上海敏芯信息科技有限公司--代谢组学介绍-整合版
美吉 代谢组学

美吉代谢组学代谢组学是一门利用化学和计算方法研究生物体代谢物谱的学科。
随着技术的发展,代谢组学在生物医学领域中的应用越来越广泛。
美吉公司是一家专注于代谢组学研究和应用的公司,通过代谢组学技术为客户提供个性化的健康管理方案。
代谢组学研究的核心是分析生物体内的代谢物谱。
代谢物谱是指生物体内所有代谢产物的集合,通过对代谢物谱的分析,可以了解生物体的代谢状态和生理功能。
代谢物谱的分析通常包括样本采集、样本制备、质谱分析和数据分析等步骤。
美吉公司拥有先进的仪器设备和专业的团队,可以提供高质量的代谢组学分析服务。
代谢组学在临床医学中有着重要的应用价值。
通过分析代谢物谱,可以帮助医生诊断疾病、评估疾病的严重程度,并预测疾病的发展趋势。
例如,在肿瘤研究中,代谢组学可以用于筛选肿瘤标志物,辅助肿瘤早期诊断和治疗。
在心血管疾病研究中,代谢组学可以揭示心血管疾病的代谢紊乱机制,为疾病的诊断和治疗提供依据。
除了临床医学,代谢组学还在食品安全和营养研究中发挥着重要作用。
通过分析食物中的代谢物谱,可以评估食品的安全性和质量,帮助监管机构进行食品安全监测。
同时,代谢组学还可以用于研究食物对人体的影响,评估不同食物对代谢的调节作用,为制定个性化的饮食方案提供科学依据。
美吉公司在代谢组学研究中积累了丰富的经验和优秀的技术团队。
公司拥有一流的实验室设施和数据分析平台,可以为客户提供全方位的代谢组学解决方案。
美吉公司与科研机构和医疗机构合作紧密,开展多项代谢组学研究项目,取得了许多重要的科研成果。
代谢组学作为一门新兴的交叉学科,具有广阔的发展前景。
随着技术的不断突破和应用的深入,代谢组学将在医学、农业、环境等领域中发挥越来越重要的作用。
美吉公司将继续致力于代谢组学的研究和应用,为客户提供更好的健康管理服务,推动代谢组学在各个领域的发展。
小鼠植入RFID芯片生理生化值的测定

在应用于动物 个体 中尤其 是小动物 中, 必须确保 电了 标 签埘 实验动 物机体 的安仝。 影 响实验动物 生长繁 殖 等 机 体 性 能 。而 国 内 目前 无 相 关 文 献 的报 道 。 本 实验 对 此 进 行 了相 关 研 究 。
实 验 动 物被 广 泛应 用 于 各类 生命 科 学研 究 中, 在 实验动物例 养和使 用过程 中, 动物 的种类和数量 一 般 都较 多, 同时同一 品系动 物其个 体外 观相似 , 在实
小 鼠颈 部皮 下接 种 动物 电了 标 识, 常规 饲养 观
实验 动物 与 比较 医学 L b rtr i a a d o aav dc e aoa y m ln mprt e o An C i Me in i
29 3
祭 。分别在植 入后 3 d、 3剧 、3、 6 1 、 2个 月 进 行采 样 测定 , 次采 样 8只 , 雄 各半 。小 鼠经 戊 每 雌 巴 比妥钠 麻醉 , 解剖 , 腹主动 脉 采 血, 管收 集 于含 一
[ 关键词 J鼠; FD芯 片; 液生化 ; 常规 、 RI 血 血
【 中图分 类号 】 53 【 Q9 —3 文献标 识码] 【 B 文章编 号]17 .8 72 1 )30 3 .3 6 45 1 (0 20 —2 80 射频 识 别技术 ( doFe u n yIe t iain Ra i rq e c ni c t , d f o R I 俗称 电了标签 , 1 9 F D) 是 9 0年 代 兴起 的一种 自动 物力 来完 成 。随着 生物 技术 和通 信 技术 的发展 , 各 类 电l标 签 的推广应 用, 了 实验动物 的标 记和识 别完仝 可 以使用 条码技 术或射 频识 别技 术代 替传统 的人 T 方法 进行 标示, 且可 以和 计算 机 管理系统 对接 , 并 形 成 实 验 动 物 识别 、 基础 数 据 阅读 、 实 验 结 果 录 入 等计 算机管理体系 。
4 Exiqon公司miicroRNA LNA实时定量PCR探针

Exiqon公司LNA microRNA的PCR系统丹麦Exiqon公司的新型miRCURY TM LNA microRNA PCR系统能够快速、精确、灵敏地对microRNA进行定量,它所使用的是基于SYBR Green检测法的microRNA特异的实时定量PCR方法。
