全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿
生物信息学与系统生物学
生物信息学与系统生物学生物信息学与系统生物学是两个密切相关的学科领域，它们在现代生物科学研究中发挥着重要作用。
生物信息学主要关注利用计算机和统计学方法来存储、分析和解释生物学数据的过程，而系统生物学则旨在通过综合生物学实验和计算模型，揭示生物系统的组织原理和功能机制。
一、生物信息学生物信息学是一门交叉学科，融合了生物学、计算机科学和统计学的方法和技术。
它的研究对象包括基因序列、蛋白质结构、基因表达和调控等生物学信息。
生物信息学的主要任务是处理和分析这些信息，以获取对生物学现象的新见解。
1. 基因组学基因组学是生物信息学的重要分支，研究的是生物体中整个基因组的序列和结构。
通过高通量测序技术，人类和其他生物的基因组序列得到了广泛的研究和探索。
基因组学的发展不仅有助于揭示基因组的组成和进化，还可以为人类疾病的诊断和治疗提供重要的基础。
2. 蛋白质组学蛋白质组学关注生物体内所有蛋白质的组成、结构和功能。
通过蛋白质质谱技术和蛋白质相互作用网络的构建，蛋白质组学可以帮助我们理解细胞和生物体内各种蛋白质的相互作用关系，以及它们在生物过程中的功能和调控。
3. 转录组学转录组学研究的是细胞内所有基因的转录过程，即mRNA的生成。
通过RNA测序技术，转录组学可以帮助我们了解细胞在不同条件下基因的表达模式和调控机制，从而深入理解生物体内的各种生理和病理过程。
二、系统生物学系统生物学是以整体性和系统性的方式研究生物系统的学科。
它通过整合大量实验数据和应用数学模型，从整体上描述和解释生物系统的结构、生物学功能和动态过程。
1. 模型构建与分析系统生物学强调建立数学模型来模拟和预测生物系统的行为。
这些模型可以是定量的、定性的或者混合的，依据不同的研究目标和问题而定。
通过对生物系统的建模和分析，我们可以预测生物系统在不同条件下的动态行为，同时也可以发现和验证新的生物学假设。
2. 网络生物学网络生物学是系统生物学的一个重要分支，研究的是生物体内各种生物分子（如基因、蛋白质和代谢产物）之间复杂的相互作用关系。
生物信息学的前沿研究
生物信息学的前沿研究生物信息学是一门融合生物学和信息学的交叉学科，通过对生物学数据的收集、存储、分析和应用，为生物学研究提供了新的方法与工具。
随着科学技术的不断进步，生物信息学在生命科学领域的应用愈发广泛，许多前沿研究不断涌现。
一、单细胞测序技术的突破单细胞测序技术是近年来生物信息学领域的一项重要突破。
传统的基因测序技术无法区分不同细胞之间的差异，而单细胞测序技术通过对单个细胞进行测序分析，可以更全面地了解细胞的多样性和功能差异。
这项技术广泛应用于生命起源、发育生物学以及肿瘤学等领域的研究中，为我们深入了解生命的奥秘提供了强有力的工具。
二、基因组学中的人工智能应用人工智能在基因组学中的应用也是生物信息学的前沿研究领域之一。
随着大规模基因组测序数据的积累，传统的数据处理方法已经无法满足日益增长的数据分析需求。
而人工智能技术，如机器学习和深度学习算法，可以更好地挖掘大规模基因组数据中的信息，帮助科学家发现新的基因与疾病之间的关联，加速疾病诊断和治疗的进程。
三、结构生物学与计算生物学的结合结构生物学是研究生物分子结构的学科，而计算生物学主要关注于通过算法和计算模型研究生物学问题。
这两个学科的结合成为了生物信息学领域的研究热点。
通过计算机模拟和算法优化等方法，结构生物学和计算生物学的结合可以更准确地预测分子结构和功能，为药物研发和生物工程领域的发展提供重要支持。
四、功能基因组学的发展功能基因组学是研究基因组中基因和其功能之间的关系的学科。
随着高通量测序技术的飞速发展，我们对基因组中的编码蛋白质基因有了更全面的认识。
然而，编码蛋白质基因只占基因组的一小部分，而功能基因组学的研究重点则是探索非编码基因以及其在基因调控和疾病发生中的作用。
通过整合大规模的基因组数据和生物学实验结果，功能基因组学为我们揭示了更多基因调控网络的细节，加深了对生物体内复杂生物过程的理解。
总结：生物信息学的前沿研究在推动生命科学的发展和应用中发挥着重要作用。
生物信息学与系统生物学的融合发展
生物信息学与系统生物学的融合发展生物信息学和系统生物学作为两个年轻的学科，在过去的几十年里发展迅速，并成为了生命科学最激动人心的领域之一。
