winkawaks kawaks 宏设置方法

winkawaks kawaks 宏设置方法
winkawaks kawaks 宏设置方法

WinKawaks的宏的定义方法:(KOF99游戏为例)

有人会问宏是干什么的呢,说简单一点,就是一个键完成一系列操作,比如说,在KOF中,你只要把相应的超必杀设定为宏,你按一个键就可以发

出极其复杂的超必杀.

宏定义的具体符号表示如下:

u=上d=下f=前b=后df=前下db=后下ub=后斜跳uf=前斜跳1=按键1 2=按键2 3=按键3 4=按键4 5=按键5 6=按键6 s=开始,=下一帧有停顿

的作用+=表示在宏定义的招式发出的同时接受其它操作指令的输入,经观察发现,u,d,f,b就是上,下,前,后的英文单词的第一个字母。

看完了具体符号表示方法后,笔者来举几个KOF99nd中人物的例子.

先打开INI目录中的KOF99nd.ini,如果你没有这个文件,运行一个kof99nd就会自动生成该文件的在记事本中查找[Macros],会跳转到该行,在这里就可以写宏命令了

K'DASH

连锁驱动:↓↘→↘↓↙←+C

宏命令:d,df,f,df,d,db,b3

你把Macro1A=12+改成Macro1A=d,df,f,df,d,db,b3然后保存

(注意:下面的Macro1B...J都是可以改的,一共支持十条宏命令)

运行kof99nd,看一下在“游戏”菜单中的"重新定义键位设定"中的"重新定义玩家1的键位设定 ..."

看到了吧,那个d,df,f,df,d,db,b3就是笔者刚才定义的宏,前面是一个1,就证明按数字1键就可以发出

K'DASH的连锁驱动的超必杀了,那个1就可以改变的,任何键都可以,只要不跟上面的控制设定冲突就行了

再给几个宏给大家参考,对照一下上面的"宏定义的具体符号表示方法"就懂了.

K'DASH

热动:↓↘→↓↘→+C

宏命令:d,df,f,d,df,f3

宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识

宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识 感染是急危重症患者死亡的主要原因之一。近年来,随着新发病原微生物的出现、耐药病原微生物的增多以及免疫抑制宿主的增加,感染的发病率和死亡率仍居高不下,脓毒症(严重感染)患者病死率高达50%[1-3]。最新调查研究发现,中国脓毒症相关性标化死亡率为66.7例/10万人口,全国每年共有脓毒症相关性死亡病例近103万例[3]。重症感染起病急、进展快、病原体复杂,短时间内能否明确致病病原微生物至关重要。 传统的病原微生物检测方法主要包括形态学检测、培养分离、生化检测、免疫学和核酸检测。因操作简单、快速、技术要求不高,同时具有一定的诊断敏感性和特异性,目前仍在临床上广泛使用。但传统的检测方法在敏感性、特异性、时效性、信息量等方面存在局限,而且对于未知或者罕见的病原微生物,无法快速识别。 基于宏基因组新一代测序技术(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,然后与数据库进行比对分析,根据比对到的序列信息来判断样本包含的病原微生物种类,能够快速、客观地检测临床样本中的较多病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫),且无需特异性扩增[4-8],尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。 为了规范运用mNGS进行病原微生物的诊断、正确解读检测结果和指导治疗,我们组织了急危重病、感染病学和病原微生物学相关领域的专家,制定了本共识。 1 mNGS分析和诊断技术是急危重症感染快速、精准诊疗的发展方向 新一代测序技术是一个开放的分析和诊断系统,目前已经纳入的病原体有8000多种,其中包括3000余种细菌、4000余种病毒、200余种真菌和140种寄生虫,为疑难危重症及罕见病原微生物感染的诊断提供了有效的技术手段。 自2008年成功应用于临床诊断新发病原体感染以来[9-10],目前mNGS技术已经逐步用于临床疑难感染诊断,如华山医院张文宏团队[11]用mNGS协助确诊猪疱疹病毒的跨物种传播,并给予针对性治疗使患者痊愈,深圳市第三人民医院用mNGS确诊了一例罕见阿米巴脑炎[11-12]。 mNGS对脓毒症、免疫抑制宿主并发严重感染、重症肺部感染等疾病具有较高的临床应用价值,能够快速、精准地找到病原体;另外对于抗菌药物治疗方案的制定和治疗效果的评估具有一定的指导作用[9-16]。Long等[17]研究发现血培养联合mNGS诊断细菌或真菌感染,阳性率较单用血培养显著升高。以健康人群为基线,建立每种微生物在正常人群中的分布情况模型,进而计算脓毒症指数来评估检出微生物的核酸数量,Crumaz等[18]发现在脓毒症患者血液标本中病原菌的脓毒症指数绝对值、丰度显著升高,而且其变化与临床治疗效

