biochemistry chapter3PPT课件

合集下载

生物化学英文课件Biochemistry-chapter 3

生物化学英文课件Biochemistry-chapter 3
Requirement:1. Less cleave sites; 2. High specificity; 3. More production.
(1)Proteases cleavage:
1.Trypsin:C-terminal of Arg, Lys. High specificity
2.Chymotrypsin: C-terminal of Phe, Trp, Tyr.
1. Separation of amino acids by ion exchange chromatography
Amino Acid Separation
Unfortunately, amino acids are not colored as described in this overhead. Therefore, what methods would you use to first check if an amino acid is indeed present?
A-E-F-S-G-I-T-P-K
L-V-G-K
• Chymotrypsin Cleavage:
L-V-G-K-A-E-F S-G-I-T-P-K
• Edman degradation: L
• Correct sequence:
L-V-G-K-A-E-F-S-G-I-T-P-K
<2> Enzymatic hydrolysis:
7. Clostripain(Arg protease ): c-terminal of Arg.
(2)Chemical cleavage:
1.CNBr: c-terminal of Met.
CNBr is useful because proteins usually have only few Met residues.

生物化学英文课件Biochemistry-chapter 3

生物化学英文课件Biochemistry-chapter 3
(2) Storage and transport of biochemical molecules (Hb, Mb)
(3) Physical cell support and shape (tubulin, actin, collagen)
(4) Mechanical movement (flagella, mitosis, muscles)
➢ (2) According to polymerization of protein molecules;
➢ Monomeric proteins ➢ Oligomeric proteins (multimeric proteins)
➢ (3) According to conjugation of protein molecules;
106 Da or more。 ➢ Usually insulin (5700 Da) or RNase (126000 Da)
was as the boundary of proteins and polypeptides. ➢ Mr of proteins ≈ Mr of amino acid ×110.
➢Mirror image pairs of amino acids are designated L (levo) and D (dextro)
➢Proteins are assembled from L-amino acids (few D-amino acids occur in nature)
Chapter 3 Amino Acids and the Primary
Structures of Proteins
3.1 Outline of Proteins 3.2 Structures of Amino Acids 3.3 Other Amino Acids and Amino

生物化学课件Chapter 3 Amino acids and Peptides

生物化学课件Chapter 3 Amino acids and Peptides
• Later, enzyme digestion of proteins (much milder condition) helped to unveil which of these identified amino acids are actual building blocks of proteins.
DNA replication
Immune response (defending)
Light production (Luciferase)
O2 transport (Hemoglobin)
Support (keratin)
All proteins are constructed from the same set of 20 standard amino acids!
a
Common structure
1.
3.
The 20 amino acids are commonly categorized into five groups based on side chain features.
2. 4.
5.
Each amino acid possesses: 1. a common name 2. a three-letter abbreviation 3. an one-letter symbol
Biochemistry lecture 2 (Sept. 18, 2014)
Part I Structure and Catalysis
Chapter 3 Amino acids and Peptides
By Prof. Zengyi Chang (昌增益)
a-amino acid
Proteins are structurally and

