基因测序分析仪
基因分析仪测序仪安全操作及保养规程
基因分析仪测序仪安全操作及保养规程随着基因分析的迅速发展，基因分析仪测序仪的使用越来越普遍。
为了确保仪器的可靠性和使用的安全，需遵守标准的操作规程和维护流程。
本文将提供测序仪的安全操作和保养规程的详细介绍，以帮助操作人员更好地保护仪器。
1. 安全操作基因分析仪测序仪使用时，需要遵循以下安全操作规程：1.1 工作环境•仪器使用时应放置在干燥、通风良好的室内环境中，避免阳光直射、潮湿和高温环境。
•要尽量避免在有液体、灰尘和化学物质等危险因素的环境下使用仪器。
•工作台周围不可以杂乱堆放物品，注意保持工作环境的整洁。
1.2 食品饮料•仪器使用者不得在使用仪器时食用或饮用。
•工作台上不得堆放食品或饮料。
1.3 操作规范•只有经过必要的培训和了解仪器操作规程的人员方可进行仪器的操作。
•操作之前应熟悉相关操作手册和注意事项。
•操作人员应穿戴适当的防护用品，包括实验服、口罩、手套等。
1.4 电源•使用前请检查电源是否接地，避免因电流泄漏等危险因素。
•请谨慎使用扩展插头和加长线等配件，避免因电压不稳定等原因导致仪器损坏。
1.5 急救预案•操作人员应熟悉急救预案，特别是电击、火灾等突发事件的预防与处理。
2. 仪器保养为确保基因分析仪测序仪的正常运行和延长仪器的使用寿命，需要进行定期的维护和保养。
以下是仪器保养规程的一些基本内容：2.1 保养周期•仪器的保养周期应按照厂家提供的说明书规定执行。
•通常情况下，仪器的保养周期需要在使用前进行检查，保养周期一般为每周或每月一次。
2.2 清洁•在每次使用后，要进行仪器的清洁，包括外壳、台面、键盘、触屏等。
•清洁可选择使用专业清洁剂或消毒液，避免使用含有腐蚀性和太强的化学物质或粉尘较大的抹布。
2.3 维护•仪器需要每隔一段时间更换零部件，包括滤芯、灯管、风扇等。
•应定期检查机械运转部位的润滑情况，避免过度磨损和磨损。
•在仪器出现故障时，应立即停机，并通过维修人员进行处理和修复。
基因测序仪器的原理和应用
基因测序仪器的原理和应用一、基因测序仪器原理基因测序仪器是一种用于测定DNA或RNA序列的设备，能够对基因组进行高通量的测序，从而揭示生物体的遗传信息。
基因测序仪器的原理主要基于两种方法：链终止法（Sanger法）和高通量测序技术。
1. 链终止法（Sanger法）链终止法是最早被广泛应用的测序方法之一，它利用DNA聚合酶合成互补链的特性进行测序。
链终止法包含以下步骤： - DNA模板的制备：通过PCR扩增或其他技术将目标DNA片段扩增出来，并纯化得到单个DNA模板。
- DNA合成反应：将DNA模板与引物、聚合酶和四种dNTP（脱氧核苷酸三磷酸盐）混合，使聚合酶从引物的3’端开始合成新的DNA链。
- 在反应体系中加入不同的ddNTP（二氧基化脱氧核苷酸三磷酸盐），ddNTP在合成链上停止DNA合成，根据不同的ddNTP分别标记上荧光物质。
- DNA片断电泳分析：将反应产物进行电泳分析，将带有不同荧光标记的DNA片断按大小分离并被记录下来，从而得到一个由A、T、G、C构成的测序结果。
2. 高通量测序技术高通量测序技术是近年来发展起来的一种基因测序方法，主要包括Illumina测序技术和Ion Torrent测序技术。
•Illumina测序技术：该技术通过将DNA模板固定在测序芯片上，并利用荧光标记的核苷酸逐个加入并记录，从而实现高通量测序。
Illumina测序技术具有高准确性、高通量以及低成本的特点，被广泛应用于基因组测序、转录组测序、表观基因组学等领域。
•Ion Torrent测序技术：该技术基于无法循环延伸DNA链的性质，通过检测质子释放来确定合成的DNA序列。
Ion Torrent测序技术具有简单、快速和低成本的特点，适用于小规模测序项目以及快速测序需求。
二、基因测序仪器应用基因测序仪器在许多领域中都有广泛的应用，包括： 1. 生命科学研究：基因测序仪器的应用使得科学家能够深入研究生物体的基因组和表观基因组，揭示基因与表型之间的关系，从而推动了生命科学领域的发展。
基因测序仪器使用说明书
