lamp技术3篇

lamp技术

第一篇:LAMP基础概念和架构

LAMP技术是一个开源的Web应用栈,由Linux、Apache、MySQL和PHP四个关键技术组成。它可以帮助Web开发人员快速、高效地构建Web应用程序。 LAMP技术一般用于开发Web

应用程序,特别是动态Web应用程序,其中PHP是脚本语言,用于动态生成Web页面。

下面分别介绍LAMP技术的四个核心技术:

1. Linux操作系统:Linux是一个开源的操作系统,具

有类Unix和POSIX的特性,是一个稳定、安全、可靠的操作

系统。与其他操作系统相比,Linux能够提供更高的性能和可

靠性,也更加灵活和开放,能够满足不同应用程序的需求。

2. Apache Web服务器:Apache是一个开源的Web服务器,是目前最流行的Web服务器之一。它可以在各种操作系统上运行,并提供高可用性和可伸缩性。Apache的模块化设计

也提供了丰富的功能,可以用于构建各种类型的Web应用程序。

3. MySQL数据库:MySQL是一种开源的关系型数据库管

理系统,它支持多用户、多线程和多表操作。MySQL提供了一

个快速、可靠、安全的数据库解决方案,可以满足不同应用程序的数据管理需求。

4. PHP脚本语言:PHP是一种开源的脚本语言,可以在

服务器端执行,并使用HTML形式向浏览器输出动态Web页面。PHP易于学习和使用,可以处理各种Web开发任务,并提供丰

富的功能和工具。

LAMP技术的架构可以概括为:Linux作为操作系统,Apache作为Web服务器,MySQL作为数据库,PHP作为脚本语言。这些技术共同组成了一个高效、灵活、可扩展的Web应用程序开发平台。

总之,LAMP技术提供了一个完整的Web应用程序开发工具箱,可以帮助开发人员构建高性能、可靠、安全的Web应用程序。它是一个开放的、可扩展的平台,可以处理任何规模的应用程序。

lamp产物检测方法(一)

lamp产物检测方法(一) LAMP产物检测 概述 LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)是一种高效、快速、特异性强的核酸检测技术,已广泛应用于医学、生物学、环境 科学等领域的产物检测中。本文将介绍LAMP产物检测的几种常用方法。方法一:实时荧光检测 实时荧光检测是LAMP检测中最常用的方法之一。通过添加与LAMP引物配对的荧光探针,荧光信号与目标基因的扩增有关。实时荧 光检测可以提供实时的扩增曲线,并且可以基于荧光信号强度计算出 目标物的浓度。该方法结果灵敏度高,操作简便。 方法二:封闭管内检测 封闭管内检测适用于大规模样本分析。在封闭管中进行LAMP反应,通过观察管内的颜色变化来判断是否存在目标产物。通常,反应阳性 样品呈黄色或绿色,而阴性样品为紫色。 方法三:便携式检测设备 随着便携式检测设备的发展,LAMP产物检测也可以在户外或实验 室之外进行。便携式检测设备结合了实时荧光检测和封闭管内检测的

优势,能够有效地检测目标产物,并且具有高灵敏度和快速反应的特点。 方法四:电化学检测 电化学检测是一种基于电化学信号变化来判断目标产物的方法。通过引入与目标基因相关的电化学标记物,可以在反应过程中测量电流或电压的变化。该方法具有高灵敏度、快速反应和较低的成本。 方法五:便携式PCR检测仪器结合LAMP 传统的PCR(Polymerase Chain Reaction)方法在LAMP产物检测中也得到广泛应用。便携式PCR检测仪器结合LAMP技术,可以提供更高的扩增效率和较低的虚警率。 结论 LAMP产物检测是一种快速、高效、特异性强的核酸检测技术。实时荧光检测、封闭管内检测、便携式检测设备、电化学检测和便携式PCR检测仪器结合LAMP是几种常用的方法。根据实际需要,可以选择适合的检测方法进行LAMP产物检测。 (以上内容仅供参考,请根据实际情况进行操作)

LAMP技术原理和引物设计

LAMP技术原理和引物设计 LAMP(Loop-mediated isothermal amplification)技术是一种基于等温扩增的核酸放大技术,具有高度特异性和灵敏度。其原理是通过一种酶体系,在恒温条件下,同时进行DNA链合成和DNA降解,实现靶DNA的指数级扩增。LAMP技术主要包括四个特点:温育,DNASA酶,硫酸镁和比色。 LAMP技术的核心引物设计包括首末引物、携带引物和环引物。首末引物是用于导向DNA合成的引物,具有特异性序列,可同时结合目标序列的两个扩增位点,使合成的DNA形成带环结构。携带引物则是用于携带首末引物,其中一个端通过末端退火与首末引物结合,另一个端通过内部部位退火与目标序列结合。环引物则是富含寡聚核苷酸,可与合成的DNA的循环结构结合,形成DNA环。 1.反应体系准备:将首末引物、携带引物、环引物、dNTPs(脱氧核苷三磷酸盐)、荧光素和DNASA酶等加入反应管中,并加入模板DNA。 2.反应液混合:充分混合反应液,使其均匀分布。 3.等温扩增:将反应管放入恒温水浴中进行等温扩增,通常温度为60-65摄氏度。 4.结果判断:观察扩增产物是否有荧光生成,可用裸眼观察或借助实时荧光PCR仪进行观测。同时,也可根据扩增产物的数量和大小来判断目标序列的存在与否。 1.高度特异性:通过引物的设计,能够实现对目标序列的高度特异性扩增,避免非特异性放大。

