精卫的诞生与基因起源之谜
山海经：精卫其实是炎帝女儿“女娃”驯养的一种精卫鸟！
山海经：精卫其实是炎帝女儿“女娃”驯养的一种精卫鸟！北山经共记载了87座山，其28座山无草木，包括求如山、谯明山、石者山、蔓联山、单张山、小咸山、大咸山、少咸山、浑夕山、北单山、罴差山、狐岐山、白沙山、尔是山、敦头山、梁渠山、姑灌山、敦题山、龙候山、天池山、彭囟比山、沮洳山、敦与山、空桑山、泰戏山、饶山、乾山、雁门山。
其中白沙山方圆三百里，都是流沙。
说明这一带当时的植被是最少的。
根据北山经记载，灌题山西部的泑泽盛产磁石。
我们常说指南针是中国的四大发明，北山经中有关于磁石的记载，表明中国早在尧舜禹时代就懂得磁石的性能，并早已会利用磁石判别方向。
北山经第65段记载：“……发鸠之山……有鸟焉，其状如乌，文首、白喙、赤足，名曰精卫，其名自詨。
是炎帝之女名曰女娃，女娃游于东海，溺而不返，故为精卫，常衔西山之木石，以堙东海……”。
这段话翻译成现代文应是：“发鸠山有一种鸟，样子像乌鸦，长着花斑脑袋，有白色的嘴巴和红色的爪子，名叫精卫，这鸟的叫声就是它的名字。
炎帝的女儿叫女娃，女娃到东海游泳时不幸溺水身亡，于是她生前驯养的精卫鸟，常衔回西山的树枝和石头来填塞东海。
”由于古今语言语法的差异，有人将这段记载中的“故为精卫”翻译成“（女娃）变成了精卫鸟”。
于是将这段真实的记载当作“神话”。
我认为“故为精卫”应译成“（女娃）生前驯养的精卫鸟”。
我们常听到“动物救主”的故事，而上述记载中的女娃溺水身亡后，女娃生前驯养的精卫鸟，正是为了救主，而不断从西山衔树枝和石头到东海。
事实上，很多古籍记载的都是真实的历史，但由于古今语言语法的差异，人们误解了其意思，并误以为是古人编出来的“神话”。
这是我们读古籍时应注意的。
【民间故事】不屈的英灵精卫
【民间故事】不屈的英灵精卫在古老的中国历史中，有一位英勇的英雄，他名叫精卫，是一只美丽的鸟。
精卫的故事源自中国古代的传说和民间故事，被传颂千年，深受人民喜爱。
相传在很久以前，有一位叫做大禹的伟大治水英雄，他用尽全力治理洪水，终于让人们免于水患。
而在治理洪水的过程中，有一位名叫精卫的小鸟，也为人类的幸福付出了很多。
精卫是一只美丽而机敏的小鸟，它生活在深邃的山谷之间。
它的羽毛闪烁着七彩的光芒，如同一颗颗宝石般美丽。
精卫飞翔在天空中，俯瞰着大地，它对人类的疾苦和困苦心怀感慨，决心为人类的幸福做出自己的贡献。
有一天，洪水泛滥，水势汹涌，吞噬着人的家园和生命。
精卫看到人们无助的样子，心中产生了深深的悲痛和怜悯。
它决心为了人类的利益，也为了让自己能够成为对抗洪水的一员，不再袖手旁观。
精卫冲入洪水之中，奋勇拼搏，尽管体型微小，但它的心却是无比坚强，它不顾危险，不畏风浪，竭尽所能，救助被卷入洪水中的人们。
精卫不断地往返于水中，用自己渺小的力量，顽强地抵抗着汹涌的洪水。
在这样的危急关头，精卫用自己的勇气和智慧，拯救了许多人的生命。
人们感激不尽，称赞精卫是真正的英雄。
从此以后，精卫成为人们心中的英雄，传颂千秋。
精卫并没有因此而停止，它知道，洪水是无情的怪物，破坏的力量仍在不断扩大。
为了避免更多的人遭受洪水的侵袭，精卫决心不再束手就擒，它要找寻到能够有效抑制洪水的方法。
