结直肠癌全基因组关联分析研究进展_张艳
全基因组关联分析在消化系肿瘤中的研究进展
全基因组关联分析在消化系肿瘤中的研究进展马进;陈云昭;李锋【期刊名称】《世界华人消化杂志》【年(卷),期】2011(19)33【摘要】全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是应用人类基因组中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为标记进行分析,以期发现影响复杂性疾病发生的遗传特征的一种新策略.因其可在全基因组范围内进行整体研究,能够一次性对疾病与基因的关联进行轮廓性概览,所以在过去的5年中,全基因组关联研究方法已被证明是研究复杂疾病一种有效手段.近年,各国科学家运用全基因组关联分析在人类肿瘤,特别是在消化系肿瘤的研究中取得了一系列重要的研究成果,本文将综述消化系肿瘤GWAS研究进展,并展望GWAS所面临的挑战及可能的解决策略.【总页数】9页(P3432-3440)【关键词】全基因组关联分析;食管癌;胃癌;结直肠癌【作者】马进;陈云昭;李锋【作者单位】新疆地方与民族高发病教育部重点实验室/石河子大学医学院病理教研室【正文语种】中文【中图分类】R735【相关文献】1.全基因组关联分析在消化道肿瘤中的研究进展 [J], 管延蒙;陈锦飞2.全基因组关联分析在畜禽重要经济性状中的研究进展 [J], 乔贤;王志新;赵艳红;何利兵;李金泉;苏蕊;张磊;李晓凯;范一星;马宇浩;张燕军;刘志红;王瑞军;王志英3.羊经济性状全基因组关联分析与基因组育种的研究进展 [J], 王俊杰;赵勇;闵令江;雷初朝;沈伟4.全基因组关联分析在德国牧羊犬髋关节发育不良中的研究进展 [J], 余盼;魏荣兴;赵勤涛;张建华;叶俊华;5.全基因组关联分析(GWAS)技术在家犬中的应用研究进展 [J], 万九生;李静;陈超;邓卫东;岳锐;徐虎;黎立光因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
全基因组测序在肿瘤领域的应用现状与未来趋势
全基因组测序在肿瘤领域的应用现状与未来趋势
佚名
【期刊名称】《中国肿瘤临床》
【年(卷),期】2024(51)1
【摘要】数十年间,传统肿瘤治疗手段均是“一刀切”,而忽视了驱动肿瘤发生发展的基因变异。
1990年发起的“人类基因组计划”,以及新一代测序技术的出现,加速了癌症基因组学的发展。
癌症基因组图谱(TCGA)计划于2005年提出,标志着癌症基因组测序工作的开始。
预计到2030年,进行基因组测序的肿瘤患者数量可达到上亿。
在肿瘤领域,临床中的基因组测序目前是利用外显子组进行测序,但外显子仅占人类基因组的1.2%。
【总页数】1页(P26-26)
【正文语种】中文
【中图分类】R73
【相关文献】
1.微生物全基因组测序在预防医学领域的应用
2.山羊内源性鼻内肿瘤病毒enENTV-FJ1株全基因组测序及生物信息学分析
3.我国首次完成牧草领域第一个全基因组测序
4.基于限制性内切酶的简化基因组测序在家禽基因组研究中的应用现状
5.全基因组重测序在畜禽研究领域的应用进展
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
循环肿瘤细胞对结直肠癌预后的相关性研究
循环肿瘤细胞对结直肠癌预后的相关性研究张艳红;段春芳;谢凭【摘要】目的研究分析肥大细胞三种亚型对结直肠癌预后可能产生的影响,从而发现肥大细胞对结直肠癌预后的影响因素,为临床指导治疗提供理论依据.方法选择2011年资料完整的结直肠癌根治术后石蜡标本40例作为试验组,术前未放疗或化疗;另取20例正常大肠组织,作为对照组,采用双重免疫组化技术对试验组做连续切片进行染色,观察2组中各亚型构成比是否有差异.计算出40例结直肠癌患者切片中各亚型的总平均计数值,与试验组每张切片相对应的平均计数值进行比较,观察肥大细胞各亚型的数量与性别、癌的分化程度、癌的浸润深度、淋巴结转移及生存时间的关系,并总结肥大细胞三种亚型与结直肠癌之间的关系.结果 TIM在结直肠癌根治术后石蜡标本有不同程度的浸润,2组的在结直肠癌的N分期和TNM分期及肿瘤分化程度方面差异有统计学意义(P<0.05).高计数组和低计数组5年总生存率和无瘤生存率分别为63.1%、59.3%和82.9%、79.0%,2组比较差异有统计学意义(P<0.05).COX比例风险模型单因素分析结果显示,在肿瘤组织中,肥大细的浸润是对结直肠癌患者总生存时间和无瘤生存时间造成影响的不良因素,后续多因素分析得出,对结直肠癌患者总生存时间、无瘤生存时间而言,浸润肥大细胞为其独立影响因素(P<0.05).结论 TIM与结直肠癌的N分期和TNM分期相关,循环肿瘤细胞可影响结直肠癌患者预后,所以可借助对循环肿瘤细胞的检测,去对结直肠癌患者的生存预后进行预测,提高患者的预后及生存率.