2.高灵敏度:引物结构的设计使得扩增产物形成大量的环结构,进一步促进扩增反应,提高灵敏度。 3.简易操作:LAMP技术无需特殊设备和复杂条件,只需常规实验室设备和简单的温度控制即可完成扩增反应。 4.短时间:由于不需要PCR步骤,LAMP技术的扩增反应时间一般在1-2小时内就可以完成。 5.可视化检测:扩增产物可以通过荧光素染料或草铁蓝等染料进行可视化检测,便于结果判断和数据分析。 总结起来,LAMP技术是一种快速、高效、特异性强和操作简便的核酸放大技术,引物的设计是实现该技术的关键。通过合理设计首末引物、携带引物和环引物,能够实现目标序列的高特异性扩增,并且能够进行可视化检测,广泛应用于生物医学领域。

LAMP

LAMP(环介导等温扩增)技术 2011-07-28 11:46 来源:北京蓝谱点击次数:1341 关键词:LAMP PCR技术环介导等温扩 增 分享到:收藏夹腾讯微博新浪微博开心网 PCR方法在人类及动植物疾病基因诊断、食品分析和环境监测等领域发挥着举足轻重的作用,其灵敏度高、特异性好,是目前最精准的基因诊断方法。然而PCR方法操作起来较复杂,对仪器和人员要求比较高,不适合基层或现场快速诊断,因此在国内的推广速度并不是很快。 2000年日本学者Notomi在Nucleic Acids Res杂志上公开了一种新的基因诊断技术,即LAMP (L oop-mediated isothermal amplification),中文名为“环介导等温扩增反应”,受到了世卫组织WHO、各国学者和相关政府部门的关注,短短几年,该技术已成功地应用于SARS、禽流感、HIV等疾病的检测中,在这次甲型H1N1流感事件中,日本荣研化学公司接受WHO的邀请进行H1N1 LAMP试剂盒的研制。通过荣研公司近十年的推广,LAMP技术已广泛应用于日本国内各种病毒、细菌、寄生虫等引起的疾病检测、食品化妆品安全检查及进出口快速诊断中,并得到了欧美国家的认同。LAMP方法的优势除了高特异性、高灵敏度外,操作十分简单,对仪器设备要求低,一台水浴锅或恒温箱就能实现反应,结果的检测也很简单,不需要像PCR那样进行凝胶电泳,LAMP反应的结果通过肉眼观察白色浑浊或绿色荧光的生成来判断,简便快捷,适合基层快速诊断。 可以预见,在未来的基因诊断领域,LAMP方法将占据大壁江山。 目前,在万方数据库搜索LAMP文章500多篇。详见:https://www.360docs.net/doc/7719336690.html,/paper.asp x?q=loop-mediated+isothermal+amplification&o=sortby+CitedCount+CoreRank+date+relevanc e%2fweight%3d5&f=top&n=10&p=1 1. 优缺点介绍: LAMP方法优点:灵敏度高(比传统的PCR方法高2~5个数量级);反应时间短(30~60min就

LAMP技术研究进展及其在动物疫病检测中的应用

LAMP技术研究进展及其在动物疫病检测中的应用 LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)技术是一种能够在恒温下快速、高效地进行核酸扩增的方法。它通过特殊的引物和酶,在简单的实验条件下可以在短时间内扩增大量目标DNA序列,并且具有高度的特异性和灵敏性。LAMP技术最早由日本学者Notomi等人于2000年首次提出,自此以后,LAMP技术在许多领域得到了广泛的应用,尤其在动物疫病检测中。 1.快速诊断:LAMP技术可以在一个小时内进行核酸扩增反应,比传统的PCR方法要快得多。这对于迅速确定疫病的诊断结果非常重要,可以提高动物疫病的早期预警和防控能力。 2.高度特异性:LAMP技术使用多个特异性引物,在同一个反应体系中进行扩增,可以显著提高对目标序列的特异性识别能力。这对于区分不同疫病病原体或者同一病原体的不同亚型具有重要意义,可以帮助鉴定传染病源和病原菌的变异。 3.高灵敏性:LAMP技术不仅在快速扩增速度上具有优势,还在扩增效果上具有高灵敏性。在初始目标DNA浓度低至10个分子时,LAMP技术仍能够进行有效扩增,这对于低浓度病原体的检测非常关键。 4.操作简便性:LAMP技术不需要复杂的设备和特殊的实验条件,只需要一个简单的恒温器就可以进行核酸扩增反应。这极大地降低了操作门槛,使得不同实验室和场所都可以进行动物疫病的检测工作。 5.物价低廉:LAMP技术所需的试剂和设备成本相对较低,特别是与PCR技术相比较,更加经济实惠。这对于资源有限的地区和农村地区的疫病监测和防控工作尤为适用。

