网络药理学SCI-网络药理学常用数据库介绍
常用11大国外数据库详细介绍
常用11大国外数据库详细介绍一、美国(1)Wiley InterScience(英文文献期刊) Wiley InterScience是John Wiely & Sons公司创建的动态在线内容服务，1997年开始在网上开通。
通过InterScience，Wiley公司以许可协议形式向用户提供在线访问全文内容的服务。
WileyInterScience收录了360多种科学、工程技术、医疗领域及相关专业期刊、30多种大型专业参考书、13种实验室手册的全文和500多个题目的Wiley学术图书的全文。
其中被SCI收录的核心期刊近200种。
期刊具体学科划分为：Business,Finance & Management (商业、金融和管理)、Chemistry (化学)、Computer Science（计算机科学）、Earth Science （地球科学）、Education （教育学）、Engineering （工程学）、Law（法律）、Life and Medical Sciences （生命科学与医学）、Mathematics and Statistics（数学统计学）、Physics （物理）、Psychology （心理学）。
(2)美国IEEE (英文文献期刊)IEEE（Institute of Electrical & ElectronicsEngineers）是电子信息领域最著名的跨国性学术团体，其会员分布在世界150多个国家和地区。
据IEEE统计，IEEE会员总数2001年比2000年增加3.1%，达到人，其中学生会员为65669人，增长12.6%。
随着人们的信息越来越多地来自Internet，IEEE需要为会员提供更加完善和全面的电子信息产品和服务。
IEEE应成为IEEE会员获得信息的首选之地。
IEEE必须识别正确的信息，并提供对它们的访问方法。
实现这个目标的重要一步是通过IEEEXplore与IEEE/IEE Electronic Library(IEL)连接。
国内外常用数据库介绍
国内外常用数据库介绍一、中国1、中国知网(CNKI) /中国知识基础设施工程（China National Knowledge Infrastructure,CNKI）是由清华同方光盘股份有限公司、清华大学中国学术期刊电子杂志社、光盘国家工程研究中心联合建设的综合性文献数据库,于1999年6月在CERNET上开通了中心网站(),在CHINANET上开通了第二中心网站(),并且在许多图书馆和情报单位建立了镜像站点。
目前CNKI已建成了中国期刊全文数据库、优秀博硕士学位论文数据库、中国重要报纸全文数据库、重要会议论文全文数据库、科学文献计量评价数据库系列光盘等大型数据库产品，中国期刊全文数据库为其主要产品之一。
CNKI中国期刊全文数据库（Chinese Journal Full-text Database，CJFD）收录了1994年至今的6600种核心期刊与专业特色期刊的全文,积累全文文献618万篇，分为理工A（数理化天地生）、理工B（化学化工能源与材料）、理工C（工业技术）、农业、医药卫生、文史哲、经济政治与法律、教育与社会科学、电子技术与信息科学9个专辑,126个专题文献数据库。
网站及数据库交换服务中心每日更新,各镜像站点通过互联网或光盘来实现更新。
（免费帐号及密码）2、中文科技期刊数据库/维普数据库（VIP）/由科技部西南信息中心直属的重庆维普资讯公司开发，收录1989年以来8000余种中文期刊的830余万篇文献，并以每年150万篇的速度递增。
维普数据库按照《中国图书馆图书分类法》进行分类，所有文献被分为7个专辑：自然科学、工程技术、农业科学、医药卫生、经济管理、教育科学和图书情报,7大专辑又进一步细分为27个专题。
（免费帐号及密码）3、万方数据知识服务平台（wanfangdata）/万方数据股份有限公司是国内第一家以信息服务为核心的股份制高新技术企业，是在互联网领域，集信息资源产品、信息增值服务和信息处理方案为一体的综合信息服务商。
药学专业常用网址大全
