和RNA在化学组成、分子结构和生理功能有何异同? 利用核酸的理化性质在临床实践中有何应用?
N O O
-

NH2 N N OCH2
-
O O
-
O O
-
N H H
P O
-
P O
-
P O
O
H H
OH OH 三磷酸腺苷 (AT P )

多磷酸核苷酸
5′-磷酯键
N N O -O O O O O
NH 2
N
N

P O-

P O-

P O-
O
CH 2 H H OH
O H H H
脱氧腺嘌呤核苷 脱氧腺嘌呤一磷酸 (dAMP) 脱氧腺嘌呤二磷酸 (dADP) 脱氧腺嘌呤三磷酸 (dATP)


NH

核苷
N N
2 N 9 N
糖苷键
CH O H O 2 1'
H H OH H 2' O H H
嘌呤N-9或嘧啶N-1与核糖C-1通过β-N-糖苷 键相连形成核苷。

核苷酸(ribonucleotide)
NH2
酯键
O
N N O
N
9 N
糖苷键
HO P O CH 2 O
-
H
H
OH
' 1 H H 2'
* tRNA的二级结构
——三叶草形
氨基酸臂 DHU环 反密码环
额外环

生物化学第三章核酸

生物化学第三章核酸

第三节 RNA的结构与功能
Structure and Function of RNA
• DNA和RNA的区别
不同点 戊糖 碱基 二级结构 碱基互补配对 种类 RNA 核糖 G C A U 单链 忠实性较低 多 (mRNA,rRNA, tRNA 等) DNA 脱氧核糖 G C A T 双链 忠实性高 少

碱基互补配对: 腺嘌呤/胸腺嘧啶(A-T)
4.双螺旋表面存在大沟和小沟
小沟
大沟
(二) DNA二级结构的多样性
• 三种DNA构型的比较
螺距 旋向 (nm) 每圈碱 基数 螺旋直径 (nm) 骨架 走行
存在条件
A型 右手 B型 右手
2.3 3.54
11 10.5
2.5 2.4
平滑 平滑
体外脱水 生理条件
(二)碱基
碱基(base)是含氮的杂环化合物。
腺嘌呤
嘌呤 碱基 嘧啶 鸟嘌呤 存在于DNA和RNA中
胞嘧啶
尿嘧啶 胸腺嘧啶 仅存在于RNA中 仅存在于DNA中
NH2
嘌呤(purine,Pu)
N 7 8 9 NH
N
N
NH
5 4
6 3 N
1N 2
腺嘌呤(adenine, A)
O N
N
NH
NH
鸟嘌呤(guanine, G)
(二) 原核生物DNA的环状超螺旋结构
原核生物DNA多为环状,以负超螺旋的形 式存在,平均每200碱基就有一个超螺旋形成。
DNA超螺旋结构的电镜图象
(三) DNA在真核生物细胞核内的组装
真核生物染色体由DNA和蛋白质构成
基本单位是核小体
DNA染色质呈现出的串珠样结构。 染色质的基本单位是核小体(nucleosome)。