基因测序仪器使用说明书一、前言基因测序仪器是一种用于测定DNA或RNA序列的设备，它在生物科学研究、医学诊断等领域具有重要应用价值。
本使用说明书将详细介绍基因测序仪器的组成、使用方法以及注意事项，以帮助用户正确、安全地操作仪器，获得准确的测序结果。
二、仪器组成1. 主机：基因测序仪器的主要组成部分，包括光学系统、电子系统、激光系统等。
2. 数据分析软件：用于对测序结果进行分析和解读的计算机软件。
3. 数据存储设备：用于存储测序原始数据和分析结果的设备，如硬盘、U盘等。
三、操作步骤1. 准备工作a. 确保基因测序仪器处于水平放置的稳定表面上，有足够的工作空间和通风条件。
b. 检查仪器的供电情况，确保电源线连接牢固且通电正常。
c. 检查仪器内部的耗材和试剂，确保有足够的库存，并检查其有效期。
2. 样本处理a. 根据实验设计，准备待测样本。
b. 提取DNA或RNA，并进行纯化和浓缩处理。
c. 根据实验要求，进行必要的片段扩增、连接和修复。
3. 测序准备a. 根据测序类型选择合适的芯片或测序流程。
b. 准备所需的引物和试剂，并按照说明书中的要求进行稀释和配置。
c. 将样本与引物和试剂按照比例混合，并尽快投入仪器进行测序。
4. 仪器操作a. 打开仪器主机电源，待仪器启动完成后，进入操作界面。
b. 将样本混合液注入仪器芯片中，并按照仪器界面指引进行操作。
c. 在测序过程中，注意仪器显示的实时数据，并根据需要调整相关参数。
5. 数据分析与结果解读a. 测序完成后，将测序结果数据导出到计算机上。
b. 打开数据分析软件，导入测序结果数据。
c. 根据实验目的，选择相应的分析方法，对数据进行处理和解读。
d. 结果解读时，结合实验设计和相关文献，对数据进行合理的解释。
四、注意事项1. 安全操作：在操作过程中，务必佩戴手套和口罩，避免接触样本和试剂。
2. 仪器维护：定期检查仪器的光学系统和电子系统，保持清洁，并按照维护手册进行维护和保养。
全自动dna测序仪的原理和应用
全自动DNA测序仪的原理和应用1. 前言DNA测序技术是现代生物学、医学研究中的重要工具之一。
随着技术的不断进步，全自动DNA测序仪在DNA测序领域占据重要地位。
本文将介绍全自动DNA测序仪的原理和应用。
2. 原理全自动DNA测序仪基于Sanger测序技术，通过离心分离、扩增和合成等步骤来获取DNA序列信息。
其原理主要包括以下几个步骤：2.1 模板制备全自动DNA测序仪需要将待测的DNA样品进行模板制备。
一般采用PCR（聚合酶链式反应）技术来扩增目标DNA片段，以增加其浓度和复制数目。
2.2 扩增产物净化PCR扩增产生的扩增产物中会包含引物和杂质，需要进行净化处理。
常用的方法是利用凝胶电泳分离扩增产物，并使用各类商业化学试剂盒进行提取和净化操作。
2.3 DNA片段测序将净化后的DNA片段进行测序。
全自动DNA测序仪采用Dye-termination测序方法，使用一系列特殊的引物，通过DNA链延伸过程中的不同颜色发光来标记每个碱基。
之后，仪器会通过激光扫描读取每个碱基的发光信号。
2.4 数据分析与测序结果全自动DNA测序仪会生成一系列的发光数据，这些数据需要进行分析和处理。
通常会使用相关软件进行碱基识别、序列拼接和测序结果的校正等步骤，从而获得准确的DNA序列信息。
3. 应用全自动DNA测序仪广泛应用于各个领域，例如：3.1 生物学研究在生物学研究中，全自动DNA测序仪可以用于基因组测序、转录组测序、蛋白质相互作用的研究等。
通过测序获得的DNA序列信息可以帮助研究者了解生物体的遗传信息、功能和相互关系。
3.2 医学领域在医学领域，全自动DNA测序仪可以用于诊断遗传性疾病、癌症等疾病的基因突变。
通过测序可以快速准确地分析患者的基因组信息，从而为临床医生提供准确的诊断和治疗方案。
3.3 农业和食品安全全自动DNA测序仪在农业和食品安全领域也有广泛的应用。
它可以用于鉴定转基因作物、检测食品中的基因改造成分、追溯食品来源，保证食品安全和品质。
基因组测序仪MiSeqDx使用手册说明书
