竹子遗传育种研究进展
基于RAD-seq_的菜心InDel_标记开发及应用

广东农业科学Guangdong Agricultural Sciences 2024,51(3):91-102 DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2024.03.009许玉富,黄依琳,李荣华,黄红弟,郭少龙,李光光,郭培国,夏岩石. 基于RAD-seq的菜心InDel标记开发及应用[J]. 广东农业科学,2024,51(3):91-102.XU Yufu, HUANG Yilin, LI Ronghua, HUANG Hongdi, GUO Shaolong, LI Guangguang, GUO Peiguo, XIA Yanshi. Development and application of InDel markers in flowering Chinese cabbage based on RAD-seq[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2024,51(3):91-102.基于RAD-seq的菜心InDel标记开发及应用许玉富1,黄依琳1,李荣华1,黄红弟2,郭少龙2,李光光3,郭培国1,夏岩石1(1.广州大学生命科学学院/广东省植物适应性与分子设计重点实验室,广东 广州 510006;2.广东省良种引进服务公司,广东 广州 510091;3. 广州市农业科学研究院,广东 广州 510308)摘 要:【目的】开发多态性丰富的的InDel分子标记,为菜心育种提供研究基础。
【方法】以Chiifu-401-42的基因组序列为模板,利用4份菜心材料的RAD-seq重测序数据,在全基因组范围内鉴定InDel位点。
利用生物信息学方法筛选4份菜心材料间具有潜在多态性的InDel 位点,挑选分布于10条染色体的80个InDel 位点设计引物,对55份菜心种质材料进行遗传多样评价。
【结果】通过与参考基因组序列比对,在4份菜心材料的重测序数据中共鉴定出84 510个InDel位点,其中插入/缺失长度大于5 bp的3 609个InDel位点在4份菜心材料间具有潜在多态性。
肌肉生长抑制素基因在重要经济动物育种中的研究进展

2023·05XUMUSHOUYI 畜牧兽医摘要:肌肉生长抑制素(myostain ,MSTN )又称生长分化因子8,是转化生长因子-β超家族的一员,是动物体正常运作所必需的蛋白质,也是肌肉发育的负性调节因子,决定了动物的整体肌肉质量。
由于MSTN 的突变,许多大型动物,包括牛、羊、狗和人类,都表现出“双肌”表型。
本文首先概述MSTN 的结构特征、表达规律、生物学功能和作用机制,然后介绍了肌肉抑制素基因的多态性在动物育种领域的重要意义,以及MSTN 基因编辑技术在牛、羊、猪等经济动物生产中的应用情况。
关键词:肌肉生长抑制素;双肌表型;多态性;基因编辑肌肉性状是影响畜牧生产中的重要经济性状,提高家畜肌肉品质是家畜育种工作者的毕生追求。
肌肉生长抑制素(myostain ,MSTN ),又名生长分化因子8(growth and differentiation factor 8,GDF8),是目前唯一明确的对骨骼肌生长发育和再生起负向调节作用的分泌性糖蛋白,对肌肉发育和稳态维持都起着重要作用,其自然突变或敲除导致的蛋白功能失活或者表达量下降都会导致肌肉异常发达,反之,其表达上升则会引起肌肉萎缩。
MSTN 缺失型家畜骨骼肌重量增加,使得肌肉与其他组织相比,比例大大提高。
自然界中存在MSTN 天然突变体动物:如比利时蓝牛、皮埃蒙特牛、特克赛尔羊,其肌肉异常发达的“双肌”表型引起了遗传育种研究领域的高度关注。
1MSTN 基因的结构特征MSTN 基因编码的MSTN 蛋白因其具有转化生长因子β(transforming growth factor beta )超家族的典型结构特征而成为了TGF -β超家族的成员之一,但相较于其他家族成员,其C 端的氨基酸序列要更短一些。
MSTN 基因在不同物种中结构相似且高度保守,包括三个相似大小的外显子以及两个内含子,但其在不同脊椎动物物种中的染色体定位并不相同。
