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siRNA 中文操作手册(lipo2000)
THE RNAi COMPANYRNAi 产品使用手册上海吉玛制药技术有限公司Shanghai GenePharma Co.,Ltd.Ⅰ. RNAi 简介 1A. RNAi 实验原理B. RNAi 实验流程C. RNAi 实验所需试剂D. 上海吉玛 RNAi 相关产品Ⅱ. siRNA设计7A. 哺乳动物siRNA设计B. 上海吉玛 siRNA 产品特性C. siRNA oligo 技术数据Ⅲ. siRNA 对照9A. 普通阴性对照B. 荧光标记的阴性对照C. siRNA阳性对照D. 转染试剂对照E. 避免off-target对照Ⅳ. siRNA 转染10A.siRNA 转染的方法B.Lipofectamin2000 转染试剂C.Lipofectamin2000适用的细胞类型D.转染前细胞培养E.Lipofectamin：siRNA/DNA比例F.贴壁细胞转染程序G.悬浮细胞siRNA转染程序H.DNA和siRNA共转染细胞程序I. 体内siRNA导入方法J. siRNA转染常见问题与建议Ⅴ. mRNA水平RNAi效果监测15A. siRNA细胞转染条件优化B. Real-Time PCR RNAi 效果检测C. Real-Time PCR 结果分析Ⅵ. 蛋白质水平RNAi效果监测20A. western-blot原理B.western-blot操作步骤wC.estern-blot上样液的制备D.western-blot常用试剂的配制Ⅶ. RNAi实验常见问题解答22Ⅰ. RNAi 简介A. RNAi实验原理RNA干扰（RNA interfering，RNAi）现象是由与靶基因序列同源的双链RNA（double-stranded RNA，dsRNA）引发的广泛存在于生物体内的序列特异性基因转录后的沉默过程。
细胞中的核糖核酸酶III家族成员之一的，dsRNA特异性的核酸酶Dicer将dsRNA裂解成由21-25个核苷酸组成的小干扰RNA (small interfering RNA，siRNA)，随后siRNA作为介导子引起特异性地降解相同序列的mRNA，从而阻断相应基因表达的转录后基因沉默机制。
酶免分析加样系统star操作流程
酶免分析加样系统star操作流程下载提示：该文档是本店铺精心编制而成的，希望大家下载后，能够帮助大家解决实际问题。
文档下载后可定制修改，请根据实际需要进行调整和使用，谢谢!本店铺为大家提供各种类型的实用资料，如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等，想了解不同资料格式和写法，敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by this editor. I hope that after you download it, it can help you solve practical problems. The document can be customized and modified after downloading, please adjust and use it according to actual needs, thank you! In addition, this shop provides you with various types of practical materials, such as educational essays, diary appreciation, sentence excerpts, ancient poems, classic articles, topic composition, work summary, word parsing, copy excerpts, other materials and so on, want to know different data formats and writing methods, please pay attention!酶免分析加样系统STAR操作流程介绍酶免分析加样系统STAR（Sample and Transfer Robot）是一种用于自动化生物化学分析的先进设备。
批量导出芯片探针与基因对应关系 r语言代码
批量导出芯片探针与基因对应关系r语言代码1. 简介在基因芯片分析中，探针是一种用于检测特定基因表达水平的工具。
而对于芯片数据的分析和处理，了解芯片探针与基因的对应关系是非常重要的。
在r语言中，我们可以使用一些包和函数来批量导出芯片探针与基因的对应关系，方便后续的数据分析和挖掘。
2. 准备工作在进行批量导出芯片探针与基因对应关系之前，首先要确保已经安装了相应的r包，比如"affy"、"pd.hugene.1.0.st.v1"等。
接下来，我们以Affymetrix芯片为例来介绍如何进行批量导出。
3. 导出代码我们需要加载"affy"包，并且使用该包中的函数来读取芯片探针的注释信息。
```Rlibrary(affy)library(pd.hugene.1.0.st.v1)data(pd.hugene.1.0.st.v1)probeAnno <- as.data.frame(pd.hugene.1.0.st.v1PROBEID)```接下来，我们可以使用"select"函数来选择我们感兴趣的基因，并且将其对应的探针信息导出到一个文件中。
```Rgene_list <- c("GeneA", "GeneB", "GeneC")selected_probe <- probeAnno[probeAnno$Gene %in% gene_list, ]write.csv(selected_probe, file = "probe_gene_mapping.csv") ```4. 总结与回顾通过以上的代码，我们可以批量导出芯片探针与基因的对应关系，并且保存到一个csv文件中。
这样一来，我们就可以在后续的数据分析中方便地使用这些对应关系进行基因表达水平的分析和挖掘。
mitofinder参数
Mitofinder 是一个用于从基因组或转录组数据中自动重建完整线粒体基因组的工具。
Mitofinder 会执行诸如基因注释、线粒体基因组装以及重复序列的鉴定等任务。
为了实现这些功能，它结合了多个生物信息学工具，如SPAdes、BLAST、MAFFT 和HMMER 等。
使用Mitofinder 时，您可以通过命令行指定多种参数来定制分析过程。
下面是一些常见的Mitofinder 参数和它们的功能：- `-i / --input_folder`：指定含有输入数据的文件夹路径。
- `-o / --output_folder`：指定输出结果的文件夹路径。
- `-r / --reference`：提供一个参考基因组用于基因注释过程。