宏基因组学概述

宏基因组学概述

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宏基因组学概述 王莹,马伊鸣 (北京交通大学土木建筑工程学院环境1402班) 摘要:随着分子生物学技术的快速发展及其在微生物生态学和环境微生物学研究中的广泛应用,促进了以环境中未培养微生物为研究对象的新兴学科——微生物环境基因组学(又叫宏基因组学、元基因组学,英文名Metagenomics)的产生和快速发展。宏基因组学通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能.在短短几年内,宏基因组学研究已渗透到各个领域,包括海洋、土壤、热液口、热泉、人体口腔及胃肠道等,并在医药、替代能源、环境修复、生物技术,农业、生物防御及伦理学等各方面显示了重要的价值。本文对宏基因组学的主要研究方法、热点内容及发展趋势进行了综述 关键词:宏基因组宏基因组学环境基因组学基因文库的构建 Macro summary of Metagenomics WangYing,Ma Yi-Ming (BeijingJiaotongUniversity, Institute of civil engineering,)Key words:Metagenome; Metagenomics;The environmental genomics 宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质(或获得新基因)的新理念和新方法。其主要含义是:对特定环境中全部微生物的总DNA(也称宏基因组,metagenomic)进行克隆,并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质;或者根据rDNA数据库设计引物,通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。 1.起源 宏基因组学这一概念最早是在1998年由威斯康辛大学植物病理学部门的Jo Handelsman等提出的,是源于将来自环境中基因集可以在某种程度上当成一个单个基因组研究分析的想法,而宏的英文是"meta-",具有更高层组织结构和动态变化的含义。后来伯克利分校的研究人员Kevin Chen和LiorPachter将宏基因组定义为"应用现代基因组学的技术直接研究自然状态下的微生物的有机群落,而不需要在实验室中分离单一的菌株"的科学。 2 研究对象 宏基因组学(Metagenomics)是将环境中全部微生物的遗传信息看作一个整体自上而下地研究微生物与自然环境或生物体之间的关系。宏基因组学不仅克服了微生物难以培养的困难, 而且还可以结合生物信息学的方法, 揭示微生物之间、微生物与环境之间相互作用的规律, 大大拓展了微生物学的研究思路与方法, 为从群落结构水平上全面认识微生物的生态特征和功能开辟了新的途径。目前, 微生物宏基因组学已经成为微生物研究的热点和前沿, 广泛应用于气候变化、水处理工程系统、极端环境、人体肠道、石油污染、生物冶金等领域, 取得了一系列引人瞩目的重要成果。 3 研究方法

数控车床由浅入深的宏程序实例

宏程序 裳华职业技术中专鲍新涛 宏程序概述 其实说起来宏就是用公式来加工零件的,比如说,如果没有宏的话,我们要逐点算出上的点,然后慢慢来用直线逼近,如果是个光洁度要求很高的工件的话,那么需要计算很多的点,可是应用了宏后,我们把椭圆公式输入到系统中然后我们给出Z坐标并且每次加10um那么宏就会自动算出X坐标并且进行切削,实际上宏在程序中主要起到的是运算作用。.宏一般分为A类宏和B类宏。 A类宏是以G65 Hxx P#xx Q#xx R#xx的格式输入的,而B类宏程序 则是以直接的公式和语言输入的和C语言很相似在0i系统中应用比较广。 宏程序的作用 数控系统为用户配备了强有力的类似于高级语言的宏程序功能,用户可以使用变量进行算术运算、逻辑运算和函数的混合运算,此外宏程序还提供了循环语句、分支语句和子程序调用语句,利于编制各种复杂的零件加工程序,减少乃至免除手工编程时进行繁琐的数值计算,以及精简程序量。 宏程序指令适合抛物线、椭圆、双曲线等没有插补指令的曲线编程;适合图形一样,只是尺寸不同的系列零件的编程;适合工艺路径一样,只是位置参数不同的系列零件的编程。较大地简化编程;扩展应用范围。 宏的分类 B类宏 由于现在B类宏程序的大量使用,很多书都进行了介绍这里我就不再重复了,但在一些老系统中,比如(FANUC)OTD系统中由于它的MDI键盘上没有公式符号,连最简单的等于号都没有,为此如果应用B类宏程序的话就只能在计算机上编好

再通过RSN-32接口传输的数控系统中,可是如果我们没有PC机和RSN-32电缆的话怎么办呢,那么只有通过A类宏程序来进行宏程序编制了,下面我介绍一下A 类宏的引用; A类宏 A类宏是用G65 Hxx P#xx Q#xx R#xx或G65 Hxx P#xx Qxx Rxx格式输入的,xx 的意思就是数值,是以um级的量输入的,比如你输入100那就是0.1MM.#xx就是号,变量号就是把数值代入到一个固定的地址中,固定的地址就是变量,一般OTD 系统中有#0~#100~#149~#500~#531.关闭电源时变量#100~#149被初始化成“空”,而变量#500~#531保持数据.我们如果说#100=30那么现在#100地址内的数据就是30了,就是这么简单.好现在我来说一下H代码,大家可以看到A类宏的标准格式中#xx和xx都是数值,而G65表示使用A类宏,那么这个H就是要表示各个数值和变量号内的数值或者各个变量号内的数值与其他变量号内的数值之间要进行一个什么运算,可以说你了解了H代码A类宏程序你基本就可以应用了,好,现在说一下H代码的各个含义: 应用 以下都以#100和#101和#102,及数值10和20做为例子,应用的时候别把他们当格式就行, 基本指令 H01赋值;格式:G65H01P#101Q#102:把#102内的数值赋予到#101中 G65H01P#101Q#10:把#10赋予到#101中 H02加指令;格式G65 H02 P#101 Q#102 R#103,把#102的数值加上#103的数值赋予#101

