最新Scifinder检索方法
scifinder介绍及使用教程
Scifinder 的功能和特点
检索功能
Scifinder 支持关键词、化合 物结构、反应式等多种检索 方式，方便用户快速找到所 需信息。
结构绘图
Scifinder 内置了强大的化学 结构绘图功能，用户可以方 便地绘制和修改化学结构。
数据筛选
Scifinder 支持对检索结果进 行筛选，用户可以根据需要 选择符合特定条件的文献和 数据。
如何正确使用相似结构检索功能
总结词
理解相似结构的概念
详细描述
相似结构检索是指通过输入一个化学结构或分子式，在 Scifinder 中查找与之相似的其他分子或化合物。在使用 此功能之前，需要先了解相似结构的定义和判断标准。
总结词
选择合适的相似度阈值
详细描述
在相似结构检索中，需要选择一个合适的相似度阈值来限 定相似度的范围。不同的阈值会导致不同的检索结果，用 户可以根据实际需求选择合适的阈值。
总结词
结合其他检索条件使用
详细描述
在使用相似结构检索功能时，可以结合其他检索条件如关 键词、分子属性等进行综合检索，以获得更精确的结果。
THANKS
03
还可以设置Scifinder的个性化推送和提醒功能，以便更好 地使用Scifinder。
03 Scifinder 检索功能
基本检索
简单易用
Scifinder的基本检索功能为用户提供了一个简单易用的界面，用户只需输入关键词，即可快速检索到相关的科研文献、专利 和化学物质信息。
高级检索
高级筛选
如何解决检索结果为空的问题
总结词
无效的检索条件
详细描述
当检索结果为空时，可能是由于输入的检索条件无效或过 于宽泛所致。请检查检索条件是否正确，并尝试缩小检索 范围或使用更具体的关键词进行检索。
SciFinder
SciFinder数据库
SciFinder介绍----背景
由CAS(化学文摘社)自主开发研究的一站式的信息检索平台。
可以检索有关生物化学，化学工程，应用化学，普通化学，
物理化学，食品科学，医药等化学相关学科的信息。������
从中可以检索来自专利，期刊的文献。
������ 最大的二次文献数据库。
CASREACT® 是检索化学反应最权威的来源
CASREACT是世界上最大的，更新速 度最快的反应数据库 CASREACT 能非常快速、精确、全面 的回答您的化学反应问题
16
CHEMCATS（化学物质供应商）
收录从 1995 年至今的化学品的来源信
息。信息来自900 多家商业化学物质供应商
的 1,000 多本化学物质目录。包括化学品
������
全球最大的物质数据库。
SciFinder数据库
1.概述
2.SciFinder数据库检索
1.概述
1） SciFinder数据库简介 2） SciFinder数据库内容
SciFinder简介
SciFinder 是美国化学文摘（Chemical Abstracts,CA)
的网络版, 它整合了Medline医学数据库、欧洲和美国等50几
用户名： 必须是唯一的，且包含 5-15 个字符。它可以只包含字母或字母组合、数字 和/或以下特殊字符： -（破折号） _（下划线)
. （句点）
密码：
@（表示“at”的符号）
必须包含 7-15 个字符，并且至少包含三个以下字符：
字母
数字
SciFinder使用指南(图示讲解)
SCIFinder提供了丰富的可视化工具，如化学结构绘图和3D分子模 型，帮助用户更好地理解化学结构和分子间的相互作用。
02
SCIFinder基本操作
登录与注册
01
打开SCIFinder软件或网页界面。
02 点击“注册”按钮，填写个人信息并设置密码， 完成注册。
03 已注册用户可直接输入用户名和密码进行登录。
合物名称检索中，用户可以选择精确匹配，输入完整的化合物名称以获取精确结果。
化学性质分析
总结词
对检索得到的化合物进行化学性质分析，包括物 理性质、化学性质和光谱数据等。
总结词
支持自定义属性筛选，用户可以根据需要选择特 定的属性进行分析。
详细描述
SCIFinder可以对检索得到的化合物进行全面的化 学性质分析，提供各种物理性质、化学性质和光 谱数据，帮助用户深入了解化合物的性质。
化合物属性分析
SCIFinder提供了一系列化合物属 性，如分子量、熔点、沸点等， 帮助用户了解化合物的物理性质。
SCIFinder的特点
权威数据来源
SCIFinder的数据库来源于权威的学术和工业界数据，确保数据的 准确性和可靠性。
高级搜索功能
SCIFinder提供了多种搜索选项和过滤器，使用户能够精确地找到 所需信息。
04
SCIFinder图示讲解
检索流程图示讲解
总结词
详细展示SCIFinder的检索流程，包括关键词输入、检索选项选择、检索结果展示等步 骤。
详细描述
SCIFinder的检索流程非常直观，用户可以通过关键词输入框输入化学物质名称、分子 式、结构等关键词进行检索。同时，用户还可以通过选择不同的检索选项，如化合物类 型、来源等，进一步缩小检索范围。检索结果会以列表形式展示，包括化合物的名称、
SCIfinder 引文查找教程
Markush检索——初步的专利评估
• 字母 • 混合的大小写字母 • 数字 • 非字母数字的字符（例如 @、#、%、&、*）
14
使用这个链接登陆SciFinder
15
SciFinder登陆界面
输入SciFinder帐号 和密码
16
问题？选题：现 有的研究条件、 背景、能力。。
实验：实验方法， 活性评价方法。。。。
• SciFinder 特色功能 • SciFinder网络资源平台
3
美国化学文摘社—Chemical Abstract Service •创建于1907年 •ACS的分支机构 •密切关注，索引和提炼着全球化学相关的文献和专利 •最早创立了《化学文摘》 •总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市
4
SciFinder中的内容
亚结构检索： 所画的结构必须存在，母体结构不能修改，但可以被修饰
相似结构检索： 获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以被修饰，用 相似度来控制获得的结果
57
化学结构检索
Exact 精确结构检索 Substructure 亚结构检索