- `-m / --mitogenome`：如果已知线粒体基因组，可以提供该序列用于基因组装。
- `-g / --genetic_code`：指定使用的遗传密码表，默认为动物线粒体密码表。
- `-s / --species`：提供物种名称，用于基因注释。
- `-a / --annotation`：选择要执行的注释类型（例如，全注释、仅蛋白质编码基因等）。
- `-c / --circular`：指定线粒体基因组是否是环形的。
- `-t / --threads`：指定并行运行时使用的CPU线程数。
- `-j / --min_contig_size`：设置最小的组装片段大小，用于基因组装。
- `-k / --keep_blast`：在分析完成后保留BLAST 结果。
- `-v / --verbosity`：控制程序运行时的输出信息量。
请注意，Mitofinder 的参数可能会随着版本更新而改变。
因此，为了获取最新和最准确的参数信息，建议查阅Mitofinder 的官方文档或使用命令行工具查看帮助信息，通常可以通过在命令行中输入`mitofinder -h` 或`mitofinder --help` 来访问。
sratoolkit中prefetch命令参数
sratoolkit中prefetch命令参数简介命令参数p,--p i n f o此参数用于显示有关数据库中测序数据的信息，如测序数据的版本、大小、样品信息等。
使用示例：p r ef et ch-p<a cc ess i on_n um be r>v,--v e r s i o n此参数用于显示正在使用的s ra to ol ki t版本信息。
使用示例：p r ef et ch-vX,--q u a l此参数用于获取测序数据的质量分数信息。
使用示例：p r ef et ch-X<a cc ess i on_n um be r>-a s c p-p a t h此参数用于指定高速下载工具AS CP（A sp e ra）的路径。
使用示例：p r ef et ch--as cp-pa t h<pa th_t o_as cp>-a s c p-o p t i o n s此参数用于指定使用A SC P下载时的附加选项。
使用示例：p r ef et ch--as cp-op t io ns"<op ti on s>"-u s e-f t p此参数用于强制使用F TP下载测序数据。
使用示例：p r ef et ch--us e-ftp<ac ce ss io n_nu mbe r>-h t t p s此参数用于下载测序数据时使用H TT PS协议。
使用示例：p r ef et ch--ht tp s<a c ce ss io n_nu mb er>-f a s t e r q-d u m p-p at h此参数用于指定f ast e rq-d um p工具的路径，该工具用于快速将SR A 格式转换为F AS TQ格式。
使用示例：p r ef et ch--fa st erq-du mp-p at h<pa th_t o_fa st er q-du mp>用法示例下载测序数据使用以下命令下载指定测序数据：p r ef et ch<a cc es sio n_n um be r>查看测序数据信息使用以下命令查看指定测序数据的信息：p r ef et ch-p<a cc ess i on_n um be r>获取测序数据的质量分数信息使用以下命令获取指定测序数据的质量分数信息：p r ef et ch-X<a cc ess i on_n um be r>强制使用F T P下载测序数据使用以下命令强制使用F TP下载指定测序数据：p r ef et ch--us e-ftp<ac ce ss io n_nu mbe r>下载测序数据时使用H T T P S协议使用以下命令下载测序数据时使用HT TPS协议：p r ef et ch--ht tp s<a c ce ss io n_nu mb er>结论通过SR AT oo lk it中的p re fe tc h命令及其各种参数，我们可以方便地从NC BI的S R A数据库中下载原始测序数据。
LightCycler480_系统操作快速指南2.1
罗氏应用科学部/分子诊断部rLightCycler® 480实时荧光定量PCR系统操作快速指南 V 2.0说明及版本历史1.基本界面及图标1.1.Overview界面1.2.New Experiment 界面1.3.Navigator 界面2.PCR及结果分析2.1.开机2.2.运行一次PCR实验2.2.1.PCR程序的设定2.2.2.样本的编辑2.2.3.程序的运行2.3.实验结果的分析2.3.1.绝对定量分析2.3.2.相对定量分析2.3.3.基因分型分析2.3.4.Tm calling2.4.结果报告3.数据管理及模块化操作3.1.历史数据的处理3.2.应用Template和Macros简化实验流程4.用户管理5.日常维护6.Troubleshooting本指南用于本指南用于简要说明简要说明LightCycler® 480 系统软件系统软件的界面及操作要点的界面及操作要点的界面及操作要点，，对初学者了解系统软件有所帮助统软件有所帮助。
但荧光定量PCR 是一个相对较为复杂和精确的定量方法是一个相对较为复杂和精确的定量方法，，要求使用者对仪器仪器、、软件和实验设计有比较系统深入的了解软件和实验设计有比较系统深入的了解，，方能对方能对实验的设计实验的设计实验的设计、、操作及分析运用自如操作及分析运用自如。
因此请各位使用者在初步了解本软件的操作要点后因此请各位使用者在初步了解本软件的操作要点后，，尽快通过完整的操作手册尽快通过完整的操作手册，，熟悉系统相关软件和实验设计关软件和实验设计、、分析分析。
版本历史1.0 2007-3-272.02007-8-22第一部分 基本基本界面及界面及界面及图标图标概述概述：：一、 O verview 界面Exit ：关闭LC480软件Log off ：从目前使用的数据库中退出并可登陆其他的数据库Overview ：点击该图标进入点击该图标进入““Overview ”界面Navigator ：点击该图标进入点击该图标进入““Navigator ”界面界面，，可进行数据的导入导出等操作可进行数据的导入导出等操作，，详见详见。
(文档库)解码位置代码
解码位置代码在一个设备显现故障时，您需要明白该设备在系统中的物理位置，以即能够改换它。
errpt或lscfg命令提供了一个位置代码，指定了故障设备所在的位置。
有了位置代码和效劳器手册，或包括您的型号的IBM® Redbooks®，乃至您能够访问IBM Web 信息中心取得更有效的信息，您就能够够识别设备所在的确切位置。
简介碰到设备故障确信是一件麻烦事。
故障设备的类型可能是热插拔硬件，比如风扇冷却装置或热插拔外设组件互连（PCI）卡。