MiSeq TM Dx使用手册MiSeqDx 使用手册文件号1000000039320 v04 | 1 2020年12月Material # 20030132引言本文档及其内容是Illumina，Inc.及其附属公司（“Illumina”）所有，并且仅供与所述产品相关的合同约定的客户使用，无其他用途。
未经Illumina事先书面同意，本文件及其内容不得以其他方式传播、披露或转载和/或用于任何其他目的。
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Illumina, MiSeq TM Dx，南瓜橙颜色和流动底纹设计是Illumina, Inc.和/或其在美国和/或其他国家/地区附属公司的商标。
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MiSeqDx 使用手册文件号1000000039320 v04 | 2 2020年12月Material # 20030132修订历史MiSeqDx 使用手册文件号1000000039320 v04 | 3 2020年12月Material # 20030132目录引言 (2)修订历史 (3)目录 (4)第一章概述 (6)产品名称 (6)预期用途 (6)产品结构及组成 (6)第二章设备安装及环境要求 (14)运输和储存 (14)运输和安装 (14)实验室要求 (15)电气要求 (17)环境要求 (18)网络要求 (18)用户自备耗材和设备 (19)第三章工作原理 (21)工作原理 (21)需要但不提供的设备和材料 (21)第四章性能指标 (22)仪器技术指标 (22)仪器使用期限 (23)产品合规性和监管声明 (23)第五章运行操作 (26)P ART וL OCAL R UN M ANAGER（本地运行管理） (26)本地运行管理 (26)登陆信息管理 (26)操作界面概述 (27)管理设置和任务 (31)工作流程概述 (37)P ART װM I S EQ O PERATING S OFTWARE (M I S EQ操作软件) (41)启动和开机 (41)MiSeqDx 使用手册文件号1000000039320 v04 | 42020年12月Material # 20030132测序运行 (43)结果分析 (54)质量控制 (55)文件夹管理 (55)MOS软件界面图标 (56)第六章局限性和注意事项 (58)使用局限性 (58)警告和注意事项 (58)第七章危害及标志 (60)安全考虑和标志 (60)通用标志 (62)第八章设备维护 (63)维护频率 (63)维护清洗 (63)待机清洗 (65)关机步骤 (67)重启步骤 (68)所需磁盘空间 (68)杀毒软件 (68)第九章故障排除 (69)附件 (78)MiSeqDx 使用手册文件号1000000039320 v04 | 52020年12月Material # 20030132第一章概述产品名称中文名称：基因测序仪英文名称：MiSeq TM Dx Instrument型号：MiSeq TM Dx预期用途用于体外诊断。
geneprecision2000 技术参数
geneprecision2000 技术参数GenePrecision2000 是一款具有先进功能和卓越性能的基因测序仪器。
其准确、高通量的测序能力使其在基因组学研究、生物医学领域和药物开发中发挥着重要作用。
本文将详细介绍 GenePrecision2000 的技术参数。
1. 测序平台GenePrecision2000 基于Illumina测序技术平台，采用碱基读取方法进行测序。
该平台已被广泛应用于全基因组测序、外显子测序、RNA测序、甲基化测序等多个领域。
2. 测序通量GenePrecision2000 具有高通量测序的能力，每次运行可同时测序多个样本，有效节约了时间和成本。
其最大测序通量可达到每天多于500GB，满足大规模测序项目的需求。
3. 读长GenePrecision2000 具有灵活的读长选择，可根据实验需求进行调整。
