pubmed文献查询
Pubmed文献检索
PubMed的特点
• 自动词语匹配 • 链接点多，部分在网上免费获得全文 • 也可以直接定购原文
二、检索规则
（一）Automatic Term Mapping 词汇自动转换
1、 直接输入关键词 MeSH Translation table 例如：Vitamin c 转换为
“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word]
（二）短语检索
• 如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell” “oxygen free radicals”
（三）布尔逻辑运算：
• AND、OR、NOT必须大写。
E-coli AND hamburger；vitamin c OR zinc； trace element NOT zinc
• 例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等 备注：将不执行转换功能； 截词检索只限于单词，对词组无效，
三、检索途径与方法
• • • • 基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 期刊检索 – Journal Search
J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am
高级检索
点击
高级检索界面
检 索 历 史 预 览 检索
清 空
检索字段选择与检索 词填写
增加检索字段
高级检索界面下半部分
点击
限定检索
点击
与 高 级 检 索 下 半 部 分 类 似
限定检索下半部分
最后点击
检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”
用PUBMED查文献方法
先给大家一段查询语言：(myocardial[Title/Abstract] AND infarction[Title/Abstract]) AND ("loattrfull text"[sb] AND"2008/09/26"[PDat] : "2009/09/25"[PDat] AND English[lang] AND Review[ptyp])。
能看懂吗，是不太复杂了？其实就是查询近一年的关于心肌梗死的英文综述。
所幸的是，我们不需要记这样的查询语言，有了PubMed，我们完全可以简单的操作就可查到想要的目标文献。
呵呵，有点像做广告哈。
先介绍一下pubmedPubMed包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容。
它还包括一些被MEDLINE认为超出范围的文章和杂志，（这些文章或杂志）由于内容或在某一时期不在索引范围内。
因此PubMed是比MEDLINE的更大的集合。
看一下它所收录的数据库：PubMed现已有19 million文章信息（文章的名称，发布日期杂志，摘要，全文链接以及与要查询内容相关的文章），最早的文章可追塑到1948年。
另外，PubMed Central还能提供大概300000篇免费全文。
因此，PubMed是科研过程中文献查找的一个最重要的工具，就我个人而言，一般是先在PubMed中找到全文链接，然后再上相应的数据库查找。
下面我们就一步步的教大家如何有效应用该资源。
首先，进入PubMed的首页面，网址是/pubmed/,如果从NCBI首页进入，Search 的地方选择PubMed就可进入了。
页面介绍：最上面一行为查询框，在首页的文字部分给出了三种查询方式：1、topic主题检索。
很简单，在查询框输入主题词（如：心肌梗死myocardial infarction），点右边的“go”就OK了；2、authors著者检索。
医学文献检索(PubMed)
检索方法
基本检索 (search)：主界面默认的检索方法
自动词语匹配 （Automatic Terms Mapping） 精确检索 截词检索 字段限定检索 著者检索 期刊检索 逻辑组配检索
Part 2 检索方法 基本检索-自动语言匹配
对输入的有实际意义的检索词、短语，系统会自动进行词语 的匹配转换，并返回检索结果。 匹配原理 输入的检索词、短语依次在多个词表（MeSH转 换表、刊名转换表、著者转换表、著者索引表、合作者转换 表及合作者索引表）中进行搜索、比对，并自动转换为相应 的MeSH词、刊名或著者，再将短语、构成短语的单词分别 在所有字段中检索，输出检索结果。
美国医学文献数据库 PubMed
主要内容
Part 1 Part 2 Part 3 Part 4
了解 PubMed 检索方法
检索结果的解读与处理 同类推荐
Part 1
了解PubMed
P美国国立医学图书馆 NCBI 美国国立生物技术信息中心
检索出篇名中出现 糖尿病的综述文献
Part 2 检索方法 基本检索-著者检索
在检索框中输入著者姓名时，通过“自动词语匹配”，系统 会自动执行著者检索。
检索2002年前的论文时要求姓前名后，姓用全称，名用首字母缩写。 2002年以后的论文还可用姓和名的全称检索，且前后顺序不限。
使用著者字段进行限定检索可实现特殊的检索要求。如检索 某著者作为第一作者或排名最后的作者发表的论文时，即可 用字段限定检索来实现。
临床试验(Clinical Trials) 点击Clinical Trials进入Clinical 页面， 可检索来自全球178个国家的12万个实验信息。
临床查询(Clinical Queries) 专为医生设计的检索服务，输入疾病名称后， 可选择查询临床研究分类（Clinical Study Categories）、系统评价 （Systematic Reviews）和医学遗传学（Medical Genetics）三大类文献， 仍可再细分。
PubMed检索系统
系统特点
1.检索词自动转换功能(Automatic Term Mapping) 1.检索词自动转换功能 2.截词检索功能 2.截词检索功能 3.强制检索功能 3.强制检索功能 4.链接功能 4.链接功能
词汇自动转换功能
(1) MeSH转换表 转换表
包括MeSH词、参见词、副主题词等。例如：键入 词 参见词、副主题词等。例如： 包括 “Vitamin h”，系统将其转换成 ，系统将其转换成detail("biotin"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "biotin"[MeSH Terms] OR Vitamin h[Text Word]后进行检索。 后进行检索。 后进行检索 (2)刊名转换表 : 包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和 刊名转换表 包括刊名全称、 形式的缩写和 ISSN号。Stud mycol 号
PubMed检索系统 PubMed检索系统
/entrez
概况
由美国国立生物技术信息中心 NCBI） （NCBI）开发的网上免费的生物医学 文献检索系统。 文献检索系统。
