植物DNA条形码序列筛选与鉴定研究

DNA条形码是指用短的、标准的DNA序列作为物种标记来鉴定物种的一种新技术,它是传统形态学分类的有效补充。目前,植物类群中DNA条形码的研究和应用尚处于探索阶段,筛选候选片段、进而确定通用条形码是当前植物条形码研究的首要任务。

为了评估候选条形码在植物中的通用性,本文选取了植物主要类群之一裸子植物门作为取样对象进行研究。此外,由于DNA条形码的应用主要集中在属内物种水平,因此本文还专门针对被子植物门中蔷薇科和大戟科两个具体类群进行小范围研究,进而加快植物标准DNA条形码的确定,促进植物完整条形码数据库的建立。

综合实验分析结果,得出的主要结论如下：(1)基于扩增效率、种内种间遗传距离、"DNA barcoding gap"和物种鉴定能力四个筛选标准,本文评估了七个DNA 片段(psbA-trnH, rbcL, matK, rpoB, rpoCl,ITS和ITS2)对裸子植物鉴定的有效性。研究结果表明ITS2是所选片段中最适合鉴定裸子植物的条形码。

为了进一步验证ITS2对裸子植物的鉴定能力,我们扩大了样本范围对其进行评估。对于涵盖12科80属502种的888个样本,ITS2的正确鉴定效率在种水平和属水平分别达到73%和98%。

(2)以蔷薇科植物为研究对象,本文分别对四个DNA片段(rbcL, matK, rpoCl 和ITS2)的扩增成功率、遗传距离差异、"DNA barcoding gap"和物种鉴定能力四个方面进行了评估和比较。研究结果表明ITS2是所评估DNA片段中最有潜力的DNA条形码。

为了进一步检验ITS2对蔷薇科植物鉴定的有效性,本文基于一个更大的样

本量对其进行验证。对于来自96属893种的1410个样本,ITS2可以将其78%的样本正确鉴定到种,属水平的鉴定成功率可达到100%。

此外,本文还专门针对蔷薇科中12个富含密切相关种的属进行了研究。结果表明,除了Amelanchier, Alchemilla和Rosa之外,ITS2对其他九个属均有较高的物种鉴定成功率(69%-97%)。

对于含有大于100个物种的属(Cliffortia, Prunus和Rubus),ITS2仍能正确鉴定>70%的物种。(3)通过对大戟科植物四个DNA条形码候选序列rbcL, matK, ITS和ITS2在种内种间遗传距离差异,"DNA barcoding gap"以及物种鉴定能力等方面的评估和比较,结果表明,ITS/ITS2非常适合鉴定大戟科植物。

为了证明ITS/ITS2的鉴定能力,本文在扩大样本量的基础上对这两个片段进行了进一步评估,对于大戟科66属871种的1183个样本,ITS/ITS2可以成功鉴定大于90%的种以及100%的属。此外,本文还专门研究了ITS/ITS2对大戟科中七个属(Andrachne, Mallotus, Euphorbia, Croton, Phyllanthus, Macaranga and Glochidion)的鉴定能力。

结果表明,ITS／ITS2对七个属均有较高的物种鉴定成功率(68%-100%)。对于Euphorbia和Croton两个属,每个属的物种数均大于240个,ITS／ITS2仍能正确鉴定88%-99%的物种。

本研究以裸子植物、蔷薇科以及大戟科为例,系统地分析和比较了不同DNA 片段作为植物DNA条形码的鉴定有效性。ITS2在所选取的三个植物分类单元中均有较好表现,因而我们的研究结果表明ITS2有潜力成为植物标准DNA条形码之一。

该研究将会给其他植物类群DNA条形码研究提供参考并最终促进植物标准

DNA条形码的确定。

条形码与二维码的优缺点分析

条形码与二维码的优缺点分析什么是条形码？条形码(barcode)是将宽度不等的多个黑条和空白，按照一定的编码规则排列，用以表达一组信息的图形标识符。常见的条形码是由反射率相差很大的黑条（简称条）和白条（简称空）排成的平行线图案。条形码可以标出物品的生产国、制造厂家、商品名称、生产日期、图书分类号、邮件起止地点、类别、日期等许多信息，因而在商品流通、图书管理、邮政管理、银行系统等许多领域都得到广泛的应用。条形码技术，是随着计算机与信息技术的发展和应用而诞生的，它是集编码、印刷、识别、数据采集和处理于一身的新型技术。它的种类包括有：EAN码，UPC码，UCC/EAN-128码，交叉25码，39码，以及库德巴码。各种不同种类的 UPC-E码条形码的发展历程最早被打上条形码的产品是箭牌口香糖。条形码技术最早产生在风声鹤唳的二十世纪二十年代，诞生于威斯汀豪斯（Westinghouse）的实验室里。一位名叫约翰·科芒德（John Kermode）性格古怪的发明家“异想天开”地想对邮政单据实现自动分检，那时候对电子技术应用方面的每一个设想都使人感到非常新奇。他的想法是在信封上做条码标记，条码中的信息是收信人的地址，就象今天的邮政编码。为此科芒德发明了最早的条码标识，设计方案非常的简单（注：这种方法称为模块比较法），即一个“条”表示数字“1”，二个“条”表示数字“2”，以次类推。然后，他又发明了由基本的元件组成的条码识读设备：一个扫描器（能够发射光并接收反射光）；一个测定反射信号条和空的方法，即边缘定位线圈；和使用测定结果的方法，即译码器。此后不久，随着LED（发光二极管）、微处理器和激光二极管的不断发展，迎来了新的标识符号（象征学）和其应用的大爆炸，人们称之为“条码工业”。今天很少能找到没有直接接触过即快又准的条形码技术的公司或个人。由于在这一领域的技术进步与发展非常迅速，并且每天都有越来越多的应用领域被开发，用不了多久条形码就会像灯泡和半导体收音机一样普及，将会使我们每一个人的生活都变得更加轻松和方便。条形码的的运作原理识别原理要将按照一定规则编译出来的条形码转换成有意义的信息，需要经历扫描和译码两个过程。物体的颜色是由其反射光的类型决定的，白色物体能反射各种波长的可见光，黑色物体则吸收各种波长的可见光，所以当条形码扫描器光源发出的光在条形码上反射后，反射光照射到条码扫描器内部的光电转换器上，光电转换器根据强弱不同的反射光信号，转换成相应的电信号。根据原理的差异，扫描器可以分为光笔、红光CCD、激光、影像四种。电