于是，它四处寻找，最终发现了一种奇特的树木，叫做“苦树”。
它们可以生长在洪水中，在抵御洪水的袭击中，非常乐于作为城市防护树。
于是它用嘴巴抓起树籽，到处撒播，让苦树在城市到处生长，为人民生活提供安全保障。
精卫在这样的努力下，终于让洪水的袭击有了一些减缓，城市的人们再也能够安居乐业了。
精卫成为了人们心中的救世主，留下了一段佳话。
善者必为多病者所忌，也有正确于精卫。
有一次，精卫为了寻找树籽，寻找了一个很高的悬崖，一个光滑的岩石，精卫用力扑通一声摔下去悬崖。
当它摔在悬崖下面，它的身体被摔得粉碎。
新基因起源与进化
新基因的产生与进化
（Sources and evolution of new genes ）
研究一个新基因的起源的两个步骤 首先，我们要知道一个新的基因结构在自 然界的某一生物个体产生的突变步骤。 其次，我们需要知道这一单一个体的新基 因扩散到一个物种所有个体的固定过程。
新 基 因 产 生 的 分 子 机 制
研究发现其3’端外显子与ATP合成酶F 研究发现其3’端外显子与ATP合成酶F链具有同源性，但不含内含子， 其两端有短的重复序列(TTCG)，并且在3’末端有poly(A)序列，这些证 其两端有短的重复序列(TTCG)，并且在3’末端有poly(A)序列，这些证 据指示此外显子是由ATP合成酶F链逆转座插入产生的。而sphinx基因 据指示此外显子是由ATP合成酶F链逆转座插入产生的。而sphinx基因 5‘端的调控序列及外显子被推测是由原先已存在的基因所贡献，这2部 5‘端的调控序列及外显子被推测是由原先已存在的基因所贡献，这2 分通过外显子重排形成一新的嵌合基因。sphinx基因具有多种剪切形式， 分通过外显子重排形成一新的嵌合基因。sphinx基因具有多种剪切形式， 并且有的剪切形式具有性别表达特异性
但已经获得的基因组数据中，大多数的基因产生 太早，在漫长的进化时间中积累的大量突变，早 已湮没了大部分重要的进化信息。许多关于新基 已湮没了大部分重要的进化信息。许多关于新基 因起源的细节随着漫长的进化年代都丢失了。 与那些古老的基因相比，年轻基因由于产生时间 年轻基因由于产生时间 年轻基因 短，保留了大量进化过程中的重要信息，可以提 短，保留了大量进化过程中的重要信息， 供给人们新基因进化早期的结构、序列信息，有 助于推断其起源机制及进化力量，是研究新基因 是研究新基因 产生的理想材料。
《山海经》异兽奇鸟——精卫鸟
《山海经》异兽奇鸟——精卫鸟原文：东三百里，曰沮洳之山。
无草木，有金玉。
濝水出焉，南流注于河。
又北三百里曰神囷之山。
其上有文石，其下有白蛇，有飞虫。
黄水出焉，而东流注于洹。
滏水出焉，而东流注于欧水。
又北二百里，曰发鸠之山。
其上多柘木。
有鸟焉，其状如乌，文首、白喙、赤足，名曰精卫，其名自詨。
是炎帝之少女，名曰女娃。
女娃游于东海，溺而不返，故为精卫。
常衔西山之木石，以堙于东海。
漳水出焉，东流注于河。
又东北百二十里，曰少山。
其上有金玉，其下有铜。
清漳之水出焉，东流于浊漳之水。
又东北二百里，曰锡山。
其上多玉，其下有砥。
牛首之水出焉，而东流注于滏水。
又北二百里曰景山，有美玉。
景水出焉，东南流注于海泽。
又北百里，曰题首之山。
