分子生物学简答题(整合)(1)

分子生物学简答题(整合)(1)
分子生物学简答题(整合)(1)

2014-2015(2)医学分子生物学复习题

一、名词解释

DNA及基因组(2015年):Tm,核小体,Split gene,多基因家族,EST,SNP Tm值:就是DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。一般DNA在生理条件下Tm值在85-95℃。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm 值越高。

核小体(nucleosome):是染色体的基本结构单位,核小体由DNA和组蛋白(histone)构成。由4种组蛋白H2A、H2B、H3和H4,每一种组蛋白各二个分子,形成一个组蛋白八聚体,约200 bp的DNA分子盘绕在组蛋白八聚体构成的核心结构外面,形成了一个核小体。

断裂基因(Split gene):真核生物结构基因,有若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因或间隔基因.

表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)通过从cDNA文库中随机挑选的克隆进行测序所获得的部分cDNA的5'或3'端序列称为表达序列标签(EST),一般长300-500bp左右。其意义在于有效反映在正常或受控条件中表达的全基因的时空图,EST除提供序列信息外,同时也提供了该基因表达的组织、生理状况与发育阶段的信息。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性。它成为一种信息量非常大的遗传标记系统,并且可以直接以序列的差异作为标记。它的意义在于是定位基因的重要手段,大致了解各个基因或DNA片断之间的相对距离与方向,同时是研究人类基因组遗传与变异的重要手段

多基因家族(multigene family),是指一组具有类似功能,核苷酸序列又有同源性的基因。多基因家族是真核生物基因组最显著的特征之一。它的家族成员在核酸上的同源性提示它们是由同一个祖先基因进化而来的。

RNA(2015年):校正突变与校正tRNA,SD序列和Kozak序列,polyA与polyA signal,单顺反子和多顺反子,RNA编辑,RNA再编码,RNA依赖的RNA聚合酶,反义RNA 校正突变(mutations correction):发生在非起始突变位点上,能够抵消或中和起始突变的第二次突变。

校正tRNA(correction tRNA):通过tRNA分子的突变来校正mRNA上的有害突变就属于基因间的校正,能够校正mRNA中有害突变的tRNA也称为校正tRNA

SD序列(Shine-Dalgarnosequence):原核生物mRNA5`端AUG上游一段富含嘌呤的保守序列。位于起始密码上游25个核苷酸,处,与16SrRNA的3’,末端相应的富含嘧啶序列互补,是在翻译过程中核糖体与mRNA识别与结合的部位,在IF3、IF1促进下和30S亚基结合

Kozak序列是位于真核生物mRNA 5’端帽子结构后面的一段核酸序列,它可以与翻译起始因子结合而介导含有5’帽子结构的mRNA翻译起始。对应于原核生物的SD序列。

polyA真核生物mRNA 3`端的一段约20~250个腺苷酸(polyA)的序列。

polyA-signal:在结构基因的最后一个外显子中有一个保守的AATAAA序列,此位点下游有一段GT丰富区或T丰富区,这两部分序列共同构成poly(A)加尾信号。

mRNA转录到此部位后,产生AAUAAA和随后的GU(或U)丰富区。与RNApol结合的延长因子可以识别这种结构并与之结合,然后在AAUAAA下游10-30个碱基的部位切断RNA,并加上poly(A)尾.

polyA-site:mRNA的多聚A添加位点,RNA转录本上的位点,通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基。

多顺反子(polycistronicmRNA):多个结构基因转录在一条mRNA上。原核生物单顺反子(monocistron):一个结构基因转录在一条mRNA上。真核生物

RNA依赖性RNA 聚合酶(RNA dependent RNA polymerase):RdRp以单链RNA为模板合成与模板互补的核苷酸序列的RNA的酶

mRNA编辑(mRNA editing)许多真核生物基因转录后有一个对mRNA外显子加工的过程,可通过特定碱基的插入、缺失或置换,使mRNA序列中出现移码突变、错义突变或无义突变,导致mRNA与其DNA模板序列不匹配,使同一前体mRNA翻译出序列、功能不同的蛋白质。这种基因表达的调节方式称为mRNA编辑

RNA的再编码(RNA recording):mRNA,科学上把RNA编码和读码方式的改变称为RNA 的再编码,包括重复阅读或跳过不读。

反义RNA(antisense RNA):在细菌和病毒中存在一类调节基因,从基因组中非编码区转录的一段,能与目标mRNA序列互补配对的单链RNA,从而阻断该目标mRNA翻译成蛋白质。

蛋白质(2015年):Anfinsen定律,分子病,超二级结构,朊病毒,分子伴侣Anfinsen定律:蛋白质的一级结构决定其空间结构的正确折叠,包括二硫键的正确配对形成。相似一级结构的蛋白质必有相似的空间结构和功能。

分子病(molecular diseases):由于遗传上的原因而造成的蛋白质分子结构或合成量的异常所引起的疾病。实际上任何由遗传原因引起的蛋白质功能异常所带来的疾病都是分子病,但习惯上把酶蛋白分子催化功能异常引起的疾病归属于先天性代谢缺陷而把除了酶蛋白以外的其他蛋白质异常引起的疾病称为分子病。

超二级结构(super-secondary structure):在一级结构基础上,相邻二级结构单位(ɑ螺旋、β折叠等)在三维折叠中相互靠近,形成超二级结构

蛋白质分子中的一些二级结构单元,有规则地聚集在一起形成全由α螺旋、全由β片层或α螺旋与β片层混合、均有的超二级结构基本形式,具体地说,形成相对稳定的αα、βββ、βαβ、β2α和α Tα (HTH)、α Lα (HLH)等超二级结构,又称模体(motif)。

朊病毒(prion):为蛋白类感染颗粒的缩写,又称蛋白质病毒。是一类能侵染动物并在宿主细胞内复制的蛋白质,不含核酸。

分子伴侣(chaperone;molecular chaperone):分子伴侣是细胞内一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象、促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠。主要有:伴侣蛋白和热休克蛋白

复制(2015年):半不连续复制,大肠杆菌DNA聚合酶I,DNA连接酶,点突变半不连续复制(Half a discontinuous replication):DNA复制时,以3‘→5‘走向为模板的一条链合成方向为5‘→3‘,与复制叉方向一致,称为前导链;另一条以5‘→3‘走向为模板链的合成链走向与复制叉移动的方向相反,称为随从链, 前导链上DNA的合成是连续的,随从链上是不连续的, 先形成许多不连续的片断(冈崎片断),最后连成一条完整的随从链,故称为

半不连续复制

大肠杆菌DNA聚合酶1(E.Coli DNA polymerase)原核细胞中的一种多功能DNA聚合酶,主要有3种作用:①把底物形成3’-5’磷酸二酯键,5’→3’的聚合作用。但不是复制染色体而是修补DNA,填补DNA上的空隙或是切除RNA引物后留下的空隙。②3’→5’的外切酶活性。消除在聚合作用中掺入的错误核苷酸。③5’→3’外切酶活性,切除受损伤的DNA。它在切口平移(nick translation)中应用。

DNA连接酶(DNA Ligase)催化两段DNA之间的连接,也就是催化一段DNA链的5’磷酸根与另一段DNA链的3’-OH形成磷酸二酯键,需要ATP供能(注:底物一定是双链的底物)

点突变( point mutation):指基因中只有一个碱基对发生改变。也称作单碱基替换(base

substitution)。碱基替换又分为转换(transitions)和颠换(transversions)两类。转换:嘌呤和嘌呤之间的替换,或嘧啶和嘧啶之间的替换。颠换:嘌呤和嘧啶之间的替换。

转录(2015年):σ亚基(σ subunit),选择性剪接(alternative splicing),RNA编辑(RNA editing),cDNA,启动子(promoter)

σ亚基(σ subunit):原核生物RNA聚合酶的一个亚基,是转录起始所必需的因子,主要影响RNA聚合酶对转录起始位点的正确识别。它是核心酶和启动子之间的桥梁.。一旦转录开始,σ因子就被释放,而链的延伸则由四聚体核心酶(core enzyme)催化。所以,σ因子的作用就是识别转录的起始位置,并使RNA聚合酶结合在启动子部位。

选择性剪接(也叫可变剪接)(alternative splicing)是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程,而最终的蛋白产物会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性,或者,在相同的细胞中由于表达水平的不同而导致不同的表型。

RNA编辑(RNA editing):指基因转录产生的mRNA分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置换,使成熟RNA序列与编码链DNA外显子序列不同,改变翻译生成的蛋白质的氨基酸组成,扩大了mRNA遗传信息量。

许多真核生物基因转录后有一个对mRNA外显子加工的过程,可通过特定碱基的插入、缺失或置换,使mRNA序列中出现移码突变、错义突变或无义突变,导致mRNA与其DNA 模板序列不匹配,使同一前体mRNA翻译出序列、功能不同的蛋白质。这种基因表达的调节方式称为mRNA编辑(mRNA editing)。

cDNA(complementary DNA):以RNA为模板,在适当引物的存在下,由依赖RNA的DNA 聚合酶(反转录酶)的作用而合成的DNA,并且在合成单链cDNA后,除去与其对应的RNA 以后,以单链cDNA为模板,可合成双链cDNA。

启动子(Promoters):是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。

翻译(2015年):氨基酰tRNA合成酶,蛋白质的靶向输送,核定位序列,摆动配对,EF-Tu 氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase):催化氨基酸的活化及活化氨基酸与特异性tRNA连接反应的酶。此化学反应又可分为两个步骤完成:第一步是以氨基酸和ATP 为底物生成氨基酰-AMP-酶复合体;第二步是AMP-酶被tRNA置换,形成氨基酰-tRNA。这说明氨基酰-tRNA合成酶具有绝对专一性,酶对氨基酸、tRNA两种底物都能高度特异地识别。因有20种氨基酸,故有20种氨基酰- tRNA合成酶。

蛋白质的靶向输送(protein targeting):蛋白质在核糖体上合成后,必须分选出来,定向输送到一个合适部位才能行使各自的生物学功能这一过程称为蛋白质的靶向输送。蛋白质的靶向输送与翻译后修饰过程同步进行。

核定位序列(Nuclear localization signal):靶向输送到细胞核的蛋白质多肽链中含有特异的信号序列被称为NLS,NLS为含4--8个氨基酸残基的短序列,富含带正电荷的赖氨酸、精氨酸、脯氨酸,可位于肽链的不同部位,而不只在N端,不同的NLS间未发现共有序列,在蛋白质进核定位后,NLS不切除。

