[医学]胃肠肿瘤基因检测
《2024年CT影像组学分析鉴别胃肠道间质瘤c-kit基因9-11号外显子突变的初步研究》范文

《CT影像组学分析鉴别胃肠道间质瘤c-kit基因9-11号外显子突变的初步研究》篇一CT影像组学分析鉴别胃肠道间质瘤c-kit基因9-11号外显子突变的初步研究一、引言胃肠道间质瘤(Gastrointestinal Stromal Tumors,GISTs)是一种常见的胃肠道间叶性肿瘤,其发病机制与c-kit基因的突变密切相关。
其中,c-kit基因的9号和11号外显子突变是GISTs中最常见的突变类型。
近年来,随着医学影像技术的进步和计算机辅助诊断的快速发展,CT影像组学在肿瘤诊断与鉴别诊断中发挥了重要作用。
本研究旨在通过CT影像组学分析,初步探讨鉴别GISTs中c-kit基因9/11号外显子突变的可能性。
二、研究方法1. 研究对象本研究选取了经病理确诊的GISTs患者,收集其CT影像资料及相应的基因检测结果。
2. CT影像采集与处理采用多排螺旋CT扫描仪进行腹部扫描,获取GISTs的横断面、冠状面及矢状面影像。
对影像进行预处理,包括噪声抑制、对比度增强等。
3. 影像组学特征提取通过计算机辅助诊断系统,对预处理后的CT影像进行多层次、多角度的特征提取,包括形态学特征、纹理特征、边缘特征等。
4. 统计分析将提取的影像组学特征与c-kit基因9/11号外显子突变状态进行关联分析,采用统计学方法评估各特征与突变状态的关联性。
三、结果1. 影像组学特征与c-kit基因突变的关系通过统计分析,我们发现某些CT影像组学特征与c-kit基因9/11号外显子突变存在显著关联。
例如,肿瘤的形状、边缘清晰度、内部密度等特征在突变组与非突变组间存在明显差异。
2. 鉴别诊断效果基于上述统计结果,我们建立了一个基于CT影像组学特征的GISTs c-kit基因突变鉴别模型。
该模型在独立测试集上的准确率、敏感度和特异度均达到了较高水平,为临床诊断与鉴别诊断提供了有力支持。
四、讨论本研究表明,CT影像组学分析在鉴别GISTs c-kit基因9/11号外显子突变方面具有一定的应用价值。
肿瘤基因检测与治疗

肿瘤基因检测与治疗肿瘤是一种致命的疾病,对于患者来说,早期诊断和治疗至关重要。
随着医学技术的不断进步,肿瘤基因检测逐渐成为一种新的治疗方法。
然而,肿瘤基因检测还是一个新兴领域,很多人对它的认识还比较浅薄。
本文将介绍肿瘤基因检测及其与治疗的关系。
一、肿瘤基因检测肿瘤基因检测正逐渐成为一种重要的诊断方法。
肿瘤基因检测的原理是通过检测癌症细胞的基因变异来诊断癌症类型和治疗方案。
目前,肿瘤基因检测已经可以检测出癌症发生的机制。
而且,肿瘤的发生与肿瘤相关基因的变化密切相关,因此,通过检测肿瘤相关基因可为临床定制治疗方案,实现个性化治疗。
二、肿瘤基因检测与治疗的关系肿瘤基因检测可以为个体化治疗提供依据,使得患者能够获得更为贴心的治疗。
个体化治疗是一种基于肿瘤的基因特征和个人物质基础的治疗方式。
它根据患者的基因型、病理特征、生化特征和疗效反应来进行治疗。
不同患者的基因型和生物学表现不同,针对同一疾病的治疗方案也应该因人而异。
因此,要针对不同的肿瘤致病基因进行检测,针对不同的基因变异制定相应的治疗方案。
这种治疗方式,不仅可以提高治疗效果,还可以减少不必要的治疗副作用。
三、如何进行肿瘤基因检测肿瘤基因检测需要进行实验室的检测,通常需要患者去医院进行检测。
检测大多通过两种方式:样本检测和体液检测。
样本检测是指采集组织样本进行检测。
体液检测则是通过患者的血液、尿液等体液来检测指标。
其中,样本检测通常检测结果比较准确。
当前,公立医院和一些大型诊所提供基因检测服务。
