DH3和HC2和COBAS产品比较
通用型基因组dna试剂盒性能大比拼

通用型基因组DNA试剂盒性能大比拼自从上次“实测快速通用型基因组DNA提取试剂盒的性能”文章发布后,已经有很多客户向我们申请了试用装,使用的反馈效果也不错。
其中某生物科技有限公司更是做了多家试剂盒的测试对比,接下来小新就将该公司测试的结果分享给大家,毕竟产品自测的效果难免让人怀疑有做广告的嫌疑,第三方的测试才会显得公平公正。
一、实验材料试剂盒:**赞(DC112-01)、**金(EE101-01)、*根(KG203)、新景(3105005)、*为(CW2298M)样本:小鼠肌肉、猪血、大肠杆菌(DH5α)、夹竹桃叶片二、实验方法1.样本处理:A.小鼠肌肉:称取20mg,液氮研磨成粉;B.猪血:取200μl全血;C.大肠杆菌(DH5α):1.5ml菌液离心取细菌沉淀;D.夹竹桃叶片:称取100mg,液氮研磨成粉。
2.按照各试剂盒说明书操作,提取DNA。
3.用超微量分光光度计测量提取的DNA,并进行电泳检测和Qubit检测。
三、实验结果1.超微量分光光度计测量结果如下:2.电泳检测结果如下:3.Qubit检测结果如下:四、分析与讨论1.从超微量分光光度计测量结果看,小鼠肌肉样本提取效果最好的是**赞,猪血样本提取效果最好的是**赞,大肠杆菌样本提取效果最好的是*为,夹竹桃叶片样本提取效果最好的是新景。
2.从电泳结果看,小鼠肌肉样本提取效果最好的是新景,猪血样本提取效果最好的是**赞和新景,大肠杆菌样本提取效果最好的是**赞,夹竹桃叶片样本提取效果最好的是新景。
(*根试剂盒提取的样本电泳均未显示条带,但浓度高的原因是该试剂盒为快速样品制备试剂盒,样本裂解处理后DNA已经降解成小片段,虽然可以直接用作qPCR检测,但电泳已经观察不到DNA条带。
)3.从Qubit检测结果看,小鼠肌肉样本提取效果最好的是**赞,猪血样本提取效果最好的是新景,大肠杆菌样本提取效果最好的是*为,夹竹桃叶片样本提取效果最好的是新景。
全自动化学发光分析仪性能参数比较罗氏雅培贝克曼拜耳等收集自网络

附件一标准曲线稳定期28天(7天-lowvolume)28天(7天-lowvolume)28天(8天-lowvolume)28天56天28天56天●检测项目★甲状腺、激素、肿瘤标志物、肝炎、心肌标志物、贫血、骨标志、糖尿病、和免疫球蛋白等70多个项目,种类齐全,且每年有新项目上市。
★甲状腺、激素、肿瘤标志物、肝炎、心肌标志物、贫血、骨标志、糖尿病、和免疫球蛋白等70多个项目,种类齐全,且每年有新项目上市。
★甲状腺、激素、肿瘤标志物、肝炎、心肌标志物、贫血、骨标志、糖尿病、和免疫球蛋白等70多个项目,种类齐全,且每年有新项目上市。
30项左右,项目数太少,不利于以后的项目开展。
★TORCH、肝炎、肿瘤、性激素、甲状腺、代谢类、EB病毒、贫血、自身免疫疾病、心肌标记物、脓毒血症、骨与矿物质、等80余项。
项目有限,乙肝两对半定量等常用项目不全。
可扩展性可以与c501组成cobas 6000血清工作站,并可有多种组合方式。
可以与c301组成cobas 4000血清工作站,并可有多种组合方式。
可以与c8000全自动生化仪组成ARCHITECTci8200。
单机系统单机系统,与DxC800连接需要额外的硬件支持整体评价:一、从技术的先进性二、罗氏E601能满足三、罗氏E411除了速四、雅培i2000主要缺五、贝克曼DxI800,六、索灵LIAISON速度七、进口全自动化学*雅培是传染病(肝炎ACS系列第三代产品56天。
三家国产试剂盒HPV分型检测结果一致性比较分析

