生物信息学入门知识
生物信息学概述(共59张PPT)精选全文完整版
蛋白质 结构
蛋白质 功能
最基本的 生物信息
2024/11/11
生命体系千姿百 态的变化
维持生命活 动的机器
9
第一部遗传密码已被破译，但对密码的转录过程还不清楚，对大多
数DNA非编码区域的功能还知之甚少
对于第二部密码，目前则只能用统计学的方法进行分析。破译“第
二遗传密码”：即折叠密码（folding code），从蛋白质的一级结构
Rickettsia prowazekii
Helicobacter pylori
Buchnerasp. APS
Escherichia coli大南芥
Thermotoga maritima
Thermoplasma acidophilum
mouse
Caenorhabitis elegans
以基因组计划的实施为标志的基因组时代（1990年至2001年）是生
物信息学成为一个较完整的新兴学科并得到高速发展的时期。这一 时期生物信息学确立了自身的研究领域和学科特征，成为生命科学 的热点学科和重要前沿领域之一。
这一阶段的主要成就包括大分子序列以及表达序列标签 （ expressed sequence tag，EST）数据库的高速发展、BLAST（ basic local alignment search tool）和FASTA（fast alignment）等工具软件的研制和相应新算法的提出、基因的寻 找与识别、电子克隆（in silico cloning）技术等，大大提高
细胞质（线粒体、叶绿体） 基因组DNA
人类基因组：3.2×109 bp 18
人类自然科学史上的 3 大计划
曼哈顿原子 弹计划
阿波罗登月 计划
人类基因组计划
生物信息学介绍(PPT20页)
• 蛋白质怎样实现细胞和有机体的动力学：
– 生命为什么是蛋白质的运动方式
• 个体发育和系统发育的法则和机理：
– 肌体如何长成、运作、衰老和进化
• 征服疾病：
– 主要循环系统疾病、癌症、病毒源性疾病、遗传病和衰老
• 保护和利用生物资源，开发和发展生物产业：
– 生物学怎样造福人类
•
1、
功的路 。2020/10/262020/10/26Monda y, October 26, 2020
成功源于不懈的努力，人生最大的敌人是自己怯懦
•
2、
。2 020/10/ 262020 /10/26 2020/10 /2610/ 26/202 0 12:03:09 AM
每天只看目标，别老想障碍
–蛋白质的三维结构
– 蛋白质的物理性质预测
– 其他特殊局部信息：其它特殊局部结构包括 膜蛋白的跨膜螺旋、信号肽、卷曲螺旋 (Coiled Coils)等，具有明显的序列特征和结 构特征，也可以用计算方法加以预测
• cDNA 芯片相关的数据管理和分析
实验室信息管理系统 基因表达公共数据库
• 分子进化
基因芯片流程（二）
6. 图象处理（采用专门软件，对图象进行分析， 提取每个点上的数字信号），得到原始数据表。
7. 数据校正和筛选（对cy5或cy3信号进行校正， 消除实验或扫描等各环节因素对数据的影响， 同时利用筛选规则对数据中的“坏点”，“小 点”，“低信号点”进行筛选，并作标记。）
8. 差异表达基因的确定（采用ratio值对差异基因 进行判断，或采用统计方法如线性回归、主成 分分析、调整P值算法等对差异基因进行统计 推断）
远期任务
• 读懂人类基因组，发现人类遗传语言的 根本规律，从而阐明若干生 物学中的重 大自然哲学问题，像生命的起源与进化 等。这一研究的关键和核心是了解非编 码区
1-生物信息学背景知识
多肽
2013-7-4生物信息学概论
讲义
35
蛋白质
蛋白质分子结构多样性 功能多样性
有些蛋白质是构成细胞和生物体的重要物质
• 如人和动物的肌肉主要是蛋白质
有些蛋白质有催化作用
• 如参与生物体各种生命活动的绝大多数酶
有些蛋白质有运输作用
• 如细胞膜上的载体、红细胞中的血红蛋白
有些蛋白质有调节作用
2013-7-4生物信息学概论
讲义
13
DNA分子结构
DNA分子的碱基序列储存和编码 了大量遗传信息 DNA分子可以看作是一个由 A,C,G,T四个字符组成的序列 人类DNA分子的长度为3G个碱 基 人类DNA分子中大约含有3万多 个基因 基因直接控制着生命最本质的 活动 ---- 蛋白质的合成
第1章 生物信息学背景知识
DNA分子结构 基因结构 蛋白质 基因表达 生物信息数据库
2013-7-4生物信息学概论
讲义
1
DNA分子结构
构成DNA分子的基本单位 脱氧核苷酸(碱基、核糖和磷酸) 脱氧核苷酸通过一定的化学键连 接起来形成脱氧核苷酸链 四种核苷酸 嘌呤: 腺嘌呤(adenine A) 鸟嘌呤(guanine G) 嘧啶:胞嘧啶(cytosine C) 胸腺嘧啶(thymine T)
讲义
33
蛋白质
H H N
H C R1
O C
H N
H C R2
O C
H N
H C R3 COOH
三肽
2013-7-4生物信息学概论
