罗非鱼谷胱甘肽过氧化物酶1基因的克隆与分析

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尼罗罗非鱼γ-干扰素基因的克隆、结构分析及组织表达

尼罗罗非鱼γ-干扰素基因的克隆、结构分析及组织表达

摘要 :. y - 干扰素 ( i n t e f r e r o n ,I F N ) 是调控天然免疫与 细胞 免疫 的一种重要 细胞 因子 ,在抵抗病 毒入侵和 细菌感染
中发挥重要作用 。该研究从尼 罗罗非鱼 ( O r e o c h r o m i s n i l o t i c u s ) 脾脏组 织 中扩增到 . 干扰 素基 因的 c D N A,大小 为
Cl o n i n g, s t r u c t u r e a n a l y s i s a n d e x p r e s s i o n o f i n t e r f e r o n g a mma
( I F N- } , )g e n e i n O r e o c h r o mi s n i l o t i c u s
Y U J i a x i n ,WU F a n g ,S U N C h e n g f e i ,D O N G J u n j i a n ,T I A N Y u a n y u a n ,Y E X i n g ,
( 1 .K e y L a b . o f T r o p i c a l &S u b t r o p i c a l F i s h e r i e s R e s o u r c e A p p l i c a t i o n& C u l t i v a t i o n ,Mi n i s t r y o f A g r i c u l t u r e ;P e a r l R i v e r
第 1 3卷第 1 期 2 0 1 7 年 2月
d o i :1 0 . 3 9 6 9 / j . i s s n . 2 0 9 5—0 7 8 0 . 2 0 1 7 . 0 1 . 0 1 1

鱼类谷胱甘肽转移酶基因cDNA克隆及其序列分析

鱼类谷胱甘肽转移酶基因cDNA克隆及其序列分析
Ch n ia
Absr c s ta t :Usn ig RT— CR P meh d h lttin r n frs ic to 。te guaho e ta seae P DNAs wee co e r m C p iu a po r ln d fo y rn s c r i.ny —
bew e n fs nd m a m a S 3% b t e n fs d mph bi ,a d t e h a m l ,3 i ew e h a i n a i a n l n 5% b The e we n f h i n rhr po e pe tv l
类群:哺乳 类组 成类群 一(o t rp1 0;鱼 类组成 类群 二(o t rp9 ) b os a 0 ) t b os a 3 。通 过 比较 鱼 类与哺 乳类 GS i t TP N末 端
和 C末端 功 能域 的氨基 酸组 成差 异, 探讨 了淡水 鱼类 GS s 担 较 强的微 囊 藻毒 素去毒 能 力 的可 能分 子机 制。 T承

s q e c i l r y wa i mo g fs e , d t e a ea e v l e o e 4 c p i i swa b u 5 e u n e smia i s bg a n h s a h v r g a u ft y rn d sa o t8 %. h l g n t e s t i n h P y o e e i t ewa cr
摘 要 :采用 R -CR方法,从鲢 、鲤 、鲫 3种 鱼类肝 脏总 R A 中克隆 出 了谷胱 甘肽 转移 酶 P 型( TP )DNA TP N i GS i c 序 列,推 导 了其 编码 的氨基 酸序 列 。 3种 鱼 类 GS i OR TP 的 F全 长 6 7b ,编 码 2 8个氨基 酸 。 译起 始 密码均 2 p 0 翻 为 AG T ,终 止 密码子均 为 T GA。 鱼类与 哺乳 动物 、两栖 类爪蟾 以及 节肢 动物 丝虫之 间 GS i T P 氨基 酸序 列相似 度 平均值 分别 为 5 %、3 %、l %左右 。5种 鱼 类之 间的氨基 酸序 列相似 度较 大,其 中鲤 科 鱼类之 间平均 为 8 % 0 3 5 5 左 右 。我们 以 G TP 为分 子标 记,用 最 大简约 数法( ) S i MP 构建 了 l 3个物 种 的系统进 化树 ,识别 出两个 大的单 系

