《外源基因的表达》PPT课件

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第七章-外源基因的表达PPT课件

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的基因,而不能用基因组DNA。 (3)必须利用原核细胞的强启动子和S-D序列等调控元件控 制外源基的表达。 (4)外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读 框架。 (5)利用宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,防止外 源基因的表达产物对宿主菌的伤害。
3.原核生物基因表达的调控序列
只有在了解了原核生物基因表达调控序列的基础上, 才能够 构建高效的表达载体,使外源目的基因在原核细胞中得到高效 率、高水平地表达。对于原核细. 胞来讲,基因表达的调控序 4
■-10区(Pribnow框,TATAAT):RN
5
原核表达系统中通常使用的可调控的强启动子有lac(乳糖启 动子)、trp(色氨酸启动子)、PL及PR(λ噬菌体左向和右 向启动子)、tac(乳糖和色氨酸的杂合启动子)等。
(2)终止子
在一个基因或一个操纵子的3’端往往有一个特定的核苷酸序 列 , 它 有 终 止 转 录 的 功 能 , 这 一 段 DNA 序 列 称 为 终 止 子 (terminator)。终止子在结构上有一些共同的特点,即有一 段富含A/T的区域和一段富含G/C的区域,G/C区域具有回文 对称结构,使转录后的RNA具有茎环结构。
这个载体系统是由pBR322为基础构建的。 ➢带有大肠杆菌最强的启动子之一,即Ipp(脂蛋白基因)启 动子。在启动子的下游装有lac UV5的启动子及其操纵基因, 并把lac阻遏子的基因(lac I)也克隆到这个质粒上。这样目 的基因的表达就成为可调节的了。 ➢在转录控制的下游再装上人工合成的高效翻译起始序列(SD序列及ATG)。 ➢信号肽序列取自于大肠杆菌中. 分泌蛋白的基因ompa(外膜9 蛋白基因)。
根据转录终止作用类型,终止子可分为两种:依赖于ρ因子 的转录终止子及不依赖于ρ因子的转录终止子。

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2.真核表达系统:使外源基因在真核细 胞中表达的体系。
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3
原核生物作为基因表达系统的受体细胞具有如下特点:
(1)大多数为单细胞异养,生长快,代谢易于控制, 可通过发酵迅速获得大量基因表达产物。
(2)基因组结构简单,便于基因操作和分析。
(3)多数原核生物细胞内含有质粒或噬菌体,便于 构建相应的表达载体。
一、启动子
启动子(promoter, P)是指能被RNA聚合
酶识别、结合并启动基因转录的一段 DNA序列。
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5
1. 原核生物的启动子
原核生物的启动子一般由四个部分构成:转录 起始位点、两个六联体保守序列区和间隔区。
识别区 Pribnow框 转录起点
16~19bp
5~9bp
5’ TTGACA TATAAT A(G) 3’
RNA … NNAAGCGCCGNNNNCCGGCGCUUUUUUNNN-OH
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N
N
N
N
C
GC
CG C G RNA结构
GC
CG
GC
AU
AU
……NNNN UUUU-OH3
图: 强终止子模式图
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三、SD序列:
mRNA的翻译起始效率主要由其5’端的结构序列 所决定,称为核糖体结合位点(RBS),它包括下列 四个特征要素:
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(3)Sextama框: 在转录启动区的另一个六联体 保守序列位于距转录起始位点上游35bp处,通常称 为-35区,该保守序列为TTGACA,其中前三个碱 基具有较强的保守性,它是RNA聚合酶的识别位点。
(4)间隔区: 原核生物启动子在转录起始位点与 Pribnow框之间、Pribnow框与Sextama框之间存在 长度不等的间隔序列。间隔序列内部无明显的保守 性,其序列的碱基组成对启动子的功能并不十分重 要, 但间隔序列的长度却是影响启动子功能的重要 因素。

外源基因表达ppt课件

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序列修饰,pr稳定性因子 优化发酵过程:工艺 生物学:菌体生长,表达条
件,产物总量
The expression vector
Most important elements in the vector
Promoter
-35: TTGACA (E. coli ) -10: TATAAT (E. coli )
Terminator (hairpin) Ribosome binding site (RBS) Selection marker Vector replication sequence
(ori) Polylinker (MCS)
In the gene/vector
tac promoter
GAL system
Gene cloned under control of the GAL4 promoter Induction by galactose as the sole carbon source Stronger induction by PGAL1 Gal4p transcriptional activator - 1-5% of total protein - Leaky promoter
赵 子 昂
第七章 基因表达系统
外源基因表达系统 泛指目的基因与表达载体重组后,导入合适受体细
胞,并在其中有效表达,产生目的基因产物 1.E. coli表达系统: 常用lac & tac:以lac操纵子调控机制为基础:lacP
lacO 结构基因(lacZ, Y, A),lacI 阻遏pr,IPTG诱 导, PL & PR:以phage溶原/溶菌循环 T7启动子:T7RNA聚合酶识别序列在pET中MCS上 端,RNA聚合酶位于BL21(DE3)基因组中,上端为 lac启动子调控,IPTG