随着这两个学科的发展，人们意识到它们之间存在着密不可分的联系。
生物信息学和系统生物学的融合发展，不仅为生命科学领域的研究提供了新思路和新方法，更为人类的健康事业做出了卓越的贡献。
一、生物信息学所谓生物信息学，简单来说，就是通过计算机科学和信息技术手段，对生命现象的数据进行收集、存储、分析和应用的一门新兴学科。
它的主要任务是利用各种方法和技术，解析生命现象中隐藏的规律和问题，为生物学提供新的视角、思路和工具。
自从1990年人类基因组计划启动以来，对基因组信息的获取和处理成为了生物信息学的一个重要部分。
高通量测序技术、微阵列技术等新技术的出现，将人们获取生命现象数据的能力提高到了一个新的水平。
同时，也推动了生物信息学的快速发展。
在生物信息学的发展过程中，人们建立了大量的计算工具、数据库和分析技术，如BLAST、ClustalW、FASTA和KEGG等，这些工具和数据库为生物信息学的应用提供了更加稳健和优秀的基础和物质。
二、系统生物学另一个快速发展的生命科学领域是系统生物学。
系统生物学是一种科学思维方式，旨在理解生物系统的组成、结构和功能，以及不同生物组成之间的相互作用。
该学科结合了生物学、物理学、化学、计算机科学和数学等多个学科的知识，建立了一种综合性的、系统性的生物研究模式。
它的重点在于探究生物系统的整体性质、动态性质和精确性质。
系统生物学的核心研究内容包括：生物系统的建模、分析和仿真；生物系统的网络建立和拓扑分析；生物系统内各个元素的空间分布研究和药物动力学分析等。
三、生物信息学和系统生物学的融合由于生物信息学和系统生物学都是对生命现象进行数据建模和分析等方面的研究，因此它们有很多相似的地方。
例如，两者都使用计算工具来进行数据处理和分析，两者都需要建立模型来表征、预测和优化系统行为。
生物医学信息学的国际合作
生物医学信息学的国际合作生物医学信息学是一门综合了计算机科学、数据科学和生命科学的学科。
它通过收集、处理、分析和应用生物与医学数据，来推动医学科技的发展，帮助人类更好地理解和治疗疾病。
生物医学信息学的国际合作是十分重要的。
一方面，科技的进步让数据和信息可以在全球范围内快速传输，创新性的科研成果也往往依赖于不同国家的协同合作；另一方面，不同国家和地区的疾病类型和流行病学也存在差异，这为合作提供了更多的科学挑战和机会。
因此，加强国际合作，打破学科和领域的壁垒，是推动生物医学信息学健康发展的关键。
在生物医学信息学领域，许多国际组织和机构已经成立，通过开展合作研究、组织学术会议和培训等活动，促进该领域的交流和发展。
例如，生物信息学联盟（ISCB）是一个全球性的组织，旨在促进生物信息学发展。
该组织积极开展国际会议和学术研究，如每年一次的“生命科学计算生物学大会”，该会议为生物医学信息学领域提供了一个展示最新研究进展的平台。
除此之外，该组织还通过举办各种活动和培训班，以吸引年轻有为的科学家和学生加入到该领域的研究中来。
另外，欧洲联合生物医学工程学会（EMBS）聚集了关于医学工程和生物医学信息学专业的专家和学者，以提高欧洲社会的医疗水平和国际竞争力。
该组织致力于加强不同领域的交流，建立国际性的研究合作平台，并且通过发布国际性的学术期刊和举办学术研讨会等方式，为生物医学信息学领域贡献出了巨大的力量。
在亚太地区，亚洲生物医学科学联合会（APBM）是一个由来自不同国家的生物医学科学学者组成的非营利性组织。
该组织定期举办学术研讨会、培训班和科研合作活动等，并鼓励青年学者参与到学术交流和合作中。
此外，APBM还与其他国际组织举办联合会议，为不同学科和领域提供交流平台。
除此之外，许多国际合作项目也在推动生物医学信息学领域的发展。
例如，由欧盟资助的“人类蛋白质计划”（HPP）致力于建立一个全面的人类蛋白质图谱，并促进在任何蛋白质水平上的研究协作。
生物信息学前沿研究
生物信息学前沿研究随着生物学研究的深入，生物信息学这门学科也越来越受到重视。
生物信息学是一门交叉学科，涉及生物学、计算机科学、数学和统计学等领域。
它利用计算机技术和数学方法对生物学的信息进行处理、分析、管理和解释，为生物学研究提供了强大的工具。
生物信息学前沿研究领域很广，其中一些比较重要的领域包括：基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、系统生物学、结构生物学等。
下面我将从这些方面来谈谈生物信息学前沿研究的一些进展。
基因组学基因组学是研究基因组结构、组成和功能的学科。
