生物样本库构建基本流程 ppt课件
生物样本库的建设培训讲学
全血、血清、血浆、干血片、血凝块、白细胞
全血：由液态血浆和血细胞组成
血浆：离开血管的全血经抗凝处理后，通过离心沉淀，所获得的不含细胞成分的液体，其中含 有纤维蛋白原。 血清：指全血不经抗凝处理，在凝固过程中，血浆中除去纤维蛋白原分离出的淡黄色透明液体或 指纤维蛋白原已被除去的血浆
标本采集
标本采集
标本运送
➢ 血液标本采集后应尽快从采血现场运送至实验室，注意是否存 在干扰血凝块。
➢ 标本运送过程中要注意样本的包装、温度要求及处理方法等， 要确保分析成分的稳定性，标本管在运送过程中要保持管口封 闭，向上垂直放置，避免剧烈振动
➢ 尿液标本从流取到检验应在2小时内完成，如不能及时送检分析， 必须加防腐剂或冷藏不超过8小时
政策法规
ISO标准 实验室Leabharlann 全 临床实验室 伦理 运输生
物 样
技术标准
本
库
伦理规范
标准操作规范 （SOPs）
质量控制标准 知情同意书 伦理委员会 伦理审查
质量审查
样本运输
样本采集 样本处理 样本质量检验 样本储存 样本运输
DNA质量鉴定、RNA质量 鉴定、蛋白质质量鉴定
样本转移协议
ISO标准
ISO15189:2003 医学实验室质量和能力的专用要求 CNAS-CL02 医学实验室-质量和能力的认可准则 ISO/IEC17025:2005 检测和校准实验室能力的通用要求 CNAS-CL01 检测和校准实验室认可准则 ISO9001:2008/GBT19001-2008 质量管理系统 要求 GB/T1.1-2009 标准化工作导则：标准的结构和编写规则
化，细菌生长，尿素酵解生成氨使尿pH升高，尿液有形成份破坏，葡萄糖被细菌利用而降低。
生物样本库
据我所知，我国在生物样本库信息化管理系统的开发和建设上还处于发展期，但已经开始有国内外专家和企业在此领域投入了。现在国内常用的系统是海尔生物医疗开发的BIMS（BiobankInformation Management Solution，生物样本库信息管理整体方案），其在2015年推出了最新一代BIMS“灵珑”系统，具有“平台化-小样本大数据”、“个性化-自由定制”、“图形化-所见所得”三个特点，是符合中国生物样本库建设的最佳方案。
举例
以我们实验主攻的组织样本为例：
a) 新鲜组织样本应在采集后简单用生理盐水清洗处理后1天内低温运输至研究人员使用；
b) 冰冻组织样本应在原始样本采集后30分钟内取材并进行快速冰冻后储存；
c) 福尔马林固定石蜡包埋组织样本应在原始样本采集后立刻投入福尔马林固定后进行相应处理。
2.生物样本储存
储存样本时的冷却速度和方法对细胞活性有重大影响。储存会影响样本的质量，决定样本以后使用的可能性。在冷冻样本时必须考虑以下方面：
总体来说，生物样本库建设主要分为三大部分：标准化样本处理、生物样本存储、样本生物信息化管理，下面从宏观角度为大家介绍这几个部分具体工作。
1. 标准化样本处理
生物样本种类繁多（主要分为5大类：组织样本、血液样本、核酸和蛋白质样本、冻存的细胞样本、组织切片和组织芯片），对样本进行标准化处理是构建样本库最重要也是最核心的一样工作。
生物样本库
概念：又称生物银行（Biobank），主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本（包括人体器官组织、全血、血浆、血清、生物体液或经处理过的生物样本（DNA、RNA、蛋白等）以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系统。
生物样本库的建设
生物样本库的建设生物样本库是一个存储和管理生物样本的设施，通常包括血液、尿液、组织样本等。