摆动配对(wobble base pairing):tRNA上反密码子的第1位碱基与mRNA密码子的第3位碱基的配对有时并不严格遵循常见的碱基配对规律,这一现象称为摆动配对mRNA第1,2位碱基固定不变,对应反密码子2,3位碱基固定不变,但是tRNA第3位碱基要变,故反密码子的第1位碱基相应的跟tRNA变。在这个过程中,C和G按A和U 原来的正确方式配对,在U和G时,U可以识别A和G,G可以识别C和U。

EF-Tu:是原核延伸因子之一,帮助延长的安吉酰tRNA进入A位,具有GTP酶活性

癌基因和抑癌基因(2015年):1、癌基因(oncogene)、2、病毒癌基因(virus oncogene)3、细胞癌基因(cellular oncogene)4、原癌基因(proto-oncogene)5、抑癌基因(tumor suppressor gene) 癌基因(oncogene):是细胞基因组内正常存在的控制细胞正常生长和分化的基因,其编码产物通常作为正调控信号,促进细胞的增殖和生长。它的结构异常或表达异常,可诱导细胞发生恶性转化。即指在体外能引起细胞转化,在体内能诱发肿瘤的基因。

细胞癌基因(cellular oncogene, c-onc):存在于生物正常细胞基因组中的癌基因也称细胞癌基因,在正常情况下处于静止或低表达的状态,不仅对细胞无害,而且对维持细胞正常功能具有重要作用,但在异常表达时,其产物可使细胞无限制分裂。

原癌基因(proto-oncogene):将存在于正常细胞内未被激活的癌基因,即与病毒癌基因具有同源性的细胞癌基因也称为原癌基因(proto-oncogene) 它是基因的正常版本,是活化的癌基因的前体,一类编码关键性调控蛋白质的正常细胞基因。表达产物与正常细胞的生长、增殖、分化及调控和发育等功能相关,是生长发育过程中所不可缺少的。

病毒癌基因(viral oncogene):存在于病毒(大多是逆转录病毒)基因组中能使靶细胞发生恶性转化的基因。它不编码病毒结构成分,对病毒无复制作用,但是当受到外界的条件激活时可产生诱导肿瘤发生的作用。

抑癌基因(tumor suppressor gene):是调节细胞正常生长和增殖的基因,其生物学功能与癌基因相反:其基因表达产物对细胞的生长和增殖起负调控作用,并能抑制细胞的转化。

DNA及基因组(2015年):

1、什么是逆转录转座子?Alu序列属于哪一种逆转录转座子?请描述Alu序列在基因组转移的可能机制。

真核生物中等重复序列要先转录成RNA,再逆转录生成cDNA,然后重新整合到基因组中,这

种通过逆转录旁路的转移元件称为逆转录转座子(retroposon),它分两类:一类病毒样逆转录转座子,另一类非病毒样逆转录转座子,Alu属于非病毒样逆转录转座子。

机制:Alu序列的两端有两个7-12bp的正向重复序列,这两个序列与Alu插入基因组DNA 有关。在3’端正向重复序列前还有一段poly(A),而在后面也有一段poly(T)作为RNA 聚合酶III的转录终止位点。转录下来的RNA就有相应的poly(A)和poly(U)序列。Poly (U)可以折过来与poly(A)配对结合。这样逆转录酶就可以识别这一结构,并在poly(U)的3’端游离羟基开始合成cDNA,在完成双链cDNA后再整合到基因组

2、试述线粒体基因组和线粒体病的特点。

线粒体基因组是线粒体DNA为呈环状的双链DNA,不同物种之间大小差别很大。它位于线粒体基质内,每个线粒体中含有多个拷贝。在动物的mtDNA中基因之间的空隙很小,转录是多顺反子,只有单个控制复制和基因表达的非编码区。

人线粒体基因组的特点:

(1)mtDNA结构紧密,几乎都是编码顺序,不含内含子,只有87个核苷酸不参与基因的组成。

(2)mtDNA没有组蛋白包绕,而且两条链不对称, H链有28个编码序列,L链有9个编码序

列。

(3)遗传密码子的意义有所不同。甚至不同种属的线粒体所用的遗传密也有所不同。

(4)mtDNA的突变率高于核DNA,并且缺乏修复能力。(比核基因大10-20倍,4/1000bp)

(5)mtDNA为严格母系遗传。

线粒体疾病以线粒体结构和功能缺陷为主要疾病原因的疾病称为线粒体病。一般情况下,线粒体病主要是由于基因的突变引起的。例如线粒体肌病和脑肌病、线粒体眼病等。

线粒体病的特点:

1.高突变率

2.异质性——指野生型mtDNA与突变型共存与组织细胞的现象。

3.母系遗传——母亲传给儿子和女儿,女儿继续传递。

4.阈值效应——能够引起特定组织器官功能障碍的突变mtDNA的最少数量。该阈值与组织器官特异性有关;与发育阶段有关,新生儿无症状,成年人表现症状;与个体差异有关。分裂旺盛的细胞表现出排斥突变型mtDNA趋势,表现野生趋同现象。静止细胞表现出突变mtDNA 复制优势,导致突变积累。

RNA(2015年):

1、试比较miRNA与siRNA

miRNA与siRNA的比较:

miRNA与siRNA的联系:

1)均为Dicer的切割产物:长度均为22nt左右,siRNA duplex、miRNA duplex

2)均需Argonaute家族蛋白的存在,同为Risc的组分

3)两者进化关系上可能的推论:siRNA是miRNA的补充,

miRNA在进化中替代了siRNA

2、RNA有哪些生物学功能,试举例说明。

1)参与蛋白质的合成:mRNA作为蛋白质合成的模板,tRNA识别mRNA上的密码子并作

为转运载体运送相应氨基酸,rRNA与核糖体蛋白构成核糖体,执行蛋白质的合成功能。

?信使核糖核酸mRNA(模板)

?转运核糖核酸tRNA(工具)

?核糖体核糖核酸rRNA(场所)

2)储存遗传信息:RNA病毒

3)参与催化反应:核酶是具有催化活性的RNA, 即化学本质是核糖核酸(RNA), 却具有酶的

催化功能。核酶的作用底物可以是不同的分子, 有些作用底物就是同一RNA分子中的某些部位。核酶的功能很多,有的能够切割RNA, 有的能够切割DNA, 有些还具有RNA 连接酶、磷酸酶等活性。

4)参与基因表达调节:antisense RNA、siRNA、microRNA。例如miRNA,广泛存在于真核细胞中的一组短小的、不编码蛋白质的RNA家族,由约22nt组成的单链RNA。它参与调节基因表达的机制包括:3`UTR 不完全互补,抑制翻译;与编码区完全互补,降解mRNA。

3、什么是Dicer酶?并述Dicer酶各个结构域的功能。

Dicer酶是RNase III家族成员--核酸内切酶,特异性识别并切割dsRNA 1)PAZ结构域,它具有一个大的延伸环,此环在Dicer序列中保守,能够促使其对RNA 的识别,与dsRNA的末端结合

2)RNA解旋酶结构域:RNA解旋酶结构域通利用ATP提供的能量完成dsRNA的解旋功能,便于Dicer酶进行切割。

3)dsRNA结合结构域:结合dsRNA片段,使之作为对目标mRNA识别的模板。

4)RNase III催化结构域:RNase III催化结构域催化dsRNA降解成siRNA

1)PAZ结构域:专一和蛋白质结合形成复合物

2)dsRNA结合结构域(dsRNA-binding domain,dsRBD):将dsRNA切割产生含21-25个核苷

3)解旋酶结构域(helicase domain):带有正电荷,有利于结合切割下来的带有负电荷的

siRNA

4)RNase III催化结构域:把长的dsRNA切割成短的siRNA

蛋白质(2015年):

1、蛋白质一级结构与功能的关系

(1)相似一级结构的蛋白质必有相似的空间结构和功能

一级结构是蛋白质发挥生理功能的分子基础eg:血红蛋白与肌红蛋白;癌蛋白与生长因子或生长因子受体

(2)认识酶、激素前体一级结构的局部断裂与功能激活的分子基础

生物体内的某些生化过程中,蛋白质分子的部分肽链必须先按特定的方式断裂才能呈现出生物活性

胰蛋白酶原(trypsinogen) →胰蛋白酶(trypsin)

前胰岛素原(preproinsulin) 109aa→胰岛素(insulin) 51 aa

(3)认识蛋白质种属差异和分子进化的亲缘关系

不同种属生物的同一种蛋白质,一级结构相似,但有差异,差异决定免疫原性,一般不在活性中心,不影响生物活性,保守区域决定空间结构和生物学功能

(4)认识蛋白质一级结构的变异与“分子病”(molecular disease)的关系

“分子病”指DNA结构改变导致表达产物蛋白质一级结构改变和功能异常所造成的疾病。基因的有义突变导致其编码蛋白质氨基酸序列的变化,其结果是该蛋白质的结构和生物活性发生变化,导致功能的改变。有些改变会在人体内引发相应的疾病,例如镰刀型贫血等。2、α-螺旋与π-螺旋的区别

α-螺旋:在多种蛋白质中存在,各种蛋白质中所占比例各不相同。

1)肽链骨架是右手螺旋结构

2)每一螺旋由3.6个氨基酸残基组成, 螺距5.4nm,相邻螺旋间由第1个氨基酸肽键的C=O

与第5个氨基酸肽键的N-H形成氢键,中间包括13个原子,又称3.613螺旋。

3)氢键方向与α螺旋长轴平行,链内氢键是α螺旋稳定的主要因素。

4)侧链R位于螺旋外侧,其基团大小、形状、带电状态影响α螺旋的形成和稳定。

π-螺旋:主要存在于胶原蛋白分子中。

1)比a - 螺旋稍大且疏松的左手螺旋。

2)每圈螺旋含4.4个氨基酸残基,与螺旋长轴基本平行的氢键维持稳定,氢键跨18个原子,

称4.418螺旋,胶原蛋白分子中三股左手螺旋再盘曲为右手三股超螺旋。

α-螺旋

1) 肽链骨架是右手螺旋结构

2) 每一螺旋由3.6氨基酸残基组成, 螺距5.4nm

3) 相邻螺旋间由第1个氨基酸肽键的C=O与第5个氨基酸肽键的N-H形成氢键,中间包括13个原子,又称3.613螺旋

4) 氢键方向与α螺旋长轴平行,链内氢键是α螺旋稳定的主要因素

5)侧链R位于螺旋外侧,其基团大小、形状、带电状态影响α螺旋的形成和稳定

6) 各种蛋白质中α螺旋所占比例各不相同

π-螺旋

主要存在于胶原蛋白分子中,每圈螺旋含4.4个氨基酸残基,与螺旋长轴基本平行的氢键维持稳定,氢键跨18个原子,称4.418螺旋,比α - 螺旋稍大且疏松的左手螺旋。胶原蛋白分子中三股左手螺旋再盘曲为右手三股超螺旋。

