斑点印迹杂交ppt课件
Northern-Blot印迹杂交.ppt

五、结果与分析:
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13. 探针的纯化及比活性测定:
①准备凝胶:将1g 凝胶加入30 ml DEPC水中,浸 泡过夜。用DEPC水洗涤膨胀的凝胶数次,以除 去可溶解的葡聚糖。换用新配的TE (pH 7.6)。
② 取1 ml 的注射器,去除内芯推扞,将注射器底 部用硅化的玻璃纤维塞住,在注射器中装填 12Sephadex G-50。
冰上5 min。 ③ 短暂离心,将溶液收集到管底。
16.杂交: ① 加入0.5 ml ULTRAhyb到变性的探针中,混匀
后,将探针加到预杂交液中。 ② 42℃杂交过夜(14~24 h),杂交完后,将杂
交液收集起来于-20℃保存。
17.洗膜:加入High Stringency Wash Solution 2 (100cm2膜面积加入20 ml洗膜溶液),42℃ 摇动 洗膜20 min两次。
5. 电泳: 将RNA样品小心加到点样孔中,5V/cm 下进行电泳(在电泳过程中,每隔30 min 短暂 停止电泳,取出胶,混匀两极的电泳液后继续 电泳),当胶中的溴纷蓝接近胶的边缘时终止 电泳; 紫外灯下,检验电泳情况,并用尺子测 量18S、28S、溴纷蓝到点样孔的距离(注意不 要让胶在紫外灯下曝光太长时间)。
10.将胶和紫外交联后的膜,在紫外灯下检测 转移效率。(避免太长的紫外曝光时间)。
11.将膜在-20℃保存。
12. 探针的制备:
① 在1.5ml离心管中配制以下反应液: 模板DNA(25 ng) 1μl;Random Primer 2 μl ; 灭菌水 11 μl ;总体积:14 μl 。
② 95 ℃加热3 min后,迅速放置于冰冷却5 min。
③在离心管中按下列顺序加入以下溶液:
8.印迹杂交技术

55
用ASO探针分别与待测DNA进行杂交
只与正常探针杂交-正常纯合子 结果 与正常及突变探针均杂交-杂合子
地高辛标记
18
生物素-11-dUTP
19
异硫氰酸荧光素
罗丹明
荧光素
20
四、探针标记的方法
1.切口平移标记法
2.随机引物标记法 3.PCR标记法
4.末端标记法
21
(一)缺口平移标记法
22
(二)随机引物标记法
23
(三)PCR标记法
以四种dNTP(其中一种为标记dNTP)
为底物,扩增产物即为标记DNA,可作 探针使用,其灵敏度和特异性很高。
上,转移后各待测核酸片段在固相膜 上的相对位置和在凝胶中的相对位置
一样。此过程最重要的是要保持核酸
片段的相对位置不变。
31
固相膜:硝酸纤维素膜、尼龙膜 活化滤纸
印迹方法 毛细管虹吸转移法(毛细转移)
真空转移法 电转移法(电泳转移)
32
(1) 毛细管虹吸转移法
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(2)真空转移法
34
(3) 电转移法
片段的大小和含量
40
41
第四节 核酸分子杂交的分类
根据杂交核酸分子的种类:
DNA与DNA杂交
DNA与RNA杂交 RNA与RNA杂交
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根据杂交探针标记的不同: 同位素杂交
非同位素杂交
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根据杂交介质的不同: 液相杂交 点杂交/狭缝杂交
医学分子生物学第九章印迹杂交技术

cDNA。 将标记后的cDNA与点好的芯片进行杂交。 激光扫描芯片杂交结果,计算机处理。 分析杂交数据。
基因芯片
芯片杂交操作流程:
基因芯片
经大规模PCR扩增获得独立cDNA插入片段
人工制作芯片
商业化芯片
分别用cy3(绿色)和cy5红色两种荧光燃料标记两 种cDNA
23 ICK
4 IL-3
22 MIP-3 alpha
25 MMP-8
原始值
model
normal
30386
12625 14732 14606 11547.5 9262.5 20601 16912 16590.5 22787 28232.5
12482.5
7836.5 8059.5 8564.5 6742.5
辣根过氧化物酶源自底物产物, 并发出光辣根过氧化物酶:HRPO 底片曝光
③ Blotting过程
1)牛血清白蛋白封闭硝酸纤维素膜 2)先用一抗(待测蛋白的单克隆抗体)与
膜上的蛋白结合。 3)洗去未结合的一抗。 4)用二抗与一抗结合(二抗上带有HRPO)。 5)清洗掉未结合的二抗。 6)显影,检测
④结果 单抗blotting 结果
在蛋白质凝胶电泳以后,用转膜和免疫的方法检测 胶上的蛋白质泳带。
(1)SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS-PAGE):
是蛋白质的变性剂,使煮沸变性的蛋白质维持线 性状态,并与蛋白质结合,使蛋白质带上负电荷。
② 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) (Polyacrylamide gel electrophoresis)
(一)核酸的变性与复性
复性
RNA
DNA
斑点印迹杂交(共7张PPT)