MSTN 位于人、黑猩猩、牛、绵羊和山羊的2号染色体上,位于小鼠1号染色体上,位于大鼠9号染色体上,位于猪15号染色体上,位于马18号染色体,位于狗37号染色体,而兔、鸡的该基因定位在7号染色体。
水稻基因组和遗传育种的研究进展

水稻基因组和遗传育种的研究进展水稻,作为世界上最为重要的粮食作物之一,一直以来都受到人们的重视。
为了提高水稻的产量和质量,科学家们不断探索水稻的基因组和遗传育种,取得了许多研究进展。
第一部分:水稻基因组的研究进展1.1高质量水稻基因组测序和注释2002年,国际水稻基因组组织(IRGSP)启动了水稻基因组测序工作,历时十年,于2012年公布了高质量水稻基因组序列。
该项目不仅提供了水稻基因组的底图,也为全球的水稻研究工作提供了重要的资源。
除了基因组测序,对基因组的注释也至关重要。
2018年,中国、日本、美国等国的科学家们联合发表了一篇名为“HostPathogen”(Waxman),通过整合多种表达组学数据,对水稻基因组的注释进行了更新,共发现了14614个新的基因,有效地促进了水稻基因组研究的深入。
1.2水稻基因组结构和功能特点的研究水稻基因组大小为389Mb,包含大约4.29万个基因。
其中,基因密度比拟其他植物要大,基因的组织分布也呈现出显著的区分。
此外,水稻的基因序列中还含有许多支配了基因表达和基因功能的调控因子,如调控元件、非编码RNA等。
这些结构和特点的研究有助于更深层次的解析水稻的遗传机制。
第二部分:水稻遗传育种的研究进展2.1利用基因编辑技术改良水稻水稻主要遗传特征的研究为利用基因编辑技术改良水稻提供了核心思路。
近年来,科学家们通过CRISPR-Cas9等基因编辑技术,针对水稻各个方面的遗传特征进行了深入的研究。
其中具有代表性的成果有:(1)使水稻茎粗略化的“SNU-16”基因的敲除,使其茎干更粗壮,抗风能力更强;(2)针对水稻的“脱粒非白化”基因进行靶向基因编辑,在保持其他基因不变的情况下,成功实现了水稻产量的提升。
2.2水稻病虫害抗性的研究水稻的病虫害是影响水稻丰产的主要因素之一。
研究表明,水稻的病虫害抗性主要由多个基因共同作用而得。
因此,为了实现水稻病虫害抗性的提升,科学家们也探寻了许多新的遗传调控方法。
作物遗传育种论文参考文献范例

作物遗传育种论文参考文献一、作物遗传育种论文期刊参考文献[1].近15年国家自然科学基金稻、麦类作物遗传育种领域项目申请情况分析.《作物学报》.被中信所《中国科技期刊引证报告》收录ISTIC.被北京大学《中文核心期刊要目总览》收录PKU.2015年5期.邹华文.王道杰.边秀秀.商海红.杨新泉.[3].怎样教好作物遗传育种精品课.《职业教育(下旬)》.2014年12期.尹春.王雪玉.侯建华.[4].湖南农业大学作物遗传育种专业研究生学位论文分析.《中国农学通报》.被中信所《中国科技期刊引证报告》收录ISTIC.被北京大学《中文核心期刊要目总览》收录PKU.2008年4期.罗红兵.袁名安.罗水清.[5].地方高校重点学科建设的探索与实践——以宜春学院作物遗传育种学科为例.《宜春学院学报》.2015年6期.焦茂兴.李润根.刘苏铭.刘小林.[6].我国作物遗传育种学科的发展现状与“十三五”发展重点.《河北农业科学》.2015年6期.张江丽.董文琦.杜晓东.[7].科研与教学相互促进,全面提高作物遗传育种学教学质量.《考试周刊》.2012年58期.林小虎.杜利强.郭振清.孟俊青.郭俊良.董洪平.东方阳.[8].高职院校《作物遗传育种》课程教学改革的研究.《环球市场信息导报》.2014年10期.付艳.[9].作物遗传育种研究进展Ⅲ.作物基因工程与基因组编辑.《作物研究》.被中信所《中国科技期刊引证报告》收录ISTIC.2014年3期.刘忠松.[10].单核苷酸多态性在作物遗传育种中的研究.《安徽农学通报》.2012年23期.邹枚伶.王海燕.卢诚.王文泉.二、作物遗传育种论文参考文献学位论文类[1].玉米籽粒品质性状QTL定位及其遗传相关研究.被引次数:7作者:王延召.作物遗传育种河南农业大学2007(学位年度)[2].利用SSR标记分析玉米自交系的遗传多样性.被引次数:8作者:孙友位.作物遗传育种中国农业科学院2007(学位年度)[3].荞麦种质资源遗传多样性分析.被引次数:8作者:赵丽娟.作物遗传育种中国农业科学院2006(学位年度)[4].