有玉焉，多石，无水。
又北百里曰绣山。
其上有玉、青碧。
其木多[木旬]，其草多芍药、芎藭。
洧水出焉，而东流注于河。
其中有鳠、黾。
又北百二十里，曰松山。
阳水出焉，东北流注于河。
解读：谒戾山东三百里处是沮洳山。
山上没有草木，还盛产金属矿石和玉石。
濝水从山中发源，向南流入黄河。
沮洳山北三百里处是神囷山。
山上有许多带有花纹的石头，山下还很多白蛇盘踞，飞虫聚集。
黄水从山中发源，向东流入洹水。
滏水也从山中发源，向东流入欧水。
神囷山北二百里处是发鸠山。
山上生长许多的柘木树。
山中还栖息着一种鸟，名为精卫。
精卫的身形像乌鸦，但是精卫的脑袋上的羽毛有花纹，还长着白色的嘴喙，红色的爪子，发出的声音就像是在呼喊自己的名字。
传说精卫是炎帝的小女儿，名为女娃。
有一天，女娲到东海去游玩，不慎淹死在东海，死后她的灵魂变成了精卫鸟。
常常衔西山的木石，来填东海。
漳水从山中发源，向东流入黄河。
这里的精卫便是我们熟知的《精卫填海》的出处了。
发鸠山东北一百二十里处是少山。
山上盛产金属矿石和玉石，山下盛产铜矿石。
清漳水从山中发源，向东流入浊漳水。
少山东北二百里处是锡山。
山上盛产玉石，山下有很多磨刀石。
牛首水从山中发源，向东流入滏水。
锡山北二百里处是景山，山上有美玉。
精卫填海的精卫指什么
精卫填海是一个神话故事。
故事中的精卫指的是一种叫精卫的鸟。
据说精卫曾经是炎帝最宠爱的女儿，有一天她去东海玩，可是突然风暴袭来，她意外淹死了。
精卫死后就变成了一只鸟，这个鸟的名字就叫精卫鸟。
这个故事出自《山海经，北山经》原文是：“炎帝之少女，名曰女娃。
女娃游于东海，溺而不返，故为精卫，常衔西山之木石，以湮于东海。
”译成现代文的意思就是说。
：炎帝的小女儿名字叫女娃，有一天女娃去东海游玩。
遇到风暴意外淹死，从此就再也没有回家。
这个故事是说女娃不甘心自己就这样死去，她恨大海夺去他的生命。
她发誓一定要把大海填平。
她的灵魂化作名叫精卫的小鸟，住在北方的发鸠山，精卫每天都飞到西山去，衔石子或者树枝，然飞到东海投入海中，她想要把大海填平。
大海嘲笑精卫，认为她这是不自量力。
精卫却不在意，她认为再弱小的力量也不容小觑。
是只要自己一直努力，就一定会有成功的一天，就这样，精卫不停的飞翔着，不停地往返于西山，锲而不舍的把西山的石头和树枝衔来投入大海，她就这样往返的飞翔，从来不休息，直到今天她还在不停的做这种同样的工作。
这是中国上古神话中记录的神话故事之一。
故事也表示了人在自然的力量面前显得如此的弱小和无能。
连炎帝的女儿都不能抵抗自然的力量，而意外的被淹死。
死后仇恨大海夺去了她的生命，化作精卫鸟来填海。
也显现出人的生命的脆弱和大海的强大。
最后即便是灵魂不散，仇恨不去，化作精卫鸟。
但是想填平大海的愿望也是那样的微弱和徒劳。
这个故事也还告诉我们另一个道理，只要下决心去做一件事，就不要在乎他是否成功，只要自己不断的努力和坚持，坚定自己的信念，永不言弃。
这也是古人用来弘扬一种锲而不舍的精神。
精卫的父亲是“三皇”神农，她与东海有何深仇，立志要填平大海？
精卫的父亲是“三皇”神农，她与东海有何深仇，立志要填平大海？精卫的父亲是“三皇”神农，她与东海有何深仇，立志要填平大海？中国的民间神话，留下了许多有趣且励志的传说，上古传说“精卫填海”，就是其中的一个。