%Objective To investigate the effects of three subtypes of mast cells (TIM) on the prognosis of patients with colorectal carcinoma in order to find the influencing factors of mast cells on the prognosis of colorectal cancer,so as to provide theoretical basis for guiding clinical treatment of rectal cancer.Methods The 40specimens of radical resection of colorectal cancer with complete clinical data in 2011 were selected as experimental group,without preoperative radiotherapy or chemotherapy,and the other 20 cases of normal colorectal tissues were served as control group.The differences of subtypes were observed by using double immunohistochemical technique continuous slices staining.The correlation between the numbers of different subtypes of mast cells and patient's sex, differentiation degree of cancer, invasion depth, lymph node metastasis,patient's survival time wasanalyzed,moreover, the correlation between the three subtypes of mast cell and colorectal cancer was investigated.Results The TIM had different degree infiltration in paraffin-embeded specimens after radical resection of colorectal cancer,there were significant differences in N staging and TNM staging of colorectal cancer between two groups (P<0.05).The 5-year total survival rates and tumor-free survival rate in high counting group and low counting group were 63.1%, 59.3% and 82.9%, 79%,respectively,there were significant differences between two groups (P<0.05).The single factor analysis of COX proportional hazards model showed that in tumor tissue, infiltration of mast cells was adverse factors influencing overall survival time and tumor-free survival time of patients with colorectalcancer.Moreover multiple factor analysis showed mast cells infiltration was independent influencing factors on overall survival time and tumor-free survival time of patients with colorectal cancer (P<0.05).Conclusion TIM is closely correlated to N staging and TNM staging of colorectal cancer,and circulating tumor cells can influence the prognosis of patients withcolorectal cancer, therefor, the detection of circulating tumor cells can be used to predict the survival prognosis of patients with colorectal cancer to improve patient's prognosis and survival rate.【期刊名称】《河北医药》【年(卷),期】2017(039)011【总页数】4页(P1634-1637)【关键词】循环肿瘤细胞;结直肠癌;预后;相关性【作者】张艳红;段春芳;谢凭【作者单位】511442 广东省广州市番禺区南村医院;广东省广州市番禺新造医院;511442 广东省广州市番禺区南村医院【正文语种】中文【中图分类】R735.3作为最常见的实体恶性肿瘤，结直肠癌有着较高的发病率和致死率，在恶性肿瘤中，其发病率占据第3位[1,2]，病死率居第5位，在肿瘤间质中，肥大细胞无疑是重要的组成部分，包括MCt和MCtc两种亚型，其能通过c-kit发挥效能，以往已有研究证实肥大细胞与肿瘤性疾病的病理过程密切相关，肿瘤部位能够清晰观察到肥大细胞侵润，因此很多研究认为肥大细胞具有作为肿瘤治疗靶点的潜在价值[3]，但是否与肿瘤患者的预后有关系尚不明确，也鲜见此方面的研究，因此，本研究选择结直肠癌根治术后石蜡标本和正常大肠组织进行了研究分析，报道如下。
