chemdraw教程 (21)
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1)Preference命令
在ChemDraw7.0的版本里,Preference位于File菜单的下拉选项中。各功能罗列入下,如图2-3。
●Units(单位)可以改变标尺,交叉校准线等单位,但一般不需要改动。选择单位有
cm,in(1in=2.54cm)等。
●Tolerance(容差)允许改变的光标快的大小尺寸。Tolerance影响光标去选择和接触
对象的远近和难易程度。
●Include Footer(打印页脚)包括文件名,最后制作的日期和时间,显示在打印文件的左
下角。
●Show 35mm Slide Boundary Guides (35mm幻灯片界限设置)
●Automatic Atom Labels(自动标记原子)建议选择此项功能,可以自动添加氢原子,
标记其它元素,相当于快捷键。
●Print Background Colour(打印背景颜色)去掉为白色。
●Check Structure When Copying to Clipboard or Exporting(拷贝到粘贴板上时的结构检
查)
●Show Attachment Rank Indicators(显示接触顺序指示)用于显示顺序接触点的虚拟
解释。
●Always Display and Print Reacting Mapping(显示和打印反应过程)
●Auomatic Reaction Mapping(自动反应图)建议选择
2)Document settings命令
●Drawing Settings设置如何绘制键的文件设置,因为化学科技论文有固定的格式,一
般不需要改变设置,需要说明的仅有Fixed length选项,有时候因为处理对象不同,需
要取消对键长的固定。如果做ppt演示,最好把line width放宽一点(画分子的时候也许Tolerances也要大点,并且所有的键、原子都可以选成不同的颜色,这样贴到powerpoint里面比较pp一些。
图2-3 Preference对话框
Color Palette(调色板)可以添加,移动或变化默认的前景或背景的颜色。
1.5 ChemDraw文件操作
ChemDraw文件本身的格式是*.cdx。在File /Apply Document Settings from…中集成了国际很多通用的格式,经常用的会是ACM格式。
下面是ACS(美国化学会)所有杂志包括JACS对ChemDraw画分子结构的要求:
1) As drawing settings select:
chain angle 120°
bond spacing 18% of width
fixed length 14.4pt(0.508cm,0.2in.)
bold width 2.0pt(0.071,0.0278in.)
line width 0.6pt(0.021cm,0.0084in.)
margin width 1.6pt(0.056cm,0.0222in.)
hash spacing 2.5pt(0.088cm,0.0347in.)
2) As text sttings select:
Font Helvetica
Size 10pt
3) Under the preferences choose:
Units Points
Tolerances 3Pixels
4) Set the page setup to 100%
5) Label the drawings:
"Reduce to 75% of current size for publication."
每次打开一个文件就会出现一个新的文件窗口,如果打开多个文件,文件窗口只显示最后打开的文件,通过Ctrl+Tab可以进行窗口的变换。
第二节化学结构的绘制
2.1键工具
1.固定键的长度,角度
软件对键的长度有一定的限制,在Object下拉菜单中,点击Fixed lengths,则画出的键长
度固定。同样的方法Fixed angles用于固定键的角度,默认值15度为一个单位。如果需要临时改变键的长度或者角度,按下Alt键,同时按动键到所需长度和角度即可。
2.楔键工具
点击楔键工具,从楔键窄面点按动到宽面另一点。绘制完成后,将鼠标放在键上,单击即可改变键的方向。
3.多重键的绘制
在Chemoffice2002以后的版本中直接包含了绘制各种多重键的工具,直接点击即可。也可以用比较原始的方法。列在下面,尽管原始,但又是比较省事,免去切换功能键
1)双键选择实键工具,点击绘制单键,在单键基础上再按动一次即可得到双键。通过
在双键中间(出现光标块)的点击可以改变双键的位置,在上,在下或中间。
2)双抉择键在双键基础上,选择波浪键,在双键上点击即可。
3)叁键双键基础上,再次按动。叁键再次点击后即成单键。
注意,以上按动和点击的区别,按动是按住鼠标,拉出一根键后松开,点击是单击的意思。两者并不同。
4.碳氢长链的绘制
使用无环链工具,选择后单击,在弹出的对话框中输入键的个数即可。按住鼠标,上下移动可以改变长链的方向。
2.2环工具
环己烷凳环可以用两个方位进行绘制,选择工具,点击即可得到水平方向环,按住shift点击则得到水平方向环。
除了环己烷凳环外,其他环工具在按住Ctrl键时点击均会得到不定域共轭结构,如图2-4。
图2-4组合键对环工具的影响
对于苯环,双键可以绘制成任意两个方向之一,可以通过按下shift键同时单击进行切换。如图2-5。
图2-5 shift键对于苯环方向的影响
2.3移动原子
将光标指向化学物结构式的任意原子,出现光标块,按下shift键和鼠标左键即可移走目标原字。此功能在将6元环变为5元环时很方便。
2.4键的前后交叉
把一个被交叉在前面的建议到后面的办法。选择任何键工具,用鼠标这项操作键的选择块,双击后即可变到后面。也可以使用object菜单中的bring to front和send to back实现。
第三节文本说明和文字标记
4.1文本