目前,LAMP技术已经在许多动物疫病的检测中得到了应用。比如,它被成功用于禽流感、猪瘟、传染性胸膜炎、家禽新城疫等重大疫病的快速检测。通过该技术,可以快速而准确地检测出病原体的存在,为疫病的早期检测和防控提供了有力的手段。 总之,LAMP技术在动物疫病检测中具有广阔的应用前景。随着该技术的不断进步和完善,相信将能够更好地满足动物疫病检测的需求,为动物疫病的防控提供更加可靠、快速和经济实惠的手段。

lamp检测技术原理

lamp检测技术原理 LAMP 是一种常用的 Web 应用技术栈,包括了 Linux、Apache、MySQL 和 PHP。而 LAMP 检测技术是针对这种技术栈的安全漏洞检测 技术,可以帮助企业及个人发现 LAMP 技术栈平台上存在的漏洞,进 而提升其安全性。下面就让我们来了解一下 LAMP 检测技术的具体原 理吧。 一、探测系统 LAMP 检测技术首先需要对目标系统进行探测,以了解其系统版本、应用版本、端口信息等。这些信息对于后续的漏洞检测、指纹识 别等操作都有着非常重要的作用。探测系统的方式一般会分为两种, 一种是主动探测,即主动发送请求获取回应,另一种是被动探测,即 通过监控网络流量等方式探测目标系统的信息。 二、指纹识别 在获取了目标系统的基本信息后,LAMP 检测技术会进行指纹识 别操作,即通过目标系统的特征信息来判断其应用程序、Web 服务器、数据库等具体的软件环境。指纹识别可以帮助检测人员快速定位目标 系统的软件环境,进而选择相应的漏洞检测工具和攻击方式。 三、漏洞扫描 指纹识别后,LAMP 检测技术会进行漏洞扫描操作,即发现目标 系统可能存在的漏洞。漏洞扫描可以使用已知的漏洞库进行检测,依 据其已有的漏洞特征来发现目标系统上的漏洞。漏洞库一般可以通过 自学习模式不断进行更新升级,以发现更多、更准确的漏洞。 四、渗透测试 在发现目标系统存在漏洞后,LAMP 检测技术会进行渗透测试, 并尝试利用已有的漏洞进行攻击,最终获取系统权限。渗透测试时需 要谨慎行事,避免对目标系统造成不必要的损害。 综上所述,LAMP 检测技术主要由探测系统、指纹识别、漏洞扫 描和渗透测试等步骤组成。通过这些步骤的操作,LAMP 检测技术可以

LAMP技术原理和引物设计

LAMP技术原理和引物设计 LAMP技术(Loop-mediated isothermal amplification),中文称 为环介导等温扩增技术,是一种于2000年由Eiken Chemical Co. Ltd. 日本公司开发的基于异十四链聚合酶反应(Bst聚合酶)的异源DNA快速 扩增技术。LAMP技术通过引物设计和反应条件的优化,实现在等温条件 下对目标DNA的高效扩增。下面将分别介绍LAMP技术的原理和引物设计。 LAMP技术的核心原理是通过酶的协同作用,在等温条件下进行DNA 的扩增。它利用一种特殊的DNA聚合酶(Bst聚合酶),能够在不需要高 温退火的情况下,具有高度特异性和高效率地进行DNA合成。LAMP技术 本身具有极高的扩增速度,优势在于其在等温下,不需要复杂的设备和严 格的实验条件,可以简化扩增过程。同时采用特殊设计的引物组合,能够 提高扩增特异性。 1.初始化反应:将反应体系中的DNA片段与引物(包括2个外端引物 和2个补体引物)结合; 2. 引物扩增:引物与Bst聚合酶作用,反应体系中的DNA得到扩增; 3.聚合物合成:一种特殊的引物结合到目标DNA的5'末端,通过内 端引物和内部位点进行扩增; 4.循环放大:扩增产物作为新的模板参与反应,进行连续循环扩增。 通过这种等温扩增的方法,LAMP技术可以在短时间内获得大量的目 标DNA,且具有很高的扩增特异性和灵敏度,可以用于分子生物学、诊断 医学和病原检测等领域。 引物设计:

引物设计是LAMP技术成功应用的重要因素之一、LAMP技术使用了4 个单链引物,包括2个外端引物(forward outer primer,F3和reverse outer primer,B3)和2个内端引物(forward inner primer,FIP和reverse inner primer,BIP)。 外端引物负责扩增DNA的初始段,内端引物负责扩增DNA的中间段。 在引物设计中,需要注意以下几个方面: 1.引物的特异性:要求引物能够有高度特异地结合到目标DNA的区域,确保扩增的目标是准确的; 2.引物的长度和碱基组成:引物的长度通常为20-24个碱基,碱基组 成要尽量避免重复序列和形成组内结构,以保证扩增效率和特异性; 3.引物的位置和方向:合理选择引物的位置和方向,以确保扩增产物 的特异性和有效性; 4.引物的浓度:引物的浓度需要进行优化,以获得最佳的扩增效果。 在引物设计的过程中,可以借助计算机软件进行模拟和分析,以提高 引物的特异性和效率。同时,根据具体的研究目的和实验条件,可以对引 物进行一定程度的修改和优化,以获得更好的扩增结果。 总结起来,LAMP技术的原理是通过酶的协同作用,在等温条件下进 行DNA的高效扩增;而引物设计是LAMP技术成功应用的关键因素,需要 考虑引物的特异性、长度和碱基组成、位置和方向等因素,以提高扩增的 特异性和效率。