外源基因在酵母菌中表达讲义课件

外源基因在酵母菌中表达讲义课件
达稳定期关闭
• UBI 4 编码泛素五聚体对数生长期关闭稳定期表达
酵母菌共有七个泛素连接酶基因:
• UBC 1、UBC 2、UBC 3、UBC 4、UBC 5、UBC 6、UBC 7
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•8
减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌
泛素降解途径衰减的酿酒酵母
• UBI 4缺陷型: 在酿酒酵母菌中,泛素主要由UBI 4基因表达,UBI 4-突变
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•12
酵母菌克隆表达质粒的构建
含有ARS的YRpp质粒的构建 • ARS为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.5kb,染色体
上每30-40kb就有一个ARS元件。酵母菌自主复制型
质粒的构建组成包括复制子、标记基因、提供克隆 位点的大肠杆菌质粒DNA。
以ARS为复制子的质粒称为YRp
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•27
酵母菌表达系统的选择
酿酒酵母表达系统 • 酿酒酵母的基因表达系统最为成熟,包括转录活性
较高的甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因GAPDH、磷酸甘油 激酶基因PKG、乙醇脱氢酶基因ADH所属的启动子,
多种重组外源蛋白获得成功表达。 • 酿酒酵母表达系统的最大问题在于其超糖基化能力,
基因工程受体系统(Generally Recognized As Safe GRAS) • 酵母菌是最简单的真核模式生物
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•2
酵母菌的宿主系统
提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌 抑制超糖基化作用的突变宿主菌 减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌
列HARS已被克隆,并用于构建克隆表达载体,但与
巴斯德毕赤酵母相似,这种载体在受体细胞有丝分

基因工程II-外源基因的表达(ppt62)(1)

基因工程II-外源基因的表达(ppt62)(1)
复性与重折叠 :
● 主要任务: 通过次级键的形成使蛋白质复性 将多肽链中被拆开的游离巯基重新折叠
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
◆ 包涵体型表达
复性与重折叠 : ● 复 性:
分段稀释法 一步稀释法 试剂添加法 蛋白修饰法 产物隔离法 分子伴侣法
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
◆ 包涵体型表达
复性与重折叠 : ● 二硫键形成
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
劣势
缺乏蛋白质的复性功能 缺乏蛋白质的修饰加工系统 内源性蛋白酶降解异源蛋白 胞内含多种内毒素
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
外源基因高效表达的原理
启动子 终止子 核糖体结合位点 密码子 质粒拷贝数
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
外源基因高效表达的原理
◆ 启动子
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
◆ 包涵体型表达
包涵体的溶解与变性 : ● 主要任务:拆开错配的二硫键和次级键
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
◆ 包涵体型表达
溶解与变性 :
清洗剂 SDS、正十二醇肌氨酸
● 试剂和条件:
促溶剂 盐酸胍、尿素 混合溶剂
极端pH
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
◆ 包涵体型表达
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
◆ 密码子
密码子偏爱性: 密码子偏爱性对外源基因表达的影响:
策略
外源基因全合成 同步表达相关tRNA编码基因
(一)外源基因在大肠杆菌中的表达
外源基因在大肠杆菌中的表达形式
包涵体型异源蛋白的表达 分泌型异源蛋白的表达 融合型异源蛋白的表达 寡聚型异源蛋白的表达 整合型异源蛋白的表达
化学氧化法 二硫键交换法