预杂交的:将探膜封针入15〕ml离,心管中放,做射好剪自角标显记。 影,判断是否有杂交或其杂交强度,主 要用于基因缺失或拷贝数改变的检测。根据点样磨具不同, 点样形状呈圆形称为斑点杂交,呈狭缝形那么称为狭缝杂交。
斑点杂交:是指将待测的DNA变形后点加在硝酸纤维素膜〔或 5 洗膜:倒掉杂交液,洗液1(每次5ml〕洗膜三次〔洗液1预热到42℃〕,每次5min;
预杂交:将膜封入15ml离心管中,做好剪角标记。
再将洗液2 (每次5ml〕洗膜两次〔预热到42℃〕,每次15min。
尼龙膜〕上,用已标记的探针进行杂交,洗膜〔除去未结合 封闭杂交膜上非特异性的蛋白结合位点
立即置于冰中5min〔使DNA变性〕,参加 根据点样磨具不同,点样l 20×SSC混匀。 封闭杂交膜上多余的非特异性DNA结合位点
置42℃恒温摇床上,轻轻振摇30min。
点样:将上述变性后的样品180ul点在尼龙膜的 预杂交:将膜封入15ml离心管中,做好剪角标记。
第3页,共7页。
斑点印迹杂交不需要电泳和转移,杂交过程包括点 样,变性,中和,枯燥固定,预杂交,杂交,封闭, 检测杂交结果等步骤,相对southern印迹杂交和 Northern印记杂交来说快,适合于同时分析多个样 品。
第4页,共7页。
实验步骤:
变性:按8:1将80ul ddH2O参加至10ul待测 DNA样品中,稀释样品。100℃加热10min后,
中120℃烘烤15min。使变性的DNA与膜结合 杂交的双方是待测核酸及探针。
杂交的双方是待测核酸及探针。
牢固 点样:将上述变性后的样品180ul点在尼龙膜的毛面上,真空抽滤,室温下风干后,于烤箱中120℃烘烤15min。
斑点印迹原理、操作步骤及应用

斑点印迹原理、操作步骤及应用一、原理斑点印迹(dot blot)是一种定性检测核酸或蛋白质的技术,其基本原理是硝酸纤维素膜和醋酸纤维素膜具有很强的静电吸附力,在中性条件下即可有效地吸附蛋白质等生物大分子,因而将抗原吸附于纤维素膜后,就可利用纤维素膜作为固相载体进行抗原-抗体反应。
当加入抗体后即可与膜上的抗原结合,然后再加入带有标记物的抗体,使标记通过抗抗体和相应抗体的结合间接地交联于纤维素膜上。
加入标记物相应的底物后,标记物即可与底物作用形成不溶性产物,呈现斑点状着色,从而判定结果。
二、材料免疫斑点印迹所需的材料包括硝酸纤维素膜(或尼龙膜、NC膜),PBS缓冲液,抗原、抗体、标记二抗、相应底物,洗涤液、封闭液,37℃湿盒和温箱。
三、操作步骤免疫斑点印迹根据所用的二抗标记物不同,又可分为:①辣根过氧化物酶免疫斑点试验;②碱性磷酸酶免疫斑点试验;③金银染色免疫斑点试验(使用胶体金作为抗抗体的标记物)等。
其中最常用的是以辣根过氧化物酶标记系统为基础的免疫斑点试验。
具体操作步骤如下:1.抗原包被将0.01mol/L PBS pH 7.4稀释的已知抗原液2μl点于硝酸纤维素膜(或醋酸纤维素膜)上,置37℃温箱中干燥20~30分钟。
2.封闭滴加封闭液37℃温盒中封闭10分钟,用洗涤液洗1~2次,滤纸吸干。
3.抗原抗体结合加用稀释液稀释的抗体或待检标本,置37℃湿盒中30分钟。
4.洗涤用洗涤液震洗3次×3分钟、吸干。
5.加酶标二抗加入经过辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶或胶体金标记的抗抗体,孵育、震洗、吸干。
6.显色加相应标记抗抗体的底物溶液显色5~10分钟,终止反应,观察结果。
四、注意事项免疫斑点印迹要求包被的抗原处于最适浓度,多以蛋白质含量500~1000μg/ml为宜。
浓度过高可出现假阳性,过低则降低试验的敏感性。
注意酶结合物的浓度,最适浓度常与包被抗原浓度有关,应根据试验具体条件作方阵滴定来确定。
第十二章 印迹杂交技术

