DNA抽提

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实验一-DNA提取

实验一-DNA提取

实验一-DNA提取实验一DNA的小量制备小量法提取植物基因组DNA(CTAB法)1 实验目的:随着基因工程等分子生物学技术的迅速发展及广泛应用,人们经常需要提取高分子量的植物DNA,用于构建基因文库、基因组southern 分析、酶切及克隆等,这是研究基因结构和功能的重要步骤。

本实验目的是学习从植物材料中提取和测定DNA 的原理并掌握CTAB 提取DNA 的方法,进一步了解DNA 的性质。

2 实验原理细胞中的DNA 绝大多数以DNA-蛋白复合物(DNP)的形式存在于细胞核内。

提取DNA 时,一般先破碎细胞释放出DNP,再用含少量异戊醇的氯仿除去蛋白质,最后用乙醇把DNA 从抽提液中沉淀出来。

DNP 与核糖核蛋白(RNP)在不同浓度的电解质溶液中溶解度差别很大,利用这一特性可将二者分离。

以NaCl 溶液为例:RNP 在0.14mol/L NaCl中溶解度很大,而DNP 在其中的溶解度仅为纯水中的1%。

当NaCl 浓度逐渐增大时,RNP的溶解度变化不大,而DNP 的溶解则随之不断增加。

当NaCl 浓度大于1mol/L 时,DNP的溶解度最大,为纯水中溶解度的2 倍,因此通常可用1.4mol/L NaCl 提取DNA。

为了得到纯的DNA 制品,可用适量的RNase 处理提取液,以降解DNA 中搀杂的RNA。

关于植物总DNA 的提取主要有两种方法:1.CTAB 法:CTAB(十六烷基三甲基溴化铵,hexadecyltrimethylammonium bromide, 简称CTAB):是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可溶的,当降低溶液盐的浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB 与核酸的复合物同蛋白、多糖类物质分开,然后将CTAB 与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液中,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB 能溶解于乙醇中。

DNA抽提和质粒DNA制备

DNA抽提和质粒DNA制备
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琼脂水解酶:将含DNA的凝胶进行消化, 琼脂糖水解成二糖,释放DNA,后使用 酚抽提方法回收DNA
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问题
从细胞或组织中分离DNA时,常用蔗糖, 目的是( ) A 抑制核酸酶
• B 保护DNA,防止断裂 C 加速蛋白质变性 D 有利于细胞破碎
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用SDS-酚抽提DNA时,SDS浓度十分重要, 当SDS浓度为0.1%时,( )
1.菌株类型 2.质粒的大小 3.细菌染色体DNA变性条件强弱的控制 4.细菌的培养与收集
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(四)碱裂解法原理:
在 pHl2.0-12.6 碱 性 环 境 中 , 线 性 的大分子量细菌染色体DNA变性, 而共价闭环(CC)质粒DNA仍为自然 状态。
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将pH调至中性并有高盐浓度存在的条件 下,染色体DNA之间交联形成不溶性网 状结构。大部分DNA和蛋白质在去污剂 SDS的作用下形成沉淀,而CC质粒DNA 仍然为可溶状态。
上,然后用带钩或U型玻璃棒在界面轻搅, DAN沉淀液绕于玻棒。生成DNA约 80kb。
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• 4 异丙醇沉淀法:基本同1法,仅用二倍 容积异丙醇替代乙醇,可去除小分子 RNA(在异丙醇中可溶状态)。
• 5 表面活性剂快速制备法:用Triton X-100或 NP40表面活性剂破碎细胞,然后用蛋白酶K 或酚去除蛋白,乙醇沉淀或透析。
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DNA回收
主要是从电泳中分离回收DNA片段。 回收原则:尽量提高回收率
去除回收DNA样品中的污染物
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电泳到DEAE-纤维素膜 : DEAE是一种阴离子交换纤维素,可以吸 附带有负电荷的DNA分子。
在所需条带前插入DEAT-纤维素膜,继续电泳 至条带DNA都到膜上,取出洗下。 500bp-5kb的DNA片段回收率较好,纯度高。 但不适用于分子量超过10kb和单链DNA。