3

复制(2015年):

1、半保留复制实验的证明

同位素实验证实:把大肠埃希菌放在含15NH4CL的培养液中培育,用15N标记DNA,由于15N-DNA比14N-DNA重约1%,然后把大肠埃希菌转移到含14NH

CL的培养液中,在培育的不

4

同时间取出样本,将大肠埃希菌瞎报用裂解液裂解,放在CsCL溶液中超速离心20h,此时从管底到管口CsCL密度形成一个梯度分布,DNA分子在与它相等的层次中停留,在紫外线下可看到一条吸收带,而在15NH4CL的培养液中所得到的亲代全为重DNA,在转移入14NH4CL 的培养液中所得的的第一代DNA密度介于两者之间的混合链DNA,第二子代第三代第四代都会显示两条吸收带,轻DNA比例不断增大。两条轻链复制是,一条轻链进入子代,一条轻链无限制复制下去,就是半保留复制(选择大肠杆菌原因:选择一条染色体的DNA的原核生物,大肠杆菌传代恒定,20min)

2、为什么说DNA聚合酶III是复制的主要酶

10种亚基组成,不对称二聚体,全酶分子量900KD。有三个特点:非常高的续进性(processivity)>500,000 nt,催化活性高>1000 nt /秒,3‘→5’外切酶活性,这三个特点决定了DNA聚合酶III是复制的主要酶(校正功能)

3、简述碱基切除修复

1)DNA糖苷酶识别损伤的碱基并切割,产生一个缺嘌呤或缺嘧啶的位置,也称AP位置。2)AP核酸内切酶切除AP位置附近的磷酸二酯键。

3)DNA聚合酶I去除损伤链并合成新DNA链。

4)最后由DNA连接酶封口。

(1)DNA糖苷酶识别损伤碱基, 切割

(2)AP核酸内切酶切AP位置附近磷酸二酯(缺碱基时会被激活)

(3)DNA聚合酶Ⅰ 除去损伤链,合成新DNA链(5’-3’)

(4)DNA连接酶封口

细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能够特异性切除受损核苷酸上的N-β-糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。DNA分子中一旦产生了AP位点,AP核酸内切酶就会把受损核苷酸的糖苷-磷酸键切开,并移去包括AP位点核苷酸在内的小片段DNA,由DNA聚合酶Ⅰ合成新的片断,最终由DNA连接酶把两者连成新的被修复的DNA链,这一过程即为碱基切除修复(base-excision repair, BER)

转录(2015年):

1、真核生物mRNA转录后加工的具体步骤?

1)mRNA前体的加工,

a)5’端帽结构的形成

?5’端上加上7甲基鸟苷酸通过5’-5’三磷酸酯键链接:其中在2’-OH位加上甲基,由S-腺苷甲硫氨酸提供

?使RNA免受核酸酶的攻击

?形成核糖体结合位点

b)3’端的剪切和多聚腺苷酸的加入:作用是提高mRNA稳定性,防止降解。和mRNA转

运(由核——胞质)有关,稳定翻译模板,提高翻译效率。

2)mRNA前体剪切

a)hnRNP与mRNA前体结合

b)hnRNA参与mRNA前体的加工和运输

c)内含子的切除:剪除内含子,连接外显子,形成有功能的mRNA。

d)选择性剪切:基因的初级转录物,通过选择性使用外显子以不同方式加工,可以得

到不同的mRNA,翻译为不同的蛋白质。

3)RNA编辑:基因转录产生的mRNA分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置换,基因转

录物的序列不与基因编码序列互补,使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成,不同于基因序列中的编码信息

4)细胞中mRNA退化的速度不同

2、逆转录与逆转录酶的概念?逆转录与DNA复制的比较?

在分子生物学中心法则中遗传信息是由DNA流向RNA的。在某些RNA病毒中遗传信息是从RNA流向DNA,这种现象称为逆转录。

逆转录(reverse transcription)是以RNA为模合板成DNA的过程,即RNA指导下的DNA 合成。此过程中,核酸合成与转录(DNA到RNA)过程与遗传信息的流动方向(RNA到DNA)相反,故称为逆转录。

逆转录酶以RNA为模板,在4种dNTP存在及合适条件下,能按碱基互补配对原则合成互

3、试述RNA聚合酶II最大亚基羧基末端结构域(carboxy-terminal domain,CTD)在基因转录中的作用。

CTD具有高度保守性、重复性、以及RNA聚合酶Ⅱ“专有”特征,其重复单位的拷贝数目在不同物种间具有差异,能够发生磷酸化和去磷酸化的循环反应。该结构可通过与mRNA 加工因子的相互作用而对其加工过程产生直接或者间接的影响,在mRNA的转录和加工的偶联过程中具有重要的作用。CTD的磷酸化有可能是mRNA转录作用起始地“开关”,RNA 聚合酶Ⅱ正是借助了CTD的磷酸化跨越了启动子障碍,引发出下游的转录合成与加工的诸多事件。

RNA 聚合酶II是一个多亚基的蛋白质复合物,CTD 结构是RNA 聚合酶II最大亚基的羧基末端的一段特殊的序列(仅RNA 聚合酶II具有,RNA 聚合酶I、III都不具有)。 CTD 尾具有高度保守的重复序列,由7个氨基酸(Tyr - Ser - Pro - Thr - Ser - Pro - Ser)组成重复单位。 mRNA在转录后需进行加工,有多种加工因子参与加工过程。CTD 尾可与mRNA加工因子发生相互作用,而对mRNA的加工过程产生直接或间接的影响。所以CTD 尾在mRNA转录和加工的偶联过程中发挥了重要作用。

翻译(2015年):

1、简述mRNA作为翻译模板的特点

基本性质

1)遗传密码的编码比例3:1

64个遗传密码,由3个碱基组成的三联体,三联体= 一个密码子一个氨基酸

起始密码:AUG,终止密码:UAA、UGA、UAG

一些原核生物中的起始密码:GUG/UUG,人类线粒体有特有的密码子

2)遗传密码的重叠性和非重叠性

非重叠性

?模板上的碱基三联体在翻译中运用不发生重叠

?特点:读码框架固定,翻译成一种肽

重叠性

?读码框架移动1~2个碱基→同一序列的模板→具有不同氨基酸序列的多肽

?病毒、噬菌体

3)遗传密码的简并性既有保守性又有灵活性

61个密码子编码20个氨基酸

一个A.A有多个密码

密码第1、2位上碱基不变,第3位碱基可改变

4)遗传密码的阅读无间隔

连续阅读从mRNA5’→3’

肽链合成N端→C端

框移突变(frameshift mutation)

5)mRNA编辑,可以使单顺反子的真核生物mRNA种类大大增加,mRNA作为模板多样

性也大大增加,最终使蛋白质的种类也增加

2、试比较原核生物、真核生物翻译起始的异同点

相同点:掺入肽链前需氨基酸活化——mRNA-起始氨基酰-tRNA-核蛋白体

3、简述蛋白质因子在原核生物核糖体循环中的作用

肽链合成的起始、延长和终止称核糖体循环。

起始因子IF

IF1:辅助IF3

IF2:(特异识别起始tRNA(fmet-tRNA i fmet),形成起始tRNA-IF2-GTP复合物,协助起始tRNA 进入核糖体P位与mRNA配对;(可结合GTP有GTP酶活性;)

IF3:起始时促进30S小亚基结合mRNA;终止时促使核糖体解离(一个IF3分子结合一个30S 亚基)

延长因子EF

EF-Tu:(形成AA-tRNA-Tu-GTP复合物,)协助AA-tRNA进入核糖体A位;(可结合GTP并有GTP酶活性)

EF-Ts:促进EF-Tu的再利用

EF-G:(形成EF-G-GTP复合物,)协助mRNA前移,并将游离tRNA从E位释放;(可结合GTP 并有GTP酶活性;)

释放因子RF

RF1 RF2:识别终止密码子。(RF1识别UAA、UAG。RF2识别UAA、UGA)

RF3:促进释放肽链和tRNA,(可结合GTP并有GTP酶活性)

1)起始:起始因子

a)IF1:辅助IF3

b)IF2:有GTP酶活性,特异识别fmet-tRNAifmet,形成fmet-tRNAifmet- IF2-GTP

c)IF3:促进30S小亚基结合mRNA,抗连接因子:终止时促使核糖体解离,稳定游离的

30S,一个IF3分子结合一个30S亚基

2)延长:延长因子(EF)

a)EF-Tu:具有GTP酶活性,协助AA-tRNA进入A位,

b)EF-Ts:促进EF-Tu的再利用

3)终止:释放因子:识别终止密码子引起完整的肽链和核糖体从mRNA上释放

a)RF1:作用于UAA、UAG

b)RF2:作用于UGA、UAA

c)RF3:结合GTP/GTP酶活性,促进释放

4、简述蛋白质翻译后的加工过程

1)多肽链折叠为天然的三维结构

促进蛋白折叠功能的大分子

?分子伴侣(热休克蛋白/伴侣素)(跟肽链进行结合,促进各功能域和整体蛋白质的正确折叠,Dna J必须的,Dna K-ADP-被折叠蛋白质复合物,GrpE维持ATP状

态)

?蛋白二硫键异构酶(决定空间结构)(内质网,多肽链内、链间二硫键的正确形成)

?肽-脯氨酰顺反异构酶(决定空间结构是否正确)

2)肽链一级结构的修饰

肽链N端的修饰

个别氨基酸的修饰

多肽链的水解修饰

3)高级结构修饰

亚基聚合

辅基连接

疏水脂链的共价连接

4)蛋白质合成后的靶向输送

保留在细胞液

进入细胞器

分泌到细胞外

5、简述干扰素的作用机制

干扰素不能直接灭活病毒,而是通过诱导细胞合成抗病毒蛋白(AVP)发挥效应。干扰素首先作用于细胞的干扰素受体,经信号转导等一系列生化过程,激活细胞基因表达多种抗病毒蛋白,实现对病毒的抑制作用。抗病毒蛋白主要包括2′-5′A合成酶和蛋白激酶等。前者活化RNaseL,降解病毒mRNA;后者通过磷酸化elf2抑制病毒多肽链的合成,使病毒复制终止。

1)干扰素诱导eIF2磷酸化而失活

dsRNA

干扰素诱导蛋白激酶 eIF

2)干扰素诱导病毒RNA降解

干扰素

dsRNA 活化 RNaseL

ATP 2’-5’腺苷酸

2’-5’多聚腺苷合成酶RNaseL 降解mRNA

癌基因和抑癌基因(2015年):

1、试简述一下细胞癌基因有哪些特点?

