基础生物化学蛋白质合成
生物化学-生化知识点_第十一章 蛋白质的生物合成

第十一章蛋白质的生物合成11-1 遗传密码(下册 P504,37章)蛋白质是生物主要的功能分子,它参与所有的生命活动过程,并起着主导作用。
蛋白质的合成由核酸所控制,决定蛋白质结构的遗传信息编码在核酸分子中。
遗传密码:编码氨基酸的核苷酸序列,通常指核苷酸三联体决定氨基酸的对应关系。
一一一三联密码:核酸分子中只有四种碱基,要为蛋白质分子20种氨基酸编码。
三个碱基编码64个,又称三联密码。
密码子:mRNA上有三个相邻核苷酸组成一个密码子,代表某种氨基酸、肽链合成的起始或终止信号。
蛋白质翻译:在RNA控制下根据核酸链上每3个核苷酸决定一种氨基酸的规则,合成出具有特定氨基酸顺序的蛋白质过程。
全部64个密码子破译后,编写出的遗传密码字典。
见P511 表37-5。
一一一遗传密码的基本特性一1一密码的基本单位遗传密码按5‘→3‘方向编码,为不重叠、无标点的三联体密码子。
起始密码子兼Met:AUG。
终止密码子:UAA、UAG和UGA。
其余61个密码子对应20种氨基酸。
一2一密码的简并性同一种氨基酸有两个或更多密码子的现象称为密码的简并性。
同一种氨基酸不同密码子称为同义密码子,氨基酸密码子的简并见P512表37-6。
简并可以减少有害突变,对物种稳定有一定作用。
一3一密码的变偶性(摆动性)编码同一个氨基酸的密码子前两位碱基都相同,第三位碱基不同,为变偶性。
即密码简并性往往表现在密码子第三位碱基上,如Gly的密码子为GGU、GGC、和GGA。
一4一密码的通用性和变异性通用性:各种低等和高等生物,包括病毒、细菌及真核生物基本上共用一套遗传密码。
变异性:已知线粒体DNA(mtDNA),还有原核生物支原体等少数生物基因密码有一定变异。
一5一密码的防错系统密码的编排方式使得密码子中一个碱基被置换,其结果常常是编码相同的氨基酸或是为物理化学性质接近的氨基酸取代。
11-2 蛋白质合成及转运下册 P5171、氨基酸是怎样被选择及掺入到多肽链当中去的。
生物化学第十一章 蛋白质的生物合成(共65张PPT)全

原核、真核生物各种起始因子的生物功能
起始因子
生物功能
IF-1
占 据 A 位 防 止 结 合 其 他 tRN A
原核
生物
EIF-2
促进起始tRNA与小亚基结合
EIF-3
促 进 大 小 亚 基 分 离 , 提 高 P位 对 结 合 起 始 tRNA 敏 感 性
eIF-2
促进起始tRNA与小亚基结合
eIF-2B,eIF-3
eEF-1-A
EF-Ts 再生EF-Tu
eEF-1-B
EFG
有转位酶活性,促进mRNA肽酰-tRNA由A位前移到P位, 促进卸载tRNA释放
eEF-2
(一)进位(P607 609)
又称注册(registration)
指根据mRNA下一组遗传密 三
码指导,使相应氨基酰-tRNA进 元
入核蛋白体A位。
第一节 蛋白质合成体系
一、翻译模板mRNA及遗传密码
二、核蛋白体是多肽链合成的装置 三、tRNA与氨基酸的活化
P602
一、翻译模板mRNA及遗传密码
(一) mRNA是遗传信息的携带者
1.顺反子(cistron):将编码一个多肽的遗传单位称为顺反
子。
2. 开放阅读框架(open reading frame, ORF):从mRNA 5 端起始密码子AUG到3端终止密码子之间的核苷酸序列。
mRNA 的结构
原核生物的多顺反子
5 PPP
ORF
ORF
真核生物的单顺反子
5 mG - PPP
3
ORF
蛋白质
3
蛋白质
非编码序列
核蛋白体结合位点
编码序列
起始密码子
简述蛋白质合成的过程

简述蛋白质合成的过程蛋白质合成是生物体内的一种生物化学过程,涉及DNA转录和翻译两个步骤。
简单来说,蛋白质合成的过程可以概括为:1. 转录(Transcription):在细胞核中,DNA的一个特定部分被转录成为一段称为信使RNA(mRNA)的分子。
这一过程中,DNA的其中一条链上的碱基依次与反向互补的RNA核苷酸配对,形成一条mRNA链。
这个过程由RNA聚合酶酶催化完成。
