第三章基因工程的酶学基础文稿演示

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基因工程的基本内容PPT演示课件

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30.09.2020
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限制性内切酶的作用过程
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DNA连接酶
❖ 连接酶的作用:将互补配对的两个黏 性末端连接起来,使之成为一个完整 的DNA分子。
❖ 连接的部位:磷酸二酯键,不是氢键。
问题 用DNA连接酶连接两个相同的 黏性未端要连接几个磷酸二酯键?
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DNA连接酶的作用过程
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限制性内切酶
1. 分布:主要在微生物中。 2. 特点:特异性,即识别特定核苷酸序列, 切割特定切点。 3. 结果:产生黏性未端(碱基互补配对)。 4. 举 例 : 大 肠 杆 菌 的 一 种 限 制 酶 能 识 别 GAATTC序列,并在G和A之间切开。
一种限制酶只能识别一种特定的核苷酸 序列,并在特定的切割点上将DNA 分子切 断。目前已发现的限制酶有200多种。
3. 种类:质粒、噬菌体和动植物病毒。
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基因操作的基本步骤
1. 提取目的基因 2. 目的基因与运载体结合 3. 将目的基因导入受体细胞 4. 目的基因的检测和表达
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1. 提取目的基因
❖ 将需要的基因从供体生物的细胞内提取出来。
取出 DNA
用限制酶 切断DNA
基因工程的基本内容
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基因决定性状(一)
❖ 青霉菌能产生对人类有用的抗生素——青霉素
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基因决定性状(二)
❖ 豆科植物的根瘤菌能够固定空气中的氮
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基因决定性状(三)
❖ 家蚕能够吐出蚕丝为人类利用
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基因工程酶课件

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基因工程酶
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目前已发现的限制酶有三大类:
类 型

识 别 与 切 割 位 点分 别 , 随 意 切
割 , 相 距 较 远 ,
单 链 切 割
Ⅱ 相 同
Ⅲ 相 距 5-10bp
功 能 (限 制 , 修 饰 ) 防 御 , 单 功 能 对 基 因 工 程 意 义不 大
单 功 能 双 功 能 (限 制 -修 饰 )
如: 高浓度Hg2+、酚,氯仿、乙醇、EDTA SDS、NaCl等。
基因工程酶
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2、反应系统因素
基因工程 工具酶
基因工程酶
1
基因工程酶
2
基因工程工具酶
基因工程的操作,是在分子水平上的操作,是依赖一些酶(如限制 性核酸内切酶,连接酶,DNA聚合酶等)作为工具对基 因进行人工切割, 拼接和扩增等操作。所以把这些酶称之为“工具酶”。工具酶是对野生菌 (或真核生物如酵母)进行改造、优株化、而产生的生物工程产品。
3′ C T T A A G 5َ ′
5َ ′G 3′C T T A A 5’
c. 3′粘性末端
如 PstⅠ
5’A A T T C 3′ G 5َ ′
5َ ……′ C T G C A G 3′ ……
…… 3′ G A C G T C 5َ ′ ……
5َ ′ C T G C A 3′
3′ G 5َ ′
限制性内切酶的性质及切割特点
1、裂解产物均具有3′-羟基和5′-磷酸残基,5′P-N N…NN…NN-OH 3′。
2、识别序列及切点的高度专一。
5‘…… G A A T T C ……3’ 3’ ……C T T A A G ……5’
G GAT C C C C TAG G

基因工程-课件ppt

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(7)用于载体的质粒 DNA 分子上至少含一个限制酶识别位点(√ )
(8)载体的作用是携带目的基因导入受体细胞中,使之稳定存在
并表达
(√)
在日常生 活中, 随处都 可以看 到浪费 粮食的 现象。 也许你 并未意 识到自 己在浪 费,也 许你认 为浪费 这一点 点算不 了什么
2.载体需具备的条件及其作用(连线)
对点落实
返回
1.(2016·全国卷Ⅲ)图(a)中的三个 DNA 片段上依次表示出了
EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ和 Sau3AⅠ三种限制性内切酶的识别序列
与 切 割 位 点 , 图 (b) 为 某 种 表 达 载 体 的 示 意 图 ( 载 体 上 的
EcoRⅠ、Sau3AⅠ的切点是唯一的)。



