高性能计算集群的搭建
某高校高性能集群部署文档
某高校高性能计算集群部署文档（瘦节点部分）2012年11月25日目录1.文档更新历史........................................................................................................ 错误!未定义书签。
2.集群概览 (5)3.准备工作 (5)3.1.对所有节点的内置硬盘建立RAID (5)3.2.收集物理信息 (6)4.部署管理节点操作系统 (6)4.1.安装操作系统 (6)4.2.系统安装完之后配置 (7)5.安装配置Platform HPC集群管理软件 (8)5.1.安装包准备 (8)5.2.执行安装程序 (8)5.3.安装过程中的操作 (8)6.使用Platform HPC做操作系统分发 (9)6.1.配置网络接口 (9)6.2.为刀片机HS22操作系统分发 (12)6.3.对刀片组HS12操作系统分发 (16)6.4.对IO节点做系统分发 (20)6.5.对Login节点做系统分发 (23)7.使用Platform HPC维护操作系统分发 (26)7.1.移除已经部署的操作系统 (26)7.2.重新部署操作系统 (26)7.3.部署新的机器 (27)7.4.维护部署模板内容 (28)8.GPFS配置方法 ...................................................................................................... 错误!未定义书签。
8.1.XIV近线存储划分 ..................................................................................... 错误!未定义书签。
8.2.XIV存储驱动安装 ..................................................................................... 错误!未定义书签。
高性能计算集群的搭建与配置技巧
高性能计算集群的搭建与配置技巧高性能计算集群是一种利用多台计算机协同工作来完成强大计算任务的解决方案。
它可以有效地提高计算效率，加快数据处理速度，并且适用于各种应用领域，如科学研究、工程设计、数据分析等。
本文将介绍高性能计算集群的搭建与配置技巧，帮助读者了解如何创建一个高效的计算环境。
1. 硬件选型与配置高性能计算集群的性能关键在于硬件的选择与配置。
首先要确定集群规模和预算，然后选择适合的服务器、网络设备和存储系统。
在选购服务器时，要考虑计算性能、内存容量、硬盘速度以及网络带宽等因素。
确保服务器之间的网络连接速度快且稳定，并采用合适的交换机和路由器来管理网络流量。
存储系统也要具备足够的容量和读写速度，以满足大规模数据存储和访问的需求。
2. 软件安装与配置高性能计算集群需要安装和配置一系列软件来实现任务调度、资源管理、数据共享等功能。
下面是一些常用的软件组件：- 操作系统：可以选择Linux发行版作为集群的操作系统，如CentOS、Ubuntu等。
这些操作系统具有良好的稳定性和可扩展性，并且有大量的软件和工具可用于集群管理和开发。
- 并行编程库：高性能计算集群通常使用并行编程来实现任务的分配和调度。
MPI（Message Passing Interface）是一种常用的并行编程库，用于实现多节点计算。
在安装MPI时，要确保版本兼容性并准确设置环境变量。
- 任务调度器：任务调度器负责分配和管理集群中的计算任务。
常用的任务调度器包括Slurm、PBS等。
在安装和配置任务调度器时，要根据实际需求设置不同的参数，如资源分配、任务优先级等。
- 分布式文件系统：为了实现集群中的数据共享和访问，需要安装和配置适当的分布式文件系统，如NFS、GlusterFS等。
这些文件系统能够提供高性能和可靠的数据存储和访问服务。
3. 网络设置与安全在搭建高性能计算集群时，网络设置和安全性非常重要。
以下是几个关键方面：- IP地址规划：根据集群规模和网络拓扑，设置合理的IP地址规划方案，确保每个节点都有唯一的IP地址和子网掩码。
高性能计算集群方案
高性能计算集群方案引言高性能计算（High Performance Computing，HPC）是指利用大规模的计算机群集，通过并行计算方法解决复杂科学、工程和商业问题的一种计算模式。
为了提高计算效率，构建一个高性能计算集群是非常重要的。
本文将介绍一种高性能计算集群方案，该方案包括硬件设备的选择、软件平台的搭建以及集群管理的方法。
硬件设备选择搭建高性能计算集群的第一步是选择适合的硬件设备。
在选择硬件设备时，需要考虑以下几个因素：1. 处理器高性能计算集群的处理器是关键的硬件组成部分。
在选择处理器时，需要考虑其计算能力、核心数量、功耗以及成本等因素。
目前，常见的选择包括Intel Xeon、AMD EPYC等。
2. 内存集群的内存容量直接影响到计算任务的并行性和数据处理能力。
需要根据具体需求选择适当的内存容量，一般建议每个节点的内存容量应满足最大计算任务的内存需求。
3. 网络高性能计算集群需要使用高速网络进行节点间的数据通信。
目前常用的网络技术包括以太网（Ethernet）、InfiniBand等。
网络的带宽、延迟以及可扩展性都是选择网络技术时需要考虑的因素。
4. 存储对于高性能计算集群来说，快速的存储系统对于数据读写的效率至关重要。
