化学信息学课程大纲
化学信息学1
行表示、管理、模拟(建模)、传播(收集)、分析和应用, 以实现化学信
息的充分利用和共享,促进化学学科的发展。” 首先, 化学信息学应为化学学科的分支学科,其研究对象和研究目的 均属于化学的学科领域。它的研究手段为计算机技术和计算机网络技 术,研究内容则包括如何利用计算机和计算机网络技术对化学信息进行 表示、管理、模拟、传播、分析和应用等。 化学信息学的目的是为了实现化学信息的充分利用和化学家之间的 资源 共享，从而为促进化学学科的发展做出贡献。
库、常用全文数据库、常用电子期刊、特种信息资源、常用化学事实数据库及文献数 据的管理等内容。
（1）通用信息引擎
• • Yahoo() Go要内容
（一）化学信息学的内涵与意义
（二）化学化工网站与网上数据库 （三）常用化工软件
三、要求
• 了解Internet基本概念； • 学会使用重要的化工数据库查询相关资料
• 学会使用重要化工软件（origin、 chemdraw、 chem3D） • 了解化工制图软件（AUTOCAD）
四、教学环节与教学要求：
意义
“信息” 作为沟通的基础 作为学习的主要原素
作为分析事理的主要论据
帮助解决问题和作出决定
又由于Internet 的飞速发展使其逐步成为各种信息资源传
递的重要载体,化学与 Internet 正在成为一个非常活跃、进展
惊人的新兴交叉领域。 “化学信息学(Chemoinformatics)”首次提出于1987年诺贝 尔化学奖获得者J.M.Lehn教授的获奖报告中。90年代以来, 国外一些大学开设了化学信息学课程并确定为研究生的研究
Chem3D
Origin
ChemFinder
ChemDraw
第1章 化学信息学概述
1.2.2 绘制结构和辅助设计
化学信息普遍存在于化学和计算机的结合之中，几乎每一 个化学家都是一个绘制结构者，都会使用到化学绘图软件 （如ChemDraw、IsisDraw等）去绘制一个分子的二维或三 维结构。
1.1 化学信息学的产生与发展
随着以计算机与网络为标识的现代信息技术的迅速发展，
化学信息的数量日趋增加，形式也呈现多样化。
化学信息的收集、处理、管理和利用，必不可少地要借
助具有高效和共享性的计算机和网络。
由此，化学、化工与信息科学、计算机科学交叉的新兴 学科－－化学信息学应运而生。
1.1 化学信息学的产生与发展
不止于此，科学家们努力尝试去实现用计算机预测化学反 应的进行，模拟化学反应的发生，来合成一个设计好的目 标化合物。
德国Gasteiger的化学信息研究小组，已经有这样一个名叫 ERDS(Elaboration of Reactions for Organic Synthesis)的系 统，该系统能够进行反应结果的预测，或提供采用何种反 应物的建议。
第1章 化学信息学概述
化学化工学院
《化学信息学》教研组
2016.08
第十三届北京分析测试学术报告会及展览会
The 13th Beijing Conference and Exhibition on Instrumental Analysis
第1章 化学信息学概述
目
1.1
化学信息学的产生与发展 化学信息学的应用
新学科”。
J. Gasteiger给出通用的定义：“化学信息学是应用信息学
化学信息学 课程大纲
化学信息学课程大纲（2002.9）
对象：化学类专业高年级本科生
目的：学习信息的基本概念，掌握化学文献的查阅方法，了解计算机检索知识，懂得化学信息的处理方法。
内容：
第一章前言
1.1 信息理论的有关基本概念
1.2 信息理论在化学中的应用
1.3 化学信息学的目标及内容
第二章化学文献
2.1 概述
2.2 图书及图书馆
2.3 期刊
2.4 专利
2.5 工具书
第三章文献检索工具
3.1 化学文摘（CA）
3.2 科学引文索引（SCI）