无检索记录，意味着我们设计的化合物就是新结构
用大学后缀名的邮箱注册
开始创建SciFinder帐号
12
每个用户必须输入各自信息
13
设置用户名及密码注意事项
用户名：必须是唯一的，且包含 5-15 个字符。它可以只包含字母或字
母组合、数字和/或以下特殊字符： • -（破折号） • _（下划线） • . （句点） • @（表示“at”的符号）
密码：必须包含 7-15 个字符，并且至少包含三个以下字符：
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提纲
• 介绍
SCIFINDER相似结构搜索教程
在相似结构的检索中， SciFinder会用Tanimoto程序来进行检索与查询物质相似的结构，并给予相似评分。
相似结构评分相似结构检索能找出与查询结构最为相似的结构，其2-D小分子的相似度会以Tanimoto程序来计算。
以下是Tanimoto的计算公式，评分是以CAS的结构描述子为基本：100 x CTanimoto Score =(QS + FS) – CC = 代表检索结构和结果结构相同的描述子数目QS = 代表在检索结构中的描述子数目FS =代表在结果结构中的描述子数目结构描述子的介绍y原子数y环数y原子排列y键排列y周边原子y相连原子数y元素成份y环类型相似性的计算中并不考虑以下因素y氢原子的数目y离子y同位素标识y立体结构多元物质的处理y每一个多元物质的成份，都会被给予相似评分 (Tanimoto score)。
最高评分的成份物质，将会在分析相似的结果中显示。
y用户检索单一物质时，点击Get Substance后，按下Filter中的Structure components 即可。
注意事项y相似检索并不适用于R 基团、可变的原子、重复单元和可变的取代位置工具。
y分析不适用于相似结构检索。
y在限定结果时，相似评分将不会显示。
y相似评分不能保存(只适用于SciFinder) 。
相似评分的显示y以整数显示，不设小数点。
系统限制y只会显示60分以上的相似结构结果。
y最多只能显示20,000 个相似结构。
例子：检索以下的相似结构有关绘制结构图的详情，请参阅第三章。
绘制工具的使用及解释也可在第三章找到。
当你完成绘图，便会像下图所示一样。
在绘制结构后，选择Similarity Search ，然后点击确定，将结构导入检索界面。
若绘制的结构含有R 基团或可变原子 (X, Ak)， 按下确定后，便会出现以下的结构绘图错误窗口。
续修改后才能导入，导入成功后如下图所示：可通过若要缩小检索范围至特定类型，可通过Characteristic(s)，Classes，Studies等过滤选项设定，限制检索结果至指定类型，点击Search，Tanimoto的相似评分会以统计图表来显示。
scifinder scholar的检索方式
scifinder scholar的检索方式
Scifinder Scholar 中有多种检索方式，如下：
1. 基于关键词的检索：输入关键词或短语，检索与其相关的文献
2. 化学结构检索：通过输入分子的结构式或名称，检索与该分子相关的文献
3. 反应式检索：根据反应条件，输入反应物和产物，检索与该反应相关的文献
4. 序列检索：输入蛋白质、核酸或多肽的氨基酸或核苷酸序列，检索与其相关的文献
5. 表格检索：通过输入化合物属性、反应条件等相关信息，检索符合条件的文献
6. 作者、期刊、机构检索：根据作者、期刊或机构的名称，检索相关文献
7. 快速检索：在主页输入关键词，快速检索相关文献。
scifinder 第2章 文献检索
质）所涉及的文献。
注意： 该功能只能在文献数目小于 5000 时使用。 可多选位于不同子学科（category heading）的索引词（索引物质）。 该功能中的相关物质索引选项可以让检索结果达到其他功能做不到的精确。如上图显示
2) 切换后，默认的是通过关键词进行再限定；可根据自己的需要选择限定途径。选择好之 后，输入限定条件，点击下方 Refine，获取得到限定后的结果。
注意： 由于限定功能中的各种途径囊括了输入关键词页面下方的限制条件，所以可以最开始不
进行限制，先获取一个最全面的结果，再利用分析或限定功能来进行二次检索。 限定功能中的选项和分析功能中的选项有部分重合。两者区别是分析功能先让使用者看
4) 弹出完整的分析结果图。分析结果的排序默认为按照出现频率的高低来排布，也可点击
下拉选项选择按照字母顺序 个选项。
进行排列。用鼠标选择在一个或多
2.1.2 通过分析功能进行二次检索 1) 在获取全部的分析结果的页面上，用鼠标选择您想要获取相关文献的选项。如鼠标右键
点击在 PCT Int. Appl.和 U.S. Pat. Appl. Publ.前空白 。然后点击页面下方的 Apply。
不建议作初步限定。
2) 点击 Search。
各个选项的含义： 292 篇文献包含输入的短语，介词可被任意的单词代替。 3446 篇文献含输入的两个关键词的概念并且这两个同时出现在同一个检索字段中（可
以认为是在一个句子中）。 7800 篇文献含两个关键词的概念，并出现在文献中的任意地方（题目、摘要、索引，
注意：该功能操作的文献数目上限是 1000 篇。
SciFinder Scholar 使用简介
SciFinder Scholar 使用简介一、SciFinder® Scholar™ ContentSciFinder Scholar 收集由 CAS 出版的数据库的内容以及 MEDLINE®数据库 （by the National Library of Medicine ，NLM），所有的记录都为英文（但如果 MEDLINE 没有英文标题的则 以出版的文字显示）。
数据库 内容① Reference Databases （文献数据库）CAplusSM 包含来自 150 多个国家、9000 多种期刊的文献，覆盖 1907 年到现在 的所有文献以及部分 1907 年以前的文献， 包括有期刊、 专利、 会议录、 论文、技术报告、书等，涵盖化学、生化、化学工程以及相关学科， 还有尚未完全编目收录的最新文献。
（目前＞2,430 万条参考书目记 录，每天更新 3000 条以上） 包含来自 70 多个国家、3900 多种期刊的生物医学文献，覆盖 1951 到 现在的所有文献， 以及尚未完全编目收录的最新文献。