多聚核苷酸与核酸

多聚核苷酸与核酸

负超螺旋(negative supercoil)
P
P
OH 3
5 pApCpTpGpCpT-OH 3
5 A C T G C T 3
(四)核酸分为核糖核酸和脱氧核糖核酸
脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid, DNA)
存在于细胞核和线粒体,携带遗传信息,并通 过复制传递给下一代。
核糖核酸(ribonucleic acid, RNA)分布于细胞
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
(4)两条链间存在碱基互补:A与T或G与C配 对形成氢键,称为碱基互补原则(A与T为两个 氢键,G与C为三个氢键); 一条链的核苷酸序列可以决定另一条互补链的 核苷酸序列。
(5)螺旋的稳定因素为: 氢键和碱基堆积力; 两条互补链间碱基对形成氢键,横向稳定。 相邻的两个碱基对在旋转过程中会彼此重叠, 产生具有疏水性的碱基堆积力,维持纵向稳定。 对双螺旋结构稳定更为重要。
1951年发现了DNA晶体的X线衍射图谱中存在两 种周期性反射,证明DNA是一种螺旋构象。
Watson和Crick综合对DNA的知识,提出DNA双 螺旋结构模型
(二) B型双螺旋DNA的结构特点:
(1)两条链反向平行,绕同一轴相互缠 绕成右手螺旋; (2)磷酸和戊糖交替处于螺旋外围,碱 基处于内部,形成碱基对; (3) 双螺旋的直径为2nm, 螺距为3.4nm; 每个螺旋有10.5个碱基对,每两个碱 基对间相对旋转角度为36°
(一)3, 5-磷酸二酯键是核酸的基本结构键
一分子的核苷酸 的 3′- 位羟基与 另一分子核苷 酸的 5′- 位磷酸 基通过脱水可 形成3′,5′-磷酸 二酯键,从而 将两分子核苷 酸连接起来。
(二)多聚核苷酸 链有方向性