随着高通量测序技术的发展，我们可以快速、准确地测定一个生物的基因组序列。
这为我们研究生物演化、基因功能和疾病机理提供了有力的手段。
比如，通过比较多个物种的基因组序列，我们可以了解它们的演化历史，并挖掘出这些物种群体之间的基因变异。
此外，基因组学还可以帮助我们理解遗传疾病的发生机制，从而为药物研发提供参考。
转录组学转录组学研究的是细胞内所有基因表达的情况。
通过转录组测序技术，我们可以获得一个生物的所有转录本信息，从而挖掘出它们在不同生理状态下的表达模式和功能信息。
近年来，转录组学在癌症研究中取得了一些令人振奋的进展。
研究人员发现，癌细胞的转录组不同于正常细胞，其中一些基因呈现异常表达，导致了癌症的发生和发展。
利用这些信息，我们可以设计出特异性更高、副作用更小的抗癌药物，为临床治疗提供更有效的手段。
蛋白质组学蛋白质组学是研究蛋白质组成、结构和功能的学科。
与基因组学不同，蛋白质组学研究的是生物体内表达的蛋白质，因为蛋白质才是决定细胞功能和特性的重要物质。
近年来，蛋白质组学在肿瘤研究中的应用备受关注。
研究人员利用质谱技术分析肿瘤细胞中大量存在的蛋白质，发现一些具有较高水平的蛋白质在肿瘤细胞中表达过高，从而导致肿瘤发生。
利用这些信息，我们可以设计出针对这些蛋白质的特异性药物，为肿瘤治疗提供更为有效的手段。
代谢组学代谢组学是研究生物体内代谢产物的组成和变化规律的学科。
生物信息学领域国际会议列表
1.31
45
ICCIT
46
Bioinformatics and Biomedicine
BIBM
June
IEEE
High Performance Computational Biology
HiCOMB
Novenber
IEEE
47
Biotechnology and Bioinformatics Symposium
ISPA
28
IEEE Workshop on Design and Diagnostics of Electronic Circuits and Systems
DDECS
高性能计算和存储领域最好的会议之一
29
International Symposium on Computer Architecture
EMBC
4月
生物信息学与计算生物学国际研讨会
6
Workshop on Algorithms in Bioinformatics
WABI
WABI创办于2000年，每年举办一次，由欧洲理论计算机协会(EATCS)和国际计算生物学协会(ISCB)主办，强调生物信息学的算法方面。
7
8
European Conference on Computational Biology
HPCASIA
34
IEEE International Workshop on Rapid System Prototyping
RSP
35
EUROMICRO Conference on Digital System Design
DSD
36
Symposium on Integrated Circuits and Systems Design
生物信息学与系统生物学的关键概念
生物信息学与系统生物学的关键概念1. 生物信息学概述生物信息学是一门交叉学科，它将计算机科学、数学和统计学应用于生物学的研究中。
生物信息学的目的是从生物数据中提取知识，并为生物学家提供数据分析和解释的工具。
2. 系统生物学概述系统生物学是一门研究生物系统中组成部分之间的相互作用和整体行为的学科。
它关注于从分子、细胞、组织到器官和生态系统的不同层次的结构和功能。
3. 生物信息学与系统生物学的关键概念3.1 基因组学基因组学是研究生物体所有基因的学科。
它包括基因的识别、排序、结构和功能的研究。
基因组学为生物信息学和系统生物学提供了大量的数据和信息。
3.2 转录组学转录组学是研究基因表达的学科。
它关注于RNA的合成和调控，以及它们如何影响蛋白质的合成。
转录组学数据可以揭示生物体的基因表达模式和调控机制。
3.3 蛋白质组学蛋白质组学是研究蛋白质结构和功能的研究领域。
它包括蛋白质的鉴定、定量、相互作用和动态变化的研究。
蛋白质组学为理解生物体的功能和疾病机制提供了重要信息。
3.4 代谢组学代谢组学是研究生物体代谢产物的学科。
它关注于代谢物的鉴定、定量和变化，以及它们如何反映生物体的生理和病理状态。
代谢组学数据可以揭示生物体的代谢途径和调控机制。