2. 剪接(Splicing):在转录过程中,生成的mRNA分子可能包含一些无用或冗余的信息,称为非编码区(non-coding region)或内含子(intron)。
这些非编码区需要被剪接出去,只留下编码区(coding region)或外显子(exon)。
这一过程由剪接体(spliceosome)在细胞核中完成。
3. 翻译(Translation):mRNA离开细胞核进入细胞质,在细胞质中与核糖体(ribosome)相结合进行翻译。
核糖体沿着mRNA的编码区从5'端开始读取,以三个核苷酸为一个密码子进行翻译。
每个密码子对应一种氨基酸,核糖体根据密码子的序列选择相应的氨基酸,将其连接成一条聚氨基酸链,即蛋白质。
4. 蛋白质折叠(Protein Folding):蛋白质合成后,新合成的聚氨基酸链称为原始蛋白质(primary protein)。
原始蛋白质会经过一系列的折叠和修饰过程,形成特定的三维结构,这是蛋白质发挥功能的基础。
5. 蛋白质后修饰(Post-translational Modification):在蛋白质合成后,还会进行一些后修饰的过程,例如磷酸化、甲基化、乙酰化等。
这些修饰对于蛋白质的功能发挥具有重要的影响。
总的来说,蛋白质合成是一个复杂的过程,涉及DNA转录、mRNA剪接、mRNA翻译、蛋白质折叠和后修饰等多个步骤,每个步骤都至关重要,影响着最终形成的功能蛋白质。
大学生物化学课件蛋白质的生物合成

核糖体结合的分子伴侣
非核糖体结合性分子伴侣— 热休克蛋白 伴侣蛋白
(1)热休克蛋白(heat shock protein, HSP ):
属于应激反应性蛋白,高温应激可诱导该蛋白 合成增加。
在大肠杆菌中包括HSP70, HSP40和GrpE三族
Peptidyl site (P Site)
E位
Aminoacyl site (A Site)
mRNA
肽链合成需要酶类和蛋白质因子
• 蛋白质因子: • (1)起始因子 • 原核生物 IF; 真核生物 eIF • (2)延长因子 • 原核生物 EF; 真核生物 eEF • (3)释放因子 • 原核生物 RF; 真核生物 eRF
第二节 蛋白质生物合成的过程
翻译过程从阅读框架的5’-AUG开始,按mRNA 模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码 出现。
整个翻译过程可分为三个阶段:
起始(initiation)
延长(elongation)
终止(termination)
一、肽键合成的起始(Initiation)
多肽链合成后需要逐步折叠成天然空间构象才成为有 功能的蛋白质。
时间: 新生肽链N端在核蛋白体上一出现,肽链的折叠
即开始,折叠在肽链合成中、合成后完成。
细胞中大多数天然蛋白质折叠都不是自动完 成,而需要其他酶、蛋白质辅助 :
•
分子伴侣
•
蛋白二硫键异构酶
•
肽-脯氨酰顺反异构酶
1.分子伴侣*(molecular chaperon)
需要:
转位酶(原核生物中是EFG,真核生物中是eEF-2), GTP 结果:
【生物化学】蛋白质的生物合成

嘌 呤 霉 素
酯键
(3)转位(translocation)
•转位酶 (translocase): •原核:延长因子G(EF-G),真核:EF-2 • GTP
可结合并水解1分子GTP,促进核 蛋白体向mRNA的3’侧移动
进 位
成肽 转 位
合成
3、肽链终止阶段:
核蛋白体沿mRNA链滑动,不断使多 肽链延长,直到终止信号进入受位。
四、蛋白质生物合成的干扰和抑制
1、抗生素(antibiotics)
名称
作用机制
四环素类 氯霉素类 链霉素类 嘌呤霉素
抑制氨酰-tRNA与原核生物核糖体结合,抑制细菌 蛋白质合成
结合原核生物核糖体大亚基,阻断翻译延长过。高 浓度时,对真核生物线粒体内的蛋白质合成也有阻 断作用 结合原核生物核糖体小亚基,改变其构象,引起读 码错误
,IF)
有抗病毒作
用的蛋白质
1、诱导一种蛋白激酶,使eIF2磷酸 化,从而抑制病毒蛋白质的生物合 成。
2、诱导生成一种寡核苷酸(2’5’A),活化核酸内切酶RNaseL, 可降解病毒RNA。
谢 谢!
