pubmed短语检索的3种格式
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Pubmed文献检索
PubMed的特点
• 自动词语匹配 • 链接点多，部分在网上免费获得全文 • 也可以直接定购原文
二、检索规则
（一）Automatic Term Mapping 词汇自动转换
1、 直接输入关键词 MeSH Translation table 例如：Vitamin c 转换为
“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word]
（二）短语检索
• 如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell” “oxygen free radicals”
（三）布尔逻辑运算：
• AND、OR、NOT必须大写。
E-coli AND hamburger；vitamin c OR zinc； trace element NOT zinc
• 例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等 备注：将不执行转换功能； 截词检索只限于单词，对词组无效，
三、检索途径与方法
• • • • 基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 期刊检索 – Journal Search
J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am
高级检索
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检 索 历 史 预 览 检索
清 空
检索字段选择与检索 词填写
增加检索字段
高级检索界面下半部分
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限定检索
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与 高 级 检 索 下 半 部 分 类 似
限定检索下半部分
最后点击
检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”
pubmed基本功能及检索
收录范围
1. MEDLINE
• 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
2. PreMeMdElDiLnIeNE数据库由美国国家医学图书馆 • 是临（时性Na医ti学o文na献l 数L据ib库ra，r每y 天of接收Me新di数c据in，e，经M简eS称H词N表LM标） 引后编，每制周，向是me印dl刷in刊e移《加I一n次de。x Medicus》》（医学索 引）、《Index to Dental Literature》（牙科 • 记录文标献注[索Pu引bMe）d 和- 《in Ipnrtoecersnsa]tiongal Nursing Index》 （国际护理索引）的光盘版，数据摘自3700种期
11单词短语词组检索单词短语词组检索22作者检索作者检索33期刊名称检索期刊名称检索44截词检索截词检索55带逻辑运算符的复合检索式带逻辑运算符的复合检索式读者培训系列讲座之pubmed1313pubmedpubmedpubmedpubmedpubmedpubmed读者培训系列讲座之pubmed1414检索出文章总篇数综述类文献总篇数单词检索系统自动进行转换匹配后生成的检索式读者培训系列讲座之pubmed1515livercancer固定搭配词组检索自动转换匹配后进行逻辑或的运算读者培训系列讲座之pubmed1616短语检索自动转换匹配后的结果读者培训系列讲座之pubmed1717强制短语词组检索针对特定的短语和词组的检索需要在短语或者词组上加上双引号
PubMed检索界面
PubMed基本检索功能
特征栏辅助检索
其他辅助检索 检索结果的处理
显示检索结果(Display) 输出检索结果（send to )
输出到文本（send to Text)
如何使用pubmed进行 文献检索
1997年9月26日， MEDLINE网络版开通， 取名PubMed，并向全球免费开放。
一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间，却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事， 必先利其器"，PubMed就好像一把功能强 大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹，更重要的是，你 要知道如何利用准星瞄准，如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代：1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围：
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表：MeSH（医学主题词表）
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]：出版类型 review[pt]
• Title[TI] ：文章题名 • Text Words[TW]：文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词，PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换，然后进行检索。 ① MeSH表：包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表： 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表：文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表： PubMed所收录的的作者姓名组成。
一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间，却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事， 必先利其器"，PubMed就好像一把功能强 大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹，更重要的是，你 要知道如何利用准星瞄准，如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代：1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围：
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表：MeSH（医学主题词表）
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]：出版类型 review[pt]
• Title[TI] ：文章题名 • Text Words[TW]：文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词，PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换，然后进行检索。 ① MeSH表：包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表： 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表：文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表： PubMed所收录的的作者姓名组成。
pubmed检索方法与技巧
6.1 结果的显示
（3）MEDLINE：以MEDLINE数据库的记录格 式来显示检索结果。字段内容主要包括PMID、 题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版 类型、出处、MeSH、文献ID、出版状态等。
6.1 结果的显示
6.1 结果的显示
6.2 检索结果的保存
保存记录 在“send to”下拉菜单中选择“File”，可完 成将记录保存为文件。 选择“E-mail”，则可将结果发送至邮箱。 在检索结果显示页面可将某一次检索的全部 记录或标记记录保存；而“Clipboard”页面 可用于保存一次或多次检索的结果记录。
In Process Citations：每天收录，尚 未经规范处理的数据。[pubmed-in process]
Publisher-Supplied Citations：由出 版商提供的电子文献，每条记录标有 [PubMed-as supplied by Publisher]。
3. PubMed检索机制
