组蛋白甲基化
组蛋白甲基化、磷酸化乙酰化检测实验

组蛋白甲基化/磷酸化/乙酰化检测实验
实验技术服务简介:
本检测包括甲基化组蛋白H3K4、甲基化组蛋白H3K9、甲基化组蛋白H3K27、组蛋白H3磷酸化(Ser10)检测、组蛋白H3磷酸化(Ser28)检测、组蛋白H3乙酰化检测、组蛋白H4乙酰化检测等。
【晶莱生物】
本方法基于特异性抗体检测组蛋白各组分,通过比色定量的方法得出各组分的含量。
实验周期:10-12个工作日内完成,重复检测优惠。
客户注意事项
1、抗体:
事先咨询晶莱生物,明确抗体种属以及是否有该抗体可使用,如无可由双方协商而定,客户自己购买提供或我公司代购;
2、标本收集与保存:
组织样品:新鲜组织放入液氮或-70度保存,组织不少于100mg(约绿豆大小);培养细胞:通过细胞计数取不少于2000000个细胞于EP管,加入0.5ml生理盐水或蛋白保护剂,混匀后保存于冰箱(-70℃,避免反复冻融);
血液细胞标本:以抗凝管保存血样或以淋巴细胞分离液分离细胞后加入0.5ml 生理盐水或蛋白保护剂,保存(-70℃可长期保存,避免反复冻融)
血清或细胞培养液标本:离心去掉杂质后取上清入EP管,保存(以上4℃可保存15-20天,-70℃可长期保存,避免反复冻融)
3、样本运输:
可选以下任何的一种方式寄送标本
组织样本、细胞样本以干冰运输或加入蛋白保护剂后加冰袋运输;
细胞样本也可以直接快件寄送培养瓶(密封保证不污染,培养液不漏出,细胞不要长得太满,50%左右,灌满培养液);
血清或上清液直接加冰袋寄送(密封保证液体不漏出,视路途远近2-3天可到达)。
组蛋白甲基化的功能

如对您有帮助,可购买打赏,谢谢组蛋白甲基化的功能导语:健康长寿是每个人都想拥有的,所以对于很多人来说,要想让自己健康长寿,必须要了解更多的健康知识,所以有很多人,想全面了解一下组蛋白甲健康长寿是每个人都想拥有的,所以对于很多人来说,要想让自己健康长寿,必须要了解更多的健康知识,所以有很多人,想全面了解一下组蛋白甲基化的功能,为了你能了解的更详细,就来一起看看下面详细的介绍,希望你能了解更多。
甲基化的功能甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。
最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。
DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。
研究证实,CpG二核苷酸中胞嘧啶的甲基化导致了人体1/3以上由于碱基转换而引起的遗传病。
DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鸟嘌呤(7-mG)。
在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出现在CpG序列、CpXpG、CCA/TGG和GATC中。
DNA甲基化是指生物体在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DMT) 的催化下,以s-腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,将甲基转移到特定的碱基上的过程。
DNA甲基化可以发生在腺嘌呤的N-6位、胞嘧啶的N-4位、鸟嘌呤的N-7位或胞嘧啶的C-5位等。
但在哺乳动物中DNA甲基化主要发生在5’-CpG-3’的C上生成5-甲基胞嘧啶(5mC)在哺乳动物中CpG以两种形式存在:一种是分散于DNA序列中;另常识分享,对您有帮助可购买打赏。
表观遗传学——甲基化,组蛋白修饰

表观遗传学——甲基化,组蛋⽩修饰参考资料:1.2.3.1.什么是表观遗传学?举个例⼦:同卵双⽣的双胞胎个体,从遗传学⾓度说他们的DNA序列是⼀致的,但多种表型存在⼀些差异。
经典的孟德尔遗传定律和⽣物学表型之间还存在另外⼀层调控因素,即表观遗传。
表观遗传(Epigenetics)是指DNA序列未发⽣变化,但基因表达却发⽣了可遗传改变。
这种改变的特点:可遗传性;可逆性;没有DNA序列的变化。
可逆性:表观遗传的修饰⽅式可以在某些因素的条件下被去除。
这使得通过调控表观遗传来影响⽣物学性状称为可能。