三家国产试剂盒HPV分型检测结果一致性比较分析余红;陆其兵【摘要】目的比较分析三家国产试剂盒HPV分型检测结果的一致性.方法收集近2个月来由之江检测的阳性标本82份,阴性标本10份,分别用3家国产试剂进行HPV基因分型检测2次,并进行比较.结果三家试剂结果重复性分别是之江95.6%,凯普96.7%,安普利95.6%.三家试剂检测结果完全一致率为51.1%(47/92),部分一致率为24.9%(22/92),不一致率为25.0%(23/92).单一型感染的一致率86.4%(32/37),多重感染完全一致率为22.2%(10/45),部分一致率为48.9%(22/45).结论三家国产试剂检测结果一致性不理想.建议患者进行前后治疗的效果对比,最好选在同一家医院进行检测,这样才具有可比性.【期刊名称】《临床输血与检验》【年(卷),期】2019(021)003【总页数】3页(P320-322)【关键词】人乳头瘤病毒;国产试剂盒;结果一致性【作者】余红;陆其兵【作者单位】224400 江苏省阜宁县人民医院检验科;224400 江苏省阜宁县人民医院检验科【正文语种】中文【中图分类】R373.9;R446.11人乳头瘤病毒(HPV)是常见的一种性传播疾病的病原体,分为高危型和低危型,其中高危型HPV感染已被证实与宫颈癌的发生密切相关,HPV检测在宫颈癌筛查中越来越受到重视[1]。
目前HPV检测主要采用分子生物学方法,我国注册的HPV检测试剂盒大部分检测L1基因序列,也有检测全基因组或HPV E6/7序列,但分子生物学方法检测技术也并不完美,这些设计无法顾全到HPV型别全覆盖和型别特异等问题。
本文选用了三家国产试剂进行HPV分型检测并进行比较,发现三家国产试剂检测结果的一致性很不理想。
材料与方法1 仪器与试剂仪器为上海复星SLAN-96S实时荧光扩增仪,三家国产试剂分别是上海之江生产的HPV分型试剂:6+11、16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68、82,其中两个低危不分型。
cobas b 123竞争产品比较

小巧、便携,内置电池,电池供 电可进行15个测试 SafePICO自动混匀器,减少分析 前误差,节省时间 仅需65µl样本,35s得到结果, 从一个结果到下一个结果仅需80s
ABL 90 的缺点
快速的检测导致准确性受质疑 不能检测红细胞压积(Hct) 试剂包不是完全密封,有泄漏风 险 手动进样,仅适合右手进样 进样针需要经常更换且容易发生 样本泄漏 试剂包最长仅能保存120天
更换电极盒后启动时间约为10 min 试剂包中包含3个水平的质控液 电极盒上机时间长达30天 超过40项计算参数
机上仅能储存1000个患者数据, 没有WIFI无线连接
没有酸碱平衡图和病人趋势图
page 6 © 2009 Roche
ABL 90 优点的反驳
• ABL 90 能很快得到检测结果 • cobas b123 的检测也非常快速,相差1分钟对于病人管理并没有太大 意义。此外,雷度声称的35 s检测时间也并不准确,实际需要1 min~1 min 20 s。
泵可能出现问题:如漏水等
ABL 800 缺点
• 采用单独分开的电极,需要定期更换电极膜,且电极价格昂贵(单 个电极高达上万元) • 采用气体定标,物流成本高且危险 • 打星号的结果——质疑自己的检测结果 • 多种不同的试剂,且使用的时间不一,冲洗液1~2周就需更换,繁琐 而浪费时间
• 血氧模块仅128波长
• 屏幕显示操作菜单,图标触摸显示屏 • iQM质控和远程数据管理 • 可选配血氧、血凝组件
• 有多参数、多规格可选
• 极易堵包 • 无自动质控包 • 无内置血氧计
GEM Premier 3000
显示屏:那个更容易被用户接受?
DH和HC和COBAS产品比较

特点:无核酸提取,无扩增,无需PCR实验室,无需有资质工作人员
基于PCR技术
特点:有核酸提取,有扩增,需PCR实验室,需有资质工作人员
检测时间
4-5小时/90样本,270个样本/人/天
4-5小时/90样本,270个样本/人/天
>7小时/90样本
重复性
好,并且每次检测都做重复性
好,并且每次检测都做重复性
12个月
实验室要求
小,普通房间,120cm×60cm的工作台即可
小,普通房间,120cm×60cm的工作台即可
检测仪器
化学发光仪,直接检测即可
化学发光仪,直接检测即可
结果判读
仪器判读,直接出报告
仪器判读,直接出报告
报告形式
能显示相对病毒载量
能显示相对病毒载量
规格型号
96测试/盒、48测试/盒
96测试/盒
960测试;240测试
批准日期
有效期
注:以上信息为CFDA官网上查询;2010年WHO确定的与宫颈癌相关的高危型HPV有14种,DH3和cobas检测14种,而HC2只检测13种,不包括HPV66型
技术原理
杂交捕获-化学发光法
特点:无核酸提取,无扩增,无需PCR实验室,无需有资质工作人员
商品名dh3hc2cobas产品名人乳头状瘤病毒hpv核酸检测试剂盒杂交捕获化学发光法高危型人乳头瘤病毒检测试剂盒杂交捕获二代法人乳头状瘤病毒hpv检测试剂盒pcr荧光法注册号国食药监械准字2014生产单位杭州德同生物技术有限公司qiagengaithersburgincrochemolecularsystemsin产品适用范围该产品用于体外定性检测子宫颈脱落细胞样本中的2hpv1618型和12hpv313335394551525658596668型人乳头状瘤病毒hpv核酸该产品用于对宫颈样本中的13种高危型人乳头瘤病毒hpvdna进行定性检测
常用的五种基因测序仪器的比较