LAMP技术介绍

LAMP技术介绍 首先,LAMP技术的第一个组成部分是Linux。Linux是一个开源的操 作系统,非常稳定和安全。它可以运行在各种硬件平台上,并且具有广泛 的应用程序支持。Linux是一个非常流行的操作系统选择,因为它不需要 高额的授权费用,可以为开发者提供灵活性和自由度。 第二个组件是Apache。Apache是一个开源的Web服务器,广泛用于 互联网应用程序的托管。它具有高度稳定性和可扩展性,可以处理大量的 并发请求。Apache提供了许多功能,例如虚拟主机支持、SSL加密和基本 身份验证等。 MySQL是LAMP的第三个组成部分,是一种开源的关系型数据库管理 系统。它具有高性能、可靠性和灵活性。MySQL可以处理大量的并发请求,并且提供了很多高级功能,例如事务处理、存储过程和触发器等。MySQL 还可以通过复制和分区来实现数据的高可用性和扩展性。 最后一个组件是PHP,它是一种广泛使用的服务器端脚本语言。PHP 是一种解释性语言,可以嵌入到HTML中,用于生成动态的Web页面。它 具有简单易用的语法,非常适合Web开发。PHP提供了许多功能和库,可 以轻松地处理表单数据、数据库访问和图像处理等任务。 然而,LAMP技术也有一些局限性。首先,它对硬件配置要求较高, 需要一定的服务器和存储资源来支持。其次,LAMP技术中的每个组件都 需要单独配置和管理,这对于初学者可能会有一定的学习曲线。此外,一 些人认为PHP的性能不如其他服务器端语言。 尽管如此,LAMP技术仍然是一种非常流行和成功的互联网开发平台。许多大型互联网公司和网站都在使用LAMP来构建和部署他们的应用程序。

lamp检测技术原理

lamp检测技术原理 LAMP(loop-mediated isothermal amplification)技术是一种新开发的核酸扩增技术,采用了一种较为简单的反应体系,它利用单一的酶就能在恒温下迅速扩增寡核苷酸序列。相对于PCR技术,LAMP技术具有操作简便、响应时间短、在复杂的基因组背景下具有更高的特异性和灵敏度等诸多优点。本文主要介绍LAMP技术的原理和优缺点以及应用前景。 一、LAMP技术原理 LAMP技术的核心是利用反转录酶将RNA模板转录成具有这种序列的cDNA,然后利用核酸聚合酶扩增cDNA。其反应原理基于无需热循环多重扩增(muliple displacement amplification)的核酸扩增技术,主要分为两个阶段: 第一阶段:反应的产物是DNA扩增物。在此过程中,LAMP引物包括两个外部引物F3和B3,以及两个内部引物FIP和BIP。FIP包含与F3序列完全匹配的5'端及与目标序列互补的3'端,BIP则包含与B3序列完全匹配的5'端及与目标序列互补的3'端。引物F3和B3均相似于PCR反应中的起始引物,用于启动扩增反应。内部引物FIP和BIP通常由两个互补的寡核苷酸序列构成,这个引物可以形成一个干扰环(intra-loop),这个结构能够保护引物与目标序列的杂交效率,并促进反向归一分支(reverse transcription displacement loop,RTDL)的形成。… 1. 优点 (1)不需要高昂的设备和专业技术 (2)无需基因分离,避免污染和误差 (3)反应耗时短,使其更易于操作 (4)对反应体系的优化可以大大提高扩增效率 (5)对于丰富的背景DNA和RNA不敏感,具有更高的特异性 (6)精确和准确度高,可以探测到低浓度的目标核酸 2.缺点 (1)由于插入引物扩增导致的较多的非特异性扩增,使得LAMP扩增产品更难直接测序,容易产生误导性解释。 (2)单一目的基因的特异性鉴定