——GAATTC—— ——GGATCC—— ——GATC——
返回
(2)写出产生的末端的种类:①产生的是黏性末端;②产生的 是 平末端 。 (3)EcoRⅠ限制酶和 SmaⅠ限制酶识别的碱基序列 不同,切割 位点不同 (填“相同”或“不同”),说明限制酶具有专一性 。
在日常生 活中, 随处都 可以看 到浪费 粮食的 现象。 也许你 并未意 识到自 己在浪 费,也 许你认 为浪费 这一点 点算不 了什么
图(b)
图(c)
(3)DNA 连接酶是将两个 DNA 片段连接起来的酶,常见的
有__E_·_c_o_l_i__D_NA_连__接__酶_和____T_4D_N_A_连___接__酶___,其中既能连接黏 性末端又能连接平末端的是__T_4D_N_A__连__接__酶___。
解析
在日常生 活中, 随处都 可以看 到浪费 粮食的 现象。 也许你 并未意 识到自 己在浪 费,也 许你认 为浪费 这一点 点算不 了什么

第三章基因工程工具酶.ppt

第三章基因工程工具酶.ppt

B)应用 * 补平限制酶切割产生的3’凹端. * 以[32P]dNTP补平DNA的3’凹端并进行标记. * 对带3’突出端的DNA进行末端标记. * 在cDNA克隆中用于合成cDNA的第二链. * 在体外诱变中用于从单链模板合成双链DNA.
3)T4 DNA 聚合酶 A)补平或标记限制酶消化DNA后产生的3’凹
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•9、要学生做的事,教职员躬亲共做; 要学生 学的知 识,教 职员躬 亲共学 ;要学 生守的 规则, 教职员 躬亲共 守。2021/6/132021/6/13Sunday, June 13, 2021 •10、阅读一切好书如同和过去最杰出 的人谈 话。2021/6/132021/6/132021/6/136/13/2021 10:02:15 AM •11、一个好的教师,是一个懂得心理 学和教 育学的 人。2021/6/132021/6/132021/6/13Jun-2113- Jun-21 •12、要记住,你不仅是教课的教师, 也是学 生的教 育者, 生活的 导师和 道德的 引路人 。2021/6/132021/6/132021/6/13Sunday, June 13, 2021 •13、He who seize the right moment, is the right man.谁把握机遇,谁就心想事成 。2021/6/132021/6/132021/6/132021/6/136/13/2021 •14、谁要是自己还没有发展培养和教 育好, 他就不 能发展 培养和 教育别 人。2021年6月 13日星 期日2021/6/132021/6/132021/6/13 •15、一年之计,莫如树谷;十年之计 ,莫如 树木; 终身之 计,莫 如树人 。2021年6月2021/6/132021/6/132021/6/136/13/2021 •16、提出一个问题往往比解决一个更 重要。 因为解 决问题 也许仅 是一个 数学上 或实验 上的技 能而已 ,而提 出新的 问题, 却需要 有创造 性的想 像力, 而且标 志着科 学的真 正进步 。2021/6/132021/6/13J une 13, 2021 •17、儿童是中心,教育的措施便围绕 他们而 组织起 来。2021/6/132021/6/132021/6/132021/6/13

基因工程载体(质粒-3章)幻灯片(1)

基因工程载体(质粒-3章)幻灯片(1)

非接合型质粒的寄主细胞中同时存在一 种接合型质粒,那么它们通常也是可以 被转移的。这种由共存的接合型质粒引 发的非接合型质粒的转移过程,叫质粒 的迁移作用(mobiligation)又叫质粒 的诱动。
带有大肠杆菌素基因的Col质粒和带有抗菌素抗性基因的R 质粒既有属于接合型的,也有属于非接合型的。
如果在非接合型质粒的寄主细胞中同时存在一种接合 型质粒,那么它们通常也是可以被转移的。这种由共存的 接合型质粒引发的非接合型质粒的转移过程,叫质粒的迁 移作用(mobilization)又叫质粒的诱动。ColE1是一种可以 迁移但属于非接合型质粒。
2)F 因子
F因子是最有代表性的接合型质粒,又称致育因子 (fertility factor)或性质粒(Sex plasmid)。它在寄主细胞中有 三种存在方式:①独立于染色体之外,闭环双链DNA形式 存在。这种细胞称F+细胞。②独立于染色体之外,闭环双 链DNA形式存在,但其DNA上还携带有寄主菌染色体基因 或DNA区段。这种细胞称之为F-细胞。③以线性DNA形式, 从不同位点整合到寄主菌染色体上,这种细胞称为Hfr细胞 (高频重组细胞)。
如加入不同启动子序列,用于生产单链 DNA或RNA,外源基因的大量表达。又加 入COS位点,使载体能容纳更大的DNA片 段等等。
质粒载体的选择标记:
外源DNA片段与质粒载体DNA连接,再转化入 宿主菌,经培养后需筛选鉴定转化子。这就需 要利用质粒载体的可选择标记。
质粒载体的选择标记
抗生素抗性基因选择标记
蓝-白斑实验
构建的质粒人工载体,应用最广的是 PBR322,分子量为2.6×106,含46332bp。 含有选择标记抗氨苄青霉素(Apr)基因来 自天然质粒RSF2124和抗四环素(Ter)基因 来自PSC101质粒。复制子部分来自PMB9 (一类Co1E1质粒)。多克隆限制性内节切 酶位点有9个