其最大读长可达到300bp，使其在分析复杂基因组结构和查找DNA重排等方面具备优势。
4. 测序质量GenePrecision2000 的测序质量非常高，具有较低的错误率。
其Phred质量值在Q30以上，即测序准确率超过99.9%。
高质量的测序数据有助于准确解读基因组信息和发现潜在的生物学变异。
5. 数据分析GenePrecision2000 配套的数据分析软件功能强大，可以进行高效的基因组学数据分析。
该软件提供了丰富的分析模块，包括序列比对、变异检测、基因表达分析等，可为用户提供全面的生物信息学解读。
6. 灵敏度和特异性GenePrecision2000 具备高度的灵敏度和特异性。
其能够检测到极低频率的变异位点，帮助发现罕见或低频变异与疾病之间的关联。
同时，由于使用了独特的肽核酸（PNA）技术，GenePrecision2000 可有效减少假阳性结果的产生，提供更可靠的分析结果。
7. 数据存储和共享GenePrecision2000 支持数据存储和共享。
用户可以将测序数据上传至云端或本地服务器进行存储，方便后续的数据管理和回溯。
基因测序仪_实验报告(3篇)
第1篇一、实验目的1. 了解基因测序仪的基本原理和操作流程。
2. 掌握基因测序的基本操作步骤。
3. 熟悉基因测序仪在实际科研中的应用。
二、实验原理基因测序仪是一种用于测定生物体DNA或RNA序列的仪器。
通过分析DNA或RNA分子中的碱基排列顺序，可以了解生物体的遗传信息。
目前，常见的基因测序技术主要有Sanger测序、Illumina测序和纳米孔测序等。
本实验采用Illumina测序技术，该技术具有高通量、高准确度、操作简便等优点。
Illumina测序原理基于Sanger测序技术，通过PCR扩增目的基因，然后将扩增产物进行文库构建，最后利用测序仪对文库进行测序。
三、实验材料与仪器1. 材料：目的基因DNA模板、引物、dNTPs、PCR酶、Illumina测序试剂盒等。
2. 仪器：PCR仪、基因测序仪、凝胶成像系统、移液器、离心机等。
四、实验步骤1. DNA提取：根据实验室常规方法提取目的基因DNA。
2. PCR扩增：设计特异性引物，进行PCR扩增目的基因。
3. 文库构建：将PCR扩增产物进行文库构建，包括末端修复、接头连接、PCR扩增等步骤。
4. 测序：将构建好的文库上机进行测序。
5. 数据分析：利用测序仪自带的分析软件或第三方分析软件对测序数据进行质控、比对、组装等分析。
五、实验结果与分析1. PCR扩增：通过凝胶成像系统观察PCR扩增结果，判断扩增是否成功。
2. 文库构建：通过PCR扩增结果和测序结果判断文库构建是否成功。
3. 测序：通过测序仪自带的分析软件对测序数据进行质控、比对、组装等分析，得到目的基因的序列。
4. 数据分析：将测序结果与参考序列进行比对，分析目的基因的结构和功能。
六、实验讨论1. 影响PCR扩增的因素：引物设计、模板DNA质量、PCR酶活性等。
2. 影响文库构建的因素：末端修复、接头连接、PCR扩增等步骤。
3. 影响测序的因素：测序仪参数设置、测序深度等。
4. 数据分析过程中需要注意的问题：比对准确性、组装质量等。
DNA测序仪的测序原理和操作规程
DNA测序仪的测序原理和操作规程DNA测序仪DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。
自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。
美国pe abi 公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。
本实验介绍的是abi prism 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。
原理abi prism 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法),因此通过单引物pcr测序反应,生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序pcr产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。