细胞癌基因是细胞基因组内正常存在的控制细胞正常生长和分化的基因,其编码产物通常作为正调控信号,促进细胞的增殖和生长。它的结构异常或表达异常,可诱导细胞发生恶性转化。即指在体外能引起细胞转化,在体内能诱发肿瘤的基因。

1)广泛存在于生物界中,从酵母到人的细胞普遍存在

2)基因序列高度保守

3)作用通过其产物蛋白质来体现,维持细胞正常生理功能、调控细胞生长和分化起重要作

4)某些物理、化学及感染性因等能使原癌基因激活,被激活后,导致正常细胞癌变

5)既可以被导入逆录病毒而活化成病毒癌基因,也可因突变或异常表达而活化成癌基因;

活化的癌基因能诱导细胞的异常增殖和肿瘤发生

2、病毒癌基因与细胞癌基因有什么异同点?

1)病毒癌基因在其名称前冠以前缀“v”,如v-ras;细胞癌基因在其名称前冠以前缀“c”,

如c-ras

2)v-onc是病毒基因组中特殊的核苷酸序列,能引起细胞转化;

c-onc是存在于正常细胞基因组中的癌基因,在正常情况下处于静止或低表达的状态,不仅对细胞无害,而且对维持细胞正常功能具有重要作用,但在异常表达时,其产物可使细胞无限制分裂。

3)细胞癌基因与病毒癌基因核酸序列有同源性(即它们的DNA序列是相对应的),表达产物

也基本相同,但二者的同源序列有一定程度的差异

病毒癌基因在两端通常有序列的丢失

病毒癌基因无内含子,细胞癌基因通常有内含子或插入序列

病毒癌基因常会出现碱基取代或碱基缺失

3、原癌基因活化的方式有哪些?原癌基因激活成癌基因的结果是什么?

1)获得强启动子与增强子引起基因表达调控差异导致产物过表达

2)染色体易位:调控原件丢失

3)基因扩增引起蛋白质结构差异导致产物活性和功能发生改变

4)突变

4、参与细胞生长调控的癌基因主要有哪几类?试每类各举一例说明癌基因的产物及其功能。 细胞的生长信号——生长因子:sis、PDGF

生长因子受体:erbB、EGFR

细胞内信号转导体:Src、Ras、Raf、PKC

核内转录因子:erbA、Jun、Fos、myc、NF-κB

细胞周期调节因子:cyclin D、Cdk、RB、p53、bcl-1

其他

1)细胞生长因子:sis基因表达的蛋白p28和PDGF能促进血管的生长

2)跨膜生长因子受体:erb B可不依赖受体的结合激活胞内酪氨酸激酶的活性,从而刺激细

胞增殖

3)细胞内转导体

非受体酪氨酸激酶:c-Src,通过激酶的磷酸化作用,使底物的结构发生改变,增加激酶对底物的活性,加速生长信号在胞内的传递,与细胞无限生长关系密切 丝氨酸/苏氨酸激酶:c-Raf,N端结合Ras,C端结合并磷酸化MEK、MAPK、MAPKK

G蛋白及Ras蛋白(H-ras,K-ras和N-ras):Ras参与细胞增殖信号的细胞内转导过程,是维持细胞生长和分化的重要信号转换器

4)核内转录因子:类固醇类激素受体基因,作为顺式元件作用于DNA从而影响基因表达

5)细胞周期调节因子:细胞周期素,调控细胞增殖分裂过程

5、试举例说明抑癌基因的产物及其功能。

肿瘤抑制基因的表达产物:主要包括结构蛋白,跨膜受体,胞质信号转导因子,转录因子,转录调节因子,细胞周期因子,DNA损伤修复因子等等。

功能:主要参与细胞生长增殖的负调控,即可抑制细胞生长并具有潜在抑癌作用。

RB基因表达产物p105RB蛋白,它有磷酸化和去磷酸化两种状态,磷酸化是非活性状态,去磷酸化是活性状态。脱磷酸p105RB抑制细胞增殖的机理是由于它能和转录因子E2F结合。E2F能激活与DNA复制有关的酶的基因转录。当脱磷酸的p105RB与E2F 结合后,使E2F丧失活性。一些肿瘤病毒编码的癌蛋白能与癌细胞的P105RB结合,使其失去结合E2F的能力,使细胞不断分裂增殖,如SV40病毒大T抗原、腺病毒5型、E1A癌蛋白等。