商品学论文-条形码在商场中的应用分析

条形码在商场中的应用分析（摘要：条形码，绝大多数人都认识，它在商场中的运用，极大地方便了人们的购物生活，由于它的功能的强大，也越来越受到各方面的重视，社会在逐步更加充分的开发条形码的作用和功能。本论文通过介绍条形码的内容、功能、作用等，进一步阐述条形码在现代的商业社会，特别是一些大型商场的广泛作用。）正文：所谓的条形码，在一些商场里面随处可见，许多的超市，你会发现里面的商品，每件上面都贴有由一排黑色线条组成的标签，这就是条形码。仔细看一下，就会发现条形码上的线条有宽、有窄；黑线条之间是空白，空白也是有宽、有窄。正式的说，条形码是一门技术，通过查找资料，我们知道，条形码是在计算机应用和实践中产生并发展起来的一种广泛应用于商业、邮政、图书管理、仓储、工业生产过程控制、交通等领域的自动识别技术，具有输入速度快、准确度高、成本低、可靠性强等优点，在当今的自动识别技术中占有重要的地位。条形码是由一组规则排列的条、空以及对应的字符组成的标记，“条”指对光线反射率较低的部分，“空”指对光线反射率较高的部分，这些条和空组成的数据表达一定的信息，并能够用特定的设备识读，转换成与计算机兼容的二进制和十进制信息。通常对于每一种物品，它的编码是唯一的，对于普通的一维条形码来说，还要通过数据库建立条形码与商品信息的对应关系，当条形码的数据传到计算机上时，由计算机上的应用程序对数据进行操作和处理。因此，普通的一维条形码在使用过程中仅作为识别信息，它的意义是通过在计算机系统的数据库中提取相应的信息而实现的。通过查询资料，了解到条形码技术有如下优点：1、输入速度快：与键盘输入相比，条形码输入的速度是键盘输入的5倍，并且能实现"即时数据输入"。2，可靠性高：键盘输入数据出错率为三百分之一，利用光学字符识别技术出错率为万分之一，而采用条形码技术误码率低于百万分之一。 3、采集信息量大：利用传统的一维条形码一次可采集几十位字符的信息，二维条形码更可以携带数千个字符的信息，并有一定的自动纠错能力。 4、灵活实用：条形码标识既可以作为一种识别手段单独使用，也可以和有关识别设备组成一个系统实现自动化识别，

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则 1. 背景中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题，鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性，为保证中药材临床应用安全、准确、有效，有必要增加中药材DNA条形码分子鉴定法。 2. 定义及原理 DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术，是传统形态鉴别方法的有效补充。由于DNA序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基以不同顺序排列组成，因此一定长度DNA序列能够区分不同物种。中药材DNA条形码分子鉴定是以ITS2为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系，其中植物类中药材选用ITS2为主体序列，psbA-trnH为辅助序列，动物类中药材采用COI为主体序列，ITS2为辅助序列，符合中药材鉴定简单、精确的特点，有明确的判断标准，能够实现对中药材及其基原物种的准确鉴定。本指导原则用于规范中药材DNA条形码分子鉴定法，为其应用提供指导。 3. 适用范围适用于中药材(包括药材、药材粉末及部分药材饮片)及基原物种的鉴定。4. 方法流程中药材DNA条形码分子鉴定法主要包括供试品处理、DNA提取、PCR扩增、测序、序列拼接及结果判定，以下内容详细说明各流程中的主要原理及注意事项。1）供试品处理除特殊标明外，药材使用75%乙醇擦洗表面后晾干，称取10-100 mg备用。具体见各药材项下。 2）DNA提取 DNA的提取包括破碎细胞壁、释放DNA，DNA的分离和纯化，DNA的浓缩、沉淀与洗涤等基本步骤，目前常用试剂盒法，包括植物基因组DNA提取试剂盒和动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒。由于植物类中药材种类繁多，可根据所研究中药材的具体情况对提取方法加

我国期刊条形码分析及使用

“=L1+J1+H1+F1+D1+B 1”（相当于奇数位之和），在A4单元格中输入 “=A2+A3”，之后，通过人工计算，用10减去A4单元格数字的个位，即得校验码C的值（见图1，由于此时E1，F1，G1，H1，I1，J1，K1，L1，M1还没有输入具体数字，所以A2，A3，A4单元显示是错误的）。以2012年出版的《出版科学》为例，将 D1D2D3D4D5D6D7分别用1009585代替，Y1Y2 用12代替，结果如图2所示，计算结果为94，用10减去94的个位数4，即得到的校验码为6，因此《出版科学》2012年全年的主代码为：9771009585126。图1 条码主码中校验码计算示意图图2 以《出版科学》2012年的条码主码的校验码计算为例 1.2 附加码附加码S1S2表示连续出版物的系列号，即周或月份的序数。附加码S1S2的取值见表2中的第2列。表2 附加码S1S2的取值标准中的笔者建议出版周期S1S2 备注S1S2 备注周刊01~53 用出版周的序数表示01，02，……52 周刊，全年刊期 52期旬刊01~36 用出版旬的序数表示01，02，……， 36 旬刊，全年刊期 36期双周刊02，04，06~52或 01~03~05~53 用出版周的序数表示 01，02，……， 26 双周刊，全年刊期26期半月刊01~24 用出版半月的序数表示01，02，……， 24 半月刊，全年刊期24期

