图像分析基本原理及分析过程

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遥感图像分析的基本原理与方法

遥感图像分析的基本原理与方法

遥感图像分析的基本原理与方法遥感图像分析是一种通过获取和解释地球表面的图像数据来研究地理现象和环境变化的方法。

它利用遥感技术获取的图像数据进行数据处理和分析,以揭示地球的表面特征、变化和趋势。

本文将介绍遥感图像分析的基本原理和方法,并探讨其在地质、环境和农业等领域的应用。

一、遥感图像分析的基本原理遥感图像分析依赖于传感器获取的电磁辐射数据。

电磁辐射是能量在电磁波形式下传播的过程,其波长范围从长波到短波,包括可见光、红外线和微波等。

传感器可以通过不同波段的响应来获取不同的辐射数据,从而得到不同频谱范围内的图像数据。

在遥感图像中,每个像素代表一块地表区域的平均辐射量。

图像数据可以由数字矩阵表示,其中每个像素的灰度值或颜色值表示该区域的辐射强度或反射率。

通过对这些数据进行处理和分析,可以获得地表特征的信息。

二、遥感图像分析的方法1. 预处理遥感图像预处理是为了去除图像中的噪声、增强特征和调整图像的对比度等。

常见的预处理步骤包括去噪、辐射校正、大气校正和几何校正等。

这些步骤可以提高图像质量并准确反映地表特征。

2. 特征提取特征提取是指从遥感图像中提取有用的地物信息。

可以根据图像的灰度、色彩、纹理和形状等特征来区分不同的地物类型。

常用的特征提取方法包括直方图均衡化、主成分分析、变化检测和物体识别等。

3. 分类与识别遥感图像分类是将图像中的像素按照其地物类型划分为不同的类别。

分类可以基于监督或无监督方法进行。

其中,监督分类依赖于训练样本和分类器,而无监督分类则是通过数据的统计分布和聚类分析进行分类。

4. 变化检测变化检测是利用多期遥感图像比较分析同一地区在不同时间的变化情况。

通过对像素之间的差异进行检测和分析,可以揭示地表的变化趋势和时空模式。

变化检测在环境监测、城市规划和资源管理等领域具有重要应用价值。

三、遥感图像分析的应用1. 地质勘探遥感图像分析可以帮助地质学家在不同尺度上研究地球表面的地质结构和岩矿成分。

遥感图像分析

遥感图像分析

遥感图像分析遥感图像分析是利用遥感技术对获取的遥感图像进行解译和处理,以获取地表信息和探索地理现象的一种方法。

本文将介绍遥感图像分析的基本原理、常用的分析方法以及其在各个领域的应用。

一、遥感图像分析的基本原理遥感图像是通过遥感卫星或飞机等平台获取地球表面信息的图像,利用其进行分析可以揭示出地表的空间分布、变化规律及与地理现象的联系。

遥感图像主要包括光学遥感图像和微波遥感图像两种类型,其中光学遥感图像主要利用反射特性获取地表信息,而微波遥感图像则是通过电磁波的散射和回波等特性获取地表信息。

二、遥感图像分析的常用方法1. 图像预处理:遥感图像预处理是为了提取有效的地表信息,常用的预处理方法包括辐射定标、大气校正、几何校正等。

通过这些预处理方法,可以降低图像中的噪声,使图像更加清晰,有利于后续的分析工作。

2. 特征提取:特征提取是遥感图像分析的核心步骤,它是将图像转化为可供分析和解释的信息的过程。

常用的特征提取方法包括光谱特征提取、纹理特征提取、形状特征提取等。

通过提取图像的各种特征,可以获得地表的物理和几何信息。

3. 分类分类是遥感图像分析的重要任务,它是将图像中的像素划分为不同的类别。

常见的分类方法包括有监督分类、无监督分类和半监督分类等。

分类结果可以用来监测地表的变化,研究地表的演化过程以及评估地表的植被覆盖程度等。

4. 变化检测:变化检测是遥感图像分析的一项重要任务,它通过对多期遥感图像进行比较,来识别出地表变化的位置和程度。