在这个神话传说，精卫面对广阔无边的大海，发下誓言要填平大海？这种精神，有些像“愚公移山”。
事出必有因。
精卫与大海有何冤仇，在力量悬殊相差很大的情况下，她又为何为非要填海？填的又是哪个海呢？“源易缘”查阅传统文化古籍发现，精卫并不是闲着没事找事，而是她与大海有一次很大的“过节”。
是什么过节呢？今天我们就来重温一下这个古老的传说。
精卫出生在一个名门望族，她的父亲是后人尊称的“三皇”之一，神农氏——炎帝。
炎帝神农，曾尝过百草，相传他牛头人身。
由于神农勤劳勇敢和才艺超群，神农长大后被人们推为部落首领，曾发明了医药，教会了百姓种植五谷……他还联合黄帝打败了蚩尤，开创华夏大地，中华民族都称为“炎黄子孙”。
神农有一个美丽的小女儿，名叫女娃。
请注意，此名与上古正神、抟土造人的“女娲娘娘”并非同一人。
相传，女娃从小就很喜欢大海，也常去海边玩。
有一次，女娃想到东海，想到海的另一边，寻找自己的父亲——神农氏。
她驾着一条小船，驶向大海的另一端。
年幼的女娃并未想到，危险正一步一步的来临。
当她驾驶的小船，驶向大海深处时，天空越来越暗，海浪也越来越大。
就在前行的途中，女娃被一个巨浪卷到了深深的海底。
水火无情，女娃幼小的生命被海水瞬间无情的吞噬。
在神话传说里称，女娃的身体虽然被海水夺去。
但他的精魂并没死。
于是女娃化成了一种小鸟，常常盘旋在大海的上空。
”源易缘“注意到，这种小鸟脑袋是花色的，嘴壳是白色的，脚爪是红色的，后来人们就称作此鸟为”精卫鸟“。
本来天真的想找自己的父亲，不成想却永远回不了自己的家，还有多少人会遭遇这样的不幸呢？……一想到这里，精卫的心里就痛恨起来大海，决定要填平大海。
他不怕疲劳的往返于发鸠山，用嘴衔起一粒粒小石子，抛到了大海。
精卫（顾炎武）
精卫（顾炎武）精卫顾炎武万事有不平，尔何空自苦？长将一寸身，衔木到终古。
我愿平东海，身沉心不改。
大海无平期，我心无绝时。
呜呼！君不见西山衔木众鸟多，鹊来燕去自成窠！[注释］1.精卫：古代神话中所记载的一种鸟。
相传是炎帝的少女，由于在东海中溺水而死，所以死后化身为鸟，名叫精卫，常常到西山衔木石以填东海。
2.顾炎武：明末清初的思想家、文学家和爱国志士。
[评析]顾炎武从二十七起开始编篡两部巨著，《天下郡国利病书》和《肇域志》。
这首诗是顾炎武在36岁时根据《山海经》关于精卫鸟的故事写成的。
相传，精卫鸟是炎帝的女儿，被大海吞噬了生命。
她的灵魂变成了一只精卫鸟，锲而不舍不知疲倦地从高山采集石子和树枝衔在嘴里丢向东海。
顾炎武把自己比喻为精卫鸟，决心以精卫鸟填海的精神，实现自己抗清复明和编写巨著的大业。
精卫诗表达了他坚持气节，不向清王朝屈服的决心。
在历经三十年后，巨著终于完成。
顾炎武为了探索经国济民之道，跋山涉水，调查研究，作了大量笔录，孜孜以求，直到“死而后已”。
[作者介绍]顾炎武（1613--1682）明清之际思想家、学者。
初名绛，字宁人，曾自署蒋山傭。
江苏昆山人。
学者称亭林先生。
明末，曾参加“复社”反宦官权贵斗争。
清兵南下，嗣母王氏殉国，又参加昆山、嘉定一带人民抗清起义。
失败后，十谒明陵，遍游华北。
所至访问风俗，搜集史料，尤致力边防及西北地理研究。