四、肿瘤基因检测的优点和缺点肿瘤基因检测的优点是可以针对患者的特定情况进行治疗,可以提高治疗效果,减少治疗的副作用。
缺点是:一方面,该技术还处于发展阶段,精确性和可靠性都需要进一步提高,且成本较高;另一方面,由于涉及到患者的基因信息,涉及到个人隐私安全方面的问题。
五、结论与传统的治疗方式相比,个体化治疗物是基于个体基因特征,具有显著的实际效果。
因此,肿瘤基因检测对于肿瘤治疗具有重要的意义。
消化道恶性肿瘤化疗药物相关基因检测临床应用价值

实 用 临 床 医 药 杂 志
Ju l f l i l dc ei rci o ma o ic in P ate C n aMe i n c ・1 3 ・ 5
消 化 道 恶 性 肿 瘤 化 疗 药 物 相 关 基 因检 测 临床 应 用价 值
原因之一 , 严重危害人 民健康 , 主要治疗手段是 其 外科手术 , 但大多数患者就诊时已属 中晚期 , 化疗 和放 疗 技术 的发 展提 高 了肿瘤外 科 根治切 除术后
的疗 效 , 又为 不 能 实施 手 术 切 除 患 者提 供 了一 个
新 的治疗 途径 。 目前尽 管肿 瘤化 疗取 得 了一些 进
展 , 由于在 不 同种族 人群 中 , 同个 体 间仍有 显 但 不 著 的化疗 有 效 率 、 性 反应 的异 质 性 。据 有 关 统 毒
计数 据 , 目前 应用 的抗 肿瘤 药 物 对 至少 7 %的患 0
因 组 D A 2 L 超 纯 水 9 5 L 在 N , .2 。
者疗 效 有 限 ,0 0 2 ~4 %患 者甚 至 有 可 能接 受 了错 误 的药物 治疗 ; 据美 国癌症协 会估 计 ,0 以上 的 9% 患者死 于不 同程 度 的肿 瘤 细 胞 耐 药性 , 因此 逆 转 肿瘤 细胞 的耐 药 性 , 高 化 疗 药 物 的敏 感 性 对 癌 提 症 的治 疗 具 有 积 极 意 义 … 。 随着 药 物 基 因组 学 以及 在此基 础 上 发 展 的蛋 白组 学 、 录组 学 等 高 转 通蛋 白和超 高 通 技术 的 出现 , 临床 医师 和 分 子 使 生物学 家很 快 就 找 到 了共 同 的关 注 点 , 即从 个 体 基 因组 中分析 和鉴定 患 者之 间存 在 的疾 病 相关 的 个 体差 异 , 利 用 这 些差 异来 合 理 地 筛 选 药 物指 并 导 临床 治疗 。本 文就 消 化道肿 瘤 患者化 疗 药物基 因组学 基 因型 进行 了分 析 , 以便 对 选 择 化疗 药物 个 性化 治疗 进行 指导 。
肿瘤基因检测的应用前景如何

肿瘤基因检测的应用前景如何在当今的医学领域,肿瘤基因检测正逐渐成为一种重要的诊断和治疗工具。
它为我们深入了解肿瘤的发生、发展机制提供了关键的线索,也为肿瘤的精准治疗开辟了新的途径。
那么,肿瘤基因检测的应用前景究竟如何呢?首先,我们需要了解什么是肿瘤基因检测。
简单来说,肿瘤基因检测就是通过对肿瘤细胞的基因进行分析,来确定肿瘤的类型、基因突变情况以及潜在的治疗靶点。
这种检测技术可以从肿瘤组织、血液或其他体液中获取样本进行分析。
肿瘤基因检测在肿瘤的早期诊断中具有巨大的潜力。
传统的肿瘤诊断方法,如影像学检查和病理活检,往往在肿瘤已经形成较大肿块时才能发现。
而基因检测可以在肿瘤发生的早期,甚至在细胞刚刚发生基因突变时就检测到异常。
例如,对于一些具有遗传倾向的肿瘤,如乳腺癌、卵巢癌等,通过检测特定的基因突变,可以提前预警个体患癌的风险,从而采取相应的预防措施,如加强监测、预防性手术等。
在肿瘤的治疗方面,基因检测更是发挥着至关重要的作用。
通过检测肿瘤细胞中的基因突变,医生可以为患者选择更加精准、有效的治疗方案。