上市时间
2002年 2007年 1月
2007年
2005年 2008年
2月
如何选择合适的测序仪
测序的准确度和各自的优势的考虑:比如是善于发
现插入、缺失突变还是善于发现碱基替换突变。
项目考量:比如重测序对于测序长度的要求没有从
头测序的要求高;对于需要依靠标签计数的测序项目,会更 加需要能将待测片段分割成尽量多、尽量小片段的测序方法。
大规模并行焦
ROCH-454
磷酸合成
GS FLX
测序法
通过质量优
化将错误率 可获得超过20 GB的
降低到0.1%
高品质数据
检测同 聚物
每轮运行能获得4-6 超长的读
亿个碱基对
长400bp
HeliScope
大规模并行单分子 焦磷酸合成测 序法
重新以反方 向再次 测序
目前测序读长较短
检测碱基 替换突变, 费用低
二、测序仪之——ABI SOLID
1. ABI SO• 连接酶测序:SOLiD连接反应的底物是8碱基 单链荧光探针混合物。连接反应中,这些探 针按照碱基互补规则与单链DNA模板链配对。 这样经过五轮测序反应后便可以得到所有的 碱基序列
• SOLID的双碱基编码矩阵
乳液PCR扩增 焦磷酸测序
2. ROCH-454的优势
• 454平台的突出优势是读长。目前454系统 的序列读长已超过400 bp。虽然454平台的 测序成本比其他平台要高很多,不过对于 那些需要长读长的应用,如从头拼接和环 境微生物组学,它仍是最理想的选择。
五、测序仪之——HeliScope
• 3. 简单、快速、自动化 Genome Analyzer系统高精确度的数据。自动化的流程不减少了手工操作误差和 污染可能性,也不需要机器人操作或洁净室。
罗氏HPV检测系统竞争性优势

可以
是否存在检测灰区
不存在
存在灰区(模糊值),阳性界值样本重复性差
保证结果稳定可靠
自动化程度
全自动
需大量手动操作:配置试剂、核酸提取过程、检测反应体系配置、检测数据需人工转移至分析平台
避免人工操作带来的实验结果偏差,保证结果稳定、可靠
污染控制
专利AmpErase酶技术,有效控制实验室污染
无
可有效避免实验室中之前实验产生的核酸气溶胶污染
大样本多中心临床验证
ATHENA临床验证(47000人)
无
检测结果经过临床验证,能够优化检测出≥CIN2病变的同时,最大限度地减少对一过性感染的检出率
是否有统一的判读标准
经过ATHENA验证的统一判定阈值
无,主观的肉眼观察,
避免人人为结果判读导致结果出现不稳定和误差
宫颈癌整体解决方案
与CINTec PLUS和CIINTec Histology组成从筛查到确诊的完成解决方案
无
四、cobasHPV检测与CervistaHPV检测(Invader Technology)参数较及优势价值:检测技术
实时荧光定量PCR技术
基于Invader?专利技术的酶切信号放大法
是否在检测高危型HPV的同时提供HPV16/18分型
可以
不可以,高危型HPV检测与HPV16/18分型分为两次检测
无
检测结果经过临床验证,能够优化检测出≥CIN2病变的同时,最大限度地减少对一过性感染的检出率
是否有统一的判读标准
经过ATHENA验证的统一判定阈值
无,主观的肉眼观察,
避免人人为结果判读导致结果出现不稳定和误差
宫颈癌整体解决方案
与CINTec PLUS和CIINTec Histology组成从筛查到确诊的完成解决方案
HPV分型试剂盒及市场各产品比较