("humans"[MeSH Terms] OR "humans"[All Fields] OR "human"[All Fields]) AND recombinant[All Fields] AND ("trefoil factor"[Supplementary Concept] OR "trefoil factor"[All Fields])
第2步：检索白血病/药物疗法
主题检索举例： 长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献
5.4 临床咨询和系统评价
可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献，如临 床疾病的诊断、治疗、病因和预后等；
PUBMED数据库检索
PubMed - indexed for MEDLINE
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
PUBMED具有自动词语匹配功能，系统将按顺 序自动使用如下3种索引，对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词，系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献？
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录
总
结
充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索，重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
PUBMED具有自动词语匹配功能，系统将按顺 序自动使用如下3种索引，对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词，系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献？
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录
总
结
充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索，重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
NCBIPubMed检索简介与检索技巧集锦
NCBI PubMed检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入Pu bMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therap y"[MESH]>。
PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, Nation al Institu es of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medici n e）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, Nation al Center for Biotec hnol o g y Inform a tion）提供，可通过NCBI网站的E n trez检索系统（E ntrez retrie val system）进行MED L I NE和P reMED LINE引文数据库的在线免费检索。
此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。
PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。
Pubmed检索方法(技术材料)
基本检索
高级检索
主题检索
期刊检索
专用检索
技术研究
32
主题检索
技术研究
33
MeSH Database：
例1：从主题途径查找FK506副作用 例2：从主题途径查找肾移植的文献 例3：从主题途径查找阿司匹林治疗高血压的
文献
技术研究
34
检索流程 第一步：主题分析 英文转换
FK506 adverse effects
技术研究
43
第四步： search box
点击 search PubMed
检索结果
技术研究
44
search box
技术研究
45
题录格式界面
技术研究
46
逻辑组配（#4 and #6）
技术研究
47
技术研究
48
例：检索利用阿司匹林治疗高血压的文 献。
分析：本课题包含两个主题词，即阿司 匹林（aspirin)和高血压 (hypertension)，阿司匹林（aspirin) 组配副主题词治疗应用（theraputic use)，高血压应组配副主题词药物疗法 （drug therapy)，两条检索式之间用 and联接。
加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构） 选择合适的副主题词
选择加权或不扩展
send to
技术研究
40
主题词细节屏
主题词细节屏 主题词词义注释
主题词词义注释 副主题词选择
技术研究
加权检索 不扩展检索 41
入口词
曾用词 曾用词
药理作用 药理作用
树状结构
树状结构
技术研究
42
选择发送方式 Search Box with AND Search Box with OR Search Box with NOT
PubMed 医学文献检索
（2）刊名转换表（Journal Tanslation Table）
包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。 该转换表能把键入的刊名全称转换为 “MEDLINE缩写[Journal Name]”后进行检索。 如：在检索提问框中键入：“new England journal of medicine”, PubMed将其转换为“N Engl J Med [Journal Name]”后进行检索。
PubMed系统是用于检索MEDLINE、PreMEDLINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国 国立医学图书馆最重要的书目文摘数据库，内 容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生 保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和 地区的4500余种生物医学期刊，现有书目文摘 条目1700万余条，时间起自1950s。
PubMed 网上更新速度是每周一次。 PubMed数据库收录的文献大多数原始语 种也是英语，或有英文摘要，但1975年 以前的文献无英文摘要。
一、辅助检索功能
辅助检索功能包括条件限定【Limits】、预 览/索引【Preview/Index】、检索史【History】 和粘贴板【Clipboard】4种功能设置。
三、批量文献匹配
四、词汇自动转换功能 （Automatic Term Mapping） ）
在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按 顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检 索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括 MeSH MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发 现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的 MeSH词和Text Word词（题名词和文摘词）进行检索。 例如：键入“Pancreatic cancer”，系统将其转换成 “Panreatic Neoplasms[MeSH Terms] OR Pancreatic cancer[Text word]”后进行检索。
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pubmed短语检索的3种格式
在PubMed中进行短语检索有三种格式：
1. 短语用英文双引号括住：例如，输入"词组"进行检索，PubMed将只匹配含有与"词组"完全一致的检索结果。
2. 使用截词符号*：例如，输入kidney transplant*进行检索，PubMed将匹配含有kidney transplantation、kidney transplants等词组的检索结果。
需要注意的是，只有在词组后面添加*号，才不会进行ATM（Automatic Term Mapping，自动主题词映射）。
3. 使用字段检索：在检索词后面加上[字段标识符]，例如，输入kidney transplantation[title]进行检索，PubMed将只匹配标题中包含kidney transplantation的检索结果。
具体的字段标识符包括：论文主题字段，如标题、关键词等；作者相关字段；期刊字段，如刊名、卷期号等；图书字段；数据库及其它字段，论文被数据库收录后，数据库赋予的标记；主题相关字段。