DNA的提取的原理和方法

DNA的提取的原理和方法

DNA的提取的原理和方法DNA的提取的原理和方法一、实验原理DNA是生物体遗传信息的主要载体,它是一种长链的生物高分子,由四种碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤、胞嘧啶)按照特定的顺序排列组成。

DNA主要存在于细胞的细胞核中,也有一些存在于线粒体和叶绿体中。

DNA提取的原理主要是利用不同物质在特定溶剂中的溶解度不同,通过控制溶剂的种类和条件,将DNA从细胞中分离出来。

在DNA提取过程中,通常需要使用一些化学物质,如苯酚、氯仿等,来破坏细胞膜和核膜,使DNA释放出来。

同时,还需要使用蛋白酶等酶类物质来消化蛋白质,以便更好地分离DNA。

二、实验方法1.材料准备提取DNA的材料可以是动物组织、植物组织、微生物等。

不同的材料需要采用不同的处理方法,以最大限度地获得高质量的DNA。

例如,对于植物组织,可以使用液氮研磨法或CTAB法等方法进行提取。

2.细胞裂解细胞裂解是DNA提取的关键步骤之一,目的是破坏细胞膜和核膜,使DNA释放出来。

常用的裂解方法有机械法、化学法和酶法。

机械法包括研磨、超声波等;化学法使用化学物质如苯酚、氯仿等;酶法使用蛋白酶等酶类物质来消化蛋白质。

3.蛋白质去除在细胞裂解后,蛋白质也会随着DNA一起释放出来。

为了获得纯净的DNA,需要去除蛋白质。

常用的去除蛋白质的方法有苯酚/氯仿抽提法和盐析法。

苯酚/氯仿抽提法利用苯酚和氯仿的特性,将蛋白质和DNA分离开来;盐析法则是利用高浓度的盐溶液使蛋白质沉淀,而DNA则溶解在上清液中。

4.DNA沉淀去除蛋白质后,需要通过一定的方法将DNA沉淀下来。

常用的沉淀方法有乙醇沉淀法和盐析法。

乙醇沉淀法利用乙醇能够使DNA沉淀的特性,将DNA从溶液中分离出来;盐析法则是利用高浓度的盐溶液使DNA沉淀,然后通过离心等方法将DNA 收集起来。

5.DNA洗涤和溶解DNA沉淀后,需要用70%乙醇洗涤数次以去除杂质,然后用适量的TE缓冲液或去离子水溶解DNA。

TE缓冲液是一种常用的维持DNA稳定的缓冲溶液,含有Tris-HCl和EDTA二钠等成分。

提取dna的实验步骤原理

提取dna的实验步骤原理

提取dna的实验步骤原理DNA提取是一项重要的实验技术,用于从细胞中分离纯净的DNA。

它在生物学、医学、犯罪学等领域具有广泛的应用。

DNA提取的过程可以分为以下几个步骤:样品收集、细胞破碎、蛋白质消化、DNA分离、洗涤、溶解和纯化。

首先,样品收集是DNA提取的第一步。

样品可以来自不同的来源,如血液、唾液、组织样本等。

对于血液样品,静脉采血是最常见的方式。

收集的血液样品需要采用抗凝剂进行预处理,以防止凝血。

细胞破碎是DNA提取的关键步骤之一。

细胞破碎的目的是将细胞膜以及核膜破坏,释放细胞内的DNA。

常用的细胞破碎方法有物理破碎、化学破碎和酶解法。

物理破碎一般采用高速离心仪或超声波处理,通过机械力量破坏细胞结构。

化学破碎使用适当的溶液,如细胞裂解液(例如EDTA、SDS、蛋白酶K等)来分解膜脂质和蛋白质。

酶解法则通过酶的作用来降解膜和核酸。

蛋白质消化是为了去除提取过程中的蛋白质杂质。

蛋白质会干扰DNA的纯化和测定。

在蛋白质消化过程中,常用的方法是加入蛋白酶K或肾脏酸性蛋白酶等蛋白水解酶,通过其酶解作用将蛋白质降解。

