pubmed文献查询

免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
PubMed简介——是什么？
MEDLINE：[pubmed-indexed for medline]
数据来源
Publisher-Supplied Citations：出 版商提供的电子文献 [PubMed-as supplied by Publisher]。 In Process Citations：每天收录， 尚未经规范处理的数据。 [pubmed-in process]
[注] 截止2006年3月15日PubMed公布的数据
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围

OldMedline


1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] 标记表示。
PubMed简介——是什么？
Biotin的款目词。
PubMed检索方法——怎么用？
2. 布尔逻辑运算符
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B （AIDS and therapy）
A B 布尔逻辑组合 检索，常用的 逻辑关系词有 AND，OR， NOT等
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B （ AIDS or Acquired Immunodeficiency SFra Baidu bibliotekndrome） A B
PubMed简介——是什么？

NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么？

生物数据库 永久数据的大的组织体 结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。 容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息 Entrez： NCBI的数据库搜寻与存取系统，可 用来获取单一数据库或许多数据库的整合数 据。 目前，NCBI提供的公开（Open Access）数据 库包括如下：
文摘型数据库PubMed 检索方法与技巧
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed简介——是什么？



创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI) 1996年1月开始向全球开放 特色：免费、收录广、内容全、检索途径多、 检索体系完备、 文摘库，部分文献还可在网 上直接免费获得全文。 http://pubmed.gov
PubMed简介——是什么？
PubMed简介——是什么？

NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么？
Entrez 一个整合的访问序列，定位，分类和结构数据的搜索和检索 系统。 整合的数据库包括核酸序列，蛋白序列，大分子结构，全基 因组，和通过PubMed检索的MEDLINE。 可以检索相关的序列，结构和参考文献。
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围

MEDLINE



4800余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理 、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等 学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国 家和地区。 文献量达1千2百多万条记录，并回溯到1966年 。 记录中用[PubMed-indexed for MEDLINE]标记 表示
PubMed简介——是什么？
Entrez可以检索的数据库：




Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人类遗传疾病相关文献数 据库 PopSet，族群演化分析相关研究资料 Protein sequence database，蛋白质序列数据库（包含Swiss-Prot、 PIR、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质 序列资料） PubChem BioAssay，化学成分之生物活性筛选资料 PubChem Compound，小分子化学物质结构 PubChem Substance，具生物活性之化学物质筛选数据 PubMed，科学文献报导数据库 PubMed Central，科学文献数字全文数据库 Site Search，可搜寻NCBI的网页与FTP SNP，单点核酸多样性数据库(dbSNP) Structure，分子模型数据(MMDB) Taxonomy，以核酸或蛋白质为基础的分类学信息 UniGene，人类unique基因序列数据库 UniSTS，unique序列卷标地址数据库
检索词输入框
Welcome to PubMed
使用帮助
常用工具
更多服务
PubMed检索方法——怎么用？
限制检索 基本检索 主题检索
高级检索
临床咨询
PubMed检索方法——怎么用？
一.基本检索
默认检索字段 为主题、作者、 期刊
PubMed检索方法——怎么用？
一.基本检索

关键词、词(词组)或短语： ⑴ 输入任意关键词：liver cancer、Lung cancer； ⑵ 带有双引号“ ”作为短语检索：“cancer therapy”； ⑶ 带有连接号“-”作为一个词组检索：interleukin-6。 限制检索字段：如liver cancer[ti] 作者：Smith J 、
PubMed简介——是什么？
Entrez可以检索的数据库：

Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database（CDD），蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains，蛋白质功能区块立体结构数据 Gene，包含许多物种的基因数据库 Genome，包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT，小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets，基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles，基因表现图谱 HomoloGene，同源基因批注数据库 Journals，期刊文献（包含PubMed） MeSH，医学主题词数据库 NCBI Web Site，所有NCBI网页 NLM Catalog，美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database，核酸序列数据库（包含GenBank、RefSeq 和PDB等三大序列数据库）
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B（ Hepatitis not Animal） A B
PubMed简介——怎么用？ PubMed检索方法——怎么用？ 3. 检索方法

基本检索 高级检索 限制检索 主题检索 临床咨询
www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed


出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录 记录中用[PubMed-as supplied by publisher]标 记表示。
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围

PubMed not Medline

PubMed收录Medline不收录的文献。 记录中用[PubMed]标记表示。
BLAST 序列相似搜索程序，还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。 在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。 附加软件工具 开放阅读框寻觅器（ORF Finder），电子PCR，序列提 交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以 从HTTP或FTP来获得。
PubMed简介——是什么？

NCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心) 目前国际上几个重要分子生物信息网站之一 成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性 1988年11月4日成立 是National Institutes of Health（NIH 美国国立卫 生研究院）底下的National Library of Medicine（ NLM 美国国立医学图书馆）的部门之一 NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。
PubMed特色服务——能干什么？

Pubmed小工具
①
跟踪某一领域的最新进展——Cubby（My NCBI)
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed检索方法——怎么用？ 1. 检索机制

如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有 自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者 对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序 索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复 包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例 如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词， 上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组 进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺 PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中 如，如果你输入“New England Journal of Medicine”， 的每个单词用`AND’组配并在所有字段中查找。 序是： 多次出现的常用词组表， PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。

1. 要注册账号 http://www.medlive.cn/pubmed/pubme 2. 英文检索
d_search.jsp（汉化）
PubMed简介——是什么？
新版PubMed首页 特色： 简洁、清新 检索速度较快
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围


数据类型：期刊论文、综述以及与其他数 据资源链接。 特点：
PubMed简介——是什么？
数据来源
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed特色服务——能干什么？
1. 查文献：查找目的文献的文摘题录信息— —书目文摘条目2千万余条，每年约增加50 万条（2011年数据） 2. 找全文： ① 获得部分文献的全文——PMC（Pubmed Center）可提供部分文献的全文 ② 提供可以获得全文的网站和数据库链接— —Linkout 3. 扩展阅读：提供相关文献链接—— Related citations

MeSH表 期刊刊名注释表 短语表 作者索引 MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参 短语检索(Phrase Searching) 照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果 ” 要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ 输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被 将其引起来。 作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如， 如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系 如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin 统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。 ［MeSH］OR vitamin h［tw］)——vitamin h是MeSH词
PubMed数据范围

In process citation


提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 获MeSH词后，再加入MEDLINE。 记录中用[PubMed-in process]标记表示。
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围

Publisher Supplied Citations