常见的变化检测方法包括基于像元的变化检测和基于物体的变化检测等。

变化检测可以应用于城市规划、农田利用变化分析等领域。

三、遥感图像分析的应用1. 农业:遥感图像可以提供农作物的生长状态、土壤湿度、植被覆盖度等信息,帮助农民合理安排农作物的种植和施肥。

2. 环境监测:通过遥感图像分析,可以监测海洋和河流水质、大气污染、森林覆盖变化等环境问题,为环境保护和资源管理提供数据支持。

医学图像处理技术的基本原理与应用

医学图像处理技术的基本原理与应用

医学图像处理技术的基本原理与应用随着科技的不断进步,医学图像处理技术在医疗领域的应用越来越广泛。

这项技术通过对医学图像的处理和分析,可以帮助医生更准确地诊断和治疗疾病。

本文将介绍医学图像处理技术的基本原理和一些常见的应用。

首先,让我们了解一下医学图像处理技术的基本原理。

医学图像处理技术主要包括图像获取、预处理、特征提取和图像分析等步骤。

图像获取是指通过医学设备如X射线、CT扫描、MRI等获取患者的医学图像。

预处理是对原始图像进行去噪、增强、几何校正等处理,以提高图像的质量和准确性。

特征提取是指从预处理后的图像中提取出有用的特征,如病变区域的形状、纹理、颜色等信息。

图像分析是对提取的特征进行分析和解释,以帮助医生做出准确的诊断和治疗决策。

医学图像处理技术的应用非常广泛。

其中,最常见的应用之一是肿瘤检测和诊断。

通过对肿瘤图像的处理和分析,医生可以确定肿瘤的位置、大小和类型,从而制定出最合适的治疗方案。

此外,医学图像处理技术还可以用于心脏病的诊断和治疗。

通过对心脏图像的处理和分析,医生可以评估心脏的功能和结构,检测心脏病变,并制定出相应的治疗方案。

除了肿瘤和心脏病的诊断,医学图像处理技术还可以在其他疾病的诊断和治疗中发挥重要作用。

例如,在神经科学领域,医学图像处理技术可以用于脑部图像的分析,帮助医生确定脑部病变的位置和程度,并指导手术治疗。

在骨科领域,医学图像处理技术可以用于骨折的诊断和治疗,通过对骨骼图像的处理和分析,医生可以确定骨折的类型和位置,制定出最佳的治疗方案。

此外,医学图像处理技术还可以应用于医学研究和教育。

在医学研究中,医学图像处理技术可以帮助研究人员分析大量的医学图像数据,发现疾病的新特征和治疗方法。

在医学教育中,医学图像处理技术可以用于教学演示和培训,帮助学生更好地理解和掌握医学知识。

尽管医学图像处理技术在医疗领域的应用已取得了显著的进展,但仍然存在一些挑战和问题。

首先,医学图像处理技术需要大量的计算资源和专业知识,这对医疗机构和医生的要求较高。

图像分析基本原理及分析过程

图像分析基本原理及分析过程

图像分析基本原理及分析过程概述在生物及医学研究中,对图像的判读与分析特别是对显微镜下微观图像的观察研究从来都是重要的研究手段。

随着技术的进步,分析图像的方法也从眼观尺量进入到了使用计算机软件进行定量分析的阶段。

计算机软件的发展速度呈加速前进,采集图像的设备也不断更新,这使得我们能有更多的手段来分析测量复杂的生物图像。

现在我们可以使用CCD数码相机来采集图像。

使用功能比较强大的图像分析软件来进行图像分析测量。

相比之下,在不太久远的十来年前使用的图像分析仪及单色的图像采集摄像机已经过时了。

而图像分析的手段也比以前丰富。

简单地引用以前的分析方法未必就是最佳的方法,在许多情况下,需要我们依据软件及相机的情况设计与研究目标相适应的分析方法。

分析测量图像绝不仅仅是一个软件使用的问题,而是从实验设计开始,就要综合考虑研究目标、样品制作方法、拍摄方式、选择视野等各方面因素,最后才是通过软件实现最有效的图像分析测量。