小麦中国春背景下长穗偃麦草E<'e>染色体组特异AFLP及STS标记的建立.被引次数:3作者:张丽.作物遗传育种四川农业大学2008(学位年度)[5].大麦胰凝乳蛋白酶抑制子2(CI2)基因的SNP分析和单倍型鉴定.作者:曾祥辉.作物遗传育种四川农业大学2008(学位年度)[6].硬粒小麦节节麦合成六倍体小麦的抗穗发芽特性研究.作者:蒋云.作物遗传育种四川农业大学2008(学位年度)[7].嗜酸热硫化叶菌Sulfolobusacidocaldarius基因敲除体系的构建.被引次数:1作者:彭文舫.作物遗传育种中国农业科学院2008(学位年度)[8].川芎苓种的初步筛选及快繁体系的建立.被引次数:1作者:赵勇.作物遗传育种四川农业大学2008(学位年度)[9].携带1RS/1BL易位染色体三个小麦品种的抗衰老生理特性及其功能叶对产量贡献研究.作者:李永攀.作物遗传育种四川农业大学2008(学位年度)[10].烤烟农艺性状和烟叶化学成分的遗传分析.被引次数:7作者:肖炳光.作物遗传育种浙江大学2005(学位年度)三、相关作物遗传育种论文外文参考文献[1]AmixedmodelQTLanalysisforsugarcanemultipleharvestlocationtrial data..Pastina,M.M.Malosetti,M.Gazaffi,R.Mollinari,M.Margarido,G.R.A.Oliveir a,K.M.Pinto,L.R.Souza,A.P.Eeuwijk,F.A.vanGarcia,A.A.F.《TheoreticalandAppliedGenetics》,被EI收录EI.被SCI收录SCI.20125[2]Precisemapping<i>Fhb5</i>,amajorQTLconditioningres istanceto<i>Fusarium</i>infectioninbreadwheatonchromosome 2BS.. LiuZiJiZhuJieCuiYuLiangYongWuHaiBinSongWeiLiuQingYangTsoMinSunQiXinLiuZhiYong《TheoreticalandAppliedGenetics:InternationalJournalofBreedingResearc handCellGenetics》,被EI收录EI.被SCI收录SCI.20126[8]GeneticdiversityandpopulationstructureintheUSUplandcotton(Goss ypiumhirsutumL.)..Tyagi,P.Gore,M.A.Bowman,D.T.Campbell,B.T.Udall,J.A.Kuraparthy,V.《TheoreticalandAppliedGenetics:InternationalJournalofBreedingResearc handCellGenetics》,被EI收录EI.被SCI收录SCI.20142[9]Seedsizeisdeterminedbythecombinationsofthegenescontrollingdiff erentseedcharacteristicsinrice.. YanSongZouGuiHuaLiSuJuanWangHuaLiuHeQinZhaiGuoWeiGuoPengSongHongMiaoY anChangJieTaoYueZhi《TheoreticalandAppliedGenetics》,被EI收录EI.被SCI收录SCI.20117[10]Advancesandprospects:Biotechnologicallyimprovingcropwaterusee fficiency. ZhangZhengbinXuPingShaoHongboLiuMengjunFuZhenyanChuLiye.《CriticalReviewsinBiotechnology》,被EI收录EI.被SCI收录SCI.20113四、作物遗传育种论文专著参考文献[1]欧洲牧草、草坪草与饲料作物遗传育种研究进展.米福贵,2009中国草学会牧草育种委员会第七届代表大会[2]作物次级作图群体的研究进展.