dna生物合成过程
原核生物DNA生物合成过程

原核生物DNA生物合成过程原核生物DNA的合成过程称为DNA复制,是指通过复制一个DNA分子来产生两个完全相同的DNA分子。
DNA复制是生物体繁殖中最基本的过程之一,也是维持遗传物质稳定性的保证。
下面将详细介绍原核生物DNA复制的过程。
DNA复制需要一系列酶和蛋白质的协同作用,其中最重要的酶是DNA聚合酶,它能将单链DNA合成双链DNA。
DNA复制过程可以分为三个阶段:初始化、扩展与终止。
初始化阶段:复制起始点和原核生物的染色体数量密切相关。
大多数原核生物只有一个染色体,复制起始点只有一个。
在初始化阶段,DNA复制起始点被特定酶组合所识别。
这些酶会解开DNA双链,形成一个起始点复制泡。
在这个复制泡周围,一个叫做“起始点复制泡”(replication bubble)的结构被形成。
扩展阶段:在扩展阶段,DNA聚合酶从复制起始点开始沿着DNA双链进行扩展。
当DNA聚合酶在复制泡两侧的DNA链上移动时,它会读取模板链上的碱基序列,并将互补的碱基加到新合成的DNA链上。
DNA复制是一个半连续的过程,其中一个DNA链被称为连续链,另一个被称为离散链。
在连续链的合成过程中,DNA聚合酶能够连续地合成DNA链,但在离散链的合成过程中,DNA聚合酶只能合成一小段DNA,这个段落被称为Okazaki片段。
当一个Okazaki片段生成后,另外一种酶称为DNA连接酶会将各个Okazaki片段连接起来形成一个完整的DNA链。
终止阶段:在DNA复制的最后,当整个DNA分子被复制完毕后,DNA聚合酶会到达染色体的末端。
在这个位置,酶无法继续进行DNA的合成,因为无法找到连接新的核苷酸的3'-OH末端。
当DNA聚合酶到达末端后,DNA分子会被一种酶称为DNA拓扑异构酶解开,这样两个DNA分子就完全分离了。
在DNA复制过程中,还有一种酶称为核切酶会解开DNA双链,以允许DNA复制进行顺利进行。
此外,还有其他一些酶和蛋白质参与DNA复制的调控、修复和保护等过程。
DNA的生物合成(精)

一. DNA的复制
复制部位:
真核生物:细胞核
原核生物:细胞质的核质区
(一) 复制的反应
一. DNA的复制
n1d ATP n2d CTP n3d GTP n4d TTP
DNA聚合酶 DNA模板
DNA +(n1+n2+n3+n4)PPi
PPi随即被焦磷酸酶水解,从 而推动聚合反应的进行。
做半保留复制(semiconservative replication)。
(二) 复制的方式 半保留复制
一. DNA的复制
(二) 复制的方式
一. DNA的复制
如何证明半保留复制
1958年,Meselson 证明:用,15NH4Cl唯一氮源
培养大肠杆菌,之后,用14NH4Cl培养,然后进行
CsCl2进行密度梯度离心。由于15NH4Cl密度大于
双螺旋DNA
3′5′ 带切开的3′ 端单链穿越 与另一条连 接封口 Tyr
一.DNA的复制
TopⅠ被解离 (-) (-)
P OH
2个负超螺旋 DNA-酶中间物
O R HN CH C NH R′ CH 2 Tyrosine N O O O 5′ H Oˉ H P O O P Oˉ (b) O O H H DNA链 N H N NH 2 N
② 随后链的合成
引物的合成:随后链的每个冈崎片段都需要合成
RNA引物。也是由引物酶催化。
冈崎片段的合成: DNA聚合酶 Ⅲ (原核细胞 )在引物的 3'末端使DNA链延伸,直至抵达其 下游的另一个冈崎片段的 RNA引物
的5'端。
(五)复制的过程 3.复制叉的推进-复制叉推进的过程
DNA生物合成过程