目前＞1300 万 （ 参考书目记录，每周更新 4 次）MEDLINE®② Structure Database （结构数据库）REGISTRYSM 涵盖从 1957 年到现在的特定的化学物质， 包括有机化合物、 生物序列、 配位化合物、聚合物、合金、片状无机物。
REGISTRY 包括了在 CASM 中引用的物质以及特定的注册。
例如：管制化学品列表如 TSCA 和 EINECS 中的注册。
（目前＞7400 万条物质记录， 每天更新约 7 万条， 每种化学物质有唯一对应的 CAS 注册号）③ Reaction Database （反应数据库）CASREACT ® 包括从 1907 年到现在的单步或多步反应信息。
CASREACT 中的反应 包括 CAS 编目的反应以及下列来源： ZIC/VINITI 数据库 （1974—1991 , by InfoChem GmbH），INPI（Institut National de la Propriete Insutrielle， 法国）1986 年以前的数据，以及由教授 Klaus Kieslich 博士指导编辑 的生物转化数据库。
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反应物中没有硫 醇的缩硫醛化反 应共330个
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对1，4，5，8－萘四酰二亚胺的修饰
物质的盐，同位素，混合物，聚合物 查询物质是目标物质的一部分
环锁定工具
结构与查询物质相似，但不相同
原子锁定工具，被锁定的原子不允许接取代基
A代表氮原子链接除氢原子外的任何基团
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符合检索条件的物质共有2013个
14491 Vs 40561
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Pharmaceutical 的同义词也会命中
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再次利用 Refine限定为 中国发表的
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主题限定为 抗癌药物
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可根据需要进行不同的分析
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按出版年限
按文献类型
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按刊名
按机构名称
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按学科范围或 物质名称归类
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如果存储为rtf文件，可 打印、修改类似word文 档，存储文献数量要≤50
2950万个有机和无机物质； 5700万个蛋白质核酸序列； 日更新4000多个新物质。
CHEMCATS
来自全球734家化学品供应商的834 种产品目录，包括 产品价格信息和供应商联络方式；
CHEMLIST
来自19个国家和国际性组织的管制化学品清单 。
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SFS 功能
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检索科技信息
定位查找某一参 考文献或物质
按刊名浏览
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按主题检索
按化学结构检索
按作者 检索
按公司或机构检索
按分子式检索
按化学结构 检索化学反应
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例： 查找中南大学化学化工学院王建秀老师 ▪文章总数 ▪被引用次数
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选择框
检索结果数目
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利用Refine限定为中国发表的
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对于初步的检索结果进行研究对于如何找到正确的检索路径是 非常有帮助的，就像做研究一样，试验－查看－修正－再试验
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反应信息 管制信息
物质的名称、俗名、CAS Registry Number。 Locate Locate substance
分子式。Explore Molecule Formula
化学结构式。 Explore Chemical Structure Nhomakorabea-
检索过程
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重复基团工具
可变位置连接工具
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• Exact search 物质的盐 、同位素、混合物、聚合物 • Substructure search 查询物质是目标物质的一部分 • Similarity search结构与查询物质相似，但不相同
文摘数据库 反应数据库 物质数据库
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SFS 概述
CAplus
