核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明

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NUT核磁处理软件实用指南

NUT核磁处理软件实用指南

单击鼠标左键出现红色光标线, 移动到积分的起点,单击左键, 此时出现绿色光标线,移动到积 分的终点,单击左键,即完成对 某一峰的积分工作。重复操作即 可对每个峰进行积分工作。
NUTs 基本操作

积分
主要命令 “ID” 按 “Ctrl+I” 显示积分值
单击鼠标左键,出现 红色光标线,将光标 移动到已积分好的峰 上:
NUTs 特殊操作

多重图谱的显示 IS
NUTs 特殊操作
多重谱图的显示 主要命令:“IS”, “DD”, “BU” DD:双图谱显示,并对其对比和进行加、减操作 先将需要插入的图谱进行一些基本操作(如FT、SR、 PE)之后,键入或选择命令“AL”,打开另一个需要对比 的图谱,适当处理后,键入命令“DD”,即可调出上一图 谱。用“AM”编译前一谱图。
NUTs 特殊操作

插入注释用图片或文字
图例“MO” 主要用于图 片的插入
NUTs 特殊操作

插入注释用图片或文字
键入或选择命令“NO”,用 鼠标左键点击任意位置或键 入命令“A” ,出现对话框, 输入所需的信息。 在此命令状态下,选定某一 文本,按鼠标右键可对其再 编译,或删除。 键入“C”,取消所有插入 键入“P”,显示实验参数
峰值编译
主要命令 “PP”, “DP”
键入“DP”命令后,将光标放在所要编译 的峰上,点击鼠标右键,出现编译对话框。 Label at Page Top: 决定 峰值的显示是否在谱图 的最上面。如果取消对 其的选择可以将峰值放 在任何想要放的位置。 Show Info field only:显 示用户想要显示的数据 或文字
AS命令下可以对两个谱图进行加、减等操作。
优点:双谱图显示,可进行加减操作,应用广泛 缺点:无法实现多谱图显示

NUTs处理NMR谱图技巧解析

NUTs处理NMR谱图技巧解析

NUTs 基本操作

峰值译
主要命令 “PP”, “DP”
键入“DP”命令后,将光标放在所要编译 的峰位移值的方框上,点击鼠标右键,出 现编译对话框。 Label at Page Top: 决定 峰值的显示是否在谱图 的最上面。如果取消对 其的选择可以将峰值放 在任何想要放的位置。 Show Info field only:显 示用户想要显示的数据 或文字 碳谱小窍门: 键入“DP”命令后,键入 “I “,可显示有多少个峰; 再键入“I”,则显示峰位 移值。
页 面 设 置
NUTs 特殊操作

多重图谱的显示
主要命令:“IS”, “DD”, “BU”
IS: 插入图谱。
选定想要插入部分谱图后,键入或选择命令 “IS”,在此状 态下键入命令“A”,即完成对谱图的插入。重复操作,可 插入多个谱图单元。在键入命令“IS”之前也可以打开另一 个图谱,将当前图谱插入下一谱图中。 在“IS”命令状态下,对插入的图谱进行移动、字体、坐 标轴、显示等方面的编译 优点:插入的谱图有坐标轴、可以对其进行编译 缺点:只能显示双谱,且不可进行两谱图间的操作
NUTs 处理NMR谱图技巧
NMR处理软件

核磁数据处理软件有:NUTS、MestRe-C、Gifa等, NUTS可以处理一维及二维核磁数据,其功能包括 付立叶变换、相位校正、差谱、模拟谱、匀场练习 等几乎所有核磁仪器操作软件的功能, 其演示版可以 在/下载;MestRe-C为处理 一维核磁数据的免费软件,功能完善。其最新版本 为2.3,有兴趣者可以在 c.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.html 处查看有关信息即下载;Gifa可以处理一至三维核 磁数据,为运行在LINUX操作系统中X-Window上 的免费软件,有关信息可查看 http://www.cbs.univmontp1.fr/GIFA/。