生物样本库的建设对于疾病诊断、药物研发、遗传疾病的研究以及各种医学研究都有着非常重要的意义。
本文将从建设生物样本库的必要性、建设流程、建设中需要注意的问题等方面来进行介绍。
一、建设生物样本库的必要性1. 对医学研究的促进作用。
生物样本库的建设可以提供疾病相关的生物材料，为各种临床疾病的研究提供了丰富的资源。
例如，对于肝癌的研究，需要大量肝癌组织样本进行研究；对于肿瘤的研究，则需要一系列的血清样本、组织样本等。
生物样本库的建设可以为医学研究提供坚实的基础。
2. 对药物研发的促进作用。
药物研发需要进行大量的体内体外实验来验证药效和安全性。
而且，药物研发通常需要进行三期临床试验，这需要大量的生物样本来进行研究。
生物样本库的建设可以提供大量的生物样本，为药物研发提供重要的支持。
3. 对遗传疾病的研究的促进作用。
生物样本库还可以用于研究遗传疾病。
例如，利用生物样本库中的DNA样本、RNA样本等可以进行基因检测，寻找遗传疾病的发病机制，开发治疗方案等。
二、建设生物样本库的流程生物样本库的建设是一个较为复杂的过程，需要包括以下几个步骤：样本收集、样本处理、样本管理和样本使用。
1. 样本收集样本收集是建设生物样本库的第一步，并且是非常重要的一步，因为样本的质量直接影响到后续的研究结果。
在样本收集时需要遵循一定的标准和规范。
例如，对于血液样本的采集，需要严格控制采血时的时间、采血时使用的采血针的规格、采血筒等。
2. 样本处理样本处理是保证样本质量的另一重要步骤。
对于不同的样本，需要进行不同的处理。
例如，对于血液样本，需要进行血细胞分离、血浆离心等处理。
在进行样本处理时，需要严格控制处理的时间和温度，以及处理过程中的各种条件。
3. 样本管理样本管理是生物样本库建设的核心环节，包括样本存储、样本记录、样本追踪等等。
样本存储需要考虑样本的长期保存，而且，不同样本的保存条件也有所不同。
生物样本库ppt课件
海尔的努力---参与起草样本库标准
2011年1月7日，海尔参与中国生物医药技术协会样本库分会共同起草生 物样本库行业标准。
生物芯片上海国家工程研究中心
海尔集团公司
北京大学肿瘤医院
参 与
北京协和医院 北京大学人民医院 复旦大学附属中山医院
成 第二军医大学附属长海医院
员 第四军医大学附属西京医院
中山大学附属肿瘤医院
复旦大学附属肿瘤医院
国家863分子分型与肿瘤基因组重大项目
组
取
国内首个生物样本库行业标准
得 成 果
《中国医药生物技术协会生物样 本库标准（试行）》已在《中国 医药生物技术》2011年2月第6 卷第1期刊登。
海尔的努力---中华骨髓库
样板工程：“中华骨髓库”项目使用海尔超低温冰箱100 台
标本
---安全储存100多万份全球华人造血干细胞血样
信息化
耗材
• 冻存架、冻存盒、 冻存管
• 打印机、扫描枪、 条码标签
解决方案标准化流程
冷链监控系统
一、环境设计方案
房间平面尺寸图
样本库的基建布局 超低温设备的摆放 配电、通风、散热 网络、信息化设计
生物样本库排风散热方案
生物样本库配电方案
二、超低温产品方案
立式
卧式
上下门
-150度
序号 超低温型号
容积 冻存架 冻存盒
1 DW-150L200 2 DW-86L828 3 DW-86L728 4 DW-86L626 5 DW-86L490 6 DW-86L388
200L 828L 728L 626L 490L 388L
12
132
24 600/360
24 480/288
生物样本库
参 与 成 员
取 得 成 果
国内首个生物样本库行业标准 《中国医药生物技术协会生物样 本库标准（试行）》已在《中国 医药生物技术》2011年2月第6 卷第1期刊登。