DNA分离是将DNA与其他细胞组分分离的过程。

DNA在细胞破碎后呈现为线性或环状的形态。

为了分离DNA,一般采用盐溶液和有机溶剂共同作用的方案,如添加高浓度的盐类(如NaCl)和异丙醇。

这些溶剂会沉淀细胞残渣和蛋白质,而DNA则溶于水相中。

洗涤过程是为了去除残留的蛋白质和盐类。

洗涤液一般为酒精溶液,如酒精和醋酸盐。

洗涤时,将沉淀的DNA加入洗涤液中,通过离心使DNA沉淀,然后去除上清液。

此过程重复一至三次可以有效去除杂质。

溶解是将沉淀的DNA重新溶解于缓冲液中,以便于后续的操作。

溶解液可以是Tris-EDTA缓冲液、无菌纯水等。

在加入缓冲液后,将溶液置于水浴中进行搅拌和温度控制,使DNA彻底溶解。

纯化是最后一步,目的是去除DNA提取过程中的杂质,获得纯净的DNA。

常见的纯化方法有酚-氯仿抽提法和硅胶纯化法。

DNA提取

DNA提取

组织样DNA的提取方法:1.取黄豆大小组织样,用70%酒精棉球擦干净,尽量剪碎,置于2 ml离心管中。

(剪刀、镊子每次都擦干净)2.每管中加裂解液800ul,蛋白酶K 30ul。

3.55℃水裕14-20小时至管中无组织块为止(加封口膜防水)4.每管加等体积(800ul)饱和酚,摇匀器上摇出10-15分钟,10000转4℃离心10-15分钟5.取上清,置于另一管中,加500ul饱和酚,500ul氯仿(氯仿:异戊醇=24:1),混摇10-15分钟,10000转4℃离心10-15分钟6.取上清置于另一管中,加800ul氯仿,混摇10-15分钟,10000转4℃离心10-15分钟7.取上清,加800ul无水乙醇,室温混摇15-20分钟,10000转4℃离心7-8分钟8.倒掉管中液体(小心DNA 团块),再用70%乙醇轻洗,吸干乙醇,通风橱内风干加灭菌水溶解,4℃放置几个小时重要仪器、设备和试剂●UV-754型紫外线分光广度计●PCR扩增仪●DYYⅢ-12型电脑恒功率多功能电泳仪●TGL-16G高速台式离心机●DF110电子天平●HY-1型自动旋转式混匀仪●H-1微型混合器●蛋白酶K:MERCK公司产品●三羟基氨基甲烷(Tris)●十二烷基磺酸钠(SDS)●Tris饱和酚●琼脂糖●丙稀酰胺●N,N’-亚甲基双丙烯酰胺●TaqDNA聚合酶●4dNTP●PBR332 DNA/MSPI Markers: 华美生物工程公司●微卫星引物溶液配制(1) 10%十二烷基硫酸钠SDSSDS 10g溶于100 mL双蒸水中,30℃以上贮存。

(2) 组织样裂解液Tris.Cl(pH=8.0)50mM乙二胺四乙酸二钠(EDTA)100mM氯化钠(NaCl)100mMSDS 0.5%(3) 蛋白酶K:20mg/mL贮存液,-20℃保存(4) 1M Tris·Cl(pH 8.0,高压灭菌,NaOH调pH值)Tris 12.11g浓HCl 4.2ml加双蒸水定容至100ml(5) 0.5M EDTA(pH 8.0,高压灭菌,NaOH调pH值)EDTA 18.61g;加双蒸水定容至100ml(6) 1M NaCl(分装高压灭菌)NaCl0.5g;加双蒸水定容至50ml(7) 氯仿:异戊醇(24:1)氯仿480ml+异戊醇20ml(8) TE缓冲液(pH8.0)1M Tris.Cl 1 mL (Tris: 12.11g)0.5M EDTA 0.2 mL(EDTA: 18.61g)加蒸馏水定容至100ml(1) 10%SDS: SDS 10.0g溶于双蒸水中。