lamp环介导等温扩增技术

lamp环介导等温扩增技术 LAMP环介导等温扩增技术是一种用于检测DNA或RNA的方法,具有快速、高度敏感和特异性等优点。下面我们来详细介绍一下这种技术的原理和应用。 一、原理 LAMP技术是一种环介导等温扩增方法,与PCR不同的是,LAMP不需要高精度的温度控制和特异性引物,只需要4-6个引物就可扩增目标序列。LAMP反应的基本步骤为:首先,在等温条件下,外部引物(F3和B3)和内部引物(FIP和BIP)结合在DNA目标序列上,形成一个环形结构;然后,在BIP的3'端内部引物(LF和LB)的作用下,DNA目标序列不断的进行扩增,最终形成一个由数以百万计的拷贝构成的扩增产物。在反应中,LF和LB作为内部补体引物,增强了反应的特异性和扩增效率。 二、优点 1、高度敏感:在LAMP扩增反应中,由于不需要复杂的环境条件和反应体系,扩增过程高效,形成的扩增产物数量极多,可以检测到非常微弱的目标DNA或RNA信号。 2、特异性强:LAMP反应需要多个引物结合于目标序列,而且引物是从多个区域的序列中选择设计的,所以扩增的产物只会与目标序列高度特异结合,不会出现交叉反应的问题。 3、环境友好:LAMP扩增只需要一个热水浴,不需要PCR反应所需的高精密温控仪器,同时反应体系中不含有有毒有害的物质,对环境及实验者均无危害。

三、应用 LAMP技术已广泛应用于临床医学、食品安全、环境检测和生物技术等领域。 1、临床医学:LAMP技术可以高效、快速、准确地检测病原微生物、基因突变和药物耐药性等,对于疾病的快速诊断和精准治疗提供了有力支持。 2、食品安全:LAMP技术可以检测微生物、病毒和其他有害物质,对于食品安全监管起到了重要作用。 3、环境检测:LAMP技术可以应用于环境污染的检测、植物病害的检测以及水质检测。 4、生物技术:LAMP技术可以用于基因组学、遗传学和分子病理学等领域的基础科研。 总之,LAMP技术作为一种新兴的DNA或RNA检测技术,具有快速、高效、经济和特异性强等优点,已成为分子生物学和生命科学领域的焦点研究。

lamp技术介绍以及在微生物检测中的应用

研究生课程论文 课程: 微生物检测技术 题目LAMP技术及其在微生物检测中的应用姓名: 王飞 学院: 生命科学学院 专业: 微生物 学号: 2011216016 20 11 年12 月30 日

LAMP技术及其在微生物检测中的应用 摘要:环介导等温扩增(1oop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术是近年来发展出的一种敏感、特异、方便快捷的核酸扩增技术。与传统PCR方法相比,LAMP不需要热循环,为等温扩增,且由于LAMP反应中产生大量的副产物一白色焦磷酸镁沉淀,扩增产物可不经过电泳,通过肉眼观察或浊度计即可判定结果。因此LAMP是一种不需要热循环仪、肉眼即可判定结果的高度特异和敏感的DNA 扩增方法。近年LAMP技术在病原微生物检测及食品微生物检测上已有广泛应用,本文就LAMP极其在这两方面的研究进展作一综述。 关键词:LAMP;环介导等温扩增;核酸扩增 Application of LAMP in detection of microorganism Abstract:LAMP (loop-mediated isothermal amplification) method, which develops in recent years, is a sensitivity, special and convenience nucleic acid amplification technique. To compare with the traditional PCR, LAMP, which needn’t hot circle, is constant temperature amplification. Because LAMP can produce a mount of coproduce, magnesium pyrophosphate,which is a white precipitation,the result can be estimated by eyes or nephelometer without electrophoresis. In recent years, the application of LAMP in detection of disease pathogen and microorganism in food had been wide studied. These articles summarize the studies in these two aspects. Key words:LAMP; loop-mediated isothermal amplification; nucleic acid amplification 1.引言 核酸体外扩增技术是分子生物学领域最重要的研究手段之一,以检测核酸为基础的分子诊断技术已广泛应用于临床医学和微生物检测等领域。目前,核酸体外扩增技术主要包括常规PCR扩增和等温扩增两大类。常规PCR包括单一PCR[1]、复合PCR[2]、套式PCR、竞争性PCR[3]和实时荧光定量PCR[4-8],等温扩增包括核酸序列依赖扩增(nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)[9]、滚环DNA 扩增(rolling circle DNA amplification,RCA)[10]、指数式扩增反应(exponential amplification reaction,EXPAR)[11]、连接酶链扩增反应(ligase chain reaction,LCR)[12]、链置换扩增反应(strand displacement amplification,SDA)[13]和环介导等温扩(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)[14]技术等。常规PCR扩增由于快速、灵敏度和特异性高等优点广泛用于分子诊断领域,但由于常规PCR扩增需要配套的控温精密的仪器和复杂的实验程序,大大提高了检测成本。等温扩增技术是近年来发展迅速的一类核酸体外扩增检测技术,其区别于常规PCR扩增技术的关键在于扩增反应的温度不同,无需控温精密的实验仪器和复杂的实验程序。上述几种等温核酸扩增技术中,LAMP技术由于具有快速、高效、灵敏度高、特异性高和可定量分析等优点已经广泛用于临床和微生物分子诊断领域。本文就LAMP 技术的原理、引物设计及其在分子诊断和检测领域的应用进行综述。

