中山大学生化资料中山大学生命科学院生物化学试题答案与评分标准.doc

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生物化学I (2006年秋季学期,A卷)

1.简答题(共25小题,超过60分以60分计入总分)

1 .哪些标准氨基酸含两个手性碳原子?写出它们的Fisher投影式。

2.为什么SDS变性电泳可以估算蛋白质的分子量?

3.Mass spectroscopy在生物大分子研究中有什么应用?

4.-Keratin、Collagen、Silk fibroin的二级结构和氨基酸组成有何特点?

5.根据二级结构的组成和排列可将蛋白质结构分为哪些类型?

6.蛋白质in条件下的折叠有哪些辅助因了?

7.蛋白质在与其他分子的相互作用中发挥作用,这种相互作用有何特点?

8.哪些因素可以导致Hemoglobin与O2的亲和力增加?

9.图示抗体的一般结构(包括结构域及可能的二硫键)。

10.构成肌肉粗丝和细丝的蛋白分子有哪些,各有什么功能?

11.写出蛋白质氨基酸测序的基本步骤。

12.什么是酶催化的过渡态理论?列出你所知道的支持证据?

13.酶的可逆抑制剂有几类?它们的抑制动力学各有何特点?

14.酶在体内的活性是如何受到调控的?

15.淀粉与纤维素的结构有何区别?

16.细胞膜表面的Glycoprotein和Glycolipid有哪些生物学功能?

17.细胞内的DNA可能会出现哪些异常结构,他们有什么生物学意义?

18 .膜脂的分类及其结构特点

19.生物膜的功能有哪些?

20.膜蛋白以哪些方式参与生物膜的构成?

21.图示 secondary active transport, uniport, symport, anti port.

22.Acetylcholine receptor通道是如何控制开关的?

23.K+离子通道是如何对通过的离子进行选择的?

24.膜电位是怎样控制Na*通道开关的(可图示并说明)?

25.Ca新泵和NaF泵的异同点。

IT. You have a crude lysate sample containing a mixture of six proteins (1, 2, 3, 4, 5, and P -galactosidase). Some characteristics of these proteins are shown in the table below. Give an available procedure of purifying B -galactosidase.

I.

1.苏氨酸Thrtl7

COO—

COO-

H3N-C-H

H-C-OH

ch3

H3N-C-H

【2’】;异芫氨酸He [ 1' H—C—CHs

CH2

CH3

【2'】

1 45% 3S 3.7

2 80% 22 4.8

3 65% 1

4 5.3

4 20% 7

5 6.8

5 30% 55 9.5

-galactosidase 45% 115 5.3

III.You are working on a compound as a potential drug that inhibits an overproduced enzyme whose uncontrolled activity leads to uncontrolled cell proliferation (cancer). A steady-state kinetic analysis of the

enzyme-catalyzed reaction was carried out, with velocities measured as a function of the concentration of the substrate in the absence and in the presence of 10 nM inhibitor. The results of the kinetics experiment are plotted for you below. Please answer the following questions.

1.What type of inhibitor is this compound (be as specific as you can)?

Show the diagram of the inhibitor" s mechanism (by E denoting enzyme, S denoting substrate, E+S §益】ot帛走+ P inhibitor; for

example: ).

2.Calculate the K ni, K cat in the absence of inhibitor and K」叫,K cat app in

the presence of inhibitor (app denoting apparent. The total

concentration of enzyme is 2nM).

3.Calculate the inhibitor constant K h

生物化学I (2006年秋季学期,A卷)

2.①SDS能够与蛋白质结合,导致蛋白质变性。不同蛋白质-SDS复合物形状也相

似,都呈椭圆状;【2'】

%1大量SDS的负电荷消除了不同种类蛋白质间的电荷符号的差异,蛋白分子越大结合的SDS越多,各蛋白质-SDS复合物的电荷密度(或荷质比)趋于一致;

【2,】

%1自由电泳时,它们的泳动率基本相同,而在适宜浓度的聚丙烯酰胺凝胶介质中电泳时,由于凝胶的分子筛效应,电泳迁移率就取决于蛋白质-SDS复合物的大小,也可以说是取决于蛋白质分子量的大小。【2,】

3.①MS可以很高精度地测定生物大分子的分子量;【2,]

%1串联MS可以用于DNA;【2’ ]

%1和蛋白质测序。【2,】

5. All , all 【每个 I】

6.① Chaperone proteins/Molecular Chaperone; [1'】

%1Isomerases [1'】including protein disulfide isomerase (PDI)【1'] and Peptidyl prolyl isomerases (PPI) [1'】

7.① Reversible; [1'】

%1Structural complementary 【1’ 】 & specific; [1'】

(3) Structural dynamicness [1'】

8.①氧分压升高;【1,】

%1pH值升高【1'】;

%1BPG浓度降低【1’】;

9.【6,】

%1“丫”字型,轻链(L)重链(H)【2,】

%1不变区(C)可变区(V)【2’】;

%1二硫键位置和数量正确【2,];

10.①Myosinmolecule (肌球蛋白分子),构成粗肌

丝,分子头部有ATP结合位点和肌动蛋白

结合位点;【2,]