可以选择使用固态硬盘（SSD）作为主存储，同时使用磁盘阵列（RAID）进行数据备份和冗余。
软件平台搭建搭建高性能计算集群的第二步是搭建软件平台。
软件平台需要提供集群管理、作业调度以及并行计算等功能。
1. 集群管理软件集群管理软件可以协调和控制集群中的各个节点。
常见的集群管理软件有Slurm、OpenPBS等，可以根据实际需求选择合适的软件。
2. 作业调度软件为了提高集群资源的利用率，需要使用作业调度软件进行任务调度和节点分配。
常见的作业调度软件有Torque、Moab等，根据需求选择合适的软件。
3. 并行计算软件高性能计算集群需要支持并行计算，因此需要安装相应的并行计算软件。
高性能计算集群的配置与管理指南
高性能计算集群的配置与管理指南随着科技的发展和计算需求的增加，高性能计算集群成为了解决复杂计算问题的有效工具。
配置和管理一个高性能计算集群需要考虑各种因素，包括硬件、软件和网络方面的要求。
本文将介绍高性能计算集群的配置和管理指南，帮助您构建和维护一个高效的计算环境。
一、硬件配置在配置一个高性能计算集群时，首先需要考虑的是硬件方面的需求。
以下是您应该关注的一些关键要素：1.服务器规格：选择适合您计算需求的服务器规格。
您可以根据计算密集型或存储密集型的任务来选择具有较高的CPU和内存的服务器。
同时，一个具有良好的网络连接的集群也是必要的。
2.网络交换机：选择高质量的网络交换机以确保高性能的数据传输。
对于规模较小的集群，千兆以太网可能足够，但对于大规模集群，您可能需要考虑使用万兆以太网或光纤通信技术。
3.存储系统：合理选择存储系统以满足数据存储和访问的需求。
对于大规模的数据集，您可以考虑使用分布式文件系统，如Hadoop分布式文件系统（HDFS）或GlusterFS。
二、软件配置正确的软件配置对于高性能计算集群的操作和性能至关重要。
以下是您应该注意的一些关键软件配置方面的要素：1.操作系统：选择适合您的需求的操作系统。
Linux是一个常见的选择，因为它具有广泛的开源软件支持，并提供了强大的性能和稳定性。
2.调度器：选择一个合适的调度器来管理和分配集群上的作业。
Slurm、PBS Pro和SGE（Sun Grid Engine）是常见的调度器选择，它们可以帮助您合理地分配计算资源，提高集群的利用率。
3.并行计算库：使用并行计算库可以加速计算任务的执行。
常用的并行计算库包括OpenMP、MPI和CUDA。
根据您的任务需求，选择合适的并行计算库来优化代码执行效率。
三、集群管理高性能计算集群的管理是确保其正常运行的关键。
以下是您应该关注的一些关键管理方面的要素：1.集群监控：使用适当的监控工具来实时监测集群的状态。
高性能集群方案
高性能集群方案摘要：随着科技的不断发展，越来越多的企业和组织面临处理大规模数据和处理复杂计算任务的需求。
为了应对这些需求，高性能集群方案被广泛采用。
本文将介绍高性能集群方案的基本概念和原理，并探讨如何设计和部署一个高效的集群系统。
一、引言随着云计算、大数据和人工智能等技术的快速发展，许多领域的数据和计算需求呈现指数级增长。
传统的单机计算模型已经无法满足这些需求，因此高性能集群方案变得越来越重要。
二、高性能集群的定义高性能集群是一种将多个计算资源联合起来形成一个统一计算实体的解决方案。
这些计算资源可以是物理服务器、虚拟机、容器等。
高性能集群的目标是通过并行计算和分布式存储来实现高性能和高可靠性。
三、高性能集群的优势1. 高性能：高性能集群可以并行处理大规模数据和复杂计算任务，大大提高计算速度。
2. 高可扩展性：集群系统可以根据实际需求扩展计算资源，满足不断增长的计算需求。
3. 高可靠性：高性能集群通常采用冗余备份和自动故障转移机制，保证系统的高可靠性。
4. 节省成本：通过合理的资源利用和自动化管理，高性能集群可以降低企业的IT运维成本。
四、高性能集群的关键技术1. 分布式存储：高性能集群通常采用分布式文件系统，将数据分散在多个节点上进行存储，提高数据访问效率和可靠性。
2. 分布式计算：高性能集群通过任务划分和并行计算的方式，将复杂计算任务分发到多个计算节点上进行处理，提高计算速度和效率。
3. 负载均衡：为了保证集群中各个节点的负载均衡，高性能集群通常采用负载均衡算法来分发任务，并根据节点的实际负载情况进行动态调整。
4. 容错机制：高性能集群通过冗余备份和自动故障转移机制，提高系统的可靠性和容错性。
五、高性能集群的设计和部署1. 硬件选型：根据实际需求选择适合的计算节点和存储设备，保证集群系统的性能和容量。
2. 网络架构：设计合理的网络架构，保证节点之间的高速通信和低延迟。
3. 软件配置：安装和配置适合集群的操作系统和软件，进行节点的管理和监控。
高性能计算集群的配置与使用教程
高性能计算集群的配置与使用教程高性能计算（High Performance Computing，HPC）集群是一种强大的计算工具，能够处理大规模的数据和执行复杂的计算任务。
本文将介绍高性能计算集群的配置和使用方法，并为您提供详细的教程。
1. 配置高性能计算集群配置高性能计算集群需要以下几个步骤：1.1 硬件要求选择适合的硬件设备是配置高性能计算集群的第一步。
您需要选择性能强大的服务器，并确保服务器之间能够互相通信。
此外，还需要大容量的存储设备来存储数据和计算结果。
1.2 操作系统安装选择合适的操作系统安装在每个服务器上。
常用的操作系统有Linux和Windows Server，其中Linux被广泛使用于高性能计算集群。
安装操作系统后，您还需要配置网络设置、安装必要的软件和驱动程序。
1.3 服务器网络连接为了保证高性能计算集群的正常工作，需要配置服务器之间的网络连接。