一个完整的图像分析过程应该包括:1.明确需要测量分析的对象。

2.使用适当的方法拍摄下这个对象,包括进行适当的染色及取样,采集到突出显示的测量对象的照片。

3.分析照片上的图像元素,确定能反映测量对象的图像图形4.测量照片上的图形的测量参数,进而得到测量对象的测量数据5.对测量对象进行统计分析。

图像分析的最佳效果,是利用图像分析软件可以自动地判断测量目标,准确分析测量出目标对象的数值。

由于生物图像的复杂性,软件往往作不到这一点。

此时只能退而求其次,采取抽样统计,手工选择等方法进行近似的测量。

测量方法本身有时候也能成为一个研究课题。

一、把研究目标转换到图像分析问题上。

在丁香园混了好几年了,虽然很喜欢与大家讨论图像分析的问题,但是却经常对一些求助视而不见,例如:请问用IPP怎么分析双染的结果?谢谢!最近正要测肾小球面积以及球内PAS染色阳性面积(粉紫色),不会操作,希望各位老师及同仁多多指教,非常感谢!传张片子上来,请指导一下哦!免疫荧光定量分析选什么软件好?是IPP吗?这个软件可以做杂交结果的分析吗?具体如下:杂交后获得阳性结果和阴性对照的结果,如何分析结果呢?下面是阳性和阴性的图。

了解图像识别和处理的基本原理和算法

了解图像识别和处理的基本原理和算法

了解图像识别和处理的基本原理和算法图像识别和处理是计算机视觉领域的重要研究方向,它涉及到对图像进行分析、理解和处理的技术和方法。

本文将介绍图像识别和处理的基本原理和算法。

一、图像识别的基本原理图像识别是指通过计算机对图像进行分析和理解,从而识别出图像中的对象、场景等信息。

其基本原理包括以下几个方面:1. 特征提取:特征是图像中的一些具有代表性的属性或者模式,通过提取这些特征可以描述图像的内容。

常用的特征包括颜色、纹理、形状等。

特征提取可以通过局部特征描述子(如SIFT、SURF等)或者深度学习模型(如卷积神经网络)来实现。

2. 特征匹配:将待识别图像的特征与已知图像库中的特征进行匹配,找出最相似的图像。

匹配算法可以使用最近邻算法、支持向量机等。

3. 分类器训练:通过使用已标注的图像数据集来训练分类器,使其能够自动学习图像的特征和类别之间的关系。

常用的分类器包括支持向量机、随机森林、深度学习模型等。

二、图像处理的基本原理图像处理是指对图像进行各种操作和变换,以改善图像的质量、增强图像的特征或者提取图像中的有用信息。

其基本原理包括以下几个方面:1. 图像增强:通过对图像的亮度、对比度、颜色等进行调整,使图像更加清晰、鲜艳。

常用的图像增强方法包括直方图均衡化、对比度拉伸等。

2. 图像滤波:通过对图像进行滤波操作,去除噪声、平滑图像或者增强图像的边缘等。

常用的图像滤波器包括均值滤波器、中值滤波器、高斯滤波器等。

3. 图像分割:将图像分成若干个不同的区域或者对象,以便进一步分析和处理。

常用的图像分割方法包括阈值分割、边缘检测等。

4. 特征提取:提取图像中的特征以描述图像的内容。

常用的特征包括边缘、纹理、形状等。

特征提取可以通过使用滤波器、边缘检测算法等实现。

三、图像识别和处理的常见算法在图像识别和处理领域,有许多经典的算法被广泛应用。

以下是其中一些常见的算法:1. SIFT算法:尺度不变特征转换(Scale-Invariant Feature Transform,SIFT)是一种用于图像特征提取和匹配的算法。