各种DNA提取方法

各种DNA提取方法

各种DNA提取方法提取方法提取方法提取方法一,基因组DNA提取方法制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。

在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。

主要是CTAB方法,其他的方法还有1物理方式:玻璃珠法超声波法研磨法冻融法。

2化学方式:异硫氰酸胍法碱裂解法3生物方式:酶法。

根据核酸分离纯化方式的不同有:硅质材料、阴离子交换树脂等试验步骤:1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。

2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次,离心收集。

试验步骤2再重新作一边。

3、加入5mlDNA提取缓冲液,(10mmol/%SDS)混匀。

4、加入25ul 蛋白酶K使终浓度达到100ug/ml 混匀,50℃水浴3h 5、用等体积的酚抽提一次,2500rpm离心收集水相,用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min离心收集水相6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。

加入等体积的5mol/L的LiCL混匀,冰浴,10min.。

7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。

加入等体积的异丙醇。

室温10min。

2500rpm离心10min。

弃上清。

8、加入倍体积3mol/L乙酸钠与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。

-20℃20min。

9、12000r/min室温离心5min。

弃上清。

将DNA 溶于适量TE中。

二,外周血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法:试验步骤:1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm 离心10min。

2、小心吸取上层血浆,分装到3个离心管中。

3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。

4、2500rpm离心10min,弃上清。

5、加入10ml 溶血液,摇匀,冰浴15min。

6、3000rpm离心10min,弃上清。

7、倒置离心管,去掉残液。

8、得白细胞,-80℃冻存。

酚氯仿抽提dna原理

酚氯仿抽提dna原理

酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿(Phenol-Chloroform)抽提DNA是一种常用的DNA 提取方法。

其原理是基于酚在酸性条件下具有与DNA高度亲和性的特点,可以将DNA从细胞溶液中抽提出来。

具体的步骤如下:
1. 细胞溶解:首先将待提取DNA的细胞样品加入适量的细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法使细胞壁破裂,释放出细胞内的DNA。