思路丨LAMP 等温扩增技术常见问题总结

思路丨LAMP 等温扩增技术常见问题总结 Q1:LAMP有哪些特点? ●仅需一种酶Bst DNA Polymerase参与; ●恒温60-65℃,30-60 min完成扩增反应; ●灵敏度高,比传统的PCR高2~5个数量级; ●操作的简便性及对仪器设备和人员要求低。 Q2:LAMP扩增引物如何设计? Fig 1. 扩增引物设计位置示意图 设计要点: ●引物区域之间的距离: F2和B2的5'端之间的距离为120-180 bp; F2和F3以及B2和B3之间的距离是0-20 bp; 环形区域(F2的5'端到F1的3'端,B2的5'端到B1的3'端)的距离为40-60 bp。 ●引物区域Tm值: 富含GC和常规的引物Tm值为60-65°C; 富含AT 的引物Tm值为55-60°C。 ●GC含量: 在富含GC或通常区段一般为50-60%; 在富含AT区段一般为40-50%。 ●3'端避免富含AT,以避免二级结构形成。

Q3:LAMP的环引物LF或LB有什么作用? 环引物可以结合环区域,增强扩增效率。据实验结果表明,使用环引物扩增所需的时间仅是 不使用环引物的三分之一到二分之一,可在30 min内实现扩增。 Q4:如何对RNA进行RT-LAMP检测? 可以通过在反应体系中添加适量的逆转录酶,巨匠生物已推出耐高温逆转录酶二代(A TG#R111),耐受72℃,利于复杂长链RNA在高温下打开二级结构,进行高效逆转录。 Q5:为什么做LAMP实验经常会有假阳性产生?如何避免? ●同一区域移液高拷贝(10^6 copies/μl 或更高)的模板,则可能会发生污染; ●由于灵敏度过高,导致引物试剂在容易污染的环境下反复开盖,极易污染气溶胶后,产 生假阳性; ●样本制备区/试剂准备区/加样区/反应区等尽可能做到分区; ●每次试验前后或者步骤之间对空气和工作区以及移液器,要用核酸清除剂或10%漂白 剂消毒清除气溶胶污染; ●引物设计设计多套作为备选,通过实验测试挑选最佳引物组。 Q6:SNP可以用LAMP法区分嘛? 可以。可结合RNase HII(A TG#E207)酶学功能,以LF或LB为基础,在SNP位点设计MB荧光探针: /FAM/DNA-rN-DNA/Dab/,通过荧光信号检测,高灵敏度区分WT和MT。 Q7:LAMP有些哪些产物检测方式 琼脂糖凝胶电泳;荧光探针检测;核酸染料可视化显色。 Q8:LAMP荧光探针法检测是否有较好的方案? 由于Bst DNA polymerase具有较强的链置换活性,经实验测试发现,一般Taqman探针适配

实验丨LAMP荧光探针方案最佳伴侣,非FEN1莫属!

LAMP荧光探针方案最佳伴侣,非FEN1莫属! 环介导等温扩增(LAMP) 技术是一种在恒温条件下进行的DNA扩增技术之一,具有高灵敏度、扩增快速等优点,结合微流控技术和多种终点检测手段方案,在医学诊断、生物安全、农业和环境监测等领域都有广泛的应用前景。 但基于LAMP扩增技术需要精准检测,还是荧光探针法更为合适,目前市面产品,某些厂商推出的主要基于Taqman探针法,而殊不知Bst DNA Polymerase具有极强的链置换功能,即便是具有5’端外切功能的Bst DNA Polymerase,LF也是会先推起退火上去的探针,而先非切割,导致荧光信号曲线不能真实反映扩增过程,所以导致LAMP扩增跑胶结果与荧光曲线表现大相径庭。 那么我们思考发现探针退火模板后,被Bst DNA Polymerase遇到推起,但在那一瞬间会形成一个瓣状结构flap,另一方面FEN1正好具有切割5’flap的酶学功能,这两者之间似乎可以联系在一起。接下来的一些实验和理论依据更加佐证了这两者具有极高的匹配度。 1.热稳定性实验结果表明,FEN1在65℃下具有最高活性(Table 1) Table 1. 不同温度下FEN1活性 TEMPERATURE ACTIVITY% 25°C< 1 % 37°C< 5 % 45°C20 % 50°C50 % 60°C90 % 65°C100 % 70℃95 % 2.我们再基于扩增引物设计探针,后续扩增过程中Bst DNA Polymerase就会遇到已形成二级结构的引物 型探针,将其推起形成5’flap结构不就可以被FEN1直接切割,从而发出荧光(Fig. 1)。 Fig. 1 LAMP结合FEN1荧光探针检测原理示意图