表观遗传改变主要从四个层⾯调控基因表达(1)DNA甲基化:DNA共价结合甲基基团,使相同序列等位基因处于不同修饰状态;(2)组蛋⽩修饰:通过对结合DNA的组蛋⽩进⾏不同的化学修饰实现对基因表达的调控;(3)染⾊质重塑:通过改变染⾊质的空间构象实现对基因表达的调控;(4)⾮编码RNA的调控:RNA可通过某些机制实现对基因转录和转录后的调控。
2.DNA甲基化DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNMT)的催化作⽤下,以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)作为甲基供体,通过共价结合的⽅式获得⼀个甲基基团的化学修饰过程。
最常见能够被甲基化的碱基是胞嘧啶(C),此外腺嘌呤,鸟嘌呤也可以被甲基化。
下图是5甲基胞嘧啶。
在4位上是⼀个胺基,5位上没有其他基团的结合。
在SAM提供甲基的情况下,在DNMT(DNA甲基转移酶)的作⽤下,甲基从SAM转移到胞嘧啶的5位,成为了5甲基胞嘧啶。
DNA甲基转移酶根据序列的同源性和功能,真核⽣物DNA甲基化转移酶主要分为:Dnmt 1, Dnmt2 和Dnmt 3.Dnmt 1参与序列甲基化的维持; Dnmt 3主要作⽤是从头甲基化。
a图左边的序列通过Dnmt 3的作⽤转化为右边的序列,这两个序列的差别是,所有的C(互补链上)被甲基化,这是⼀种重头甲基化的⽅式。
b图中左边的序列其中⼀条链上C位点被甲基化,互补链上的C没有甲基化,可以在甲基化维持酶(Dnmt 1)的作⽤下可以使得另外⼀条⾮甲基化的链进⾏甲基化。
组蛋白的甲基化和乙酰化

组蛋白的甲基化和乙酰化组蛋白是一种存在于细胞核中的蛋白质,它在维持染色体结构和功能中起着重要的作用。
组蛋白的甲基化和乙酰化是两种常见的修饰方式,对基因表达和细胞功能具有重要调控作用。
甲基化是指在组蛋白上加上一个甲基(CH3)基团的化学修饰过程。
这个过程由一系列酶催化,并且可以在不同的位点上进行。
甲基化可以起到两种不同的作用:一种是直接影响DNA的结构,抑制基因的转录和表达;另一种是通过与其他蛋白质结合,招募特定的蛋白复合物来调节染色体的结构和功能。
甲基化的位点和程度可以决定基因的启动或关闭,从而影响细胞的发育和分化。
乙酰化是指在组蛋白上加上一个乙酰基(CH3CO)基团的修饰过程。
乙酰化主要发生在组蛋白的氨基酸残基上,特别是赖氨酸残基。
乙酰化可以通过增加组蛋白的正电荷来改变其电荷性质,从而影响染色体的结构和功能。
乙酰化还可以提供特定的结合位点,招募其他蛋白质结合并调节基因的表达。
乙酰化的位点和程度也可以决定基因的启动或关闭,从而影响细胞的功能和命运。
组蛋白的甲基化和乙酰化在细胞中是高度动态的过程,可以受到内外环境的调控。
甲基化和乙酰化的酶活性可以受到DNA序列、细胞因子和信号通路的调控。
这些修饰可以在细胞分裂、细胞分化和细胞应激等过程中发生变化,从而影响基因的表达和细胞的功能。
甲基化和乙酰化在遗传学、表观遗传学和癌症研究中具有重要意义。
通过研究组蛋白的甲基化和乙酰化状态,可以揭示基因组的结构和功能,理解基因调控的机制。
甲基化和乙酰化的异常可以导致基因的异常表达和细胞功能的异常,进而导致疾病的发生和发展。
因此,研究组蛋白的甲基化和乙酰化对于深入了解生物学和疾病机制具有重要意义。
组蛋白的甲基化和乙酰化是细胞基因表达和功能调控的重要机制。
这些修饰可以通过改变染色体的结构和功能来影响基因的表达和细胞的命运。
研究组蛋白的甲基化和乙酰化状态对于理解生物学和疾病机制具有重要意义,有望为疾病的诊断和治疗提供新的靶点和策略。
组蛋白甲基化与去甲基化

组蛋白甲基化与去甲基化的机制及功能研究摘要:组蛋白修饰是真核生物中最重要的控制基因转录调节的表观遗传修饰之一。
其中,组蛋白甲基化和去甲基化又是组蛋白最主要的并且研究较为清楚的修饰种类。
经典的分子生物学和基因工程工具为组蛋白甲基化和去甲基化提供了很有利的研究手段。
在此,我们回顾了一下此方面成就和进展,对组蛋白甲基化和去甲基化的机制和功能进行了较为详细的介绍。
关键词:组蛋白甲基化去甲基化机制功能核小体是染色质的基本组成单位,是由4种核心组蛋白(H3、H4、H2A、H2B)叠加构成的一种八聚体复合物,同时也是DNA的载体,其外盘绕着核酸链。
4种组蛋白结合紧密,但其N端“尾部”却伸向核小体外侧,是各种组蛋白修饰酶的作用靶点,这些修饰在基因的转录调控中发挥着重要作用:一方面它们能够改变染色质的结构状态而影响转录;另一方面,它们也可作为某些转录因子的识别位点和结合平台,从而募集基因转录的调控因子[1]。