在这两种情形下，都需要明白设备的物理位置，然后才能改换它。
因此，您需要明白设备的位置代码。
故障设备会显示在错误报告中（利用 errpt 命令），该报告还会发布物理位置代码。
另外，利用 lscfg 命令能够取得您设备的物理位置。
在取得该位置后，应该如何定位设备？AIX 内部代码和物理代码AIX 提供了两种不同的代码，它们别离是：IBM AIX®（内部）位置系统代码物理位置代码AIX 内部位置代码可与物理代码配合利用来识别设备，咱们稍后会在本文这了解这种用法。
利用AIX 生成的那些代码引用了某些特定的设备，例如：10-80-00-3,0 SCSI CD Drive10-80-00-2,0 SCSI disk02-08-00 SAS disk上面的代码是访问实际设备的内部途径，能够利用 lsdev 命令来查看它们。
另一个咱们专门感爱好的位置代码是物理类型的，由固件生成。
例如：U789C.001.DQD3F62-P2-D3 SAS Disk Drive自从几年前发布了IBM POWER5 处置器以后，物理位置代码就成了定位设备的首选方式。
作为一项体会法那么，您需要的一般是物理代码。
这也是本文的重点。
表1 中提供的命令使您能够取得有关设备的各类信息。
表1. 取得有关您的设备的信息的命令命令描述lsdev -C -H -F "name status physloc location description"获得AIX（如果存在）和物理位置代码。
ncbi的accession numberprjna开头
ncbi的accession numberprjna开头
NCBI的Accession number是指NCBI数据库中数据记录唯一标识符，可用于在数据库中快速检索和识别特定数据记录。
以prjna开头的Accession number一般指的是NCBI的Sequence Read Archive (SRA)数据库中的项目号，这些编号标识了已经提交的原始测序数据集和相关的元数据。
在SRA中，研究人员可以将测序数据、分析结果、实验信息等数据上传至NCBI数据库，成为公共资源以供更多的研究人员使用。
SRA 包含了海量的测序数据，可以为各种生物学研究提供必要的基础数据支持。
因此，SRA为科学家们带来了极大的便利，可以节省大量的时间和精力。
Accession number通常具有一定的系统性和规律性，例如，NCBI 数据记录的Accession number由字母和数字组成，其前缀的含义和后缀的含义各不相同。
其中，以prjna开头的Accession number表示一个项目编号，后面的数字则代表该项目的唯一标识符。
使用prjna开头的Accession number，可以快速查询NCBI数据库中的项目信息、原始数据、分析结果等相关信息。
此外，该Accession number也可以在相关文章中使用，为读者提供精确的数据来源信息，保证科研成果的可信度和可靠性。
总而言之，NCBI的Accession number是唯一标识符，可以在NCBI数据库中快速查找特定数据记录。
以prjna开头的Accession number是NCBI SRA数据库中的项目编号，为研究人员分享测序数据提供了便捷的方式，也为科学家们提供了有效的研究资源支持。
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Supported OS WinCE, Linux Supported Software Standard Base software platform to support core location, graphics, and multimedia functions Premium SiRFInstantFix™ extended ephemeris services SiRFDiRect™ GPS/Dead Reckoning software for continuous and accurate positioning for portable navigation Target Applications Portable navigation devices Automotive navigation systems Automotive infotainment systems Portable media players Personal navigation devices Location-centric phones Digital video cameras Telematics
ARM11 CPU + VFPU and L1/L2 Cache Camera I/F LCD I/F
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱKEY FEATURES
High-performance GPS and Galileo location engine High-speed ARM11 CPU with floating point unit Integrated hardware 2D/3D engine with OpenGL ES 1.1 support and vertex geometry processor for enhanced transform and lighting features Integrated hardware video decoder engine with support for D1 resolution H.264/MPEG1/MPEG2/MPEG4/WMV9 Integrated hardware video and image encoder engine with support for D1 resolution H.264/MPEG4 video and 10 megapixel JPEG still images Integrated touch screen controller Advanced memory controller supports Mobile-SDR, Mobile-DDR, and DDR 8/16-bit NAND flash interface with 8-bit BCH HW ECC support for direct booting from SLC or MLC NAND Integrated SD/MMC/MMC+ controller Two high-speed USB 2.0 ports can be configured as host or slave 128-bit secure ID Low power advanced 65 nm process
SiRFprima BLOCK DIAGRAM
SiRFprima Location Processor