基因工程中的酶PPT课件

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两条链上的断裂位置是交错 地,但又是围绕着一个对称 结构中心,这样形成的断裂 结果形成具有粘性末端的 DNA片段
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含有几个核苷酸单链的末端。 分两种类型:
① 5’端凸出(如EcoR I切点)
5 ’3 ’5 ’3 ’-
GAATTC CTTAAG 3 ’G AATTC CTTAA G 5’-
第三节基因工程中的酶学
关键词: • 了解各种酶在基因工程 中的作用 • 掌握限制性内切酶和连 接酶的基本特性 • 逆转录酶在A技术中常用的工具酶
工具酶 功能
限制性核酸内切酶 识别特异序列,切割DNA DNA连接酶 催化DNA中相邻的5‘磷酸基和3’羟基末端之间形成 磷酸二酯键,是DNA切口封合或是DNA片段连接 ①合成双链cDNA的第二条链 DNA聚合酶I ②缺口平移制作高比活探针 ③DNA序列分析 ④填补3’末端 ①合成cDNA 反转录酶 ②代替DNA聚合酶I 进行填补,标记或DNA序列分析 催化多聚核苷酸5’羟基末端磷酸化,或标记探针 多聚核苷酸激酶 在3’羟基末端进行同质多聚物加尾 末端转移酶 切除末端磷酸基 碱性磷酸酶
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(3)平末端( blunt end ) 两条链上的断裂位置是处在一 个对称结构的中心,这样形式的 断裂是形成具有平末端的DNA 片断。不易重新环化。
EcoR V 5’-GATATC-3’ 3’-CTATAG-5’
产生平齐末端
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(4)粘性末端(sticky ends,cohensive ends)
(5)粘性末端的意义 ①连接便利 i)不同的DNA双链:
只要粘性末端碱基互补就可以连接。 这比连接两个平齐末端容易的多。 ii)同一个DNA分子内连接: 通过两个相同的粘性末端可以连接 成环形分子。

基因工程的酶学基础

基因工程的酶学基础

基因工程的酶学基础
核酸限制性内切酶的类型及主要特性
特性
Ⅰ类内切酶
Ⅱ类内切酶 Ⅲ类内切酶
限制和修 饰活性
内切酶和甲基 共同亚基的双功
单一多功能的酶 化酶分开
能酶
内切酶的 蛋白结构
3种不同的亚基
2种不同的亚基 单一成分
限制作用 所需要的 辅助因子
寄主特异 性位点识 别序列
ATP、 Mg2+和SAM
EcoB:TGA(N)8TGCT EcoK:AAC(N)6GTGC
• 2. 性
•内切酶
•即质在核酸分子链的内部制造切口的酶。
•形成5’-P和3’-OH末端
• 3. 功
•自我保护作用

•细菌的限制和修饰系统(R/M体系)
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基因工程的酶学基础
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基因工程的酶学基础
(1)限制(Restriction)
•限制性内切酶将侵入细菌体内的外源DNA 进行分解,切成小片断。
•如 Hind Ⅱ:d菌株 • EcoR I :抗药性R质粒

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基因工程的酶学基础
•3. 如果一种特殊的菌株内有几种不同的限制与 修复系统,用罗马字母表示该菌株中发现某种酶
的先后次序。

