Construction of Genetic Linkage Map Based on SSR Markers in Peanut (Arachis hypogaea L.)

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2014-基因组学——最终版

2014-基因组学——最终版

基因组学题库一基因组学介绍1 基因组与基因组学基因组是指生物的整套染色体所含有的全部DNA序列,是生物体所有遗传信息的总和。

基因组学(Genomics)是以生物信息学分析为手段研究基因组的组成、结构、表达调控机制和进化规律的一门学科,研究对象是基因组结构特征、变演规律和生物学意义。

2 C质与C质悖论C值(C value)通常是指某一生物单倍体基因组DNA的总量。

C值悖论(C Value Paradox):生物的复杂性与基因组的大小并不完全成比例增加。

3 人类基因组计划及其8个目标人类基因组计划(human genome project, HGP)是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动的。

美、英、法、德、日和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。

按照这个计划的设想,在2005年,要把人体内约10万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因的谱图。

其8个目标:1)人类DNA序列(Human DNA sequence);2)开发测序技术(Develop sequencing technology);3)识别人类基因组序列变异(Identify human genome sequence variation);4)功能基因组学技术(Functional genomics technology);5)比较基因组学(Comparative genomics);6)伦理、法律、社会问题(ELSI: ethical, legal, and social issues);7)生物信息学和系统生物学(Bioinformatics and computational biology);8)Training and manpower。

4 什么是宏基因组(metagenomics)?研究一类在特殊的或极端的环境下共栖生长微生物的混合基因。

生境中全部微小生物遗传物质的总和。

它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。

布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究

布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究

布莱凯特黑牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性的研究赵仕全;董雅娟;柏学进;牛召珊;杨莉;张新浩【摘要】利用PCR-SSCP方法测定96头布莱凯特黑牛H-FABP基因外显子2和内含子2的部分序列多态性,并对含有多态序列的片段进行了序列分析.结果表明,引物1、3的扩增序列不存在多态性,引物2、4的扩增序列存在多态性;引物2在内含子第323位点处存在G→A突变,在群体中产生了AA、AB、BB 3种基因型,基因型频率分别为0.448、0.146、0.406,多态信息含量(PIC)为0.375,属于中度多态(0.25<PIC<0.5),经x2检验该位点基因型频率不处于Hardy-Weinberg平衡状态;引物4在内含子2第872位点处存在C→G的突变,产生了HH、Hh、hh 3种基因型,基因型频率分别为0.104、0.417、0.479,多态信息含量(PIC)为0.337,为中度多态(0.25<PIC<0.5),经x2检验该位点基因型频率达到Hardy Weinberg平衡状态.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2013(040)011【总页数】4页(P42-45)【关键词】布莱凯特黑牛;心脏脂肪酸结合蛋白基因;单核苷酸多态性【作者】赵仕全;董雅娟;柏学进;牛召珊;杨莉;张新浩【作者单位】青岛农业大学动物胚胎工程中心,山东青岛 266109;山东省黑牛繁育工程技术研究中心,山东青岛 266109;青岛农业大学动物胚胎工程中心,山东青岛266109;山东省黑牛繁育工程技术研究中心,山东青岛 266109;山东布莱凯特黑牛科技股份有限公司,山东淄博256306;青岛农业大学动物胚胎工程中心,山东青岛266109;山东省黑牛繁育工程技术研究中心,山东青岛 266109;山东布莱凯特黑牛科技股份有限公司,山东淄博256306;青岛农业大学动物胚胎工程中心,山东青岛266109;山东省黑牛繁育工程技术研究中心,山东青岛 266109;青岛农业大学动物胚胎工程中心,山东青岛 266109;山东省黑牛繁育工程技术研究中心,山东青岛266109;青岛农业大学动物胚胎工程中心,山东青岛 266109;山东省黑牛繁育工程技术研究中心,山东青岛 266109【正文语种】中文【中图分类】Q349+.53心脏脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein,H-FABP)是一种低分子质量胞浆蛋白,它是脂肪酸结合蛋白(FABP)家族的成员之一。

