BIOFACH CHINA 2015上海有机展5月启航-论文

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甾醇脱氢酶的基因挖掘、分子改造及其催化合成熊去氧胆酸

甾醇脱氢酶的基因挖掘、分子改造及其催化合成熊去氧胆酸

甾醇脱氢酶的基因挖掘、分子改造及其催化合成熊去氧胆酸游智能1张仙1李春秀2许建和2(1. 上海百福安生物科技有限公司上海 200030;2. 华东理工大学生物工程学院上海 200237)摘要本文介绍近年来利用以甾醇脱氢酶为核心元件的生物合成法制备熊去氧胆酸的研究进展,并提出了该技术进一步发展所面临的挑战和未来的研究方向,旨在为熊去氧胆酸的生物合成研究提供参考。

关键词熊去氧胆酸甾醇脱氢酶生物合成中图分类号:Q81; Q819 文献标志码:A 文章编号:1006-1533(2024)07-0016-08引用本文 游智能, 张仙, 李春秀, 等. 甾醇脱氢酶的基因挖掘、分子改造及其催化合成熊去氧胆酸[J]. 上海医药, 2024, 45(7): 16-23.Gene mining and molecular modification of hydroxysteroid dehydrogenase and its catalytic synthesis of ursodeoxycholic acidYOU Zhineng1, ZHANG Xian1, LI Chunxiu2, XU Jianhe2(1. Shanghai Bioforany Biotechnology Co., Ltd., Shanghai 200030, China; 2. School of Biotechnology,East China University of Science and Technology, Shanghai 200237, China)ABSTRACT The research progress in the biosynthesis of ursodeoxycholic acid with hydroxysteroid dehydrogenase as the core element in recent years is reviewed, and the challenges and future research directions for further development of this technology are proposeed, aiming to provide reference for the ursodeoxycholic acid biosynthesis.KEY WORDS ursodeoxycholic acid; hydroxysteroid dehydrogenase; biosynthesis熊去氧胆酸(ursodeoxycholic acid, UDCA)是传统名贵中药熊胆粉的主要活性成分,其化学名为3α,7β-二羟基-5β-胆甾烷-24-酸。

2015上海有机食品展会将在上海10月召开

2015上海有机食品展会将在上海10月召开

2015上海有机食品展会将在上海10月召开
佚名
【期刊名称】《食品安全导刊》
【年(卷),期】2015(000)021
【摘要】"民以食为天,食以安为先"国家"十二五"规划中明确指出了保证食品安全,加强食品监管的重要性,政府已经把食品安全提到了战略的高度。

这些举措,不仅体现出政府对于人民生命健康的高度重视,同时对于整个食品行业的未来走向也产生了深远的影响。

2015上海绿色有机食品展览会(SFEC)将于2015年10月16-18日在上海光大国际会展中心举行,届时将吸引20多个国家和地区企业集中亮相,势必成为专业性最强、产品覆盖面最广、效益最好的国际品牌盛会。

【总页数】1页(P14)
【正文语种】中文
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卤键、碳氢活化偶联机理的量子化学计算及药物结合口袋的识别与应用研究