外源基因表达与基因工程药物ppt课件

外源基因表达与基因工程药物ppt课件

➢ 生物技术工程: 基因工程、蛋白质工程、酶 工程、细胞工程等
➢ 基因工程(genetic engineering) —— 实现基因 克隆所用的方法及相关的工作称基因工程, 又称重组DNA工艺学。
➢ 目的: ① 分离获得某一感兴趣的基因或DNA ② 获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质)
(二)工具酶
• 粘性质粒(cosmid)
粘性质粒
也称柯斯载体。是带有粘性末端位 点的质粒, 柯斯质粒是人工建造的的含有 λDNA的cos序列和质粒复制子的特殊 类型的质粒载体。
粘性质粒
用于克隆大片段DNA的载体,它是由λ噬菌体 的cos末端及质粒重组而成的载体。cosmid载体带 有质的复制起点、克隆位点、选择性标记以及λ噬 菌体用于包装的cos末端等。
DNA聚合酶Ⅰ
Klenow片段 反转录酶
多聚核苷酸激酶
①合成双链cDNA分子或片段连接 ②缺口平移制作高比活探针 ③DNA序列分析 ④填补3´末端
又名DNA聚合酶I大片段,具有完整DNA聚合酶I的53 聚合、35外切活性,而无53外切活性。常用于 cDNA第二链合成,双链DNA 3末端标记等
①合成cDNA ②替代DNA聚合酶I进行填补,标记或DNA序列分析
Bam HⅠ
GGATCC CCTAGG
GCCTAG+
GATCC G
➢ 分类: Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(基因工程技术中常用Ⅱ型)
➢ 作用: 与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰
系统,限制外源DNA,保护自身DNA。
➢ 命名:
Hin dⅢ
Haemophilus influenzae d株 流感嗜血杆菌d株的第三种酶
催化多聚核苷酸5´羟基末端磷酸化,或标记探针
末端转移酶