《期刊出版形式规范》规定：“期刊条码的附加码应与期刊出版的刊期和（或）出版的年份、月份或期号保持一致”。由表2可以看出，由于期刊出版月份不固定，例如，有的双月刊逢单月出版则附加码分别表示为（01，03，05，07，09，11），逢双月出版则分别为02，04，06，08，10，12，这样在阅读附加码时，还必须结合刊期才能断定是第几期，不具有唯一性。季刊的情况更麻烦，要分3种情况，季头，季中，季末则有3 种表示方式：（01，04，07，10），（02，05，08，11），（03，06，09，12）。所以，笔者建议，采用期刊的刊期作为附加码，去掉《期刊出版形式规范》中的期刊条码的附加码应与期刊出版年份、月份保持一致的规定。具体见表2中的第4列。例如对于双月刊来说，今后不管是逢单月出还是逢双月出，附加码都是唯一的，因为采用期次作为附加码，刊期为双月刊的期刊一年出版6期，提供的附加码就是01，02，……，06这6组数字。南红梅等[3]也撰文建议采取这种作法，这样，期刊条码中的附加码就具有了唯一性，便于各编辑部选择。由于《出版科学》是双月刊，所以2012年各期的附加码分别是：01，02，

DNA条形码

DNA条形码技术研究进展摘要： DNA条形码（DNA barcoding）是近几年国际生物学研究的重点，即通过使用短标准核酸片段，对物种进行快速、准确的识别和鉴定。该技术在动物研究中采用线粒体COI基因中650bp片段，在植物中条形码主要在叶绿体基因组上进行选择，此外还有核基因ITS等。虽然DNA条形码研究还处于起步阶段，面临巨大的挑战，但是越来越多的研究表明DNA条形码可以广泛应用于生物的分类和鉴定，是一种简便、高效、准确的物种鉴定技术。本文简略的概述了DNA条形码的主要研究方法，开发应用以及面对的困难和争议，并展望该技术在生命科学领域的发展前景。关键词：DNA条形码，物种鉴定，分类引言科学准确的鉴别区分物种是进一步开展深入研究的和利用的前提和基础。自瑞典植物学分类家Carolus Linnaeus建立双名法命名体系以来，虽然已经鉴定出大约一百七十万种生物，但是地球生物种类繁多，已鉴定分类的物种斤占生物总数约15%，人类仍然没有认识鉴定的物种占大多数，尤其是深海，原始丛林中的物种。传统生物分类法主要依据形态学特征，比较解剖学等，在形态特征显著的脊椎动物，高等植物，昆虫等生物类群中应用效果较好，对形态差异较小的微小生物则差强人意，此外许多生物的形态容易受环境及生理时期影响，会导致分类产生误差。自上世纪五十年代DNA双螺旋结构提出以来，人类对遗传物质的认识与日俱增，特别是PCR技术、测序技术和生物信息学技术的飞速发展，推动了利用DNA 蕴藏的信息对系统发育学的快速发展，并应用至生物分类学研究。条形码技术是现代零售业发展的需求而产生的，在零售业的商品管理与销售中发挥了无法替代的关键作用。生物分类学家从中得到启示，DNA分子一级结构上的线性核苷酸序列可以建立类似的生物条形码，应用于快速鉴别生物。基于此，加拿大Guelph大学教授Hebert等（2003a）首次提出DNA条形码（DNA barcoding）

DNA条形码技术

D N A条形码技术 -标准化文件发布号：（9456-EUATWK-MWUB-WUNN-INNUL-DDQTY-KII

DNA条形码技术一、DNA条形码 1、定义 DNA条形码（DNA barcode）是指生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。 2、特点理想的DNA barcoding应当符合下列标准：(1)具有足够的变异性以区分不同的物种，同时具有相对的保守性；(2)必须是一段标准的DNA区来尽可能鉴别不同的分类群；(3)目标DNA区应当包含足够的系统进化信息以定位物种在分类系统(科、属等)中的位置；(4)应该是高度保守的引物设计区以便于通用引物的设计；(5)目标DNA区应该足够的短以便于有部分降解的DNA的扩增… 。 DNA barcoding作为生物“种水平species—level”鉴定的工具引人注目。Genbank数据库中CO I序列正在快速增加。Min等分析了CO I序列及其来源基因组核苷酸含量之间的关系，结果表明849个CO I基因的5 端的DNA barcoding 序列令人惊奇地准确地代表了其来源完整线粒体基因mtDNA的重要信息，也就是说对于未测序的基因组，从DNA barcoding能快速预知完整基因组的组成。 3、优点（1）以DNA序列为检测对象，其在个体发育过程中不会改变。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的，即经过加工，形态发生变化，而DNA序列信息不会改变，较之传统的方法，扩大了检测样本范围；同时样本部分受损也不会影响识别结果。（2）可进行非专家物种鉴定。该技术是机械重复的，只要设计一套简单的实验方案，经过简单培训的技术员即可操作。（3）准确性高。特定的物种具有特定的DNA序列信息，而形态学鉴别特征会因趋同和变异导致物种的鉴定误差。

条形码的识别图像处理报告解析

华侨大学厦门工学院图像通信课程设计报告题目：基于数字图像处理的条形码识别专业、班级：学生姓名：学号：指导教师：分数:

目录一、设计任务及要求 (3) 二、设计原理及设计方案 (3) 2.1、条码译码原理 (3) 2.2条码译码方案 (4) 三、设计步骤与结果 (10) 3.1设计步骤 (10) 3.2结果分析 (11) 四、课程设计总结 (15) 五、心得体会 (15) 六、参考文献 (16) 附录一、源程序 (17) 附录二、成绩评定表 (25)

一、设计任务及要求本课程设计研究的是基于数字图像处理的EAN-13条形码识别算法，通过工具平台MATLAB 实现。其中图像处理部分是条码识别重要的前期工作，利用MATLAB 强大的图象处理工具箱实现图像的读入、加噪仿真、滤波、二值化处理等工作，最终得到高质量的二值化图像。条码识别就是在二值图像的基础上实现，二值图像的质量直接关系到条码能否正确识读。二、设计原理及设计方案 2.1、条码译码原理：如图1-1所示是EAN-13条码的一个字符。条、空宽度的定义如下：图中1C 、 2C 、3C 、4C 表示每个字符中四个相邻条、空的宽度，T 表示一个字符的宽度。图1-1 EAN-13条码宽度的定义设一个字符中单位模块的宽度为n ，则单位模块的宽度: n=T /7 T=1C +2C +3C +4C 由于条码条、空宽度1C 、2C 、3C 、4C 已知，设条码条、空分别占单位模块的个数为i m ,则： i m =i C /n(其中i 取1、2、3、4) 因此，由mi 可知道条码的编码。例如：（1）若1m =2、2m =2、3m =2、4m =1; 条码的排列为条-空-条-空，则可知条码编码为1100110，是右侧偶性字符1；