3.3 其它检索工具
第四章化学电子资源
4.1 化学信息资源导航
4.2 联机文献检索工具
4.3 期刊图书信息
4.4 专利信息服务
4.5 网上化学数据库
4.6 化学研究机构信息
4.7 商业化学信息
第五章 Chemoinformatics
5.1 基本概念辨析
5.2 化学信息的计算机表达与可视化
5.3 分子结构、反应数据库
5.4 常用化学软件介绍
第六章Cheminformatics
6.1 概述
6.2 分子二维数据库和数据库检索技术
6.3 分子多样性和化合物筛选
6.4 三维结构的实验数据资源
6.5 基于三维结构的计算方法
6.6 三维结构数据库
6.7 化合物组合库
6.8 虚拟高通量筛选
课程安排:
上课与实习相结合。
化学信息学教学大纲
《化学信息学》实验教学大纲
课程代码：
适用专业：化学工程与工艺
实验总学时：8
实验一：CA文献检索
一、实验学时：2学时。
二、实验类型：综合实验。
三、实验目的：掌握CA文献检索和专利文献检索技巧。
四、实验所需仪器设备：计算机
五、实验方法和步骤
用分子式索引，主题索引（普通主题、化学物质）进行专利文献检索“1998年以后关于青霉素的制备”的文献。
实验二：Origin应用
一、实验学时：2学时。
二、实验类型：综合实验
三、实验目的：掌握Origin的使用方法
四、实验所需仪器设备：计算机。
五、实验方法和步骤：
使用Origin进行标准曲线绘制、方差分析、参数检验、建立回归方程、
实验三：ChemWindow应用
一、实验学时：2学时。
二、实验类型：综合实验
三、实验目的：掌握ChemWindow的使用方法
四、实验所需仪器设备：计算机。
五、实验方法和步骤：
使用ChemWindow绘制青霉素的结构式、反应方程式
实验四：HyperChem应用
一、实验学时：2学时。
二、实验类型：综合实验
三、实验目的：掌握HyperChem的使用方法
四、实验所需仪器设备：计算机。
五、实验方法和步骤：
使用HyperChem的量子力学、分子力学方法计算卡托普利的稳定结构，并计算分子体积、表面积、能量、原子电荷、摩尔折射率、极化率
1。
化学信息学的入门指南
化学信息学的入门指南1. 引言化学信息学作为化学科学与计算机科学的交叉学科，旨在利用计算机技术和信息科学方法解决化学问题。
它不仅可以加速化学实验的设计与优化，还可以实现大规模数据处理与分析，为药物设计、材料科学等领域提供支持。
本文将介绍化学信息学的基本概念、主要方法和应用领域，以帮助读者了解和使用这一领域的知识。
2. 化学信息学的基本概念2.1 分子描述符分子描述符是化学信息学中的重要概念之一，它用数值或文本表示化学分子的结构、性质和活性。
常见的分子描述符包括分子的拓扑结构、物理化学性质、电子结构等。
分子描述符是进行分子相似性计算、药物设计和毒理性评估等任务的基础。
2.2 化学数据库化学数据库是存储化合物信息和相关数据的集合，它包括大量的化合物结构、性质、活性等信息，并提供搜索、筛选和分析功能。
化学数据库广泛应用于药物研发、材料科学等领域，并可供研究人员快速获取需要的数据。
2.3 分子建模与计算分子建模与计算是化学信息学中发展最为迅速的领域之一，它通过计算机模拟和预测手段研究化合物的结构、性质和活性。
常见的分子建模与计算方法包括分子力场、量子化学计算和药效团模型等。
这些方法可以为药物设计和材料发现提供重要依据。
3. 化学信息学的主要方法3.1 分子相似性计算分子相似性计算是一种判断两个或多个分子之间相似程度的方法，它常用于药物设计、环境毒理等研究。
常见的相似性计算方法包括基于拓扑结构的指纹法和基于分子描述符的 QSAR（定量构效关系）模型等。
3.2 药物筛选与设计在药物研发过程中，高吞噬药物筛选与设计是一个复杂而耗时的过程。