药学专业常用网址大全索引：1 医药法规; 2 药事新闻; 3 医药机构; 4 药学期刊杂志; 5 文献资料; 6 药品信息及药物知识; 7 传统医药; 8 图书馆资源; 9 医药企业索引; 10 外国药学资源; 11药学专业常用网址; 12全国中医药大学精品课程集锦; 13常用搜索网址; 14药品信息（化学名及商品名）中文网站/英文网站;15企业与市场信息; 16药品研制与申报; 17期刊杂志; 18网上图书阅览; 19技术转让与合作; 20保健品; 21专利; 22天然药及中药; 23其他.1 医药法规1.1 医药法规/library/law01.htm 有关医药管理、卫生方面的法规。
1.2 医药经济信息/gyy/guide 列有中国医药政策法规、医疗保健及上海联合名医中心。
2 药事新闻2.1 国外药/NEWDRUGS.HTM 国外医药界新闻和新药信息等。
2.2 国内药 国内药学界最新动态。
3 医药机构3.1 卫生/html/weisheng.htm 研究和制订卫生事业发展的总体规划和战略目标，制订重大疾病防治规划。
3.2 中国药学/tcm/chinacpa.htm 全国各地的药学会介绍。
3.3 国家中药品种保护审评委员 提供中药保护政策法规及相关数据库查询。
3.4中国医学科学院药物研究/cams/institue_index.html 有该所以及所里的主要人员的图文资料。
3.5中国医学科学院医药生物技术研究/chinese/ibiotech.html 该所简介及主要工作人员的图文介绍。
3.6 中国药品生物制品检定 负责药品生物制品的检验监督以及药品的注册信息和新药动态等。
3.7 国家医药管理局-南方医药经济研究 研究中国医药市场、发布各种医药经济信息。
3.8 中国医院信 列有全国医院、医学院校、科研机构及学术团体名录。
3.9 传统中医药网/～hai001 介绍中医药组织、学校、诊所及相关软件。
网络药理学分析
将化学成分英文名（compound）输入网上数据库 (.hk/LSP/tcmsp.php）查找Related targets
Mol ID
复制该信息 到excel
N/A不要
将每个成分（compound）查找到的Related targets 逐个复 制到excel中（后栏为N/A则弃去）
将Related targets(化合物靶点)内容输入治疗靶点数据库 （/uniprot/）找蛋白编号（ID） （单个查询）
huma n
蛋白编号
星号文件
对应名称
huma n
蛋白编号选择黄色星号文件、对应名称、人源
将Related targets(化合物靶点)内容输入治疗靶点数据库 （/uniprot/）找蛋白编号（ID）
点击通路 作用靶点
找寻代谢组学中的差异性标志物关联的蛋白靶点 （b.csic.es/mbrole2/analysis.php）
代谢物KEGG号
一般选择HMDB或KEGG; 也可以全部选上
选择 点击
不同数据库来源，前面靶点有 重复项 ，excel进行筛选
（批量查询）
化合物靶点名称 或
Uniplot号
将Related targets(化合物靶点)内容输入治疗靶点数据库 （/uniprot/）找蛋白编号（ID）Βιβλιοθήκη （批量查询）蛋白编号（ID）
蛋白名称
下载文件
将蛋白编号（ID）excel表
将蛋白编号（ID）txt文件
CAS号
其二, 利用Mol ID号在excel文件（03_Info_Molecules[成分 名]或1、merge--Mol ID-原始）中查找化合物靶点名称
药智网数据库介绍
药智网数据库介绍药智网数据库介绍药智网成立于2009年，是国内较早对医药数据进行开发的数据提供服务商。
和丁香园一样延伸了像药智咨询、药智传媒、康洲智通、康洲汇通、药智汇、药智通、药智人才、PDI 峰会、药智沙龙、产业大脑等版块。
药智网数据库分类：药品说明书、红外光谱图、中药材标准、药品查询、药典查询；如果按搜索分类与药融云基本一致分为药品研发、一致性评价、生产检验、全球上市、市场信息、合理用药、药物化学、中药材、医疗器械、化妆品、食品。
（注：药智数据属于药智网的一部分）药智数据查询技巧注册登陆：标准全文查询需要先注册登陆（免费）。
药品名称查询：本查询系统支持模糊查询：如果你需要搜索“维生素C片”，只需要在”药品名称”搜索框内输入其中的关键字，如“维生素”或“C片”都可查询。