比如,对于非小细胞肺癌患者,如果检测到EGFR 基因突变,就可以使用相应的靶向药物进行治疗,大大提高治疗效果,延长患者的生存期。
此外,基因检测还可以帮助医生预测患者对化疗、放疗等传统治疗方法的敏感性和耐药性,从而优化治疗方案,减少不必要的治疗副作用。
肿瘤基因检测还在肿瘤的预后评估中具有重要意义。
通过分析肿瘤基因的特征,医生可以预测肿瘤的复发风险、转移倾向以及患者的生存预后。
这有助于医生对患者进行更加个性化的随访和治疗干预,提高患者的生存质量。
然而,尽管肿瘤基因检测具有诸多优势,但目前仍面临一些挑战。
技术方面,基因检测的准确性和可靠性还有待进一步提高。
检测过程中可能会出现假阳性或假阴性结果,影响医生的诊断和治疗决策。
此外,基因检测技术的成本相对较高,限制了其在临床中的广泛应用。
伦理和法律问题也是不容忽视的。
胃癌基因检测

药物
铂类药物 (卡铂、 顺铂、奥 沙利铂)
基因
XRCC1
检测位点
rs1799782
检测结果
T/T T/C C/C
结果解读
药物敏感性高 药物敏感性高 药物敏感性低
rs25487
G/G
G/A
药物敏感性高
药物敏感性低
A/A
ERCC1 rs11615 C/C C/T T/T GSTP1 rs1695 G/G G/A A/A ERCC1 mRNA表达水平
胃癌遗传风险评估
Lynch综合征:
• 错配修复基因的主要功能是纠正DNA复制时单个 核苷酸的错误配对,其发生突变引起微卫星不稳 定(microsatellitesinstability,MSI),DNA复制不能 正常进行或遗传信息发生错误传递。 • MLH1、MSH2、MSH6和PMS2是最常见发生突变 的四个错配修复基因。大约70%的Lynch综合征患 者是由MSH2和hMLH1突变所致(NCCN指南建 议进行胃癌筛查),其余30%多由MSH6和PMS2 突变所致。
肿瘤细胞仅有部分膜染色只要有成簇的肿瘤细胞有微勉强可见的膜染色而不管着色肿瘤细胞百分比阴性膜的染色只要有成簇的肿瘤细胞有弱到中等强度的完整膜染色基侧膜染色或侧膜染色而不管着色肿瘤细胞百分比意义不明确染色只要有成簇的肿瘤细胞有强的完整膜染色基侧膜染色或侧膜染色而不管着色肿瘤细胞百分比阳性术前化疗联合放疗时用药原则静脉滴注5fu可用卡培他滨替代fu和顺铂胃癌的化疗d2顺铂13胃癌的化疗术后辅助化疗适用于转移性或局部晚期肿瘤患者不适宜进行手术时曲妥珠单抗化疗用于her2neu过表达的腺癌患者曲妥珠单抗不推荐与蒽环类药物联用fu1类及dcf改良方案fu1类及ecf改良方案胃癌的化疗胃癌的化疗胃癌靶向治疗her2单克隆抗体曲妥珠单抗egfrher1单克隆抗体西妥昔单抗vegfr受体2拮抗剂雷莫芦单抗胃癌的化疗胃癌靶向治疗her2单克隆抗体曲妥珠单抗检测her2基因拷贝egfrher1单克隆抗体西妥昔单抗kras突变定量检测vegf单克隆抗体贝伐单抗vegfmrna表达vegfr受体2拮抗剂雷莫芦单抗vegfr1mrna表达多靶点酪氨酸激酶抑制剂拉帕替尼pi3kca基因突变舒尼替尼vegfr1mrna表达索拉菲尼pdgfrmrna表达胃癌的化疗毒理
基因检测技术对于肿瘤的治疗有非凡的意义

肿瘤分为良性肿瘤和恶性肿瘤两种,而恶性肿瘤就是我们常说的癌症,相信大家对这种疾病都不陌生,近些年来癌症已经成为了影响人类健康的主要杀手之一,但是受制于当前的医疗水平,我们在对抗癌症方面依然没有必胜的把握,精准治疗是未来癌症治疗的大方向,在此基础上加入基因检测,可以称之为医疗史上非凡的进步。
基因检测的意义从基因层面治疗肿瘤,可以确定患者发病的个体化情况,从而提供个体化治疗方案,提高肿瘤诊疗技术的有效性和针对性,进而通过基因诊断复查治疗效果,结合肿瘤发展阶段和临床症状等,准确的选择药物和方法,制定康复治疗方案。