日本鳗鲡谷胱甘肽过氧化物酶_1_和_4_的克隆、分析和组织表达分布

日本鳗鲡谷胱甘肽过氧化物酶_1_和_4_的克隆、分析和组织表达分布
1 材料与方法
1.1 材料 1.1.1 实验动物 日本鳗鲡,体质量 250 ~ 300 g,每 80 尾养殖于 4 m3 水体中。 1.1.2 菌株、试剂 Trizol 购自 Invitrogen 公司,cDNA 第一链合成试剂盒、Taq 酶、TdT 酶、pMD18-T 载体、 SYBR green premix 购自 TaKaRa 公司,凝胶回收试剂 盒、PCR 纯化试剂盒购自 Axygen 公司,TOP10 工程 菌为本实验室保存。 1.2 方法 1.2.1 cDNA 第一链的合成 用0.02 %的H2O2 浸泡 日本鳗鲡,诱导 GPx 表达。4 h 后取日本鳗鲡肝脏组织, 参照Trizol说明书提取RNA,参照PrimeScript cDNA第 一链合成试剂盒说明书,反转录 cDNA 第一链。 1.2.2 GPx1、GPx4 基因中间片段的克隆 根据已知 的脊椎动物GPx1、GPx4基因,使用Oligo 6.0软件设计 兼 并 引 物GPX1F/GPX1R以 及GPX4F/GPX4R(表1), 以 cDNA 第一链为模板,合成鳗鲡 GPx1、GPx4 的中间 片段,PCR反应程序为:94 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72℃ 30 s,35个循环;72℃ 5 min。PCR产物进行 琼脂糖凝胶电泳,割胶回收目的片段,与 pMD18-T 载 体连接,转化到 Top10 菌株中,送上海生工公司测序。 1.2.3 GPx1、GPx4 基因的 3′RACE 根据克隆到的 中间片段设计正向引物 GPX1F1、GPX1F2,GPX4F1、 GPX4F2,与反向引物 RAP、AP(表 1)。以 cDNA 第一链 为模板,先分别用 GPX1F1/RAP 和 GPX4F1/RAP 进行第
ROS 浓度过高会造成氧化应激,损伤机体组织细 胞 [1]。谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,

罗非鱼SIRT1基因的克隆及其表达规律分析

罗非鱼SIRT1基因的克隆及其表达规律分析

罗非鱼SIRT1基因的克隆及其表达规律分析陈亨德; 褚武英; 李玉珑; 许友卿; 丁兆坤; 钟艺文; 王利香; 安晓玲【期刊名称】《《江苏农业科学》》【年(卷),期】2019(047)021【总页数】4页(P103-106)【关键词】罗非鱼; SIRT1基因; 实时定量PCR; 饥饿; 系统进化树【作者】陈亨德; 褚武英; 李玉珑; 许友卿; 丁兆坤; 钟艺文; 王利香; 安晓玲【作者单位】广西大学水产科学研究所广西南宁530004; 长沙学院湖南长沙410000【正文语种】中文【中图分类】S917.4罗非鱼是联合国粮食及农业组织(FAO)向全世界推广的优质养殖鱼类品系,目前全球有近百个国家和地区进行罗非鱼的规模化人工养殖,罗非鱼同时也是我国农业农村部主要推广的重要淡水养殖品种,我国罗非鱼养殖产量在世界上高居榜首。

尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)是罗非鱼类中的主要养殖品种,该鱼的养殖性能极其优越,具有生长快、食性广、抗病强、肉质鲜美、富含谷氨酸和甘氨酸等特点[1],深受许多美食爱好者的喜爱。

沉默信息调节因子2同源蛋白1(silent mating type information regulation 2 homolog1,简称SIRT1)是一种依赖于烟酰胺腺嘌呤二核甘酸(NAD+)的组蛋白去乙酰化酶[2],于1999年从人类中发现[3]。

SIRT1能够广泛表达于成熟组织,在胚胎早期和生殖细胞中含量也较高[4]。

哺乳动物中Sirtuins家族共有7名成员(SIRT1~SIRT7)[3],其中SIRT1与沉默信息调节因子2的同源性最高[5],是Sirtuins家族中目前研究得最为广泛的1名成员。

SIRT1在机体内可通过对几种控制代谢转录因子的去乙酰化作用来调节其活性,广泛参与机体的糖代谢和脂肪代谢通路,还参与基因转录、细胞衰老的调节过程[6]。

SIRT1还可抑制成脂肪分化因子PPARγ的转录因子活性,减少脂肪的合成与堆积[7]。

大连海洋大学水产养殖饲料课期末2013复习题 养殖10-2整理

大连海洋大学水产养殖饲料课期末2013复习题 养殖10-2整理

复习题一、名词解释1.必需氨基酸:指动物自身不能合成或合成的量不能满足动物的需要,必须由饲粮提供的氨基酸。

2.非必需氨基酸:指水产动物体内能利用其他物质合成足量的AA,不从饵料中供给,也不会出现缺乏症。

3.代谢氮:鱼、虾类在摄取无蛋白质饲料时,其排出的粪和尿中亦有含氮物质等代谢产物,从粪中排出的氮叫代谢氮(medogenous nitrogen),主要是肠黏膜脱落细胞、黏液和消化液所含有的氮;4.内源氮:鱼、虾类在摄取无蛋白质饲料时,其排出的粪和尿中亦有含氮物质等代谢产物,从尿排出及鳃分泌出的氮叫内源氮。