如何进行遥感图像解译与分析

如何进行遥感图像解译与分析

如何进行遥感图像解译与分析遥感图像解译与分析是一门利用遥感数据进行地表特征提取和地物分类的技术。

遥感图像提供了我们观测和分析地球表面的有力工具,可以帮助我们更好地了解地球上的各种自然和人为现象。

本文将介绍遥感图像解译与分析的基本原理和方法,并探讨其在各个领域中的应用。

一、遥感图像解译与分析的基本原理与方法遥感图像解译与分析主要通过分析遥感图像上的特定信息,如亮度、色彩和纹理等,来提取地物的空间分布和特征。

首先,我们需要对图像进行预处理,对噪声进行滤除和图像增强,以提高图像的质量和可解释性。

然后,我们可以利用不同的算法和技术,如分类和目标检测,来对图像的各个地物进行划分和识别。

最后,我们可以通过图像的统计分析和空间分布模式,来获取地物的数量、分布和变化趋势等信息。

在遥感图像解译与分析中,常用的方法包括基于像元的分类、基于物体的分类和基于深度学习的分类。

基于像元的分类方法是最常用的一种,它通过分析每个像元的亮度、颜色和纹理等特征,将其划分到不同的地物类别中。

基于物体的分类方法则根据物体的形状、大小和背景等特征,来进行划分和识别。

而基于深度学习的分类方法则是利用神经网络算法,通过训练一个深度学习模型,来进行图像的分类和识别。

二、遥感图像解译与分析的应用领域遥感图像解译与分析广泛应用于各个领域,包括农业、林业、城市规划和环境保护等。

在农业领域,我们可以利用遥感图像来监测农田的植被覆盖状况和土壤湿度等信息,以便科学种植和管理农作物。

在林业领域,我们可以通过分析遥感图像来评估森林的生长状况和植被类型,以便制定合理的森林管理策略。

在城市规划中,遥感图像可以提供城市土地利用和建筑物分布等信息,从而帮助规划者做出科学决策。

在环境保护方面,我们可以利用遥感图像来监测污染物的排放和土地退化等现象,以便采取相应的措施保护环境。

三、遥感图像解译与分析的挑战与前景尽管遥感图像解译与分析在各个领域中都有着广泛的应用,但仍然存在一些挑战和难题。

遥感图像解译二案:遥感图像解译的基本原理与方法

遥感图像解译是利用遥感技术获取的卫星、空遥感图像数据,进行目标、地貌、植被等地物信息的分类、提取和分析的过程。

它已经成为现代地质、地理、环境和农业等领域中不可或缺的技术手段。

在工程建设、资源管理和环境保护等方面,都具有不可替代的作用。

遥感图像解译的基本原理遥感图像解译需要依赖遥感技术采集的图像数据。

遥感图像数据一般包括光学图像和雷达图像。

光学图像是通过接收地物反射或辐射的能量采集的图像。

它的频谱范围一般包括可见光、红外线和紫外线等波段。

雷达图像则是通过接收地物反射或散射的雷达波信号采集的图像。

它的频谱范围主要在微波段。

在遥感图像解译中,需要通过对不同波段的图像数据进行处理和分析,以达到目标、地貌、植被等地物信息的分类、提取和分析等目的。

因此,了解不同波段的地物反射和散射特性是遥感图像解译的基本原理。

遥感图像解译的方法遥感图像解译的方法可以分为人工解译和计算机自动解译两种。

人工解译是指通过观察和分析遥感图像,利用人类的经验和知识来进行判断、分类和提取等操作的一种解译方法。

计算机自动解译则是指利用计算机程序和算法来实现遥感图像的分类、目标检测和特征提取等操作的一种解译方法。

人工解译的基本流程包括:影像预处理、目标提取、图像分类、图像后处理等步骤。

其中,影像预处理主要包括对图像进行去噪、增强、几何校正和辐射定标等操作;目标提取则是指对图像中的目标进行检测和分割操作;图像分类则是指按照特定的标准对目标进行分类和识别;图像后处理则是指对分类结果进行精细化处理和分析。