该系统是由以下三部分组成:miRCURY TM LNA 第一链(First-strand)cDMA KitmiRCURY TM LNA SYBR Green master mixmiRCURY TM LNA microRNA引物组这个系统提供了所有必需的组份,并对实时定量PCR实验的反应体系作了优化,确保对微量样本如10pg的总RNA也能达到很好的效果,可靠的检测底限为10个拷贝的microRNA。
这个系统提供了各种高品质的引物组,所有的microRNA引物都能确保获得低背景、高特异性和高灵敏度的结果。
miRCURY TM LNA microRNA的PCR系统主要优点:●灵敏度高✧即使样品的总RNA少于10pg,或者只来自一个细胞的总RNA都可用于实验。
✧可靠的检出少于10个拷贝的microRNA。
●线性范围广✧可精确定量的线性范围超过8个数量级。
✧可靠的检测同一样本中高表达和低表达的microRNA。
●特异性高✧具有单碱基差异的识别能力,能够特异的区分序列相近的microRNA家族成员。
✧能够区分microRNA成熟体和前体。
●重复性好✧两次实验之间的相关性超过98%。
●完全经过验证的microRNA实验✧高品质的基于LNA专利技术的microRNA特异引物组。
●快速可靠✧简单的两步法实验,能够在三小时内完成。
✧短PCR引物能够降低引物错配或二聚体形成的风险。
✧能够对microRNA进行高通量的分析。
快速稳健的聚合酶链反应程序miRCURY TM LNA microRNA PCR系统结合了LNA专利技术、SYBR Green染料和简单的两步法反应,包括从总RNA中对microRNA 进行特异的反转录以及进行实时定量PCR实验。
ma检验报告

ma检验报告尊敬的用户:您好!感谢您选择我们的服务,我们将竭力为您提供专业、高效、可靠的服务。
根据您的要求,我们特别为您提供了ma检验报告,详见下文:一、实验目的本实验的目的是通过对样本中差异表达基因的筛选和聚类分析,发现与肿瘤相关的生物标志物,为进一步研究肿瘤相关机制提供有力的依据。
二、实验原理在本实验中,我们选择了Affymetrix microarray芯片作为实验平台,通过检测样本中基因在不同的条件下的表达水平,筛选出与实验组和对照组相关的差异表达基因。
然后,通过ma检验(均值比较分析),比较各样本组之间的差异并进行分析,挖掘与其相关的生物标志物。
三、实验过程1. 样本准备本实验采用的是人体癌细胞系及其对应的正常细胞系样本。
详见表格。
2. RNA提取和芯片杂交样本总RNA提取后,利用Affymetrix One-Cycle Target Labeling和Control Reagents Kit进行cDNA合成,然后进行清洗、打标和杂交操作,最后使用Affymetrix GeneChip Scanner 3000扫描芯片。
3. ma检验利用Partek Genomic Suite软件,对芯片数据进行MA Plot分析,并进行差异表达分析和聚类分析。
四、实验结果通过差异表达分析和聚类分析,我们共筛选出了745个差异表达基因,其中有512个基因表达上调,233个基因表达下调。
详见表格。
五、实验结论1. 本实验成功地筛选出了745个差异表达基因,并进行了相关分析。
2. 经过ma检验,我们挖掘出了与实验组和对照组相关的生物标志物,进一步探究其与肿瘤发生发展的相关机制。
附:实验数据表格表格1:样本信息表样本名称组别A1 对照组A2 对照组A3 对照组B1 实验组B2 实验组B3 实验组表格2:差异表达基因筛选结果表基因编号基因名称 FoldChange p-value001 TP53 2.8 0.001002 EGFR 3.4 0.003003 CDKN2A 0.5 0.01... ... ... ...以上即为我们为您提供的ma检验报告,如有疑问或需进一步讨论,请随时联系我们,谢谢!祝您生活愉快,工作顺利!。
sam代谢组学

sam代谢组学全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:Sam代谢组学是一种以甲基化组学分析为基础的新兴研究领域,通过对生物体内代谢物质的分析来研究个体对环境的适应性、健康状况以及疾病的发生发展。
Sam代谢组学通常通过高通量测序技术和生物信息学分析来识别和量化生物体内的代谢产物,从而揭示代谢物与健康、疾病之间的关联。
在Sam代谢组学中,甲基化组学是一个重要的研究手段。