NUTS处理NMR谱图技巧

NUTS处理NMR谱图技巧

NUTs 基本操作
下载原始数据和 NUTs软件 运行软件NUTs
可下载NUTs的服务器 10.13.51.87 10.13.51.238
NUTs 基本操作
获取NMR原始文件
打开NMR原始文件(可从服务器上下载)。一般文件名 为FID 快捷命令 “GA”
NUTs 基本操作
谱图的傅立叶转换和翻转
快捷命令 “SR ” 快捷命令 “FT ”
NUTs 特殊操作
多重图谱的显示
主要命令:“IS”, “DD”, “BU” IS: 插入图谱。 选定想要插入部分谱图后,键入或选择命令 “IS”,在此状 态下键入命令“A”,即完成对谱图的插入。重复操作,可插 入多个谱图单元。在键入命令“IS”之前也可以打开另一个图 谱,将当前图谱插入下一谱图中。 在“IS”命令状态下,对插入的图谱进行移动、字体、坐 标轴、显示等方面的编译 优点:插入的谱图有坐标轴、可以对其进行编译 缺点:只能显示双谱,且不可进行两谱图间的操作
NUTs 特殊操作
多重图谱的显示 IS
NUTs 特殊操作
多重谱图的显示
主要命令:“IS”, “DD”, “BU” DD:双图谱显示,并对其对比和进行加、减操作 先将需要插入的图谱进行一些基本操作(如FT、SR、 PE)之后,键入或选择命令“AL”,打开另一个需要对比的 图谱,适当处理后,键入命令“DD”,即可调出上一图谱。 用“AM”编译前一谱图。 AS命令下可以对两个谱图进行加、减等操作。 优点:双谱图显示,可进行加减操作,应用广泛 缺点:无法实现多谱图显示
NUTs 基本操作
峰值标定
主要命令 “PP”, “DP”
键入“DP”命令后,出 现十字光标,将光标移 动到想要标示的峰上, 点击鼠标左键,重复操 作可以对每一个想要标 示的峰进行标示。 可以在此命令状态下, 按住鼠标左键(此时数 字框变成蓝色),键入 命令“D”来删除某一个 特定的峰值 用 “Ctrl+P” 命令决定 是否显示峰值。

核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明

核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明

核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明核磁共振数据处理软件NUTS主要包括以下几个步骤:1、调入图谱;4、FT变换(将FID信号转换成频率域图谱) ;5、相位调节;6、基线校正;7、化学位移定标;8、积分;9、画图。

下面就这些步骤中最基本的内容做简单介绍,详细的说明请查阅该软件的Online Help。

1、调入图谱启动NUTS软件,点击File→Open, 找到核磁数据目录,从该目录或它的子目录中找到名*.fid的文件,调入文件,屏幕上出现FID信号。

4、FT变换键入“FT”,或点击上方FT图标P,将FID信号转变为频率域谱图。

可用右侧滚动条、“PAGE UP”、“PAGE DOWN”或“<”,“>”调节谱峰高度。

5、相位调节相位调节的方法有三种:a自动相位校正:键入“QP”(有时不能正确调节相位);c 分段相位校正:点击ZOOM图标,选择某个图谱区域,键入“1” ;选择其他区域,键入“2” 。

回车(enter),键入“PE”,按住左键(left button),左右移动鼠标,调区域1的相位,右键(right button)调节区域2的相位,完成后回车(enter)退出。

6、化学位移定标Base Level状态下,按住鼠标左键,出现一红色“十”字光标,将光标移至要定标参考峰(TMS或溶剂峰)处,使竖线与峰重叠,按住左键的同时键入“O”,在出现的对话框中输入参考峰(TMS或溶剂峰)的化学位移值,然后点击OK,即可。

必要时可将参考峰放大(方法参见下画图部分)。

8、积分积分的方法有二种:b 手动积分(manual integral):Base Level下,键入“ID”,左边滚动条调节积分线高低。

如积分线不平,键入“B”,按住鼠标左键(left button)调整积分线左边到水平,按住鼠标右键(right button)到水平,完成后回车(enter)。

左键在选定峰的起点双击,出现一条绿线,再在该峰的终点单击,完成该峰的积分,其他峰操作相同。

nuts软件的使用

nuts软件的使用

Nuts 软件(1)输入ft; 输入qp←(该箭头表示需按回车键,下同);(2)选中谱图左侧部分并设为“1”,选中右侧部分并设为“2”←;(3)输入pe, 左键调平“1”区域的基线,右键调平“2”区域的基线←;(如果采用ap自动调平基线,就不需要这个pe操作);(4)左键不松手出现十字交叉红线,同时输入“M”标峰←;dp命令用于标记化学位移值,dp命令下,在峰附近左击即可标记该峰的化学位移值,若在峰附近按K,即取消对该峰化学位移值的标记。