由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的ccd(charge-coupled device)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在ccd摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。
分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。
它是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。
pe公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA 测序胶(pop 6)和genescan胶(pop 4)。
这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。
它主要由毛细管电泳装置、macintosh 电脑、彩色打印机和电泳等附件组成。
常用的五种基因测序仪器的比较
四、测序仪之——ROCH-454
SOLID的双碱基编码矩阵
两个碱基共同决定一 个颜色，可以极大的 提高测序的准确率
五轮测序反应反应后，按照第0、1位，第1、2 位... …的顺序把对应于模板序列的颜色信息连起来， 就得到由“0，1，2，3…”组成的SOLiD原始颜色序 列。
2. ABI SOLID的特性
• 无以伦比的通量 目前SOLiD 3系统单次运行能产生50 GB的人基因 组序列数据，相当于基因组的17倍覆盖度，这显 然是其他任一台新一代测序系统都无法达到的
测序仪器 3730XL
所采用测序技术
鸟枪Sanger测 序法 毛细管 电泳技术
校错方法
高通量
主要用于KB～MB 级别的测序
ABI SOLiD 微乳液PCR扩增 双碱基编码
连接酶法测序
技术
最高可达180 GB
优势方面
常规测序， 高准确度
第二代测 序仪中准 确度最高
Solexa GA
桥式PCR技术 合成测序法
加入DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。 每个循环掺入单个碱基。用激光扫描反应板表 面，读取所聚合上去的核苷酸种类。之后，将 这些基团化学切割，恢复3′端粘性，继续聚合第 二个核苷酸。如此继续下去，直到每条模板序 列都完全被聚合为双链。这样，就可以得知每 个模板DNA片段的序列。
桥式PCR
2. Illumina GA的特性
上市时间
2002年 2007年 1月
2007年
2005年 2008年
2月
基因测序仪原理
基因测序仪原理
基因测序仪是一种用于测定DNA序列的仪器，其原理是基于DNA的碱基对特异性配对原则和光信号检测技术。
基因测序仪通常使用Sanger测序方法或者高通量测序方法。
Sanger测序方法是一种基于链终止法的测序技术。
它利用了DNA聚合酶在合成新链时会停止反应的特性。
在Sanger测序中，DNA样品被分为四个反应管，每个反应管中含有一种特定的碱基（脱氧核苷酸，即dA、dC、dT和dG）以及DNA
聚合酶和DNA模板。
DNA聚合酶会在合成新链中遇到与其互补的碱基时停止反应，使反应停在对应的碱基上。
高通量测序方法通常采用Illumina测序技术。
在这种方法中，DNA样品首先经过碱基测序反应，产生含有特定碱基序列的DNA片段。
然后，这些DNA片段被固定到玻片上，并进行DNA桥放大，得到成百上千个DNA桥序列。
接下来，聚合酶会反复在每个DNA桥上合成新链，同时使用荧光标记的脱氧核苷酸，并记录每个合成事件的光强度。
最后，测序仪会根据光信号的不同强度来确定每个位置的碱基。
在测序过程中，测序仪会产生大量的数据，这些数据会通过计算机软件进行分析和整理，最终得到DNA序列信息。