《生物化学》(2)第3部分ppt-PowerPoint

《生物化学》(2)第3部分ppt-PowerPoint
有的传递体起传递电子的作用,叫做 “递电子体”,主要有细胞色素及铁硫蛋
(1)铁硫蛋白
铁硫蛋白类作用机理是通过铁的变
价互变进行电子传递。
由于其活性部位含有两个活泼的硫 和两个铁原子,所以叫做铁硫蛋白。
铁硫蛋白存在于微生物、动物组织 中,通常在线粒体内膜上与黄素酶或细 胞色素结合成复合物而存在。
线粒体的离体实验证明,经NADH呼 吸链氧化生成水的P/O为3,经FAD呼吸 链氧化生成水的P/O为2。其氧化磷酸化 的偶联部位见图。
3、细胞液中NADH的氧化磷酸化
线粒体是糖、脂肪、蛋白质等能源物 质的最终氧化场所,这些物质的彻底氧化 是在线粒体内通过呼吸链生成ATP。但是 糖、蛋白质和脂肪的全部氧化过程并不是 都在线粒体内进行(如糖酵解作用在细胞 液中进行,真核生物细胞液中的NADH不 能通过正常的线粒体内膜),细胞液中 NADH不能通过线粒体内膜进入线粒体内 进行氧化磷酸化,必须通过两种“穿梭” 途径。
种类:
1、 α-脱羧和β-脱羧; 2、直接脱羧和氧化脱羧:氧化脱羧是指
脱羧过程中伴随着氧化(脱氢)。
α-直接脱羧: β-直接脱羧:
α-氧化脱羧: β-氧化脱羧:
(三)生物氧化中水的生成
生物氧化中所生成的水是代谢物脱 下的氢经生物氧化作用和吸入的氧结合 而成的。
糖类、蛋白质、脂肪等代谢物所含 的氢在一般情况下是不活泼的,必须通 过相应的脱氢酶将之激活后才能脱落。 进入体内的氧也必须经过氧化酶激活后 才能变为活性很高的氧化剂。但激活的 氧在一般情况下,也不能直接氧化由脱 氢酶激活而脱落的氢,两者之间尚需传 递才能结合成水。所以生物体主要是以 脱氢酶、传递体及氧化酶组成的生物氧 化体系,以促进水的生成。
二、生物氧化的特点和酶类 (一)特点 氧化还原的本质是电子的转移。生物体

生物化学第三前半-PPT文档资料

生物化学第三前半-PPT文档资料

酶的催化活性可调节控制
常需要辅助因子
二 酶的化学本质和组成
1、 酶的化学本质---蛋白质或核酸
1926年,James Summer由刀豆中提取出脲酶得到 结晶,证明是蛋白质。 此后,J.Northop等又连续获得胃蛋白酶、胰蛋白 酶和胰凝乳蛋白酶结晶,并证明是蛋白质。 1983年Thomas R.Cech 发现某些RNA分子具有 催化活性,对有催化活性的RNA,命名为核酶 (Ribozyme)
COOH COOH
(CH2)2
H—C—NH2 +
CH3
C O 谷丙转氨酶(CH2源自2H—CCH3COOH
谷氨酸
COOH
丙酮酸
O + NH2 C H— COOH COOH
丙氨酸
酮戊二酸
A· X
+B
A +B· X
(3)
水解酶 hydrolase
• 水解酶催化底物的加水分解反应。 • 主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。 例如,脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应:
第1亚亚类,H受体为NAD+
该酶在亚亚类中的流水编号
根据反应性质将酶分为6大类
(1) 氧化还原酶类
(2) (3) (4) (5) (6) 转移酶类 水解酶类 裂合酶类 异构酶类 连接酶类
(1) 氧化-还原酶 Oxidoreductase
• 氧化-还原酶催化氧化-还原反应。 主要包括氧化酶(Oxidase)和脱氢酶 (dehydrogenase) 如,乳酸(-羟基丙酸,Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱 氢反应。
三 酶的命名和分类
1、习惯命名法 2、系统命名法
3 国际系统分类法和酶的编号
1、习惯命名法-1961年前用的都是此法

高中生物必修三第3章第3节 其他植物激素 课件.(共21张PPT)(完美版课件)