分子生物学简答题

分子生物学:研究核酸、蛋白质等所有生物大分子的形态、结构特征及其重要性、规律性和相互关系的科学。 C值反常:也称c值谬误,指c值往往与种系进化复杂性不一致的现象,及基因组的大小与遗传复杂性之间没有必然的联系,某些较低等的生物c值却很大。DNA重组技术:又称基因工程。将不同的DNA片段按照预先的设计定向连接起来,在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状的技术。 GU-AG法则:多数细胞核mRNA前体中内含子的5’边界序列为GU,3’边界为AG,因此,GU表示供体衔接点的5’端,AG 表示接纳点的3’端序列,习惯上,把这种保守序列模式称为GU-AG法则。 RNA干涉:是利用双链小RNA高效,特异性降解细胞内同源MRNA,从而阻断体内靶基因的表达,使细胞内出现靶基因缺失表性的方法。 摆动假说:crick为解释反密码子中子某些稀有成分的配对(如I)以及许多氨基酸中有两个以上密码子而提出的假设。编码链/有义链:在DNA双链中,与mRNA 序列(除t/u替换外)和方向相同的那条DNA,又称有义链 模板链:指双链DNA中能够作为模板通过碱基互补原则指导mRNA前体的合成的DNA链,又称反义链 操纵子:原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控原件组成的基因表达单元。 反式作用因子:能直接或间接识别或结合在各类顺式作用元件中核心序列上参与调控靶基因转录效率的pro。 基因定点突变:向靶DNA片段中引入所需的变化,包括碱基的添加,删除,或改变基因家族:在基因组进化中,一个基因通过基因重复发生了两个或更多的拷贝,这些基因即构成一个基因家族,是具有显著相似性的一组基因,编码相似的蛋白质产物 基因敲除技术:针对一个序列已知打包功能未知的基因,从DNA水平上设计实验,彻底破坏该基因的功能或消除其表达机制,从而推测该基因的生物学功能 基因组DNA文库:某一生物体全部或部分基因的集合,将某个生物的基因组DNA 或cDNA片段与适当的载体体外重组后,转化宿主细胞,所谓的菌落或噬菌体的集合即为…… 基因治疗:是将具有治疗价值的基因即“治疗基因“装配于带有在人体细胞中表达所必备元件的载体中,导入人体细胞,通过靶基因的表达来治疗遗传疾病 聚合酶链反应:指通过模拟体内DNA复制方式在体外选择性的将DNA某个特定区域扩增出来的 魔斑核苷酸:在应急反应过程中,由大量GTP合成的ppGpp和pppGpp,它们的主要作用可能是影响RNA聚合酶与启动子结合的专一性,诱发应急反应,帮助细菌度过难关 弱化子:原核生物操纵子中能明显减弱甚至终止转录作用的一段核苷酸序列 同工tRNA:几个代表AA,能够被一个特殊的氨酰—tRNA合成酶识别的Trna 顺式作用元件:存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列,包括启动子,增强子等,本身不编码任何pro,仅提供一个作用位点,与反式作用因子相互作用参与基因表达调控 原位杂交技术:用标记的核苷酸探针,经放射自显影或非放射检测体系,在组织,细胞及染色体水平上对核苷酸进行定位和相对定量研究的手段 转座/移位:遗传信息从一个基因座转移至另一个基因座的现象,由可移问位因子介导的遗传物质的重排 管家基因:维持细胞正常生长发育的必需基因,所以细胞中均需表达的一类基因转座子:是存在染色体上的可自主复制和移位的基本单位,参与转座子易位及DNA 链整合的酶称为转座酶 原癌基因:正常细胞中与病毒癌基因具有显著同源性的基因,本身没有致癌作用,但是经过致癌因子的催化下激活成为致 癌基因,使正常细胞向恶性转化。 SP序列:mRNA中用于结合原核生物核糖 体的序列 无义突变:在蛋白质的结构基因中,一个 核苷酸的改变可能是代表某个AA的密码 子变成终止密码子(UAG UGA UAA),使 pro合成提前终止,合成无功能或无意义 的多肽,这称— 错义突变:由于结构基因中某个核苷酸的 变化使一种AA的密码子变成另外一种AA 的密码 指导RNA:与已正确编码的RNA序列互补 的一小段RNA,被用来作为向未经编辑的 RNA中插入碱基的模板。 上游启动子元件:将TATA区上游的保守 序列称为— 启动子:与基因表达启动相关的顺式作用 原件,是结构基因的重要成分。它是一段 位于转录起始位点5’端上游区大约 100~200bp以内的具有独立功能的DNA序 列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA 准确地相结合并具有转录起始的特异性。 细菌转化:是一种细菌菌株由于捕获了来 自供体菌株的DNA而导致性状特征发生 遗传改变的过程,提供转化DNA的菌株叫 做供体菌株,接受转化DNA的菌株被称作 受体菌株。 实时定量PCR技术:利用带荧光检测的 PCR仪对整个PCR过程中扩增DNA的累积 速率绘制动态变化图。 基因工程:在体外将核算分子插入病毒, 质粒或其他载体分子,构成遗传物质的新 组合,使之进入新的宿主细胞内并获得持 续稳定增殖能力和表达。 应答原件:能与某个(类)专一蛋白因子 结合,从而控制基因特异表达的DNA上游 序列。 增强子:是指能使与它连锁的基因转录频 率明显增加的DNA序列(1.5分)。它可 以在启动子的上游,也可以在启动子的下 游,绝大多数增强子具有组织特异性(1.0 分)。 分子伴侣:是结合其他不稳定蛋白质并稳 定其构象的一类蛋白质(1.0分)。通过 与部分折叠的多肽协调性地结合与释放, 分子伴侣促进了包括蛋白质折叠、寡聚体 装配、亚细胞定位和蛋白质降 负调控:阻遏蛋白结合在操作子位点,阻 止基因的表达。没有调节蛋白时操纵元内 结构基因是表达的,而加入调节蛋白后结 构基因的表达活性被关闭,这种调节称为 负调节。 应急因子:是指与核糖体相结合的蛋白质 RelA,当空载的tRNA进入A位时,它催 化GTP形成pppGpp或催化GDP形成 ppGpp。 信号肽:在蛋白质合成过程中N端有 15~36个氨基酸残基的肽段,引导蛋白质 的跨膜。 密码的简并性:由一种以上密码子编码同 一个氨基酸的现象称为密码的简并性 移码突变(frame-shift mutation):在 mRNA中,若插入或删去一个核苷酸,就 会使读码发错误,称为移码,由于移码而 造成的突变、称移码突变 简答题 1原核生物与真核生物基因组的不同? 答:原核基因组:常仅由一条环状双链DNA 分子组成,结构简单;基因组中只有一个复 制起点;具有操纵子结构,转录的RNA为多 顺反子;有重叠基因(1、基因内基因 2、部 分重叠基因 3、一个碱基重叠);无内含子; 编码pro的DNA在基因组中所占比例较大; 结构基因为单贝 真核基因组:真核基因组庞大,一般都远 大于原核生物;真核基因组存在大量的重复 序列;真核基因组的大部分为非编码序列, 占整个基因组序列的90%以上;真核基因组的 转录产物为单顺反子;真核生物为断裂基因、 有内含子结构;真核基因组存在大量的顺式 作用原件;真核基因组中存在大量的DNA多 态性;真核基因组具有端粒结构。 2比较RNA转录与DNA复制的异同? 答:相同:都以DNA链作为模板;合成方向 均为5’—3’;聚合反应均是通过核苷酸之间 形成的3’,5’—磷酸二酯建使核苷酸链延长 不同:复制转录 模板:两条链均复制;模板链转录(不对称 转录) 原料:dNDP ; NTP 酶:DNA聚合酶;RNA聚合酶 产物:子代双链DNA;mRNA,tENA,rRNA 配对:A---T ,G---C; A—U,T---A,G---C 引物:RNA引物;无 试比较转录与复制的区别。: 1,目的不同,所使用的酶、原料及其它辅助 因子不同,转录是合成RNA,复制是合成DNA; 2,方式不同:转录是不对称的,只在双链DNA 的一条链上进行,只以DNA的一条链为模板, 复制为半不连续的,分别以DNA的两条链为 模板,在DNA的两条链上进行;3,复制需要 引物,转录不需要引物;,4复制过程存在校 正机制,转录过程则没有;5转录产物需要加 工,复制产物不需要加工;6复制与转录都经 历起始、延长、终止阶段,都以DNA为模板, 新链按碱基互补原则,5'→3’方向合成。 3、 RNA转录的基本过程? 转录的基本过程包括:模板识别、转录起始、 转录的延伸和终止。 模板识别:RNA聚合酶与启动子DNA双链相互 作用并与之结合; 转录起始:RNA聚合酶结合在启动子上以后, 是启动子附近的DNA双链解旋并解链,形成 转录泡以促使底物核糖核苷酸与模板DNA的 碱基配对,当RNA链上第一个核苷酸键产生 标志着转录的起始,一旦RNA聚合酶成功地 合成9个以上核苷酸并离开启动子区,转录 就进入正常的延伸阶段。 转录的延伸:RNA聚合酶释放因子离开启动子 后,核心酶沿模板DNA链移动并使新生成RNA 链不断伸长,在解链区形成RNA—DNA杂合物。 转录终止:当RNA链延伸到转录终止位点时, RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯建,DNA— RNA杂合物分离,转录泡瓦解,DNA恢复成双 链状态,DNA聚合酶和RNA链都从模板上释放 出来,转录终止。 4.DNA复制的过程和机制? 答:分三个阶段:即复制的起始、延伸、终 止。 复制的起始:DNA解旋解链,形成复制叉,引 发体组装,然后在引发酶的催化下以DNA链 为模板合成一段短的RNA引物。 延伸:DNA链的延伸由DNA聚合酶催化以亲代 DNA链为模板引发体移动,从5’—>3’方向 聚合子代DNA链,前导键的合成以5’—>3’ 方向随着亲本双链体的解开而连续进行复 制,后随链在合成过程中,一段亲本DNA单 恋首先暴露出来,然后以与复制叉移动相反 方向,按5’—>3’方向合成一系列冈崎片段。 终止:当子链延伸到终止位点时,DNA复制终 止,切除RNA引物,填充缺口,在DNA连接 酶的催化下将相邻的DNA片段连接起来形成 完整的DNA长链。 5、真核生物与原核生物在翻译的起始过程中 有哪些区别? 答:真核生物的起始tRNA是met-tRNA met 原核是fmet-tRNA fmet; 真核生物核糖体小亚基识别mRNA的帽子结 构,而原核生物通过与mRNA的SD序列结合; 真核生物小亚基先与met-tRNAmet结合再与 mRNA结合,而原核生物小亚基先与mRNA结合 再与fmet-tRNAfmet结合;真核生物有较多 的起始因子参与,且核糖体较大为80S,而原 核生物有较少的起始因子参与,且核糖体较 小为70S 6.简述蛋白质生物合成过程。,以大肠杆菌为 例: (1)氨基酸的活化:游离的氨基酸必须经过活 化以获得能量才能参与蛋白质合成,由氨酰 -tRNA合成酶催化,消耗1分子ATP,形成氨 酰-tRNA。 (2)肽链合成的起始:由起始因子参与,mRNA 与30S小亚基、50S大亚基及起始甲酰甲硫氨 酰-tRNA(fMet-tRNAt)形成70S起始复合物, 整个过程需GTP水解提供能 (3)肽链的延长:起始复合物形成后肽链即开 始延长。首先氨酰-tRNA结合到核糖体的A 位,然后,由肽酰转移酶催化与P位的起始 氨基酸或肽酰基形成肽键,tRNA f 或空载tRNA 仍留在P位.最后核糖体沿mRNA5’→3’方 向移动一个密码子距离,A位上的延长一个氨 基酸单位的肽酰-tRNA转移到P位,全部过程 需延伸因子EF-Tu、EF-Ts,能量由GTP提供 (4)肽链合成终止,当核糖体移至终止密码 UAA、UAG或UGA时,终止因子RF-1、RF-2 识别终止密码,并使肽酰转移酶活性转为水 解作用,将P位肽酰-tRNA水解,释放肽链, 合成终止。 7.试比较真核生物与原核生物mRNA转录的主 要区别。 答:转录单元:原核生物常为多顺反子转录, 真核生物常为单顺反子转录。酶:RNA聚合酶 核心酶加p因子,原核生物为RNA聚合酶Ⅱ 聚合酶加转录因子。转录产物:真核生物不 需加工与翻译相偶联真核生物需加工与翻译 分开。转录过程:无核小体的结局和组装的 过程,原核生物有核小体的结局和组成的过 程。转录终止“原核生物两种方式分别是依 赖P因子的终止和不依赖P因子的终止,真 核生物转录的终止加尾修饰同步进行。反应 部位:原核生物在类核,真核生物在核内。 8.比较原核和真核生物mRNA的区别? 答:(1)、原核生物mRNA5’端无帽子结构,3’ 端没有或只少较短的polyA结构,真核生物 5’端存在帽子结构,3’端具有polyA尾巴. (2)、许多原核生物mRNA可能以多顺反子形 式存在,而真核生物几乎都是单顺反子(3)原 核生物mRNA的半衰期短,转录与翻译是紧密 相连的,两个过程不仅发生在同一细胞间里, 而且几乎是同步进行的,真核生物mRNA的录 翻译是发生在不同空间和时间范畴内的。(4) 原核生物以AUG作为起始密码有时以GUG, UUG作为起始密码,真核几乎永远以AUG作为 起始密码。 9.乳糖操纵子调控机理 答:是大肠杆菌中控制半乳糖苷酶诱导合成 的操纵子。包括调控元件P(启动子)和O(操 纵基因)阻遏子(I),以及结构基因lacZ(编 码半乳糖苷酶)、lacY(编码通透酶)和lacA (编码硫代半乳糖苷转乙酰基酶)。转录时 RNA聚合酶首先与启动子结合,通过操纵区向 右转录,转录从O区中间开始,按Z→Y→A 方向进行,每次转录出来的一条mRNA上都带 有这3个基因,转录的调控是在启动区和操 纵区进行的。 1、无乳糖时,调节基因lacI编码阻遏蛋白, 与操纵子基因O结合后抑制结构基因转录, 不产生代谢乳糖的酶。 2、只有乳糖存在时,乳糖可以与lac阻遏蛋 白结合,而使阻遏蛋白不与操纵基因结合, 诱导结构基因转录,代谢乳糖的酶产生以代 谢乳糖。 3、葡萄糖和乳糖同时存在时,葡萄糖的降解 产物能降低cAMP的含量,影响CAP与启动基 因结合,抑制结构基因转录,抑制代谢乳糖 的酶产生。 10、色氨酸操纵子及机制? 答:负责色氨酸的生物合成,当培养基中有 足够的色氨酸时,这个操纵子自动关闭,缺 乏时操纵子打开,trp基因表达,色氨酸或与 其代谢有关的某种物质在阻遏过程中起作 用。由于trp体系参与生物合成而不是降解, 它不受葡萄糖或cAMP-CAP的调控。 弱化作用:当色氨酸达到一定浓度、但还没 有高到能够活化R使其起阻遏作用的程度时, 产生色氨酸合成酶类的量已经明显降低,而 且产生的酶量与色氨酸的浓度呈负相关。先 导序列起到随色氨酸浓度升高降低转录的作 用,这段序列就称为衰减子或弱化子。在trp 操纵元中,对结构基因的转录阻遏蛋白的负 调控起到粗调的作用,而衰减子起到细调的 作用。 11.原核生物和真核生物复制的差异? 答:原核真核 复制起点:一般为单复制起点;一般为多复 制起点 主要的酶:DNA聚合酶Ⅲ;DNA聚合酶& 单链复制叉复制速度:快;慢 复制的延伸:无核小体的解聚及诚信组装; 有核小体…… 终止:两个复制叉相遇终止复制(环形DNA); 端粒酶复制末端完成复制(线性DNA) 12原核细胞和真核细胞在合成蛋白质的 起始过程有什么区别。 .(1)起始因子不同:原核为IF-1,IF-2, IF-2,真核起始因子达十几种。 (2)起始氨酰-tRNA不同:原核为 fMet-tRNA f ,真核Met-tRNAi (3)核糖体不同:原核为70S核粒体, 可分为30S和50S两种亚基,真核为80S 核糖体,分40S和60S两种亚基