宏基因组测序技术检测方法

宏基因组测序技术检测标准 简介: 宏基因组测序介绍 宏基因组学是以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,通过现代基因组技术手段包括功能基因的筛选和测序分析,对环境中微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系以及环境之间的关系进行研究的新的微生物研究方法。随着高通量测序技术的发展,为宏基因组学研究提供了新的理想研究方法。高通量测序的方法无需分离环境中各种微生物,也无需构建克隆文库就可以直接对环境中所有微生物进行测序。可以真实客观的反映环境中微生物的多样性、种群结构、进化关系等。目前又可以分为针对16s DNA/18sDNA/ITS测序和针对宏基因组全序列的测序研究。下面就是对这两者的具体介绍。 一、16s DNA/18s DNA/ITS测序 16sDNA是最常用的微生物物种分子鉴定的标签,,通过对样品中16sDNA测序可以鉴定其中微生物物种的丰度和分布情况。目前,普遍使用Roche 454平台来对环境样品进行16s DNA测序。因为16s DNA序列比较相似,读长短的话,难以进行有效的比对,而454平台的平均读长在400bp左右,可以很好的避免此类问题。 二、宏基因组全测序 在这种测序方式中,我们可以假定一个环境中的所有微生物就是一个整体,然后对其中所有的微生物进行测序。这样我们就可以研究样品中的功能基因以及其在环境中所起的作用而不用关心其来自哪个微生物。可以发现新的基因,可以进行基因的预测,甚至有可能得到某个细菌基因组的全序列。此外,该项测序不单可以针对DNA水平,也可以针对全RNA进行基因表达水平的研究。 样品处理:

宏基因组样品收集主要有口腔,下呼吸道痰液,下呼吸道灌洗液,皮肤和粪便。样品采集遵照样品采集规范(人)所规定的操作来进行。尽量留足备份样品。核酸提取: 宏基因组核酸提取主要有两种方法:膜过滤法和直接裂解提取。对于液体样品如痰液,灌洗液两种方法都适用,对于固体样品如粪便宜采用直接裂解的方法。核酸提取后用NanoDrop ND-1000测定,260/280 = , 260/230 = ,电泳检测DNA 应是完整的一条带。 测序Sequencing 1)16S/18S测序: Sanger测序: 用于低通量的16S/18S DNA测序,提取宏基因组后,首先通过PCR将16S/18S 序列扩增出来,再将其连接到克隆载体上,导入感受态细胞,涂平板做蓝白斑筛选,选出阳性克隆提质粒,对质粒进行测序反应,测序反应后纯化后用ABI 3130或ABI 3730进行毛细管电泳测序。 由于其测序准确率比较高,而通量非常低,现通常用做二代测序结果的验证。454 Platform: 454平台主要包括两种测序系统:454 GS FLX+ System和454 GS Junior System。454 GS FLX+ System测序读长可以达到600-1000bp,通量450-700M,GS Junior System测序读长在400bp左右,通量在35M。

宏基因组测序技术检测方法模板

宏基因组测序技术 检测方法

宏基因组测序技术检测标准 简介: 宏基因组测序介绍 宏基因组学是以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,经过现代基因组技术手段包括功能基因的筛选和测序分析,对环境中微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系以及环境之间的关系进行研究的新的微生物研究方法。随着高通量测序技术的发展,为宏基因组学研究提供了新的理想研究方法。高通量测序的方法无需分离环境中各种微生物,也无需构建克隆文库就能够直接对环境中所有微生物进行测序。能够真实客观的反映环境中微生物的多样性、种群结构、进化关系等。当前又能够分为针对16s DNA/18sDNA/ITS测序和针对宏基因组全序列的测序研究。下面就是对这两者的具体介绍。 一、16s DNA/18s DNA/ITS测序 16sDNA是最常见的微生物物种分子鉴定的标签,,经过对样品中16sDNA测序能够鉴定其中微生物物种的丰度和分布情况。当前,普遍使用Roche 454平台来对环境样品进行16s DNA测序。因为16s DNA序列比较相似,读长短的话,难以进行有效的比对,而454平台的平均读长在400bp左右,能够很好的避免此类问题。 二、宏基因组全测序

在这种测序方式中,我们能够假定一个环境中的所有微生物就是一个整体,然后对其中所有的微生物进行测序。这样我们就能够研究样品中的功能基因以及其在环境中所起的作用而不用关心其来自哪个微生物。能够发现新的基因,能够进行基因的预测,甚至有可能得到某个细菌基因组的全序列。另外,该项测序不单能够针对DNA水平,也能够针对全RNA进行基因表示水平的研究。 样品处理: 宏基因组样品收集主要有口腔,下呼吸道痰液,下呼吸道灌洗液,皮肤和粪便。样品采集遵照样品采集规范(人)所规定的操作来进行。尽量留足备份样品。 核酸提取: 宏基因组核酸提取主要有两种方法:膜过滤法和直接裂解提取。对于液体样品如痰液,灌洗液两种方法都适用,对于固体样品如粪便宜采用直接裂解的方法。核酸提取后用NanoDrop ND-1000测定,260/280 = 1.8-2.0, 260/230 = 1.8-2.0,电泳检测DNA应是完整的一条带。 测序Sequencing 1)16S/18S测序: Sanger测序: 用于低通量的16S/18S DNA测序,提取宏基因组后,首先经过PCR将16S/18S序列扩增出来,再将其连接到克隆载体上,导

数控铣宏程序实例(DOC)

数控铣宏程序实例(DOC)