HPV分型试剂盒1、HPV目前市场上主要产品:杂交法(达安19、凯普21、亚能23、透景26);实时荧光PCR(之江13种高危分型、港龙凯普亚能13种高危不分型、达安8个型定量);第二代杂交捕获法(HC2)等2、操作方法:①HPV所有厂家标本处理操作流程(包括之江生物,都大同小异):②HPV实验:A、杂交法:首先加样上PCR仪做扩增,上机时间大约一个半小时左右。
PCR 完成后做杂交,目前市场上有手工杂交和使用杂交仪杂交。
操作时间2-4个小时。
B、第二代杂交捕获法(HC2):原理是利用对抗体捕获信号的放大和化学发光信号的检测DHA DNA-RNA 抗体 化学发 计算机 分解 杂交 捕获 光检测判读 45ntin 60min 60min30min15minfaC 、荧光定量PCR :直接上机通过荧光信号累积实时监测整个PCR 进程,之江生物是用多重PCR 对标本进行准确的13个高危型的具体分型,其他不具体分型。
举例之江产品:之江八管双通道仪器(双色荧光PCR 仪器都可以用):123456789101112一排八管做一个标本即可具体分型! 结果判断:ABI7500480CFX96SLAN96PCRA B C D四管做一个标本即可具体分型!3E F G H4、上海之江HPV优劣势:•优点:①闭管PCR操作,避免扩增污染②能够对13个高危型精确分型③灵敏度高,操作简单,减少了杂交的操作程序,一个实验大约2个小时内完成④针对开放荧光PCR检测系统,无需额外增加设备,有人员培训基础。
⑤可以相对定量:Ct值M30(+);30>Ct值M24(++);Ct值V24(+++)•缺点:①检测通量还比较小,每次24样本。
②需要多色荧光PCR仪。
5、市场大约销售价格:目前市场上两种收费政策:分型345元,定量165元。
两种产品市场销售价格分型:110-170不等,定量80元左右。
市场目前形势:分型量很小,定量市场量很大。
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96测试/盒、48测试/盒
96测试/盒
960测试;240测试
批准日期
有效期
注:以上信息为CFDA官网上查询;2010年WHO确定的与宫颈癌相关的高危型HPV有14种,DH3和cobas检测14种,而HC2只检测13种,不包括HPV66型
技术原理
杂交捕获-化学发光法
特点:无核酸提取,无扩增,无需PCR实验室,无需有资质工作人员
杂交捕获-化学发光法
特点:无核酸提取,无扩增,无需PCR实验室,无需有资质工作人员
基于PCR技术
特点:有核酸提取,有扩增,需PCR实验室,需有资质工作人员
检测时间
4-5小时/90样本,270个样本/人/天
4-5小时/90样本,270个样本/人/天
>7小时/90样本
重复性
好,并且每次检测都做重复性
好,并且每次检测都做重复性
DH3和HC2ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱcobas产品比较
商品名
DH3
HC2
cobas
产品名
人乳头状瘤病毒(HPV)核酸检测试剂盒(杂交捕获-化学发光法)
高危型人乳头瘤病毒检测试剂盒(杂交捕获二代法)
人乳头状瘤病毒(HPV)检测试剂盒(PCR荧光法)
注册号
国食药监械(准)字2014第3401443号
国食药监械(进)字2012第3404455号
12个月
实验室要求
小,普通房间,120cm×60cm的工作台即可
小,普通房间,120cm×60cm的工作台即可
检测仪器
化学发光仪,直接检测即可
化学发光仪,直接检测即可
结果判读
仪器判读,直接出报告
仪器判读,直接出报告
报告形式
能显示相对病毒载量
能显示相对病毒载量
该产品用于对宫颈样本中的13种高危型人乳头瘤病毒(HPV)DNA进行定性检测。本试剂盒所检测的HPV类型包括16/18/31/33/35/39/45/51/52/56/58/59/68高危型HPV。该产品对上述高危型HPV不做具体分型。
该产品用于体外定性检测患者宫颈细胞样本中的人乳头瘤病毒。这项检测通过多聚酶链反应(PCR)和核酸杂交技术扩增靶点DNA,可在一个单独的测试中检测14种高危型HPV。这项检测可以特异性的鉴别HPV16和HPV 18亚型,同时在临床相关感染水平上检测其它的高危亚型(31,33,35,39,45,51,52,56,58,59,66和68b)。
好,提取过程和扩增过程均由机器完成
检测靶标
全长探针,不会因部分片段缺失或变异而漏诊;
探针试剂为工作液
全长探针,不会因部分片段缺失或变异而漏诊;
探针试剂需要稀释配制成工作液方可使用
抗污染能力
不涉及扩增,不会造成污染
不涉及扩增,不会造成污染
抑制反应
无
无
储运条件
整个试剂盒2-8℃
整个试剂盒2-8℃
有效期
12个月
国食药监械(进)字2012第3402469号
生产单位
杭州德同生物技术有限公司
QIAGEN Gaithersburg, Inc
Roche Molecular Systems,Inc
产品适用范围
该产品用于体外定性检测子宫颈脱落细胞样本中的2种(HPV16、18型)和12种(HPV31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、68型)人乳头状瘤病毒(HPV)核酸