春草秋治对麦田杂草的防治效果

春草秋治对麦田杂草的防治效果
1 材料与方法
1. 1 试验材料 在河北省曲周县,选择范李庄村、麻庄村、张西
头村、张庄村、王庄村和东高固村 ( 图 1) 麦田进行 试验。不同村庄的小麦主栽品种不尽相同 ( 表 1) 。
表 1 试验点的土壤类型与小麦主栽品种 Table 1 The soil type and wheat varieties of surveyed fields
播娘蒿 节节麦 荠菜 麦瓶草
学名[14] Descurainia scphia ( L. ) Webb ex Prantl Aegilops tauschii Coss Capsella bursa-pastoris ( L. ) Medic Silene conoidea L.
科名
十字花科 禾本科 十字花科 石竹科
2 结果与分析
2. 1 春草秋治对杂草种类及其田间频率的影响 PY 处理麦田的杂草主要有播娘蒿、节节麦、荠
菜和麦瓶草 4 种; 且杂草田间频率均 < 其 CK,其中, 荠菜田间发生频率下降幅度最大 ( 75. 0% ) ,播娘蒿 次之 ( 61. 8% ) ,麦 瓶 草 降 幅 最 小 ( 25. 4% ) ( 表 2) 。说明春草秋治可彻底清除麦家公,降低播娘蒿、 节节麦、荠菜和麦瓶草的田间频率,其中对防治荠菜 和播娘蒿效果明显。
Abstract: The wheat fields of six villages in Quzhou County,Hebei Province were chosen to conduct a survey aiming at understand the effect of weed control before winter in winter wheat field. The main varieties of wheat in each village were not all the same. The contrast test was adopted that using self-propelled mechanical spraying machine with tribenuron methyl 150 - 180 g / hm2 and water 450 kg / hm2 to spray pesticide in the middle of November,2013 ( one month after wheat seeding) and the fields that did not make any deal with as controls. Then the occurrence species and quantity of weeds in wheat field were investigated in March,2014. The results showed that Descurainia scphia was the main weed in the district and weed control before winter could greatly reduce the species,quantity and relative density of winter wheat field compared to the ordinary fields. The relative density of Descurainia scphia was also reduced. The weed control before winter has wide application and popularization prospect. Key words: Wheat; Weed; Survey; Variety; Frequency; Density

遗传实验报告6_果蝇开放实验-图距的测量

遗传实验报告6_果蝇开放实验-图距的测量

果蝇基因图距的测量实验日期:2013年4月15日– 2013年5月31日组号:2-3生17班姚远同组搭档:赵心怡一、实验目的1.通过果蝇杂交实验计算在同一染色体上控制三对性状的基因的相对位置、图距等参数,理解和验证基因的连锁和交换定律。

2.掌握果蝇杂交的方法,深入了解果蝇生活史、世代周期。

二、实验原理广泛用于遗传学研究的果蝇为黑腹果蝇(Drosophila melanogaster) , 属于果蝇科、果蝇属, 它作为遗传学模式生物有如下特点:1)生活史长短随温度而不同;2)成年雌性蝇类长到12小时才成熟,便于确保雌性蝇类是处女蝇;3)繁殖能力强;4)突变种类多,染色体数目少。

位于同源染色体上的非等位基因在形成配子时,多数随所在染色体一起遗传,若发生非姊妹染色单体之间的交换可产生少量的重组型配子。

位于同一条染色体上的基因连在一起的伴同遗传的现象称为连锁(linkage)。

连锁现象是英国遗传学家(W. Bateson)等人于1906年在香豌豆(Lathyrus doratus )杂交过程中发现。

1911年摩尔根用果蝇做杂交实验,发现了同类现象,提出了连锁与互换的概念,称之为遗传学第三定律。

基因的交换率反映了两基因之间的相对距离。

1910年,Morgen TH提出假设:假定沿染色体长度上交换的发生具有同等的几率,那么两个基因位点间的距离可以决定减数分裂过程中发生重组染色体的发生率,即重组分数。

人们规定同一染色体上两个位点间在一百次减数分裂发生一次重组的机会时,定义两位点间的相对距离为一个cM(centimorgan)。

根据基因在染色体上有直线排列的规律,把每条染色体上的基因排列顺序(连锁群)制成图称为遗传学图(genetic map),亦称基因连锁图(gene-linkage map )。