64 Channel High Sensitivity GPS Engine Media Encoder/ Decoder Advanced Memory Controller 2D/3D Graphics Accelerator Peripherals
Multifunction Platform
Appl ications
Portable Navigation Devices
Automotive
SiRFprima Multifunction Location Platform
GPS/Galileo Location, 2D/3D Graphics, and Multimedia Processor
HS USB 2.0 OTG NAND Controller
TECHNICAL SPECIFICATIONS
Computing Core ARM1136JF-S CPU Vector Floating Point Unit L1 cache 16 KB/16 KB (D/I) L2 cache 128 KB Memory Subsystem System bus 64 bit DMA 16 channels Mobile-SDR, Mobile-DDR, DDR1 support GPS/Galileo Receiver 64 channels, high sensitivity Seamless compatibility with SiRF GRF3i+ Storage Direct boot from 8/16-bit SLC/MLC NAND Flash SDHC/SD 2.0/MMC4.2 (x2) Direct boot from iNAND/MoviNAND 2D/3D Graphics 4 Mtriangles/second 350 Mpixel/sec fill rate OpenGL ES 1.1 support Four hardware overlay layers Supports up to 1024x768 @ 32 bpp Multimedia Decoder MPEG2/MPEG4/H.264/WMV D1@30 fps Encoder MPEG4/H.264 D1@30 fps JPEG codec for camera applications Interfaces CCIR656, Parallel TS for mobile TV Peripheral Connectivity AC97/I2S UART (x3), USP for PCM, DSP, I2S, SPI, irDA SPI/I2C (x2) 10-bit ADC SDIO support for WiFi, Bluetooth, and digital TV High-speed USB 2.0 (x2) up to 480 Mbps
HIGHLIGHTED ADVANTAGES
Premium automotive and portable navigation devices require a platform that can provide enough computing horsepower and features to render the most complex, photo-realistic maps without sacrificing GPS speed and tracking performance. The growing demands of today’s mobile user require devices that can simultaneously enable location-awareness and deliver multimedia content through a rich user experience. Many products on the market today provide some of these features in a standalone fashion but leave much to be desired when these applications blend together. The SiRFprima multifunction platform is designed to address these needs. The SiRFprima is powered by an ARM11 CPU with floating point unit and a location engine optimized for simultaneous tracking of GPS and Galileo satellites. Peak performance is ensured with an integrated 128KB L2 cache and a 64-bit bus interface to a high-speed memory controller capable of supporting various DRAM modules including SDRAM/DDR/MobileDDR, providing adequate memory bandwidth for the most intensive application scenarios. The built-in OpenGL ES 1.1 2D/3D graphics accelerator and hardware multi-standard video encoder/decoder enable crystal-clear user interfaces and support for the latest crop of video files including H.264/MPEG1/MPEG2/WMV9 at DVD resolutions for media player, smart phone, and camera applications. The location, graphics, and multimedia engines in SiRFprima function optimally in unison and with adequate memory bandwidth to enable extremely rich consumer experiences expected of next-generation mobile devices. The SiRF GRF3i+ and digital TV chips connect seamlessly to the SiRFprima processor to deliver full convergence capabilities to these devices.