二、RNA印迹法(Northern blot)
操作:与Southern印迹极为相似,但不需要酶切可直 接变性转移; RNA经变性后再电泳(可用甲酰胺、甲醛等 使RNA变性,不能用碱,易使RNA降解); 电泳时不能加EB,影响RNA与膜结合; 严防RNase污染。 用途:检测RNA(定性或定量分析细胞内总RNA或 某一特定RNA,特别是分析mRNA的大小和含 量)——研究基因插入缺失等突变、基因表达(金 标准)。
一、核酸探针
——带有标记物且序列已知的核酸片段, 能与待测核酸中的特定序列特异杂交。
• 核酸探针是否合适是决定核酸杂交分析 能否成功的关键。
核酸杂交与分子探针
核酸探针应具有的条件
① 特异性高:只与待测核酸样品中的 互补序列杂交。 ② 带有标记物:标记物灵敏度高而稳 定,检测方便。
核酸探针的种类
常用核酸杂交分类
杂交方法
Southern印迹 Northern印迹 斑点杂交 菌落杂交和噬斑杂交
适用范围
检测经凝胶电泳分开的DNA 分子,需转印到膜上 检测经凝胶电泳分开的RNA 分子,需转移到膜上 检测未经分离的,固定在膜上的 DNA或RNA分子 检测固定在膜上的,经裂解后从 细菌和噬菌体中释放的 DNA分子 检测细胞或组织中的DNA或 RNA分子
2.非放射性标记物
优点:无环境污染,可长时间贮存。 • 生物素:
一种小分子水溶性维生素,连接在碱基上 和抗生物素蛋白(avidin)特异结合 抗生物素蛋白上连接有显色物质(酶、荧光素等) 。 • 酶促显色:
碱性磷酸酶(ALP或AKP):催化底物(5-溴-4-氯-4吲哚 磷酸,BCIP)和硝基蓝四氮唑(NBT),生成不溶性紫色 化合物二甲臜; 辣根过氧化物酶(HRP):催化底物二氨基联苯胺(DAB) 生成红棕色沉淀物;或催化底物四氨基联苯胺(TMB)生 成蓝色沉淀物。
《杂交技术》幻灯片PPT

C
1
2
3
4
5
6
7
8
rRNA
Northern杂交检测
〔四〕、Western杂交
1、定义、 是将蛋白质先经电泳〔 SDS —PAGE 胶〕别离,
然后转移到固相载体上,最后用特异性抗体进 展免疫测定或蛋白质的染色。
Western 印迹法又称蛋白质印迹技术,它是70年 代末,80年代初开展起来的一种蛋白质检测新 技术。其根本过程
结合的探针〔用放射性检测仪探测放射强度〕。
(5) 洗完的膜用滤纸吸干膜外表的水份,并用保鲜膜包裹,
且保鲜膜与NC膜之间不能有气泡。
X光片,每一片都用透明胶带固定,合上暗盒, 置-70℃低温冰箱中曝光。
(7) 根据信号强弱决定曝光时间,一般在1-3天时间。洗片
2. 随机引物合成法
• 随机引物:能与任何DNA模板的多个位点配对互
补的多个不均一序列寡聚核苷酸DNA片段。
• 随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA
模板结合,在DNA聚合酶Klenow大片段的作用下,
能在随机引物的引导下以带有标记物的dNTP为 原料合成新的与模板DNA互补的探针。 • 通常产物平均长度为400-600个核苷酸。
3、 RNA变性电泳的方法
用一定剂量的乙二醛-二甲基亚矾,或甲醛和甲基氢 氧化汞等处理RNA样品和凝胶,使双链RNA在电泳过 程中变性而完全解离形成单链。
Northern 杂交和 Southern 杂交主要区别在于: Northern 杂交中待测的物质是 RNA。 Southern 杂交中待测的物质是 DNA。
blot一词,有不同翻译,有人叫“印迹法〞, 也有人翻译为“斑渍法〞,更为普通的 是直接称为Southern blot)
混合斑的检验学习课件PPT