海尔的努力---中华骨髓库
样板工程：“中华骨髓库”项目使用海尔超低温冰箱100 台
标本 ---安全储存100多万份全球华人造血干细胞血样
使用升级：由简单储存---安全、便捷地储存管理
配备1套Express版海尔生物样本库资源管理系统、1套冷链监控系统、一台Brady IP300热转 印打印机、DS6708条码扫描枪；
海尔的努力---上海交通大学医学院附属瑞金医院
研究院所：内分泌研究所（重点学科） 项目规模：30台超低温保存箱。
样本数量：50万份以上
海尔愿与您一起， 共同推进的生物样本库的发展！
样本库专用 打印机
条码打印机
●IP300、BBP11 ●热转移打印方式 ●高清晰 高稳定性 高分辨率 ●B490：耐受-196℃液氮温度 ●B427：耐受-80℃超低温 ●耐酸、耐碱、防水、防油污
冻存管
●康宁、爱思进、海尔 ● 2英寸、3英寸 ● 9*9 81格、10*10 100格
冻存盒
条码标签
量身定制
海尔的努力---河北磁县肿瘤医院
用户现状：
磁县肿瘤医院肿瘤防治研究所，创建于 1973年。自创建以来， 始终担负着河北省的肿瘤防治任务。1991年由原国家科技部、卫生部、 全国肿瘤防治办公室确定为全国肿瘤防治研究现场。之后，相继承担 了国家“七五”、“八五”、“九五”、“十五”食管癌科技攻关课 题，中英、中日食管癌合作研究课题以及目前正在实施的国家“食管 癌早诊早治示范基地”。目前该用户已经与英国、日本签订合作协议， 长期提供样本；
最新常见生物模型构建的一般步骤4-ppt课件精品课件
1．概念模型 2．数学模型 3．物理(wùlǐ) 模型
第二页，共35页。
一、概念模型：
1.定义 (dìngyì)：
概念模型是对生物学中某个问题或事 物进行描述。概念模型包括(bāokuò)：中 心概念、内涵、外延。在新课程生物教材 中，概念模型通常以概念图的形式出现， 表达概念之间的相互关系，体现知识的网 络构架。通过概念模型的构建，有利于对 概念知识的理解和联系。
第二十六页，共35页。
二、数学模型：
3.其他(qítā)常见的数学模型：
• （8）酵母菌数量调查数学模型： • ①直接记数：计算的数学模型为：N=（m×n）×103/（1×1×0.1） • 模型中各参数的意义：N为1mL溶液中酵母菌的数量；m为小方格总
数；n为每个小方格中酵母菌的平均数；103为1mL=103mm3； 1×1×0.1为记数板上溶液的体积（1为记数板每边总长，0.1为记数板 上溶液厚度(hòudù)）。 • ②对比记数法：计算的数学模型为：N=（M×n）/ m • 模型中各参数的意义：N为1mL溶液中酵母菌的数量；M为已知的红 细胞总数；n为每个小方格中酵母菌的平均数；m为每个小方格中红 细胞的平均数。
（3）根据实验数据，建构模型： Nt=N0 λt，N0代表细菌初始数量，t表示第几代，Nt表示t代细菌
数量。 （4）进一步观察(guānchá)，修正模型：
观察(guānchá)、统计细菌数量，对自己所建立的模型进行检验 或修正。
以细菌(xìjūn)繁殖Nt=N0 λt 为例
第二十页，共35页。
二、数学模型：
第二十一页，共35页。
二3、.其数他学(q模ítā型)常：见的数学
生物样本库的建立流程
生物样本库的建立流程一、前期规划。
咱们先得有个想法，就是为啥要建这个生物样本库呀？是为了研究某种疾病，还是为了保护生物多样性呢？这个目标得明确。
就像咱们出门得知道去哪儿一样。
然后呢，得找个地方来建这个样本库。
这个地方可不能随便选，得考虑很多因素呢。
比如说，要安全，不能随随便便就被水淹了或者着火了。