2. 酚抽提:加入相同体积的酚溶液,并进行充分混合。

酚能与DNA形成复合物,并与其他细胞组分(如蛋白质和脂质)发生分层,形成一个DNA上层和一个下层。

3. 脱水:将抽提产物转移至新管中,加入酒精或异丙醇,通过离心将DNA沉淀下来。

脱水过程可以去除溶液中的多余酚,提高DNA沉淀的纯度。

4. 酯化:将DNA沉淀物溶解在适量的TE缓冲液(含有EDTA和Tris)中,经过一定的时间酯化,使DNA变得更为稳定。

5. 沉淀:通过低温离心将DNA沉淀下来,去除上清液。

6. 洗涤:用70%的乙醇洗涤并去除残余的盐、酚和脏物质。

洗涤过程中,可以多次进行离心和上清液倒掉操作。

7. 干燥:最后,将DNA输送液置于干燥器中或者自然风干,以去除溶剂中的残留物质,得到纯度较高的DNA。

通过酚氯仿抽提DNA的方法,可以从复杂的细胞中提取出高质量、高纯度的DNA,以供后续分子生物学研究使用。

基因组DNA抽提操作流程

基因组DNA抽提操作流程

基因组DNA抽提操作流程1.样本选择:选择适合抽提基因组DNA的样本类型,如细胞、组织或血液。

确保样本保存在合适的条件下,以保持DNA的完整性。

2.细胞破碎:对于细胞样本,首先需要将细胞破碎以释放DNA。

可以使用物理方法,如机械剪切或超声波处理,或者使用化学方法,如洗涤溶解和细胞裂解酶处理。

3.DNA溶解:将细胞裂解提取物加入DNA溶解缓冲液中,以彻底溶解DNA。

通常,添加蛋白酶K来去除蛋白质的干扰,增加DNA产量。

4.蛋白质去除:使用蛋白酶K等酶来去除样品中的蛋白质。

酶处理后,样品经过酚/氯仿萃取,即加入等体积的酚/氯仿混合物混合,离心分离水相和有机相。

DNA会在水相中,而蛋白质会在有机相中。

5.DNA沉淀:将水相中的DNA通过加入盐和冷乙醇来沉淀下来。

经过高速离心后,形成DNA沉淀,此时可以看到白色的DNA沉淀,即可将上清去掉。

6.DNA洗涤:将DNA沉淀用70%乙醇洗涤,去除盐、蛋白质和杂质。

洗涤过程中,可以使用离心将DNA沉淀到底,倒掉上清,重复洗涤2-3次。

7. DNA溶解:将洗涤后的DNA沉淀用TE缓冲液(含EDTA和Tris-HCl)等来溶解,使其在后续的分析和储存中稳定。

此时可以使用紫外可见光谱仪检测DNA的浓度和纯度。

8.DNA质量检测:可以通过琼脂糖凝胶电泳、分光光度计或荧光检测等方法对提取的DNA进行质量检测。

目的是确定DNA的完整性、浓度和纯度。

注意事项:-操作中严格遵守无菌操作,以防止DNA污染。

-样本处理前最好进行冰浴,以保持DNA稳定。

-减少DNA的损伤和降解,所有的操作和试剂都必须在冷冻或低温环境下进行。

- 防止RNase的污染,因为RNase会降解RNA,进而影响DNA的测定。

-严格按照实验操作要求进行步骤,以确保DNA提取的高纯度和高质量。

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实验操作(1):
鼠肝匀浆液 塑离 1/3匀浆液 匀浆液 白色絮状沉淀 +2.5V冰ETOH; 冰 ; 0.1MNaCl 颠倒混匀
+
20%SDS 25ul; ; EDTA 30ul; ; PK 20ul 50℃ ℃ 塑离 30min
&匀
+等体积酚:氯仿 等体积酚 等体积
保证高分子量DNA的完整性 的完整性 保证高分子量
影响因素: 影响因素: 物理因素:机械剪切力--牵拉DNA损伤, --牵拉DNA损伤 物理因素:机械剪切力--牵拉DNA损伤,对化学键破 DNA断裂 坏,DNA断裂 化学因素:过酸过碱----DNA变性 化学因素:过酸过碱----DNA变性 ----DNA 生物因素:DNA酶-------DNA DNA降解 生物因素:DNA酶-------DNA降解 操作注意事项: 操作注意事项: 物理因素:避免机械剪切力--钝口滴管, --钝口滴管 物理因素:避免机械剪切力--钝口滴管,动作轻柔 化学因素:防止过酸过碱----保证温和条件pH4 ----保证温和条件pH4~ 化学因素:防止过酸过碱----保证温和条件pH4~10 pH8.0) (pH8.0) 生物因素:抑制DNA -------低温 使用EDTA DNA酶 低温、 生物因素:抑制DNA酶-------低温、使用EDTA