Y染色体:
优点 1不用分离精液成分和阴道液成分,两者 1/100~2000 时仍可正确检出精子 DNA,避免了操作过程中 精子DNA的损失,提高了检出阳性率 2 精子细胞比体细胞更稳定,保存 25 年的阴 道式子Y-STR获得成功 3可以推测犯罪嫌疑人的数目----轮奸案 注意提取多个部位的检材或一个检材的 不同部位,分别提取DNA 注意 可以排除,但不可以肯定
糖链----ABH特异性抗原,用A、B、O红细胞和AB型人血清吸收 蛋白----有器官特异性抗原 解离试验 +混合斑的浸出液 ELISA夹心法
Y
血清型、酶型
对比推断:血清型---- Gm、Km 酶 型----PGM1、Fu
DNA分析
常染色体:
关键---获得纯净的精子DNA-----差异裂解或二步抽提法 原理:精子细胞的表面蛋白含有大量的二硫键,可以抵抗去垢剂 SDS 核蛋白酶K的消化,而其他组织的细胞膜则可以被这两种物质消化。 方法:第一步:检材+1%SDS+100ug/ml蛋白酶K---37度2~3h 500r/min离心15min、去上清,精子留在沉淀物中 第二步:+40Mm/L DTT+1%SDS+100ug/ml蛋白酶K---注意:消化条件选择----主要是第一步消化时间 消化不完全----当阴道上皮细胞过多,不能使两者彻底分离 过渡消化----可能消化一部分精子细胞,导致精子DNA减少 *** 实际操作前,应进行涂片检查,根据精子和阴道上皮 细胞的比例,对消化时间、温度、试剂的浓度等进行 适当的调整 提取方法选择----采用有机溶剂的方法比较好 酚-氯仿能够去掉混合斑中的精浆蛋白,阴道分泌液、细 菌污染严重的的,用有机溶剂提取后,用5%clekex100提1次。
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实验目的
掌握斑点印迹杂交的原理及方法
实验原理
杂交:具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及
离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。
杂交的双方是待测核酸ຫໍສະໝຸດ 探针。斑点杂交:是指将待测的DNA变形后点加在硝酸纤维素膜(或尼龙膜)
上,用已标记的探针进行杂交,洗膜(除去未结合的探针),放射自 显影,判断是否有杂交或其杂交强度,主要用于基因缺失或拷贝数改 变的检测。根据点样磨具不同,点样形状呈圆形称为斑点杂交,呈狭
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酶联抗体结合:倒掉封闭液,加入 3ml亲和素-辣根过氧化物 酶(HRP),于37℃轻轻振摇30min。酶联抗体与生物素结合
8 洗膜:倒掉第七步骤中液体,加入 5ml洗液3,洗膜三次,每次 2-3min。洗去未结合的酶联抗体
9 显色:洗膜后,加3ml的显色液避光显色1-2min,斑点出来后
就可倒掉显色液,用ddH20冲洗几次,终止显色。
2h。变性DNA与探针结合
5 洗膜:倒掉杂交液,洗液1(每次5ml)洗膜三次(洗液1预热到
42℃),每次5min;再将洗液2 (每次5ml)洗膜两次(预热
到42℃),每次15min。洗去未结合的探针,否则本底会太高 6 封闭:倒掉洗液2,加入5ml封闭液,37℃作用15min。封闭杂交
膜上非特异性的蛋白结合位点
• 点样:将上述变性后的样品180ul点在尼龙膜的毛面上,真空抽滤,
室温下风干后,于烤箱中120℃烘烤15min。使变性的DNA与膜结合牢固 1 预杂交:将膜封入15ml离心管中,做好剪角标记。加入预杂交液3ml。
置42℃恒温摇床上,轻轻振摇30min。封闭杂交膜上多余的非特异性DNA结
合位点
2 杂交:加入探针3ml(生物素-DNA),置42 ℃恒温床上,轻轻振荡1-
斑点杂交预期结果图
制备样品→点样→固定(可用斑点杂交仪 或直接点样)
NCF 滤纸 支撑板 至真空泵 点样板
96孔 12×8
废液储槽
缝形则称为狭缝杂交。
斑点印迹杂交不需要电泳和转移,杂交过程包括点样,
变性,中和,干燥固定,预杂交,杂交,封闭,检测杂交
结果等步骤,相对southern印迹杂交和Northern印记杂交
来说快,适合于同时分析多个样品。
实验步骤:
1 变性:按8:1将80ul ddH2O加入至10ul待测DNA样品中,稀释样品。 100℃加热10min后,立即置于冰中5min(使DNA变性),加入90ul 20×SSC混匀。