席章营,20042004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议[3]GNA转优质小麦品种获得成功.徐琼芳.农业部作物遗传育种重点实验室.陈孝.农业部作物遗传育种重点实验室.李连城.农业部作物遗传育种重点实验室.杜丽璞.农业部作物遗传育种重点实验室.马有志.农业部作物遗传育种重点实验室.徐惠君.农业部作物遗传育种重点实验室.辛志勇.农业部作物遗传育种重点实验室,2001全国农业科技创新与生产现代化学术研讨会[4]作物光合作用的遗传与产量改良.任光俊.陆贤军.高方远.郑家国.吕世华,2003全国作物遗传育种学术研讨会[5]遗传学及作物遗传育种系列课程综合性改革与实践.郭海滨.张志胜.李亚娟.俞淑红.刘向东,2010全国高等院校遗传学教学改革研讨会[6]稻曲病病原菌(Ustilaginoideavirens)群体遗传结构的初析.周永力.樊金娟.曾超珍.刘小舟.王疏.章琦.王春连.赵开军,2003全国作物遗传育种学术研讨会[7]分子标记技术在棉花遗传育种上的研究进展.郭玉平.张友秋.栗红梅,2014中国棉花学会2014年年会[8]一个与水稻抗白叶枯病基因Xa23紧密连锁的RFLP标记.曾超珍.赵开军.王春连.刘耀光.章琦.刘丕庆,2003全国作物遗传育种学术研讨会[9]水稻抗白叶枯病cDNA差减文库的构建及初步筛选.樊金娟.曾乃燕.欧阳石文.王春连.章琦.林汉明.徐正进.赵开军,2003全国作物遗传育种学术研讨会[10]作物核心种质的建立及其在遗传育种研究中的应用.张学勇.张启发.董玉琛.李振声.贾继增.李自超.邱丽娟.喻德跃.梅捍卫.李英慧.张洪亮.赵团结,2013中国林学会林木遗传育种分会第七届全国林木遗传育种学术大会。
基因编辑CRISPR技术在海洋生物遗传育种的应用进展

第36卷第1期2021年2月Vol.36No.1Feb.2021大连海洋大学学报JOURNAL OF DALIAN OCEAN UNIVERSITYD0I:10.16535/ki.dlhyxb.2020-049文章编号:2095-1388(2021)01-0169-08基因编辑CRISPR技术在海洋生物遗传育种的应用进展于笛1,迟小妹,滕炜鸣打谢玺1,赵冲2,王庆志1*(1.辽宁省海洋水产科学研究院大连市海产贝类种质资源创新利用重点实验室,辽宁大连116023; 2.大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023)摘要:基因编辑(gene editing)是生命科学领域目前应用最广泛的技术之一,以其对生物内源基因改变的精确性极大地推动着生命科学的研究进程,而CRISPR技术则是目前适应范围最广、可靠性最高的一类基因编辑技术,与其他技术相比,该技术具有高效、简单等优点。
CRISPR等基因编辑技术已在动植物遗传育种、生物医疗等领域广泛应用,其中在海洋生物中的应用也日渐增多。
本文以基因编辑技术为切入点,综述了基因编辑技术的发展史、原理、应用过程,以及CRISPR技术在海洋生物遗传育种中的应用现状及发展前景,旨在为推动基因编辑技术在海洋生物资源保护与开发、遗传育种等领域的应用提供科学参考。
关键词:基因编辑;CRISPR;海洋生物;遗传育种中图分类号:Q789文献标志码:A基因编辑(gene editing)技术是指在基因组水平进行基因的定点插入/缺失突变、敲除、多位点同时突变和小片段删除等精确操作技术。
通过对基因编辑技术的研究,可以帮助人类探索生命本质,揭开疾病发生之谜,寻求疾病预防与治疗的有效途径[1]。
基因编辑的最初技术手段为同源重组介导的基因打靶技术(gene targeting),该技术虽可以准确对特定基因进行修饰,但在实际操作中存在效率低、耗时长且可能导致基因突变等问题,影响了该技术的实际应用。
水产动物遗传育种研究进展

水产动物遗传育种研究进展摘要水产养殖是我国农村经济重要支柱产业之一。
由于长期大规模的人工养殖,已出现了严重的种质退化现象,制约了水产养殖业健康发展。
就目前水产动物优良品种培育所采取的新方法进行概述。
关键词水产动物;育种;转基因;性别控制;杂交育种;细胞工程随着我国水产养殖面积的增加、养殖种类的增多以及生态环境的改变,对水产动物的种质资源的保护、优良苗种的需求尤显重要。