数控铣宏程序实例 §4.1 椭圆加工(编程思路:以一小段直线代替曲线)例1:整椭圆轨迹线加工(假定加工深度为2mm) 方法一:已知椭圆的参数方X=acosθ Y=bsinθ变量数学表达式 设定θ= #1(0°~ 360°) 那么 X= #2 = acos[#1] Y= #3= bsin[#1] 程序 O0001; S1000 M03; G90 G54 G00 Z100; G00 Xa Y0; G00 Z3; G01 Z-2 F100; #1=0; N1 #2=a*cos[#1]; #3=b*sin[#1]; G01 X#2 Y#3 F300; #1=#1+1; IF[#1LE360]GOT01; GOO Z50; M30;

例2:斜椭圆且椭心不在原点的轨迹线加工(假设加工深度为2mm) 椭圆心不在原点的参数方程 X=a*COS[#1]+ M Y=b*SIN[#1]+ N 变量数学表达式 设定θ=#1; (0°~360°) 那么X=#2=a*COS[#1]+ M Y=#3=b*SIN[#1]+ N 因为此椭圆绕(M ,N)旋转角度为A 可运用坐标旋转指令G68 格式 G68 X - Y - R - X,Y:旋转中心坐标; R: 旋转角度 程序 O0002; S1000 M03; G90 G54 G00 Z100; GOO Xa+M YN; GOO Z3; G68 XM YN R45; #1=0; N99 #2=a*COS[#1]+M; #3=b*SIN[#1]+N; GO1 X#2 Y#3 F300; G01 Z-2 F100; #1=#1+1; IF[#1LE360]GOTO99; G69 ; GOO Z100; M30;

宏基因组学研究方法及应用概述

宏基因组学研究方法及应用概述彭昌文 (山东省济宁学院生物学系 273155) 颜 梅 (山东省曲阜师范大学生命科学学院 273165) 摘 要 本文简要介绍了宏基因组的概念,概述了其原理及应用。 关键词 宏基因组 宏基因组学 环境基因组学 基因文库的构建 迄今,人们对微生物世界的认识基本都来源于对占细菌总种数不到1%的微生物的单个种群的孤立研究结果。然而微生物是通过其群落而非单一种群来执行在自然界物质与能量循环中的作用的,对微生物群落作为整体的功能认识远远落后于对其个体的认识。这种状况不利于全面认识微生物在自然界所扮演的重要角色。为了获得完整的环境微生物基因表达产物,早在1978年许多学者就提出了直接从环境中提取微生物DNA的思路,1998年,AR I A D phar maceutical公司的科学家Handels man等首次提出宏基因组的概念[1]。宏基因组(the genomes of the total m icrobi ota found in nature)是指生境中全部微生物基因的总和[2]。它包含了可培养的和未培养的微生物的基因总和,微生物主要包括环境样品中的细菌和真菌。而宏基因组学就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系等为研究目的的新的微生物研究方法,也称为微生物环境基因组学、元基因组学或生态基因组学。它主要研究从环境样品获得的基因组中所包含的微生物的遗传组成及其群落功能,为充分认识和开发利用非培养微生物,并从完整的群落水平上认识微生物的活动、最大限度地挖掘微生物资源,提供了可能,已成为国际生命科学技术研究的热点和前沿。 1 宏基因组学的研究方法 宏基因组学的研究过程一般包括从环境样品中提取基因组DNA,克隆DNA到合适的载体,导入宿主菌体,筛选目的转化子等工作,可分为三个步骤。 1.1 宏基因组的提取 在宏基因组筛选过程中,目的基因是整个核苷酸链中的一部分,因此样品前期的富集能够提高筛选命中率。DNA的提取是宏基因文库构建的关键步骤。提取步骤通常需要满足两个条件:既要尽可能提取样品所有微生物的基因,又要保持片段的完整和纯度。目前所开发的DNA提取方法有两种:细胞提取法和直接裂解法。直接裂解法包括物理法(冻融法、超声法、玻璃球珠击打法、液氮碾磨法)、化学法(常用化学试剂有表面活性剂、盐类、有机溶剂等)及酶裂解法。另外,依据提取样品总DNA前是否分离细胞,可以分为原位裂解法和异位裂解法。原位裂解法可以直接破碎样品中的微生物细胞而使DNA 得以释放,由于无需对样品微生物进行复苏,且黏附颗粒上的微生物细胞亦能被裂解,所得DNA能更好地代表样品微生物的多样性。此法操作容易、成本低,DNA 提取率高,但由于机械剪切作用较强,所提取的DNA 片段小(1~50kb),通常适用于构建小片段插入文库(以质粒和λ噬菌体为载体)的DNA提取。异位裂解法则先采用物理方法将微生物从样品中分离出来,然后采用较温和的方法抽提DNA。此法条件温和,可获得大片段DNA(20~500kb),纯度高,但操作繁琐、成本高、得率低,通常适用于构建大片段插入文库(以柯斯质粒或者细菌人工染色体为载体)的DNA提取。1.2 宏基因组文库的构建 宏基因组文库的构建需适宜的克隆载体。通常用于DNA克隆的载体主要包括质粒、黏粒和细菌人工染色体等。质粒一般用于克隆小于10kb的DNA片段,适用于单基因的克隆与表达。黏粒的插入片段可达40kb左右,细菌人工染色体插入片段可达350kb,可用来制备由多基因簇调控的微生物活性物质的完整代谢途径的相关片段文库。1.3 目的基因的筛选 目的基因的筛选方法包括序列分析和功能分析两种。序列分析适用于小片段DNA文库的基因筛选;而功能分析通常适用于大片段DNA文库的筛选。序列分析筛选不依赖于重组基因在外源宿主中的表达,因为所使用的寡聚核苷酸引物是直接通过DNA序列中的保守区域设计的,反映了氨基酸序列的保守性,可获得未知序列的目的基因。该方法对DNA量的要求不高,筛选到新活性物质的可能性较大。序列分析的另一个手段是对宏基因组克隆测序,无论是全部或随机测序都是发现新基因的有效手段。 对于功能分析而言,首先需获得目的克隆,然后通过序列和生化分析对其进行表征。此法能快速鉴定出全新且有开发价值的活性物质,可用于医药、工农业等行业。由于此法检出率较低,工作量较大,且受检测手段的限制,所以常要借助于高通量筛选。 2 宏基因组学的应用 2.1 在生态学方面的应用 当今微生物生态学研究的主要目的之一是将微生物与其所在环境中的代谢过程相联系。应用16s r DNA作为系统发育锚去鉴定属于某种微生物的克隆,然后对基因进行测序,从而获得