(5)输入ai, id, c, b (自动积分,并可将积分线调整到合适的高度)←; (6)放大积分区域,输入id命令,可在该区域进行积分操作:(I)左键点击一下出现红线,击两下后出现的绿线是积分的起始处;再将红线移动至积分终结处点击一下,完成该峰的积分。

同上,对其它峰进行积分操作。

(II)在已积分峰处按住左键不松手,同时输入“V”,可在弹出对话框中设定该峰的氢的个数。

(III)在已积分峰处按住左键不松手,同时输入“d”,可以删除该峰处的积分。

在积分状态下按“L”键,可以取消最后一次的积分。

(IV)积分相关操作结束后需按回车键;而重新开始积分相关操作,只要先输入id命令再操作即可。

(7)输入dp命令(标峰相关的操作):单击左键可以逐个手动标峰;移动光标至已标峰处并按“k”键,可以删除该处的标峰。

dp命令结束后,需按回车键。

(8)输入no,a:弹出文件名对话框,输入你的文件名,“choose font”可以设置文件名的字体和大小,点“ok”完成。

再按回车键。

Mo 输入分子式(9)点开nuts软件的file菜单:(I)打开printer setup,将“方向”改为“横向”,再点开“属性”按钮并点击“属性”按钮中的“基本”,点击“确定”、“确定”即可。

(II)打开page setup,取消“Border Box Printed on page”和“Parameters Printed on Page”勾选项,再点击“ok”即可。

Nuts 处理技巧——dual display

Nuts 处理技巧——dual display

编辑后效果:
PS:将谱图转换成pdf格式打印输出后文字部分的彩色可以保留,但谱图全变成黑白,建议用PrintScreen来操 作得到全彩的图片比较漂Display
如要使更多的核磁谱出现在同一张谱图里也行,nuts里有一个multiple display操作,具体内容各位如 有兴趣请到nuts help 里的advanced features里的buffers里去看吧,里面介绍得很清楚,我就不再累述了。
弹出对话框:
第一栏是对buffer的核磁信号进行放大或缩小,第二栏是基线平移,第三栏是调整buffer 核磁的相对高度
调整后效果:
注:选择pp显示峰值时,只能显示后面的一张核磁的数据,buffer的峰值及积分都不能显 示,这是在选择buffer时选择出峰少的核磁谱的原因
键入NO对核磁谱进行编辑: 先输入NO算法,然后键入a, (add notes) 可对两个谱图进行编辑
注:选择反应前的或是峰值少的那张核磁数据
通过File选项中open操作打开另一张需要比较的核磁谱:
新的核磁谱被打开,原先的核磁谱存入buffer,被隐身
通过view菜单中的dual display操作, 使第一张存入buffer的核磁谱显身
通过tool菜单中的Edit AS parameters对两张核磁谱进行修饰:
Nuts 处理技巧——双重显示
Dual Display
Advantage
• 在一些比较复杂或者反应前后核磁信号变 化不明显的谱图中,采用双谱共显的方式 容易更直观的给出准确的结果。
• 在工艺研究中,做内标,以及相对浓度的 变化也可以给出直观的展现。
首先打开一张核磁谱,利用tool栏里的AL操作将其设定为buffer.

核磁共振处理软件NUTS2000-NUTS2013使用方法.

核磁共振处理软件NUTS2000-NUTS2013使用方法.