而且要方便，不管是运样本进来，还是研究人员来取样本出去做研究，交通得便利。
这时候就像找房子一样，得挑个好地段。
还有呀，得考虑这个地方的大小，要是以后样本越来越多，不能一开始就挤得满满当当的呀。
二、样本采集。
有了地方，咱们就开始采集样本啦。
这采集可讲究了呢。
比如说采集血液样本吧，得找专业的医护人员来做。
他们就像超级英雄一样，拿着小小的针管，一下子就能准确地采集到血液。
而且采集的时候得注意卫生，不能让样本被污染了。
要是采集的是植物样本呢，也得小心，得选那些健康的植物，还得按照一定的方法采集，不能把人家植物给弄伤了。
采集的样本还得有记录，就像给每个样本办个身份证一样。
要写清楚这个样本是从哪儿来的，是什么时候采集的，采集的人是谁等等。
这可不能马虎，不然以后做研究的时候都不知道这个样本是啥情况啦。
三、样本处理。
采集好的样本可不能就这么放着，得处理一下。
比如说血液样本，可能要离心，把血清和血细胞分开。
这就像把混合的果汁和果肉分开一样有趣呢。
处理样本的时候也得有标准的流程，要用到合适的设备。
这些设备就像魔法棒一样，能把样本处理得妥妥当当的。
而且处理过程中也要记录好数据，比如处理的温度啊，用了什么试剂啊之类的。
这就好比做菜的时候要记录放了多少盐多少糖一样。
四、样本存储。
处理好的样本就要存储起来啦。
存储的环境可重要了呢。
有些样本要放在低温环境下，就像把冰淇淋放在冰箱里一样，得保持低温才能保证样本不变质。
而且不同类型的样本可能存储的条件还不一样。
比如说有的要放在液氮里，那温度可低了，感觉就像到了北极一样。
存储样本的容器也得选好，要保证样本不会泄露，不会被外界的东西污染。
《生物样本分析》PPT课件
通过安装在线稀释旁通流路，可大量注入血浆（血清） 样品。
这便是Co-Sense的关键技术！
●
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在线稀释流路
导入泵
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自动进样器
在线稀释流程图
前处理柱
样品处理柱的容量
• 进样体积对色谱图的影响 • 当进样体积加大的时候，由于样品处理柱子容量
的限制会发生峰展宽的现象.
100 uL 50 uL 10 uL
背景
样品前处理是目前分析化学的瓶颈，是分析化学研究的难点和 热点问题之一。由于样品数量极多，且分析物含量越来越低、 基体越来越复杂，迫切要求发展高通量、高选择性、高效率的 在线样品前处理技术。因此，开展这方面的研究具有极为重要 的意义。
HPLC/LC-MS广泛应用于血浆或血清的代谢物分析和 原药分析，一般的血浆和血清分析，需要对样本进行 预处理，以除去蛋白质，这样会降低精确度和工作效 率。引入了具有限制性通路媒介（restricted access media -RAM）的预柱，可对血浆样本进行直 接分析，而不必进行预处理。这样，可提高精确度、 简化操作和提高工作效率 。但是，使用限制性通路 媒介柱，也存在一些问题，需解决的问题：回收率、 灵敏度、耐用性。
97
98
98
96
95
96
100mM phosphate (Na) buffer <pH=6.9>
629其中酸性化合物145碱性化合物675两性化合物180分子量一般离子化质谱分析编辑ppt血浆样品的特点基质复杂选择性强待测物含量低灵敏度高浓度差异大线性范围宽编辑ppt除蛋白质分离纯化浓缩液液萃取法固相萃取法规模缩小的柱色谱法直接沉淀法超滤法编辑ppt血浆样品加入提取溶媒酸化或碱化涡旋离心取上清液吹氮气浓缩残渣溶解过滤进样色谱分析编辑ppt药代动力学研究面临的挑战高效液相色谱法hplc的特点和局限