组蛋白修饰有很多种,如:甲基化、乙酰化、范塑化等。
组蛋白修饰可以发生在不同的位点,同一位点也可以发生不同的组蛋白修饰,这些修饰通过影响组蛋白-DNA和组蛋白-组蛋白的相互作用而改变染色质的结构。
单一的组蛋白修饰往往不能独立地发挥作用,一种修饰的存在可以指导或抑制同一组蛋白上另一修饰的存在,形成一个修饰的级联。
这些修饰可以作为一种标志或语言,也被称为“组蛋白密码”[1],组蛋白密码大大丰富了传统遗传密码的信息含量。
组蛋白甲基化是目前研究相对清楚的一种组蛋白修饰。
组蛋白甲基化是由组蛋白甲基化转移酶(histone methylation transferase,HMT)完成的,可以发生在赖氨酸和精氨酸两种氨基酸残基上。
赖氨酸可以分别被一、二、三甲基化,精氨酸只能被一、二甲基化,这些不同程度的甲基化极大地增加了组蛋白修饰和调节基因表达的复杂性。
其中,组蛋白H3的K4、K9、K27、K36、K79、H4的K20和H3的R2、Rl7、R26及H4的R3均可被甲基化。
组蛋白的甲基化和乙酰化

组蛋白的甲基化和乙酰化组蛋白是一类含有大量赖氨酸和苏氨酸的蛋白质,它是染色质的基本单位。
组蛋白的修饰在细胞的生命活动中起到重要的调控作用。
其中,甲基化和乙酰化是最为常见和重要的修饰方式。
本文将分别介绍组蛋白的甲基化和乙酰化,并阐述它们在细胞功能和疾病发生中的作用。
一、组蛋白的甲基化甲基化是指在组蛋白的赖氨酸残基上加上一个甲基基团。
该修饰方式通常发生在赖氨酸的氮原子上。
甲基化修饰可以通过甲基转移酶来实现,其中最为重要的甲基转移酶是组蛋白甲基转移酶(PRMT)。
甲基化修饰可以在组蛋白的不同位置进行,如赖氨酸的侧链上、赖氨酸的氨基端和羧基端等。
甲基化修饰可以对染色质结构和功能产生重要影响。
首先,甲基化修饰可以改变染色质的结构,使其更加紧密,从而影响DNA的可及性和基因的表达。
其次,甲基化修饰可以参与转录调控,影响基因的启动子活性和转录因子的结合。
此外,甲基化修饰还可以参与染色质的重塑和DNA修复等生命活动过程。
甲基化修饰在细胞功能和疾病发生中具有重要作用。
例如,甲基化异常与多种疾病的发生密切相关,如肿瘤、心血管疾病和神经系统疾病等。
甲基化异常可以导致基因的过度沉默或过度激活,从而破坏细胞的正常功能。
因此,研究甲基化修饰在疾病中的作用机制,对于疾病的早期诊断和治疗具有重要意义。
二、组蛋白的乙酰化乙酰化是指在组蛋白的赖氨酸残基上加上一个乙酰基团。
乙酰化修饰通常发生在赖氨酸的氨基端上。
乙酰化修饰可以通过乙酰转移酶来实现,其中最为重要的乙酰转移酶是组蛋白乙酰转移酶(HAT)。
乙酰化修饰可以在组蛋白的不同位置进行,如赖氨酸的侧链上、赖氨酸的氨基端和羧基端等。
乙酰化修饰可以对染色质结构和功能产生重要影响。
首先,乙酰化修饰可以使组蛋白的正电荷减少,从而减弱组蛋白与DNA之间的静电相互作用,使染色质更松散,增加DNA的可及性和基因的表达。
其次,乙酰化修饰可以提供转录因子结合位点,促进转录因子的结合,从而增强基因的转录活性。
个人整理:组蛋白甲基化在真核基因中的调控作用

组蛋白甲基化在真核基因中的调控作用1 组蛋白修饰的结构基础在真核生物中,核小体是染色质的基本结构单位,是由DNA和组蛋白共同构成。
组蛋白分子分为H1、H2A、H2B、H3和H4等5种。
核心组蛋白足由H2A、H2B、H3、H4各2个分子形成的八聚体,与其上缠绕的146 bp DNA双螺旋分子构成了核小体的核心颗粒,核小体的核心颗粒之间再由约60个碱基对DNA和组蛋白H1连接起来形成串珠样结构。
组蛋白富含带正电荷的精氨酸和赖氨酸,可以与带有负电荷的DNA分子紧密结合。
每个核心组蛋白由一个球形结构域和暴露在核小体表面的N端尾区组成,其N端氨基末端会发生多种共价修饰,包括磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化、糖基化、碳基化等。
2 组蛋白修饰、组蛋白密码与表观遗传学组蛋白翻译后修饰包括乙酰化与去乙酰化、磷酸化与去磷酸化、甲基化与去甲基化、泛素化与去泛素化等。
这些修饰可能通过两种机制影响染色体的结构与功能:改变组蛋白的电荷,因此改变了组蛋白与DNA结合的特性;产生蛋白识别模块的结合表面,因此能募集专一蛋白复合物到它们的表面起作用。
单一组蛋白的修饰往往不能独立地发挥作用,一个或多个组蛋白尾部的不同共价修饰依次发挥作用或组合在一起,形成一个修饰的级联,它们通过协同或拮抗来共同发挥作用。