四. DNA提取
酚抽提法 先用蛋白酶K SDS破碎细胞 消化蛋白, 破碎细胞, 先用蛋白酶K、SDS破碎细胞,消化蛋白, 然后用酚和酚-氯仿抽提, 然后用酚和酚-氯仿抽提,最后乙醇沉淀 DNA大小为100- 大小为100 获DNA大小为100-150kb
五、DNA的浓缩
乙醇沉淀: 乙醇沉淀:
(1)需要阳离子盐的存在 NaCl对含SDS样品好 对含SDS NaCl对含SDS样品好 (2)沉淀温度与时间 0℃,10-15分钟 0℃,10-15分钟 (3)离心 小于100bp DNA需超速离心 小于100bp DNA需超速离心: 4℃,12000g,10分钟 0-4℃,12000g,10分钟
二. 提取DNA的总原则:
1、保证核酸一级结构的完整性; 保证核酸一级结构的完整性; 2、排除其它分子的污染
a.样品不纯,失去抑制酶作用 样品不纯, 样品不纯 有机溶剂、高浓度的金属离子) (有机溶剂、高浓度的金属离子) b.蛋白质 糖/脂的污染降到最低 蛋白质/糖 脂的污染降到最低 蛋白质 c.DNA中无 中无RNA 中无
短期贮存: 1. 短期贮存: 4℃或 20℃存放于TE(tris和EDTA,pH8) 存放于TE 4℃或-20℃存放于TE(tris和EDTA,pH8) 缓冲液中 2. 长期贮存: 长期贮存: 70%乙醇,或在DNA溶液中加一滴氯仿, DNA溶液中加一滴氯仿 在70%乙醇,或在DNA溶液中加一滴氯仿, 70℃保存 -70℃保存
DNA浓度(μg/ml) DNA浓度(μg/ml) 浓度 1/光径 = A260nm ×50 ×稀释倍数 ×1/光径
DNA的吸收 DNA的吸收 峰在260nm 峰在260nm OD相当于 相当于: 1 OD相当于: 50 μg/ml DNA 40 μg/ml RNA 20 μg/ml 寡核苷酸
八. DNA的贮存
六. DNA的鉴定
分光光度法
在260nm和280nm处测定DNA溶液的光吸收, 260nm和280nm处测定DNA溶液的光吸收, 处测定DNA溶液的光吸收 之比应在1.75 1.75- A260与A280之比应在1.75-1.80 低于此值表明制备物中留有蛋白质成份或酚 高于此值表明有RNA RNA的残留量 高于此值表明有RNA的残留量
DNA纯度鉴定: DNA纯度鉴定: 纯度鉴定
A260/A280 ≈ 1.8 《 1.8 》 1.8 纯 酚或蛋白质污染 RNA污染 RNA污染
七. DNA的定量
分光光度法: 分光光度法:
测定DNA在 的光吸收, 测定DNA在A260nm的光吸收,计算浓度 DNA A260×稀释倍数×50= 稀释倍数×50= µg/ml (双链DNA) (双链DNA) 双链
+70% ETOH洗 洗
10000rpm,5min ,
轻缓混匀 10000rpm,5min , 沉淀+1mlTE溶解 溶解 沉淀 水相 37℃ ℃ 水相 刻离 +RNase20ul 30min 刻离 +2.5V冰ETOH; 冰 ; 0.1MNaCl
白色絮状沉淀
Precipitated DNA molecules appear as long pieces of fluffy, stringy, web-like strands.
保证高分子量DNA的纯度 的纯度 保证高分子量