测序结果可以用于研究基因突变、寻找新的基因变异、揭示个体遗传特征等各种应用。
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号、产地、数量、单价及总价
22 提供详细配置清单及分项报价（含名称、规格、型号、数量、单价及总价）
具备
23 提供所需试剂及耗材清单（含名称、规格、型号、数量、单价及总价）
具备
三 技术及售后服务
整机质保期≥3 年（提供厂家保修承诺），在质保期内每年由维修工程师提供至少 2 ★1
次的上门维护保养工作
线电射频识别）技术的耗材
具备
非接触式超声波细胞破碎仪：利用 ACT 超声波样本破碎技术, 核酸样本破碎大小 范围 1kb~ 150bp ，单次可处理 12 个样本，最大体积 12ml。1 台，提供具体品牌、 具备 规格型号、产地、数量、单价及总价
4 时内提供维修方案及报价，24 小时内到达现场，郑州有常驻工程师，提供工程师姓名 具备
及联系方式
5 提供设备附件、耗材及各类配件详细报价清单
具备
6 到货时间：提供合同签订后到货时间
具备
数变异
高数据通量：每次反应可生成 100-120G 亿碱基数据
具备
有两种通量模式的芯片可选，中通量的芯片可产生单端 130M 的 reads，高通量的芯片 具备
可产生 400M 的 reads
芯片扫描功能，可以扫描高通量 SNP 芯片
具备
可扫描成熟的细胞遗传学芯片，可以检测拷贝数变异，染色体上的微小缺失和重复 具备
荧光分光光度计：核酸与蛋白质定量，测量速度：≤5 秒/样品，数据储存不少于 具备
1000 份。1 台，提供具体品牌、规格型号、产地、数量、单价及总价 生物分析仪：全自动蛋白分析每小时 20 个样本，样本消耗 4ul 灵敏度 1pg/ul
具备 ，核酸分析 RNA 分析完毕直接输出 RNA 完整数。1 台，提供具体品牌、规格型
中标方应对设备操作及维修人员进行操作及维修培训，直至技术人员维修技能为止，提供详细培训记录,提供设备设计使用寿命
维修保障：提供中文说明书、操作手册、详细维修手册、整机线路图、系统安装软件
★3
具备
及维修密码，软件终身免费升级
一个月内非人为质量问题提供换货。设备出现故障时 2 个小时内提供备用设备，6 小
基因测序分析仪
一 ★1 2 ★3 4 5 6 二
1
★2 3 ★4 ★5 ★6 ★7 8 9 10 11 12 ★13 14 15 ★16 17 18
19
20
21
总体要求
满足医院要求，凡涉及设备安装及施工由中标方负责，按照医院要求提供交钥匙工程 具备
投标时要求提供原厂家的检验报告、技术参数表及产品彩页
具备
投标产品应适用于临床、科研、教学并满足将来发展临床应用及科研领域的需要，提 具备
供国际 ISO13485 质量体系认证
提供近三年的销售业绩
具备
仪器配备所有软件使用最新版本且终身免费升级，端口免费开放，能与我院各信息系 具备
统无缝对接
数量
1台
技术要求
未知物种全基因组测序，已知物种再测序，全基因表达组定量分析，全基因组小 RNA 分析，染色质免疫互沉淀（ChIP）研究,转录组分析，扩增子测序，定向重测序，拷贝 具备
可以做全基因组测序的应用和从头测序
具备
可以做全转录组测序的应用
具备
数据读长：单端读取序列，读长不低于 150 个碱基
具备
双端读取序列：读长不低于 2x150 个碱基
具备
可精确读取≥12 个的连续单个重复碱基
具备
可同时进行 96 个样品的 1536 重 PCR 产物的测序
具备
数据质量：在 2*150bp 测序时，75％以上的碱基质量高于 Q30
具备
采用 SBS（边合成边测序）的测序原理，通过可逆终止子的方法，可以根据应用 具备
的需求控制测序片段的长度，每个测序反应仅合成一个碱基
无需进行 emusion PCR 反应
具备
扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成
具备
采用发光二极管进行荧光激发，激光二极管进行荧光检测
具备
提供简单优化的生物信息学支持软件：如新物种拼接，小 RNA 分析，扩增子分析，重 具备