讲义
34
பைடு நூலகம்
蛋白质
H H C R1 O || C H C Rn HN CO O H N H O H H
生物信息学复习资料
生物信息学复习资料第一章1、什么是生物信息学？生物信息学是一门交叉科学，它包含了生物信息的获取、加工、存储、分配、分析、解释等在内的所有方面，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义2、BIOINFORMATICS这个词是谁提出的？林华安3、生物信息学的发展经过了哪些阶段？前基因组时代、基因组时代、后基因组时代4、HGP是什么意思？什么时候开始？什么时候全部结束？人类基因组计划、1990.10、20035、生物信息学的研究对象是什么？6、生物信息学的研究内容有哪些？获取人和各种生物的完整基因组、新基因的发现、SNP分析（单核苷酸多态性：single nucleotide polymorphism,SNP）、非编码区信息结构与分析、生物进化；全基因组的比较研究、蛋白质组学研究、基因功能预测、新药设计、遗传疾病的研究以及关键基因鉴定、生物芯片7、学习生物信息学的目的是什么？阐明和理解大量数据所包含的生物学意义第二章1、生物信息数据库有哪些要求？时间性、注释、支撑数据、数据质量、集成性2、生物信息数据库分为哪几级，每一级是如何让定义的，每一级各包含哪些数据库？一级数据库二级数据库；一级数据库：数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释二级数据库：对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的一级数据库：包括基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库二级数据库：根据生命科学不同研究领域的实际需要，对基因组图谱、核酸和蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释，构建具有特殊生物学意义和专门用途的数据库3、请列出至少三个国际知名生物信息中心网站、至少三个核酸数据库、至少三个蛋白数据库。
网站：NCBI、EBI、SIB、HGMP、CMBI、ANGIS、NIG、BIC核酸数据库：EMBL、DDBJ、GenBank蛋白质序列数据库：PIR（Protein Information Resource）、SWISS-PROT、TrEMBL、UniProt、NCBI生物大分子数据库：PDB（Protein Data Bank）蛋白质结构分类数据库SCOP、蛋白质二级结构数据库DSSP、蛋白质同源序列比对数据库HSSP4、NCBI和EBI使用的搜索引擎分别是什么？NCBI提取工具：Entrez EBI提取工具：SRS65、GENBANK使用的基本信息单位是什么，包括哪几个部分，最后以什么字符结尾？基本信息单位：GBFF（GenBank flatfile, GenBank平面文件）格式：GBFF是GenBank数据库的基本信息单位，是最为广泛使用的生物信息学序列格式之一哪几个部分：头部包含整个记录的信息（描述符）、第二部分包含了注释这一记录的特性、第三部分是核苷酸序列本身最后字符：所有序列数据库记录都在最后一行以“//”结尾6、什么是Refseq？The Reference Sequence database 参考序列数据库RefSeq数据库，即RefSeq参考序列数据库，美国国家生物信息技术中心（NCBI）提供的具有生物意义上的非冗余的基因和蛋白质序列7、FASTA格式有哪些部分组成，以什么字符开始？8.NCBI的在线和离线序列提交软件是什么？在线提交软件：Bankit 离线提交软件:Sequin第三章1、什么是同源、直系同源、旁系同源？同源性和相似性有什么区别？同源性：两条序列有一个共同的进化祖先，那么它们是同源的相似性：序列间相似性的量度同源性和相似性的区别：同源性是序列同源或者不同源的一种论断，而相似性或者一致性是一个序列相关性的量化，是两个不同的概念直系同源（orthology）：不同物种内的同源序列旁系同源（paralogy）：同一物种内的同源序列2、什么是序列比对、全局比对、局部比对？序列比对的关键问题是什么？序列比对：根据特定的计分规则，将两个或多个符号序列按位置比较排列后，得到最具相似性的排列的过程。
生物信息学基础
蛋白质结构数据库
• PDB PDB是目前最主要的蛋白质分子结构数据库，目前由美 国RCSB管理；以文本格式存放数据，包括原子坐标、物 种来源、测定方法、提交者信息、一级结构、二级结构 等。 PDB的网址是：/pdb/。
生物分子数据的存储与获取
EMBL 基因组 数据库
• 改变生物学的研究方式
–改变传统研究方式，引进现代信息学方法
• 在医学上的重要意义
–为疾病的诊断和治疗提供依据 –为设计新药提供依据
生物信息学将是21世纪生物学的核心
Thank You!