分子生物学作业

分子生物学作业 一、名词解释 1.断裂基因 真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区相互间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因成为断裂基因。 2.单核苷酸多态性 单核苷酸多态性是由基因组DNA上的单个碱基的变异引起的DNA 序列多态性。是人群中个体差异最具代表性的DNA多态性,相当一部分还直接或间接与个体的表型差异、对疾病的易感性或抵抗能力、对药物的反应性等相关。单核苷酸多态性被认为是一种能稳定遗传的早期突变。 一、简答题 1.简述真核生物基因组的结构与功能特点。 ①真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体,储存于细胞核 内,除配子细胞外,体细胞内基因组是双份的(即双倍体),有两份同源的基因组。 ②真核生物的基因转录产物为单顺反子。即一个结构基因经过转 录生成一个mRNA分子,再翻译生成一条多肽链。 ③真核生物基因组存在重复序列,重复次数可达百万次以上。 ④真核生物基因组中不编码的区域多于编码的区域。 ⑤真核生物的大部分基因都含有内含子,因此,基因是不连续的

(断裂基因)。 ⑥真核生物基因组远远大于原核生物的基因组,具有多复制起始 点,而每个复制子的长度较小。 2.试述双向凝胶电泳技术的基本原理。 双向凝胶电泳技术是指第一向的固相pH梯度等电聚焦电泳与第二向SDS-PAGE组成的分离系统,也称双向聚丙烯酰胺凝胶电泳,简称2-DE。等电聚焦电泳是基于蛋白质等电点(pI)的差异进行分离,SDS-PAGE则是根据蛋白质分子量(Mw)的不同进行分离。 其中等电聚焦指:在电场中电泳基质形成一个从正极到负极不断增大的PH梯度,由于蛋白质为两性电解质,带负电荷的蛋白质分子向正极移动,待正电荷的蛋白质分子向负极移动,当蛋白质分子运动到各自的PI处时,所带净电荷变为零,于是停止迁移而留在该位置上,这种不同的蛋白质分别聚焦在各自的PI处,形成一条狭窄稳定的区带而彼此分开的现象就称为等电点聚焦。 SDS-PAGE是在PAGE系统中加入SDS和还原剂后所组成的电泳系统。SDS是一种阴离子去垢剂,疏水端能插入蛋白质分子内,破坏蛋白质分子内的氢键及疏水作用,改变蛋白质分子的三级和四级结构;还原剂则断裂蛋白质分子内的二硫键,使蛋白质分子去折叠,结构变得舒展。蛋白质分子与SDS充分结合后,形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物,所带负电荷大大超过蛋白质分子原有的电荷量,消除了不同分子间原有电荷的差异。蛋白质-SDS复合物在聚丙烯酰胺凝胶电泳系统中的迁移率不再与电荷相关,而主

西南大学1166 《分子生物学》第五次作业及参考答案

西南大学1166 《分子生物学》第五次作业及参考答案 论述题: 1. 基因与多肽链有什么关系? 2. hnRNA转变成mRNA的加工过程包括哪几步? 3. 作为蛋白质生物合成模板的mRNA有何特点? 4. 原核基因表达调控有什么特点? 5. 真核基因表达调控与原核生物相比有什么异同点。 6. 简述分子生物学在医药工业中的应用。 参考答案: 1.基因与多肽链有什么关系? 多肽链是基因的编码产物,基因的碱基序列与蛋白质分子中氨基酸的序列之间的对应关系是通过遗传密码实现的。 2. hnRNA转变成mRNA的加工过程包括哪几步? hnRNA转变成mRNA的加工过程包括:①5`端形成特殊的帽子结构(m7G5`ppp5`N1mpN2p-);②在链的3`端切断并加上多聚腺苷酸(polyA);③通过剪接除去由内含子转录而来的序列;④链内部的核苷被甲基化。 3. 作为蛋白质生物合成模板的mRNA有何特点? 信使核糖核酸具有以下特点:①其碱基组成与相应的DNA的碱基组成一致,即携带有来自DNA的遗传密码信息;②mRNA链的长度不一,因为其所编码的多肽链长度是不同的;③在肽链合成时mRNA应与核糖体作短暂的结合;④mRNA的半衰期很短,因此mRNA的代谢速度很快。 4.原核基因表达调控有什么特点? 原核生物大都为单细胞生物,没有核膜,极易受外界环境的影响,需要不断地调控基因的表达,以适应外界环境的营养条件和克服不利因素,完成生长发育和繁殖的过程。原核生物基因的表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终止的每一步骤中。这种调控多以操纵子为单位进行,将功能相关的基因组织在一起,同时开启或关闭基因表达,既经济有效,又保证其生命活动的需要。调控主要发生在转录水平,有正、负调控两种机制。在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。细菌的转录和翻译过程几乎在同一时间内相偶联。

分子生物学试题及答案

分子生物学试题及答案

分子生物学试题及答案一、名词解释 1.cDNA与cccDNA:cDNA是由mRNA通过反转录酶合成的双链DNA;cccDNA是游离于染色体之外的质粒双链闭合环形DNA。 2.标准折叠单位:蛋白质二级结构单元α-螺旋与β-折叠通过各种连接多肽可以组成特殊几何排列的结构块,此种确定的折叠类型通常称为超二级结构。几乎所有的三级结构都可以用这些折叠类型,乃至他们的组合型来予以描述,因此又将其称为标准折叠单位。3.CAP:环腺苷酸(cAMP)受体蛋白CRP(cAMP receptor protein ),cAMP与CRP结合后所形成的复合物称激活蛋白CAP(cAMP activated protein ) 4.回文序列:DNA片段上的一段所具有的反向互补序列,常是限制性酶切位点。 5.micRNA:互补干扰RNA或称反义RNA,与mRNA序列互补,可抑制mRNA的翻译。 6.核酶:具有催化活性的RNA,在RNA的剪接加工过程中起到自我催化的作用。 7.模体:蛋白质分子空间结构中存在着某些立体形状和拓扑结构颇为类似的局部区域 8.信号肽:在蛋白质合成过程中N端有15~36个氨基酸残基的肽段,引导蛋白质的跨膜。

除了5’ 3’外切酶活性 19.锚定PCR:用于扩增已知一端序列的目的DNA。在未知序列一端加上一段多聚dG的尾巴,然后分别用多聚dC和已知的序列作为引物进行PCR扩增。 20.融合蛋白:真核蛋白的基因与外源基因连接,同时表达翻译出的原基因蛋白与外源蛋白结合在一起所组成的蛋白质。 二、填空 1. DNA的物理图谱是DNA分子的(限制性内切酶酶解)片段的排列顺序。 2. RNA酶的剪切分为(自体催化)、(异体催化)两种类型。3.原核生物中有三种起始因子分别是(IF-1)、( IF-2 )和(IF-3 )。4.蛋白质的跨膜需要(信号肽)的引导,蛋白伴侣的作用是(辅助肽链折叠成天然构象的蛋白质)。 5.启动子中的元件通常可以分为两种:(核心启动子元件)和(上游启动子元件)。 6.分子生物学的研究内容主要包含(结构分子生物学)、(基因表达与调控)、( DNA重组技术)三部分。 7.证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是(肺炎球菌感染小鼠)、( T2噬菌体感染大肠杆菌)这两个实验中主要的论点证据是:(生物体吸收的外源DNA改变了其遗传潜能)。 8.hnRNA与mRNA之间的差别主要有两点:( hnRNA在转变为mRNA 的过程中经过剪接,)、

(完整版)分子生物学试题及答案(整理版)