3.5 系统建模系统建模是生物信息学和系统生物学中的一项重要技术。
它通过建立数学模型来模拟生物系统的组成部分和它们之间的相互作用。
系统建模可以帮助预测生物系统的行为和响应。
3.6 数据挖掘和机器学习数据挖掘和机器学习是生物信息学和系统生物学中用于分析大量生物数据的技术。
它们可以帮助识别模式、预测结果和发现新的关联。
3.7 生物信息学工具和软件生物信息学工具和软件是用于生物信息学分析和解释的程序和应用程序。
它们包括基因组浏览器、序列分析工具、系统建模软件和数据挖掘工具。
4. 生物信息学与系统生物学的发展趋势生物信息学和系统生物学的发展趋势包括：1. 技术的进步：高通量测序、质谱和成像技术的发展为生物信息学和系统生物学提供了更多的数据和信息。
生物信息学及其广泛应用
揭示遗传性疾病特别是癌症的发病机制，并研发新 的诊 断 和治 疗 方 法 。其 报 告 “ Ｉ ｎ ｔ ｅ ｇ ｒ ａ ｔ ｉ ｖ ｅ Ｃ ａ ｎ ｃ ｅ ｒ
Ｇｅ ｎ ｏ ｍｉ ｃ ｓ ：Ｉ ｍｐ ａ ｃ ｔ ｏ ｆ Ａｌ ｔ ｅ ｒ ｎ ａ ｔ ｉ ｖ ｅ Ｓ ｐ ｌ ｉ ｃ ｉ ｎ ｇ ｏ ｎ Ｍｉ ＲＮＡ
和相关研究人员能够对生物信息学领域的热点问题 进行深入的研究与探讨 ，促进国内外生物信息学者 的交流。 会议 旨在研究讨论 国外教学模式 、 科技前沿
趋势 、 科研工作的方法和理念 ， 提高我 国科研水平 ， 培养优 秀人才 ， 搭建 海外华 裔 学者 回 国服 务 的桥 梁 ， 促进生物信息学研究 的交流与发展。
Ｗｏ ｒ ｋ ｓ ｈ ｏ ｐ ， Ｉ Ｂ Ｗ ２ ｏ １ ２ ） 。
本届生物信息学 国际研讨会开幕式由吉林大学
计算机科学与技术学院副院长梁艳春教授主持 ， 吉 林 大学 校 长助 理李 凡 教授 莅 临 会议 并致 欢 迎词 ， 大 会主席徐鹰教授就本届研讨△Ｊ 晴况 向大家作了说明 报告 。１ ９ 位特邀代表 的大会报告涉及到基因组分
校。 他 的研 究 方 向包 括 基 因调控 网络 的结构 、 动力 学 性质 及进 化 、 衰 老 的分 子生 物学 机制研 究等 。 他 的报
告“ Ａ Ｓ ｙ ｓ ｔ ｅ ｍｓ Ｂ ｉ ｏ ｌ ｏ ｇ ｙ Ａ ｐ ｐ ｒ ｏ ａ ｃ ｈ ｔ ｏ Ａ ｇ ｉ ｎ ｇ ａ ｎ ｄ Ｃ ｏ ｍｐ ｌ ｅ ｘ
Ｅ － ｍ ａ ｉ ｌ ： ｙ ｕ ｚ ｈ ａ ｏ ＠ｊ ｌ ｕ ． ｅ ｄ ｕ ． ｃ ｎ
衔 计以及临床医学等。 参会人员包括来 自国内外 ４ ０ 多
勤
慧
于钊 ： 副研究员。
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Deep learning and applications in computational 曾坚阳
biology
清华大学
梁晗
Functional proteomics as a major approach for precision cancer medicine
美国德克萨斯大 学 MD 安德森
第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会 暨国际生物信息学前沿研讨会
会议时间：2016 年 10 月 7 日— 9 日（6 日报道） 会议地点：成都市金牛区金泉路 2 号（成都金牛宾馆）
会议日程概要
时间
内容
地点
10 月 6 日 10 月 7 日
10:00 ~22:00 20:30~ 21:30
8:15 ~11:50 11:50 ~12:20 13:30 ~17:40
开幕式
1. 领导、专家致辞 8:15 – 8:45 2. 大会秘书长致辞、简要报告会议的筹备
8:45 – 9:05 全体参告
时间
报告人
报告题目
主持人
9:05 – 9:35 郝柏林 原核生物亲缘和分类的大范围考察 9:35 – 10:05 陈润生 待定
孙之荣
10:05 – 10:20 10:20 – 10:50 10:50 – 11:20 11:20 – 11:50
刘海燕
构
学
Investigating the large-scale conformational
龚海鹏 change of membrane proteins using molecular
清华大学
dynamics simulations
茶歇
专题报告（一）蛋白质等生物大分子结构与功能研究
主持人：刘海燕/龚海鹏
4:00 – 4:20 4:20 – 4:40