中药材dna条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(版)中的应用复习课程

中药材D N A条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(2015年版)中的应用

《中药制剂分析》课程论文中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》（2015年版）中的应用药学（药物分析方向）2012级指导教师：高晓霞 2015 年 11月

摘要：中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题，鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性，为保证中药材临床应用安全、准确、有效，有必要增加中药材DNA条形码分子鉴定法。如今分子生物学技术在中药材鉴定领域的应用已逐步深入。《中国药典》2010年版收载了乌梢蛇饮片、蕲蛇饮片、川贝母药材的DNA分子鉴定方法，而《中国药典》2015年版收载了“中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则”，DNA条形码分子鉴定法是利用公认的相对较短的DNA序列来进行物种假定的一种分子生物学技术，是传统形态鉴别方法的有效补充。这标志着中药材的分子鉴定由实验室科研层面进入国家标准的应用层面。关键词：中药材；DNA；鉴定；指导原则一、中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[1] 1.1定义及原理该鉴定方法主要适用于中药材（包括药材、药材粉末及部分药材饮片）及基原物种的鉴定。DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术，是传统形态鉴别方法的有效补充。由于DNA序列是由腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）4种碱基以不同顺序排列组成，因此一定长度DNA序列能够区分不同物种。中药材DNA条形码分子鉴定指导原则通过对大样本量中药材进行DNA条形码分子鉴定研究，建立以ITS2为核心，psbA-trnH为辅的植物类药材DNA条形码鉴定体系和以COI为主、ITS2为辅的动物类药材DNA条形码鉴定体系。 1.2方法与步骤

中国条形码技术市场的发展分析

中国条形码技术市场的发展前沿动态导读：在当今条形码技术发展非常迅速，并且每天都有越来越多的应用领域被开发，用不了多久条形码就会象灯泡和半导体收音机一样普及，将会使我们每一个人的生活都变得更加轻松和方便。条形码技术诞生有一个故事由来，最早产生于二十世纪二十年代的Westinghouse实验室里。一位名叫John Kermode性格古怪的发明家“异想天开”地想对邮政单据实现自动分检，那时候对电子技术应用方面的每一个设想都使人感到非常新奇。他的想法是在信封上做条码标记，条码中的信息是收信人的地址，就象今天的邮政编码。Kermode发明的条码标识，设计方案非常简单，即一个“条”表示数字“1”，二个“条”表示数字“2”，以次类推。然后，他又发明了由基本的元件组成的条码识读设备：一个扫描器(能够发射光并接收反射光);一个测定反射信号条和空的方法，即边缘定位线圈;和使用测定结果的方法，即译码器。 Kermode的扫描器利用当时新发明的光电池来收集反射光。“空”反射回来的是强信号，“条”反射回来的是弱信号。与当今高速度的电子元气件应用不同的是，Kermode利用磁性线圈来测定“条”和“空”。就象一个小孩将电线与电池连接再绕在一颗钉子上来夹纸。Kermode 用一个带铁芯的线圈在接收到“空”的信号的时候吸引一个开关，在接收到“条”的信号的时候，释放开关并接通电路。因此，最早的条码阅读器噪音很大。开关由一系列的继电器控制，“开”和“关”由打印在信封上“条”的数量决定。通过这种方法，条码符号直接对信件进行分检。

直到1949年的专利文献中才第一次有了Norm Woodland和Bernard Silver发明的全方位条形码符号的记载，后来到了1970年Iterface Mechanisms公司开发出“二维码”之后，才有了价格适于销售的二维矩阵条码的打印和识读设备。那时二维矩阵条形码用于报社排版过程的自动化。此后不久，随着LED(发光二极管)、微处理器和激光二极管的不断发展，迎来了新的标识符号(象征学)和其应用的大爆炸，人们称之为“条码工业”。今天做条形码的企业琳琅满目，如何选择有保障的条形码企业是每一个想买条形码客户所要考虑的首要问题，通过市场调查发现，在中国有10个比较出名的企业，鹭源条码科技网居其中之一，有周到的售前咨询，售后技术支持，以强硬的服务诚信确保客户的利益，有将近10年的经验技术做后盾。在当今条形码技术发展非常迅速，并且每天都有越来越多的应用领域被开发，用不了多久条形码就会象灯泡和半导体收音机一样普及，将会使我们每一个人的生活都变得更加轻松和方便。