如Hind Ⅱ:d菌株中发现的第二个酶
•4. 所有的限制酶,除以上名称外还要冠以系统名 称。限制性内切酶的系统命名为R,甲基化酶为M。
•含有几个核苷酸单链的末端。 •分两种类型:
• ⅰ) 5’端凸出(如EcoR I切点)
•5’•3’-
•GAATTC •CTTAAG
•-3’ •-5’
•5’•3’-
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2 基因工程的酶学基础

2 基因工程的酶学基础

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2. Ⅲ型限制性内切酶
识别序列与切割位点不相一致
切割位点相对固定 反应需要ATP、 Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸)。
EcoP1: AGACC EcoP限制性内切酶的基本特性
识别双链DNA分子中4 - 8对碱基的特定序列
大部分酶的切割位点在识别序列内部或两侧识别切割(一致) 序列呈典型的旋转对称型回文结构
酶催转换 DNA易位作用
甲基化作用的位点 寄主特异性位点 寄主特异性 寄主特异性 位点 位点 识别未甲基化的序 能 列进行切割 序列特异的切割 不是

是 十分有用

是 用处不大
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基因工程中的用途 无用
四、限制性内切酶酶解反应条件 1. 标准酶解体系的建立
识别位点处
切开双链DNA,形成粘性末端(sticky end)或 平齐末端(blunt end)。如:
EcoR I 5’-GAATTC-3’
3’-CTTAAG-5’
EcoR V
5’-GATATC-3’ 3’-CTATAG-5’ 产生平齐末端
Pst I
5’-CTGCAG-3’ 3’-GACGTC-5’
Bgl Ⅱ
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Sau 3A
[7] 限制酶的酶活性
限制性内切酶的识别和酶切活性一般在一定的
温度、离子强度、pH等条件下才表现最佳切割
能力和位点的专一性。
所以一般使用专一的反应缓冲液。 ① 星号(*)活性
如果改变反应条件就会影响酶的专一性和切割 效率,称为星号(*)活性。
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使用的时候要特别注意!
EcoR I和BamH I等都有*活性。
7
4. 如果酶存在于一种特殊的菌株中,则将该菌株
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4.限制酶的特性
a.限制酶识别靶序列同DNA的来源无关; b.限制酶识别靶序列是唯一的(对某种限制酶只
具一个限制位点的质粒)。
二、Ⅱ型酶
1. II 型限制性核酸内切酶的基本特性
识别双链DNA分子中4 - 8对碱基的特定序列, 大部分酶的切割位点在识别序列内部或两侧, 识别切割序列呈典型的旋转对称型回文结构
第三章基因工程的酶学基础文稿演示
优选第三章基因工程的 酶学基础
一、限制性核酸内切酶
(restriction endonuclease)
这类酶又简称为限制性内切酶或限制酶
是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定 核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核苷 酸内切酶
1.寄主控制的限制(restriction)
R/M体系的作用: 保护自身的DNA不受限制; 破坏外源DNA使之迅速降解
2.限制性内切酶的分类
• 限制性内切酶本是微生物细胞中用于专门水解 外源DNA的一类酶,其功能是避免外源DNA的干 扰或噬菌体的感染,是细胞中的一种防御机制。 由于R/M现象的发现使得核酸内切酶成为基因 工程重要的工具酶。
• 根据酶的功能、大小和反应条件,及切割DNA 的特点,可以将限制性内切酶分为三类: • Ⅰ型酶、Ⅱ型酶、 Ⅲ型酶
Ⅰ型酶:
1968年,M.Meselson和R.Yuan在E.coliB和 E.coliK中分离出的核酸内切酶。
分子量较大,反应需Mg++、S-腺苷酰-L-甲硫 氨酸(SAM)、ATP等。这类酶有特异的识别位 点但没有特异的切割位点,而且切割是随机的, 所以在基因工程中应用不大。
与修饰 (modification) 现象
人们发现侵染大肠杆菌的噬菌体都存在着一些 功能性障碍,即所谓的寄主控制的限制与修饰现象 简称(R/M体系)