分子生物学试题及答案 一、名词解释 1.cDNA与cccDNA:cDNA是由mRNA通过反转录酶合成的双链DNA;cccDNA是游离于染色体之外的质粒双链闭合环形DNA。 2.标准折叠单位:蛋白质二级结构单元α-螺旋与β-折叠通过各种连接多肽可以组成特殊几何排列的结构块,此种确定的折叠类型通常称为超二级结构。几乎所有的三级结构都可以用这些折叠类型,乃至他们的组合型来予以描述,因此又将其称为标准折叠单位。 3.CAP:环腺苷酸(cAMP)受体蛋白CRP(cAMP receptor protein ),cAMP与CRP结合后所形成的复合物称激活蛋白CAP(cAMP activated protein ) 4.回文序列:DNA片段上的一段所具有的反向互补序列,常是限制性酶切位点。 5.micRNA:互补干扰RNA或称反义RNA,与mRNA序列互补,可抑制mRNA的翻译。 6.核酶:具有催化活性的RNA,在RNA的剪接加工过程中起到自我催化的作用。 7.模体:蛋白质分子空间结构中存在着某些立体形状和拓扑结构颇为类似的局部区域 8.信号肽:在蛋白质合成过程中N端有15~36个氨基酸残基的肽段,引导蛋白质的跨膜。 9.弱化子:在操纵区与结构基因之间的一段可以终止转录作用的核苷酸序列。 10.魔斑:当细菌生长过程中,遇到氨基酸全面缺乏时,细菌将会产生一个应急反应,停止全部基因的表达。产生这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸(pppGpp)。PpGpp与pppGpp的作用不只是一个或几个操纵子,而是影响一大批,所以称他们是超级调控子或称为魔斑。 11.上游启动子元件:是指对启动子的活性起到一种调节作用的DNA序列,-10区的TATA、-35区的TGACA 及增强子,弱化子等。 12.DNA探针:是带有标记的一段已知序列DNA,用以检测未知序列、筛选目的基因等方面广泛应用。13.SD序列:是核糖体与mRNA结合序列,对翻译起到调控作用。 14.单克隆抗体:只针对单一抗原决定簇起作用的抗体。 15.考斯质粒:是经过人工构建的一种外源DNA载体,保留噬菌体两端的COS区,与质粒连接构成。16.蓝-白斑筛选:含LacZ基因(编码β半乳糖苷酶)该酶能分解生色底物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)产生蓝色,从而使菌株变蓝。当外源DNA插入后,LacZ基因不能表达,菌株呈白色,以此来筛选重组细菌。称之为蓝-白斑筛选。 17.顺式作用元件:在DNA中一段特殊的碱基序列,对基因的表达起到调控作用的基因元件。18.Klenow酶:DNA聚合酶I大片段,只是从DNA聚合酶I全酶中去除了5’→3’外切酶活性 19.锚定PCR:用于扩增已知一端序列的目的DNA。在未知序列一端加上一段多聚dG的尾巴,然后分别用多聚dC和已知的序列作为引物进行PCR扩增。 20.融合蛋白:真核蛋白的基因与外源基因连接,同时表达翻译出的原基因蛋白与外源蛋白结合在一起所组成的蛋白质。 二、填空 1. DNA的物理图谱是DNA分子的(限制性内切酶酶解)片段的排列顺序。 2. RNA酶的剪切分为(自体催化)、(异体催化)两种类型。 3.原核生物中有三种起始因子分别是(IF-1)、(IF-2)和(IF-3)。 4.蛋白质的跨膜需要(信号肽)的引导,蛋白伴侣的作用是(辅助肽链折叠成天然构象的蛋白质)。5.启动子中的元件通常可以分为两种:(核心启动子元件)和(上游启动子元件)。 6.分子生物学的研究内容主要包含(结构分子生物学)、(基因表达与调控)、(DNA重组技术)三部分。7.证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是(肺炎球菌感染小鼠)、( T2噬菌体感染大肠杆菌)这两个实验中主要的论点证据是:(生物体吸收的外源DNA改变了其遗传潜能)。 8.hnRNA与mRNA之间的差别主要有两点:(hnRNA在转变为mRNA的过程中经过剪接,)、 (mRNA的5′末端被加上一个m7pGppp帽子,在mRNA3′末端多了一个多聚腺苷酸(polyA)尾巴)。 9.蛋白质多亚基形式的优点是(亚基对DNA的利用来说是一种经济的方法)、(可以减少蛋白质合成过程中随机的错误对蛋白质活性的影响)、(活性能够非常有效和迅速地被打开和被关闭)。 10.蛋白质折叠机制首先成核理论的主要内容包括(成核)、(结构充实)、(最后重排)。 11.半乳糖对细菌有双重作用;一方面(可以作为碳源供细胞生长);另一方面(它又是细胞壁的成分)。所以需要一个不依赖于cAMP—CRP的启动子S2进行本底水平的永久型合成;同时需要一个依赖于cAMP—CRP的启动子S1对高水平合成进行调节。有G时转录从( S2)开始,无G时转录从( S1)开

现代分子生物学第六章作业

现代分子生物学第六章作业 09级一班芮世杭222009317011027 1,列举两种研究基因表达模式的方法并简述其原理。 (1)基因表达序列分析技术(SAGE)是一种以DNA序列测定为基础定量分析全基因组表达模式的技术能够直接读出任何一种细胞类型或组织的基因表达信息在转录组水平上,任何长度超过9—10个碱基的核苷酸片段都可能代表一种特异性核苷酸的转录产物,因此,用特定限制性核酸内切酶分离转录产物中具有基因特异性的9—10个碱基的核苷酸序列并制成标签。将这些序列标签连接,克隆,测序后,根据其占总标签数的比例即可分析其对应编码基因的表达频率。 (2)原位杂交技术(ISH)是用标记的核酸探针,经放射自显影或非放射检测体系,在组织,细胞,间期核及染色体上对核酸进行定位和相对定量研究的一种手段,分为RNA和染色体原位杂交两大类。RNA原位杂交用放射性或非放射性标记的特异性探针与被固定的组织切片反应。若细胞中存在与探针互补的mRNA分子,两者杂交产生双链RNA,课通过反射性标记或经酶促免疫显色,对该基因的表达产物做出定性定量分析。 (3)基因芯片技术(FISH)对寡核苷酸探针做特殊的修饰和标记,用原位杂交与靶染色体或DNA上特定的序列结合,再通过与荧光素分子相耦联的单克隆抗体来确定该DNA序列在染色体上的位置。 2,简述基因芯片技术对分子生物学研究的意义。 解某些基因对特定生长发育阶段的重要性;基因芯片还可用于进行基因诊断,可建立正常人特定组织、器官的基因芯片,给出标准杂交信号图。用可疑病人的cDNA做探针与之杂交,检查哪些基因的表达受抑制或激活,另可研究表达基因的生物学特性。 3,比较酵母双杂交技术和免疫共沉淀技术在研究蛋白质相互作用方面的优缺点? (1)酵母双杂交技术称Two-hybrid system也叫interaction trap(相互作用陷井),是90年代初发展起来的分离基因的新方法,可用于分离能与已知靶蛋白质(target protein)相互作用的基因。 基本原理: 真核生物的转录因子大多是由两个结构上分开、功能上独立的结构域组成的。如GAL4的N端1-147aa是DNA结合域(BD),其C端768-881aa是转录激活域(AD)。一般情况下,AD能与GAL4效应基因启动子上游的特定DNA区段(UAS)相结合,而此时,AD 则推动了转录起始。 若用基因工程的方法,将GAL4 AD和BD分别克隆到不同的载体上,导入同一细胞株中表达,效应基因无法被激活,但可把来自不同转录因子的AD或BD区域连成一个功能基因。 主要实验过程: a. 选择缺失GAL4编码基因的酵母寄主菌株-SFY526或HF7c; b. 构建带有GAL1 UAS-启动子-lac Z(His3)的转化载体; c. 把已知的靶蛋白质编码基因克隆到pGBT9的多克隆位点上,把所有cDNA都克隆到pGAD424载体上,构成cDNA表达文库。 d. 从大肠杆菌中分别提取这两种重组质粒DNA,共转化感受态酿酒酵母菌株。 e. 将共转化的酵母菌株涂布于缺少Leu,Trp和His的培养基上,筛选表达相互作用的杂种蛋白的阳性菌落。

分子生物学问答题

1.什么是转座? 转座因子在一个DNA分子内部或者两个DNA之间不同位置 间的移动。 2.病毒基因组有哪些特点?答:不同病毒基因组大小相差较大;不同病 毒基因组可以是不同结构的核酸;除逆转录病毒外,为单倍体基因组;病毒基因组有的是连续的,有的分节段;有的基因有内含子;病毒基因组大部分为编码序列;功能相关基因转录为多顺反子mRNA有基因重叠现象。 3.原核生物基因组有哪些特点?答:基因组由一条环状双链DNA组成; 只有一个复制起始点;大多数结构基因组成操纵子结构;结构基因无重叠现象;无内含子,转录后不需要剪接;基因组中编码区大于非编码区;重复基因少,结构基因一般为单拷贝;有编码同工酶的等基因;基因组中存在可移动的DNA序列;非编码区主要是调控序列。 4.真核生物基因组有哪些特点?答:每一种真核生物都有一定的染色 体数目;远大于原核基因组,结构复杂,基因数庞大;真核生物基因转录为单顺反子;有大量重复序列;真核基因为断裂基因;非编码序列多于编码序列;功能相关基因构成各种基因家族。 5.基因重叠有什么意义?答:利用有限的核酸储存更多的遗传信息,提 高自身在进化过程中的适应能力。 6.质粒有哪些特性? 答:在宿主细胞内可自主复制;细胞分裂时恒定地 传给子代;所携带的遗传信息能赋予宿主特定的遗传性状;质粒可以转移。 7.什么是顺式作用元件? 答:基因中能影响基因表达,但不编码RNA 和蛋白质的DNA序列。顺式作用元件主要包括启动子、增强子、负调控元件等。 8.简述原核基因表达的特点。答:(1)只有一种RNA聚合酶。(2)原核 生物的基因表达以操纵子为基本单位。(3)转录和翻译是偶联进行的。(4)mR

现代分子生物学第四章作业【修订版】

现代分子生物学第四章作业(5-13题) 222009317011128 牛旭毅2011.10.15 5,比较原核与真核的核糖体组成? 答:相同点:核糖体是一个致密的核糖核蛋白颗粒,可以解离为两个亚基,每个亚基都含有一个相对分子质量较大的rRNA和许多不同的蛋白质分子。 不同点:(1)原核生物核糖体由约2/3的RNA及1/3的蛋白质组成。真核生物核糖体中RNA占3/5,蛋白质占2/5。(2)大肠杆菌核糖体小亚基由21种蛋白质组成,分别用S1……S21表示,大亚基由33种蛋白质组成,分别用L1……L33表示。真核生物细胞核糖体大亚基含有49种蛋白质,小亚基有33种蛋白质。 6,什么是SD序列?其功能是什么? 答:定义:因澳大利亚学者夏因(Shine)和达尔加诺(Dalgarno)两人发现该序列的功能而得名。信使核糖核酸(mRNA)翻译起点上游与原核16S 核糖体RNA或真核18S rRNA 3′端富含嘧啶的7核苷酸序列互补的富含嘌呤的3~7个核苷酸序列(AGGAGG),是核糖体小亚基与mRNA结合并形成正确的前起始复合体的一段序列。 功能:此序列富含A-G,恰与16SRNA3’端富含T-C的序列互补,因此mRNA 与核蛋白体sRNA容易配对结合。因此SD序列对mRNA的翻译起重要作用。 7,核糖体有哪些活性中心? 答:核糖体有多个活性中心,即mRNA结合部位、结合或接受AA- tRNA部位(A 位)、结合或接受肽酰-tRNA的部位(P位)、肽基转移部位及形成肽键的部位(转肽酶中心),此外还应有负责肽链延伸的各种延伸因子的结合位点。 8,真核生物与原核生物在翻译起始过程中有什么区别? 答:原核生物的起始tRNA是fMet-tRNA(fMet上角标),30s小亚基首先与mRNA 模板相结合,再与fMet-tRNA(fMet上角标)结合,最后与50s大亚基结合。 真核生物的起始tRNA是Met-tRNA(Met上角标),40s小亚基首先与Met-tRNA(Met上角标)相结合,再与模板mRNA结合,最后与60s大亚基结合生成起始复合物。真核生物蛋白质生物合成的起始机制与原核生物基本相同,其差异主要是核糖体较大,有较多的起始因子参与,其mRNA具有m7GpppNp帽子结构,Met-tRNA (Met上角标)不甲酰化,mRNA分子5' 端的“帽子”参与形成翻译起始复合物。9,链霉素为什么能预制蛋白质合成? 答:链霉素是一种碱性三糖,干扰fMet-tRNA与核糖体的结合,从而阻止蛋白质合成的正确起始,并导致mRNA的错读。若以poly(U)作模板,则除苯丙氨酸(UUU)外,异亮氨酸(AUU)也会掺入。链霉素的作用位点在30S亚基上。