五、用“PE”命令对谱图作手动调整后的结果
四、查看精细结构


1、点 放大按扭,或者在图谱上双击 2、按住鼠标左键选择需要放大的区域,选择的区域 为红色显示 3、松开鼠标,点一下右键,此时选择的区域就已经 放大了 4、若想继续放大,可以继续按住鼠标左键选择某一 区域,然后点右键 5、若要查看全谱,再次点击右键即可 6、若点右键无法显示全谱,可以试试双击右键 7、中途退出‘放大’操作请按回车
3、自定义峰值显示,主要命令 “DP”
1、键入“DP”命令后,出现十字光标,将光标移动到想要标 示的峰上,点击鼠标左键,重复操作可以对每一个想要标示 的峰进行标示。 2、在某个峰上点右键,可以看到该峰的强度值,还可以修改 化学位移是否置顶显示 3、可以在此命令状态下,对某个峰值按住鼠标左键(此时数 字框变成蓝色),对其进行任意拖动,放在你想要的位置。 4、‘K’:删除离鼠标最近的峰值 5、‘U’、‘D’、‘L’、 ‘R’:对鼠标最近的峰进行上下左右 拖动 6、用 “Ctrl+P” 命令决定是否显示峰值。
七、积分
1、输入命令 “ID”,如图所示,左边出现滚动条,拉动滚 动条可以调整积分线的大小,使积分线处于软件屏幕内。
2、输入命令Z,左边又出现一个滚动条,拖动此滚动条可 以调整积分线的高低,调整完毕后回车退出此滚动条,注 意回车只能按一次。
多数情况下可以忽略这一步
单击鼠标左键出现红色光标线,移动到积分的起点,第二 次单击左键,此时出现绿色光标线,移动到积分的终点, 第三次单击左键,即完成对某一峰的积分工作。重复操作 即可对每个峰进行积分工作。按L可以删除最后一个积分
2、简单手动调整相位
用鼠标点 ,然后按住鼠标左键不放,左 右拉动,直到相位调整到满意为止,若一次 调整不好,还可以松开鼠标后再次按住鼠标 左右拖动。 命令方式:“PH” , 一般结合 “ZP” 命令 应用

NUTs处理NMR谱图技巧.

NUTs处理NMR谱图技巧.

NUTs 基本操作

峰值标定主要命令 “PP”, “DP”
键入“DP”命令后,出现 十字光标,将光标移动到 想要标示的峰的峰形的正 中间上,点击鼠标左键, 重复操作可以对每一个想 要标示的峰进行标示。 将光标对准目标峰位移值 的方框,按住鼠标左键 (此时数字框变成蓝色), 键入命令“K”来删除某 一个特定的峰值 将光标对准目标峰位移值 的方框,按住鼠标左键左 右移动,可以左右移动位 移值在图上的位置 用 “Ctrl+P” 命令决定是 否显示峰值。

积分
主要命令 “ID” 按 “Ctrl+I” 显示积分值
单击鼠标左键,出现 红色光标线,将光标 移动到已积分好的峰 上:
键入 “V”,确定该 峰的积分值,确定积 分面积标准。
键入“D”可删除该 积分,进行重新积分。 键入“M” 可调节 积分数值在谱图中的 位置:1次-底部;2次上部;3次-复原。 分别 键入“1”, “2”, “3” 分别调节 积分数值的高低
AS命令下可以对两个谱图进行加、减等操作(用加减 号)。
优点:双谱图显示,可进行加减操作,应用广泛
缺点:无法实现多谱图显示
NUTs 特殊操作

双重谱图的显示 DD
“AL” 命令
NUTs 特殊操作

双重谱图的显示 DD
图示运 用“DD” 命令
NUTs 特殊操作

双重谱图的显示 DD
NUTs 特殊操作
NUTs 基本操作

相位调整
用“PE”命令对谱图作手动调整
1. 2. 3.
键入命令 “PE”后,按住鼠标的左键,左右拖动对第一区域进行相位调整, 调整完毕后,松开左键,按住右键,左右拖动对第二区域进行相位调整, 调整完毕后,松开右键,输入回车(Enter)即完成手动相位调整。
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核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明
核磁共振数据处理软件NUTS主要包括以下几个步骤:
1、调入图谱;
4、FT变换(将FID信号转换成频率域图谱) ;
5、相位调节;
6、基线校正;
7、化学位移定标;
8、积分;
9、画图。