%1Actin molecule (肌动蛋白分子),构成细肌丝主体;【2'】

%1Tropomyosin molecule (原肌球蛋白分子),覆盖或暴露细肌丝上肌球蛋白分子的结合位点;【2,]

%1Troponin molecule (肌钙蛋白分子),与原肌球蛋白分子相连,通过与钙离子结合调控粗丝和细丝的结合与解离。【2,]

11 ? StepI: Analysis of aa composition;【1'】

Steph Breaking disulfide bonds if existing;【1'】

Step3: Cleaving large peptide into small;【1'】

Step4: Sequencing of the small peptides;【1 '】

Step5: Ordering the small peptides;【1'】

Step6: Locating disulfide bonds if existing.【1'】

12.①酶与反应过度态结构的契合程度高于酶与底物的契合程度;【3,]

②证据:对底物结构的修饰对Krn改变较小而Kcat改变较大;【1,】

过度态类似物与酶的亲和力显著高于底物与酶的亲和力;【1'】

抗体酶的成功.【1’】

13.①Competitive inhibitor (竞争性抑制剂)[V】,抑制剂浓度增加测得的Km

值增加,但Vmax不变;【1'】

%1Uncompetitive inhibitor (反竟争性抑制剂)【1'】,抑制剂浓度增加,测得的Km值和Vmax都减小;【1'】

%1Mixed inhibitor (混合性抑制剂)【1'】,抑制剂浓度增加,Km值增加但Vmax减小;【1’】

%1Noncompetitive inhibitor (非竞争性抑制剂)[1'】,是混合性抑制剂的特殊类型,抑制剂浓度增加,Vmax减小但Km值不变。【1,】

14.① Allosteric regulation (变构调节);[1'】

%1Covalent mo dification (共价修饰);[1'】

%1Proteolytic cleavage (水解激活);【1'】

%1Gene regulation: changing the amount of specific enzymes [1'】。15.① 淀粉的单体为-D-glucose【1'】,通过 1 一4)糖苜键连接【1'】,其

三维结构为螺旋型【1'】;

② 纤维素的单体-D-glucose ],通过1一4)糖昔键连接【1’】,其

三维结构为直线型【1'】。

】,antiport

16. 【列举一项给一分,不超过4分】细胞表面的Glycoprotein 和Glycolipid 上的 糖

链可能是:病毒的受体;毒素的受体;细胞黏附分子;抗原……

17. Z-DNA 【1'】,triple helix 【1'】,tetraplex 【1'];与 replication,

recombination, transcription 启动和调节有关【1'】。 18. 【列出脂的种类3分,指出脂的骨架结构给3分】

磷脂 (phospholipid)

糖脂 (glycolipid)

固醇

(cholesterol)

头部 含磷酸基团 含糖基

骨架 甘油

神经鞘氨醇

神经鞘氨醇

甘油

又称为鞘脂

尾部

脂肪酸

脂肪酸

19. ① Boundary & permeability ;【1'】

② Organization & localization of function ;【1'】 (3) T ransport process ; [1'】 (4) S ignal transduction ; [1'】 %1 Cell-to-cell communication [1']

20. ? Peripheral membrane proteins [ 1f

]: lipid linked [0. 5f

】,lipid

bound 【0.5'】,protein bound 【0.5’ ];

② Integral membrane proteins [ 1f ]: single span 以-helix 【0.5'】,

multi span 以-helix 【0.5'】,barrel 【0.5'】。

】,symport [ 1' M* ―MM *.

;

不同点:Ca"泵为uniport【0. 5'】,Na」K*泵为uni port【0. 5'】。

II.答案要点

1.30 %硫酸铉沉淀,离心取上清,上清中主要蛋白为proteinl、2、3和

-galactosidase;【2']

2.45%硫酸铉沉淀,离心去上清留沉淀,沉淀中主要蛋白为proteinl和

-galactosidase;【2']

3.溶解沉淀,脱盐,浓缩,凝胶过滤层析,收集最先流出组分,主要蛋白为

-galactosidase;【2']

4.将步骤3得到的样品(pH7)进行离子交换层析(阴离子交换树脂,NaCl梯度洗

脱);【2,】

5.对步骤4得到的各组分进行SDS-PAGE变性电泳,根据分子量鉴定各组分及纯度。

如有必要可重复3/4 [2f)

如没有步骤1扣1分,步骤3和2颠倒扣1分

III.答案要点

1.① Noncompetitive inhibitor, a special mixed inhibitor [Ipts]

②【2pts】

ik L EI + S - 」ESI

2.K ln = 1/0. 8 = 1. 25 uM [Ipt]

K cat = Vy/[E] = 1/ (2XW6) = 5X105 mM/s [Ipt]

K;pp = 1.25 同[Ipt]

K cat app = (1/4) / (2XW6) = 1.25X 105 mM/s [Ipt]

3.= (1 + [I]/K,) = * / Vb [Ipt]

K( = [I]/( V心 / V lnax app -1) = 10X10~7 (4-1) = 3. 3X10"6 mM [2pts]

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