分子生物学作业(完整版)

分子生物学作业 第一次 1、Promoter:(启动子)一段位于结构基因5…端上游、能活化RNA聚合酶的DNA序列,是RNA聚合酶的结合区,其结构直接关系转录的特异性与效率。 2、Cis-acting element:(顺式作用元件)影响自身基因表达活性的非编码DNA序列,组成基因转录的调控区包括:启动子、增强子、沉默子等 一、简述基因转录的基本特征。(作业)P35 二、简述蛋白质生物合成的延长过程。P58 肽链的延伸由于核糖体沿mRNA5 ′端向3′端移动,开始了从N端向C端的多肽合成。 起始复合物,延伸AA-tRNA,延伸因子,GTP,Mg 2+,肽基转移酶 每加一个氨基酸完成一个循环,包括: 进位:后续AA-tRNA与核糖体A位点的结合 起始复合物形成以后,第二个AA-tRNA在EF-Tu作用下,结合到核糖体A位上。 通过延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-Tu?GTP复合物,参与下一轮循环。 需要消耗GTP,并需EF-Tu、EF-Ts两种延伸因子。 转位:P位tRNA的AA转给A位的tRNA,生成肽键; 移位:tRNA和mRNA相对核糖体的移动; 核糖体向mRNA3’端方向移动一个密码子,二肽酰-tRNA2进入P位,去氨酰-tRNA 被挤入E位,空出A位给下一个氨酰-tRNA。移位需EF-G并消耗GTP。 三、真核细胞mRNA分子的加工过程有哪些?P40 1、5’端加帽 加帽指在mRNA前体刚转录出来或转录尚未完成时,mRNA前体5’端在鸟苷酸转移酶催化下加G,然后在甲基转移酶的作用下进行甲基化。 帽子的类型 0号帽子(cap1) 1号帽子(cap1) 2号帽子(cap2) 2、3’端的产生和多聚腺苷酸花 除组蛋白基因外,真核生物mRNA的3?末端都有poly(A)序列,其长度因mRNA种类不同而变化,一般为40~200个A 。 大部分真核mRNA有poly(A)尾巴,1/3没有。 带有poly(A)的mRNA称为poly(A)+, 不带poly(A)的mRNA称为poly(A)-。 加尾信号: 3?末端转录终止位点上游15~30bp处的一段保守序列AAUAAA。 过程: ①内切酶切开mRNA3?端的特定部位; ②多聚A合成酶催化加poly(A)。 3、RNA的剪接

分子生物学简答题教学教材

试述乳糖操纵子的阻遏作用、诱导作用及正调控。 阻遏作用:阻遏基因lacl转录产生阻遏物单体,结合形成同源四体,即阻遏物。它是一个抗解链蛋白,当阻遏物与操纵基因O结合时,阻止DNA形成开放结构,从而抑制RNA聚合酶的功能。lacmRNA的转录起始受到抑制。 诱导作用:按照lac操纵子本底水平的表达,每个细胞内有几个分子的β-半乳糖苷酶和β-半乳糖苷透过酶。当加入乳糖,在单个透过酶分子的作用下,少量乳糖分子进入细胞,又在单个β-半乳糖苷酶的作用下转变为诱导物异构乳糖,诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之因不能与操纵基因结合而失活,O区没有被阻遏物占据从而激发lacmRNA 的合成。 调控作用:葡糖糖对lac操纵子的表达的抑制是间接的,不是葡萄糖本身而是其降解产物抑制cAMP的合成。cAMP-CAP复合物与启动子区的结合是lacmRNA转录起始所必须的,因为该复合物结合于启动子上游,能使DNA双螺旋发生弯曲。有利于形成稳定开放型启动子-RNA聚合酶结构。如果将葡萄糖和乳糖同时加入培养基中,lac操纵子处于阻遏状态,不能被诱导 试述E.coli的RNA聚合酶的结构和功能。 2个α亚基、一个β亚基、一个β’亚基和一个亚基组成的核心酶,加上一个亚基后则成为聚合酶全酶 α亚基:核心酶组装、启动子识别 β和β’亚基:β和β’共同形成RNA合成的催化中心 因子:存在多种因子,用于识别不同的启动子 试述原核生物DNA复制的特点。 1.原核只有一个起始位点。 2.原核复制起始位点可以连续开始新的复制,特别是快速繁殖的细胞。 3.原核的DNA聚合酶III复制时形成二聚体复合物。 4.原核的DNA聚合酶I具有5'-3'外切酶活性 DNA解旋酶通过水解ATP 产生能量来解开双链DNA 单链结合蛋白保证被解链酶解开的单链在复制完成前保持单链结构 DNA拓扑异构酶消除解链造成的正超螺旋的堆积,消除阻碍解链继续进行的这种压力,使复制得以延伸 真核生物hnRNA必须经过哪些加工才能成为成熟的mRNA,以用作蛋白质合成的模板? (1)、在5’端加帽,5’端的一个核苷酸总是7-甲基鸟核苷三磷酸(m7Gppp)。 (2)、3’端加尾,多聚腺苷酸尾巴。准确切割,加poly(A)(3)、RNA的剪接,参与RNA剪接的物质:snRNA、snRNP(4)、RNA的编辑,编辑(editing)是指转录后的RNA 在编码区发生碱基的突变、加入或丢失等现象。 (5.)、RNA的再编码,mRNA有时可以改变原来的编码信息,以不同的方式进行翻译 (6.)、RNA的化学修饰,人细胞内rRNA分子上就存在106种甲基化和95种假尿嘧啶产物。

(完整版)分子生物学简答题全

简答题 6.为什么利用RNAi抑制一个基因的表达较利用反义RNA技术更为彻底。 答:RNAi是外源或内源性的双链RNA 进入细胞后引起与其同源的mRNA特异性降解.dsRNA进入细胞后,在Dicer作用下,分解为21-22bp的SiRNA.SiRNA结合相关 酶,形成RNA介导的沉默复合物RISC.RISC在ATP作用下,将双链SiRNA变成单链 SiRNA,进而成为有活性的RISC,又称为slicer.slicer与靶mRNA结合,导致其断裂,进 而导致其彻底降解。 反义RNA是与靶mRNA互补的RNA,它通过与靶mRNA特异结合而抑制其翻译表达,反义RNA是与靶mRNA是随机碰撞并通过碱基互补配对,所以,mRNA不一定完全 被抑制。 8.简述真核基因表达的调控机制。 答:(1)DNA和染色质结构对转录的调控: ①DNA甲基化,②组蛋白对基因表达的抑制,③染色质结构对基因表达的调控作 用,④基因重排,⑤染色质的丢失,⑥基因扩增; (2)转录起始调控: ①反式作用因子活性调节,包括表达调节、共价调节,配体调节等蛋白质相互作用 调节),②反式作用因子与顺式作用原件结合对转录过程进行调控; (3)转录后调控: ①5’端加帽和3’端多核苷酸化调控,②选择剪接调控,③mRNA运输调控,④mRNA 稳定性调控; (4)翻译起始的调控: ①阻遏蛋白的调控,②对翻译因子的调控,③对AUG的调控,④mRNA 5’端非编 码区的调控,⑤小分子RNA; (5)翻译后加工调控: ①新生肽链的水解,②肽链中氨基酸的共价修饰,③信号肽调控。 9.简述mRNA加工过程。 答:(1)5′端加帽(由加帽酶催化5′端加入7-甲苷乌苷酸,形成帽子结构m7GpppmNP-)。(2)3′端加入Poly(A)尾(A、组蛋白的成熟mRNA无需加polyA尾;B、加尾信号包括AAUAAA和富含GU的序列;C、加尾不需模板;D剪切过程需要多种蛋白质因 子的辅助)。 (3)mRNA前体的剪接(剪接加工以除去内含子序列,并将外显子序列连接成为成熟的有功能的mRNA分子。内含子两端的结构通常是5′-GU……AG-3′。选择性剪接的作 用机制包括;A使用不同的剪接位点,B选择使用外显子,C、反式剪接,D、使用 不同的启动子,E、使用不同的多腺苷酸化位点)。 (4)RNA的编辑(发生于转录后水平,改编mRNA序列,C→U或A→G,增加遗传信息容量)。 10.简述生物的中心法则。 答:中心法则(genetic central dogma),是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。

现代分子生物学作业

现代分子生物学与基因工程作业 姓名________________班级_____________学号________________ 1、绝大多数的真核生物染色体中均含有HI、H2A、H2B、H3和H4五种组蛋白,在不同物种之间它们的保守性表现在() A.H3和H4具有较高的保守性,而H2A和H2B的保守性比较低 B. H2A和H2B具有较高的保守性,而H3和H4的保守性比较低 C. H1和H4具有较高的保守性,而H3和H2B的保守性比较低 D. H1和H3具有较高的保守性,而H4和H2B的保守性比较低 2、下列叙述哪个是正确的() A. C值与生物体的形态学复杂性成正相关 B. C值与生物体的形态学复杂性成负相关 C. 每个门的最小C值与生物体的形态学复杂性是大致相关的 C值指一种生物单倍体基因组DNA的总量。不同物种的C值差异很大,随着生物体的进化 3、真核DNA存在于() A. 线粒体与微粒体内 B. 线粒体与高尔基体内 C. 线粒体与细胞核内 D.细胞核与高尔基体内 E. 细胞核与溶酶体内 4、在核酸分子中核苷酸之间的连接方式是() A. 2‵-3‵磷酸二酯键 B. 2‵-5‵磷酸二酯键 C. 3‵-5‵磷酸二酯键 D.糖苷键 5、所有生物基因组DNA复制的相同之处是() A. 半保留复制 B. 全保留复制 C. 嵌合型复制 D. 偶联型复制 6、复制子是() A. 细胞分离期间复制产物被分离之后的DNA片段 B. 复制的DNA片段和在此过程中所需的酶和蛋白 C. 任何自发复制的DNA序列(它与复制起始点相连) D. 复制起点和复制叉之间的DNA片段 7、在原核生物复制子中,下列哪种酶除去RNA引发体并加入脱氧核糖核酸() A.DNA聚合酶I B.DNA聚合酶II C.DNA聚合酶III D. 连接酶

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