新代宏程序实例

新代宏程序实例文件编码(GHTU-UITID-GGBKT-POIU-WUUI-8968)

1、R E P E A T直到型循环REPEAT <循环体> UNTIL <条件表达式> END_REPEAT; 说明:REPEAT直到型循环控制,先执行循环体,后判断条件表达式,当条件满足时退出循环。 例如: % @MACRO ,为了;?倾向于;?关于;?当作; conj.因为,由于;? FOR <循环变量> := <表达式1> TO <表达式2> [ BY <表达式3>] DO <循环体> END_FOR; 说明:FOR循环控制,式中各参数意义如下 循环变量——控制循环次数的变量; 表达式1——循环计数的起始值,可为整数或表达式; 表达式2——循环计数的终止值,可为整数或表达式; 表达式3——循环计数每次的累加值,可为整数或表达式; 循环体——循环每次执行内容; FOR循环执行过程为:先给循环变量赋起始值,然后判断循环变量是否为终止值,当循环变量已为终止值时退出循环,否则执行循环体,再对循环变量加上每次累加值, 4、无条件转移

GOTO转移语句 语法: GOTO n; 说明:无条件地跳到指定的n行号执行,其中n可为整数或表达式。GOTO常和IF语句搭配使用,那就是说当程序检查到某个条件满足时用GOTO语句去进一步处理,但应尽量少用该语句以提高程序可读性。 范例: % @MACRO Z10.; … N100 G01 X30. Z30.; … M02; EXIT循环中断语句 语法:EXIT; 说明:循环中断,跳离循环控制;用在循环控制中,通常EXIT都和IF 语句搭配使用,当某个条件满足后就跳离循环。请参考WHILE范例。

宏基因组学概述

宏基因组学概述 王莹,马伊鸣 (北京交通大学土木建筑工程学院环境1402班) 摘要:随着分子生物学技术的快速发展及其在微生物生态学和环境微生物学研究中的广泛应用,促进了以环境中未培养微生物为研究对象的新兴学科——微生物环境基因组学(又叫宏基因组学、元基因组学,英文名Metagenomics)的产生和快速发展。宏基因组学通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能.在短短几年内,宏基因组学研究已渗透到各个领域,包括海洋、土壤、热液口、热泉、人体口腔及胃肠道等,并在医药、替代能源、环境修复、生物技术,农业、生物防御及伦理学等各方面显示了重要的价值。本文对宏基因组学的主要研究方法、热点内容及发展趋势进行了综述 关键词:宏基因组宏基因组学环境基因组学基因文库的构建 Macro summary of Metagenomics Wang Ying, Ma Yi-Ming (BeijingJiaotongUniversity, Institute of civil engineering,) Key words: Metagenome; Metagenomics; The environmental genomics 宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质(或获得新基因)的新理念和新方法。其主要含义是:对特定环境中全部微生物的总DNA (也称宏基因组,metagenomic)进行克隆,并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质;或者根据rDNA数据库设计引物,通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。 1.起源 宏基因组学这一概念最早是在1998年由威斯康辛大学植物病理学部门的Jo Handelsman等提出的,是源于将来自环境中基因集可以在某种程度上当成一个单个基因组研究分析的想法,而宏的英文是"met a-",具有更高层组织结构和动态变化的含义。后来伯克利分校的研究人员Kevin Chen和Lior Pachter 将宏基因组定义为"应用现代基因组学的技术直接研究自然状态下的微生物的有机群落,而不需要在实验室中分离单一的菌株"的科学。 2 研究对象 宏基因组学(Metagenomics)是将环境中全部微生物的遗传信息看作一个整体自上而下地研究微生 物与自然环境或生物体之间的关系。宏基因组学不仅克服了微生物难以培养的困难, 而且还可以结合生物信息学的方法, 揭示微生物之间、微生物与环境之间相互作用的规律, 大大拓展了微生物学的研究思路与方法, 为从群落结构水平上全面认识微生物的生态特征和功能开辟了新的途径。目前, 微生物宏基因组学已经成为微生物研究的热点和前沿, 广泛应用于气候变化、水处理工程系统、极端环境、人体肠道、石油污染、生物冶金等领域, 取得了一系列引人瞩目的重要成果。 3 研究方法 宏基因组学的研究过程一般包括样品和基因(组)的富集;提取特定环境中的基因组 DNA;构建宏基因组 DNA 文库;筛选目的基因;目的基因活性产物表达(图 1)五个步骤。