结直肠癌Kras、Nras基因突变检测及临床意义
结直肠癌Kras、Nras基因突变检测及临床意义徐利芬【摘要】目的：探究结直肠癌Kras、Nras基因突变检测方法和效率。
方法：选取2013年12月~2015年12月间我院收存的100例结直肠癌标本作为研究对象。
对其分别进行荧光定量PCR检测和Sanger测序检测,对比观察两种方法检测效果。
结果：在本次研究中,基因总体突变率高达80%,而荧光定性PCR检测的准确率为91%,而Sanger检测准确率为96.35%。
两组数据对比差差异具有统计学意义（P 〈0.05）。
结论：在对结直肠癌患者的临床检测中,对Kras和Nras基因突变进行临床检测,可以为临床治疗提供有力的依据,进而可以提升患者的治疗效果。
【期刊名称】《生物技术世界》【年(卷),期】2016(000)004【总页数】1页(P125-125)【关键词】结直肠癌 Kras基因 Nras基因基因突变【作者】徐利芬【作者单位】贵州医科大学附属医院，贵州贵阳550004【正文语种】中文【中图分类】R73随着人们生活质量的不断提升，结直肠癌的机率在逐渐升高。
医学研究人员认为，结直肠癌与Kras基因突变和Nras基因突变之间存在较大的关联，并且在运用靶向药物进行治疗时，传统的治疗方案对于基因突变患者明显的缺乏实效性［1］。
因此，加强对患者两种基因的检测研究，可以为患者的临床治疗提供可靠的依据，现报道如下。
1.1 一般资料选取2013年12月～2015年12月间我院收存的100例结直肠癌标本作为研究对象。
所有患者中，男性47例，女性53例，年龄18～82岁，平均年龄为（44.21±1.81）岁。
纳入标准：（1）经过临床诊断，患者均为结直肠癌患者。
（2）本次研究经过伦理委员会批准，并且患者签署知情同意书。
1.2 方法1.2.1 仪器与试剂的选择选择的检测试剂盒及石蜡标本DNA提取试剂盒均由厦门艾德生物医药科技有限公司生产，荧光定量PCR仪为美国生产。
结直肠癌影像组学研究进展(全文)
结直肠癌影像组学研究进展在中国，结直肠癌是最常见的消化系统肿瘤之一，发病率及死亡率均日益升高。
目前肠镜下活体组织检查是诊断结直肠癌最有效的方式，但存在一定风险，如出血、穿孔等。
目前临床亟须精准、无创的诊断结直肠癌的方法。
传统医学影像学主要观察组织的形态改变。
影像组学能提供图像中肉眼无法识别的深层定量特征，弥补传统影像学方法的不足，为结直肠癌术前分期、制定治疗方案、疗效及预后评估提供依据。
本研究围绕影像组学在结直肠癌中的研究进展进行综述。
1.影像组学的概念及分析流程影像组学指从图像中提取大量多维特征，通过高通量定量分析，应用自动化数据特征化算法，将ROI中的影像学数据转化为具有高分辨率、可发掘的空间数据；其流程包括采集数据、分割图像、提取和选择特征、建立模型和共享数据各阶段。
1.1采集数据获取图像是影像组学研究的基础。
基于CT、MRI、PET/CT可获取大量影像学数据，随扫描方案、参数及后处理方法不同，影像学参数差异较大。
为此北美放射学会（RadiologicalSocietyofNorthAmerica，RSNA）和国家生物医学成像和生物工程研究所提出了定量成像生物标记联盟（QuantitativeImagingBiomarkerAlliance，QIBA），旨在减少图像参数设置对影像组学分析结果的影响。
1.2分割图像分割图像为影像组学研究的关键。
分割图像即将病变组织与正常组织分离。
近年有多种分割算法用于标定肿瘤区域，不同算法的适用范围和条件各不相同。
因此，制定标准化图像分割方法是未来一段时间迫切需要解决的问题。
1.3提取及选择特征提取特征即提取能鉴别正常图像与异常图像的特征信息。
所提取的特征数据大致可分为4组：第1组为肿瘤强度特征，第2组为形状特征，第3组为纹理特征，第4组为小波特征。
为防止过拟合，影像组学提取高维特征后，需采用机器学习或统计学方法删除不稳定特征，保留最主要特征。
选择特征主要采取机器学习理论中的算法，如最小绝对收缩和选择算子（leastabsoluteshrinkageandselectionoperator，LASSO）、递归特征消除（recursivefeatureelimination，RFE）、最小冗余最大相关性（minimumredundancymaximumcorrelation，mRMR）及主成分分析法（principalcomponentanalysis，PCA）等。
直肠癌研究总结范文
一、研究背景直肠癌是一种常见的恶性肿瘤，全球每年新增病例约190万例，发病率居所有癌症第三位。
在我国，直肠癌的发病率逐年上升，已成为严重威胁人类生命健康的重大疾病。
为了提高直肠癌的早期诊断率和治愈率，国内外学者对直肠癌进行了广泛的研究。