高中生物必修三第3章第3节  其他植物激素  课件.(共21张PPT)(完美版课件)
实验材料:豌豆幼苗、一定浓度的生长素、 一定浓度的赤霉素、培养液等
每个人都有潜在的能量,只是很容易被习惯所掩盖,被时间所迷离,被惰性所消磨。把命运寄托在自己身上,这是这个世界上最美妙的心思。为此努力,拼搏,不舍 满了魔鬼,学会控制他。如果你还认为自己还年轻,还可以蹉跎岁月的话,你终将一事无成,老来叹息。在实现理想的路途中,必须排除一切干扰,特别是要看清那 气,免百日之忧信心、毅力、勇气三者具备,则天下没有做不成的事改变自己是自救,影响别人是救人。当你感到无助的时候,还有一种坚实的力量可以依靠,那就 想未来是妄想,最好把握当下时刻。幸福不在得到多,而在计较少。改变别人,不如先改变自己。一个人能走多远,要看他有谁同行;一个人有多优秀,要看他有谁 要看他有谁相伴。同样的一瓶饮料,便利店里2块钱,五星饭店里60块,很多的时候,一个人的价值取决于所在的位置。忙碌是一种幸福,让我们没时间体会痛苦; 实地感受生活;疲惫是一种享受,让我们无暇空虚。10、我是世界上独一无二的,我一定会成功!成功者往往有个计划,而失败者往往有个托辞。成功者会说:“我 者说:那不是我的事。成功三个条件:机会;自己渴望改变并非常努力;贵人相助亿万财富买不到一个好的观念;好的观念却能让你赚到亿万财富。一个讯息从地球 0.05秒,而一个观念从脑外传到脑里却需要一年,三年甚至十年。要改变命运,先改变观念。人生的成败往往就在于一念之差。鸟无翅膀不能飞,人无志气不成功。 一个人不成功是因为两个字——恐惧。一个会向别人学习的人就是一个要成功的人。人要是惧怕痛苦,惧怕种种疾病,惧怕不测的事情,惧怕生命的危险和死亡,他 格的完善是本,财富的确立是末。傲不可长,欲不可纵,乐不可极,志不可满。在人之上,要把人当人;在人之下,要把自己当人。锲而舍之,朽木不折;锲而不舍 之至也,不精不诚,不能动人。我觉得坦途在前,人又何必因为一点小障碍而不走路呢?对时间的慷慨,成功不是将来才有的,而是从决定去做的那一刻起,持续累 困约,而败于奢靡。企业家收获着梦想,又在播种着希望;原来一切辉煌只代表过去,未来永远空白。一个最困苦、最卑贱、最为命运所屈辱的人,只要还抱有希望 翼,为何一生匍匐前进,形如蝼蚁世界上只有想不通的人,没有走不通的路。世上那有什么成功,那只是努力的另一个代名词罢了。所谓英雄,其实是指那些无论在 去的人。微笑不用本钱,但能创造财富。赞美不用花钱,但能产生气力。分享不用过度,但能倍增快乐。微笑向阳,无畏悲伤。我们不知道的事情并不等于没发生, 表不存在。我们渴望成功,首先要志在成功。我要让未来的自己为现在的自己感动。想哭就哭,想笑就笑,不要因为世界虚伪,你也变得虚伪了。小鸟眷恋春天,因 价值。笑对人生,能穿透迷雾;笑对人生,能坚持到底;笑对人生,能化解危机;笑对人生,能照亮黑暗。学在苦中求,艺在勤中练。不怕学问浅,就怕志气短。一 切成就都缘于一个梦想和毫无根据的自信。永远不要嘲笑你的教师无知或者单调,因为有一天当你发现你用瞌睡来嘲弄教师实际上很愚蠢时,你在社会上已经碰了很 话少胜过多言;坦率胜过伪装,自然胜过狡辩;心静何来多梦,苦索不如随缘。有一种落差是,你配不上自己的野心,也辜负了所受的苦难。最可怕的不是有人比你 还比你更努力。最有希望的成功者,并不是才干出众的人而是那些最善利用每一时机去发掘开拓的人。昨天如影——记住你昨天的挫折和失败的教训;今天如画快乐 去描绘;明天如梦——珍惜今天,选择好自己的目标,努力地为自己的明天去寻求和拼搏。不曾扬帆,何以至远方。不论你在什么时候开始,重要的是开始之后就不 去播种,再肥的沃土也长不出庄稼,不去奋斗,不去创造,再美的青春也结不出硕果。不要盘算太多,要顺其自然。该是你的终会得到。成大事不在于力量多少,而 成功者最重要的条件,就是每天精力充沛的努力工作,不虚掷光阴。从未跌倒算不得光彩,每次跌倒后能再战起来才是最大的荣耀。脆弱的心灵创伤太多,追求才是 挫折经历的太少,所以总是把一些琐碎的小事看得很重。当你知道你不在是你的时候,你才是真正的你!漫无目的的生活就像出海航行而没有指南针。人生多一份感 的豪言都收起来,所有的呐喊都咽下去。成功六机握机当你握着两手沙子时,一定就拿不到地上那颗珍珠了。快乐在满足中求,烦恼多从欲中来。人若有志,万事可 方法,就是要集中你所有的智慧,所有的热诚,把今天的事情做得尽善尽美。在茫茫沙漠,唯有前进时的脚步才是希望的象征。在我们了解什么是生命之前,我们已 界既不是有钱人的世界,也不是有权人的世界,它是有心人的世界。这个世界上任何奇迹的产生都是经过千辛万苦的努力而得的,首先承认自己的平凡,然后用千百 正的导者,其厉害之处不在于能指挥多少君子,而在于能驾驭多少小人。追逐着鹿的猎人看不到脚下的高山。