宏基因组测序技术检测方法

宏基因组测序技术检测方法

宏基因组测序技术检测标准 简介: 宏基因组测序介绍 宏基因组学是以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,通过现代基因组技术手段包括功能基因的筛选和测序分析,对环境中微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系以及环境之间的关系进行研究的新的微生物研究方法。随着高通量测序技术的发展,为宏基因组学研究提供了新的理想研究方法。高通量测序的方法无需分离环境中各种微生物,也无需构建克隆文库就可以直接对环境中所有微生物进行测序。可以真实客观的反映环境中微生物的多样性、种群结构、进化关系等。目前又可以分为针对16s DNA/18sDNA/ITS测序和针对宏基因组全序列的测序研究。下面就是对这两者的具体介绍。 一、16s DNA/18s DNA/ITS测序 16sDNA是最常用的微生物物种分子鉴定的标签,,通过对样品中16sDNA 测序可以鉴定其中微生物物种的丰度和分布情况。目前,普遍使用Roche 454平台来对环境样品进行16s DNA测序。因为16s DNA序列比较相似,读长短的话,难以进行有效的比对,而454平台的平均读长在400bp左右,可以很好的避免此类问题。 二、宏基因组全测序 在这种测序方式中,我们可以假定一个环境中的所有微生物就是一个整体,然后对其中所有的微生物进行测序。这样我们就可以研究样品中的功能基因以及其在环境中所起的作用而不用关心其来自哪个微生物。可以发现新的基因,可以进行基因的预测,甚至有可能得到某个细菌基因组的全序列。此外,该项测序不单可以针对DNA水平,也可以针对全RNA进行基因表达水平的研究。 样品处理: 宏基因组样品收集主要有口腔,下呼吸道痰液,下呼吸道灌洗液,皮肤和粪便。样品采集遵照样品采集规范(人)所规定的操作来进行。尽量留足备份样品。

EXCEL宏编程实例.doc

Excel 宏编程举例说明 学习宏编程,需要VB基础,如果一点VB基础和面向对象的概念,建议先去补补VB,不然即使自认为学好了也只能拿着高射炮打蚊子! 一)、宏学习 首先需要明确的是,本文不可能教会您关于宏的所有内容。您需要学会利用"录制宏"的方法来学习宏:点击Excel"工具"下拉菜单中"宏"下?quot;录制新宏",此后可象平时一样进行有关操作,待完成后停止录制。然后再点击"工具"下拉菜单中"宏"下"宏"的"编辑"选项即可打开刚才所录制的宏的Visual Basic源程序,并且可以在此时的"帮助"下拉菜单中获得有关的编程帮助。对录制宏进行修改不仅可以学习宏的使用,还能大大简化宏的编写。 二)、基本概念 为了学习Excel中的宏,我们需要先了解以下一些基本概念。 1、工作簿:Workbooks、Workbook、ActiveWorkbook、ThisWorkbook Workbooks集合包含Excel中所有当前打开的Excel工作簿,亦即所有打开的Excel文件;Workbook对应Workbooks中的成员,即其中的Excel文件;ActiveWorkbook代表当前处于活动状态的工作簿,即当前显示的Excel文件;ThisWorkbook代表其中有Visual Basic代码正在运行的工作簿。 在具体使用中可用Workbooks(index)来引用Workbook对象,其中index为工作簿名称或编号;如Workbooks(1)、Workbooks("年度报表.xls")。而编号按照创建或打开工作簿的顺序来确定,第一个打开的工作簿编号为1,第二个打开的工作簿为2……。 2、工作表:Worksheets、Worksheet、ActiveSheet Worksheets集合包含工作簿中所有的工作表,即一个Excel文件中的所有数据表页;而Worksheet则代表其中的一个工作表;ActiveSheet代表当前处于的活动状态工作表,即当前显示的一个工作表。 可用Worksheets(index)来引用Worksheet对象,其中index为工作表名称或索引号;如Worksheets(1)、Worksheets("第一季度数据")。工作表索引号表明该工作表在工作表标签中的位置:第一个(最左边的)工作表的索引号为1,最后一个(最右边的)为Worksheets.Count。需要注意的是:在使用过程中Excel会自动重排工作表索引号,保持按照其在工作表标签中的从左至右排列,工作表的索引号递增。因此,由于可能进行的工作表添加或删除,工作表索引号不一定始终保持不变。3、图表:Chart 、Charts、ChartObject、ChartObjects、ActiveChart Chart代表工作簿中的图表。该图表既可为嵌入式图表(包含在ChartObject中),也可为一个分开的(单独的)图表工作表。 Charts代表指定工作簿或活动工作簿中所有图表工作表的集合,但不包括嵌入式在工作表或对话框编辑表中的图表。使用Charts(index) 可引用单个Chart图表,其中index是该图表工作表的索引号或名称;如Charts(1)、Charts("销售图表")。图表工作表的索引号表示图表工作表在工作簿的工作表标签栏上的位置。Charts(1)是工作簿中第一个(最左边的)图表工作表;Charts(Charts.Count)为最后一个(最右边的)图表工作表。 ChartObject代表工作表中的嵌入式图表,其作用是作为Chart对象的容器。利用ChartObject 可以控制工作表上嵌入式图表的外观和尺寸。 ChartObjects代表指定的图表工作表、对话框编辑表或工作表上所有嵌入式图表的集合。可由ChartObjects(index)引用单个ChartObject,其中index为嵌入式图表的编号或名称。如