正文搜索：本系统部分标准提供全文查询，如在“正文搜索”搜索框内输入关键字“高效液相”，就可以查出所有正文中含有“高效液相”的标准。
标准来源选择：查询时可以对标准类型选择，如输入在药品名称“分散片”，同时在“标准来源”的第一个下拉框中选择“中国药典”标准类型，第二个下拉框中选择“中国药典2010”输入“2010”，则可以查询出2010药典所有的分散片标准。
PDF阅读说明：部分标准原件采用是PDF格式，如果你没有安装相关软件，请下载并安装PDF阅读软件。
药智网数据库会员权限药智网会员分为普通会员与付费会员。
相比药融云医药数据库，药智普通会员查看权限相对有限，目前药融云免费开放8个版块的86个数据库部分内容，相对价值更高；对付费会员而言，药融云医药数据库提供沙龙、巡讲、峰会、项目资产交易、批文转让、展位媒体服务包、需求对接等活动支持，VIP药融圈生态链（目前国内做得最好的医药人脉圈），能创造更多的无限可能。
中药材数据库药品中药材数据库基本上收录了国家和地方地药材质量标准信息，共计20000多条，大多数标准提供全文查询、下载。
收录标准如下：1、中国药典（中药材及饮片、提取物部分）2010年版及其勘误、2005年版及其勘误和增补版（2009）、2000年版及其增补版（2002）；2、卫生部药品标准中药材第一册（1992年版）；3、卫生部药品标准蒙药分册药材部分；4、卫生部药品标准藏药第一册药材部分；5、维吾尔医常用药材；6、中国卫生部药品标准维吾尔药分册药材部分；7、福建省中药材标准2006年版；8、山东省中药材标准2002年版；9、北京市中药材标准1998年版；10、河南省中药材标准1993年版；11、江苏省中药材标准1989年版；12、江西省中药材标准1996年版；13、湖南省中药材标准1993年版；14、湖南省中药材标准2009年版；15、海南省中药材标准1993年版；16、广西中药材标准90版；17、广西中药材标准第二册(96版)；18、广东省中药材标准2004年版；19、上海市中药材标准1994年版；20、黑龙江省中药材标准2001年版；21、云南省中药材标准第二册(彝族药)；22、西藏自治区地方药材质量标准；23、部分中药材进口标准药品查询数据库药品数据库基本上收录了所有国家药品质量标准信息，共计40000条，绝大多数标准提供全文查询、下载。
八章药学相关数据库
其优化限定Refine功能有：
Chemical Structure结构再次限定：帮助对结构再次限定 Isotope-Containning Substances同位素限定：帮助获得
结构中含有同位素的物质 Metal-Containing Substances金属包含限定：帮助获得
结构中含有金属的物质 Commercial Avaliability商业化限定：帮助获得可购买
Company/Organization机构排名
Database数据库来源显示
Document Type文献类型如综述、论文、专利的文献 量排名：帮助分析研究信息的新颖性、成熟性、系 统性、实用性等不同文献类型以反映科学的研究过 程
Index Term索引词分析：分析检索结果中检索词出 现频率排名帮助确定文献主要内容
的物质 Property Data性质数据限定：对可提供的物性数据分析 Property Avaliability通过物质的理化性质对物质进行
限定 Reference Av提供参考分析：帮助获得至少1篇参考信息
3．化学反应分析与限定功能
从Explore Reaction 途径检索得出结果共有10种分析 手段，包括： 催化剂catalyst：了解反应中出现的催化剂 溶剂solvent：了解反应中可能出现的溶剂 反应步数number of steps in reaction：了解反应步数 的情况 产率product yield：了解产物的产率 余分析手段同Research Topic途径
2．启动程序 运行SciFinder Scholar， 通过客户端直接连接SciFinder Scholar的 服务器，连接后，系统出现使用协议，接 受后，进入主页， 检索学术文献和信息查 找特定事实或化学物质、浏览特选期刊的 内容目录。