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
数据来源
Medline。[PubMed - indexed for MEDLINE ] 。 PreMEDLINE。未经标引的新记录，标有 。未经标引的新记录， [PubMed标识。 [PubMed-in process]标识。这些数据经标引和 标识 加工后每周 每周向 提供一次更新。 加工后每周向MEDLINE提供一次更新。 提供一次更新 Publisher Supplied Citation。出版商直接向 。 PubMed递送的电子记录，每条均标有 递送的电子记录， 递送的电子记录 [PubMed- as supplied by publisher] PubMedPubMed
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法（实用版4篇）目录（篇1）I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.可用于生物医学领域C.pubmed的局限性1.搜索结果可能不准确2.检索结果可能过于广泛3.需要具备一定的生物医学知识III.pubmed的应用场景A.科研人员1.检索最新研究成果2.了解疾病机制3.确定研究方向B.医学专业学生1.学习专业知识2.查找相关病例3.进行学术论文写作C.普通读者1.了解疾病症状和治疗方法2.查找相关疾病信息3.获取健康生活建议正文（篇1）pubmed是一种非常实用的生物医学文献检索工具，可以帮助用户快速查找、浏览和筛选与特定主题相关的文章。
目录（篇2）I.检索PubMed的目的和意义II.PubMed检索的方法和技巧III.PubMed检索的应用和价值正文（篇2）一、检索PubMed的目的和意义PubMed是一个广泛使用的生物医学文献数据库，可以检索到全球最新的研究成果。
对于需要了解某个领域最新进展的研究者来说，PubMed 的检索方法非常重要。
正确的PubMed检索方法可以帮助研究者快速、准确地找到自己需要的文献。
二、PubMed检索的方法和技巧1.关键词检索：在PubMed中，可以通过输入关键词来检索相关文献。
关键词的选择应该准确、全面，能够涵盖研究主题。
例如，如果要检索关于某种疾病的治疗方法，可以输入“疾病名称 treatment”。
2.高级检索：PubMed提供了高级检索功能，可以根据研究的时间、来源、语种等进行筛选。
高级检索可以帮助研究者更快地找到符合自己需求的文献。
3.检索限制：在PubMed中，可以通过设置检索限制来排除不相关的文献。
例如，可以设置时间限制、主题限制等。
4.浏览相关文章：在PubMed中，可以通过浏览相关文章来了解某个研究领域的整体情况。
pubmed 文献调研 组合检索
pubmed 文献调研组合检索Pubmed是一个由美国国立卫生研究院（NIH）开发的生物医学文献数据库，收录了全球范围内的生物医学文献，包括医学、生物学、生物化学、生理学、药学等领域的文献。
在进行文献调研时，组合检索是一种常用的方法，可以帮助我们更快速、准确地找到所需的文献。
组合检索是指将多个关键词或者检索词组合在一起进行检索，以缩小检索结果的范围，提高检索的准确性。
在使用Pubmed进行文献检索时，我们可以使用以下几种组合检索的方法：1. AND检索：将多个关键词用AND连接起来，表示同时包含这些关键词的文献。
例如，我们想要查找关于“心脏病”和“高血压”的文献，可以使用“heart disease AND hypertension”进行检索。
2. OR检索：将多个关键词用OR连接起来，表示包含其中任意一个关键词的文献。
例如，我们想要查找关于“心脏病”或“高血压”的文献，可以使用“heart disease OR hypertension”进行检索。
3. NOT检索：将一个关键词用NOT连接起来，表示不包含该关键词的文献。
例如，我们想要查找关于“心脏病”的文献，但是不想包含“高血压”的文献，可以使用“heart disease NOT hypertension”进行检索。
4. 括号检索：使用括号可以改变检索词的优先级，使得检索结果更加准确。
例如，我们想要查找关于“心脏病”和（“高血压”或“糖尿病”）的文献，可以使用“heart disease AND (hypertension OR diabetes)”进行检索。
除了以上几种组合检索的方法，我们还可以使用通配符、引号、限定词等方式进行检索，以更加精确地找到所需的文献。
在使用Pubmed进行文献检索时，我们需要注意以下几点：1. 关键词的选择：选择合适的关键词可以帮助我们更快速地找到所需的文献。
关键词应该具有代表性、准确性和广泛性。
2. 检索词的组合：合理地组合检索词可以缩小检索结果的范围，提高检索的准确性。
pubmed检索英文文献的步骤
pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献，可以按照以下步骤进行：1. 访问PubMed网站，打开浏览器，输入"/pubmed"，进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题，明确你感兴趣的研究主题，可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索，在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的，以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项，如果你想进一步精确搜索结果，可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮，可以在更多的搜索字段中输入关键词，如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果，当你点击搜索按钮后，PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围，如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文，在搜索结果中，你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述，帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文，可以直接阅读，而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献，如果你找到了感兴趣的文献，可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献，在每篇文献的页面上，你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助，可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒，PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录，搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来，PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献，以及利用检索历史和搜索提醒功能。