【医学ppt课件】生物化学(Biochemistry)

【医学ppt课件】生物化学(Biochemistry)
2003年版; 3. Hames B et al., Instant notes in biochemistry(影印版),
1999年版。
10
物质代谢变化与生理机能的关系——机能生物化学。
5
(三) 基因表达及其调控
转录
翻译
DNA
RNA
Pr
基因: 携带一定遗传信息的特定DNA片断以及相关的 调控序列;
(四) 专题生化
肝胆生化、水盐代谢和酸碱平衡等。
6
四. 生 物 化 学 与 医 药 学 的 关 系
与医学关系 2. 与药学关系 3. 与其他学科关系
【医学ppt课件】生物化学 (Biochemistry)
第一章 绪 论 (introduction)
2
一. 生物化学
主要是运用化学的理论和方法,从分子水平研究生 物体的化学组成及其在生命活动过程中化学变化规律 的一门学科,从而揭示生命现象的化学本质。
又称生命的化学(chemistry of life)。
3
二. 研 究 对 象
(主要针对组成生物体的六大营养素): 糖、脂、蛋白质、核酸、水和无机盐等
4
三. 主要内容
(一)生物体的物质组成及其结构和功能
蛋白质、核酸和多糖 —— 生物大分子 / 生物信息分子 物质的组成、结构与化学性质等 —— 静态生物化学;
(二) 物质代谢及其代谢调节
物质在体内的代谢变化规律、能量代谢及其代谢调节是生 物化学的中心内容——动态生物化学;
7
五. 学 习 生 化 的 目 的
1. 了解生物体内物质的化学变化过程; 2. 从分子水平阐明疾病发生、发展的机制; 3. 更科学、有效地诊断与防治疾病,并帮助阐明中医
药的作用机理; 4. 指导新药的研制、提高对重大疾病的防治水平; 5. 为其他医药学基础课及临床医学打下扎实的基础。

生物化学3第三章 维生素与辅酶zjg ppt课件.ppt

生物化学3第三章 维生素与辅酶zjg ppt课件.ppt
▪ 2、功能:在脱氢酶催化的氧化-还原反应中,起 着电子和质子的传递体作用。
▪ 缺乏时组织呼吸减弱,代谢强度降低。主要症状 为口腔发炎,舌炎、角膜炎、皮炎等。
2021/3/15
ZhangJG-Biochemistry
12
2021/3/15
ZhangJG-Biochemistry
13
2021/3/15
ZhangJG-Biochemistry
14
三、泛酸和辅酶A(CoA)
1. 结构——特点是含有β-丙氨酸