计算机自动解译则是利用计算机程序和算法来进行遥感图像解译。

其中,监督分类法是常见的自动分类方法之一。

监督分类法是指利用已知分类样本和特征向量等信息,来训练计算机程序,然后对整幅遥感图像进行分类的一种方法。

一般情况下,监督分类法需要进行数据选择、特征提取、模型训练和分类等步骤。

除了监督分类法外,还有无监督分类法、神经网络法、模糊聚类法和支持向量机法等自动解译方法。

医学影像分析

医学影像分析医学影像分析是指通过使用各种影像学技术和方法来观察、评估和解释医学图像,并为医学诊断和治疗过程提供有价值的信息。

随着医学技术的发展和进步,医学影像分析在现代医学领域中发挥着越来越重要的作用。

本文将介绍医学影像分析的基本原理、应用及其未来的发展方向。

一、医学影像分析的基本原理医学影像分析是基于对医学影像进行图像处理和分析的方法。

它的基本原理是通过对影像进行数字化处理和分析,提取出有用的信息以辅助医生进行诊断和治疗决策。

常见的医学影像包括X光片、CT扫描、磁共振成像(MRI)和超声波等。

二、医学影像分析的应用1. 医学诊断医学影像分析在疾病的诊断中发挥着至关重要的作用。

通过对患者的影像进行分析,医生可以获取关于病变类型、病变大小、病变位置和病变进展的信息。

这些信息对于制定准确的诊断和选择合适的治疗方案非常关键。

2. 病理分析医学影像分析还广泛应用于病理分析领域。

通过对病理切片等影像进行分析,可以帮助医生定量分析组织结构、癌症分级和预后等因素,从而指导治疗方案的选择。

3. 医学研究医学影像分析在科学研究中也扮演着重要角色。

研究人员可以利用医学影像数据来开展疾病统计学分析、基因关联分析和药物疗效评估等工作,为科学研究提供有力的支持。

三、医学影像分析的发展方向1. 人工智能技术的应用随着人工智能技术的迅速发展,医学影像分析领域也开始采用机器学习和深度学习等技术。

通过训练模型识别和分析医学影像,可以大大提高影像分析的准确性和效率。

2. 多模态医学影像分析多模态医学影像分析是指利用不同类型的医学影像数据进行联合分析。

例如,结合X光片和CT扫描影像,可以提供更加全面和准确的信息,有助于医生做出更为精确的诊断。

3. 数据共享与合作医学影像分析需要大量的数据支持。

未来,医学影像分析领域需要加强数据共享与合作,建立起大规模的医学影像数据库,以更好地支持医生的诊断和治疗工作。

结语医学影像分析作为现代医学的重要组成部分,对于临床诊断和治疗具有重要意义。

遥感图像目视解译原理及基础

遥感图像目视解译原理及基础遥感图像目视解译是利用遥感技术获取的图像数据进行目视解读和分析的过程。

本文将介绍遥感图像目视解译的基本原理和方法,并探讨在遥感图像解译中常用的技术和工具。

1. 遥感图像目视解译的定义遥感图像目视解译是通过直接观察遥感图像,并根据空间信息、光谱信息和形态信息等特征,对图像中的地物进行识别、分类和解读的过程。

目视解译是一种常用的遥感图像解译方法,可帮助研究人员获取目标地物的信息,了解地表覆盖的特征和变化情况。

2. 遥感图像目视解译的原理遥感图像目视解译的原理基于遥感图像中地物的光谱反射特征和空间分布特征。

在目视解译过程中,通过观察图像的色调、亮度、纹理和形状等特征,可以对地物进行分类和识别。

在不同波段的遥感图像中,地物的反射特性通常会有所不同,因此通过多光谱图像的综合分析,可以更准确地进行目视解译。

3. 遥感图像目视解译的基础方法遥感图像目视解译的基础方法包括以下几个步骤:3.1. 图像预处理在进行目视解译之前,通常需要对遥感图像进行预处理,包括图像配准、辐射校正和大气校正等,以确保图像数据的准确性和一致性。