甲基化是一种重要的表观遗传标记,通过DNA甲基化修饰可以影响基因的表达,从而影响生物体内的代谢途径和代谢产物的组合。
研究DNA甲基化谱和代谢物谱之间的关系对于了解代谢组学在健康和疾病中的作用具有重要意义。
Sam代谢组学的研究对象涵盖了多种生物体,包括人类、动物、植物等。
在人类中,Sam代谢组学被广泛应用于疾病的早期诊断、个体化治疗和药物疗效监测等方面。
通过对代谢产物的定量和分析,可以发现疾病的潜在生物标志物,为疾病的诊断和治疗提供重要参考。
在动物和植物中,Sam代谢组学的研究也具有重要意义。
在动植物的生长与发育过程中,代谢产物的变化反映了生物体内代谢途径的调控机制,通过研究代谢组学可以了解生物体在不同生长阶段的代谢状态,为生物体的生长发育提供指导。
除了研究生物体内代谢产物的变化,Sam代谢组学还可以通过研究代谢产物与环境因素之间的相互作用,揭示生物体对环境的适应性和耐受性。
通过研究植物叶片中的代谢产物,可以了解植物对环境中营养元素、水分和光照等因素的响应机制,为植物的育种和生产提供理论依据。
Sam代谢组学是一种多学科交叉的研究领域,涉及生物学、生物化学、生物信息学等多个学科的知识和技术。
通过对代谢产物的研究,Sam代谢组学可以为健康、疾病和环境等方面提供重要的科学依据,推动生命科学领域的发展和进步。
希望未来能够有更多的研究者参与到Sam代谢组学的研究中,共同探索生物体内代谢的奥秘,为人类和地球上的生物体健康和可持续发展做出贡献。
第二篇示例:代谢组学是运用生物信息学和化学分析技术来研究生物体内代谢物的全套信息的一门高新技术。
强大的多重检测平台

强大的多重检测平台——Panomics/Luminex多重核酸与蛋白定量检测平台Luminex 多重核酸、蛋白定量检测平台又称作液相芯片,是基于xMAP 技术(flexible Multi-Analyte Profiling )的新型生物技术平台。
xMAP 技术最早在1997年由美国Luminex 公司开发,可用于免疫学、蛋白质、核酸检测、基因研究等领域,已成为一种新的蛋白质组学和基因组学研究工具。
Luminex 的代表产品 Luminex ® 100/200(图1)以及新推出的FLEXMAP 3D 多功能流式点阵仪, 是唯一得到美国FDA 批准的,也是唯一被纳入美国临床实验室质控网络的高通量诊断技术,被国际业界专家评价为临床诊断的趋势性技术之一。
达到500种编码微球)。
不同颜色微球在分类激光激发下产生的荧光互不相同,这种分类荧光是识别不同微球的唯一途径。
利用这100种微球,可以分别标记上100种不同的探针分子。
2. 交联探针、抗体或抗原:把针对不同检测物的核酸探针、抗体或抗原以共价方式结合到特定荧光编码的微球上(图3)。
3. 检测反应:先把针对不同检测物的、用不同荧光色编码的微球混合,再加入被检测物。
悬液中的微球与被检测物特异性结合,结合物被标记上报告荧光。
4. 激光分析:微球成单列通过两束激光,一束判定微球的荧光编码;另一束测定微球上的报告分子的荧光强度。
红色激光可将微球分类,从而鉴定各个不同的反应类型(即定性);绿色激光可确定微球上结合的报告荧光分子的数量,从而确定微球上结合的目的分子的数量(即定量)。
因此,通过红绿双色激光的同时检测,完成对反应的实时、定性和定量分析(图4)。
一. Luminex多重检测平台技术原理Luminex 多重检测平台主要由4部分构成:生化试剂、微球、流体和光学设备以及高速电子处理设备。
其核心技术是基于xMAP 微球技术的液相芯片检测系统,在不同荧光编码的微球上进行抗原—抗体、酶一底物、配体—受体的结合反应及核酸杂交反应,通过激光分别检测微球编码和报告荧光来达到定性和定量的目的,一个反应孔内可以完成多达100种不同的生物学反应。
microRNA-223-3p靶向微管相关蛋白1B抑制肝星状细胞活化的机制研究

·肝纤维化及肝硬化·DOI: 10.3969/j.issn.1001-5256.2023.12.015 microRNA-223-3p靶向微管相关蛋白1B抑制肝星状细胞活化的机制研究谢文涛,鱼康康,程琦,李宁复旦大学附属华山医院感染科,上海市传染病与生物安全应急响应重点实验室,国家传染病医学中心,上海 200040通信作者:李宁,*******************.cn(ORCID: 0000-0002-4375-2857)摘要:目的 探讨microRNA-223-3p (miR-223-3p)对肝星状细胞活化的影响及机制。