新版PubMed文献检索
Search Details框详细显示自动词语匹配的实际 检索式 有较好的查全率，同时保证一定的查准率
例如，查找阿司匹林防治心肌梗死的文献，最简单 的方法是在检索框中直接输入heart attack aspirin三个词，系统即进行自动词语匹配检索， Detail栏目显示PubMed实际执行的检索式为
高级检索
基本检索
登录 My NCBI
PubMed主页面
自动词语匹配检索(Automatic Terms Mapping) 输入有实际意义的检索词，点击“Search”，系 统按照自动词语匹配的原理进行检索 PubMed最具特色的检索功能之一
智能化的检索过程 基本原理：对输入的检索词，首先在多个索引词表进 行搜索、比对，并自动转换为相应的MeSH主题词、著 者或刊名，再将检索词在all fields（所有字段）中检索， 并执行“OR”逻辑运算。如有多个检索词或短语词组， 则继续将其拆分为单词后分别在all fields（所有字段） 中检索，单词之间的逻辑关系为“AND”
注意：用MeSH词检索时，只检索来源于 MEDLILNE的文献，不检索PubMed其他来源的文 献（包括in-process， supplied by publisher, OLDMEDLINE等）
选定检索词后进行 布尔逻辑运算
PubMed的索引检索
MeSH主题词检索（MeSH） MeSH主题词检索是PubMed最具特色的检索功能 之一，能保证较好的查全率和查准率
主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范 主题词可以组配相应的副主题词，使检索结果更加专指 主题词的树状结构表：系统默认对含有下位概念的主题词 进行扩展检索（点选Do Not Explode this term则不进行 扩检） 应用Major Topic（主要主题词）检索，可以使检索结果 更加准确
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
PubMed检索方法——怎么用？
2. 布尔逻辑运算符
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B （AIDS and therapy）
A B 布尔逻辑组合 检索，常用的 逻辑关系词有 AND，OR， NOT等
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B （ AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome） A B
出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录 记录中用[PubMed-as supplied by publisher]标 记表示。
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
PubMed not Medline
PubMed收录Medline不收录的文献。 记录中用[PubMed]标记表示。
PubMed简介——是什么？
数据来源
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed特色服务——能干什么？
1. 查文献：查找目的文献的文摘题录信息— —书目文摘条目2千万余条，每年约增加50 万条（2011年数据） 2. 找全文： ① 获得部分文献的全文——PMC（Pubmed Center）可提供部分文献的全文 ② 提供可以获得全文的网站和数据库链接— —Linkout 3. 扩展阅读：提供相关文献链接—— Related citations
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B（ Hepatitis not Animal） A B
PubMed简介——怎么用？ PubMed检索方法——怎么用？ 3. 检索方法
基本检索 高级检索 限制检索 主题检索 临床咨询
/pubmed
PubMed特色服务——能干什么？
Pubmed小工具
①
跟踪某一领域的最新进展——Cubby（My NCBI)
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed检索方法——怎么用？ 1. 检索机制
如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有 自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者 对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序 索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复 包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例 如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词， 上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组 进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺 PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中 如，如果你输入“New England Journal of Medicine”， 的每个单词用`AND’组配并在所有字段中查找。 序是： 多次出现的常用词组表， PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。
[注] 截止2006年3月15日PubMed公布的数据
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
OldMedline
1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] 标记表示。
PubMed简介——是什么？
PubMed简介——是什么？
Entrez可以检索的数据库：
Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database（CDD），蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains，蛋白质功能区块立体结构数据 Gene，包含许多物种的基因数据库 Genome，包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT，小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets，基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles，基因表现图谱 HomoloGene，同源基因批注数据库 Journals，期刊文献（包含PubMed） MeSH，医学主题词数据库 NCBI Web Site，所有NCBI网页 NLM Catalog，美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database，核酸序列数据库（包含GenBank、RefSeq 和PDB等三大序列数据库）
文摘型数据库PubMed 检索方法与技巧
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed简介——是什么？
创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI) 1996年1月开始向全球开放 特色：免费、收录广、内容全、检索途径多、 检索体系完备、 文摘库，部分文献还可在网 上直接免费获得全文。
免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
PubMed简介——是什么？
MEDLINE：[pubmed-indexed for medline]
数据来源
Publisher-Supplied Citations：出 版商提供的电子文献 [PubMed-as supplied by Publisher]。 In Process Citations：每天收录， 尚未经规范处理的数据。 [pubmed-in process]
MeSH表 期刊刊名注释表 短语表 作者索引 MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参 短语检索(Phrase Searching) 照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果 ” 要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ 输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被 将其引起来。 作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如， 如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系 如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin 统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。 ［MeSH］OR vitamin h［tw］)——vitamin h是MeSH词
PubMed简介——是什么？
NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么？
生物数据库 永久数据的大的组织体 结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。 容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息 Entrez： NCBI的数据库搜寻与存取系统，可 用来获取单一数据库或许多数据库的整合数 据。 目前，NCBI提供的公开（Open Access）数据 库包括如下：
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
MEDLINE
4800余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理 、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等 学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国 家和地区。 文献量达1千2百多万条记录，并回溯到1966年 。 记录中用[PubMed-indexed for MEDLINE]标记 表示
PubMed数据范围
In process citation
提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 获MeSH词后，再加入MEDLINE。 记录中用[PubMed-in process]标记表示。
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
Publisher Supplied Citations
PubMed简介——是什么？
NCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心) 目前国际上几个重要分子生物信息网站之一 成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性 1988年11月4日成立 是National Institutes of Health（NIH 美国国立卫 生研究院）底下的National Library of Medicine（ NLM 美国国立医学图书馆）的部门之一 NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。
检索词输入框
Welcome to PubMed
使用帮助
常用工具
更多服务
PubMed检索方法——怎么用？
限制检索 基本检索 主题检索
高级检索
临床咨询
PubMed检索方法——怎么用？
一.基本检索
默认检索字段 为主题、作者、 期刊
PubMed检索方法——怎么用？
一.基本检索
关键词、词(词组)或短语： ⑴ 输入任意关键词：liver cancer、Lung cancer； ⑵ 带有双引号“ ”作为短语检索：“cancer therapy”； ⑶ 带有连接号“-”作为一个词组检索：interleukin-6。 限制检索字段：如liver cancer[ti] 作者：Smith J 、
BLAST 序列相似搜索程序，还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。 在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。 附加软件工具 开放阅读框寻觅器（ORF Finder），电子PCR，序列提 交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以 从HTTP或FTP来获得。