UniProt数据库检索方法及其应用

实用生物信息技术课程第2次作业

UniProt数据库检索方法及其应用

姓名________ 学号______________ 组号_____ 座位号_____

________年___月___日

1.UniProt蛋白质序列数据库由哪几部分组成？各有什么特点？

2.认真阅读UniProt数据库SwissProt和TrEMBL统计报表（Release Statistics）

1)列表说明这两个子库的总数据量，以及不同蛋白质证据（Protein Existence）的数据

条目数。

2)列表说明这两个子库中数据条目数列前10位的物种。

3)说明这两个子库中序列长度分布特征。

3.以人血红蛋白alpha亚基（HBA_HUMAN）为例，说明SwissProt注释信息主要包括哪几

部分

4.以人血红蛋白alpha亚基（HBA_HUMAN）为例，说明SwissProt一般注释信息（General

Annotation）主要包括哪些内容。

5.以人血红蛋白alpha亚基（HBA_HUMAN）为例，说明SwissProt序列注释信息（Sequence

Annotation）主要包括哪些内容。

6.以人血红蛋白alpha亚基（HBA_HUMAN）为例，说明SwissProt数据库交叉链接（Cross

Reference）主要包括哪些数据库。

7.简述如何利用高级检索（Advanced Search）功能，从SwissProt数据库中检索人珠蛋白

家族12个亚基，进行多序列比对，说明其序列相似性异同。

8.简述如何利用高级检索（Advanced Search）功能，从SwissProt数据库中检索你课题相

关蛋白质家族，进行多序列比对，说明其序列相似性异同。

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