植物DNA条形码研究简介

植物DNA条形码摘要DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统, 从而实现对物种的快速自动鉴定。尽管这一技术在理论上和具体应用上仍存在很多争论, 但DNA条形码概念自2003年由加拿大分类学家Paul Hebert首次提出后就在世界范围内受到了广泛关注。该技术在动物研究中已得到广泛的应用，所采用的标准片段是线粒体COl基因中约650 bp长的一段。然而在植物DNA条形码的研究进展相对缓慢，目前尚处于对所提议的各片段比较和评价阶段，还未获得一致的标准片段。由于植物中线粒体基因组进化速率较慢，因此条形码片段主要在叶绿体基因组上进行选择，被提议的编码基因片段主要有rpoB，rpoC1，matK,rbcL，UPA，非编码区片段有trnH-psbA，atpF-atpH,psbK-psbl,此外还有核基因ITS。关键词DNA条形码，物种识别，ITS, matK, 形态分类学，植物DNA条形码, rbcL, trnH-psbA，DNA barcoding，DNA barcode，plant DNA barcoding 期刊或会议生命条形码联盟(CBOL):由研究条形码的学者、专家所组成的国际性组织。2008年2月在昆明召开“中国生命条形码研究战略研讨会”。会议邀请十余名国外顶级专家以及国内植物、动物、微生物的知名学者，就DNA条形码的研究技术、策略和进展以及条形码管理发表演讲。中国科学院、国家自然科学基金委员会及科技部领导和近150名国内外专业人士参加了本次会议。2009年，为了明确中国生命条形码研究的发展战略，部署与生命条形码相关的各项工作，由中国科学院牵头，中科院动物研究所承办的“生命条码联盟（CBOL，the Consortium for the Barcode of Life）中国会议”近日召开。本次大会的主题是：建立国内的生命条形码合作平台，保持独立性并体现特色，在此基础上实现与国际进行接轨合作。大会旨在引进国际上生命条形码发展的先进理念、技术和成功经验，扩大与世界各国在生命条形码相关领域的交流与合作，进一步推进并指导我国生命条形码发展进程。 PLOS：公共科学图书馆（Public Library of Science，简称PLoS）是一个由科学家和医生组成的非营利机构，致力于把世界上科学和医学的文献作为免费资源向公众开放。2003年，PLoS作出一个非营利科学医学发布的决定，为科学家和医生提供高质量高水平的期刊，其中会发布他们最重要的作品。在这个开放资源的模式下，PLoS期刊直接在网上可以看到，免费使用，之后再发布或使用也没有任何限制，只要按创作共享注明出处授权条款的要求注明作者和来源即可。 Molecular Ecology Resources：分子生物学期刊

解析商品条形码

解析商品条形码商品条形码是指由一组规则排列的条、空及其对应字符组成的标识，用以表示一定的商品信息的符号。其中条为深色、空为纳色，用于条形码识读设备的扫描识读。其对应字符由一组阿拉伯数字组成，供人们直接识读或经过键盘向计算机输入数据运用。这一组条空和相应的字符所表示的信息是相同的。条形码技术是随着计算机与信息技术的开展和应用而降生的，它是集编码、印刷、辨认、数据采集和处置于一身的新型技术。运用条形码扫描是今后市场流通的大趋向。为了使商品可以在全世界自在、普遍地流通，企业无论是设计制造，申请注册还是运用商品条形码，都必需遵照商品条形码管理的有关规则。目前世界上常用的码制有ENA条形码、UPC条形码、二五条形码、穿插二五条形码、库德巴条形码、三九条形码和128条形码等，而商品上最常运用的就是EAN商品条形码。 EAN商品条形码亦称通用商品条形码，由国际物品编码协会制定，通用于世界各地，是目前国际上运用最普遍的一种商品条形码。我国目前在国内推行运用的也是这种商品条形码。EAN商品条形码分为EAN－13（规范版）和EAN－8（缩短版）两种。 EAN－13通用商品条形码普通由前缀局部、制造厂商代码、商品代码和校验码组成。商品条形码中的前缀码是用来标识国度或地域的代码，赋码权在国际物品编码协会，如00-09代表美国、加拿大。45－49代表日本。690-692代表中国大陆，471代表我国台湾地域，489代表香港特区。制造厂商代码的赋权在各个国度或地域的物品编码组织，我国由国度物品编码中心赋予制造厂商代码。商品代码是用来标识商品的代码，赋码权由产品消费企业本人行使，消费企业依照规则条件本人决议在本人的何种商品上运用哪些阿拉伯数字为商品条形码。商品条形码最后用1位校验码来校验商品条形码中左起第l－12数字代码的正确性。商品条形码的编码遵照独一性准绳，以保证商品条形码在全世界范围内不反复，即一个商品项目只能有一个代码，或者说一个代码只能标识一种商品项目。不同规格、不同包装、不同种类、不同价钱、不同颜色的商品只能运用不同的商品代码。商品条形码的规范尺寸是37.29mmx26.26mm,放大倍率是0.8-2.0。当印刷面积允许时，应选择1.0倍率以上的条形码，以满足识读请求。放大倍数越小的条形码，印刷精度请求越高，当印刷精度不能满足请求时，易形成条形码识读艰难。由于条形码的识读是经过条形码的条和空的颜色比照度来完成的，普通状况下，只需可以满足比照度（PCS值）的请求的颜色即可运用。通常采用淡色作空的颜色，如白色、橙色、黄色等，采用深色作条的颜色，如黑色、暗绿色、深棕色等。最好的颜色搭配是黑条白空。依据条形码检测的理论经历，红色、金色、浅黄色不宜作条的颜色，透明、金色不能作空的颜色。 EAN－8商品条形码是指用于标识的数字代码为8位的商品条形码，由7位数字表示的商品项目代码和1位数字表示的校验符组成。商品条形码的降生极大中央便了商品流通，现代社会已离不开商品条形码。据统计，目前我国已有50万种产品运用了国际通用的商品条形码。我国参加世贸组织后，企业在国际舞台上必将博得更多的活动空间。要与国际惯例接轨，顺应国际经贸的需求，企业更不能慢待商品条形码。信息来源：条码设备网原文地址：https://www.360docs.net/doc/8e11734118.html,/detail/75-3605.html

DNA条码

DAN条码的应用及前景摘要：DNA条形码技术在最近几年发展迅速，本文就DNA条码技术在医学媒介生物鉴定中的应用，用该技术进行物种鉴定具有快速、简便的优点，及其DNA条码技术的背景进行了介绍。关键词：DNA 条形码技术；背景；物种鉴定；生物多样性保护 DNA条形码技术是运用来自生物体基因组适当部分的一段短的核苷酸序列对物种进行种级水平鉴定，DNA条形码技术的核心是选择合适的DNA片断其变异速率必须足够的慢从而使种内变异最小，同时也要求充分的快来显示种间变异，同时它必须相对容易得到，人或缺失尽量的少，使序列的对比更容．理想中的DNA条码技术应符合下列标准：(1)．同一物种不同个体之间作为条码的DNA序列一致，而不同物种之间具有差异；(2)．应该是标准化的，即同分类群使用相同的DNA片断作为条码；(3)．条码DNA片断应包含足够的系统发育信息，以便很容易将未知的或尚未“编条码”物种划入其分类等级(属，科等)中；(4)．应该非常稳健，有高度保守的引物区和高可靠性的DNA扩增和测序；(5) 条码DNA片断应该足够的短，以便允