生物化学与分子生物学第二版(贾弘禔)名词解释与课后题总结

生物化学与分子生物学第二版(贾弘禔)名词解释与课后题总结

可利用氨基酸理化特性对其进行定性定量分析 2 氨基酸 氨基酸具有两性离子特征,氨基酸具有特征性的滴定曲线 氨基酸的氨基和羧基可发生多种化学反应,包括肽反应和形成 schiff 碱。 利用其理化性质进行定性定量反应的方法 氨基酸与茚三酮试剂发生呈色反应 氨基酸与 2,4-二硝基氟苯反应生成二硝基苯基氨基酸 氨基酸与亚硝酸反应生成氮气 含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质 薄层层析是鉴定氨基酸及其修饰的经典方法 此外,含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质,色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在 280 nm 附 近。 核苷酸:核苷酸的紫外吸收特征可用于其定性定量分析 嘌呤碱和嘧啶碱共轭双键最大吸收 峰值 260nm 核苷酸的解离特征可用于其分离纯化 核苷酸分子在特定溶液中各基团的解离常数(pK)和等电点(pI)均为特征性常数,这些特 性赋予核苷酸以层析和电泳行为的差异,因此被广泛用于核苷酸的分离和纯化。例如,薄层 层析、离子交换层析、毛细管电泳等技术都可用于分离和纯化核苷酸。
除了 mRNAtRNArRNA 外,细胞内存在的许多其他种类的小分子 RNA ,统称为非信使小 RNA(small non-messenger RNAs, snmRNAs)。 简答 1 双螺旋结构 DNA 是反向平行、右手螺旋的双链结构 两条多聚核苷酸链相互平行但走向相反,围绕着同一个螺旋轴形成右手双螺旋结构 由脱氧核糖和磷酸基团构成的亲水性骨架(backbone)位于双螺旋结构的外侧,而疏水的碱 基位于内侧。 直径为 2 nm,螺距为 3.4 nm 从外观上看, DNA 双螺旋结构的表面存在一个大沟 (major groove) 和一个小沟 (minor groove) DNA 双链之间具有碱基互补关系 碱基垂直螺旋轴居双螺旋内側,与对側碱基形成氢键配对(互补配对形式: ) 相邻碱基平面距离 0.34nm,螺旋一圈螺距 3.4nm,一圈 10 对碱基 疏水作用力和氢键维系 DNA 双螺旋结构的稳定 相邻的两个碱基对平面在旋进过程中发生相互重叠(overlapping) ,由此产生了疏水性的碱 基堆积力(base stacking interaction) 。 这种碱基堆积力和互补碱基对的氢键共同维系着 DNA 双螺旋结构的稳定,并且碱基堆积力 在双螺旋结构的稳定中起着更为重要的作用。 科学依据:1952 年,奥地利裔美国生物化学家查伽夫(E.chargaff,1905— )测定了 DNA 中 4 种碱基的含量,发现其中腺膘呤与胸腺嘧啶的数量相等,鸟膘呤与胞嘧啶的数量相等。 这使沃森、 克里克立即想到 4 种碱基之间存在着两两对应的关系, 形成了腺膘呤与胸腺嘧啶 配对、鸟膘呤与胞嘧啶配对的概念。 1953 年 2 月,沃森、克里克通过维尔金斯看到了富兰 克琳在 1951 年 11 月拍摄的一张十分漂亮的 DNA 晶体 X 射线衍射照片,这一下激发了他们 的灵感。他们不仅确认了 DNA 一定是螺旋结构,而且分析得出了螺旋参数。他们采用了富 兰克琳和威尔金斯的判断,并加以补充:磷酸根在螺旋的外侧构成两条多核苷酸链的骨架, 方向相反;碱基在螺旋内侧,两两对应 X-射线衍射图 2 tRNA 结构特点:P55 3 嘌呤和嘧啶含有共轭双键,在紫外波段有吸收。不同的原因是一般 DNA 是双链,RNA 是 单链。 第四章 糖与复合糖 名解 单糖是不能被分解成更小分子的糖,如葡萄糖(glucose) 、果糖(fructose)和核糖(ribose)等 由 2~10 个单糖以葡糖苷键连接而成的糖称为寡糖 由 10 个以上单糖通过糖苷键连接而成的线性或分支聚合物称为多糖 糖蛋白聚糖结构的不均一性称为糖形(glycoform) 聚糖中的 N-乙酰葡糖胺与多肽链中天冬酰胺残基的酰胺氮以共价键连接,形成 N-连接糖蛋 白 N-连接糖蛋白中 Asn-X-Ser/Thr 三个氨基酸残基组成的序列段称为糖基化位点。 聚糖中的 N-乙酰半乳糖胺与多肽链的丝/苏氨酸残基的羟基以共价键相连而形成 O-连接糖 蛋白。 糖胺聚糖链共价结合的蛋白质称为核心蛋白。 简答 1 聚糖中的 N-乙酰葡糖胺与多肽链中天冬酰胺残基的酰胺氮以共价键连接,形成 N-连 接糖蛋白。N-连接聚糖结构有高甘露糖型、复杂型和杂合型 N-连接聚糖是在内质网上以长 萜醇作为聚糖载体,先合成含 14 个糖基的聚糖链,然后转移至肽链的糖基化位点上,进一 步在内质网和高尔基体进行加工而成。 每一步加工都由特异的糖基转移酶催化完成,糖基必须活化为 UDP 或 UDP 的衍生物。 2 丝/苏氨酸残基的羟基,O-连接聚糖常由 N-乙酰半乳糖胺与半乳糖构成核心二糖,核心二