4. DNA生物合成过程4.1复制的起始 DNA复制的起始阶段,由下列两步构成。
4.1.1 预引发:①解旋解链,形成复制叉:由拓扑异构酶和解链酶作用,使DNA的超螺旋及双螺旋结构解开,碱基间氢键断裂,形成两条单链DNA。
单链DNA结合蛋白(SSB)结合在两条单链DNA上,形成复制叉。
DNA 复制时,局部双螺旋解开形成两条单链,这种叉状结构称为复制叉。
②引发体组装:由蛋白因子(如dnaB等)识别复制起始点,并与其他蛋白因子以及引发酶一起组装形成引发体。
4.1.2 引发在引发酶的催化下,以DNA为模板,合成一段短的RN**段,从而获得3'端自由羟基(3'-OH)。
4.2 复制的延长 4.2.1 聚合子代DNA:由DNA聚合酶催化,以3‘→5’方向的亲代DNA链为模板,从5‘→3’方向聚合子代DNA链。
在原核生物中,参与DNA复制延长的是DNA 聚合酶Ⅲ;而在真核生物中,是DNA聚合酶α(延长滞后链)和δ(延长先导链)。
4.2.2 引发体移动:引发体向前移动,解开新的局部双螺旋,形成新的复制叉,随从链重新合成RNA引物,继续进行链的延长。
4.3 复制的终止 4.3.1 去除引物,填补缺口:在原核生物中,由DNA聚合酶Ⅰ来水解去除RNA 引物,并由该酶催化延长引物缺口处的DNA,直到剩下最后一个磷酸酯键的缺口。
而在真核生物中,RNA引物的去除,由一种特殊的核酸酶来水解,而冈崎片段仍由DNA聚合酶来延长。
4.3.2 连接冈崎片段:在DNA连接酶的催化下,形成最后一个磷酸酯键,将冈崎片段连接起来,形成完整的DNA长链4.3.3 真核生物端粒的形成:端粒(telomere)是指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构部分,通常膨大成粒状。
其共同的结构特征是由一些富含G、C的短重复序列构成,可重复数十次至数百次。
线性DNA在复制完成后,其末端由于引物RNA的水解而可能出现缩短。
故需要在端粒酶(telomerase)的催化下,进行延长反应。
第十章 DNA的生物合成(共65张PPT)

配对
方向 引物
DNA(不对称转录)
NTP RNA聚合酶 mRNA,tRNA,rRNA,小RNA
A-U,T-A,G-C
5’ 3’ 不需要
DNA复制与转录的比较
以DNA为模板
相 遵循碱基配对原则 同 都需依赖DNA的聚合酶 点 聚合过程都是生成磷酸二酯键
新链合成方向为5’→3’
重组修复(recombination repair )
• 又称复制后修复( postreplication repair)
• 受损伤的DNA在进行复制时,跳 过损伤部位,在子代DNA链与损 伤相对应部位出现缺口。通过分子 间重组,从完整的母链上将相应的 碱基顺序片段移至子链的缺口处, 然后再用合成的多核苷酸来补上母 链的空缺,此过程即重复修复。并 非完全校正。
structures were observed; no single stranded
DNA is visible.
No complete unwinding of the two
parental strands occurred before the
daughter strands are synthesized
• 当DNA受到大剂量紫外线(波长260nm附近)照射 时,可引起DNA链上相邻的两个嘧啶碱基共价聚合 ,形成二聚体,例如TT二聚体。
2. DNA损伤修复
• 光复活 • 切除修复 • 重组修复 • SOS修复
光复活(photoreactivation)
• 可见光(最有效波长 400nm)激活生物界 广泛分布(高等哺乳 动物除外)的光复活 酶,该酶分解嘧啶二 聚体。
二、DNA的复制
dnaA蛋白与起始点形成复合物,促进其他 dna蛋白也与起始点形成复合物。一旦双螺旋 解开成单链,SSB即结合单链。
DNA的生物合成

组装
大分子的
第十三章
第十四章
第十五章
DNA的生物合成
RNA的生物合成
蛋白质的生物合成
第十三章
DNA的生物合成
DNA 是
主要的遗传物质
DNA
中心法则
复制
◆ 转录
◆ 翻译
RNA
◆
蛋白质
第十三章 DNA的生物合成
引言
第一节
第二节
中心法则
★
DNA的生物合成
★
DNA的损伤与修复
底物:dNTP
★
(三)DNA的复制过程(大肠杆菌)
(四)真核细胞的DNA复制
★
(五)复制高度准确性的保障
(六)逆转录
(五)复制高度准确性的保障
在碱基互补配对的结构基础上,
细胞通过RNA引物、DNA聚合
酶的识别及外切酶活性、复制组
分的协同作用、端粒酶的作用及
强大的损伤修复系统最终保证了
复制的高保真。
正常生理情况下,错配率在10-10以下。
链的延长具有严格
的方向性:
5’ → 3’
7、DNA的半不连续复制:
酶作用的严格的延长方向
的制约所导致。
7、DNA的半不连续复制:
前导链,后随链。
冈崎片段:
5’→3’,1000~2000bp,
7~11s 的均一小片段。
8、RNA引物的切除与填补
及子链DNA片段的连接:
DNA聚合酶Ⅰ切除引物
并合成DNA填补片段;
半保留
复制的
生物学
意义?
→超螺旋的解旋?
→双螺旋的解旋?
→单核苷酸链的稳定?
→复制的具体过程?
11.DNA的生物合成