许降解的DNA 的扩增．因此，理想的DNA条码标记应具有差异的，标准化的，含有系统发育信息，极度稳健并且短的等特性，不但这样的一个理想的DNA标记尚未被发现，或许，根本存在?．用于动物和真菌的分子条形码技术的DNA片段——线粒体eoxl基因(编码细胞色素氧化酶亚基1)在陆地植物中高度保守，因此不适合作为植物的DNA条码．事实上，在植物中所有的线粒体基因进化速度都太慢，以至于不能精确的鉴别物种，因此它没有被选作植物的DNA条形码技术．核基因组在植物系统发育研究中通常使用I TS 序列，但核基因组高拷贝区复杂的一致性进化和旁系同源等性质，影响了该片断在某些类群的植物中的运用．在比较了7个主要候选质体DNA片断(at pF —at pH 间隔区，mat K基因，r b c L基因，r poB基因，r poC1基因，psbK—psbI间隔区，和t r nH—ps b A 间隔区)的性能后，CBOL推荐r b c L．mat K两个片断的联合作为植物条形码．通过对通用性、序列质量、分辨率和成本之间复杂的权衡后，这种提议可能是目前最务实的方案．[1]以2个位点r b c L—mat K为核心的条码为运用DNA序列数据鉴定物种提供了一个通用的框架，从而有助于发现陆地植物中更多的物种．选择了合适的用于分析的DNA 区段以后，必须

植物DNA条形码序列筛选与鉴定研究

植物DNA条形码序列筛选与鉴定研究 DNA条形码是指用短的、标准的DNA序列作为物种标记来鉴定物种的一种新技术,它是传统形态学分类的有效补充。目前,植物类群中DNA条形码的研究和应用尚处于探索阶段,筛选候选片段、进而确定通用条形码是当前植物条形码研究的首要任务。为了评估候选条形码在植物中的通用性,本文选取了植物主要类群之一裸子植物门作为取样对象进行研究。此外,由于DNA条形码的应用主要集中在属内物种水平,因此本文还专门针对被子植物门中蔷薇科和大戟科两个具体类群进行小范围研究,进而加快植物标准DNA条形码的确定,促进植物完整条形码数据库的建立。综合实验分析结果,得出的主要结论如下：(1)基于扩增效率、种内种间遗传距离、"DNA barcoding gap"和物种鉴定能力四个筛选标准,本文评估了七个DNA 片段(psbA-trnH, rbcL, matK, rpoB, rpoCl,ITS和ITS2)对裸子植物鉴定的有效性。研究结果表明ITS2是所选片段中最适合鉴定裸子植物的条形码。为了进一步验证ITS2对裸子植物的鉴定能力,我们扩大了样本范围对其进行评估。对于涵盖12科80属502种的888个样本,ITS2的正确鉴定效率在种水平和属水平分别达到73%和98%。 (2)以蔷薇科植物为研究对象,本文分别对四个DNA片段(rbcL, matK, rpoCl 和ITS2)的扩增成功率、遗传距离差异、"DNA barcoding gap"和物种鉴定能力四个方面进行了评估和比较。研究结果表明ITS2是所评估DNA片段中最有潜力的DNA条形码。为了进一步检验ITS2对蔷薇科植物鉴定的有效性,本文基于一个更大的样

中国动物药材DNA条形码数据库

中国动物药材DNA 条形码数据库 [摘要]课题组联合相关研究者开展动物药材DNA 条形码分子鉴定研究，并结合分析GenBank 序列，采用BLAST 分析防错、系统树分析防错和Barcoding Gap 检验防错等方法核验序列的可靠性，构建了中国动物药材DNA 条形码数据库。该库由样品数据库、序列数据库和文献数据库组成，包含800 余种动物药材和大量动物药材混伪品及密切相关物种。中国动物药材DNA 条形码数据库可以通过中药材DNA 条形码鉴定系统 ( https://www.360docs.net/doc/8e11734118.html, )进行网络访问并实现未知动物样本的DNA 条形码鉴定。该研究首次构建统一的中国动物药材DNA 条形码数据库，对动物药材鉴定、资源可持续利用和濒危物种保护均有重要意义。 [关键词]动物药材；数据库；COI ；鉴定 DNA 条形码技术是动物药材鉴定的新工具[1] ，国家药典委员会已讨论通过在《中国药典》增补本中列入中药材DNA 条形码分子鉴定指导原则[2] 。本课题组联合相关研究者开展了大量的动物药材DNA 条形码分子鉴定研究工作。鄢丹等对包含羚羊角、鹿角的传统角类药材进行DNA 条形码研究[3] ，并以此为基础提出了濒危动物药材的贸易监控和替代品寻找策略[4] 。张辉等对《中国药典》45 种动物药材及

其混伪品进行 DNA 条形码研究，结果表明 45 种动物药材的正品来源与其混伪品均可相互区分 [5] 。崔丽娜等利用 COI 序列对金钱白花蛇及其常见混伪品进行 DNA 条形码鉴别研究，结果表明，金钱白花蛇 COI 序列可以明确地与混伪品区分开[6] 。胡嵘等对海马、海龙及其混伪品共 14 个种 20 份样品的 COI 条形码序列进行研究，结果表明运用 COI 序列能够准确鉴定海马、海龙的基原动物及其混伪品 [7] 。此外，还开展了龟甲、鳖甲、鹿茸以及蛤壳等的 DNA 条形码研究工作 [8-11] 。动物 DNA 条形码分子鉴定研究工作的大量开展，为构建中国动物药材 DNA 条形码数据库奠定了基础。 DNA 条形码数据库不仅是存储样品信息和 DNA 条形码序列的工具，而且是 DNA 条形码研究和物种鉴定分析的生物信息学平台，对推动 DNA 条形码研究发展具有重要意义 [12] 。第一个国际 DNA 条形码数据系统（ BOLD ）命条形码联盟（ CBOL ）于 2007 年建立 [13] 。此外 Barcode of Life Campaign （ FISH-BOL ， http ： //https://www.360docs.net/doc/8e11734118.html,/ ）， Lepidoptera Barcode of Life （ http ： //https://www.360docs.net/doc/8e11734118.html,/ ）， Mammalia Barcode of Life Campaign http ：//https://www.360docs.net/doc/8e11734118.html,/ ）。此外，邵鹏柱等初步构建了传统药物 DNA 条形码数据库（ http ： //137.189.42.34/mherbsdb/ ），包含 1 661 个物种， 36 679 条序由国际生还有多个针对特定动物类群的条形码数据库，如： Fish