3.2. 地物分类目视解译的核心是对图像中的地物进行分类和识别。

通过观察地物的形状、大小、分布等特征,可以将地物分为不同的类别,并生成矢量或栅格数据。

3.3. 地物解译地物解译是指将图像中的地物与地物类别进行对应,并提取出地物的属性信息,如面积、形状、位置等。

地物解译通常需要结合地面调查和其他数据进行验证和修正。

3.4. 结果分析完成地物解译后,可以对解译结果进行分析和评估,了解地表覆盖的特征和变化情况,并提取出地物的信息,如土地利用、植被覆盖等。

4. 遥感图像目视解译的应用遥感图像目视解译在土地利用规划、资源调查、环境监测等领域有着广泛的应用。

通过遥感图像目视解译,可以及时获取地表覆盖的信息,监测自然灾害、城市化进程等现象,并为相关决策提供支持。

5. 结论遥感图像目视解译是利用遥感图像进行地物识别和解读的重要方法,具有广泛的应用前景。

临床病理学:体视学和图像分析

❖ 将整个视野的灰度作为样本集,计算它 的标准差。
(3)光密度
❖ 细胞的密度参数是利用摄像机输入细胞 图像信息的光电转换原理,将细胞在同 一光源下吸收或透过光的数值作为光密 度(也称吸光度)。
在同一照明度下,不同组织成份透过 光线的数值,是由灰度值换算而来。 测量目标颜色越深,透过的光线越少, 光密度就越大。
Society for Stereology,ISS) 1963年4月在维也纳召开了首次大型国
际体视学学术会议(First International Congress for Stereology) 2011年10月,第十三届国际体视学会议 在北京清华大学召开
体视学的诞生和发展
1985年3月在北京成立了由23位委员组成 的中国体视学学会筹委会
❖ X轴投影与Y轴投影之比(X轴/Y轴)。
几何参数
(11)等效宽度(Equivalence width) (12)等效长度(Equivalence length)
❖ 物体的边界以3度左右的增量旋转90°, 每次旋转一个增量后,用一个水平放置 的最小外接矩形来拟合其边界。在某一 个角度最小外接矩形的面积达到最小值。 这时最小外接矩形的尺寸可以用来表示 该物体的长度和宽度。
❖ 积分光密度为整个视野中每一点的光密 度的叠加。
积分光密度:整个视野中每一点的光密度的叠加
目标积分光密度=目标平均光密度× 目标面积;
❖ 目标颜色越深,面积越大,积分光密度 值就越大。在实际工作中我们可以用目 标积分光密度来表示组织中某种成份的 总含量。
3、场参数 (1)参考面积(Reference area)
❖ 视野 ❖ 在视野中选定一个区域的面积。
(2)总数目(Total number)
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图像分析基本原理及分析过程概述在生物及医学研究中,对图像的判读与分析特别是对显微镜下微观图像的观察研究从来都是重要的研究手段。

随着技术的进步,分析图像的方法也从眼观尺量进入到了使用计算机软件进行定量分析的阶段。

计算机软件的发展速度呈加速前进,采集图像的设备也不断更新,这使得我们能有更多的手段来分析测量复杂的生物图像。

现在我们可以使用CCD数码相机来采集图像。

使用功能比较强大的图像分析软件来进行图像分析测量。

相比之下,在不太久远的十来年前使用的图像分析仪及单色的图像采集摄像机已经过时了。

而图像分析的手段也比以前丰富。

简单地引用以前的分析方法未必就是最佳的方法,在许多情况下,需要我们依据软件及相机的情况设计与研究目标相适应的分析方法。

分析测量图像绝不仅仅是一个软件使用的问题,而是从实验设计开始,就要综合考虑研究目标、样品制作方法、拍摄方式、选择视野等各方面因素,最后才是通过软件实现最有效的图像分析测量。

一个完整的图像分析过程应该包括:1.明确需要测量分析的对象。

2.使用适当的方法拍摄下这个对象,包括进行适当的染色及取样,采集到突出显示的测量对象的照片。

3.分析照片上的图像元素,确定能反映测量对象的图像图形4.测量照片上的图形的测量参数,进而得到测量对象的测量数据5.对测量对象进行统计分析。

图像分析的最佳效果,是利用图像分析软件可以自动地判断测量目标,准确分析测量出目标对象的数值。

由于生物图像的复杂性,软件往往作不到这一点。

此时只能退而求其次,采取抽样统计,手工选择等方法进行近似的测量。

测量方法本身有时候也能成为一个研究课题。

一、把研究目标转换到图像分析问题上。

在丁香园混了好几年了,虽然很喜欢与大家讨论图像分析的问题,但是却经常对一些求助视而不见,例如:请问用IPP怎么分析双染的结果?谢谢!最近正要测肾小球面积以及球内PAS染色阳性面积(粉紫色),不会操作,希望各位老师及同仁多多指教,非常感谢!传张片子上来,请指导一下哦!免疫荧光定量分析选什么软件好?是IPP吗?这个软件可以做杂交结果的分析吗?具体如下:杂交后获得阳性结果和阴性对照的结果,如何分析结果呢?下面是阳性和阴性的图。

谢谢您的解答。

我做的是脐静脉内皮细胞管道形成实验,需要计算整张图片上内皮细胞管道的数目以及管道的总长度,这个怎么用IPP计算啊?希望能够提供详细步骤(附有图片)。

谢谢我们在对免疫组化照片的阳性区域,进行最后的的统计学分析时,用的应该是哪个参数呢?-------------------------------------------上面这些提问我是没法回答的,除非是正好作过相关的研究,知道其来龙去脉。