二、研究进展1. 早期诊断技术近年来，随着分子生物学、影像学等技术的不断发展，直肠癌的早期诊断技术取得了显著进展。
例如，粪便DNA检测、循环肿瘤DNA检测等分子诊断技术，能够提高直肠癌的早期诊断率。
此外，内镜技术、CT、MRI等影像学检查手段，为直肠癌的早期诊断提供了有力支持。
2. 遗传学研究直肠癌的发生与遗传因素密切相关。
近年来，研究人员通过对结直肠癌相关基因的研究，发现了一些与直肠癌发生、发展和预后相关的基因，如APC、KRAS、TP53等。
这些基因的突变与直肠癌的家族遗传性、肿瘤的侵袭性和预后不良有关。
3. 治疗方法研究直肠癌的治疗方法主要包括手术、化疗、放疗和靶向治疗等。
近年来，靶向治疗在直肠癌治疗中的应用越来越广泛。
例如，针对EGFR、VEGF等信号通路的小分子抑制剂，以及针对KRAS、BRAF等基因突变的抗体药物，均取得了良好的疗效。
4. 综合治疗策略直肠癌的综合治疗策略主要包括术前新辅助化疗、术后辅助化疗、放疗和靶向治疗等。
近年来，针对不同患者的个体化治疗方案逐渐成为研究热点。
例如，根据患者的基因突变情况，选择合适的靶向药物进行治疗；根据肿瘤的分期和患者的整体状况，制定个体化的手术方案等。
三、研究展望1. 遗传学研究未来，直肠癌的遗传学研究将更加深入，有望发现更多与直肠癌发生、发展和预后相关的基因，为直肠癌的早期诊断、治疗和预后评估提供更多依据。
2. 个体化治疗随着分子生物学、生物信息学等技术的不断发展，直肠癌的个体化治疗将更加精准。
通过对患者的基因、肿瘤类型、病理分期等因素的综合分析，制定出更加有效的治疗方案。
3. 药物研发针对直肠癌的新药研发将不断推进，有望开发出更多具有靶向性、低毒性的新型药物，提高直肠癌的治疗效果。
多组学分析思路
多组学分析思路随着组学新技术的不断涌现，加快了组学研究向定量化，高通量的方向发展，通过对多组学数据的整合分析，已成为科学家探索生命机制的新方向。
今天给大家分享一篇今年7月发表在Theranostics （IF:11.6）的文章。
这篇文章整合了基因组学、转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等多组学的数据探究KRAS突变在结直肠癌（CRC）中的分子机制和临床意义。
KRAS突变型结肠直肠癌的综合多组学特征分析背景KRAS是CRC中最常见的突变的致癌基因之一，约40%的CRC 患者存在KRAS激活错义突变。
KRAS基因编码一种GTP/GDP结合蛋白，属于鸟苷三磷酸酶（GTPase）RAS家族，并触发多种磷酸化级联反应。
一旦KRAS突变发生，GTP的水解被破坏，或核苷酸交换增强，导致KRAS在活性状态下的积累，并促进下游信号通路的构成性刺激，从而促进肿瘤细胞的增殖和存活。
越来越明显的是，致癌的KRAS突变介导了肿瘤微环境（TME），特别是通过促进炎症和抑制免疫反应，并最终导致免疫逃避和肿瘤进展。
然而，在具有KRAS突变的CRC中，TME的细胞异质性仍有待研究。
信号网络的复杂性和多个KRAS突变等位基因的异质性特征导致了开发针对KRAS突变体肿瘤的分子靶向治疗的困难。
先前对KRAS突变型癌症的大规模组学研究极大地提高了对KRAS驱动的癌症的分子多样性的理解。
到目前为止，主要的研究都是基于基因组学和转录组学。
值得注意的是，最近的研究已经证明了蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学特征在推进对肿瘤异质性的理解方面的重要性。
在这篇文章中，作者报道了KRAS突变的CRC肿瘤可以根据整合的转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学，分为两种不同的分子亚型。
这两种亚型具有不同的临床特征、生物学途径、拷贝数改变和与KRAS信号激活相关的磷酸化级联反应。
激酶网络分析和药物敏感性预测也揭示了潜在的治疗药物，可能有助于治疗特定的亚型。
结果KRAS突变型与野生型CRC的分子比较KRAS激活信号通路及各节点的相关抑制剂总结如图1A。
结肠癌细胞HCT116中p53的R213突变对靶基因p21表达的影响
结肠癌细胞HCT116中p53的R213突变对靶基因p21表达的影响张妍;张艳君;张业【摘要】目的确定在结肠癌细胞系中, p53的213位精氨酸突变后对其下游靶基因p21表达的影响.方法在p53缺失的结肠癌细胞系HCT116-/-中转染p53的R213位突变的质粒;荧光素酶双报告基因系统检测p53 靶基因启动子活性;EMSA 检测p53与其靶基因p21的结合能力;real-time PCR和Western blot检测p53下游靶基因p21的表达.结果 p53蛋白213位精氨酸突变为赖氨酸后,明显降低了p53靶基因的启动子活性(P<0.05);与靶基因p21启动子的结合能力明显降低(P<0.05);并抑制了p21基因的表达(P<0.05).而213位突变为谷氨酰胺后,迁移率比突变前明显变快.结论在人的结肠癌细胞中,p53蛋白R213位的不同突变对下游靶基因p21有不同的影响,提示存在着不同的调控机制.