(1)识别:释放因子(RF)识别终 止密码,进入核蛋白体的受位。
(2)水解:RF使转肽酶变为水解酶, 多肽链与tRNA之间的酯键被水解, 多肽链释放。
(3)解离:通过水解GTP,使核蛋 白体与mRNA分离,tRNA、RF脱落, 核蛋白体解离为大、小亚基。
进位
肽链的形成 移位
蛋白质 合成过程
肽链合成终止
结构与Tyr-tRNAtyr相似,阻止肽链正常合成
放线菌酮 抑制核糖体转肽酶。且只对真核生物有特异性作用
2、干扰蛋白质生物合成的生物活性物质
名称
蛋白质合成的基本过程

蛋白质合成的基本过程蛋白质是构成生物体细胞的重要组成部分,参与了生物体内的几乎所有生化过程。
蛋白质的合成是细胞内最为重要的生物化学过程之一,也是维持生命活动正常进行的基础。
蛋白质的合成过程包括转录和翻译两个阶段,通过这两个阶段,细胞可以根据遗传信息合成出具有特定功能的蛋白质。
下面将详细介绍蛋白质合成的基本过程。
一、转录阶段转录是指在细胞核内DNA模板上合成RNA的过程。
在蛋白质合成中,首先需要将DNA上的遗传信息转录成RNA,形成mRNA(信使RNA),mRNA携带着DNA上的遗传信息,将其带到细胞质中进行翻译合成蛋白质。
1.1 RNA聚合酶的结合转录的第一步是RNA聚合酶与DNA模板的结合。
RNA聚合酶是一种酶类蛋白质,它能够识别DNA上的启动子区域,并在该区域结合,开始合成RNA链。
1.2 RNA链的合成RNA聚合酶在DNA模板上沿着3'→5'方向移动,合成RNA链时是在5'→3'方向进行的。
RNA链的合成过程与DNA复制有所不同,RNA链的合成速度较快,而且只合成一条链。
1.3 终止转录在DNA上的终止子区域,会有一些特定的序列,当RNA聚合酶合成到这些序列时,转录过程会终止,RNA链会从DNA模板上脱离,形成成熟的mRNA。
二、翻译阶段翻译是指在细胞质中mRNA的遗传信息被翻译成氨基酸序列的过程。
翻译过程中涉及到多种RNA和蛋白质,包括tRNA(转运RNA)、rRNA (核糖体RNA)和核糖体等。
2.1 核糖体的结合在翻译的起始阶段,mRNA会与核糖体结合,核糖体是一种由rRNA和蛋白质组成的细胞器,能够将mRNA上的遗传信息翻译成氨基酸序列。
2.2 tRNA的运载tRNA是一种带有特定氨基酸的RNA分子,它能够将氨基酸运载到核糖体上,与mRNA上的密码子配对,完成氨基酸的添加。
2.3 氨基酸的连接在核糖体上,tRNA将氨基酸按照mRNA上的密码子顺序连接起来,形成氨基酸链。
蛋白质合成过程四个步骤

蛋白质合成是生物体内一项非常重要的生物化学过程,也被称为蛋白质生物合成。
该过程包括转录和翻译两个主要阶段,涉及到DNA、RNA和蛋白质等多种生物分子的参与。
下面我将详细介绍蛋白质合成的四个步骤,以便更好地理解这一复杂而精密的生物学过程。
步骤一:转录(Transcription)转录是蛋白质合成的第一步,它发生在细胞核内。
在这一过程中,DNA的信息将被复制到一种名为mRNA(信使RNA)的分子上。
具体来说,转录的步骤包括:1. 启动子结合:转录过程开始于启动子,启动子是DNA上的一个特定区域,其特殊序列能够与RNA聚合酶结合,从而启动转录。
2. RNA聚合酶合成mRNA:一旦启动子与RNA聚合酶结合,RNA 聚合酶将会沿着DNA模板链合成mRNA,这一过程包括RNA的合成和剪切修饰等步骤。
3. 终止:当RNA聚合酶到达终止子时,转录过程将结束,mRNA 分子从DNA模板上分离出来。