4:40 – 5:00
5:00 – 5:20
5:20 – 5:40
来鲁华
Allosteric regulation of protein functions
北京大学
肖 奕 RNA 3D structure prediction using co-evolutionary 华中科技大学 information
礼堂
大会报告 昂迈思科技暖场 展示 分会场报告
分会理事会议
礼堂
俱乐部厅 俱乐部正厅、西苑厅、芙蓉楼二层
A 东苑六层 A 会议室
大会报告，闭幕式
礼堂
离会或成都观光、体育娱乐活动
会议期间联系： 郭锋彪 13880956017， 黄 健 13730847647
1
会议日程
一、10 月 7 日上午, 礼堂
时间
董 昊 release-activated calcium channel with molecular
南京大学
dynamics simulations
Predicting the errors of predicted local backbone
高建召 angles and nonlocal solvent-accessibilities of
王存新
Molecular docking studies of protein-RNA interactions
北京工业大学
曹志伟
抗体抗原特异识别的计算方法进展
同济大学
Rare event dynamics involving membrane systems
魏冬青
上海交通大学
and cadd
蛋白质设计统计能量模型：从设计序列到设计结 中国科学技术大
陈润生
2
二、主题报告、专题报告（一）10 月 7 日下午，俱乐部正厅 主题报告（一）蛋白质等生物大分子结构与功能研究 主持人：来鲁华/肖 奕
时间
报告人
报告题目
工作单位
1:30 – 1:50 1:50 – 2:10 2:10 – 2:30 2:30 – 2:50 2:50 – 3:10 3:10 – 3:30 3:30 – 3:50 3:50 – 4:00
癌症中心
Predict noncoding RNAs' secondary structures by 鲁 志 integrating high-throughput probing data and
清华大学
energy model
Exploring the gating mechanism of the calcium
南开大学
proteins by deep neural networks
3
三、主题报告、专题报告（二）10 月 7 日下午，西苑厅 主题报告（二）复杂生物过程与复杂疾病系统生物学及转化医学 和 精准医学新理论新方法
主持人：张晓华/于军
时间
报告人
报告题目
工作单位
From genotype to phenotype: a five-track
任兵 徐鹰 李浩
茶歇
A compendium of promoter-centered long-range chromatin interactions in 27 human tissues and cell types Fenton reactions drive nucleotide and ATP syntheses in cancer, and implications Deciphering the genetic determinants of complex human traits through a global and integrative analysis of genome-wide association
中国科学院北
1:30 – 1:50 于 军 minimal stratification to address the complexity 京基因组研究
of all life forms
所
The mechanism research on anti-aging effects of 军事医学科学院
晚上
8:30
~11:45
13:00
10 月 8 日
~13:30） 13:30
~18:00
20:00
~21:30
8:30
10 月 9 日 ~11:55
下午
会议报到
金牛宾馆 礼堂
生物信息人才培 养研讨卫星会
东苑六层 A 会议室
开幕式，大会报告
礼堂
浪潮高性能计算 卫星会 分会场报告
墙报
礼堂
俱乐部正厅、西苑厅、芙蓉楼二层 A