生物信息学
Bioinformatics
孙丽丹
2014.11.27
内容
一、引言 二、生物信息学及其发展历史 三、生物信息学基础
四、生物信息学主要研究内容
五、生物信息学当前的主要任务
引 言
引言
引 言
阿波罗登月计划 曼哈顿原子弹计划
人类基因组计划
人类自然科学史上的 3 大计划
引 言
基因组计划带来的科学挑战
• 随着实验数据和可利用信息急剧增加，信息的管理和 分析成为基因组计划的一项重要的工作
1、信息的整合 2、信息的储存 3、信息的比较
基因组学
4、信息的分析
5、信息的分解 功能基因组学
引 言
这些过程都需要生物信息学的帮助!
人类基因组计划带来了……???
生物信息学
引 言
生物信息学的应用–医学
• 新药物设计
蛋白质 蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据 库中的序列 蛋白质 核酸序列翻译成蛋白质序列后和 蛋白质数据库中的序列逐一搜索。 核酸 蛋白质序列和核酸数据库中的核 酸序列翻译后的蛋白质序列逐一 比对。 核酸序列翻译成蛋白质序列，再 和核酸数据库中的核酸序列翻译 成的蛋白质序列逐一进行比对。
生物信息学论知识139页PPT
21、要知道对好事的称颂过于夸大，也会招来人们的反感轻蔑和嫉妒。——培根 22、业精于勤，荒于嬉；行成于思，毁于随。——韩愈
生物信息学论知识
51、没有哪个社会可以制订一部永远 适用的 宪法， 甚至一 条永远 适用的 法律。 ——杰 斐逊 52、法律源于人的自卫本能。——英 格索尔
53、人们通常会发现，法律就是这样 一种的 网，触 犯法律 的人， 小的可 以穿网 而过， 大的可 以破网 而出， 只有中 等的才 会坠入 网中。 ——申 斯通 54、法律就是法律它是一座雄伟的大 夏，庇 护着我 们大家 ；它的 每一块 砖石都 垒在另 一块砖 石上。 ——高 尔斯华 绥 55、今天的法律未必明天仍是法律。 ——罗·伯顿
23、一切节省，归根到底都归结为时间的节省。——马克思 24、意志命运往往背道而驰，决心到最后ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ全部推倒。——莎士比亚
25、学习是劳动，是充满思想的劳动。——乌申斯基
谢谢！
生物信息学复习资料
生物信息学复习资料生物信息学复习资料第一讲生物信息学绪论1、生物信息学诞生于计算机初创时期，1956年在美国田纳西州的Gatlinburg召开了首次―生物学中的信息理论讨论会‖２、20世纪80年代末―林华安‖博士创造了‖bioinformatics‖一词３、数据库的构建：1979年美国Genbank数据库；1982年欧洲分子生物实验室EMBL核酸序列数据库；1984年日本国家级核酸序列数据库DDBJ4、专业机构：1988年美国成立了―生物技术信息中心‖（NCBI）；欧洲生物信息学研究所（EBI）于1993年构建．5、生物信息学产生的背景（１）、传统生物学和现代生物学都是一门实验学科，生物学的发展需要数学模型的介入（２）、海量生物学数据信息的产生（2002年8月，Genbank中的序列量已达18197000,而碱基对数达22617000000,且以每秒220对的速度增加），数据的分析处理成为生物学发展的―瓶颈‖（３）、新的生物学研究模式的出发点应是理论：从理论出发，再回到实验中追踪或验证这些理论假设6、生物信息学定义（广义）：应用信息科学的方法和技术，研究生物体系和生命过程中信息的存贮、信息的内涵和信息的传递，研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中的各种生物信息，或者也可以说成是生命科学中的信息科学。
狭义：应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。
一般提到的―生物信息学‖是就指这个狭义的概念，更准确地说，应该是分子生物信息学（Molecular Bioinformatics）7、生物信息学研究的主要对象——两种信息载体：DNA分子和蛋白质分子(1)遗传信息的载体——DNA遗传信息的载体主要是DNA，控制生物体性状的基因是一系列DNA片段，生物体生长发育的本质就是遗传信息的传递和表达(2)蛋白质的结构决定其功能蛋白质功能取决于蛋白质的空间结构，蛋白质结构决定于蛋白质的序列（这是目前基本共认的假设），蛋白质结构的信息隐含在蛋白质序列之中。
(完整word版)生物信息学复习资料(word文档良心出品)