如何获得生长快速、经济性状好、抗病能力强、抗逆性好的优良品种,将成为实现增产、增效的关键。
1转基因技术传统的育种方法是建立在利用种内遗传变异的基础上,而基因转移技术的应用打破了生物种间界限,使育种工作可以充分利用所有可利用的遗传变异,利用人工方法超越自然界亿万年生物进化历程,创造出自然界原来没有的新品种或品系。
转基因动物研究是基因工程技术在动物育种领域中的一次革命。
1985年朱作言等[1-2]将冠以小鼠重金属螯合蛋白基因启动和调控顺序的人GH基因,导入鲫鱼的受精卵,培育出世界上第一批转基因鱼。
到目前为止,国内外已获得几十种转基因鱼,在促进生长、提高鱼类抗逆性、抗病性等方面取得了显著成绩。
转基因水生生物的应用前景:一是快速育种。
传统的育种需经过多代反复选种交配才能育成优良品种。
而转基因技术则可超越自然界的生物进化历程,在短时间内创造出自然界中原来没有的新品种或品系,这是常规育种难以比拟的。
二是改良养殖性状。
转基因鱼的许多优良性状已被实验所证实:如生长速度得到很大提高,即所谓“超级鱼”;有的转基因鱼可提高饵料利用率;有的则表现出较好的抗病性和抗逆性。
三是生产生物医药制品。
通过转基因水生生物来生产生物活性物质以满足医药需要,如研制携带人类胰岛素的转基因鱼以提供胰岛素的研究。
2性别控制动物的性别控制是既古老而又神秘的课题,多少年来人们一直在不停地探索着。
分子遗传学和分子生物技术的飞速发展,使得人们在基因水平上研究动物的性别控制的基因有了可能。
咖啡遗传育种研究进展

咖啡遗传育种研究进展目录一、内容概括...............................................21.咖啡遗传育种研究的重要性................................22.咖啡遗传育种研究的历史与现状............................3二、咖啡遗传多样性研究.....................................51.咖啡基因组的组成与特点..................................62.咖啡遗传变异的类型与分布................................73.咖啡种质资源的遗传多样性分析............................8三、咖啡遗传图谱与基因定位研究.............................91.咖啡遗传图谱的构建.....................................102.咖啡重要性状的基因定位.................................113.咖啡数量性状位点分析...................................12四、咖啡基因克隆与功能研究................................131.咖啡基因克隆技术与方法.................................142.咖啡重要功能基因的鉴定与验证...........................163.咖啡基因在遗传改良中的应用.............................17五、咖啡遗传育种技术的研究进展............................181.传统育种技术在咖啡遗传育种中的应用.....................192.分子标记辅助选择在咖啡遗传育种中的应用.................203.转基因技术在咖啡遗传育种中的应用与展望.................22六、咖啡遗传育种的实践与应用..............................231.咖啡新品种的选育与繁育.................................242.咖啡遗传育种的挑战与机遇...............................253.咖啡遗传育种对产业的影响与展望.........................26七、结论与展望............................................271.当前研究的总结与成果评价...............................282.未来研究方向与趋势预测.................................29一、内容概括本论文综述了咖啡遗传育种研究的最新进展,重点关注了基因组学、分子生物学和基因编辑技术在咖啡遗传育种中的应用。