垦荒种地，纠合同道，不忘兴复。
晚岁卜居华阴，卒于曲沃。
学问博洽，于国家典制、郡邑掌故、天文仪象、河漕兵农以及经史百家、音韵训诂之学，均有研究。
晚年治经侧重考证，开清代朴学风气，对后来考据学中吴派、皖派均有影响。
【民间故事】不屈的英灵精卫
【民间故事】不屈的英灵精卫在很久很久以前，有一个美丽的传说流传于大江之畔。
传说中，有一只名叫精卫的小鸟，它拥有和普通鸟不一样的力量和勇气。
很久以前，大地上有许多仙鸟，它们能在天空自由翱翔，过着快乐的生活。
而其中最受人们崇拜的就是美丽智慧的仙鸟精卫。
因为它拥有一身美丽的羽毛和聪明的头脑，所以被人们亲切地称为精卫。
精卫勇敢无畏，见义勇为，所以在大家心中享有盛誉。
有一天，一位母亲带着自己的孩子来到江边玩耍。
离她们不远的地方有一片水面，湍急的河水滔滔不息地冲击着岩石。
孩子们兴奋地欢叫着，玩得十分开心。
可是不幸的是，一下子孩子滑了下去，掉进了湍急的河水中。
“救命啊！”孩子的母亲大声呼喊着，但是周围的人都不敢上前救援，因为江水太过湍急，恐怕连救援者也不会有好的结局。
面对众人无法的呼救，精卫看不下去了。
它一下子冲进了急流中，尽管身体被浪花卷去，但它仍然坚持不懈地朝着孩子游去。
经过一番搏斗，精卫终于游到了孩子身边，小心翼翼地将孩子戴到自己的背上，然后挣扎着返回了岸边。
大家都为精卫的勇敢行为而感到钦佩不已，纷纷激动地为它鼓掌叫好。
就在精卫返回岸边的那一刻，江水的怒火卷起了一阵巨型浪花，将它卷走了。
精卫挣扎了一会儿，最终被浪花卷到水中。
精卫并没有被恶劣的水势吓倒，它不屈不挠地继续站起来，奋力地扑打翅膀。
它相信，只要自己努力，一定能够摆脱水势的束缚。
精卫用尽全力，不断战胜着江水的阻挠。
它毫不气馁地，不断努力地扑打翅膀，终于克服了恶劣的水势，重回了安全的岸边。
众人看到这一幕，都被精卫坚强的意志所感动。
纷纷赞叹精卫的不屈不挠精神，他们都认为精卫是一只不平凡的仙鸟，他为了拯救人类生命而奉献自己的生命，展现了毫不屈服的勇气和坚强的意志。
从那以后，精卫成为了人们尊敬的英雄，被铭记在大家的心中。
人们常常用精卫的故事来激励自己，意味着只要有坚强的意志，不屈不挠地奋斗，无论面对多么困难的环境，都一定能够战胜困难，取得最后的胜利。
这个故事告诉了我们，面对困难和挫折时，要像精卫一样坚韧不拔。
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1.精卫的诞生与基因起源之谜又北二百里，曰发鸠之山，其上多柘木。
有鸟焉，其状如乌；文首、白喙、赤足，名曰“”精卫“”。
是炎帝之少女，名曰女娃。
女娃游于东海，溺而不返，故为精卫。
常衔西山之木石，以堙于东海。
——《山海经·北山经》a)（一）许多年前，我在云贵高原一个绿竹满山、清溪环绕的贫困山村做农民。
山民管我们这些下乡插队的知识青年叫“知二哥”。
山民中的一位老人，曾在私塾读过线装书，因而做了乡里的文书。
他看不起我们这些从城里来的或回乡的中学生娃娃，因为我们一本线装书也没读过。
在一个深冬无聊的晚上，老文书摇头晃脑地为我背诵了精卫填海的神话。
真没想到，在我日后负笈美国，从加州大学到哈佛大学，再到芝加哥大学的十年旅途中，竟与这个神话结下了不解之缘。