泛酸又叫遍多酸
▪ 2. 功能

辅酶A——酰基载体

是生物体内代谢反应中乙酰化酶的
辅酶。参与糖、脂类、蛋白质代谢。
2021/3/15
ZhangJG-Biochemistry
15
2021/3/15
体内不能合成或合成量不足,必须从食物中获得 的微量有机物。 ▪ 2、生理功能:调节酶活性和维持正常代谢
2021/3/15
ZhangJG-Biochemistry
3
▪ 3、维生素的特点
▪ 种类多、化学结构和生理功能各异
▪ (1)两种存在方式:维生素、维生素原;不提 供热量、不构成细胞结构,作用是参与代谢调节。 (2)维持正常的生理功能所必需的化合物,是 构成辅酶或辅基的基本成分。
9
2021/3/15
ZhangJG-Biochemistry
10
▪ 2、功能:
▪ 维生素B1 在体内经硫胺素激酶催化,转变成焦磷 酸硫胺素(TPP), 是脱羧酶、丙酮酸脱氢酶等 的辅酶,参加糖代谢等。
▪ 维生素B1缺乏症
▪ (1)脚气病:四肢无力,肌肉麻木、感觉异常等末梢神 经炎表现。
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
▲the term proteome is derived from proteins expressed by the genome.
▲The genome tells us what is possible什么是可能的, the proteome tells us what is functionally present什么是(功能上)存在的
4
• ▲e.g. which proteins interact to form a signal-transduction
pathway or an ion channel in a membrane
• ▲the proteome is not a fixed characteristic of the cell. Rather,
complex level of information content, the level of functional information, which encompasses the type, functions, and
interactions of proteins that yield a functional unit. 结构信息层面→功能信息层面(包括作为基本功能单位的蛋白的 类型,功能和相互作用)
2
• How do AA sequences specify the
conformations of proteins?
• How do proteins bind specific substrates and
other molecules, mediate catalysis, and transduce energy and information?结合特异底 物和其它分子,催化反应,转换能量和信息.
5
• Milk, a source of
nourishment for all mammals, is composed, in part, of a variety of proteins. The protein components of milk are revealed by
the technique of MALDITOF mass spectrometry, 质谱法which separates molecules on the basis of their mass to chargeOTEINS
1
概述 General overview
点击输入本栏的具体文字,简明扼要的说明分项内容,请根据您 的具体内容酌情修改。
Click to enter the specific text in this column to explain the sub item content briefly. Please modify it according to your specific content.
• Casein酪蛋白
lactalbumin乳清蛋白 lactoglobulin乳球蛋白
6
An indispensable必需的 step is the
purification of the protein of interest
• An adage of biochemistry: Never waste pure
▲Human genome, all 3 billion bases with 25000~30000 genes
▲But the knowledge of genome is analogous to a list of parts for a car —it does not explain how the parts work together ▲A new word has been coined, the proteome, to signify a more
thoughts on an impure protein
• investigating, characterizing, and cataloging proteins begins the
process by separating a particular protein from all other biomolecules in the cell 蛋白纯化是上述一切的前提
because it represents the functional expression of information信 息的功能表达, it varies with cell type, developmental stage, and environmental conditions(e.g. presence of hormones)它不是细 胞的固定特征,而是随细胞类型,发育阶段,环境条件变化的. The proteome is much larger than the genome because of such factors as alternatively spliced RNA可变剪接, the posttranslational modification of proteins翻译后修饰, the temporal regulation of protein synthesis蛋白合成的时序调控, and varying protein-protein interactions变幻莫测的蛋白间相互 作用. Unlike the genome, the proteome is not static.非静态
• An indispensable 必 需 的 step is the
purification of the protein of interest
3
The Proteome is the Functional Representation of the genome蛋白质组(学)是基因组的功能表达
相关文档
最新文档