LAMP技术在微生物检测中的应用

LAMP技术在微生物检测中的应用 【摘要】本文以LAMP技术的优缺点为分析对象,并食源性致病徽生物和临床致病微生物检测行业的发展现状进行了阐述,结合实际情况,对LAMP技术在微生物检测中的应用进行了探讨。 【关键词】LAMP技术,微生物检测,应用 一、前言 LAMP技术是随着微生物检测技术发展而不断发展的,LAMP技术在微生物检测中的应用中越来越广泛。经过几十年的迅速发展,目前LAMP技术已广泛应用于很多微生物检测当中,成为一门实用的技术。 二、LAMP技术的优缺点 1、优点 (一)、特异性强、灵敏度高 4条引物可以严格识别靶核酸序列上的6个独立区域,反应过程不会受到反应混合物种非靶序列DNA的影响,保证了LAMP扩增的高度特异性。在检测过程中可以根据是否扩增就能判断目标基因是否存在,可用于细菌或病毒的定性检测。 (二)、等温高效 LAMP在等温条件下扩增,不会因温度改变而造成时间的损失,在1 h内可将靶序列扩增至109~1010倍。而且受非靶序列的影响小,模板也不需要热变性。 (三)、整个扩增反应操作简便、快捷 LAMP反应过程中会产生白色的焦磷酸镁沉淀,肉眼即可直接观察,是鉴定反应是否进行的最直接方法。另外,LAMP扩增产物可以像PCR反应利用凝胶电泳结合成像系统进行鉴定,通过产生的不同梯型来区分特异性扩增和非特异性扩增。 (四)、实验装置简单,费用相对较低 LAMP反应不需要进行模板的热变性、长时间的温度循环、繁琐的电泳和紫外观察等,在操作过程中,仅需要普通的水浴锅或其他可以得到稳定热源的设备即可。 2、缺点

(一)、LAMP技术对试验设计的要求较高 需要设计的引物数目相对较多、结构复杂,需要考虑到靶序列的片段及茎环结构等因素。在检测高度变异的病原体时,实验设计相对比较困难 (二)、LAMP技术在一次反应中只能检测一个病原体 LAMP技术的阳性反应并不只呈现单条带,而出现拖尾和一些低分子质量的带,一旦产生非特异性扩增,则不易鉴别。 三、食源性致病徽生物和临床致病微生物检测行业的发展现状 随着生态环境的破坏、经济全球化的急剧发展等环境和社会因素变化,食品安全、环境保护和医疗健康问题日益受到关注。病原微生物正在向人类发起挑战:新的致病微生物突变对人类社会构成严重威胁;大规模突发性疾病是当前生物医学面临的重大挑战;一些重大传染病的死灰复燃,在我国和世界人口大多数的欠发达地区情况仍然严重。 致病微生物的检测技术急需向高通量、高精准度和快速现场应用多元方向发展。目前基层食品安全、环境卫生和医学临床对致病微生物的检测诊断仍以微生物分离培养技术为主、分子或生化手段为辅,通常序繁复、耗时长、费用高,并且灵敏度和特异性不强。国内外学者对致病微生物的检测方法进行了大量研究,建立了从病原分离鉴定、特异蛋自的免疫学检测技术、形态学鉴定和白动生化鉴定,到核酸探针、PCR等分子生物学检测方法。在基因水平上的核酸检测,其灵敏度远高于病原分离鉴定,同时避免了医学临床检验上的窗口期影响,赢得时间,对于预防控制重大传染性疾病至关重要。近年来核酸检测在快速性、安全性、准确性和灵敏性等方面都有很大的提高。这些新技术突破了传统的形态学、生化反应等旧模式,不需要对微生物进行分离提纯,而直接用样品或样品的增菌液进行快速检测,并且与分子生物学技术及生物信息学设计相结合,向准确、快速、灵敏和自动化的方向发展。 日前流行的以PCR为代表的核酸检测技术在实际应用中也存在一些问题,如PCR技术需要专门的CPR仪,且存在易交叉污染和操作过程烦琐的缺点。而荧光实时定量PCR虽然较好地解决了交义污染,并简化了操作过程,但却需要定量PCR仪,因此不适用于现场快速检测。且实时定量PCR技术中荧光探针的成本较高,加大了推广的难度。目前国内外的致病微生物的检测产品市场中,缺少快速、准确、简便的分子检测试剂盒,不能满足用户的检测要求,加上现有产品的假阴性和假阳性问题比较严重,导致用户使用的信心不足。所以,及时运用生物技术发展的最新成果对满足病原微生物检测的要求具有重要意义。食品安全检测,医学病原微生物诊断,农畜牧致病微生物检测,水体微生物等等领域,都非常需要快速、准确、简便、设备投入少的核酸检测技术。 四、LAMP技术在微生物检测中的应用