一、名词解释(31个)1.生物信息学:广义：应用信息科学的方法和技术，研究生物体系和生物过程中信息的存贮、信息的内涵和信息的传递，研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中的各种生物信息，或者也可以说成是生命科学中的信息科学。
狭义：应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。
2.二级数据库：对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的。
3.多序列比对：研究的是多个序列的共性。
序列的多重比对可用来搜索基因组序列的功能区域，也可用于研究一组蛋白质之间的进化关系。
4.系统发育分析：是研究物种进化和系统分类的一种方法，其常用一种类似树状分支的图形来概括各种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形称为系统发育树。
5.直系同源：如果由于进化压力来维持特定模体的话，模体中的组成蛋白应该是进化保守的并且在其他物种中具有直系同源性。
指的是不同物种之间的同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性。
（来自百度）6.旁系（并系）同源：是那些在一定物种中的来源于基因复制的蛋白，可能会进化出新的与原来有关的功能。
用来描述在同一物种内由于基因复制而分离的同源基因。
（来自百度）7.FASTA序列格式：将一个DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或氨基酸字符串。
8.开放阅读框（ORF）：是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。
（来自百度）9.结构域：大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各行其功能，称为结构域。
10.空位罚分：序列比对分析时为了反映核酸或氨基酸的插入或缺失等而插入空位并进行罚分，以控制空位插入的合理性。
（来自百度）11.表达序列标签：通过从cDNA文库中随机挑选的克隆进行测序所获得的部分cDNA的3’或5’端序列。
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生物信息学入门知识生物信息学是用数理和信息科学的观点、理论和方法去研究生命现象、组织和分析呈现指数增长的生物学数据的一门学科。
首先是研究遗传物质的载体DNA及其编码的大分子蛋白质，以计算机为其主要工具，发展各种软件，对逐日增长的浩如烟海的DNA和蛋白质的序列和结构进行收集、整理、储存、发布、提取、加工、分析和研究，目的在于通过这样的分析逐步认识生命的起源、进化、遗传和发育的本质，破译隐藏在DNA序列中的遗传语言，揭示人体生理和病理过程的分子基础，为人类疾病的预测、诊断、预防和治疗提供最合理和有效的途径。
生物信息学已经成为生物医学、农学、遗传学、细胞生物学等学科发展的强大推动力量，也是药物设计、环境监测的重要组成部分。
近年来，蛋白质结构数据的快速增长，使蛋白质三维结构的处理分析也归入到生物信息学的范畴。
国际上有三大一级生物信息数据库，即美国国家信息中心 (National Center of Biotechnology Information, NCBI)的Gen Bank(http:/ / www. nchi. nlm. nih. gov/ web/Gen Bank/ imdex. html)、欧洲分子生物学室验室(European Molecular Biology L aboratory-Euro-pean Bioinformatics Institute, EMBL-EBI)的 EM-BL (http:// www.ebi. / databases/ index.html)和日本 DNA数据库 (DNA Data Bank of Japan, DDBJ) (http:/ / www.ddbj.nig.ac.jp/ )。
随着生物信息学 (Bioinformatics)的发展，通过检索数据库进行核酸序列同源性检索，电子基因定位、电子延伸、电子克隆和电子表达以及蛋白质功能分析、基因鉴定等方面起到了重要作用，已成为人们认识生物个体生长发育、繁殖分化、遗传变异、疾病发生、衰老死亡等生命过程的有力工具。