因此可以有效改善患者的生存和预后状况。
此外也可以预测肿瘤高危人群,提高肿瘤预防工作的目标性和有效性。
肿瘤精准治疗的基因检测就好比是一把钥匙开一把锁,基因检测等于是在患者身上找到疾病这把“锁”,然后再配药物这把“钥匙”,而不是用一片一片钥匙去套开这把锁。
做到有的放矢,为肿瘤病人“量体裁衣”“有的放矢”,少走弯路。
提高治疗水平,减轻治疗过程中的副作用,避免和削减不适当的治疗方案产生的浪费。
基因检测适用范围广泛现在肿瘤基因检测主要针对一些实体瘤,如肺癌、乳腺癌、胃癌、食管癌、结直肠癌、肝癌、胆管胆囊癌、胰腺癌、胃肠道间质瘤、头颈部癌、宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌、前列腺癌、膀胱癌、肾癌、黑色素瘤等。
基因检测的特点1、多基因并行检测,肿瘤疗效基因全扫描。
一份样本,一次检测,检测所有肿瘤靶向和化疗药物相关基因状态。
2、多类型试供样本,检测服务流程高效率。
手术组织、穿刺组织、石蜡包埋组织、胸水、血液样本均可检测,5—7个工作日出具检测报告。
3、新一代测序平台,基因变异类型广覆盖。
新一代测序平抬,一次性全面评估基因突变、插入缺失、融合、扩增等多种变异情况。
4、性价比高。
一次收费,可获得多基因多点位检测结果,附带详细个体化治疗信息解读,经济节约,性价比高。
融入了基因检测的肿瘤精准治疗技术,是人类未来战胜恶性肿瘤的希望所在。
肿瘤基因检测收费标准

肿瘤基因检测收费标准肿瘤基因检测是一种通过分析肿瘤细胞中的基因变异来指导肿瘤治疗的精准医学技术。
随着基因检测技术的不断发展,肿瘤基因检测的应用范围越来越广泛,对于肿瘤患者的治疗和管理起着越来越重要的作用。
在进行肿瘤基因检测时,患者和医生都会关心检测的费用标准,了解肿瘤基因检测的收费标准对于患者选择合适的检测项目和医院具有重要意义。
肿瘤基因检测的收费标准主要受到以下几个因素的影响:1. 检测项目,不同的肿瘤基因检测项目所涉及的基因数目、技术难度、耗材费用等都会对检测费用产生影响。
一般来说,涉及的基因数目越多、技术难度越大的检测项目费用也会相应增加。
2. 检测技术,肿瘤基因检测涉及的技术包括基因测序、基因芯片、PCR等,不同的检测技术在设备、耗材、人力成本等方面都存在差异,这也会直接影响到检测的收费标准。
3. 检测机构,不同的医疗机构、实验室对于肿瘤基因检测的收费标准也会有所不同。
一般来说,大型综合性医院的检测费用可能会相对较高,而一些专业的基因检测机构可能在价格上会更有竞争力。
在了解了影响肿瘤基因检测收费标准的因素之后,我们可以大致了解一下目前肿瘤基因检测的收费情况。
一般来说,目前肿瘤基因检测的收费标准在几千到数万元不等,具体费用取决于上述因素的综合影响。
对于患者来说,选择合适的肿瘤基因检测项目和机构也是非常重要的。
在选择检测项目时,患者需要根据自身的病情和治疗需求,结合医生的建议进行选择。
在选择检测机构时,除了价格因素外,还需要考虑机构的技术水平、服务质量、检测周期等因素,综合考虑选择最适合自己的机构。
总的来说,肿瘤基因检测的收费标准受到多方面因素的影响,患者在进行肿瘤基因检测时需要全面了解相关信息,谨慎选择检测项目和机构,以便为自己的治疗和管理提供更好的支持。
希望本文能够为患者和医生在肿瘤基因检测方面提供一些帮助。
肿瘤基因检测

EGFR
ALK
ROS1
B-RAF
PD-L1
NCCN指南
EGFR是肺癌靶向治疗成功的关键
Gefitinib EGFR M+ (n=132) Gefitinib EGFR M- (n=91) Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129) Carboplatin / paclitaxel EGFR M(n=85)