lamp技术

lamp技术 Lamp技术是一种非常重要的技术,它在现代生活中得到了广泛的应用。下面将详细介绍Lamp技术及其在不同领域的应用。 Lamp技术,全称是Linux + Apache + MySQL + PHP,它是一种用于构建动态网站的开源技术组合。Linux是一种操作系统,Apache 是一种服务器软件,MySQL是一种数据库管理系统,PHP是一种服务端脚本语言。这四者组合在一起,形成了Lamp技术,它成为了构建动态网站的首选技术。 首先,让我们来了解一下Linux操作系统。Linux是一个开源的操作系统,它继承了Unix操作系统的优点,并且具有高度的稳定性和安全性。许多服务器都使用Linux作为操作系统,因为它可以有效地管理资源、提供高性能的服务,同时还能够抵御各种网络攻击。 接下来是Apache服务器软件。Apache是最流行的Web服务器软件之一,在全球范围内被广泛使用。它可以以高效且安全的方式处理HTTP请求,使得网站能够快速响应用户的访问,提供稳定的服务。Apache还支持多种模块和插件,可以根据需求对其进行扩展,提供更多的功能。 MySQL是一种功能强大的关系型数据库管理系统。它可以管理大量的数据,并且支持事务处理,提供高性能的数据库服务。MySQL使用SQL语言进行数据管理,它的数据结构清晰,操作简单。因此,许多动态网站都选择使用MySQL作为其底层数据库。 最后是PHP服务端脚本语言。PHP是一种开源的脚本语言,可以嵌入到HTML中,用于处理动态内容。它可以与Apache服务器紧密集成,通过与MySQL数据库进行交互,动态地生成网页内容,实现了网站的灵活性和交互性。PHP还有丰富的函数库和框架,使得开发人员可以更快地开发出功能丰富的网站。 Lamp技术在各个领域都有广泛的应用。例如,在电子商务领域,许多在线商城都使用Lamp技术来构建他们的网站,以实现商品展示、

lamp等温扩增技术原理

lamp等温扩增技术原理 LAMP等温扩增技术是一种高灵敏度的基于序列特异性寡核苷酸探针的新型核酸检测方法,由于其极高的灵敏度、特异性和快速性,广 泛应用于疾病的诊断与研究中。该技术的原理可以分为以下步骤:第一步:沙门氏菌DNA引物的特异性结合并扩增 LAMP等温扩增技术采用一组详细的引物设计,使其具有高度特异性,能够在目标核酸序列的正常条件下,加速酶间反应来扩增目标序列。针对沙门氏菌的DNA扩增,引物组成为2个反向外部引物、2个内部引物和一个环引物。反向外部引物的特异性结合在目标DNA序列的 外侧,内部引物则在外部引物结合后依次将产物扩增。环引物在推进 反向内外部引物的条件下,促进并加速扩增反应的进行。该技术最大 的优势在于,即使非特异性的DNA序列存在,也能在反应系统中抑制 它们的扩增,从而提高扩增产物的特异性。 第二步:单管内扩增反应 LAMP等温扩增技术在单个反应管中完成扩增,因此省去了扩增过程中由于分离和清洗产物所需的步骤,从而能够提高扩增的效率。同时,该技术利用因特异性扩增反应而产生的大量产物来实现放大反应 信号。由于其不需要复杂的设备,仅需要水槽温度控制器和能够给温 度控制提供稳定电源的仪器即可完成。整个扩增过程中,所有反应物 成分的变化均与恒定温度下运行。 第三步:利用Dye负电荷的反应性质 由于在反应中引物的选取和调额完全根据目标DNA的序列比对所 进行,因此LAMP等温扩增技术具有绝对的特异性。同时,其采用的是 特殊的Dye(反应染色),具有负电荷和荧光反应性质,在在反应完成后,在阳性结果的情况下,消耗成本非常低。而在负性结果的情况下,由于该Dye信号使读取结果清晰方便。由此,LAMP等温扩增技术结果 得到广泛的应用,例如疾病的检测、环保检测等领域,得到了广泛应用。

lamp技术原理和引物设计

lamp技术原理和引物设计 LAMP原理及引物设计与实例 (LAMP引物的设计 LAMP引物的设计主要是针对靶基因的六个不同的区域,基于靶基因3' 端的 F3c、F2c和Flc区以及5' 端的Bl、B2和B3区等6个不同的位点设计4种引物。 FIP(Forward Inner Primer):上游内部引物,由F2区和F1C区域组成,F2区 与靶基因3’端的F2c区域互补,F1C区与靶基因5' 端的Flc区域序列相同。 F3引物:上游外部引物(Forward Outer Primer),由F3区组成,并与靶基因的 F3c区域互补。 BIP引物:下游内部引物(Backward Inner Primer ),由B1C和B2区域组成, B2区与靶基因3' 端的B2c区域互补,B1C域与靶基因5' 端的Blc区域序列相同. B3引物:下游外部引物(Backward Outer Primer ),由B3区域组成,和靶基因 的B3c区域互补。 2(扩增原理 60-65?是双链DNA复性及延伸的中间温度,DNA在65?左右处于动态平衡状 态。因此,DNA在此温度下合成是可能的。利用4种特异引物依靠一种高活性链置 换DNA聚合酶。使得链置换DNA合成在不停地自我循环。扩增分两个阶段。 第1阶段为起始阶段,任何一个引物向双链DNA的互补部位进行碱基配对延伸时,另一条链就会解离,变成单链。上游内部引物FIP的F2序列首先与模板F2c 结合(如图B所示),在链置换型DNA聚合酶的作用下向前延伸启动链置换合成。外部引物F3与模板F3c结合并延伸,置换出完整的FIP连接的互补单链(如图C所示)。FIP上的F1c与此单链上的Fl为互补结构。自我碱基配对形成环状结构(如 图C所示)。以此链为模板。下游引物BIP与B3先后启动类似于FIP和F3的合

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