PubMed的使用
《PUBMED使用方法》课件
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PUBMED的搜索功能和使用技巧
1 快速搜索技巧
使用搜索词时，可以写单词的缩写、同义词以及纳入相关的关键字。
PUBMED使用方法
Welcome to this presentation on how to use PUBMED. Discover the advantages of this platform, tips on searching for articles and much more.
什么是PUBMED？
PUBMED是什么？
PUBMED是运行于美国国家医学图书馆之上的免费文献检索工具，提供了数百万份的医学 文献和研究报告
PUBMED的优势与作用
PUBMED 收录的期刊文献广泛，资源丰富，并且是医学领域权威性很强的检索工具之一， 多国医生和科研人员使用。
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2 高级搜索技巧
在高级搜索中，可以使用布尔逻辑运算符（AND、OR和NOT），以更精确地定义搜索问 题。
3 搜索结果的过滤
过滤筛选与精简搜索结果相当，可以更快更容易地找到所需内容。
如何阅读PUBMED上的论文
1
选定论文
查找感兴趣的论文，结合年份，作者，期刊等进行检索。
2
查看摘要
确认论文的基本信息并查看摘要，摘要内容包括背景、目的、方法、结果、结论 以及前景。
PUBMED的其他相关资源和服务
NLM
pubmed文献检索的基本步骤
PubMed文献检索的基本步骤如下：
打开PubMed的网址进行主题词搜索。
在搜索框中输入关键词，如使用布尔运算符AND、OR或NOT进行组合检索，或者添加截词符号、特殊符号进行检索。
根据需要选择合适的主题词，并使用“限定”功能对搜索结果进行筛选。
查看搜索结果，并选择符合需求的文献进行阅读或下载。
此外，还可以使用PubMed的高级检索功能，通过限定字段、日期、作者等条件来缩小搜索范围，提高搜索的准确性和效率。
同时，也可以使用PubMed的过滤器功能，根据需要筛选出符合特定要求的文献。
总之，PubMed文献检索需要掌握一定的检索技巧和基础知识，通过不断实践和总结经验，才能提高检索效率和准确性。
pubmed检索方法
pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆（National Library of Medicine）所开发的一个免费的生物医学文献库，包含了全球几乎所有的生物医学文献，是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。
本文将介绍Pubmed 的检索方法。
一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式，通过输入关键字搜索相关的文献。
在检索时需要注意以下几点：（1）关键词要准确。
Pubmed 检索采用布尔操作符（AND、OR、NOT）连接多个关键词，关键词之间要使用英文逗号（，）隔开。
使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。
（2）参数设置。
可以根据需求调整相关参数，例如年份、文献类型（Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等）、文章作者、机构等。
（3）英文文献。
Pubmed 绝大部分都是英文文献，所以检索时需要使用英文关键词。
（4）筛选性强的关键词。
例如疾病名称、独特的药品名称等。
Pubmed 支持多种文献类型检索，例如：（1）临床试验在 Pubmed 首页上，勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。
（2）随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。
（3）综述勾选文章类型为系统综述或综述，可以检索到该领域最新的文献综述。
三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号（MeSH Terms），用户可以通过选择学科分类号进行检索。
在检索时需要注意以下几点：（1）科学性强的关键词。
例如，临床试验、人类、治疗法等。
（2）与所需内容相关的关键词。
例如，药物作用机制、剂量方案等。
（3）使用适当数量的关键词。
使用过少的关键词会导致检索结果过多，使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。
Pubmed 中的文献都会有一个分值，通过分值和其他指标来对文献进行评价。
pubmed的使用
1简介