%Objective To determine impacts of p53 with R213 mutation on the expression of its downstream target gene p21 in HCT116-/-colorectal cancer cell line.Methods Mutations of p53 at R213Q (R/Q) and R213K (R/K) were respectively constructed and transfected into the p53 null HCT116 cells.The promoter activity drived by p53 was detected by dual-luciferase reporter system.EMSA assay was used to detect the ability of p53 binding to the promoter of its target genep21.The expression of p53 downstream target genes p21 was examined by real-time PCR and Western blot experiments.Results The mutation ofR213K disrupted the efficiency of p53 transactivation(P<0.05).The mutants were less efficient in targeting the consensus binding sequences of p53 in the regulatory region of p21 gene(P<0.05), In addition, The R/K mutantattenuated the expression of p21 gene(P<0.05).The mobility of R213Q was increased.Conclusions The different mutations of Arginine 213 have different impact on p21 in colorectal cancer cells.It could exist diverse regulating mechanisms.【期刊名称】《基础医学与临床》【年(卷),期】2017(037)005【总页数】5页(P663-667)【关键词】p53;213位精氨酸;p21;突变【作者】张妍;张艳君;张业【作者单位】首都医科大学附属北京潞河医院中心实验室, 北京 101149;首都医科大学附属北京潞河医院消化内科, 北京 101149;中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室, 北京 100005;中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室, 北京 100005【正文语种】中文【中图分类】Q343.1p53是非常重要的抑癌基因[1]。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
收稿日期：2012-05-31修回日期：2012-11-12基金项目：国家自然科学基金（81172755）；浙江省自然科学基金（D2080011）；中央高校基本科研业务费专项资金资助（2011XZZX004）．作者简介：张艳（1987－），女，硕士研究生，主要从事复杂性疾病的分子流行病学研究．通讯作者：朱益民（1968－），男，博士，教授，博士生导师，从事复杂性疾病的分子流行病学研究；E-mail ：zhuym@zju．edu．cnhttp ：∥www．journals．zju．edu．cn /med DOI ：10．3785/j．issn．1008-9292．2013．03．018结直肠癌全基因组关联分析研究进展张艳1，来茂德2，朱益民1综述（浙江大学医学院1．流行病与卫生统计学系；2．病理学与病理生理学系，浙江杭州310058）［摘要］结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一，其发生发展是环境和遗传因素共同作用的结果，其中遗传因素在结直肠癌的发病中起重要作用。
全基因组关联研究(genome-wide association studies ，GWAS )已发现了一些与结直肠癌相关联的易感位点和区域，这有助于结直肠癌遗传机制的研究。
文中对近几年来结直肠癌全基因组关联分析的研究进展作一综述，分析GWAS 结直肠癌的优点和局限性以及应用前景。