蛋白水平(过表达): 细胞表面HER2蛋白受体表达大量增加 基因水平(扩增): HER2编码基因于细胞核内拷贝增加
IHC
FISH
HER-2阳性危害
1、对早期乳腺癌预后不利:
2、降低乳腺癌转移/复发患者的存活率:
HER-2阳性与靶向治疗
100 80
HER2阳性, 曲妥珠单抗 (n=191) HER2阴性 (n=1782) HER2阳性, 无曲妥珠单抗 (n=118)
存活率 (%)
60 40 20
0 0
12
24
36
48
60
确诊后时间 (月)
一项回顾性研究数据显示,与HER2阴性乳腺癌相比,HER2阳性乳腺 癌患者接受曲妥珠单抗治疗后的死亡率下降44%
Dawood S et al. J Clin Oncol 2010;28:92–98.
HER-2阳性
1、含蒽环类药物耐药:
低复发风险者(RS<18) 从化疗中的获益极微
3、胃/食管癌个性化用药基因检测
HER-2
NCCN指南-胃癌
NCCN指南-食管癌
HER-2阳性判断
4、结直肠癌个性化用药基因检测MMR/MSI来自RASB-RAF
NCCN指南
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0
1+
பைடு நூலகம்2+
3+
FISH
–+
可接受赫赛汀治疗
评分系统基于: Hofmann M, et al. Histopathology 2008; 52:797–805.
标本收集
• 标本来源:手术或活检标本可用于HER2检测
标本初步处理 • 立即 (20–30分钟内)进行标本标记、切开、固
定 • 避开出血和坏死组织
生长因子(配体)
细胞膜 细胞浆
信号传导 至细胞核
接合部
酪氨酸激酶 活性部分
细胞核
促进细胞分裂、增殖
HER2过度表达:正常状态的10-100倍
细胞质
正常
C
扩增/过度表达
3
B
A
细胞膜
A = HER2 DNA B = HER2 mRNA C = HER2 receptor protein
细胞核
2 1
4
1 = 基因拷贝数 2 = mRNA 转录 3 = 细胞表面受体蛋白表达 4 = 细胞外受体功能域释放
体征:上腹部深压痛、肿块、左锁骨上淋巴结肿大
胃癌病理表现
早期胃癌 • 概念:局限于粘膜或粘膜下层,不论其有无淋巴
结转移 • 肉眼分型:表浅型、隆起型、凹陷型 进展期胃癌 • 概念:癌组织浸润到粘膜下层以下者 • 肉眼分型:隆起型、溃疡型、浸润型 组织学类型:腺癌(管状-、乳头状-、粘液-等)
胃癌治疗
胃肠肿瘤基因 检测
内容提要
胃癌与HER2检测 结直肠癌与EGFR、KRAS检测 胃肠间质瘤与C-KIT检测
胃癌与HER2检测
胃癌概述
胃癌是消化系统最常见的恶性肿瘤,全世界恶性肿瘤的病 死率中胃癌居第二位
年龄:40-60岁;性别:男女比例约为3:1 临床表现:
症状:上腹隐痛、腹胀、食欲不振、恶心呕吐、呕血 与黑便、贫血、体重下降
差密切相关;因此对于胃癌病人都要检测HER2 赫赛汀是一种针对HER2阳性的胃癌患者新的靶向
药物。准确的HER2 检测对判断胃癌患者接受赫赛 汀治疗是否有效至关重要
胃癌HER2 检测流程
• 关键步骤包括
标本收集 固定 石蜡包埋 切片 脱蜡 IHC / FISH 检测
胃癌HER2 检测流程
肿瘤标本
石蜡包埋
• 标本用梯度乙醇/二甲苯脱水,石蜡包埋 • 避免标本长时间置于融化的石蜡中,因为高温会减少抗
原表位 • 切片前,石蜡包埋标本可长期存放
– 用新鲜的石蜡 – 石蜡包埋标本最小 1 cm2 – 以利于切片
切片和脱蜡