• PubMed 是一个免费的搜寻引擎，提供生 物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数 据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学， 但亦包括其他与医学相关的领域，像是护 理学或者其他健康学科。它同时也提供对 于相关生物医学资讯上相当全面的支援， 像是生化学与细胞生物学。该搜寻引擎是 由美国国立医学图书馆提供，作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。PubMed 的资讯 并不包括期刊论文的全文，但可能提供指 向全文提供者（付费或免费）的链接。
将两次历史添加上去，再搜索
得到较好结果
结果
全文的获取
• 由于pubmed是文摘数据库，能提供的全文 很少，故全文需要在其他全文数据库中寻 找。一般pubmed会提供相关链接，该链接 指向的目标能够提供全文（免费或收费）。 或者自己根据pubmed的相关信息到其他数 据库中寻找。Google的学术搜索也相当强 大能找到不少免费全文。
pubmed界面简介
可选检索范围
简单检索
搜索后结果
再次搜索后结果
选定副主题后搜索结果
可对结果进一步筛选
筛选后结果
• 布尔逻辑检索的简单应用 • 对于关键词较多，关键词间逻辑关系较复 杂的检索要求有很好的效果。（以DNA与 watson为例）
先检索其中一个
在检索另一个
选择“高级检索”
• 1、抓住要检索内容的关键词，比如《×××的现状与展 望》就是一篇综述而在收索时就不能收索“现状与展望”。 • 2、考虑到关键词的类似说法，即有可能出现的同义词， 比如“AIDS”的相关词“HIV”。 • 3、使用布尔逻辑法提高检索效率。 • AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词之一存在 于文中，该文就会被列出。 • OR则是至少有一个关键词出现在文中，该文才会被列出， 这种运算在有相似主题和同义词时十分有效。 • NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去， 比如“A NOT B”就是指A中不包含B的部分。这种方法 虽然提高了精确度，但降低了检全率。
pubmed的使用
第3章 PubMed检索PubMed是因特网上最著名的免费Medline数据库，是由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心（National Center for Biotechnology Information ，NCBI)提供的，其网址为：/PubMed/。
该系统于1997年开始使用，与以往的Medline 光盘数据库相比，它具有收录范围广、更新速度快、界面友好等特点，并且由于NCBI与多家出版商达成协议，出版商在期刊出版之前或在期刊出版的同时，将期刊论文题录提供给PubMed, 通过部分文献的链接可到达出版商的网站，从而获取相应期刊的全文。
3．1 PubMed的收录范围PubMed的数据主要有4个部分，即Medline、OLDMEDLINE 、In Process Citations、Record Suppled by Publisher。
Medline：与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同，但数据更新速度较快。
OLDMEDLINE:收录了1950－1965年间的美国医学索引（IM）中的题录。
In Process Citations：是一个临时性的数据库，收录准备进行标引的题录和文摘信息，每天都在接受新的数据，进行文献的标引和加工，每周把加工好的数据加入到Medline中，同时从In Process Citations库中删除。
In Process Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。
Record supplied by publisher：出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后，每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记，这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送，加入到In Process Citations后，原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。
PubMed使用教程指南
引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库，由美国国家医学图书馆（NLM）开发和维护。
这个教程指南是第二部分，旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献，并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH（医学主题词）进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed中使用主题词检索的方法