The model of DNA-pol III
11/62
DNA pol I
H B
J
小片段 大片段 (Klenow fragment)
5 ‘ →3 ’聚合功能, 3 ' →5 '外切酶活性 5 ' →3 '外切酶活性
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真核细胞中DNA聚合酶
种类: DNA-pol α、β、γ、δ、ε… DNA pol δ:合成领头链
UGA(终止密码子):Trp AGA/AGG(Arg):终止密码子 AUA(Ile):Met(起始密码子)
14/62
3’
5’ 5’ 3’
OH
P
DNA-pol
5’
3’ 5’
3’
DNA-pol 的 5´3´聚合作用
15/62
外切酶与内切酶作用图解
内切酶 (限制性内切酶) 5´ 3´外切 5’ 3´5´外切 3’
4. 冈崎片段(Okazaki fragment):
不连续复制的片段
38/62
ori 5. 双向复制 以起始点为中 心,向两个方 向进行复制。
6. 复制子(replicon) 真核生物两个相 邻复制起始点之 间的DNA片段。 ori
ori
ori
39/62
滚环复制
是某些病毒,质粒、线粒体 DNA的特殊复制形式。
性质
Ⅲ 20 100000 有 无 有 复制
10/62
Leading strand synthesis
Lagging strand synthesis
’
form the catalytic core
生物化学重点_第十一章dna的生物合成

生物化学重点_第十一章D N A的生物合成work Information Technology Company.2020YEAR第十一章 DNA的生物合成一、中心法则:① DNA的自我复制将遗传信息由亲代传递给子代;② 转录:以DNA为模板合成RNA;③ 翻译:mRNA指导蛋白质的生物合成,从而决定生物的表现型。
DNA的复制、转录和翻译过程就构成了遗传学的中心法则。
但在少数RNA病毒中,其遗传信息贮存在RNA中。
因此,在这些生物体中遗传信息的流向是④ RNA通过复制,将遗传信息由亲代传递给子代;⑤ 通过反转录将遗传信息传递给DNA,再由DNA通过转录和翻译传递给蛋白质,二、DNA复制的特点:1.半保留复制:DNA在复制时,以亲代DNA的每一股作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制(semiconservative replication)。
DNA以半保留方式进行复制,是在1958年由M. Meselson 和 F. Stahl 所完成的实验所证明。
2.需要引物(primer):DNA聚合酶必须以一段具有3'端自由羟基(3'-OH)的RNA作为引物,才能开始聚合子代DNA链。
3.半不连续复制:由于DNA聚合酶只能以5'→3'方向聚合子代DNA链,因此两条亲代DNA链作为模板聚合子代DNA链时的方式是不同的。
以3'→5'方向的亲代DNA链作模板的子代链在聚合时基本上是连续进行的,这一条链被称为前导链(leading strand)。
而以5'→3'方向的亲代DNA链为模板的子代链在聚合时则是不连续的,这条链被称为随后链(lagging strand)。
DNA在复制时,由随后链所形成的一些子代DNA短链称为冈崎片段(Okazaki fragment)。
三、DNA复制的条件:1.底物:以四种脱氧核糖核酸(deoxynucleotide triphosphate)为底物,即dATP,dGTP,dCTP,dTTP。
第13章 DNA生物合成(简明生物化学)

Dna A辨认复制启始点,然后引物酶进入(DnaG 蛋白) ,加上解螺旋酶、 DnaB蛋白和DnaC蛋 白等,与DNA的起始复制区域形成引发体。
DNA聚合酶Ⅲ 由其β亚单位辨认引物,新链的 第一个脱氧核苷酸与引物的3-OH形成磷酸二酯键, 开始复制
滚动环式:单向复制,低等生物如质粒 共价闭环双链分子的正链由核酸内切酶在一特
定位点切开,游离出的5’-磷酸基末端固定在细胞膜 上,然后以环状负链为模板,从正链的3’-OH末端 延长形成正链。不需要另外合成引物。
3′ 5′
5′
3′
领头链
5′Leabharlann 5′ 随从链3′ 3′
5′
(二)引发体的生成
复制过程需要引物--短链RNA
拓扑异构酶 单链结合蛋白 解链酶 引物酶及引发体 DNA聚合酶 DNA连接酶 引物
冈崎片段
领头链 3′ 5′
随从链 3′
5′
五、 DNA连接酶(ligase)
• 催化两段DNA之间的连接
′
5P
3′ OH
+ 5′ P
γ
P O-
β
O PO Oα-
3′
OH
DNA
ligase +AMP
5′ P
PPi
O 3′ OH
一种是全部轻的14N-14N。为1∶1; 3代:仍有两种分子,但14N-14N增多,为
1∶3; 4代:两者比为1∶7。
DNA半保留复制的证据
细菌 (含15N-DNA)
普通培养基
第一代
普通培养基
普通DNA
普通DNA 重DNA
第二代
重DNA