Linux基础教程

简单shell脚本（1）
• 新建shell脚本，vi a.sh • 以#!/bin/bash开始，表示调用bash shell • 写脚本注释# extract the pp,total energy and fermi energy of vasp calculations to output • 写正文： echo | pwd > output head -1 POTCAR >> output grep -i LEXCH POTCAR >>output grep -i fermi OUTCAR | tail -1 >> output tail -2 OSZICAR >> output • 保存退出，增加可执行属性，chmod 740 a.sh • 执行脚本，./a.sh 即可看到相关信息保存至output文件
Of course
Should be
Cluster 使用
• • • • • • 登录/退出 常见命令 文件系统/用户 编译程序 shell linux软件包安装
登录方式
• Linux下开启终端,输入 ssh usr@ip 即可。 • Window下使用软件， 如putty putty
1.输入ip 2.save一个名字 3.打开
• 查看相关命令的说明（以ls为例）: man ls • 查看相关命令参数： ls --help
Clusters 使用
• • • • • • 登录/退出 常见命令 文件系统/用户 编译程序 shell linux软件包安装
文件类型/属性/用户/组
• 文件类型 普通文件，目录文件，连接文件，特殊文件
安装软件包之二（源码）
这里重点介绍源码包的安装： 1.解压缩包(.tar.gz,.bz2,.zip等) 2.进入安装目录，查看Readme或Install文件，通常 情况下安装三部曲： a. /configure （--help查看可用参数） b. make（需要的时候修改Makefile） c. make install
Linux的诞生
• 1969 年: Ken Thompson的小型file server system: Unics • 1973 年：Unix的正式诞生，Ritchie等人以 C 语言 写出第一个正式Unix核心 • 1984 年之一：x86 架构的 Minix 诞生：Andrew Tanenbaum 之二： GNU 与 FSF 计划的成立：Stallman • 1991 年：芬兰大学生 Linus Torvalds：
mkdir/rmdir
• 创建ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ作目录：mkdir
• 删除工作目录：rmdir
Tips：rmdir 只能删除空
文件目录
cd
• 切换工作目录：
• cd ..：切换至上层目录
touch(>)/rm
• 新建一个文件: touch a.sh
• 删除一个文件: rm a.sh
Tips: rm –r 可删除非空文件目录； rm * 删除当前文件夹内所有文件
安装软件包之三（deb）
1. 下载软件包如soft.version.deb到本机某个 目录； 2、打开一个终端，su -成root用户； 3、cd soft.version.deb所在的目录； 4、输入dpkg -i soft.version.deb
linux进阶:by yourself
• 学习linux的动力: 成就感和兴趣 • 推荐网站： / / / /eschool/includes/ zhuanti/zt/linux/25. 文件属性： r-read,w-write,x-excute
• 改变文件属性/所属组/所属用户 chmod/chgrp/chown: chmod 740 filea ; chgrp dft filea; chown phwen filea
Clusters 使用
• • • • • • 登录/退出 常见命令 文件系统/用户 编译程序 shell linux软件包安装
pwd/groups/whoami
• 显示当前目录的绝对路径（从根出发）
• groups:显示自己的组 • whoami：显示当前用户名
find/locate
• 查找文件: find –name ‘INC*’
• 查找文件名：locate INCAR
tar
• 打包解包命令： 压缩打包
解压缩
Tips：bz2格式解压加 –j 参数
ln
• 创建硬链接或符号链接： 格式： ln –参数 源文件 目标文件
cat
• 文件合并命令： cat filea fileb >filec
• 文件追加命令，cat filea >> filec
grep/|(pipe)
• 从文件中找出含有特定字符的行 • “|”管道（pipe），连接命令
命令行的终极武器：man/help
Linux的发展
• 1994 虚拟团队协作下，核心正式版version 1.0, X windows • 1996年2.0版，规定稳定版和测试版，并指 定 为吉祥物 • Linux distribution= Kernel + Softwares + Tools;衍生Red Hat, Mandriva, Debian, SuSE,Ubuntu, CentOS, Fedora ...
Linux上手教程 Linux上手教程
材料学院 文艳伟 2011.9
硬件：计算机
• • • • 超级计算机（supercomputer） 大型计算机（Mainframe computer） 迷你计算机（minicomputer） 微电脑（microcomputer）
操作系统(OS)
……
How? By OS!
编译程序
• 新建一个程序源文件（例如fortran）: vi k.f • 写入程序内容，保存。 • 编译程序（intel编译器）： ifort -o k k.f (根据自己的编译器也可使用 gfortran, pgf90等) • 执行程序: ./k
Clusters 使用
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Thanks!
请同学们把选题交上来!
shell
• Shell是一种具备特殊功能的程序， 它是介于使用 者和 UNIX/Linux 操作系统之核心程序（kernel） 间的一个接口。 • 使用较广的shell有标准的Bourne shell (sh)、 Korn Shell(ksh)、C shell (csh)、Bourne Again Shell(bash)等。（echo $SHELL） • 本质上，shell 脚本是命令行命令简单的组合到一 个文件里面,基本上是一个命令解释器.
登录/退出
• 输入用户名，密码
• 退出： exit/logout
Clusters 使用
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ls
• （list）列出当前目录中文件名:
• 常用参数 –lt • 使用tab（补全）和通配符*，？，[]等
OS: Linux 特点
• • • • • • • • 自由与开放：科学界 稳定的系统 免费或少许费用 微软表示压 多任务、多使用者 力很大！ 力很大！ 使用者与群组的规划 安全性、漏洞的快速修补 相对比较不耗资源的系统 适合需要小核心程序的嵌入式系统
操作模式
• X-Window & Command Line ？
Shell （2）
编写简单脚本实现rsh在服务器和节点机间无密码访问：
Clusters 使用
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安装软件包之一（rpm）
常见的软件包有三种封装方式,rpm,tgz和deb
1.Linux软件包安装---rpm包 #rpm -ivh softwarename－版本号.i386.rpm RPM命令常参数： -i 安装软件。 -t 测试安装，不是真的安装。 -p 显示安装进度。 -f 忽略任何错误。 -U 升级安装。 -v 检测套件是否正确安装。 卸载RPM软件 ＃rpm -e 软件名
cp/mv
• 复制文件: cp a.in b.in
• 修改名称：mv a.in b.in
more/less/cat
• 查看文件内容: more：以页显示,space翻页 less:以行显示， 移动光标，pgup/pgdown 翻页 cat：全部显示 例：more INCAR cat INCAR
head/tail
• 显示文件的头行字符：head –3 INCAR
• 显示文件的末行字符：tail -2 INCAR
Vi(m)
• 查看/编辑文件：vi KPOINTS vi 实际是一个功能强大的编辑器，有两种 模式：命令模式/编辑模式 常见命令，退出(不保存)：‘:q’(如修改过， 使用’:q!’)，保存退出：’:wq’ 编辑：光标位置插入字符:a 光标位置替换字符:r 更多命令详见手册