（二）在芝加哥大学我的实验室里，聚集着一批来自美国和其它几个国家的优秀的博士后研究员、博士研究生和本科生，在共同研究一个叫做“精卫”或类似的基因。
这个基因与我们所知的四百多万个分子序列已知的基因不同之处，是它极其年轻的生命和奇异的结构。
生命的进化，常以百万年为基本的年龄单位（一岁）。
此前发现的基因，年龄都在一千岁到三千岁之间，而“精卫”的年龄大约只有两岁。
因此，我们第一次有机会考察一个基因的起源状况。
这就像研究人的早期胚胎以推断个体发育产生过程一样。
一位美国同事打了个比方，说“精卫”基因是宇宙之超新星爆炸的产物。
今天，人类已经知道许多有关自身存在的环境各个层次单位的起源过程。
在宇宙水平上，英国剑桥大学的斯蒂芬·哈肯（Stephen Hawking）所著的《时间简史》，描述了扣人心弦的宇宙起源图景。
对地球的起源及演化，从19世纪英国地质学家查尔斯·耐依尔(Charles Lyell)到今天的地球物理学家已对其40亿年的演变过程进行了详细的描述。
在生命的层次上，自19世纪中叶查尔斯·达尔文(CharlesDarwin)到现在，人类已经知道物种起源的许许多多奥秘。
在特殊情况下，已能在实验室重现一个自然界已存在的物种起源的遗传演变的全过程。
然而，直到1990年，人类却一直没有机会探究基因这一生命的最基本单位的起源之谜。
在此之前，有几位学者曾作过思辨式的探索，如30年代芝加哥大学的舍沃·怀特(Sewall Wright），70年代加州理工学院的大野·乾（Susumu Ohno）以及我以前的老师、哈佛大学的沃尔特·吉尔伯特（Walter Gilbert）。
但是他们都没有机会目睹一个新基因的起源。
因为20世纪的生命科学还处在发现和调查基因的性质、回答“”基因是什么“”的阶段，对“基因从何而来”这样的问题，还无暇顾及。
随着分子生物学技术的进步，以分子生物手段研究进化问题在80年代成为可能。
然而，我有机会研究基因的起源，则完全出于偶然。
（三）研究一个新基因的起源过程，应该包括两个相互衔接的步骤。
首先，我们要知道一个新的基因结构在自然界的某一生物个体产生的突变步骤。
其次，我们需要知道这一单一个体的新基因扩散到一个物种所有个体的固定过程。
观察新基因起源的两个步骤是一项极富挑战性的工作。
因为，前者需要阐明分子突变的分子生物学机制，后者需要涉及复杂抽象的数学过程。
而在过去的研究中，这是生物学中两个互不交叉的领域。
更困难的是作为研究对象的新基因必须很年轻。
因为我们发现，基因的起源过程与人的个体发育过程有着相似之处。
一个人在幼时相貌变化特别快，而到成人时期相貌变化则趋向缓慢。
因而，用成年时的相貌判别推测幼时的相貌，可靠程度就不会高。
同样，基因在产生之初，结构变化既大且快。
所以用老的基因如动植物共有的某些基因，去研究基因起源的早期特征是很难有准确结果的。
因此，研究新基因起源的第一步，是找到自然界的物种中刚刚产生的年幼的基因，而且这样的基因还必须在基因起源的两个步骤中都保有鲜明的特征。
我的第一个新基因研究系统的建立是一个“无心插柳柳成荫”的过程。
但这一过程的结果不仅阐明了前面所提出的两个重要问题，而且导致了对其他基因有意识的探索。