否则即使有图片提交,也看不出哪里是肾小球内PAS,哪里是管道。

不知道需要分析的对象在哪里,当然也就不会作了。

所以一个完整的图像分析过程应当是前面所述的五条,其中最重要的却不在图像分析上,而在于确定所要分析的目标以及如何把这个研究目的转换成图像分析的问题。

这是图像分析的关键之处。

当然,如果是常用的分析测量,是已经有比较成熟的方法的,以免疫组化样品为例:免疫组化的分析对象(分析测量的目标)是组织切片上特定蛋白的表达量。

为了达到这个测量目标,先用特定抗体与切片反应,使之与切片上的特定蛋白结合,然后用DAB对结合了蛋白的抗体进行染色。

这样,DAB的染色深浅及范围就能反应切片上相应蛋白的表达量了。

所以免疫组化技术就是把切片上“蛋白表达量”这个研究目标转换成了切片上“黄色染色物的分布”这个图像分析问题。

荧光标记的免疫组化图片与此类似。

另一个例子:利用凝胶电泳方法来测量RT-PCR产物的分子量及质量(重量),研究目标是样品中各种DNA 片段的分子量与质量。

通过电泳把加样孔中的样品分布到泳道之中后,不同分子量的产物成份会分布到泳道的不同位置,形成条带。

用EB染色后,在紫外灯照射下各条带发出荧光,就能显示出条带的位置与强度信息。

这样就把研究目标(产物的各组分分子量与该组分的量重)转换成了凝胶图像上的条带的位置与光密度这个图像分析问题。

具体到前面提到的那些没法回答的问题,实际上就是提问的信息不够,没法确定如何把研究目标转换为图像分析问题。

当然,这类分析方法往往是从文献上查找到的,是已经有的分析方法,这时候就要仔细学习参考文献上相关的叙述,弄明白文献上的方法是把分析目标转换成什么样的图像分析目标。

明确了这一点后,才能考虑如何通过图像分析软件实现正确的测量。

甚至进一步改进测量方法。

二、正确地处理样品并进行拍摄。

处理样品主要是指对切片作正确的染色。

虽然染色的方法基本上有一个规范的程序,但进行图像分析的时候,根据分析目标对染色方法作适当的优化能让分析测量更加方便准确。

在免疫组化切片染色时,由于要分析比较染色深浅,所以在制片时就要强调以同样条件制作所有的组织切片。

曾经遇到一位,在染色时,遇到阴性样品就有意延长一下显色时间,让片子黄一点,结果是阴性结果的光密度测量数值与阳性样品一样大。

如果要分析细胞核,就得特别注意苏木青蓝染的深浅要适当,一般情况下,浅浅的蓝色只能标记出细胞核的位置,明显的蓝色才适合于进行细胞核尺寸的测量或对细胞进行计数。

而在进行细胞核上蛋白的免疫组化分析时,过浅的蓝染会导致细胞核选择困难,过深的蓝染则会掩盖免疫组化产物的颜色。

关于荧光免疫组化的染色就更复杂了,单染色的样品要注意样品荧光与背景荧光的对比度要足够高。

双染色的样品还要注意两种染料的荧光强度应当适配,不要一种颜色的荧光特别强,另一种特别弱。

最常见的是红色荧光特别亮,而FITC的绿色却很弱。

结果是在拍摄时绿色的荧光实际上是红色荧光图像的绿色分量。

拍摄样品时影响的因素更多,更容易出错。

在拍摄大体物品时要特别注意背景与物体之间的对比。

在拍摄离体组织器官时,把组织块放在干净的白纸或黑纸上以保证组织图像与背景之间有清晰的分界线,在两侧各用灯光照明以避免留下影子。

在缺乏照明条件的时候,也可以选择在室外背光处拍摄,既有足够的照明也能避免明显的阴影。

一般的组织切片只要正确选择视野并拍摄清楚就行了。

而免疫组化的样品却额外要注意拍摄时的曝光:以同样的曝光条件拍摄样品。

特别是荧光,一个对照组的弱荧光样品,就应该拍摄得光强较弱,阴性的甚至拍摄出一张黑照片。

如果有意延长弱样品的曝光,照片虽然漂亮,但其表现的光密度就与阳性样的强荧光差不多了。

所以在我介绍免疫组化样品的分析方法之前,都是先强调如何拍摄样品。

在使用倒置显微镜拍摄活细胞的时候,很多人并未注意到在显微镜上方的灯光筒下边有一个长方形可推移的板,上面有三四个大小不一的园孔,这几个孔的位置是与物镜的选择有关的。