卤键、碳氢活化偶联机理的量子化学计算及药物结合口袋的识别与应用研究
第二部分为蛋白质口袋的探寻方法发展与应用软件开发。基于受体结构的药 物设计,首先需要准确定位药物分子和蛋白质的结合位点。在第四章中我们对蛋 白质口袋探寻的方法开展了研究。探寻蛋白质表面空腔的算法有格点法、球集法 和 Voronoi Diagram 法等。在此基础上发展了新的算法——球集向量法。该方法 首先采用滚动球集法,确定空腔的位置。然后使用向量法,排除一些非口袋格点, 从而能够更加准确的确定口袋的边界和位置。根据该算法,我们开发了 PyPocket 插件及其命令行版本。和 Fpocket、PyRoll 等软件相比,PyPocket 对口袋边界的 识别更加准确。我们对 PyPocket 进行了测试,若以探测到配体中的一个原子作 为探寻成功的标准,其成功率高达 98.6%。配体和受体的结合强弱是由其形状和 理化性质共同决定的,因此计算口袋的特征有助于判定该口袋能否被用于寻找高 结合力的配体。在口袋探寻的基础上,我们接着开发了口袋描述符的计算工具 PyPocket-Descriptors,其计算的描述符包括几何特征(口袋的体积、表面积、深 度和闭合度等)和理化特征(氨基酸的组成、电荷、氢键受体、疏水性等)。最 后我们对 56 个药物口袋的特征进行了计算和分析,发现药物口袋的体积主要集 中分布在 500-1000 Å3,口袋中出现频率最高的氨基酸是亮氨酸,最低的是半胱 氨酸。这为我们下一步预测口袋的可药性打下了基础。
第一部分包括第二章及第三章。第二章为药物-靶标间卤键作用的量子化学 计算研究。卤键是一种非常重要的非共价作用,其强度和氢键相当,但具有更强 的方向性。卤素原子头部存在正电势区域,称为 σ-hole 区域,通过该区域和其它 原子的负电势区域发生吸引作用。我们先前的研究发现带有羧基的含卤小分子在 去质子化后带有负电荷,σ-hole 区域的表面静电势显示为负值,但仍然存在 VS,max。在真空中,该类型卤键的相互作用能很弱为排斥作用,但仍具有能阱。 在溶剂环境中,这种排斥作用转变为吸引作用。我们将这种类型的卤键称之为负 电荷卤键。在本论文中,我们研究了负电荷到卤素原子的距离在不同溶剂环境下 对负电荷卤键的影响。发现随着距离的增加,卤键强度逐渐变强,在真空中尤其 明显。带负电荷的卤键强度可以通过所处的环境和距离来调节,在材料和药物设 计中可利用这些特性来改善材料的功能和提高药物活性。第三章为铑催化的碳氢 (C(sp2)-H/ C(sp3)-H)活化偶联机理的量子化学计算研究。过渡金属配合物催化 碳氢键活化构建碳碳、碳氧键等,被广泛应用于药物分子、天然产物、材料分子 的合成。反应机理的理论研究可以了解反应过程,指导并设计反应。合作课题组 Zhou 等人 利用 萘 胺 化合物和 重氮 化合物 在三价铑 的催 化下进 行 环化 反应 (annulation reaction)获得了 1-氢-苯并[g]吲哚啉。在第三章中,我们利用量子

“BioFach China 2008”5月在上海揭幕

“BioFach China 2008”5月在上海揭幕
j a n d p r e d i c t th e p o s s i b l e d e m a n d s o f m a r k e t f o r e v e r y s e a s o n o r m o n th i n th e f u t u r e . I t C an h e l p e n t e r p ri s e s a d u s t o p e r a ti o n p o l i c i e s
i n g o o d ti m e , i m p l e m e n t J I T s t o c k c o n tr o l t a c ti c s , r e d u c e v o l u m e o f s t o c k , an d i m p r o v e th e o p e r a ti o n e fi c i e n c y o f c i r c u l a t i n g f Il n d .
在美 国 、 德 国 、 丹麦 、 瑞士 、 奥地 利和英 国等 国 家 , 已形 成 了一 个 相对健全 的市场结构 , 买 家可 以在超 市 、 有机食 品专卖店及 一 些 特定 的餐厅 和 旅 馆 选 择 范 围 较 广 的 有 机 食 品 。 目前 , 国 内 的 消 费市场也 在逐 渐形成 , 很多有机农产 品或加工 品 出现 在 家乐 福 、 麦德 隆 、 沃 尔玛 等大 型 超 市 , 很 多有 机食 品专卖店悄然分布在北 京 、 上 海 、 深圳 、 杭 州 等 大 中城 市 社 区 中 间 , 为 大 家 带 来 新 的 、 健 康 的有 机 消费理 念 。 但 是 , 中国有 机 食 品销 售 量 在 国 际 国 内市 场 中 占的 比例 还 很 小 , 随 着 人 民 生 活水平 的提 高 以及 对 健康 和 环 境保 护 的关 注 , 中 国有 机 食 品 消 费 市场 有 着 巨 大 的潜力 。

利用工艺水生产微生物蛋白技术应用前景分析

利用工艺水生产微生物蛋白技术应用前景分析

节能环保与生态建设China Science & Technology Overview302022年3月下 第06期 总第378期联合国发布报告称,到2050年,全球人口会增加到96亿人,全球食品系统将需要满足96亿人的饮食需求。

到2050年肉类需求将超过4亿t,乳制品需求将超过8亿t(Boland et al., 2013),以满足当前需求消费水平对全球动物源性蛋白质的需求。

Asner 和Archer 在2010年报道,全球仅20%农用地用来生产直接供人类食用的食物,而80%农用地用于动物养殖。

大于1/3粮食收成用于动物饲料生产,中国是一个饲料大国,也是人口大国,到2050年食物增量的土地空间限制,饲料争粮的现象日益加剧。

随着行业的发展和饲料产量的不断增加,蛋白质饲料供需缺口越来越大。

2018年联合国粮农组织预计,水产养殖产量在2030年达到2.01亿t,鱼类养殖所需蛋白量每年见增长10%,鱼粉产品基本稳定在每年500万t(国际鱼粉鱼油协会)。