这些新基因独有的特征以及在进化上的意义，吸引了许多基础科学工作者。
为了让其他领域（如数学、物理、化学）的学者和一般读者能分享基因起源的知识，我将用尽量通俗的语言来介绍我们目前获得的研究成果。
(四)1990年夏，我幸运地进入了加州大学（戴维斯）美国分子群体遗传学最优秀的学者之一查尔斯·兰格利（Charles Langley）的实验室，开始了我的博士研究课题。
20世纪下半叶，生物学发生了两场改变基本观念的科学革命。
一是由沃森和吉尔伯特等人领导的分子生物学的兴起，回答“基因是什么”的问题。
二是在分子进化领域里对西方思想界和生物学界信奉达一百多年的达尔文主义的挑战，即认为达尔文理论的核心部分适应性自然选择不是分子水平进化的主要动力，是中性突变基因的随机固定造成了分子水平上物种间和物种内的变异。
这场进化理论的变革，始于哈佛大学理查德·莱旺顿（Richard Lewontin)和他的同事杰克·胡毕（JackHuby）于1966年在芝加哥大学开创的分子进化的电泳研究。
他们运用自己创造的分子技术，观察到以前的进化科学家从来没有想象过的现象：果蝇的任一个体的多于10%的基因编码的蛋白质分子是不一样的。
运用遗传载荷理论计算由于对差异的选择，每一雌果蝇为保持物种的不至灭绝必须产生十亿个以上的后代，而这在现实中是绝对不可能的。
因此，莱旺顿和胡毕指出自然选择理论不能解释产生分子差异的原因。
此后短短十年，世界上许多实验室运用电泳技术调查了一千多个生物物种，证明莱旺顿－胡毕的实验结果是普遍成立的。
面对莱旺顿－胡毕实验揭示的与原有正统理论不相容的自然现象，日本遗传学家木村资生（Motoo Kimura）提出了一套革命性的理论。
这一理论的基本观点认为，物种间和同一物种内个体间在分子水平上的遗传差异是遗传漂移所引进的突变的随机固定的结果。
通俗地说是每个生物个体生存的“运气”不同的结果，而不是达尔文理论主张的“弱肉强食”的选择所致。
同生物学的其他理论相比，木村的中性进化理论的重要，不仅在于其基本观念的变革，而且在于这一理论的独有特征：高度的数量化。
尽管中性进化论赖以建立的遗传载荷计算只适用于非常特殊的适合度模型，但这一理论所得出的一系列精确的数学预期，可以由观察实验印证，从而对理论本身进行精确的检验。
我在兰格利实验室的博士论文研究的最初计划，是发展一个适合的分子实验模型，调查中性进化论的理论预期在DNA序列水平的符合程度。
1990年夏天，英国剑桥大学的遗传学家迈克·阿系伯纳（Michael Ashburner）告诉我们他的学生皮特·杰夫斯（Pete Jeffs）的一个惊人的发现：他们观察到兰格利在80年代早期测试到的果蝇的乙醇脱氢酶基因的第二位点具有所有假基因的特征。
这一被认为没有功能的假基因失去了原有基因的所有内含子和翻译蛋白所必须的起始密码。
前一现象表明这一假基因是通过对被修饰的RNA反转录形成的DNA片段随机插入基因组形成的。
他们推测这种随机插入不会有可能置新的假基因位点于一个已存在的足以赋予新功能的调控系统之下。
后来我发现这正是由于他们追随传统思想方法而犯的一个致命的错误。
阿系伯纳－杰夫斯实验在当时是一个不寻常的发现。
因为，人们虽然在哺乳动物中已发现了许多经反转录形成的假基因，但此前从未在无脊椎动物（如果蝇）中观察到类似的基因，尽管人们已经知道无脊椎动物细胞里有形成此类基因最重要的反转录酶。