5.氨基酸平衡:所谓氨基酸平衡是指配合饲料中各种必需氨基酸的含量及其比例等于鱼、虾类对必需氨基酸的需要量。

6.限制性氨基酸(LAA):与动物需要量相比,饲料(粮)中含量不足的EAA。

7.蛋白质生物学价值:指动物利用的氮占吸收氮的百分比。

8.蛋白质效率比(PER):动物食入单位蛋白质或氮的体增重。

9.必需脂肪酸(EFA):不饱和脂肪酸中的一些脂肪酸,具有2个或2个以上的双键;在动物体内不能合成,必须由饲料供给,这样的多不饱和脂肪酸。

10.ADE:表观消化率( I-EAD(%)= ————×100%I式中:AD——表观消化率I——饲料或某一成份的总摄入量E——粪便或某一成分的总排出量11.TDE:表观消化率将粪中非饲料来源的物质(内源物质)扣除后,算得的消化率叫作真消化率。

12.AME:尿中能量来自饲料养分吸收后在体内代谢分解的产物的代谢能(AME = ADE - (UE + ZE)= (GE -FE ) - (UE + ZE)= GE - (FE + UE + ZE)13.TME:尿中能量来自于体内蛋白质动员分解的产物的代谢能(TME = TDE - [ ( UE - UeE) + ZE ]= [ GE - (FE - FmE) ] - UE – ZE + UeE= GE - (FE + UE + ZE) + ( FmE + UeE )= AME + ( FmE + UeE )14.热增耗(体增热)(HI):绝食动物投喂饲料后,产热量增加,增加的那部分热量损失掉了,这个部分热量就叫热增耗。

谷胱甘肽过氧化物酶基因的表达调控机制研究

谷胱甘肽过氧化物酶基因的表达调控机制研究

谷胱甘肽过氧化物酶基因的表达调控机制研究谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPx)是一种重要的抗氧化酶,能够将细胞内的过氧化氢等有害物质还原为无害水和氧气。

它对于维持生物体内的氧化还原平衡、预防氧化应激、维护基因稳定性和细胞生存等方面具有重要的生物学意义。

作为GPx基因的编码蛋白,GPx酶在人体内分布广泛,包括肝、肾、肌肉、大脑、血液中的各种细胞类型,甚至在母乳中都可以检测到其存在。

因此,GPx在人体免疫和保健方面的研究备受重视,特别是近年来与一些慢性疾病的关联研究更是揭示出了该酶的潜在价值和作用机制。

GPx基因的表达调控机制是研究GPx在细胞内作用中必须探索的问题,在这个过程中有许多相关因素和调控途径需要研究和探明。

一、转录水平上的调控GPx的表达调控主要是在转录水平上进行的,这与其启动子序列的结构和某些转录因子的作用有关。

GPx基因家族的启动子序列在某些生物中具有近似的特征,包括富含GC盒、反向重复序列和近似于肝X受体作用元件(LXRE)等。

因此,这些序列元件的变化和与其相关的转录因子的活性变化可能是GPx表达调控的主要限制因素。

研究表明ATF4、Nrf2等调控物质具有重要作用,而在饥饿等情况下ATF4可以与GPx启动子结合并协同作用,增加GPx的表达;在产生氧化应激时,细胞内Nrf2介导的线粒体逆向转录因子(mtTFA)可以直接与GPx启动子结合,增加GPx的表达。

此外,各种物质对GPx基因表达调控的研究也在不断深入,进一步解释了基因表达的复杂机制。

二、翻译和修饰水平上的调控翻译和修饰水平上的调控是GPx表达过程中的另一个重要环节。

其中,翻译后修饰、蛋白降解和代谢等机制都是影响GPx表达和功能的重要因素。

翻译后修饰方面,氧化磷酸化和氨基酸甲基化等修饰方式对GPx功能具有显著影响。

氧化磷酸化是调节GPx活性最为重要的修饰方式之一,研究显示,氧化磷酸化可以使GPx的催化反应更为高效,增强其对细胞内有害物质的清除能力;此外,氨基酸甲基化等修饰方式也可能通过对蛋白空间结构的改变而影响GPx的功能。