步骤二:前期mRNA处理(Pre-mRNA Processing)在转录完成后,产生的mRNA并不是立即可以被翻译成蛋白质的成熟mRNA,还需要经过一系列的前期处理。
这些处理包括:1. 剪接(Splicing):mRNA中会存在一些被称为内含子的非编码序列,而真正编码蛋白质的序列被称为外显子。
剪接过程将内含子从mRNA中切除,将外显子连接起来,形成成熟的mRNA。
2. 5'端盖(5' Cap)的添加:在mRNA的5'端,会添加一种名为7-甲基鸟苷酸(m7G)的化合物,用于保护mRNA不受降解,同时有助于mRNA与核糖体的结合。
3. 3'端聚腺苷酸(Polyadenylation)的添加:在mRNA的3'端,会添加一系列腺苷酸,形成所谓的聚腺苷酸尾巴,同样用于保护mRNA不受降解。
步骤三:翻译(Translation)翻译是蛋白质合成的第二个主要步骤,它发生在细胞质中的核糖体内。
在翻译过程中,mRNA上携带的遗传密码将被翻译成氨基酸序列,从而合成特定的蛋白质。
(完整版)生物化学习题-蛋白质的生物合成

第十二章蛋白质的生物合成一、知识要点(一)蛋白质生物合成体系的重要组分蛋白质生物合成体系的重要组分主要包括mRNA 、tRNA 、rRNA、有关的酶以及几十种蛋白质因子。
其中,mRNA是蛋白质生物合成的直接模板。
tRNA的作用体现在三个方面:3ˊCCA接受氨基酸;反密码子识别mRNA链上的密码子;连接多肽链和核糖体。
rRNA和几十种蛋白质组成合成蛋白质的场所——核糖体。
遗传密码的特点:无标点性、无重叠性;通用性和例外;简并性;变偶性。
(二)蛋白质白质生物合成的过程蛋白质生物合成的过程分四个步骤:氨基酸活化、肽链合成的起始、延伸、终止和释放。
其中,氨基酸活化即氨酰tRNA的合成,反应由特异的氨酰tRNA合成酶催化,在胞液中进行。
氨酰tRNA合成酶既能识别特异的氨基酸,又能辩认携带该氨酰基的一组同功受体tRNA分子。
肽链合成的起始对于大肠杆菌等原核细胞来说,是70S起始复合物的形成。
它需要核糖体30S和50S亚基、带有起始密码子AUG的mRNA、fMet-tRNA f 、起始因子IF1、IF2、IF3(分子量分别为10 000、80 000和21 000的蛋白质)以及GTP和Mg2+的参加。
肽链合成的延伸需要70S起始复合物、氨酰-tRNA、三种延伸因子:一种是热不稳定的EF-Tu,另一种是热稳定的EF-Ts,第三种是依赖GTP的EF-G以及GTP和Mg2+。
肽链合成的终止和释放需要三个终止因子RF1、RF2、RF3蛋白的参与。
比较真核细胞蛋白质生物合成与原核细胞的不同。
(三)蛋白质合成后的修饰蛋白质合成后的几种修饰方式:氨基末端的甲酰甲硫氨酸的切除、肽链的折叠、氨基酸残基的修饰、切去一段肽链。
二、习题(一)(一)名词解释1.密码子(codon)2.反义密码子(synonymous codon)3.反密码子(anticodon)4.变偶假说(wobble hypothesis)5.移码突变(frameshift mutant)6.氨基酸同功受体(isoacceptor)7.反义RNA(antisense RNA)8.信号肽(signal peptide)9.简并密码(degenerate code)10.核糖体(ribosome)11.多核糖体(poly some)12.氨酰基部位(aminoacyl site)13.肽酰基部位(peptidy site)14.肽基转移酶(peptidyl transferase)15.氨酰- tRNA合成酶(amino acy-tRNA synthetase)16.蛋白质折叠(protein folding)17.