［关键词］多态性，单核苷酸;结直肠肿瘤/遗传学;疾病遗传易感性;基因组［中图分类号］Ｒ735［文献标志码］A ［文章编号］1008-9292（2013）03-0360-07Ｒesearch progress on genome-wide association studies of colorectal cancerZHANG Yan 1，LAI Maode 2，ZHU Yimin 1（1．Department of Epidemiology and Biostatistics ；2．Department of Pathology and pathophysiology ，Zhejiang University School of Medicine ，Hangzhou 310058，China ）［Abstract ］Colorectal cancer （CＲC ），one of the most common malignant tumors ，is caused both by environmental and genetic factors．Genetic factor plays an important role in the pathogenesis of CＲC．Genome-wide association study （GWAS ）is a new tool of genetic research．A series of susceptibility genesand loci of the complex diseases has been identified with GWAS strategy．In this article ，the research progress on GWAS of CＲC is reviewed ，and the advantages and limitations of GWAS study as well as the prospective of its application are discussed．［Key words ］Polymorphism ，single nucleotide ；Colorectal neoplasms /genetics ；Genetic predispositionto disease ；Genome［J Zhejiang Univ （Medical Sci ），2013，42（3）：360-366．］结直肠癌（colorectal cancer ，CＲC ）是最常见的恶性肿瘤之一，全球结直肠癌患病人数估计有280万，每年新增病例超过100万，发病率居于恶性肿瘤第三，死亡率处于第四位［1］。
我国随着饮食结构和生活方式的改变，结直肠癌的发病率和死亡率呈不断上升趋势，2007年结直肠癌的发病率居恶性肿瘤第三位，死亡率居于第五［2］。
结直肠癌已经严重威胁到居民的第42卷第3期2013年浙江大学学报(医学版)JOUＲNAL OF ZHEJIANG UNIVEＲSITY (MEDICAL SCIENCES )Vol 42No 32013健康生活，并成为我国的社会负担。
因此进一步研究结直肠癌的发病机制，降低结直肠癌的死亡率显得尤为重要。
结直肠癌是由环境和遗传因素共同起作用的结果，其中遗传因素在结直肠癌的发病中起重要的作用。
研究发现结直肠癌在一级亲属的发病率是普通人群的2到3倍，基于双生子研究发现，大约35%结直肠癌的发生与遗传易感性有关［3］。
经过多年的研究已发现了许多易感基因，然而，很多潜在的结直肠癌易感基因仍然没有被发现。
近十年来，家系连锁分析已经发现了一些引起孟德尔疾病（如家族性腺瘤性息肉病）的罕见高危基因［4］。
但是，连锁分析的关键是遗传因素完全或几乎完全决定疾病的发生，致病基因具有很高的外显率等。
而结直肠癌作为复杂疾病被认为是受到多种基因的影响，每种基因的效应微弱，因此连锁分析在研究结直肠癌致病基因方面作用有限。
比较大规模病例和对照人群之间某个基因型频率差异的关联研究被认为更适合用来识别复杂疾病（包括结直肠癌）的易感位点。
全基因组关联研究（genome-wide association studies，GWAS）是利用高通量的基因芯片技术，主要对个体中数以百万计的单核苷酸多态性（SNPs）进行检测研究，在全基因组的水平上、在大样本人群中进行病例对照关联分析，发现与疾病相关的阳性位点，然后将此阳性位点在独立的样本中进行验证，从而发现影响复杂性疾病发生的遗传易感变异［5］。
迄今为止，利用GWAS已经发现了一些与结直肠癌相关联的疾病易感位点和区域，为进一步研究结直肠癌的遗传机制，有必要对结直肠癌GWAS研究进展作一综述。
1结直肠癌GWAS现状从2007年开始许多国家对结直肠癌开展了多项GWAS，在结直肠癌遗传学研究方面取得了一定的进展，发现了一些与之相关的易感位点与区域（表1）。
1．1欧美人群的结直肠癌GWAS1．1．1结直肠癌遗传性（colorectal cancer genetics，COGENT）研究COGENT研究小组在英格兰、苏格兰、加拿大人群中通过多中心大规模样本的重复验证，先后发现了11个结直肠癌的易感位点：rs6983267（8q24）［6］、rs10505477（8q24）［7］、rs719725（9p24）［7］、rs4939827（SMAD7）［8，11］、rs4779584（GＲEM1）［9］、rs16892766（EIF3H）［10］、rs10795668（10p14）［10］、rs3802842（11q23）［11］、rs7014346（8q24）［11］、rs1957636（BMP4）［16］、rs4813802（BMP2）［16］。
这些位点效应都较弱，OＲ值大部分在1．10 1．30之间。
为了发现效应更小的易感位点，对英国人群的GWAS数据进行Meta分析，以及病例对照的验证，发现了另外8个新的易感位点：rs10411210（ＲHPN2）、rs4444235（BMP4）、rs961253（BMP2）、rs9929218（CDH1）［12］、rs10936599（3q26．2）、rs11169552（12q13．13）、rs4925386（20q13．33）、rs6691170（1q41）［14］。