化学信息学可以通过建立药效团模型、虚拟筛选库和多参数优化等方法，提高药物发现与设计地效率，帮助研究人员找到具有潜在活性的候选化合物。
3.3 QSAR 模型QSAR（定量构效关系）模型是一种通过计算机预测化合物活性的方法。
通过收集一系列有关分子结构与活性之间关系的数据，并利用统计和机器学习技术建立模型，可以快速预测新候选分子的生物活性。
《化学信息学》教学大纲【最新精选】
《化学信息学》教学大纲【最新精选】《化学信息学》教学大纲一、课程基本信息课程编号:84110123课程中文名称:化学信息学课程英文名称:Chemical Informatics课程类型:专业必选课总学时:42学时学分:3适用专业:化学先修课程:无机化学、有机化学、物理化学开课院系:化学学院二、课程性质和任务本课程是化学—生物学实验班的专业必选课～辅助专业课应用的一门技术基础课。
本课程将全面介绍化学信息学的发展和现状～检索方法和文献情报的搜集整理。
使学生掌握一般化学化工参考工具书～化学情报～化学化工核心期刊的检索方法～了解互联网的知识。
并使学生利用专业课、完善学生的知识体系的能力得以提升～为今后实际工作打下坚实的基础。
三、课程教学目标在学完本课程之后，学生能够:1.了解化学信息学的发展和现状2.了解化学信息的出版形式和存储方法3.掌握各种信息资料的检索方法4.掌握化学信息的搜集整理5.掌握一般化学化工参考工具书，ISI数据库，美国化学文摘，化学化工核心期刊的检索方法。
6.了解互联网的一般知识。
四、理论教学环节和实践教学环节第一章绪论【教学目标】介绍化学文献的发展历史、化学情报检索系统的建立以及化学文献查阅的意义。
【教学重点】了解化学文献的发展历史。
【教学难点】情报检索系统。
【学时数】 2学时。
【考核知识点与考核要求】化学文献的发展历史、化学情报检索系统的建立以及化学文献查阅的意义。
第一节化学文献的发展本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、了解化学文献的发展历史。
2、理解当今化学文献总的特点。
第二节化学文献源概述本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、掌握化学文献源的构成:图书、期刊、科技报告、学位论文、会议资料、专利文献、技术标准、技术档案和产品样本。
2、掌握化学文献源的特点及作用。
第三节化学情报检索系统的建立和发展本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论1、掌握一次文献、二次文献和三次文献的概念。
化学信息学第一讲FGQ
--美国科学基金会 NSF(National Science Foundation)
4
科研工作中与信息相关的问题
• 如何在海量的信息中快速检索到相关的、高质量的信息？ • 如何有效地分析目前的研究进展并确定新的研究方向？ • 如何及时跟踪某研究方向的最新进展？ • 如何有序管理所检索到的大量文献？ • 如何迅速提高论文写作的效率？ • 如何全面了解所发表论文及其期刊的影响力 • 确定投稿方向？
14
文献的分类
科技期刊 科技图书 专利文献 科技报告 会议文献
学位论文 技术标准 产品资料 电子出版物
15
现代化学文献特点
1. 文献数量迅猛增加
16
2. 文献种类繁多，形式多样
类型：图书、期刊杂志、科技报告、学位论文、会议资料 文献载体：印刷型、缩微型、机读型 文献性质：一次文献、二次文献、三次文献
20
Top 化学杂志
2011年影响因子
Nature Science Nature Chem. Angew. Chem. Int. Ed. J. Am. Chem. Soc. Chem. Comm. Chem. Sci. Chem. Rev. Accounts Chem. Res. Chem. Soc. Rev.