数控宏程序实例

第7章宏程序 7.3 宏程序调用 7.3.1 宏程序调用指令(G65) 在主程序中可以用G65调用宏程序。指令格式如下: G65 P L 〈自变量赋值〉; 其中:P指定宏程序号:L为重复调用次数(1—9999);自变量赋值是由地址和数值构成的,用以对宏程序中的局部变量赋值。 例如: 主程序: O7002 ... G65 P7100 L2 A1.0 B2.0 ... M30 宏程序: #3=#1+#2; IF [#3 GT 360] GOTO 9; G00 G91 X#3 N9 M99

7.3.2 自变量赋值 自变量赋值有两种类型。自变量I使用除去G,L,N,O,P以外的其他字母作为地址,自变量II可以使用A,B,C每个字母一次,I,J,K每个字母可使用十次作为地址。表7—3和7—4分别为两种类型自变量赋值的地址和变量号码之间的对应关系: 表7—3 自变量赋值的地址和变量号码之间的对应关系 表7—4 自变量II的地址与变量号码之间的对应关系

上表中的I,J,K的下标只表示顺序,并不写在实际命令中。在G65的程序段中,可以同时使用表4—1及表4—2中的两组自变量赋予值。系统可以根据使用的字母自动判断自变量赋值的类型。 7.4 变量的控制和运算指令 7.4.1 算术运算和逻辑运算 在变量之间,变量和常量之间,可以进行各种运算,常用的见表7—5。

表7—5 算术和逻辑运算 运算的优先顺序如下: 1)函数。 2)乘除,逻辑与。 3)加减,逻辑或,逻辑异或。 可以用[ ]来改变顺序

7.4.2 控制指令 1.无条件转移(GOTO语句) 语句格式为: GOTO n 其中n为顺序号(1—9999),可用变量表示。例如: GOTO 1; GOTO #10; 2. 条件转移(IF 语句) 语句格式为: IF [条件式] GOTO n 条件式成立时,从顺序号为n的程序段开始执行;条件式不成立时,执行下一个程序段。 条件式有以下几类: # j EQ # K # j NE # K # j GT # K # j LT # K # j GE # K # j LE # K 条件式中变量#J或#K可以是常量也可以是表达式,条件式必须用括弧括起来。下面的程序可以得到1到10的和: O7100

宏基因组测序讲解

宏基因组测序讲解

宏基因组测序 目的 研究藻类物种的分类,研究与特定环境与相关的代谢通路,以及通过不同样品的比较研究微生物内部,微生物与环境,与宿主的关系。技术简介 宏基因组( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组) 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,其定义为"the genomes of the total microbiota found in nature" , 即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。而所谓宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组 DNA, 进行高通量测序分析,或克隆DNA到合适的载体,导入宿主菌体,筛选目的转化子等工作。 宏基因组( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组) 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,其定义为"the genomes of the total microbiota found in nature" , 即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。而所谓宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样

数控宏程序实例

数控宏程序实例 第7章宏程序 7.3 宏程序调用 7.3.1 宏程序调用指令(G65) 在主程序中可以用G65调用宏程序。指令格式如下: G65 P L 〈自变量赋值〉; 其中:P指定宏程序号:L为重复调用次数(1—9999);自变量赋值是由地址和数值构成的,用以对宏程序中的局部变量赋值。 例如: 主程序: O7002 ... G65 P7100 L2 A1.0 B2.0 ... M30 宏程序: #3=#1+#2; IF [#3 GT 360] GOTO 9; G00 G91 X#3 N9 M99 7.3.2 自变量赋值 自变量赋值有两种类型。自变量I使用除去G,L,N,O,P以外的其他字母作为地址,自变量II可以使用A,B,C每个字母一次,I,J,K每个字母可使用十

次作为地址。表7—3和7—4分别为两种类型自变量赋值的地址和变量号码之间的对应关系: 表7—3 自变量赋值的地址和变量号码之间的对应关系 地址宏程序中变量地址宏程序中变量 A #1 Q #17 B #2 R #18 C #3 S #19 D #7 T #20 E #8 U #21 F #9 V #22 H #11 W #23 I #4 X #24 J #5 Y #25 K #6 Z #26 M #13 表7—4 自变量II的地址与变量号码之间的对应关系 地址宏程序中变量地址宏程序中变量 A #1 #18 B #2 #19 C #3 #20 #4 #21 #5 #22 #6 #23 #7 #24 #8 #25

#9 #26 #10 #27 #11 #28 #12 #29 #13 #30 #14 #31 #15 #32 #16 #33 #17 上表中的I,J,K的下标只表示顺序,并不写在实际命令中。在G65的程序段中,可以同时使用表4—1及表4—2中的两组自变量赋予值。系统可以根据使用的字母自动判断自变量赋值的类型。 7.4 变量的控制和运算指令 7.4.1 算术运算和逻辑运算 在变量之间,变量和常量之间,可以进行各种运算,常用的见表7—5。 表7—5 算术和逻辑运算 运算格式说明 赋值 #i=#j 加 #i=#j+#k 减 #i=#j-#k 乘 #i=#j*#k 除 #i=#j/#k 正弦 #i=sin[#j] 角度单位为度余弦 #i=cos[#j] 正切 #i=tan[#j]