然而，这些位点效应更弱，OＲ值在1．10左右。
1．1．2欧洲其他人群研究Lascorz［13］等2010年对德国371家族性结直肠癌病例和1263例对照进行GWAS分析，经过4个独立的病例对照研究验证，新发现了rs12701937（GLI3/ INHBA）在显性模型中与结直肠癌的发病风险存在关联（OＲ=1．14），且此关联在家族性结直肠癌病例中的效应更强（OＲ=1．36）。
另外，GWAS 筛选出的不同位点已成功地在不同欧美人群中得到验证，如rs16892766［17］、rs6983267［18-22］、rs10505477［7］、rs3802842［17，21，23］、rs4444235［24］、rs4779584［21］和rs4939827［18，25］。
1．2亚洲人群的结直肠癌GWAS2011年，Cui［15］等首次报道了在亚洲人群的结直肠癌GWAS结果。
该小组在6q26 q27区域发现了新位点，SLC22A3基因上的rs7758229与远端结肠癌的发病风险存在显著关联（P=7．92ˑ10－9）。
该研究结果提示，在欧洲和亚洲人群之间结直肠的发病机制存在一定的种族差异。
1．3结直肠癌易感位点在非洲黑人人群的重复验证研究结直肠癌的GWAS在非洲人群中尚未进行，但是He［21］等在一个多种人群中对11个GWAS发现的结直肠癌易感位点进行重复验证研究，结果发现，在美国黑人中rs6983267（8q24）和rs961253（20p12）与结直肠癌/腺癌存在显著关联。
·163·第3期张艳，等．结直肠癌全基因组关联分析研究进展表1结直肠癌GWAS 筛选出的SNP 标志Table 1Loci associated with colorectal cancer risk from GWAS发表时间/第一作者SNP 基因/区域样本量（病例/对照）GWAS 整体OＲ（95%CI ）P 值（整体）2007/Tomlinson ［6］rs69832678q24940/9658264/62061．21（1．15 1．27）1．27ˑ10－142007/Zanke ［7］rs105054778q241226/7480/1．18（1．12 1．25）1．41ˑ10－8rs7197259p24123977791．14（1．01 1．21）1．32ˑ10－52007/Broderick ［8］rs493982718q21SMAD 7940/9658413/69491．18（1．12 1．23）1．00ˑ10－122008/Jaeger ［9］rs477958415q31GＲEM 1940/9657922/67411．26（1．19 1．34）4．44ˑ10－142008/Tomlinson ［10］rs168927668q23．3EIF 3H 940/96518831/1．25（1．19 1．32）3．3ˑ10－18rs1079566810p14185401．12（1．10 1．16）2．5ˑ10－132008/Tenesa ［11］rs493982718q21SMAD 7981/100217457/1．20（1．16 1．24）7．77ˑ10－28rs380284211q2316，3531．11（1．08 1．15）5．82ˑ10－10rs70143468q241．19（1．15 1．23）8．60ˑ10－262008/Houlston ［12］rs444423514q22．2BMP 41952/20288/1．11（1．08 1．15）8．1ˑ10－10rs992921816q22．1CDH 11977209711．10（1．06 1．12）1．2ˑ10－8rs1041121019q13．1ＲHPN 21．15（1．10 1．20）4．6ˑ10－9rs96125320p12．3BMP 21．12（1．08 1．16）2．0ˑ10－102010/Lascorz ［13］rs12701937GLI3INHBA 371/12635286/68701．14（1．05 1．23）1．1ˑ10－32010/Houlston ［14］rs66911701q411432/18185/1．06（1．03 1．09）9．55ˑ10－10rs109365993q26．22697201970．93（0．91 0．96）3．39ˑ10－8rs1116955212q13．130．92（0．90 0．95）1．89ˑ10－10rs492538620q13．330．93（0．91 0．95）1．89ˑ10－102011/Cui ［15］rs77582296q26SLC 22A 31583/6167/1．28（1．18 1．39）7．92ˑ10－9189844942011/Tomlinson ［16］rs195763614q22．2BMP 418185/24910/1．08（1．06 1．11）3．93ˑ10－10rs481380220p12．3BMP 220197262751．09（1．06 1．12）4．65ˑ10－11总之，GWAS 发现的与结直肠癌有关的易感位点效应都较弱，OＲ值大部分都在1．10 1．20之间。