pubmed中使用主题词检索的方法在PubMed中使用主题词进行检索是一种有效的方法，可以帮助您更准确地找到与特定主题相关的文献。
以下是使用PubMed进行主题词检索的基本步骤：1. 打开PubMed网站：在浏览器中输入PubMed的网址（），然后按Enter键打开PubMed主页。
2. 选择主题词检索：在搜索框上方，您会看到一个下拉菜单，其中列出了不同的检索选项，包括"Title/Abstract"、"Mesh"等。
选择"Mesh"选项，这将允许您使用主题词进行检索。
3. 输入主题词：在搜索框中输入您想要查找的主题词。
例如，如果您想查找与糖尿病相关的文献，可以输入"diabetes"。
4. 执行检索：点击搜索按钮或按Enter键执行检索。
5. 浏览结果：系统将返回与您输入的主题词相关的文献列表。
您可以浏览标题、摘要和其他相关信息，以确定哪些文献与您的研究兴趣相关。
6. 筛选结果：在检索结果页面上，您可以使用各种筛选器来进一步缩小结果范围。
例如，您可以按年份、研究类型或发表期刊等筛选文献。
7. 查看详细信息：如果您对某个特定的文献感兴趣，可以点击其标题或链接，进入详细信息页面。
在那里，您可以查看完整的文献摘要、作者信息、发表日期等更多信息。
8. 保存和导出：如果您需要保存或导出检索结果，您可以使用PubMed提供的导出功能。
通常，您可以将检索结果导出为CSV或PDF格式，以便于进一步分析或与他人共享。
请注意，使用主题词进行检索可以帮助您更准确地找到相关文献，但也可能排除一些与您的主题相关的其他重要文献。
因此，在进行主题词检索时，建议同时使用其他检索选项（如标题/摘要检索）来获得更全面的检索结果。
如何使用pubmed进行文献检索
如何使用pubmed进行文献检索使用PubMed进行文献检索是非常重要的，因为它是一个专门为生命科学和医学领域提供的免费文献数据库。
下面是一个详细的步骤指南，以帮助你使用PubMed进行文献检索。
2. 进行关键词：在PubMed首页的框中输入你感兴趣的关键词，可以是疾病名称、特定的治疗方法、生物标志物等。
点击“”按钮。
4.阅读摘要和全文：当你找到感兴趣的文章时，你可以点击标题以查看摘要。
摘要通常提供了关于研究目的、方法、结果和结论的概述。
如果你对文章感兴趣并且有免费全文可用，你可以直接点击“全文”链接以阅读完整的文章。
5. 扩大或缩小范围：如果你的结果不够理想，你可以尝试扩大或缩小范围。
你可以使用更广泛或更具体的关键词来，或者使用PubMed高级功能来更精确地定位你的。
6. 使用MeSH词汇进行检索：MeSH（Medical Subject Headings）是PubMed的一种标准词汇，用于对文章进行分类和索引。
如果你想进行更准确的检索，你可以使用MeSH词汇来。
在框中输入你的关键词，然后点击右侧的“在[MeSH]中”按钮以进一步精确。
7. 使用历史和提示：PubMed提供了历史和提示功能，以帮助你更好地管理和改进你的。
你可以在框下方找到你最近的历史记录，并且当你输入关键词时，PubMed会自动提供相关的建议。
8. 使用PubMed Central进行全文检索：除了PubMed，你还可以使用PubMed Central来全文可用的文章。
PubMed Central是一个免费的全文文献数据库，其中包含了许多生命科学和医学领域的文章。
你可以在PubMed结果页面的右上方切换到PubMed Central进行检索。
总结起来，使用PubMed进行文献检索需要一些技巧和经验。
通过使用关键词、筛选结果、阅读摘要和全文、扩大或缩小范围、使用MeSH词汇、使用历史和提示、使用PubMed Central进行全文检索、导出和管理文献等功能，你可以更有效地利用PubMed来找到相关的研究文献。
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PubMed的使用
生物信息学2班A组
内容提要：
PubMed的基本使用方法 PubMed的高级使用方法 PubMed与My NCBI
一、Pቤተ መጻሕፍቲ ባይዱbMed的基本使用
通过作者搜索 在搜索框中输入作者姓及名首字母，不 要在搜索框中输入标点，点击Go。如果 你只知道作者的名字而不知道姓氏，需 要使用作者搜索标签[AU]。使用Limit选 框可以作者搜索引擎，输入你知道的名 字会自动生成含有姓氏的姓名。
获得摘要 点击文章的标题阅读摘要，如果显示 “No abstract available”说明没有摘要供 阅读。
二、PubMed的高级使用方法
1、 想使搜索的效率更高可以使用一些搜 索域和标签来缩小搜索范围，这些标签 如下：
Clipboard clipboard可以暂时保存所检索的文献，最 多可保存500条，8小时之后就会被删除。 要想永久无限量的保存检索文献需要注 册My NCBI。
Details 显示检索的一些细节：
解读搜索结果 PubMed的搜索结果以汇总的方式 罗列出来，看以下的搜索结果分 析表：