林木种子活力研究意义及进展

林木种子活力研究意义及进展作者:李嫦宪黄德卫来源:《绿色科技》2016年第11期摘要:综述了我国林木种子活力的概念与意义以及研究进程,指出了影响种子活力的因素,提出了种子活力的测定以及提高林木的种子活力的措施,以期为林木种子活力的相关研究提供参考。
关键词:林木;种子活力;研究进展中图分类号:S722文献标识码:A 文章编号:16749944(2016)110076021 引言种子学作为一门独立学科约有130多年的历史,相关领域的科学家对种子活力的概念,种子活力的测定方法,影响种子活力的因素,以及遗传物质分析、作物产量与种子活力的关系等方面做了系统而全面的研究。
目前种子学领域里种子活力仍然是一个热点的研究话题,随着分子技术的飞速发展,对种子活力的研究也在进入一个新的高度[1]。
2 种子及种子活力的概念与意义整个植物界从低等植物到高等植物经过亿万年的进化产生了种子,在植物学概念里,由胚珠发育而成的繁殖器官称为种子,是遗传物质的载体[2]。
种子与人类的生存和发展有着密不可分的关系,是人类及许多动物生存繁衍的物质基础,提供了高营养的食物。
种子亦可作为纤维、粮食、香料、药物、饮料、食用油、工业油等,为人类社会的健康发展奠定强有力的物质基础。
20世纪50年代,国际种子会议把种子活力和种子的发芽力做了区分,将种子活力作为衡量种子质量的一个重要标准之一。
直到20世纪70年代末期,ISTA给种子活力做了定义:种子活力是种子在发芽期和出苗期的潜在水平特征和各种活动力的总和,高活力种子的性状优异,低活力种子的属性较差[3]。
1980年,北美官方种子分析家协会(AOSA)对种子活力的定义是:广泛的田间条件背景下,对种子迅速整齐发芽出苗以及幼苗生长起决定作用的能力[4]。
总的来说,种子活力就是种子的健康程度,形容种子健壮情况的一个指标。
种子活力强的种子,发芽快,出苗迅速整齐,对环境的适应能力强。
种子活力弱的种子,发芽慢,出苗慢并且不够整齐,甚至不出苗,对环境的适应能力差。
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竹子遗传育种研究进展
陈光才;马乃训
【期刊名称】《林业科学研究》
【年(卷),期】2005(18)6
【摘要】竹子遗传育种研究因为受到其生物学特性的限制,一直进展缓慢.近年来,国内外对竹子遗传育种的研究投入加大,竹子的组织培养技术以及转基因育种发展迅速并获得了较大的进展.本文从遗传基础、常规育种和分子育种3个方面对国内外的竹子遗传育种的研究状况进行了系统的研究概述,并提出加强竹子种质资源保护,重视种质资源保存新技术的研究,加强竹子开花机理和开花人工诱导的研究,把现代生物技术与传统育种相结合,建立稳定的技术平台,以推动竹子遗传育种的新发展.【总页数】6页(P749-754)
【作者】陈光才;马乃训
【作者单位】中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江,富阳,311400;中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江,富阳,311400
【正文语种】中文
【中图分类】S791.27
【相关文献】
1.岭南山竹子化学成分及活性研究进展 [J], 韩雨桐;李兴玉;龙春林
2.福建省沿海沙地竹子适应性研究进展 [J], 凡莉莉;薛磊;杜溶讫;荣俊冬;蔡月琴;苏小青;郑郁善
3.福建省沿海沙地竹子适应性研究进展 [J], 凡莉莉;薛磊;杜溶讫;荣俊冬;蔡月琴;苏小青;郑郁善;;;;;;;;
4.竹子组织培养研究进展 [J], 张春玲
5.福建省沿海沙地竹子适应性研究进展 [J], 凡莉莉[1];薛磊[2];杜溶讫[1];荣俊冬[1];蔡月琴[1];苏小青[1];郑郁善[1,2]
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