三点测交就是通过一次杂交和一次测交,同时确定三对等位基因(即三个基因位点)的排列顺序和它们之间的遗传距离,是基因定位的常用方法。

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□□□□□□中文题目(二号)□□□□□□□□作者姓名(小四)□□□□作者单位(小五)□□摘要: □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□(五号,宋体)关键词:□□□□□;□□□□□;□□□□□(五号,宋体)中图分类号:□□□文献标识码:文章编号:□□□□□□英文文题(二号)□□□□□□□□作者英文名字(eg. WANG Xiao-Bin)(小四)□□□□作者单位□□(小五斜体)□□Abstract:□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□(五号)Key words:□□□□□;□□□□□□;□□□□□□(五号)□□□□□□□□□□□□□□□□□□□(正文,五号,英文字体为Times New Roman 格式)X□□一级标题□□(四号)X.X□□二级标题□□(五号,粗体)□□□□□□□□□□□□□□□□□□(五号)X.X .X□□三级标题□□(五号)□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□(五号)(图表请插入文中相应位置)Table 1 □□□□□□(五号,粗体)表格为三线格,无竖线,Fig. X □□□□□□(五号,粗体)1: □□□; 2: □□□; 3: □□□; 4: □□□.(五号)References:(请见以下范例,小五号)[1] William G O, Kevin D V, Qing W. Restless legs syndrome in monozygotic twins: clinical correlates[J].Neurology, 2000, 55(9):1404~1406.[2] 吴晓雷,贺超英,王永军, 张志永,东方阳,张劲松,陈受宜,盖钧镒. 大豆遗传图谱的构建和分析[J]. 遗传学报,2001,28(11):1051~1061.WU Xiao-Lei, HE Chao-Ying, WANG Yong-Jun, ZHANG Zhi-Yong, DONGFANG Yang, ZHANG Jin-Song, CHEN Shou-Yi, GAI Jun-Yi. Construction and analysis of a genetic linkage map of soybean[J]. Acta Genetica Sinica, 2001,28(11):1051~1061.收稿日期:0000-00-00;修回日期:0000-00-00基金项目:中文名称(编号:XXXXX)[英文对照]作者简介:第一作者①通讯作者, 姓名,职称,学位;固定电话;电子邮件。

挑战杯论文格式

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挑战杯论文格式篇一:挑战杯论文格式样本挑战杯论文格式要求论文一般由以下主要部分组成,依次为:⒈封面2.中文摘要 3.英文摘要 4.论文正文,5.参考文献 6.致谢六个部分组成。

(文章版面尺寸14.5×22cm即页边距左3,其余2.5)封面要求:论文题目应当简明扼要地概括和反映出论文的主要内容,一般不宜超过36个字。

(具体见下页:例)学校______________ 参赛类别___ __第十二届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛作品申报论文扁穗牛鞭草对干旱胁迫的生理响应(黑体二号) Physiological responses of Compressed Hemarthriato drought stress(Times New Roman 二号)****** (成员姓名,宋体三号)指导老师:***(教授)***(博士)***(博士生)2021年4月正文要求:1. 中文摘要:标题宋体20号、加粗,作者黑体三号、不加粗,单位黑体小四、不加粗,三者均居中,1.5倍行距。

摘要正文楷体四号,行距最好在20-26磅之间,具体根据自身论文而言,最好中文摘要独立成页。

“关键词”三字用四号黑体,其余楷体四号。

例如:鸭茅种质资源分子水平遗传多样性研究周良彬周仁强朱钦杜勇徐偲雅(四川农业大学动物科技学院,雅安 625014 )中文摘要:本试验采用ISSR、SRAP和AFLP分子标记,对66份鸭茅种质资源进行了DNA分子水平的遗传多样性研究,主要研究结论如下:……关键词:鸭茅;种质;遗传多样性; ISSR; SRAP;AFLP2.英文摘要:字体均用Times New Roman,标题小二加粗,作者三号,单位小四。