3、PubMed Clinical Queries 临床专业检索系统
PubMed Clinical Queries 页面为临床医学 提供了专业检索系统。 在PubMed工具条上点击Clinical Queries 点击Search by Clinical Study Category 在搜索框中输入要检索的内容 选择相应的类别: therapy, diagnosis, etiology, 或者prognosis 选择检索范围: narrow, specific search or broad, sensitive search
Bibliographies 可以在这里添加需 要保存的引文。
Saved Searchers 可以对所进行的检索进行保存，下次重复同 类操作的时候直接点击便可。 添加的方法如图
Collection 可以将希望保留的引文保存才Collection中，方 法如下图：
设置个人的filter
使用刊物名搜索 在搜索框中输入刊物名或者题目的缩写， 可以附加任何相关条目，点击Go。 与搜索姓名时相同同样可以运用Limit选 框，同样在刊物搜索引擎中会自动生成 完整的刊物名，如下：
PubMed把所有可检索关键词按字母顺序排列， 方便读者快速查找。 1 点击Preview/Index 框（几个选框的内容） 2 在页面底部选择检索领域 3 在检索框中输入关键词，如果想检索所有领 域，检索框为空。 4 点击Index 5 在检索词后的括号内会显示关键词使用频率 6 选择相应的词条，可以使用布尔逻辑语法 （系统从左到右识别优先级别）。 7 添加其他的检索条目，进一步精确描述检索 对象，缩小检索范围。
预测检索结果(Preview)，在展开检索结果之前预览引 用频率: 1 点击 Preview/Index 栏 2 在检索框中输入检索关键词 3 点击 Preview. 就可以看见检索内容 4 如果想看检索频率，就点击它的链接 搜索参考文献前，可以用Preview进一步限制检索范围 1在检索框中输入检索关键词 2 点击预览，会看到现实的结果 3 按这种方法，把范围缩小到可以准确找到结果的程度 注: Preview 只显示History中的最近三个检索词，检索 历史包括19条历史检索信息
三、PubMed与My NCBI
在使用PubMed时最好注册一个My NCBI 账户，这会使PubMed的使用更具个性化 而且功能也更多。 以下介绍的功能都是在登陆My NCBI后 实现的。
1、My NCBI HOME
点击My NCBI HOME这里，你可以看到保存 的NCBI的全部数据。
2、My Saved Data
3、Batch citation matcher
顾名思义，与single citation matcher 相对， 它可以实现多篇文献的一次性搜索，搜 索时按照如下格式输入检索文献的关键 词 journal_title|year|volume|first_page|author_ name|your_key| 也可以填写E-mail地址，PubMed会通过 E-mail将检索结构发送到邮箱中。
2、如何使用Single Citation Matcher
在PubMed工具条中点击Single Citation Matcher，通过它可以实现一对一的检索。 输入要检索的单一信息，系统会根据 PubMed中的内存对关键词进行自动匹配， 比如作者姓名的全拼和简写，第一作者， 所有作者，和通讯作者等。
Preference的设置 可以通过设置参数来对搜索的数据进行过 滤。
其中的E-mail可以设置对感兴趣的搜索信 息进行追踪。 新的搜索信息会以邮件的方式发送到邮 箱中。
谢谢！
查看搜索历史记录 点击History 按钮，会显示搜索的运行结 果。例如：某次检索的运行结果为：#18 PMC Links for PubMed (Search avian influenza) 12:28:03 644 ，点击蓝色的结果 数644，可以查看搜索结果。点击搜索号 码（例如本例中的#18）可以打开选项菜 单，包括布尔逻辑符AND, OR 、 NOT， 以及Delete、Go、Details等。
4、查找引文的其他相关信息
通过Display下拉菜单连接到NCBI 的其他数据库。同时 搜索所有NCBI中的数据库可以使用跨数据库检索系统。 即点击“ALL DATABASE”进入”“Search across databases“。 利用LinkOut找到引文的其他相关链接。大多数引文有 LinkOut可以链接到不同的网站，包括出版商，图书馆， 生物数据库，序列中心等。通过链接我们就可以由相 关供应商等处，获取全文或一些其他相关资源。要查 找引文带有免费全文的链接，在搜索栏中输入搜索字 词并在其后加上AND free full text[sb] .同理要查找带有 全文的引文，可以在搜索栏中输入搜索字词并在其后 加上AND full text[sb]。例如:搜索关于禽流感的相关免 费全文，可以在检索框输入avian influenza AND free full text[sb]。