3. 电子文献与网络检索普及
化学数据库 （Scifinder、Reaxys、ISI Web of Knowledge等） 全文数据库（ACS、RSC、Elsevier、Wiley InterScience数据库）
17
科技文献的检索方法
科技文献的检索途径
化学信息学课程设计 (2)
化学信息学课程设计一、研究背景化学信息学是化学与信息学的交叉学科，它主要研究如何应用计算机、数学和信息技术等手段对化学信息进行存储、分析、检索和利用等方面的工作。
随着计算机技术的不断发展和化学工业的迅速发展，化学信息学在化学研究和化学工业生产中的应用日益广泛。
本课程的设计旨在帮助学生了解化学信息学的基本概念和应用方法，掌握化学信息学研究和应用的基本技能，提高学生解决化学信息学问题的能力。
二、课程目标1.掌握化学信息学的基本概念和基本理论；2.熟悉化学信息学的基本方法和工具；3.能够使用化学信息学软件完成常见的化学信息学任务；4.能够阅读和理解化学信息学文献，了解化学信息学的最新研究进展；5.能够将化学信息学技术与化学实验结合起来，提高化学实验效率和数据质量；6.具有创新意识、创业精神和团队协作能力，能够开展化学信息学相关的科研和创新项目。
三、课程内容第一章概论1.化学信息学的定义和基本概念；2.化学信息学的发展历程和研究领域；3.化学信息学与计算化学、化学数据库、化学计量学等交叉学科的关系。
第二章化学数据库1.化学数据库的种类和特点；2.化学数据库的构建方法和管理技术；3.化学数据库的查询和检索方法。
第三章化学计量学1.化学计量学的基本概念和基本方法；2.化学计量学模型的应用和评价方法；3.化学计量学在化学研究和化学工业生产中的应用。
第四章分子模拟1.分子模拟的概念和理论基础；2.分子模拟的方法和软件工具；3.分子模拟在药物研究和材料科学中的应用。
第五章化学信息学软件1.化学信息学软件的分类和特点；2.化学信息学软件的使用方法和技巧；3.化学信息学软件在化学研究和化学工业生产中的应用。
第六章创新项目1.化学信息学与创新项目的关系；2.创新项目的基本流程和方法；3.基于化学信息学的创新项目的实现方法和技巧。
四、课程实践1.课堂实验：化学信息学软件的使用；2.课外实践：运用化学信息学技术解决实际问题；3.课程论文：针对化学信息学相关问题，撰写一篇学术论文。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
化学信息学课程大纲（2002.9）
对象：化学类专业高年级本科生
目的：学习信息的基本概念，掌握化学文献的查阅方法，了解计算机检索知识，懂得化学信息的处理方法。
内容：
第一章前言
1.1 信息理论的有关基本概念
1.2 信息理论在化学中的应用
1.3 化学信息学的目标及内容
第二章化学文献
2.1 概述
2.2 图书及图书馆
2.3 期刊
2.4 专利
2.5 工具书
第三章文献检索工具
3.1 化学文摘（CA）
3.2 科学引文索引（SCI）
3.3 其它检索工具
第四章化学电子资源
4.1 化学信息资源导航
4.2 联机文献检索工具
4.3 期刊图书信息
4.4 专利信息服务
4.5 网上化学数据库
4.6 化学研究机构信息
4.7 商业化学信息
第五章 Chemoinformatics
5.1 基本概念辨析
5.2 化学信息的计算机表达与可视化
5.3 分子结构、反应数据库
5.4 常用化学软件介绍
第六章Cheminformatics
6.1 概述
6.2 分子二维数据库和数据库检索技术
6.3 分子多样性和化合物筛选
6.4 三维结构的实验数据资源
6.5 基于三维结构的计算方法
6.6 三维结构数据库
6.7 化合物组合库
6.8 虚拟高通量筛选
课程安排:
上课与实习相结合
欢迎您的下载，资料仅供参考！。