正文小四,以“Abstract:”开头,行距最好在20-26磅之间,具体根据自身论文而言。

关键词以“Keywords:”开头,小四,以分号隔开。

例如:Evaluation of Genetic Diversity and relationships in Orchardgrass (Dactylis glomerata L.) GermplasmBased on Molecular MarkersLiangbin Zhou,Renqiang Zhou,Qin Zhu,Yong Du,Siya Xu(College of Animal Science Technology,Sichuan Agricultural University,Ya’an 625014)Abstract: Inter-simple Sequence Repeat (ISSR)、sequence-related amplified polymorphism(SRAP)and amplified fragment length polymorphism (AFLP) molecular markers were used to detect the DNA molecul level of genetic diversity among 66 materials of Dactylis glomerata, and the main conclus ion of the study showed as follows: ……Key words: Dactylis glomerata L.;germplasm resources;genetic diversity ;ISSR;SRAP; AFLP3.正文:1 XXXXXX 一级标题用小三楷体字加粗(序号用12 ……依此类推) 1.1 XXXXXX 二级标题用四号楷体字加粗(序号用1.1、1.2……依此类推)2.1.1XXXXXXX 三级标题用4号楷体字不加粗(序号用1.1.1、1.1.2…依此类推)(1)XXXXXXX 三级标题用4号楷体字不加粗(序号依此类推)(正文内容) XXXXXXX正文用四号楷体,1.5倍行距,图表用五号宋体,并用中英双用,表格请用三线表格式。

Human genome project 人类基因组计划

与人之间的变异仅为万分之一,从而说明人类不同 “种属”之间并没有本质上的区别。 种族歧视毫无根据
第三代分子标记: 单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNP)
(二) Physical Maps
Gene distances measured in numbers of base pairs – Based on direct analysis of DNA
自然科学基金委);
1996年,人类重大疾病相关基因的定位、克隆、 结构与 功能研究(国家自然科学基金委);
• 中国HGP研究机构: 以强伯勤为主任的中国人类基因组北方中心(北京协和医 科大学); 以陈竺为主任的中国人类基因组南方中心(上海瑞金医院; 1999年7月,以杨焕明为主任的中科院遗传所人类基因组 研究中心(北京),在国际人类基因组组织注册。 • 承担任务:申请承担其中1%的测序任务,即第3号染色体 上的3000万个碱基对;2000年,成立以杨焕明为主任的杭 州华大基因研究中心(杭州)。
有了更准确的了解。
• 目前的研究结果显示,人类基因组有19599个 已经获得确定的蛋白编码基因,另外还有 2188段可能为蛋白编码基因的DNA序列。人 类基因重复片段高达5.3%,覆盖了5.3%的人 类基因组。 • IHGSC所完成的测序工作不仅完整而且精确。 该基因组序列的资料已于2003年4月被载入免 费公用数据库。
变异的;按照孟德尔的规律遗传 微卫星DNA (microsatellite DNA): 又称短串联重复(STR, short tandem repeats),重复单元2-8bp,通常重复10-60次.
重复次数在人群中是高度变异的;按照孟德尔的规律遗传
CTAGCTTATATATATATATATATATATATAAGCTTGC

第 2 章 遗传图绘制.

Site: 位点是指基因组物理图上某一确定的DNA 顺序.
注: 当locus是指确定的DNA顺序或基因序列时, 也可称为site.
遗传作图标记
1) 第一代分子标记,单一顺序多态性:
RFLP, AFLP, RAPD
2) 第二代分子标记, 重复顺序多态性:
Simple sequence length polymorphisrns, SSLPs Variable number of tandem repeats, VNTR Simple tandem repeats, STR Single sequence repeats, SSR
如何寻找RFLP标记
1) 随机克隆筛选; 2) 将其它方法获得的DNA标记, 如RAPD
(random amplified polymorphism DNA) 标记转换为RFLP标记; 3) 从cDNA 中寻找RFLP. 4) 计算机筛选, 即电子杂交.
AFLP(amplified fragment lenth polymorphism, 放大的片段长度多态性)
f r a g m e n t
l e n g t h
p o l y m o r p h i s m ,
限 制 性 片 段 长 度 多 态 性
最早发现的DNA分子标记--RFLP
RFLP是如何想到的?
1978年, 在犹他州盐湖城滑雪胜地艾尔 塔的一场例行的学术讨论中, 从事经典 人类遗传学研究的专家与从事分子生物 学研究的专家进行学术交流. 分子生物 学家从经典遗传学的研究中获得灵感.
1) 这是一种筛选RFLP分子标记的方法. 先将 DNA样品采用选定的限制性内切酶(如EcoRI, Sau3A)消化, 然后加上接头PCR引物.