于是，阿系伯纳—杰夫斯实验似乎解决了一个久已存在的逻辑悖论。
然而，这一观察为我的研究提供了第一个严格检验中性进化理论的基础是否牢固的机会。
假如这一基因位点没有功能，因而不曾接受任何自然选择，所以其分子变异的所有特征都应当符合中性进化论的精确理论预期。
当时实验室的一位博士后研究员现剑桥大学的遗传学家埃迪·福尔摩斯(Eddie Holms)评论我的实验将成为分子进化领域的一项决定性的工作。
但是后来的实验证明埃迪的话只说对了一半。
（五）按照90年代初分子生物学的发展水平和我们的课题目标，注定我在此后的一两年间，将在暗无天日中度过：对自然界含有这一假基因的果蝇的许多群体中的抽样个体，运用刚发明的多聚酶链式反应，将假基因的DNA放大到可以测量DNA序列的足够数量，然后逐一进行测序的化学反应，读出每一个体的DNA序列，鉴别所有个体间核苷酸差异。
不断重复同样的实验，测定一个又一个的果蝇。
每一次测定都是在汗流浃背中处理完危险的同位素标记。
我不知道最后的结果。
我只是以比常人大一千倍的耐心，做完所有的实验。
我期望着完成实验后进行理论分析的快乐时光！一年后的一天，兰格利教授关切地问我：“您的脸色苍白，您的身体吃得消吗？”我竟感到没有说话的气力了。
我耽心看不到最后的结果，终于去了多年不去的医院。
医生们告诉我，我所需要的一切只是休息，这无疑对我是个好消息。
两年以后，当我出于好奇违背当初的课题设计，以一种新的方式分析那厚达盈寸的DNA序列胶片时，新的结果把我再次抛向理智和勇气的深渊。
我发现所有存在的核苷酸突变，似乎都选择遗传密码的第三位置上。
本来应随机分布的突变，现在却遵从只有具备翻译蛋白的功能基因才应遵从的简并性！简并性意味着改变密码但不改变密码决定的氨基酸；意味着自然界的DNA变异似乎不改变蛋白质的功能，从而免于选择淘汰。
如果这是一个假基因，我们应当期望所有变异将均匀分布在密码子的3个位置上。
其次，似乎所有的突变都避开了通常假基因的无义密码及导致密码错译的移码突变。
最后我还看到群体变异远远低于假基因应有的变异程度。
“小伙子，您给我们原有的研究课题以及剑桥的阿系伯纳的研究戳了一个大洞。
您往后的路可能更艰难！”兰格利这样说。
我知道我必须作一次选择：或是继续承认这是一个假基因，而把所有的观察视为反常现象，然后写一篇不疼不痒的博士论文；或是鼓起勇气挑战阿系伯纳这位声名远扬的剑桥的遗传学先驱，告诉他犯了一个大错。
他们所观察到的不是一个假基因，而是一个新的功能基因。
这预示着我们将要探索一个过去从未有可能探索的问题：基因是怎样在自然界产生的？选择第一种做法似乎更安全。
这意味着既不挑战前人也不为难自己。
而选择第二种做法，我将接受严峻的考验，因为我必须跨越不同的领域，继续掌握新基因功能的形成结果与条件。
学术研究上的少数派常常被认为是不安全的，我将在怀疑的眼光中勇敢地做下去。
一位获诺贝尔奖的华裔科学家讲得好：在学术上寻求妥协不是科学家应有的传统。
于是，我义无返顾地选择了后者，开始了与原有方向相反的漫长旅行。
（六）兰格利是一位严格的老师，也是一位在学生有困难时总是给予真正帮助的、富有责任心的美国教授。