药品相关文献检索
3.2.3 FDA指南性文件
在此可以查找药物相关各方面指南，包括合规性、标签、临床、药理毒理、 CMC、仿制药、生物类似药等，此网站左侧有分类标签栏，你可以查到FDA最 新版本的指南，CFDA其实也翻译了很多FDA指南。 https:///Drugs/GuidanceComplianceRegulatoryInformation/Guida nces/default.htm
4 其他网站、论坛等
•
•
4.1 药智网
药智网的模式为威客交易模式，所不同的是针对医药、生物、化工方面的技术、学科 难题方面的交易，因此药智网提供的特色服务如下： 全国独一无二的药品数据库，包含了 药品标准数据库：系统收录了2010、2005年药典、1-75册新药转正标准、中药成方制剂、 中成药汇编、地标升国标、进口标准、单页标准……在内的全部国家药品标准。 药材标准数据库：系统收录了2010、2005年药典；蒙药、藏药、维吾尔医常用药材；福 建省、山东省、北京市、河南省、江苏省、江西省、湖南省、海南省、广东省、上海 市、黑龙江省、云南省、广西、西藏自治区……在内的全部地方中药材标准。
3.2.4 FDA网上学习课程
FDA提供了丰富的免费网上学习资源，在这里我们可以学习IND/ANDA/NDA申报、 eCTD等各种课程。 https:///Training/default.htm
3.3 欧洲药品管理局（EMA）
在EMA 上检索已上市药物，获取药物的授权信息、生产信息和评估信 息。 http://www.ema.europa.eu/ema/
1.2外文数据库
NCBI(常用数据库)
NCBI的使用方法 NCBI (National Center for Biotechnology Information）是指 美国国立生物技术信息中心。在1992年10月，NCBI承担起对GenBank DNA序 列数据库的责任。它包含基因组数据库，结构数据库，生物学门类数据库等 多项资源。 查找基因信息 在浏览器地址栏中键入/，或直接
最强攻略6：史上最全网络药理学数据库汇总解读
最强攻略6：史上最全网络药理学数据库汇总解读网络药理学主要是通过系统生物学的研究方法进行研究，使用统计学、复杂网络等数学手段，能够在分子水平上更好的理解细胞以及器官的行为，加速药物靶点的确认以及发现新的生物标志物。
网络药理学用网络科学的方法研究药理学，用网络拓扑性质来反应药物理化和生物学性质，是近年来的新兴学科，接下来我们来认识一些与网络药理学研究相关的数据库吧：01PubChem/PubChem是一个有机小分子生物活性数据，是一个生环化材中应用分子的数据模型库。
这里面包含了大量分子材料的理化性能介绍，对应每个有机分子的应用都能够追根溯源到较为全面的文献报道。
可以按名称，分子式，结构和其他标识符搜索化学物质来查找化学和物理性质，生物活性，安全性和毒性信息，专利，文献引用等等。
可供检索的化合物有11100万种，物质28700万种，生物活性27300万种、相关文献3200万篇、专利250万种。
详情请戳：PubChem：有机小分子生物活性数据库02DGIdb/DGIdb是一个药物-基因相互作用数据库，提供了基因与其已知或潜在药物关联信息。
里面的基因主要是癌基因，但是也有一些其他疾病（例如阿尔兹海默病、心脏病、糖尿病等）的相关基因。
DGIdb一共有超过14000种药物-基因的相互作用，涉及2600个基因和6300中靶向这些基因的药物，还包括了6700个其他的基因，这些基因很有可能成为未来药物的靶标。
详情请戳：DGIdb：药物基因相互作用数据库03DrugBank/drugs/DrugBank是阿尔伯塔大学将药物实验数据和药物目标信息结合起来的生物信息学和化学信息学数据库，也是目前最大的综合性药物数据库。
DrugBank包含13791种药物条目，其中包括2653种经批准的小分子药物、1417种经批准的生物技术(蛋白质/肽)药物、131种营养品和6451种实验药物。
5236个非冗余蛋白(即药物靶标/酶/转运体/载体)序列与这些药物条目相关联。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