核蛋白体循环(polyribosome)18.锌指(zine finger)19.亮氨酸拉链(leucine zipper)20.顺式作用元件(cis-acting element)21.反式作用因子(trans-acting factor)22.螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix)(二)英文缩写符号1.IF(initiation factor):2.EF(elongation factor):3.RF(release factor):4.hnRNA(heterogeneous nuclear RNA):5.fMet-tRNA f :6.Met-tRNA i :(三)填空题1.蛋白质的生物合成是以______作为模板,______作为运输氨基酸的工具,_____作为合成的场所。
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例如,当polyU与核糖体混合时,仅有PhetRNA与之结合;Pro-tRNA特异地与polyC结 合等。
64个三核苷酸(密码子)都可按设想的序列合成, 但有一些三核苷酸序列与核糖体结合不是很 有效,因此不能确定它们是否能为特异的氨 基酸编码。
1。体外翻译系 统
2。人工合成核 酸
3核糖体结合技 术
⑵遗传密码的破译
基因密码的破译先后经历了五十年代的数学推 理阶段和1961-1965年的实验研究阶段。
物理学家George Gamov(1954)根据DNA中 有4种核苷酸和蛋白质中有20种氨基酸的对 应关系,推理认为3个核苷酸为一个氨基酸 编码,可编64种氨基酸(43=64) 是最理想的。
因为在有四种核苷酸条件下,64是能满足于20 种氨基酸编码的最小数。
④重复共聚物(repeating copolymers)破译密码
Nishimura等人应用有机化学和酶学技术,制 备了已知的核苷酸重复序列。蛋白质在核糖 体上的合成可以在这些有规律的共聚物的任 一点开始,并把特异的氨基酸参入肽链。
例如,重复序列CUCUCUCUCU......是多肽 Leu-Ser-Leu-Ser... 或是Ser-Leu-Ser...的 mRNA;使用共聚物构成三核苷酸为单位的 重复顺序。
的过程称翻译。即蛋白质 的生物合成过程。
蛋白质合成过程中需要200多种生物大分子参 加,包括核糖体、mRNA、tRNA及多种蛋 白质因子。
用体外翻译系统也可以进行蛋白质的生物合成。 如细菌无细胞系统、动物无核细胞系统、网 织红细胞裂解系统和麦胚系统等。只要加入 外源mRNA模板,则可进行体外翻译。
因此从起始码AUG开始,三个碱基代表一个氨 基酸,从mRNA的5‘→3’方向构成一个连续 的读框,直至终止码。
如果在读框中间插入或缺失一个碱基就会造成 移码突变,引起突变位点下游氨基排列的错 误。
③起始密码子和终止密码子:
AUG是起始密码子,也是Met(或者fMet)的 密码子。
原核和真核生物肽链合成的第一个氨基酸都是 Met(或者fMet);少数细菌中也用GUG做 为起始码(起始位点编码fMet,密码表中编 码Val);真核生物偶尔也用CUG作起始蛋氨 酸的密码。
13.1.1.1 mRNA
原核细胞每个mRNA分子常带有多个功能相关 蛋白质的编码信息,以一种多顺反子的形式 排列,在翻译过程中可同时合成几种蛋白质;
真核细胞每个mRNA一般只带一种蛋白质编码 信息,是单顺反子的形式。
不同的蛋白质有各自不同的mRNA,mRNA除 含有编码区外,两端还有非编码区。