方法 选取人肝星状细胞系LX2细胞为研究对象,采用TGF-β刺激LX2细胞的方式构建肝星状细胞活化模型,通过实时荧光定量PCR检测miR-223-3p在肝星状细胞活化过程中表达水平变化;转染miR-223-3p mimic至LX2细胞,通过实时荧光定量PCR、蛋白免疫印迹法(Western Blot)及细胞免疫荧光明确miR-223-3p对肝星状细胞活化的调控作用;通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-223-3p与靶基因MAP1B的关系;转染MAP1B的siRNA至LX2细胞,通过Western Blot明确抑制MAP1B表达对肝星状细胞活化的影响;转染miR-223-3p至LX2细胞,通过实时荧光定量PCR和Western Blot验证miR-223-3p对MAP1B的调控作用。
计量资料两组间比较采用成组t检验。
结果 与静息状态相比,肝星状细胞处于活化状态时,miR-223-3p表达水平下降(t=9.12,P<0.001)。
过表达miR-223-3p能抑制肝星状细胞活化标志物平滑肌肌动蛋白及Ⅰ型胶原的mRNA(t值分别为8.35、12.23,P值均<0.01)和蛋白(t值分别为16.24、20.90,P值均<0.001)表达水平。
美吉 代谢组学

美吉代谢组学一、引言代谢组学是研究生物体内代谢产物的组成和变化的科学领域,它通过对生物体内代谢产物的分析,揭示了生物体在不同状态下的代谢特征和变化规律。
美吉代谢组学是一种应用代谢组学技术来研究美吉这种药物在人体内的代谢过程和效应的方法。
本文将围绕美吉代谢组学展开,介绍其基本原理、实验流程、数据分析方法以及在临床研究中的应用等方面进行详细阐述。
二、基本原理美吉是一种常用的中药,具有抗菌、消炎、镇痛等多种药理活性。
通过美吉代谢组学研究,可以了解美吉在人体内的转化过程和作用机制,为其临床应用提供科学依据。
1.代谢产物分析:通过质谱技术对人体样本中的代谢产物进行定性和定量分析,可以获得美吉及其代谢产物在不同时间点或不同个体中的浓度变化情况。
2.代谢通路分析:通过对代谢产物的分析,可以推断出美吉在人体内的代谢途径和代谢酶参与的反应,进而揭示其作用机制。
三、实验流程美吉代谢组学研究的实验流程主要包括样本采集、样品前处理、质谱分析和数据处理等步骤。
1.样本采集:收集人体血液、尿液等样本,以获得美吉及其代谢产物在体内的浓度变化信息。
2.样品前处理:对采集到的样本进行预处理,如蛋白质去除、有机溶剂萃取等,以提取目标化合物并去除干扰物质。
3.质谱分析:使用质谱仪对样品进行分析,常用的方法包括气相色谱质谱联用(GC-MS)和液相色谱质谱联用(LC-MS)等。
4.数据处理:对得到的质谱数据进行预处理、特征提取和定量分析等操作,以获取美吉及其代谢产物在不同样本中的浓度信息,并进行统计学分析和生物信息学分析。
四、数据分析方法美吉代谢组学的数据分析主要包括特征提取、差异分析和通路分析等。
1.特征提取:从质谱数据中提取出与美吉及其代谢产物相关的特征峰,可以使用多种方法,如主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)等。
2.差异分析:通过对不同组别样本的特征峰进行统计学分析,可以找到与美吉代谢变化相关的差异物质,并根据其质谱信息进行结构鉴定。
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尿液样品制备
1ml/例,原则上可以多取一点。 尿液直接分装到离心管中,每管1ml,添加一滴(约10ul)质量体积为1/100(w/v)的 叠氮化钠,-80度冻存寄送。
代谢组学检测分析实例一
代谢组学检测分析实例一
1、样品数量 、
SLE(系统性红斑狼疮):64 RA(风湿性关节炎):30 正常对照:35
6、组间差异化合物筛选 、
通过OPLS-DA分析各代谢物相应的相关系数,对有统计意义的代谢物进行进一步归 纳。在相关系数图中,将每一个变量的loading值与其标准偏差的平方根值相乘后进行数 据的回溯转换。然后与相应的相关系数临界值表进行比对,得到引起组间差异的代谢物。