使用方法:SDSK使用方法:SDS-Proteinase K-EDTA SDS:十二烷基磺酸纳(硫酸纳)------离子型表面活性剂 (1)SDS:十二烷基磺酸纳(硫酸纳)------离子型表面活性剂 主要功能:1.溶解细胞膜上的脂质与蛋白质 溶解细胞膜上的脂质与蛋白质, 主要功能:1.溶解细胞膜上的脂质与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏 细胞膜 2.解聚细胞中的核蛋白 将组氨酸从组蛋白上拆下来, 解聚细胞中的核蛋白: 2.解聚细胞中的核蛋白:将组氨酸从组蛋白上拆下来,打 开二硫键 3.SDS能与蛋白质结合成为 能与蛋白质结合成为R SO3----R+-Pro的复合物 ----R+ 的复合物, 3.SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3----R+-Pro的复合物, 是蛋白质并行而沉淀下来 4.SDS能抑制RNase的作用 在以后的提取过程中, 能抑制RNase的作用, 4.SDS能抑制RNase的作用,在以后的提取过程中,必须把 他去除干净 蛋白酶K (2)蛋白酶K: 主要功能:1.蛋白水解酶活性----广谱蛋白酶 蛋白水解酶活性----广谱蛋白酶, SDS、EDTA存在下保 主要功能:1.蛋白水解酶活性----广谱蛋白酶,在SDS、EDTA存在下保 持很高的活性 2.将蛋白质降解成肽或小片段的氨基酸 2.将蛋白质降解成肽或小片段的氨基酸 EDTA: (3)EDTA:乙二胺四乙酸 主要功能:金属离子的弱螯合剂,抑制DNase DNase的活性 主要功能:金属离子的弱螯合剂,抑制DNase的活性
操作注意事项
1.为尽可能避免DNA大分子的断裂,在实验过程中必须: (1) 匀浆时应保持低温 冰浴中 匀浆时应保持低温(冰浴中 冰浴中),匀浆时间应短(30s/次,2次 ,勿用玻璃匀浆器 (2) 实验中使用的吸取DNA水溶液的滴管管口需粗而短,并烧成 钝口 (3) 苯酚 苯酚-氯仿抽提时勿剧烈振摇 勿剧烈振摇 2.保持DNA活性,避免酸、碱或其它变性因素使DNA变性 3.苯酚 苯酚是一种强烈的蛋白变性剂。实验时,应戴手套操作 应戴手套操作,避 苯酚 应戴手套操作 免碰到皮肤,以免灼伤。苯酚蒸汽毒性较大,实验中应注 意将盛苯酚的试剂瓶盖好 苯酚的试剂瓶盖好(防氧化-8-羟喹啉) 苯酚的试剂瓶盖好 4.移液枪的使用
第一章 基因组DNA分析 基因组DNA DNA分析
实验一 高分子量DNA的提取和纯化 高分子量DNA DNA的提取和纯化
一、原理
DNA是染色体的组成成分,遗传的物质基础 研究遗传、疾病发生的基础 研究的前提:DNA的提取
1、破细胞----SDS破坏细胞壁 、破细胞 破坏细胞壁 2、去蛋白 苯酚(蛋白变性剂) 苯酚( 、去蛋白----苯酚 蛋白变性剂) 3、除RNA----RNAase 、
原理: 原理: 用蛋白酶K SDS在EDTA存在的条件下 存在的条件下, 用蛋白酶K及SDS在EDTA存在的条件下, 裂解细胞、消化蛋白质,使核蛋白解聚、 裂解细胞、消化蛋白质,使核蛋白解聚、细 胞内存在的DNA酶失活, DNA酶失活 胞内存在的DNA酶失活,酚-氯仿有机溶剂多 次抽提以后, 次抽提以后,用透析或乙醇沉淀得到纯化的 DNA
实验操作(2):
白色絮状沉淀
+70% ETOH洗 洗 余原液 沉淀加0.3-0.5ml 沉淀加 TE溶解 溶解 比色定量 PCR
稀释成3ml(1:30), ),OD260/OD280比色 取100ul稀释成 稀释成 ( : ), 比色
定性、 定性、定量
三. DNA样品准备
生物组织: 生物组织:
最好新鲜组织,若不能马上提取, 最好新鲜组织,若不能马上提取,应贮存 -70℃或液氮 ℃ 液氮冷冻敲碎研磨 组织匀浆法 液氮匀浆法
1. 二取一 DNA抽提注意事项 抽提注意事项( 物及生) DNA抽提注意事项(化、物及生) blot的流程 Southern blot的流程 2. 五取二 核酸探针 分子杂交 限制性内切酶 预杂交 随机引物标记
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