这些多样性的修饰以及它们时间和空间上的组合与生物学功能的关系可作为一种重要的表观标志或语言,也被称为“组蛋白密码” (histone code),在不同环境中可以被一系列特定的蛋白质或者蛋白质复合物所识别,从而将这种密码翻译成一种特定的染色质状态以实现对特定基因的调节。
组蛋白修饰与DNA 甲基化、染色体重塑和非编码RNA 调控等,在基因的DNA序列不发生改变时,使基因的表达发生改变,并且这种改变还能通过有丝分裂和减数分裂进行遗传,这种遗传方式是遗传学的一个分支,被称为“表观遗传学”。
组蛋白密码扩展了DNA序列自身包含的遗传信息,构成了重要的表观遗传学标志。
组蛋白修饰的机制和生物学功能

组蛋白修饰的机制和生物学功能组蛋白修饰是细胞内一个远古的、高度保守的修饰方式,广泛存在于真核生物的基因组中。
它对于基因表达的调控和维护染色质结构有着至关重要的作用。
本文将借助于组蛋白修饰的机制和生物学功能这一主题,讲述这一修饰方式的基本机理、转录调控机制、疾病相关性以及靶向治疗等研究领域的进展。
一、组蛋白修饰的基本机理组蛋白是基因组中最主要的蛋白质,负责维护染色质结构和基因表达调控。
而组蛋白的N端高度保守区域则是组蛋白修饰的主要靶标。
组蛋白修饰主要包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等几种类型。
其中,甲基化是最为常见的一种修饰方式,主要由甲基转移酶催化,使得组蛋白N端的赖氨酸残基被甲基基团取代。
甲基化修饰的组蛋白在基因表达调控中常常处于沉默状态。
乙酰化是另一种常见的组蛋白修饰方式,主要由组蛋白乙酰转移酶催化。
它可以使得组蛋白N端的赖氨酸残基上的乙酰基团取代氨基基团,从而更新组蛋白N端的电荷性质,并影响基因转录调控。
磷酸化是一种针对组蛋白N端血清氨酸残基的修饰方式,主要由磷酸基转移酶催化,可以影响染色质构象和基因表达调控。
泛素化是最后一种组蛋白修饰方式,主要通过添加小分子多肽泛素修饰组蛋白N端。
泛素修饰的组蛋白被认为是基因变异的主要原因之一。
二、组蛋白修饰转录调控机制组蛋白修饰对于基因表达和稳定有着非常重要的作用,因为这些修饰方式可以直接影响染色质的三维结构,从而影响基因转录的发生和维护。
尤其是N端赖氨酸残基上的乙酰化和甲基化,成为了RNA聚合酶II的识别信号。
研究表明,在染色质结构上处于非常类似的、相近的组蛋白上,其修饰状态的不同却可以导致基因表达变化范围达到数十倍。
这一现象意味着组蛋白修饰能够在不同的细胞状态和响应外界压力的环境中方便地改变基因表达的水平,因而在已知的转录调控机制中,组蛋白修饰是最为重要和最具有调节性质的一种。
三、组蛋白修饰与疾病相关性组蛋白修饰在多种人类疾病中有着重要的表观遗传学作用,并在肿瘤等方面呈现出重要的治疗潜力。
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Regulation of Gene Expression
Chromatin
epigenetic control
Protein degradation RNA silencing
一般而言的基因表达调控范畴
Part I: Histone modifications
组蛋白的化学修饰
组蛋白化学修饰发生在组蛋白N端尾部,尤其是组蛋白H3 和H4的修饰起始了 染色质结构的变化。组蛋白N端尾部从 DNA转弯处的核小体间延伸出来。
组蛋白化学修饰的类型
组蛋白乙酰化 Lysine (K) Acetylation 组蛋白甲基化 Lysine (K), Arginine (R) Methylation 组蛋白磷酸化 Serine (S), Threonine (T) Phosphorylation 组蛋白泛素化 Lysine (K) Ubiquitination
Histone Code
组蛋白密码
相对而言,组蛋白的甲基化修饰方式是最稳定的,所以最 适合作为稳定的表观遗传信息。而乙酰化修饰具有较高的 动态,另外还有其他不稳定的修饰方式,如磷酸化、腺苷 酸化、泛素化、SUMO化、ADP核糖基化等等。这些修饰更 为灵活的影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的 组合发挥其调控功能。所以有人称这些能被专识别的修饰 信息为组蛋白密码。这些组蛋白密码组合变化非常多,因 此组蛋白共价修饰可能是更为精细的基因表达方式。