切片 • 理想的切片应该在进行HER2检测前的短时间内立即进行 • 切片应该在肿瘤最有代表性的部位进行,且应该有HE染
手术治疗仍然是根治胃癌的最有效方法,然而, 仅有30-40%患者可能通过单纯的手术治疗而获得治愈 大部分患者死于肿瘤的再发或远处转移
寻求手术以外的途径治疗胃癌、预防其复发转移成为胃癌 综合治疗的重点和热点
晚期胃癌急需有效的治疗措施 研究显示HER2阳性胃癌患者使用靶向药物赫赛汀有效
染色细胞克隆
FISH技术介绍
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五步完成实验操作
样本预处理 探针、样本变性 探针+样本杂交
杂交后洗涤 结果观察
观察荧光信号在染色体上的位置及数量可反映相应染色体的情况
胃腺癌HER2检测可见不完全细胞膜染色
胃癌的HER2 评分标准
IHC 阴性 (0) 不染色或 <10% 的细胞膜染色
IHC阴性 (1+) >10% 的细胞膜淡染/勉强可见染色;或仅有部分膜染色
IHC 可疑 (2+) >10%的细胞轻到中度完整细胞膜或基侧细胞膜染色
IHC 阳性 (3+) 完整细胞膜或基侧细胞膜强染色,且具有如下两种情况之一 • 切除标本中,染色细胞比例>10% • 活检标本中,不管染色细胞比例多少(如<10%),具有聚集的强
HER2基因的致瘤机制:
抑制凋亡,促进增殖; 增加肿瘤细胞的侵袭力; 促进肿瘤血管新生和淋巴管新生。
研究表明: 30%以上的人类肿瘤中存在HER2基因的扩增/ 过度表达(如乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜 癌、输卵管癌、胃癌和前列腺癌等
HER2在胃癌中表现
大约16% 的进展期胃癌患者 HER2检测呈阳性 胃癌组织的HER2过表达与肿瘤侵犯程度高和预后
色证实 • 切片厚度可能影响结果的解读,保证切片厚度为2–4 μm • 将切片置于玻片上,放置于室温下 12–24 h 或 60°C 1 h
干燥
脱蜡 • 标本用二甲苯脱蜡、梯度乙醇水化 • 确保脱蜡完全,残余石蜡会增加非特异性染色
免疫组化技术
• 概念:用标记的特异性抗体对组织切片标本中某 种化学成分的分布和含量进行组织原位定性、定 位或定量研究。
• 基本原理——抗原抗体反应,即抗原与抗体特异 性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色 剂(荧光素、酶、金属离子、同位素)显色来确 定组织内抗原,对其进行定位、定性及定量的检 测
免疫组化步骤
• 对组织切片进行预处理 • 抗原修复:微波修复、热修复等 • 阻断内源性过氧化物酶:H2O2去离子水 • 滴加一抗 • 滴加二抗 • 应用DAB溶液显色、封片 • 结果观察
标本固定
• 标本固定不合格是HER2检测结果错误最常见的原因 • 在最快的时间内固定标本(20分钟内) • 固定时间
–手术标本: 6–48 h (至少 1 h/mm组织) –活检标本: 不长于 24 h (至少 1 h/mm组织) • 固定液种类 –10% 中性福尔马林
• 新配制的福尔马林 (定期更新) –其他试剂必须经过验证,以保证结果可靠 –非福尔马林制剂可能会妨碍IHC和FISH检测的可靠性
HER2
HER:human epidermal growth factor receptor,人类表皮 生长因子受体
HER2,又名c-erbB-2;原癌基因,位于17q21,编码跨 膜糖蛋白,具有跨膜酪氨酸激酶活性;
通过参与信号传道通路的一系列活动影响细胞的增殖与 分化。
HER2 受体跨膜二聚体的信号传导途径
胃癌组织中Her2表达具异质性
印戒细胞型
无扩增
肠型
高度扩增
FISH技术的特点