KEGG数据库是手工绘制的KEGG途径图的集合，每 个途径图包含分子相互作用和反应的网络，将基因组中 的基因与通路中的基因产物（主要是蛋白质）连接。
KEGG pathway analysis即为将目的基因定位到 KEGG途径图中的过程。
打开KEGG map网站 https://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html
GO功能分类注释 /
KEGG注释通路分析
http://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway2.html
最常用的通路分析是京都基因与基因组百科全书 （Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes， KEGG）。1995年，KEGG数据库项目由京都大学化学 研究所教授Minoru Kanehisa领头启动。
搜索框输入汉字：人参
http://119.3.41.228:8000/tcmid/
点击 herb，搜索框输入ren shen
点击ren shen，结果如下：
TCM-ID .sg/group/TCMsite/Default.aspx
使用韦恩图创建数据集
靶点两个
药物名称 ID号 药物类型
药物结构
所有药理学研究数据
相互作用和参考文献
临床试验数据和药物经济学
药物性质
药物质谱图
药物毒性
物种：溶血葡萄球菌
物种：人
其靶点为QacR和BIRC5两个靶点信息，在右上角为details的链接， 点击进去可以看到靶点详细的信息
/
网络药理学常用数据库介绍 与使用
网络药理学的基础-数据库
现有的数据库已为开展网络药理学研究奠定了坚实基础，主要包 括： （1）文献数据库，如Pubmed，Medline和OMIM等； （2）药物-疾病相互作用数据库，如Drugbank、PDSP、 PubChem、GLIDA和STITCH等； （3）蛋白质相互作用数据库，如MIPS、DIP、MINT、IntAct、 BioGRRID、HPRD、BIND等； （4）通路数据库，如KEGG、Ingenuity Pathway Analysi、 Nature Pathway Interaction Database和Pathguide等。
• 韦恩图，用于显示元素集合重叠区域的图示 • 在生信分析中，可用于显示组间差异的交集与并集， • 韦恩图的历史：1880年维恩（Venn）在《论命题和推理的图表化和机械化表现》 一文中首次采用固定位置的交叉环形式用封闭曲线（内部区域）表示集合及其关系 的图形。（Venn Diagram，也称韦恩图或维恩图）
数据集网络分析 https:///cgi/input.pl
GO KEGG
DrugBank：https://www.drugbank.ca/
DrugBank数据库是一个整合了生物信息学和化学信息学资源， 并提供详细的药物数据与药物靶标信息及其机制的全面分子信 息，包括药物化学、药理学、药代动力学、ADME及其相互作 用信息。每个DrugCard条目包含200多个数据字段，其中一半 用于药物/化学数据，另一半用于药物靶标或蛋白质数据。 DrugBank最大的特色是它支持全面而复杂的搜索，结合 DrugBank可视化软件，这些工具能非常容易的检索到新的药物 靶目标、比较药物结构、研究药物机制以及探索新型药物。
该数据库西北农林科技 大学王永华教授团队研 发的，包含了499味草药 （中国药典2010版）以 及每位草药的化合物成 分（共计29000余个）， 针对每个化合物提供了 较全面的人体吸收、分 布、代谢（ADME）性 质评价数据，并提供了 潜在活性分子的靶标及 其疾病信息，形成了针 对每位草药的药物-靶标疾病网络
•ห้องสมุดไป่ตู้在线网站： https://b.csic.es/tools/venny/ http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
GO功能分类注释
基因本体论（GO）本体论这个词源于哲学，本体论用于描述事物的本质，所以 基因本体论为了描述基因的本质。GO从三个方面对基因的本质进行描述。