到2050年,全球将需要多达1500万t新蛋白来源用于水产养殖。

海洋产品如鱼粉鱼油资源有限,而增加一些植物蛋白替代海洋产品,从可持续发展的角度来看也不能解决根本问题。

未来人们的平均富裕程度将超过今天的水平,人口素质和环保意识也会大大提升。

因此未来食品必须以可持续的方式生产,有助于减少气候变化及其他环境挑战。

可持续食物开发的需求增加,减少与人类食物资源的竞争将是可持续发展的关键,这就需要微生物发挥重要的作用,因为微生物的生长速度快,微生物能够见低价值的非食物生物质转化为高品质的饲料原料,对耕地、谁和气候条件的需求很小(Overland 等人,2018年)。

人类在水产养殖和农业生产中使用微生物饲料的意愿越来越高,是潜在的水产养殖和畜禽养殖可持续饲料原料[1]。

1.微生物蛋白质微生物蛋白质的主要来源分别是细菌、酵母和真菌,以及微藻。

挪威生命科学大学(NMBU)研究了以天然气作为能源和碳源进行发酵,发酵菌种有甲氧基菌、甲基球菌和少量的异源细菌如Ralstonia sp., Brevibacillus agri.和Aneurinibacillus sp.生产的微生物蛋白质。

JACS:上海有机所李昂课题组完成AplysiasecosterolA的全合成

JACS:上海有机所李昂课题组完成AplysiasecosterolA的全合成

JACS:上海有机所李昂课题组完成AplysiasecosterolA的全合成Aplysiasecosterol A(1,Figure 1)是由Kigoshi等[1]人于2015年从海兔Aplysia kurodai中分离得到的一类甾体化合物,其同系物Aplysiasecosterols B和C(2和3)也在之后相继被发现[2]。

2016年,Sung等人报道了Pinnigorgiols A、B、D和E(4-7)的全合成[3],这些化合物均含有Aplysiasecosterol A型骨架,只是侧链略有不同。

目前,研究人员已发现4可以诱导肝星状细胞凋亡,而1的生物学性质还有待进一步研究。

近日,中科院上海有机所李昂课题组首次在J. Am. Chem. Soc.上报道了Aplysiasecosterol A的不对称全合成(DOI: 10.1021/jacs.8b05070)。

(图片来源:J. Am. Chem. Soc.)1的逆合成分析(Figure 2)作者发现C环(红色部分)隐含的对称性,考虑采用去对称化策略构建季碳C10的立体化学,并产生预期的C6和C7构型。

C13-C14键是构建D环(蓝色部分)的关键。

通过金属介导的氢原子转移(HAT)对未活化的烯烃进行加氢官能化,以此构建连续的C13、C14和C8立体中心。

关键中间体α,β-不饱和烯酮8可以由9和10通过Reformatsky型反应构建。

9的C5-C7键断裂可得到环化前体11,进一步简化得到的酮12可以由对称二酮13合成。

片段10则可以由(+)-Citronellol(14)合成;而C17位的叔碳可以通过Myers不对称烷基化或Aggarwal锂化-硼化和Evans-Zweifel烯化串联反应来构建。

(图片来源:J. Am. Chem. Soc.)片段9的制备(Scheme 1)作者以二酮13为起始原料,经Corey−Bakshi−Shibata还原、TBS保护、硼氢化/氧化和Dess-Martin氧化得到酮醛17。

生物强化促进餐厨垃圾高温厌氧消化产甲烷性能的研究

生物强化促进餐厨垃圾高温厌氧消化产甲烷性能的研究

第31卷第6期2023年12月环境卫生工程Environmental Sanitation Engineering Vol.31No.6 Dec.2023生物强化促进餐厨垃圾高温厌氧消化产甲烷性能的研究*杜学勋1,史晶晶2,张斯颖2(1.上海老港固废综合开发有限公司,上海200237;2.中国科学院上海高等研究院,上海201210)【摘要】为探究水原脲芽孢杆菌Ureibacillus suwonensis E11的添加量对餐厨垃圾高温(55℃)厌氧消化产甲烷性能的影响,优化生物强化的实验条件,本研究采用5L连续搅拌厌氧反应器,以餐厨垃圾为底物,以长期驯化的高温厌氧污泥为接种物,通过改变微生物添加量(0、5%、10%、15%、20%),对比高温厌氧消化的产甲烷性能,评价强化效果,确定最佳添加剂量,并结合宏基因组数据揭示生物强化的作用机制。