谷胱甘肽过氧化物酶

谷胱甘肽过氧化物酶

本科生毕业论文(设计)题 姓 学 专 班 学目: 名: 院: 业: 级: 号:谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)对灵芝生长发育中 的活性氧物质(ROS)的改变及理化性的质影响 于南 生命科学学院 生物科学 生物科学 101 班 13210101 师亮 职称: 讲师指导教师:2013 年 5 月 20 日 南京农业大学教务处制1目录摘要 .......................................................................................................... 错误!未定义书签。

关键词 ...................................................................................................... 错误!未定义书签。

Abstract ................................................................................................... 错误!未定义书签。

Key words ................................................................................................ 错误!未定义书签。

引言 .......................................................................................................... 错误!未定义书签。

1 材料与方法 ........................................................................................ 错误!未定义书签。

尼罗罗非鱼Dmrt1基因克隆及在不同组织中的表达

尼罗罗非鱼Dmrt1基因克隆及在不同组织中的表达

尼罗罗非鱼Dmrt1基因克隆及在不同组织中的表达摘要:Dmrt1基因是Dmrt基因家族的一个重要成员,在动物性别决定过程中发挥重要作用。

参照小鼠Dmrt1基因DM保守区及有关文献,设计了1对简并引物,扩增了尼罗罗非鱼的Dmrt1基因,并对扩增产物进行了亚克隆与测序。

结果在雌雄尼罗罗非鱼个体中各获得1个预期的基因片段,长度为140bp,序列无性别差异。

序列同源性分析表明,尼罗罗非鱼Dmrtl基因DM盒区核苷酸序列与人和鼠相应基因的同源性为78%;编码的氨基酸序列与人和鼠相应基因编码序列的同源性为89%,充分显示了Dmrt1基因在进化上的高度保守性。

进一步根据获得的Dmrt1序列,设计1对特异引物,采用RT-PCR技术对尼罗罗非鱼不同组织Dmrt1基因的表达进行了研究。

结果发现,Dmrt1只在精巢中特异表达,在卵巢、眼、肠、鳃及心脏组织中无表达,提示该基因在性别分化和功能维持上可能具有重要作用。

关键词:尼罗罗非鱼;Dmrt1;RT-PCRCloning of Dmrt1 Gene and Its Expression in Different Tissues of Oreochromis niloticusAbstract:The Dmrt1 gene plays important roles in sex determination. The 140bp DM -box of Dmrt1 gene in Oreochromis niloticus was amplified by using degenerated PCR,and then subcloned and sequenced.The sequences from male and female O. niloticus were compeletely pared with the human and mouse Dmrt1 gene,the sequences of Dmrt1 shared 77%nucleotide homology and 89% amino acid indentity. The results indicated that Dmrt1 genes were highly conservative in phylogeny. According the sequence of Dmrt1,specific primers were designed for RT-PCR in different tissues in adult O. niloticus. Dmrt1 expression was only detectable in testis,and no expression was detected by RT - PCR in the following tissues:ovary,eye,intestine,gill and heart.Key words:Oreochromis niloticus;Dmrt1;RT-PCRDmrt是一种目前已知最保守的性别分化相关基因,该家族成员与果蝇的性别决定基因Doublesex (dsx)和线虫性别决定基因(Mab-3)一样,编码的蛋白质都包含一个具有DNA结合能力的保守基序,即DM(doublesex and mab-3)结构域,并以锌指结构与特异DNA序列相结合,在性别决定和分化发育中起调控作用[1,2]。