外源基因的表达2精品PPT课件

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❖T A A T G T ❖T T A A C T ❖T A T A A T ❖T A T A A T
a) 大肠杆菌的lac启动子
乳糖启动子Plac的可控性:
基底水平转录 阻遏蛋白
野生型的Plac与其控制区Olac
偶联在一起,在没有诱导物
P
存在时,整个操纵子处于基 底水平表达;诱导物可以使 启动子Plac介导的转录大幅
RNA聚合酶保护区 结构基因
5
3
3
5
5
3
-50 -40 -30 -20 -10 1 10
3
5-35 区Biblioteka TTGACA AACTGT
RNA-pol辨认位点 (recognition site)
开始转录 -10 区
T A T A A T Pu A T A T T A Py
(Pribnow box)
原核生物启动子保守序列
❖ T7噬菌体启动子
② 终止子
❖ 外源基因在强启动子的控制下表达,容易发生转录过 头现象,即RNA聚合酶继续转录质粒上邻近的DNA 序列;
❖ 过长的mRNA往往会产生大量无用的蛋白质,增加工 程菌无谓的能量消耗;
❖ 终止子(terminator,T)是给予RNA聚合酶转录终 止信号的DNA序列。
❖ 两类终止子 使用不依赖ρ因子的终止子
❖ 启动子
❖ -35 区序列
❖ -10 区序列
❖ PlL
❖T T G A C A
❖ PtraA ❖ Ptrp ❖ Plac ❖ Ptac
❖T A G A C A ❖T T G A C A ❖T T T A C A ❖T T G A C A
❖ Ptac = 3 Ptrp = 11 Plac
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2.宿主菌 蛋白水解酶缺陷型 菌株如:BL21等
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3.常见大肠杆菌表达系统 ①Lac和Tac标达系统 以lac操纵子调控机 制为基础设计和构建 的表达系统
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阻遏蛋白过量表达
当带lac操纵区的基因多拷贝存在,lacI表达的阻遏蛋 白不够用时,采用阻遏蛋白过量表达突变体
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第二节 基因表达调控元件
1.启动子(promoter) ①序列特异性 ②方向性 顺式调控元件 ③位置特性 转录区上游 ④种属特异性
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(1)原核生物启动子
①转录起始位点 ②Pribnow框 ③Sextama框 ④间隔区
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(2)真核生物启动子
I型启动子 rRNA II型启动子 mRNA
外源基因的表达
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1
第一节 基因表达的机制
1.外源基因的转录 2.mRNA的延伸与稳定性 3.外源基因mRNA的有效翻译 4.表达蛋白在细胞中的稳定性 5.目的基因的沉默
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1.外源基因的转录
启动子类型: 组成型启动子
原核生物T7启动子 诱导型启动子
原核生物lac、trp等
组织特异性表达启动子
受体细胞存在的蛋白水解酶可降解外源蛋白 避免或降低被水解的途径: ①构建融合蛋白表达系统 ②构建分泌蛋白表达系统 ③构建包涵体表达系统 ④选择蛋白水解酶缺陷型受体系统
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5.目的基因沉默 基因沉默(gene silencing) 位置效应 转录水平(TGS) 甲基化 转录后(PTGS) siRNA
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3
2.mRNA的延伸与稳定性
原核生物避免序列存在衰减子(attenuator) 带有正常转录终止序列 受体细胞情况
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trp衰减子
A
B
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带有正常转录终止序列
真核生物要带有转录终止序列与poly(A) 渗入位点 poly(A)渗入信号序列AAUAAA
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受体细胞情况
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一.大肠杆菌表达系统
1.大肠杆菌表达载体 (1)复制子 高拷贝 pMB1、p15A、ColE1等 低拷贝 pSC101等 (2)启动子与终止子
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(3)核糖体结合位点(SD) AGGAGG 翻译起始密码子与SD的距离 SD后为AAAA或UUUU效率最高
(4)密码子 (5)选择标记
外源蛋白基因与受体菌蛋白基因重组,不改变两 个基因的阅读框,表达的蛋白为融合蛋白
A
B
Gene
A
B
N
C Protein
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融合蛋白的优点:
在自身蛋白引导下,形成良好的杂合构象,可很 大程度封闭蛋白水解酶切割位点 某些情况下,具有水溶性和一定生物活性 易于分离纯化
分布位置
主要存在于细胞质中,也存在于细胞周质
构成
主要为表达的外源蛋白,还有RNA聚合酶、核糖
核蛋白体等,此外还包括一些DNA、RNA、脂
多糖等非蛋白成分
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包涵体的形成
①折叠状态的蛋白聚集作用
高表达导致水难溶的折叠态蛋白分子间相互作 用而聚在一起
②非折叠态的蛋白聚集作用
在较高培养温度的细菌中,热稳定性差的蛋白 处于非折叠态,以二硫键等结合在一起
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2.增强子(enhancer) ①双向性 ②重复序列 ③与所处位置无关 ④特异性 ⑤可增强异源基因
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3.终止子(terminator) 常用大肠杆菌rRNA操纵子上的rrnT1T2 噬菌体上TΦ
4.衰减子(attenuator) 5.绝缘子(insulator) 6.反义子(antisense RNA)
密码子偏爱性
主密码子(major codon)
罕用密码子(rare codon)
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翻译终止 UAA UAG UGA
释放因子(release faF2 UAA UGA
真核 两种eRF UAA 终止效率最高
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4.表达蛋白在细胞中的稳定性
TATA框 CAAT框 GC框 III型启动子 tRNA 5SrRNA sRNA
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(3)启动子与转录的启动
原核σ亚基参与起始
真核生物转录启动较复杂
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(4)启动子的分离
①随机克隆法
HindIII EcoRI
②聚合酶保护法
加入聚
A
合酶
B
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AB
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③过滤膜结合法 ④PCR方法
原核生物 最佳选择RNase缺失个体 真核生物 mRNA正确加工,提高稳定性
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3.外源基因mRNA的有效翻译
原核生物
①AUG(ATG)首选起始密码子 ②SD序列 ③SD与起始翻译密码子间合适距离 ④翻译起始区周围不易形成明显的二级结构
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真核生物
具有类似于SD序列的保守区CCA(G)CCATGG 对于翻译效率仍然十分重要
③蛋白折叠中间体的聚集作用
由于折叠中间体的难溶而聚在一起
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包涵体表达的优缺点 包涵体表达的优点: 简化外源表达蛋白的分离 保持表达产物结构稳定
包涵体表达的缺点:
表达的外源蛋白丧失了原有生物活性,必须经过 有效的变性、复性操作,才能得到具有正确空间 构想的活性蛋白体
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融合蛋白
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4.外源基因在大肠杆菌表达的形式 外源基因在大肠杆菌中的表达产物可能 存在于: 细胞质、细胞周质、细胞外培养基
表达蛋白形式 可溶性蛋白 不可溶性蛋白
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包涵体 (inclusion body)表达蛋白
一定条件下,外源基因的表达产物在大肠杆菌中 积累,并致密地聚集在一起,形成无膜的或被膜 的裸露结构
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第三节 外源基因表达系统
原核表达系统 真核表达系统
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目前广泛应用的为原核系统特点
大肠杆菌、芽胞杆菌、链霉菌等
①单细胞、生长快、易控制 ②基因组结构简单 ③含质粒或噬菌体 ④生理代谢途经与基因表达调控比较清楚 ⑤不具备真核生物蛋白加工系统 ⑥内源蛋白酶会降解外源蛋白,表达产物不稳定
lacI突变体lacIq
温度敏感型突变体lacIq(ts)
30°C抑制表达
42°C转录保持开放
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②PL和PR表达系统 cI基因表达蛋白阻遏PL和PR表达 cI基因温度敏感型突变体cI857(ts)
③T7表达系统
T7噬菌体RNA聚合酶高效率转录
在大肠杆菌内,存在T7噬菌体RNA聚合酶
下,T7启动子可高效精转选ppt录
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