结果表明:与未添加功能微生物的对照组相比,各生物强化组产甲烷量均有明显提高。

最佳的功能微生物添加量为15%,在此条件下,生物强化组(575.14mL/g)比对照组(452.86mL/g)的累积甲烷产量(以VS计)提高27.00%。

生物强化可以在一定程度上提高乙酸的利用效率。

微生物群落结构分析显示生物强化通过提高几种重要水解细菌以及嗜氢产甲烷菌Methanoculleus的相对丰度,来促进餐厨垃圾高温厌氧消化产甲烷。

【关键词】餐厨垃圾;高温厌氧消化;生物强化;宏基因组中图分类号:X799.3文献标识码:A文章编号:1005-8206(2023)06-0046-08DOI:10.19841/ki.hjwsgc.2023.06.008Study on Bioaugmentation to Promote Methanogenic Performance of Thermophilic Anaerobic Digestion of Food Waste DU Xuexun1,SHI Jingjing2,ZHANG Siying2(1.Shanghai Laogang Solid Waste Comprehensive Development Co.Ltd.,Shanghai200237;2.Shanghai Advanced Research Institute,Chinese Academy of Sciences,Shanghai201210)【Abstract】In order to explore the effects of adding Ureibacillus suwonensis E11on the performance of methane production during thermophilic(55℃)anaerobic digestion of food waste,and optimize the experimental conditions for bioaugmentation.A5L continuous stirring anaerobic reactor was used in this study with kitchen waste as substrate long-term acclimated high-temperature anaerobic sludge as inoculum.By changing the microbial addition amount(0,5%,10%,15%,20%),the methanogenic performance of high-temperature anaerobic digestion was compared,the enhancement effect was evaluated,the optimal addition dose was determined,and the mechanism of bioenhancement was revealed by combining metagenomic data.The results showed that compared to the control group without the addition of functional microorganisms,all bioaugmentation groups exhibited a significant increase in methane production.The optimal addition rate of functional microorganisms was15%,and under this condition,the cumulative methane production(measured as VS)in the bioaugmentation group(575.14mL/g)was27.00%higher than that in the control group(452.86mL/g). Bioaugmentation could improve the utilization efficiency of acetic acid to a certain extent.Analysis of the microbial community structure revealed that bioaugmentation promoted the methane production during thermophilic anaerobic digestion of food waste by increasing the relative abundance of several key hydrolytic bacteria and the hydrogenotrophic methanogen Methanoculleus.【Key words】food waste;thermophilic anaerobic digestion;bioaugmentation;metagenome0引言餐厨垃圾是居民在日常饭后所剩余的各类残渣的总称,也是城市生活垃圾的重要组成部分[1]。

上海市科学技术委员会关于上海市2015年度“科技创新行动计划”生物医药领域科技支撑项目的指南

上海市科学技术委员会关于上海市2015年度“科技创新行动计划”生物医药领域科技支撑项目的指南

上海市科学技术委员会关于上海市2015年度“科技创新行动计划”生物医药领域科技支撑项目的指南文章属性•【制定机关】上海市科学技术委员会•【公布日期】2015.04.08•【字号】•【施行日期】2015.04.08•【效力等级】地方规范性文件•【时效性】现行有效•【主题分类】科技计划正文上海市2015年度“科技创新行动计划”生物医药领域科技支撑项目指南为大力实施创新驱动发展战略,加快建设具有全球影响力的科技创新中心,根据国家和上海的中长期科技发展规划、“十二五”科技规划,推进上海生物医药领域科技进步,提升产业创新能力,上海市科学技术委员会特发布本指南。

一、征集范围专题一、生物和化学药物领域方向1、创新药物的发现和成药性研究研究目标:发现全新结构或全新作用机制的新药候选化合物、me-too,me-better类的新药候选化合物。

研究内容:通过合成和筛选化合物,利用新靶标、高通量筛选、计算机模拟等手段,发现新药候选化合物;在分子、细胞和小动物水平上,进行初步的药理学和安全性等成药性研究,确定具有进一步开发价值的创新药物。

考核指标:向国家知识产权局提交发明专利申请,并获得受理号;执行期限:在2018年9月30日前完成。

经费额度:每个项目不超过50万元。

申报主体要求:本市企事业单位。

方向2、新药临床前研究研究目标:完成创新药物临床前研究。

研究内容:针对结构明确且有生物学活性、并有一定研究基础的新化合物或重组蛋白等,开展药理、药效、药代、安全性评价等临床前研究。

考核指标:向国家食药监管局递交临床I期试验申请,并获得受理号。

执行期限:在2018年9月30日前完成。

经费额度:每个项目不超过50万元。

申报主体要求:本市企事业单位。

方向3、新药临床研究研究目标:完成当期新药临床试验。

研究内容:针对已获得临床试验批文的生物制品和化学药物,开展各期临床试验研究。

考核指标:,获得国家食药监管局批复的进入下一期临床试验批文,或新药证书申请受理号。

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