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n ocs 谷 胱 甘 肽 过 氧 化 物 酶 1 (lt h n eoi sl P 1 基 因 完 整 的 编 码 序 列 ( o p t cdn e i tu) li g a i epr d e ,G x ) u to xa cm l e oig s— e
qe c ,C S 。G x 基 因全长 9 4b ,5u R 5 p D 7 p T 5 p o A2 p une D ) P l 8 p T 6b ,C S56b ,3U R3 2b ,P l 0b ;第 7 1 8 y 9 —85位 碱基 ( 位于 3U R)形成 1 T 个硒半胱氨酸插入序列 (e ncs ieisro e une E I ) sl oyt n e i sq ec ,S CS ,协助 14~16位 e e n tn 7 7 密码子 T A ( G G U A)编码 1 个硒半胱氨酸 ( e ) P l Sc 。G x 包含 11 氨基酸 ,分子量 2 . D ,等 电点 80 ,无 9个 18k a .4 信号肽 和潜在 的 N 糖基化位点 。蛋 白结 构分析表 明该基 因编码蛋 白为非跨膜 蛋白。序列 比对显 示 ,G x . P l单体具
M o e u a l n ng a d c a a t rz to n l ss o l t t i ne l c l r co i n h r c e i a i n a a y i f g u a h o
p r xd s rm l ta i O e c rmi nlt u ) eo iae1fo Ni lpa( ro h o s i i s ei oc
有 Sc r 、Gn和 A n构成 的催化 四联体 。罗 非鱼 G x e 、Tp l s P l与其他脊椎 动物 G x 比较 ,核苷酸序 列相似 性为 P l相 4 . % 一 8 2 ,氨基酸序列相似性为 5 . % ~8 .% 。进化分析显示 ,处在 分类 学上不 同纲 的脊椎动物 G x 32 5.% 81 06 P1
Jn u .,2 1 00
罗非 鱼谷胱 甘肽 过 氧化 物酶 1基 因的克 隆与分 析
曹艳 林 ,柯 浩 ,刘振 兴 张建腓 , ,林 敏
( .广 东 省 农 业 科 学 院兽 医研 究 所 ,广 东 省 兽 医 公共 卫生 公 共 实 验 室 ,广 东 广 州 5 04 ; 1 16 0
A s at h o pe oigsq ec f lthoep r iae1( P 1 fNl tai O ecr s it u)w sc ndb bt c :T ecm lt cdn eu neo ua i eo ds G x )o i ipa( r ho l i s a l e y r e g t n x e l o min oc o r i a oict no N n s( A E . T eG x otn 8 p ic dn 5 p u t nle g n a 7 pcdn — a d , 1 a o c Ae d R C ) h P lcna s 4b ,nl i a 6b n as t r i , 6b i s p  ̄ f i f D i i 9 u g 5 r adeo 5 o ge q ee C S , 5 p3 n as t g na da 0b o A tl l oytn Sc a noe y h n sa s pC- une( D ) a3 2b u t nle r i n pP l i r adeo 2 y a .A s e cs ie( e )w s cddb euuul t O en e e t o dn T A, i eslncs iei e i eune ( E I)lct t T . T eG x a r ie oecd 9 m n o , G wt t e oyt n n ro sqec S C S oae a 3U R h P lw spe c dt noe1 1a io hh e e s tn d dt
C n i , KE Ha L U Z e xn Z AO Ya l n o , I h n i g , HANG Ja f i , L N Mi in e I n
( . u nd n ul a . t i r ul el ,Ist e t i r Mein ,G ago gA ae yo gi l rl 1G a g ogP b L bo V e n yP bcH at ntu V e n y d i c i f er a i h i t o e r a c e u n dn cdm f fA r ut a c u Si cs un zo 16 0 C i ;2 oeeo i c ne, ot C i gi l rlU i rt, unzo 162 h ) c ne,G aghu5 0 , hn e 4 a .C lg f Si cs Su hn A r u ua n e i G a ghu50 4 ,C i l fL e e h a c t v sy a n
分别 占据 了不同分支。利用 S i — dl ws Moe 预测了罗非鱼 G x s P l的 3 D结 构 ,序列分析显示 ,G x 可以形成 1个同源 Pl
四聚 体 。 关 键 词 :罗非 鱼 ;谷 胱 甘 肽 过 氧 化 物 酶 1 ;基 因 克 隆 中 图 分 类 号 :Q7 5 8 文 献 标 志 码 :A 文章 编 号 :17 22 63— 2 7一 (00 0 0 5 o 2 1 ) 3— 0 2一 6
第 6卷第 3期
2 0年 6月 01 di 03 6/.s .6 3— 2 7 2 1. 30 0 o:1. 99 ji n 17 2 2 .00 0 . 1 s
南 方 水 产
S t ouh Chia Fih re ce c n s e s S in e i
Vo. 1 6, No ,广东 广州 5 0 2 16 ) 4 摘要 :采用 c N D A末端 快速 扩增 (ai m liao f D A ed ,R C rpda pictno N n s A E)技术 ,克 隆 了罗非鱼 ( r cr s f i c Oe ho o mi
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