新代宏程序实例

1、REPEAT直到型循环 REPEAT <循环体> UNTIL <条件表达式> END_REPEAT; 说明:REPEAT直到型循环控制,先执行循环体,后判断条件表达式,当条件满足时退出循环。 例如: % @MACRO // 启动MACRO语法% @MACRO (宏指令开始) #1=-0.2 REPEAT REPEAT(重复) G01Z#1F80; G1X-20.F700; #2=#1-0.2; G1Z#2F80; G1X-53.F700; #1=#1-0.4; UNTIL (#1<-2.6) END_REPEAT; UNTIL(到…为止,在…以前)END(结束,终止)M30; 2、WHILE当型循环 WHILE <条件表达式> DO→<循环体>→END_WHILE; 说明:WHILE当型循环控制,先判断条件表达式,当条件满足时执行循环体,否则退出循环。例如: % @MACRO; #1=-0.2; WHILE (#14>-2.6) DO WHILE(虽然; 在…期间; 与…同时) IF #1<-2.6THEN EXIT; EXIT(退出; 退场; 离开; 去世) END_IF; G01Z#1F80; G1X-20.F700; #2=#1-0.2; G1Z#2F80; G1X-53.F700; #1=#1-0.4; END_WHILE; M30 3、FOR循环 FOR 翻译:p rep.为,为了; 倾向于; 关于; 当作; conj.因为,由于; FOR <循环变量> := <表达式1> TO <表达式2> [ BY <表达式3>] DO <循环体> END_FOR;

(完整word版)宏基因组测序讲解

宏基因组测序 目的 研究藻类物种的分类,研究与特定环境与相关的代谢通路,以及通过不同样品的比较研究微生物内部,微生物与环境,与宿主的关系。技术简介 宏基因组( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组) 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,其定义为"the genomes of the total microbiota found in nature" , 即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。而所谓宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组 DNA, 进行高通量测序分析,或克隆DNA到合适的载体,导入宿主菌体,筛选目的转化子等工作。 宏基因组( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组) 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,其定义为"the genomes of the total microbiota found in nature" , 即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。而所谓宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究

EXCEL宏编程简明教程(有实例),

Excel 宏编程简明教程 一)、宏学习 首先需要明确的是,本文不可能教会您关于宏的所有内容。您需要学会利用"录制宏"的方法来学习宏:点击Excel"工具"下拉菜单中"宏"下?quot;录制新宏",此后可象平时一样进行有关操作,待完成后停止录制。然后再点击"工具"下拉菜单中"宏"下"宏"的"编辑"选项即可打开刚才所录制的宏的Visual Basic源程序,并且可以在此时的"帮助"下拉菜单中获得有关的编程帮助。对录制宏进行修改不仅可以学习宏的使用,还能大大简化宏的编写。 二)、基本概念 为了学习Excel中的宏,我们需要先了解以下一些基本概念。 1、工作簿:Workbooks、Workbook、ActiveWorkbook、ThisWorkbook Workbooks集合包含Excel中所有当前打开的Excel工作簿,亦即所有打开的Excel文件;Workbook对应Workbooks中的成员,即其中的Excel文件;ActiveWorkbook代表当前处于活动状态的工作簿,即当前显示的Excel文件;ThisWorkbook代表其中有Visual Basic代码正在运行的工作簿。 在具体使用中可用Workbooks(index)来引用Workbook对象,其中index为工作簿名称或编号;如Workbooks(1)、Workbooks("年度报表.xls")。而编号按照创建或打开工作簿的顺序来确定,第一个打开的工作簿编号为1,第二个打开的工作簿为2……。 2、工作表:Worksheets、Worksheet、ActiveSheet Worksheets集合包含工作簿中所有的工作表,即一个Excel文件中的所有数据表页;而Worksheet则代表其中的一个工作表;ActiveSheet代表当前处于的活动状态工作表,即当前显示的一个工作表。 可用Worksheets(index)来引用Worksheet对象,其中index为工作表名称或索引号;如Worksheets(1)、Worksheets("第一季度数据")。工作表索引号表明该工作表在工作表标签中的位置:第一个(最左边的)工作表的索引号为1,最后一个(最右边的)为Worksheets.Count。需要注意的是:在使用过程中Excel 会自动重排工作表索引号,保持按照其在工作表标签中的从左至右排列,工作表的索引号递增。因此,由于可能进行的工作表添加或删除,工作表索引号不一定始终保持不变。 3、图表:Chart 、Charts、ChartObject、ChartObjects、ActiveChart Chart代表工作簿中的图表。该图表既可为嵌入式图表(包含在ChartObject 中),也可为一个分开的(单独的)图表工作表。 Charts代表指定工作簿或活动工作簿中所有图表工作表的集合,但不包括嵌入式在工作表或对话框编辑表中的图表。使用Charts(index) 可引用单个Chart图表,其中index是该图表工作表的索引号或名称;如Charts(1)、Charts("销售图表")。图表工作表的索引号表示图表工作表在工作簿的工作表标签栏上的位置。Charts(1)是工作簿中第一个(最左边的)图表工作表; Charts(Charts.Count)为最后一个(最右边的)图表工作表。 ChartObject代表工作表中的嵌入式图表,其作用是作为Chart对象的容器。

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