Metabolites S-R β-Glucose: 3.24(ddb), 3.40(t), 3.46(m), 3.49(t), 3.90(dd), 4.65(d) α-Glucose: 3.42(t), 3.54(dd), 3.71(t), 3.73(m), 3.84(m), 5.23(d) Unknown: 3.71(m) Valine: 0.99(d), 1.04(d) … -0.531 -0.507 0.428 0.473 … Ra S-N -0.521 0.825 … R-N 0.576 0.570 -0.709 0.636 …
Company
LOGO
代谢组学技术简介 及其在医学中的应用
销售经理:邓军亮
公司主营项目
软件
数据库
服务
生物信息学
培训
公司业务范围
表达谱芯片、MiRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、 lncRNA芯片、组织芯片、细胞因子抗体芯片
代谢组学检测分析实例一
3、PCA分析 、 分析
S R N
使用SIMCA-P+软件(V11.0, Umetrics AB, Umea, Sweden)对归一化后的数据进行模式识别 多变量分析,主成分分析使用中心化换算(mean center scaling)的数据标度换算方式。
代谢组学实验设计
微生物和植物 每组6个以上,越多越好
模式动物 每组10个左右,越多越好
临床标本 每组30个左右,越多越好
代谢组学样品处理
样本采集与预处理
动物体液(如尿、血、组织、器官、唾液):采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂, 并立即冷冻处理(-80 ℃ ) 微生物和细胞样本:迅速钝化代谢活动(淬灭),同时保持细胞不裂解 植物样本:采集后迅速冷冻(液氮),然后转入-80 ℃ 保存
S
20 10 t[2] 0 -10 -20 -30 -80
0.0 0.5
R
1.0
R2
Q2
-40
0 t[1]
40
80
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
R2X=69.7%, R2Y=0.310, Q2=0.209 说明:以模型的可解释指标R2和可预测指标Q2并结合排列实验验证结果共同提示组间差异性。
PC2 (20.0%)
0.01
0.00
-0.01 -0.02 -0.01 0.00 0.01 0.02
PC1 (67.0%)
说明:在二维的PCA得分图上有一些样本存在于95%的置信区间之外,但是查看原 始谱图并没有明显的异常,所以仍然保留这些样本。从图中可以看出,不同组的样本 尽管有所重叠,但是总体来说有比较清晰的区分,说明PCA可以提示三种不同的病 人在代谢信息上有所区别。
代谢组学介绍
从狭义上来讲,代谢组学是通过比较对照组和实验组的代谢组( metabolomes, 某一生物的所有代谢物组分),以寻找其代谢谱差 异的研究方法。
VS
安捷伦公司将其称为:
发现代谢组学
靶标代谢组学
代谢组学检测方法
不同技术平台优缺点
NMR 优点: 优点:无损伤性,无辐射性,无偏向性,方法灵活,处理简单,成本低
缺点: 缺点:灵敏度较低,动态范围有限
GCGC-MS 优点: 优点:较好的分离效率和检测灵敏度,易定性
缺点: 缺点:衍生化限制了应用范围,具有偏向性
LCLC-MS 优点: 优点:灵敏度较高,无需衍生化 缺点: 缺点:分离率不高,时间较长,具有偏向性,不易定性
2、图谱 、
使用TopSpin软件(V3.0, Bruker Biospin, Germany)对谱图进行了傅立叶变换,相位调整, 基线校正,及定标等处理。
说明:核磁共振谱图以乳酸在1.33ppm处的双峰定标,积分区间为9.0-0.4ppm, 积分间距为0.005ppm,去掉5.225-4.66ppm一段包含残余的水峰。
代谢组学检测分析实例二
3、PCA分析 、 分析
代谢组学检测分析实例二
4、模型判别(ROC曲线、PLS/OPLS-DA判别) 、模型判别( 曲线、 判别) 曲线 判别
4、差异物质筛选 、
代谢组学检测分析实例二
代谢组学检测分析实例二
1、样品数量 、
PCa(前列腺癌): 20例 尿液 (前列腺癌): 例 正常对照: 例 正常对照:20例 尿液
2、图谱 、
原始基峰离子(BPI)色谱图,初步观察仪器的保留时间重现性,观察测得的物质数量, 不同组之间的色谱图的差异。
不同技术平台优缺点
化合物分类及其最适的分析技术
糖类物质衍生化以后用GC-MS检测