始自1907年； 9500多种期刊和50多个专利发行机构的专利（含 专利族）。除此之外，会议录、技术报告、图书、 学位论文、评论、会议摘要、电子期刊、网络预 印本； 2500万条记录； 日更新3000条以上；
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SFS 概述
Medline
使用指南
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主要内容
• SciFinder Scholar (SFS)概述 • SciFinder Scholar 功能 • 检索技巧
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SFS 概述
SciFinder Scholar 包含六大数据库
➢CAplus ➢MEDLINE ➢CASREACT ➢REGISTRY ➢CHEMCATS ➢CHEMLIST
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索引词 “Natural product, Pharmaceutical”的使用频率最高
索引词分析可以 帮助我们了解答 案中最常出现的 主要关键词
在主题检索中使用 索引词来检索是最 全面和最准确的。
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基于所查看到的结果，我们使用索引词 “Natural product, Pharmaceutical” 来进行新的主题检索以获得最全面和最准确的结果。
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例二 得到具备一定条件的结构信息
问题： ➢存在多少种环结构 ➢X= F，Cl， Br，I 分别有多少种物质 ➢R1=H，OH，X分别有多少物质
R1= H，OH，X R2= O，S
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检索物质的途径
主题检索 Explore
Research Topic
文献链接物质。Get Related
Substance
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对氮原子所连基团的分析
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原子被取代分析 可变基团分析 设置的R基团分析 准确度分析 环分析 立体结构分析
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引用的文献 被引用的情况
涉及的物质 涉及的反应 其他网络资源的信息
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小结
➢Analyze----对研究课题的全面了解 ➢Refine----找到您真正感兴趣的文献 ➢Get related----对研究课题的拓展延伸
有机合成研究方法
宋相志
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一、有机化学主要检索工具
➢SciFinder Scholar---CA网络版 ➢Crossfire Beilstein/Gmelin化学手册网络数
据库 ➢Web of Science(科学引文索引） ➢Google Scholar
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SciFinder Scholar---CA网络版
如果存储为sfr文件，要 在scifinder中查看，文献 数量要≤10000
存储文件名称， 所属文件夹都要 为英文
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索引词
查看 摘要
链接 全文
物质索引
人工编写 的摘要
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引用的文章 被引用的情况 文章当中涉及的物质 文章中涉及的反应 Internet上其他的资源
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反应物为非硫醇的缩硫醛化反应
•例 查询思路：1 查询所有的缩硫醛化反应
2 查询反应物中有硫醇的反应 3 在1中去除2
CHO HS
HS
S S
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1 环锁定工具使苯环不再接其他的环 2 使反应物中的某原子与产物中某原子对应起来 3 反应箭头，指定物质的反应角色
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反应数 目 962
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SciFinder提供了多种方式缩小检索范围的方法
美国国立医学图书馆出品的书目型数据库 起始于1951年 生物医学相关的3900多种期刊文献。 周更新4次
CASREACT
从1840年以来1000多万条单步和多步的反应； 来源于期刊、专利； 有机反应、有机金属反应、无机反应、生化反应等； 周新增600至1300个新反应
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SFS 概述
REGISTRY 世界上最大的物质数据库
反应结构式 反应产率 反应步数 反应类别
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重复基团工具，乙基的数目可以为1－5个，扩大硫醇范围
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获取所有反应物 中有硫醇的反应
如果要用到 combine功 能一定要存 储为sfr格式
-
退回到所有缩硫 醛化反应的界面
-
两次结果之和 两次结果重合的部分 结果A去除结果B的部分 结果B去除结果A的部分