下面就这些步骤中最基本的内容做简单介绍,详细的说明请查阅该软件的Online Help。

1、调入图谱
启动NUTS软件,点击File→Open, 找到核磁数据目录,从该目录或它的子目录中找到名*.fid的文件,调入文件,屏幕上出现FID信号。

4、FT变换
键入“FT”,或点击上方FT图标P,将FID信号转变为频率域谱图。

可用右侧滚动条、“PAGE UP”、“PAGE DOWN”或“<”,“>”调节谱峰高度。

5、相位调节
相位调节的方法有三种:
a自动相位校正:键入“QP”(有时不能正确调节相位);
c 分段相位校正:点击ZOOM图标,选择某个图谱区域,键入“1” ;选择其他区域,键入“2” 。

回车(enter),键入“PE”,按住左键(left button),左右移动鼠标,调区域1的相位,右键(right button)调节区域2的相位,完成后回车(enter)退出。

6、化学位移定标
Base Level状态下,按住鼠标左键,出现一红色“十”字光标,将光标移至要定标参考峰(TMS或溶剂峰)处,使竖线与峰重叠,按住左键的同时键入“O”,在出现的对话框中输入参考峰(TMS或溶剂峰)的化学位移值,然后点击OK,即可。

必要时可将参考峰放大(方法参见下画图部分)。

8、积分
积分的方法有二种:
b 手动积分(manual integral):Base Level下,键入“ID”,左边滚动条调节积分线高低。

如积分线不平,键入“B”,按住鼠标左键(left button)调整积分线左边到水平,按住鼠标右键(right button)到水平,完成后回车(enter)。


键在选定峰的起点双击,出现一条绿线,再在该峰的终点单击,完成该峰的积分,其他峰操作相同。

完成积分后,选定一个特征的峰,设定积分参考值,将光标置于所选峰上,键入“V”,在出现的对话框中输入所定的积分值,回车。

与积分相关的一些其他指令:
a.在积分状态下,键入“C”,可消除所有积分(cancel all integrals);
b.在积分状态下,将光标置于所选峰上,键入“D”,可消除所选峰的积分(delete the integral);
c.在积分状态下,将光标置于所选峰上,键入“1”,“2”或“3”可使积分值出现在不同高度(adjust the height of integral)。

9、画图(paste molecular)
a 选定画图区域:Base Level下,用光标点击“ZO”图标,单击鼠标右键(right button),即可将红色区域放大,回车(enter)退出该功能;单击右键可使图谱恢复原来大小;
b Peak Picking:BASE LEVEL下,按住鼠标左键,出现一红色“十”字光标,将光标移置于最低所要峰的高度,键入“M”;回车(enter)退出该功能;
c PPm与Hz单位转换:Base Level下,键入“DP”,然后重复键入“H”可使Peak的单位在Hz与PPm之间转换;回车退出该功能;
d 编辑Title:Bas
e Level下,键入“NO”,然后键入“A”,在出现的对话框中直接输入图谱的Title, 键入“P”,可将参数表置于图谱中,(键入“C”,可清除所有文本(delete all text and molecular),)点击OK,用鼠标拖住红色框可调整Title和参数表在图谱中的位置。

回车退出该功能;
10.Print
a print
b printer setup
c page setup
d printer dialog
f 键入“PL”或点击“Print”图标,图谱即可打印出。

使用NUTS打印核磁图谱会出现两个两个问题
1图谱上的的字会变的很小.
2每次打印会打印出一张错误的图谱
解决方案
当设置好核磁图谱需要打印时.
1 点击Print,选择“横向”,点“确定”。

这时候打印机是无法打印出文件来,但我们的第一个问题就解决了。

2 点击Printer Dialog,选择打印到文件,并任意输一文件名,完成后再返回正常设置。

3 点击Print Setup,“确定”。

4 点击“Print”,可正常打印出谱图。

以上可以节省纸张和碳粉,请大家务必照做.如有那位同事有更好的办法改进,请告诉我们!
谱图保存
在“Base level”状态下,按“Control+C”; 然后在画图板里“Paste”,将此文件保存为“Jpeg”格式即可。

Exercise:。

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