Promoter activation involves binding of a sequence-specific activator, recruitment and action of a remodeling complex, and recruitment and action of an acetylating complex.
The heart of the remodeling complex is its ATPase subunit. Remodeling complexes are usually classified according to the type of ATPase subunit
A remodeling complex binds to chromatin via an activator (or repressor)
组蛋白SUMO化 Lysine (K) Sumoylation 组蛋白糖基化 Glutamate, Arginine (R) ADP-Ribosylation
有些化学修饰的化学基团可以减少组蛋白的正电性,从而使其与DNA 结合变疏松,使染色质结构发生变化。
histone acetylation and histone phosphorylation change the overall charge of the chromatin structure. These modifications can lead to a general decondensation of the chromatin fibre.
Transcriptional Regulation of Eukaryotic Genes (真核基因的转录调控) 1.Transcriptional initiation 2.Histone modification 3.DNA methylation
Post-Transcriptional Regulation of Eukaryotic Genes (真核基因的转录后调控) 1.siRNA and RNA silencing 2.miRNA and other ncRNA
Chromatin remodeling
The dynamic model for transcription of chromatin relies upon factors that can use energy provided by hydrolysis of ATP to displace nucleosomes from specific DNA sequences.
A genomic survey suggested that most sites that bind transcription factors are free of nucleosome.
In addition to chromatin remodeling, chemical modifications on histones also play a central role in gene regulation
Nucleosome (核小体) 是染色质的基本结构 单位,由~200 bp DNA和组蛋白八聚体组成
Nucleosomes are hard to get access
If nucleosomes form at a promoter, transcription factors (and RNA polymerase) cannot bind. If transcription factors (and RNA polymerase) bind to the promoter to establish a stable complex for initiation, histones are excluded.
two major types of chromatin remodeling complex: SWI/SNF and ISW (imitation SWI)
Chromatin remodeling is undertaken by large complexes that use ATP hydrolysis to provide the energy for remodelinபைடு நூலகம்.