您可以选择以太网、光纤等网络连接方式，并确保每个服务器都能够互相访问。
1.4 集群管理软件安装为了方便管理和控制高性能计算集群，您需要安装相应的集群管理软件。
常用的集群管理软件有Hadoop、Slurm和PBS等。
这些软件可以帮助您管理任务队列、分配资源和监控集群的运行状态。
2. 使用高性能计算集群配置完高性能计算集群后，您可以开始使用它进行计算任务。
以下是使用高性能计算集群的一般步骤：2.1 编写并提交任务首先，您需要编写计算任务的代码。
根据您的需求，可以选择编写Shell脚本、Python脚本或其他编程语言的代码。
编写完毕后，您需要将任务提交到集群管理软件中。
2.2 监控任务状态一旦任务提交成功，您可以使用集群管理软件提供的监控功能来跟踪任务的状态。
您可以查看任务的进度、资源使用情况和错误信息等。
2.3 调整任务与资源如果您发现任务需要更多的计算资源或运行时间，您可以根据需要调整任务的资源配置。
集群管理软件通常提供了资源调整的功能，您可以根据任务的实际情况进行调整。
高性能计算平台的搭建与配置手册
高性能计算平台的搭建与配置手册一、引言高性能计算平台作为科研机构、企业等需要处理大规模数据和进行复杂计算的应用中不可或缺的一项工具，对于提高计算效率、加速科学研究、推动技术创新具有重要意义。
本手册旨在介绍高性能计算平台的搭建与配置过程，帮助用户了解平台的基本组成、硬件需求和软件配置，并提供详细的操作步骤。
二、平台搭建前的准备工作1. 了解需求：在搭建高性能计算平台之前，需要明确平台的主要应用场景和计算需求。
这包括确定计算规模、数据量和计算强度，以便根据需求选择合适的硬件和软件配置。
2. 硬件需求：根据计算需求和预算情况，选择适当的服务器、存储设备和网络设备。
需要考虑的因素包括处理器类型和核心数量、内存容量、存储容量和速度，以及网络带宽和拓扑结构等。
3. 软件需求：确定所需的操作系统、编程语言和并行计算库。
常用的操作系统包括Linux、Unix和Windows Server等，编程语言可以选择C、C++、Python等，而并行计算库则有OpenMP、MPI和CUDA等。
三、平台搭建与配置步骤1. 硬件搭建（1）选择合适的服务器，根据需求选择合适的处理器型号和核心数量，并确保服务器具备足够的内存容量和存储空间。
（2）连接存储设备和网络设备，并确保网络带宽和拓扑满足计算需求。
（3）安装操作系统，根据硬件和软件需求选择合适的操作系统版本，并按照操作系统提供的安装指南进行安装。
2. 软件配置（1）选择并安装合适的编程语言和并行计算库。
根据应用需求选择编程语言，并安装相应的开发环境。
对于并行计算库，根据需求选择合适的库，并按照库提供的安装指南进行安装。
（2）配置环境变量，设置编程语言、并行计算库和其他相关软件的路径，以便在命令行中快速访问。
（3）配置网络和集群管理，设置网络参数和集群管理软件，以便在多台服务器之间进行通信和任务调度。
3. 平台测试与调优（1）进行基准测试，通过运行一些常见的计算任务，评估平台的性能和稳定性。
如何进行超级计算机集群的搭建
如何进行超级计算机集群的搭建超级计算机集群是一种将多台计算机连接在一起形成一个强大计算力的系统。
它的搭建能够为科学研究、数据分析、机器学习等领域提供高性能计算能力。
在本文中，我将介绍如何进行超级计算机集群的搭建。
1. 硬件准备超级计算机集群需要多台计算机进行连接，因此首先需要准备足够多的计算机。
这些计算机可以是台式机或者服务器，它们应该具备充足的处理能力和内存容量。
2. 网络配置搭建超级计算机集群的关键是将各个计算机连接在一起组成一个网络，以实现数据的传输和共享。
通常，可以使用交换机或者路由器来建立内部网络，确保计算机之间的通信畅通。
3. 操作系统安装与配置在每台计算机上安装相同的操作系统，如Linux操作系统。
选择合适的Linux发行版本，如Ubuntu、CentOS等，并进行基本的配置。
确保每台计算机的网络设置正确，并指定固定的IP地址。
4. 并行计算框架选择超级计算机集群可以通过并行计算框架来实现任务的分发和并行计算。
常用的并行计算框架包括MPI（Message Passing Interface）和OpenMP。
根据自己的需求和计算任务的特点选择合适的框架。
5. 软件安装与配置根据计算任务的需求，在每台计算机上安装所需的软件和库。
如若进行机器学习任务，可以安装TensorFlow、PyTorch等深度学习框架。
确保软件版本一致，并配置环境变量。
6. 分发任务通过并行计算框架将任务分发给集群中的不同计算节点，以实现任务的并行计算。
通过指定计算节点的IP地址和端口号，将任务分发给集群中的特定节点。
7. 结果收集与整合在计算完成后，将各个计算节点的结果进行收集和整合。
可以使用并行计算框架提供的API或者自行编写代码来实现结果的整合。
确保结果的正确性和完整性。
8. 系统监控与管理超级计算机集群通常包含大量的计算节点，因此需要实时监控集群的运行状态和资源使用情况。
可以使用系统监控软件来实现对计算节点的监控和管理，及时发现和解决问题。
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# vi /etc/dhcpd.conf 键入以下内容： # # DHCP Server Configuration file. # see /usr/share/doc/dhcp*/dhcpd.conf.sample # option domain-name ""; ddns-update-style none; default-lease-time 6000; max-lease-time 11400; server-name "bootserver"; use-host-decl-names on; option option-128 code 128=string; option option-129 code 129=string;