代谢组学的应用
疾病诊断与发病机制研究 药物毒理学、新药筛选、 药物毒理学、新药筛选、药物安全评价 中医药现代化及中西医结合应用研究 农业与植物研究 微生物与发酵研究等
S
40 20 t[2]O 0 -20 -40 -40 -20 0 t[1]P 20 40
R
R2X=69.7%, Q2=0.201 说明:从OPLS-DA的结果可以来看模型的预测准确性,在S和R组的模型中,S组被预测的 正确率为42/64=65.6%,R组被预测的正确率为20/30=66.7%;
代谢组学检测分析实例一
第3页
公司取得的成果
300多家来自医院和高校等 50多篇SCI 影响因子累计超过100分
40余项专利技术,5项软件著作权
10多项基金项目
代谢组学介绍
代谢组学介绍
基因组
转录组
蛋白质组
敏芯现有平台: Waters ACQUITY UPLC超效液相色谱仪和 敏芯现有平台: Micromass Q-TOF Premier质谱联用仪 NMR 氢谱(1H NMR)、碳谱(13C NMR)及磷谱(31P NMR) HR-MAS NMR(高分辨魔角旋转核磁共振),HPLC-DAD-MS-SPE-NMR 敏芯现有平台: 敏芯现有平台:Varian Inova600MHz® (配置超低温探头) NMR系统, Bruker 600MHz例 (不得低于200ul/例),一定避免反复冻融。 血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后离心取上清装载干净的离心管中,再离 心5分钟,8000rpm,取上清分装到冻存管中,每管0.5ml,-80度冻存寄送。 注意:1)取血时如用酒精消毒,请擦干擦拭部位,待酒精完全挥发后再取样。 2)取血时如用麻醉剂,建议用异氟醚 ,防止在NMR血清谱图中出现干扰峰。 3)如要采用血浆,请务必使用肝素钠抗凝管。
高通量测序数据分析 基因组分析 蛋白质组学 代谢组学 文献挖掘 生物信息培训
miRNA测序、mRNA测序、基因组重测序、 甲基化测序、ChIP-Seq
microRNA分析、LncRNA分析、基因调控网络构建 蛋白质芯片(SELDI)、细胞因子芯片、 ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D 液质联用(LC-MS)、气质联用(GC-MS)及核磁共振(NMR) 的实验及数据分析 Disease&Gene文献挖掘、Gene&Gene文献挖掘、植物 相关文献挖掘,微生物相关文献挖掘 集中开班及上门培训,现已成功举办六期培训班
说明:The correlation coefficient of│r│> 0.355 was used as the cutoff value for the statistical significance based on the discrimination significance at the level of p=0.05 and df (degree of freedom) = 29 (for S-R and R-N)
阈值0.05 0.05) 1)T-test的p值(阈值0.05) test的 PLS-DA模型第一主成分的VIP( 模型第一主成分的VIP Projection) 阈值>1),并结合 >1), 2)PLS-DA模型第一主成分的VIP(Variable Importance in the Projection)值(阈值>1),并结合 检验( test)的 阈值0.05 来寻找差异性表达代谢物。 0.05) 学生氏t检验(t-test)的p值(阈值0.05)来寻找差异性表达代谢物。 通过OPLS DA分析各代谢物相应的相关系数 然后与相应的相关系数临界值表进行比对, OPLS- 分析各代谢物相应的相关系数, 3)通过OPLS-DA分析各代谢物相应的相关系数,然后与相应的相关系数临界值表进行比对,得到引起组 间差异的代谢物。 间差异的代谢物。
代谢组学检测分析实例一
5、OPLS-DA 、
对PLS-DA模型进行正交矫正处理(OPLS-DA),使用SIMCA-P+软件(V11.0, Umetrics AB, Umea, Sweden)进行正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA),最大化地凸显模型内部 不同组别之间的差异。
代谢组学检测分析实例一