SSR分子标记技术在生物遗传学领域的应用

SSR分子标记技术在生物遗传学领域的应用杨文柱;焦燕【摘要】SSR(simple sequence repeats)分子标记技术作为一种新世纪遗传学研究工具,已被广泛应用于生物遗传多样性、遗传图谱构建、基因定位、分子标记辅助育种、种质真伪和纯度鉴定等研究中,成为生物资源利用、开发和保护常用的方法和技术.%As a genetic research tool in the new century, SSR molecular markers technique has been widely adopted in the research on diversity of biogenetics, construction of the genetic linkage map, location of genes, molecular mark-assisted selection and purity controlling of cultivars, it has been commonly used for the utilization, development and protection of biological resources.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2012(040)002【总页数】3页(P640-642)【关键词】SSR;分子标记;生物遗传学;应用【作者】杨文柱;焦燕【作者单位】内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特010019;内蒙古师范大学化学与环境科学学院,内蒙古呼和浩特010022【正文语种】中文【中图分类】Q756简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)又称短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或微卫星DNA(Microsatellite DNA),主要由串联重复单元组成,每个单元长度一般在1~6 bp之间。

超级杂交稻协优9308重组自交系的分子遗传图谱构建

分子植物育种,2008年,第6卷,第5期,第861-866页MolecularPlantBreeding,2008,Vol.6,No.5,861-866研究报告ResearchReport超级杂交稻协优9308重组自交系的分子遗传图谱构建沈希宏陈深广曹立勇占小登陈代波吴伟明程式华*中国水稻研究所,杭州,310006*通讯作者,shcheng@mail.hz.zj.cn摘要用超级杂交稻协优9308的母本协青早A的保持系协青早B和父本恢复系中恢9308杂交,以单粒传方法建立含281个株系的重组自交系(RIL)群体。

选用695对简单重复序列(SSR)引物进行亲本多态性筛选,共有186对检测到多态性,频率为26.8%。

构建成的水稻分子遗传图谱共包含163个标记座位,总图距约1578.9cM,覆盖整个基因组的87.5%,标记间平均图距为9.69cM。

群体和标记中母本等位基因频率平均为0.52,群体中标记偏分离情况较严重。

该图谱的构建为研究超级杂交稻协优9308各种性状的遗传规律及QTL定位打下了基础。

关键词超级杂交稻,重组自交系,遗传图谱ConstructionofGeneticLinkageMapBasedonaRILPopulationDerivedfromSuperHybridRice,XY9308ShenXihongChenShenguangCaoLiyongZhanXiaodengChenDaiboWuWeimingChengShihua*ChinaNationalRiceResearchInstitute,Hangzhou,310006*Correspondingauthor,shcheng@mail.hz.zj.cnAbstractUsingthemaintainerlineXQZBandrestorerlineZH9308ofsuperhybridriceXY9308asthefemaleandmaleparents,recombinantinbredline(RIL)populationconsistingof281lineswasconstructedbysingleseeddescentmethod(SSD).Atotalof695pairsofSSRmarkerswasusedtoanalyzethepolymorphismbetweenXQZBandZH9308.Itwasshownthattherewere186pairsofpolymorphismmarkersandtheirpolymorphicratioare26.8%.Alinkagemapconsistingof163SSRmarkerswesconstructed.Thismapcoveredthericegenomeabout1578.9cM(87.5%)withabout9.69cMofaverageinterval.Thegenotyperatioofthefemaleparentwas0.52in281linesand163markers.SerioussegregationdistortionwasobservedinthisRILpopulationwith80(49.5%)markersshowingsignificantdeviation.ThemapcouldbeusedforthegeneticanalysisandQTLmappingofvarioustraitsinsuperhybridrice,XY9308.KeywordsSuperhybridrice(OryzasativaL.),Recombinantinbredlines(RIL),Geneticlinkagemap基金项目:本研究由国家863计划(2006AA10Z1E8)和浙江省重大专项(2004C12020-1)资助水稻(2n=24)是重要的粮食作物。

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