第3章 多聚核苷酸与核酸

第3章 多聚核苷酸与核酸

大沟与小沟
目录
大沟与小沟
目录
3. 疏水作用力和氢键共同维系着DNA 双螺旋结构的稳定。
➢ 互补碱基对的氢键维系DNA横向结构的稳定。
➢相邻两个碱基对互相重叠产生的疏水作用, 称为碱基堆积力(base stacking interaction)。 维系DNA纵向结构的稳定
目录
目录
碱基堆积作用力
3´端
目录
核酸的一级结构: 核酸中核苷酸的排 列顺序
核苷酸间的差异主要是 碱基不同,也称为碱基 排列顺序。即碱基序列。
目录
书写方法
AGT GCT 5 P P P P P P OH 3
5 pApCpTpGpCpT-OH 3 5 A C T G C T 3
目录
核酸分子大小表示法:
单链DNA或RNA: 碱基数目, base, kilobase. 双链DNA或RNA: 碱基对数目, base pair (bp)
目录
(二)DNA双螺旋结构的多样性
目录
B型DNA: Watson和Crick, 右手螺旋(1953年) A型DNA: Wilkins (1953年) Z型DNA: Rich等, 左手螺旋,(1979年)
目录
三种DNA构型的比较
旋向 螺距 碱基数 螺旋直径 (nm) (每圈) (nm)
骨架 走行
第六章
多聚核苷酸和核酸
Polynucleotides and Nucleic Acids
目录
1953年:Watson和Crick提出DNA双螺旋结构模型 (1962年获诺贝尔奖),分子生物学时期的标志。
目录
多聚核苷酸(Polynucleotides)
多聚核苷酸是核苷酸通过3,5-磷酸二酯 键连接的聚合物,是核酸分子中的基本形式。
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二、DNA在二级结构基础上形成超螺旋结构
(一)超螺旋结构具有不同的拓扑异构体
DNA在双螺旋结构基础上通过盘绕 和折叠所形成的空间构象称为三级结构。
松弛态DNA(relaxed DNA) 在溶液中是以能量最低的状态存在的线性
DNA 。
超螺旋结构(superhelix 或supercoil) 将DNA的两端固定,使之旋进过分或旋进
其中B型与Watson-Crick提出的模型一致,是在相 对湿度92%下得到的,这是DNA双螺旋在水性环境 和生理条件下最稳定结构。
A和C型在相对低湿度的条件下形成,它们的螺距 都比B型要短。沟槽、旋转角度等都有变化。
右手螺旋。
Z型DNA首先在富含GC的DNA短片段中发现,后来证 明天然DNA中也有,它是一种左旋螺旋,在细胞中 可能有助解链和调控基因表达的作用。
A
由于核苷酸间
的差异主要是碱基
不同,所以也称为
G
碱基序列。 3端
• DNA 分 子 主 要 由 dAMP 、 dGMP 、 dCMP 和
dTMP 四 种 脱 氧 核 糖 核 苷 酸 所 组 成 。 DNA 的一级结构就是指DNA分子中脱氧核糖 核苷酸的排列顺序及连接方式。