条形码背景详细分析

条形码背景详细分析：条形码在国际上如今被统称条码，条码的形成是将多条粗细不等的黑线与空白处相结而组成，同时按照编码规则统一排列，人们常见的条形码是由黑条（黑色线条部分）与白条（白色的空白部分）排列而成的平行线图案，条形码输出的内容含盖商品的生产国家，制造厂家，商品名称，生产日期，图书分类号，类别，邮件起止地点，日期等许多信息，因此条码在商品领域、邮政管理、银行系统、食品安全及图书管理各个方面得到了广泛的应用。条形码是由前缀部分，生产制造厂商代码，各类商品代码及校验代码组合而成，条码中前缀码代表国家或地区代码，赋码权在国际物品如下:00-09代表美国，加拿大、45-49代表日本、690-695代表中国陆地、471代表中国台湾、489代表香港特区。厂商代码是由各个国家或地区的物品编码组织管理，商品条码最后用1位校验来校对商品条码的正确性，通过条形码识读设备的扫出商品的详细信息，或者通过键盘向计算机输入数据同样可以显示字符所表示的信息。条形码随着信息技术与计算机不断的发展，已经成为市场流通的大趋势，只要商品进入商场、超市、集各大卖场，均需要通过条码扫描来获取商品的各种信息。条码的设计制作、使用、流通，必需通过商品条码管理部门申请注册后方可正常流通使用。条码应用领域:零售业、物流、食品、医疗卫生、服装、建材、汽配等等身份识别。条码识别原理介绍：大家都知道白色物体能够反射各种波长的可见光，而黑色物体则可吸收各种波长的可见光。如想将条码转换成有意义及有价值的信息，那么就需要通过扫描及译码这两个过程才能得到。当条形码扫描器光源发出的光在条码上反射后会将所照射到的条码扫描器内部的光电转换到计算机上，随后会显示出相应的电信号，输出到条码扫描器的放大电路增强信号之后，会送到整形电路将模拟信号转换成数字信号，白条与黑条的宽度不同，相应的电信号持续时间也会差异，译码器通过测量脉冲数字电信号0与1数字来判别白条的数目，0与1信号持续的时间来判别条与空的宽度，此时得到的数据仍然是杂乱无章的，条码所包含的信息是需要根据对应的编码规则。将符号信息转换成数字或字符信息。最终由计算机进行数据处理与管理，随后物品的详细信息将被识别。条码的优越性： 1、真实可靠性强条码的读取准确率远远超过人工的记录水平，据了解平均每15000个字符才会有一个错误发生。 2、操作效率高条码扫描器读取信息速度相当快，大约每秒40个字符。 3、低成本条码与其它的自动化识别技术相对比较，它仅仅只需要一小张贴纸与相对构造成简单的光学

条形码码制解析大全

条形码类型及常见条形码介绍条码是由一组按一定编码规则排列的条,空符号，用以表示一定的字符,数字及符号组成的信息。条码系统是由条码符号设计,制作及扫描阅读组成的自动识别系统。条码卡分为一维码和二维码两种。一维码比较常用，如日常商品外包装上的条码就是一维码。它的信息存储量小，仅能存储一个代号，使用时通过这个代号调取计算机网络中的数据。二维码是近几年发展起来的，它能在有限的空间内存储更多的信息，包括文字、图象、指纹、签名等，并可脱离计算机使用。条码种类很多，常见的大概有二十多种码制，其中包括： Code39码（标准39码）、Codabar码（库德巴码）、Code25码（标准25码）、ITF25码（交叉25码）、Matrix25码（矩阵25码）、UPC-A码、UPC-E码、EAN-13码（EAN-13国际商品条码）、EAN-8码（EAN-8国际商品条码）、中国邮政码（矩阵25码的一种变体）、Code-B码、

MSI码、Code11码、Code93码、ISBN码、ISSN码、Code128码（Code128码，包括EAN128码）、Code39EMS（EMS专用的39码）等一维条码和PDF417等二维条码。目前，国际广泛使用的条码种类有： EAN、UPC码——商品条码，用于在世界范围内唯一标识一种商品。我们在超市中最常见的就是EAN和UPC条码。其中，EAN码是当今世界上广为使用的商品条码，已成为电子数据交换（EDI）的基础；UPC码主要为美国和加拿大使用； Code39码——因其可采用数字与字母共同组成的方式而在各行业内部管理上被广泛使用 ITF25码——在物流管理中应用较多 Codebar码——多用于血库,图书馆和照像馆的业务中另还有Code93码,Code128码等。除以上列举的一维条码外，二维条码也已经在迅速发展，并在许多领域找到了应用。编码字符集 ①数字型数据（数字0～9）； ②字母数字型数据（数字0～9；大写字母A～Z；9个其他字符：space，$，%，*，+，-，.，/，：）； ③8位字节型数据； ④日本汉字字符；