分节点：eth1 内网 ip=192.168.0.101~192.168.0.121，localhost=hpc01~hpc21
2. 安装主节点
在 hp ProLiant DL385 上外接 usb dvd 光驱，bios 设置 usb 光驱第一顺序启动， 安装 Redhat 5.4 Enterprise Server。
高性能计算集群的搭建
PC-Cluster 手记
(Version: 0.91rc) 黄灿
canhuang@
中国科学技术大学 地球和空间科学学院 2010 年 9 月 13 日
目录
1. 硬件平台和网络..........................................................................................................................1 2. 安装主节点..................................................................................................................................1 3. 配置主节点的 dhcp、nfs 和 tftp 服务......................................................................................1
2
Building a cluster system for HPC
Version: 0.91rc
filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:94:58; fixed-address 192.168.0.108; } host hpc09 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:09:F0:66; fixed-address 192.168.0.109; } host hpc10 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:09:F1:34; fixed-address 192.168.0.110; } host hpc11 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:86:F3; fixed-address 192.168.0.111; } host hpc12 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:93:82; fixed-address 192.168.0.112; } host hpc13 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:94:40; fixed-address 192.168.0.113; } host hpc14 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:09:93:A0; fixed-address 192.168.0.114; } host hpc15 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver";
在主节点根目录下新建 exports 目录，为以后网络共享使用。在 exports 目录 下新建 x64 目录，将安装光盘内的所有文件拷入，为网络安装备用。
3. 配置主节点的 dhcp、nfs 和 tftp 服务
3.1 dhcp 服务 在主节点配置 dhcp 服务的目的是为了在分节点网卡 pxe 启动时能够找到主
subnet 192.168.0.0 netmask 255.255.255.0 { option routers 192.168.0.1; deny unknown-clients; group{ next-server 192.168.0.1; filename "pxelinux.0";
1
host hpc01 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:09:F1:14; fixed-address 192.168.0.101; } host hpc02 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:09:F1:3E; fixed-address 192.168.0.102; } host hpc03 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:09:F0:0E; fixed-address 192.168.0.103; } host hpc04 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:86:D5; fixed-address 192.168.0.104; } host hpc05 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; har4E; fixed-address 192.168.0.105; } host hpc06 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:86:AF; fixed-address 192.168.0.106; } host hpc07 { filename "pxelinux.0"; server-name "bootserver"; hardware ethernet 00:15:60:5F:86:43; fixed-address 192.168.0.107; } host hpc08 {
3.1 dhcp 服务 ................................................................1 3.2 nfs 服务 .................................................................5 3.3 tftp 服务 ................................................................5 4. 网络安装分节点..........................................................................................................................7 5. 设置主节点无密码 ssh 访问 ......................................................................................................7 6. 分节点配置 nfs 服务 ..................................................................................................................8 7. 主节点配置 nis 服务...................................................................................................................8 8. 分节点配置 nis 服务...................................................................................................................9 9. 安装 openmpi............................................................................................................................10 10. 安装 torque 和 ifort................................................................................................................ 11 10.1 主节点 .................................................................11 10.2 分节点 .................................................................12 10.3 ifort 的安装配置 .......................................................13 附录 I 管理员须知........................................................................................................................14 11.1 新建用户 ............................................................... 14 11.2 删除用户 ............................................................... 14 11.3 设置运行作业的机器数 ................................................... 14 附录 II 用户须知 ..........................................................................................................................15 12.1 串行作业 ............................................................... 15 12.2 并行作业 ............................................................... 15