• RNA分子主要由AMP,GMP,CMP,UMP四 种核糖核苷酸组成。RNA的一级结构就 是指RNA分子中核糖核苷酸的排列顺序 及连接方式。
(一)3, 5-磷酸二酯键是核酸的基本结构键
• 一分子的核苷
酸 的 3′- 位 羟 基
与另一分子核
苷 酸 的 5′- 位 磷
酸基通过脱水
可形成3′,5′-磷
酸二酯键,从 而将两分子核 苷酸连接起来。
(二)多聚核苷酸 5端 链有方向性
C
A G 3端
(三)书写方法
AGT GCT 5 P P P P P P OH 3
第三章
多聚核苷酸与核酸
Polynucleotides AND Nucleic Acids
第一节 多聚核苷酸
Polynucleotides
一、多聚核苷酸就是核苷酸的多聚物
多个核苷酸(nucleitide)通过3,5磷酸二酯键(phosphodiester bond)连接、 形成的链状聚合物,即多聚核苷酸 (polynucleotides)
第二节
DNA的结构和功能
Structure and Function of DNA
一、 DNA的二级结构是右手双螺旋
(一)DNA双螺旋结构的研究背景:
夏尔加夫(Chargaff,Erwin) 奥地利-美国生 物化学家。 四十年代后期,夏尔加夫是定量 确定存在于核酸分子中的各种氮碱的科学家之 一。 他采用纸层析法和紫外法仔细分析了DNA的组 成成分,对各种核酸分子进行广泛的试验。 发现通常每种核酸分子里腺嘌呤的数目同胸腺 嘧啶的数目相等;鸟嘌呤的数目则和胞嘧啶的 数目相等。 这一发现对克里克和沃森建立沃森-克里克DNA 结构模型是非常有益的 。
• 1950~1953,夏尔加夫(Chargaff,Erwin) 研究小组对DNA的化学组成进行了研究,发 现:
① DNA碱基组成有物种差异,且物种亲缘关 系越远,差异越大;
② 相同物种,不同组织器官中DNA碱基组成 相同,而且不因年龄、环境及营养而改变;
③ DNA分子中四种碱基的摩尔百分比具有一 定的规律性,即A=T、G=C、A+G=T+C。这一 规 律 被 称 为 Chargaff 原 则 或 叫 碱 基 组 成 规 律。
(3) 双螺旋的直径为2nm, 螺距为3.4nm; 每个螺旋有10.5个碱基对,每两个碱
基对间相对旋转角度为36°
(4)两条链间存在碱基互补:A与T或G与C 配对形成氢键,称为碱基互补原则(A与T为 两个氢键,G与C为三个氢键);一条链的核 苷酸序列可以决定另一条互补链的核苷酸序 列。
(5)螺旋的稳定因素为: 氢键和碱基堆积力;
两条互补链间碱基对形成氢键,横向稳定。 相邻的两个碱基对在旋转过程中会彼此重叠, 产生具有疏水性的碱基堆积力,维持纵向稳 定。对双螺旋结构稳定更为重要。
Watson-Crick的DNA双螺旋
B型双螺旋DNA的结构特征
碱 基 配 对 及 氢 键 形 成
(三)DNA构象有多态性
DNA双螺旋分子的钠盐结晶结构一共发现了三种, 分别 命名为A、B和C型。
不足,DNA双链上就会产生额外的张力而发 生扭曲,以抵消张力。这种扭曲称为DNA双 链的超螺旋结构。
负超螺旋(negative supercoil) DNA双螺旋为右旋螺旋。自然界中闭合双链 DNA,即细胞中的环状DNA,一般呈负超螺旋。 由于右旋螺旋不足,导致部分碱基不形成配 对。 在拓扑异构酶的作用下,分子通过整体拓扑 学上的右旋来补足右旋螺旋的不足。旋进过 分的方向与DNA双链的螺旋方向相反
核、细胞质、线粒体。是DNA转录的产物,参 与遗传信息的复制与表达。某些病毒RNA也可
作为遗传信息的载体
二、多聚核苷酸链在细胞内通过复制和 转录而合成
生物体内的DNA链或RNA链的合成是 在包括DNA聚合酶或RNA聚合酶在内的一 组酶共同参与下完成的。这个合成过程以 dNTP或NTP为原料,以单链DNA链为模 板,逐步地完成从5-末端到3-末端的合成。
5 pApCpTpGpCpT-OH 3 5 A C T G C T 3
(四)核酸分为核糖核酸和脱氧核糖核酸
脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid, DNA)
存在于细胞核和线粒体,携带遗传信息,并通 过复制传递给下一代。
核糖核酸(ribonucleic acid, RNA)分布于细胞
三、多聚核苷酸链可在体外经多种方式合成
(一)DNA聚合酶链反应是当前获得DNA 片段最常用技术 (二)单链寡脱氧核糖核苷酸链可利用亚磷 酰胺三酯方法合成 (三)核糖核苷酸链可利用体外转录体系合 成
四、核苷酸的排列顺序就是多聚核苷酸
链的一级结构
5端
C
多聚核苷酸链的核
苷酸从5-末端到3-
末端的排列顺序。
• 1951年发现了DNA晶体的X线衍射图谱中存 在两种周期性反射,证明DNA是一种螺旋构 象。
• Watson和Crick综合对DNA的知识,提出DNA
双螺旋结构模型
(二) B型双螺旋Dห้องสมุดไป่ตู้A的结构特点:
(1)两条链反向平行,绕同一轴相互缠 绕成右手螺旋; (2)磷酸和戊糖交替处于螺旋外围,碱 基处于内部,形成碱基对;
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