细菌的R/M体系类似于免疫系统,能辨别自身的 DNA与外来的DNA,并能使后者降解掉
R/M体系:
寄主是由两种酶活性配合完成的 一种是修饰的甲基转移酶 另一种是核酸内切限制酶
EcoR I的切割位点
EcoR I的识别序列
5 ‘…G C T G A A T T C G A G … 3’ 3 ‘…C G A C T T A A G C T C … 5’
EcoRI等产生的5 ‘粘性末端
5‘…G-C-T-G-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ 3‘…C-G-A-C-T-T-A-A-G-C-T-C … 5’
5‘…G-C-T-C-A-G-OH P-C-T-G-G-A-G … 3’ 3‘…C-G-A-G-T-C-P OH-G-A-C-C-T-C … 5’
2.核酸内切酶作用后的断裂方式
( 1 ) 粘性末端 :两条链上的断裂位置是交错 地、但又是围绕着一个对称结构中心,这样形式 的断裂结果形成具有粘性末端的DNA片断。
识别位点是一个回文对称结构,并且切割位点也 在这一回文对称结构上。
许多Ⅱ型酶切割DNA后,可在DNA上形成粘性末端, 有利于DNA片段的重组。
主要特性 I 型
II型
III 型
限制修饰 多功能
单功能
双功能
蛋白结构 异源三聚体
同源二聚体
异源二聚体
辅助因子 ATP Mg2+ SAM
Mg2+
Mg2+ SAM ATP
识别序列 切割位点距
TGAN8TGCT AACN6GTGC
距识别序列1kb 处随机性切割
旋转对称序列
识别序列内或附近 特异性切割
GAGCC
CAGCAG
识别序列下游24-26bp处
3.限制性核酸内切酶的命名原则:
第一个字母: 大写,表示所来自的微生物属名的第一个字母 第二、三字母:小写,表示所来自的微生物种名的第一、二个字母 其它字母: 大写或小写,表示所来自的微生物的菌株号 罗马数字: 表示该菌株发现的限制酶的编号
P OH
PstI等产生的3‘粘性末端
5‘…G-C-T-C-T-G-C-A-G-G-A-G … 3’ 3‘…C-G-A-G-A-C-G-T-C-C-T-C … 5’
PstI 37 ℃
5‘…G-C-T-C-T-G-C-A-OH 3‘…C-G-A-G-P
退火4-7 ℃
P-G-G-A-G … 3’ OH-A-C-G-T-C-C-T-C … 5’
OH P
5‘…G-C-T-C-T-G-C-A G-G-A-G … 3’ 3‘…C-G-A-G A-C-G-T-C-C-T-C … 5’
P OH
PvuII等产生的平头末端
5‘…G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G … 3’ 3‘…C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C … 5’
PvuII 37 ℃
EcoRI 37 ℃
5‘…G-C-T-G-OH
P-A-A-T-T-C-G-A-G … 3’
3‘…C-G-A-C-T-T-A-A-P
OH-G-C-T-C … 5’
退火4-7 ℃
OH P
5‘…G-C-T-G A-A-T-T-C-G-A-G … 3’ 3‘…C-G-A-C-T-T-A-A G-C-T-C … 5’
பைடு நூலகம்
E.coliB含有EcoB核酸酶和EcoB甲基化酶
当λ(k)噬菌体侵染E.coliB时,由于其DNA中
有EcoB核酸酶特异识别的碱基序列,被降解掉。
而E.coliB的DNA中虽然也存在这种特异序列,但
可在EcoB甲基化酶的作用下,催化S-腺苷甲硫氨 酸(SAM)将甲基转移给限制酶识别序列的特定碱 基,使之甲基化。EcoB核酸酶不能识别已甲基化 的序列。
Ⅲ型酶
这类酶可识别特定碱基顺序,并在这一顺序的 3’端24~26bp处切开DNA,所以它的切割位点 也是没有特异性的。
Ⅱ型酶
1970年,H.O.Smith和K.W.Wilcox在流感嗜血Rd株 中分离出来的限制酶。
分子量较小(105Da),只有一种多肽,通常以同 源二聚体的形式存在。反应只需Mg++的存在,并且 具有以下两个特点,使这类酶在基因工程研究中, 得到广泛的应用。
例: EcoR I: 来自于Escheria coli RY13 的第一个限制酶
1968年,Smith等人首先从流感嗜血杆菌d株中分离出 HindII和HindIII
属名
种名 株名
Haemophilus influenzae d
嗜血流感杆菌d株
H i n d II H i n d III
同一菌株中所含的多个不同的限制 性核酸内切酶
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