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生物样本库
生物样本库（biobank）是一种集中保存各种人类生物材料 （human biological material），用于疾病的临床治疗和生 命科学研究的生物应用系统。换言之，生物样本库是标准 化收集、处理、储存和管理人类离体器官、组织、细胞、 血液、体液、分泌物、排泄物及其生物大分子衍生物等各 种生物样本，以及生物样本捐赠者的临床诊治、随访等信 息的系统
血标本送达流程
医生和病人：签署《标本收集知情同意书》 医生：填写《标本采集信息登记表》
护士：空腹采静脉血2管(紫头1支，黄头1支） 放4 ℃冰箱保存
工人：上午11点之前将血标本送至研究所（2号楼3楼5号室）
研究所：处理血标本 标本要在采集后4小时内入库（-80℃冰箱）
组织标本送达流程
医生和病人：签署《标本收集知情同意书》 医生：填写《标本采集信息登记表》
医生：取材，区分病变和对照组织，并作切割
研究所：手术室门口取标本和资料，冰盒运送
研究所： 输入资料、打标签，过液氮，入库 标本要在离体30min内入液氮
血、组织样本处理与分装
血液 组织
样本实验室入库流程
样本出库
样本入库前 准备（一）
样品入库前的 准备（二）
肝癌标本
血和组织样本入库要求
术前、术后空腹静脉血各2支：
肿瘤手术组织
5ml紫色采血管1支（血浆பைடு நூலகம்白膜层等）(肿瘤，癌旁，远端非癌组织各4管）
5ml黄色采血管1支（血清）
每管2-3块黄豆大小组织块（直径约0.5 cm ，重约0.25 g）
要求：血样本在采集后4h内入库保存 要求：标本离血30min内投入液氮，入库保存
生物样本库的科学与社会价值
二、在新药开发方面
药物敏感性和特异性的大规模样本验证是 新药研发的重要环节之一，应用基于大规模 生物样本的组织芯片筛选技术，设计筛选模 型，实现自动化高通量药物筛选，将大大减 少新药开发筛选过程中所耗费的人力、财力， 提高药物筛选的效率，缩短新药开发的周期。
生物样本库的科学与社会价值
共有-80℃冰箱46台，现存血标本量超过10万 例、组织标本2万多例。
常规收集住院及门诊肿瘤患者的血标本以及 手术离体新鲜组织标本。
支撑了400多项科研项目，极大地推动与促进 着中心科研的进步。
佛山市第一人民医院 生物样本库
自2011年启动，是佛山医院唯一一家。 现有-80℃冰箱12台，现存血标本10000多例、
三、研究型医院与学科建设的基础
生物样本库作为生物样本资源采集、储存、分发 应用的开放性的资源共享服务平台，对于促进医院 学科建设和发展、人才培养及人才引进等具有独特 的重要性和现实意义，是研究型医院建设和可持续 发展不可或缺的重要基础平台。
中山大学肿瘤防治中心 肿瘤资源库
自2001年启动，是华南地区最大的肿瘤资源 平台。
组织标本2000多例。 目前主要接收来自肿瘤中心、肾内科、神经
内科、肝脏外科、妇产科住院病人的血和组 织标本。 为全院的科研提供样本服务。
样本入库标准
有科研立项课题
暂无课题，有思路，想先收集样本
与研究所合作TCR项目
1.肿瘤、炎症、自身免疫病等与细胞免 疫相关的疾病 2.患者不伴随其他影响细胞免疫的疾病 3.治疗前/治疗后 血、组织样本
生物样本库是医学科研的基础，也是快速实现转化医学研 究的核心与关键。
生物样本库的科学与社会价值
一、在疾病基础与临床研究方面
利用生物样本宝贵资源开展细胞生物学、 分子生物学、分子病理学、基因组学和蛋白质 组学等系统生物学的研究，探讨新的疾病分类、 分型、诊断、个性化治疗和预后标准，制订疾 病预测、早期检测、分子分型与个性化治疗、 预后评估等新型的诊治策略。