高倍镜要使用小孔,低倍镜用大点的孔。

选择不对的时候,观察图像的反差不好。

拍摄彩色照片的时候,相机色彩也是常被忽视的。

最常见的是拍摄的照片色彩偏蓝。

这对分析免疫组化图片的影响非常大。

偏蓝的照片不仅降低了黄色深色的深浅程度,而且会使较浅的黄色变成了白色甚至浅蓝色。

三、确定图片上的测量目标在分析图片时,虽然我们嘴上说的是测量细胞、细胞核或胞浆。

但是心里应该有一个概念,就是实际上我们测量的是图片上的一片黄色,一个蓝色的园斑,或者一些边界线围成的区域,或者是某种色彩组成的区域。

有了这个概念,才能真正地把研究目标转换到图像分析的目标。

进而进行正确的测量。

生物图像几乎没有直线、正方或圆形这样规则的图形。

因此,要测量对象的长度,面积,直径这些指标时,是需要考虑该如何进行近似测量或等效测量的。

软件可以准确测量不规则曲线的长度与不规则区域的面积。

其他的指标往往就需要作等效计算或近似计算。

例如:测量细胞的半径。

可以先测量细胞的面积,然后利用area=pi *r^2公式计算其等效半径。

也可以通过细胞中心画一组放射线,测量细胞在这些放射线方向上的直径,然后取平均值作为它的近似测量值。

这种测量等效值或近似值的方法在几何测量中经常用。

我个人认为测量等效值更准确一些。

选择测量目标的另一个原则是要保证测量的可重复性。

即使是手工测量,也应当保证两次独立的重复测量数值不会有太大的差异。

四、使用软件测量说到这里,才算是提到了图像分析软件了。

实际上Image-pro plus不过是许多种图像分析软件中的一种。

它是一种通用的图像分析软件,不仅是用在生物图像分析上,在其他场合用得更多。

其优势当然是功能强大,操作也顺手。

缺点只有一个,就是贵。

请大家不要在此场合讨论非正版软件的问题,这不符合丁香园网站的规定。

通用的软件适合于多种场合下的应用,专用的软件则有特定的应用场合,比如凝胶电泳分析软件,它的功能范围远比不上通用的图像分析软件,但是在分析凝胶电泳图片时,它却非常方便。

这次既然提到了关于RT-PCR凝胶图片的分析及Western blot膜的分析,就得提到Image-pro plus 的姊妹软件:gel-pro。

如果使用IPP来分析电泳图片,恐怕会相当麻烦而且结果会比较粗糙。

用gel-pro来分析就轻松得多了。

Image J也是图像分析软件。

与IPP的功能类似,操作当然有不同。

优点是能自己编制处理功能,但要作到这一点却是有难度的。

专门分析凝胶图片的软件是很多的。

常用的除了gel-pro之外,还有bandscan,quantity one, visionworks等,它们大多是与凝胶拍摄系统一起购买使用的。

分析原理都一样,操作上略有不同,功能基本上都差不多,用哪个都行的。

用惯了IPP,再用gel-pro会熟悉一些。

使用凝胶电泳分析软件可以分析DNA凝胶图片,RNA凝胶图片,蛋白质的凝胶电泳图片,Western blot膜的照片,化学发光作的Western blot胶片等。

具体的软件操作步骤不是本讲座的重点。

在另外文章里,有关于Image pro plus以及gel-pro 软件的详细具体的操作方法。

五.测量数据的统计分析。

实际上统计分析测量数据依然是把研究目的转换成图像分析的问题的一部分。

虽然是最后进行的工作,但在一开始就需要考虑对测量数据该如何处理。

在最理想的情况下,使用软件能准确地识别图像上的测量对象,识别准确了,测量也就准确了。

生物图像本身是相当复杂的。

软件不能识别测量对象的情况非常普遍。

往往只能手工选择测量对象,这当然会有误差。

在更多的情况下,测量对象有许多,手工无法全部选择上,这时候还得更退一步,选择部分对象进行抽样测量,这就必须要统计分析。

实际上,在分析组织切片的时候,拍摄照片本身就是一种抽样。

你不可能把切片全部拍摄下来,而是选择几个视野拍摄下照片。

在哪里拍摄就有讲究了。

再深一步探究,就连在组织块的哪个部位作切片也是一种抽样。

这是图像分析软件所无能为力的。

所以从根本上来说,如何进行测量数据的统计分析并不是图像分析的问题,而是实验设计的问题。

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