中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则

中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则《中国药典》2015年版本法用于中药材（包括药材及部分饮片）及基原物种的鉴定。 DNA条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术，是传统形态鉴别方法的有效补充。由于不同物种的DNA序列是由腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）四种碱基以不同顺序排列组成，因此对某一特定DNA片段序列进行分析即能够区分不同物种。中药材DNA条形码分子鉴定通常是以核糖体DNA第二内部转录间隔区（ITS2）①为主体条形码序列鉴定中药材的方法体系，其中植物类中药材选用ITS2/ITS为主体序列，以叶绿体psbA-trnH②为辅助序列，动物类中药材采用细胞色素C氧化酶亚基I（COI）③为主体序列，ITS2为辅助序列。一、仪器的一般要求所用仪器有电子天平、离心机、聚合酶链式反应（polymerase chain reaction，PCR）仪、电泳仪和测序仪。 DNA序列测定用测序仪，是一台具有自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段中碱基顺序或大小，以及定量用精密仪器。测序方法主要采用双脱氧链终止法，又称Sanger法。4种双脱氧核苷酸（ddNTP）的碱基分别用不同的荧光进行标记，在通过毛细管时，不同长度的DNA片段上的4种荧光基团被激光激发，发出不同颜色的荧光，被电荷耦合元件图像传感器（charge-coupled device，CCD）检测系统识别，并直接翻译成DNA 序列，获得供试品的峰图文件和序列文件。二、测定步骤本法主要包括供试品处理、DNA提取、DNA条形码序列PCR扩增、电泳检测和序列测定、序列拼接及结果判定，主要步骤如下。

中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》(20重点

《中药制剂分析》课程论文中药材 DNA 条形码分子鉴定法指导原则及其在《中国药典》 (2015年版中的应用药学(药物分析方向 2012级指导教师:高晓霞 2015 年 11月摘要:中药材存在多基原物种及同名异物、同物异名等问题,鉴于传统基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定方法存在局限性,为保证中药材临床应用安全、准确、有效, 有必要增加中药材 DNA 条形码分子鉴定法。如今分子生物学技术在中药材鉴定领域的应用已逐步深入。《中国药典》 2010年版收载了乌梢蛇饮片、蕲蛇饮片、川贝母药材的 DNA 分子鉴定方法,而《中国药典》 2015年版收载了“中药材 DNA 条形码分子鉴定法指导原则” , DNA 条形码分子鉴定法是利用公认的相对较短的 DNA 序列来进行物种假定的一种分子生物学技术, 是传统形态鉴别方法的有效补充。这标志着中药材的分子鉴定由实验室科研层面进入国家标准的应用层面。

关键词:中药材; DNA ;鉴定;指导原则一、中药材 DNA 条形码分子鉴定指导原则 [1] 1.1定义及原理该鉴定方法主要适用于中药材 (包括药材、药材粉末及部分药材饮片及基原物种的鉴定。 DNA 条形码分子鉴定法是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA 序列来进行物种鉴定的一种分子生物学技术, 是传统形态鉴别方法的有效补充。由于 DNA 序列是由腺嘌呤 (A 、鸟嘌呤(G 、胞嘧啶(C 、胸腺嘧啶(T 4种碱基以不同顺序排列组成,因此一定长度 DNA 序列能够区分不同物种。中药材 DNA 条形码分子鉴定指导原则通过对大样本量中药材进行 DNA 条形码分子鉴定研究, 建立以 ITS2为核心, psbA-trnH 为辅的植物类药材 DNA 条形码鉴定体系和以 COI 为主、 ITS2为辅的动物类药材 DNA 条形码鉴定体系。 1.2方法与步骤中药材 DNA 条形码分子鉴定法主要包括供试品处理、 DNA 提取、 PCR 扩增、测序、序列拼接及结果判定,以下内容详细说明各流程中的主要原理及注意事项。 1.2.1 供试品处理除特殊标明外, 药材使用 75%乙醇擦洗表面后晾干, 称取 10~100 Mg 2+备用。 1.2.2 DNA提取 DNA的提取包括破碎细胞壁、释放 DNA , DNA 的分离和纯化, DNA 的浓缩、沉淀与洗涤等基本步骤, 目前常用试剂盒法, 包括植物基因组 DNA 提取试剂盒和动物组织 /细胞基因组 DNA 提取试剂盒。由于植物类中药材种类繁多, 可根据所研究中药材的具体情况对提取方法加以改进。植物细胞内含有大量次生代谢产物,如多糖、多酚等,这些物质在提取 DNA 的过程中与 DNA 共沉淀, 形成黏稠的胶状物难以溶解或产生褐变, 严重影响 DNA 提取的产量与质量, 以及后

DNA条形码技术

DNA条形码技术一、DNA条形码 1、定义 DNA条形码（DNA barcode）是指生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。 2、特点同的物种，同时具有相对的保守性；(2)必须是一段标准的DNA区来尽可能鉴别不同的分类群；(3)目标DNA区应当包含足够的系统进化信息以定位物种在分类计；(5)目标DNA区应该足够的短以便于有部分降解的DNA的扩增… 。 DNA barcoding作为生物“种水平species—level”鉴定的工具引人注目。信息，也就是说对于未测序的基因组，从DNA barcoding能快速预知完整基因组的组成。 3、优点（1）以DNA序列为检测对象，其在个体发育过程中不会改变。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的。同种生物不同生长时期的DNA序列信息是相同的，即经过加工，形态发生变化，而DNA序列信息不会改变，较之传统的方法，扩大了检测样本范围；同时样本部分受损也不会影响识别结果。（2）可进行非专家物种鉴定。该技术是机械重复的，只要设计一套简单的实验方案，经过简单培训的技术员即可操作。（3）准确性高。特定的物种具有特定的DNA序列信息，而形态学鉴别特征会因趋同和变异导致物种的鉴定误差。

（4）通过建立DNA条形码数据库，可以一次性快速鉴定大量样本。分类学家新的研究成果将不断地加入数据库，成为永久性资料，从而推动分类学更加快速深入地发展。 4、运用 DNA条形码技术简单地说，就是通过使用一个或一些短的DNA基因片段作为条形码来对物种进行快速、准确识别的技术。 DNA条形码技术的出现将极大地增强人类监测、了解和利用生物多样性资源的能力，其在生命科学、法医学、流行病学，以及医药、食品质量控制等领域均具有广泛的应用前景。DNA条形码技术不仅会进一步发展传统的分类学研究，更会加速微生物资源的保藏、鉴定工作，推动微生物资源的更有效利用。