但此方法不能确定A和C的排列方式,而只能 显示密码子中碱基组成及组成比例。
③核糖体结合技术
Nirenberg等(1964)建立了aa-tRNA与确定密 码子结合实验的破译密码新方法。
在缺乏蛋白质合成所需的因子的条件下,特异 aa-tRNA可与核糖体-mRNA复合物结合。它 并不一定需要长的mRNA分子,三核苷酸就 可以与核糖体结合。
Brenner和Grick(1961)根据DNA链与蛋白质 链的共线性(colinearity),肯定了三个核苷酸 为一个氨基酸编码的推理。随后的实验研究 证明此推理是正确的。
①均聚核苷酸指导均聚肽合成
Nirenberg 和 Mathaei ( 1961 ) 合 成 了 polyU 作 为模板,加入体外无细胞翻译系统中。将翻 译产物分析后,发现合成的肽链中的氨基酸 残基全部是Phe。确认了第一个Phe的密码子 (UUU)。
以polyA和polyC为模板,证明了分别可指导合 成polyLys和polyPro,确定了AAA是Lys的密 码子,CCC是pro的密码子。
但类似的实验不能证明GGG是何种氨基酸的 密码子,因为polyG产生牢固的氢键结合, 形成三股螺旋,而不与核糖体结合。
②特定共聚核苷酸
Speyer 等 ( 1963 ) 用 2 个 碱 基 的 共 聚 物 (mixed copolymers)破译密码的方法。
13 蛋白质生物合成
13.1 蛋白质合成体系 13.2 蛋白质的生物合成 13.3 蛋白质定位
13.1,不同的蛋白质 中氨基酸排列顺序不同,这种排列顺序是按 照基因中的碱基顺序决定的。
基因的遗传信息在转录过程 中从DNA转移到mRNA, 再由mRNA将遗传信息表 达为蛋白质中氨基酸顺序
mRNA分子上以5‘→3’方向,从AUG开始每三 个连续的核苷酸(三联体)组成一个密码子 (codon) 。
mRNA中的4种碱基可以组成64种密码子。这 些密码代表了20种氨基酸,同时决定了翻译 过程的起始与终止位置。
每种氨基酸至少有一种密码子,最多的有6种 密码子。通过遗传学和生物化学实验,1966 年编排出了遗传密码字典。
如(AAG)n,它可合成:polyLys、polyArg和 polyGlu三种类型的多肽,即AAG是Lys的密 码子,AGA是Arg的密码子,GAA是Glu的 密码子。
1965年破译了所有氨基酸的密码子
13.1.1.3 遗传密码的基本性质 ①密码子的方向性
②读码的连续性
两个密码子之间无任何核苷酸或其它成分加以 分隔,即密码子间无逗号。
非编码区对于mRNA的模板活性是必需的,特 别是5’-端非编码区在蛋白质合成中可能是与 核糖体结合的部位。
基因中各种序列的一般排列次序为:启动信 号— 5‘-端前导区(非编码区) —编码区—3‘端尾序列(非编码区) — 3‘端终止子。
13.1.1.2 遗传密码的破译
⑴遗传密码
mRNA中蕴藏遗传信息的碱基顺序称为遗传密 码(Genetic code)。
以A和C原料合成polyAC。polyAC含有8种不 同的密码子:CCC、CCA、CAA、AAA、 AAC、ACC、ACA和CAC。实验中AC共聚 物作模板翻译出的肽链由6种氨基酸组成, 即Asp、His、Thr、Pro和Lys,其中Pro和 Lys的密码子已证明是CCC和AAA。
根据共聚物成份不同的比例和翻译产物中氨基 酸比例亦不同的关系,确定了Asp、Glu和 Thr的密码子含2AlC;His的密码子含1A2C; Thr的密码子也可以含1A2C;Pro为3C或 1A2C;Lys为3A。