一、生物信息学相关网站生物信息学与生物计算：http://bioinformatics.weizmann.ac.il/这是生物信息学和生物计算学的网站，由Weizmann科学研究所，生物服务部和Crown人类基因组学中心支持。
研究领域主要涵盖序列分析，蛋白质组学和基因组学等。
该网站提供了数据库，电子论坛，教育，新闻，软件，招聘启事等。
该网站还提供了相关链接，包括欧洲分子生物学以色列国家网点，以色列国家基因组基础设施实验室以及国际生物信息学合作中心。
生物信息学专题：/bioinformatics/bioinfo.htm中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心的网站中的生物信息学专题提供与生物信息学有关的新闻信息，生物信息学文献的介绍（包括的课题例如：鉴别肿瘤的亚型，细菌中的基因转移，生物钟与微阵列--哺乳动物的基因组有节奏，混乱的DNA区分人类与黑猩猩等等），相关软件下载，与数据库的链接。
生物信息学专业网：/生物信息学专业网旨在收集、整理与生物信息学相关的信息和资源。
它的站点提供最近新闻；与生物科学相关的论文；与生物信息学相关的数据库，软件，公司，大学和期刊；工具的介绍，例如：序列逆向查询系统。
生物信息学组织：/生物信息学组织是生物信息学学科的综合性网站。
其涉及的内容有新闻、事件提醒、会议消息、免费FTP工具下载、论文、URL推荐、演示幻灯片等。
此外，其还拥有有关生物信息学研究组和软件的搜索引擎。
香港生物信息学中心：.hk/这是香港生物信息学中心(HKBIC)的网站。
香港生物信息学中心是由香港技术创新委员会和香港中文大学创办，为香港生物技术与工业界提供中心数据资源。
它为使用者提供计算设备，技术专家意见和分子生物学定向数据库等。
主要致力于核苷酸、医学、药物设计、毒理学、生物技术、化学工程、制药技术等方面的研究。
该网站还提供了研究、工具、新闻等方面的。
耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室：/这是耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室的网站。
耶鲁大学盖斯坦生物信息学实验室主要致力于生物信息学的研究，其研究领域包括基因组序列，大分子结构和表达基因数据，比较基因组学，基因表达分析，大分子几何学等。
该网站还提供研究、工作、演讲、论文等方面的信息。
用于比较基因组学的生物信息学工具：/Workshop/webTools.html用于比较基因组学的生物信息学工具是劳伦斯伯克利国家实验室提供的用于比较基因组学的生物信息学的软件、数据库和网址资源。
其涵盖五个大类分别是：基因组数据、注释、比较基因组、阵列资源、杂集。
并且，对每个类别其都有类型、名称和描述、帮助及信息等方面的说明。
中国生物信息学资源导航：/pages/source-bioinfo.htm这是中国生物信息学资源导航的网站。
该网站主要提供与生物信息学相关的学会、组织和生物计算中心的链接，也包含对网关及网络资源的链接。
NCBI生物信息学研究工具：/Tools/NCBI生物信息学研究工具网站由美国国家生物技术信息中心支持。
该网站提供了许多程序的链接，内容包括数据挖掘、核酸和蛋白质组分析等。
同时，网站还提供了许多相关链接和资源。
欧洲生物信息学研究所：/欧洲生物信息学研究所是一个非盈利学术机构，是欧洲分子生物学实验室的一部分。
它是生物信息学研究和服务的中心。
它所管理生物数据的数据库包括核酸，蛋白质序列和大分子结构。
它的使命是保证从分子生物学和基因组研究的日益增长的信息向公众公开，并且对科学研究团体提供任何方面的免费使用，以促进科学发展。
欧洲生物信息学研究所Ensembl基因组浏览器：ttp:///ensembl/index.html 欧洲生物信息学研究所Thornton研究组：/Thornton/index.html 欧洲生物信息学研究所多序列联配数据库:/embl/Submission/alignment.html欧洲生物信息学研究所工具箱:/Tools/欧洲生物信息学研究所核酸数据库:/Databases/nucleotide.html 欧洲生物信息学研究所计算基因组研究组:/research/CGG/index.html欧洲生物信息学研究所完整基因组数据库:/genomes/欧洲生物信息学研究所序列数据库研究组:/seqdb/index.htmlBrutlag生物信息学研究组：/Brutlag生物信息学研究组是斯坦福大学的一个研究团体，主要研究从蛋白质一级结构预测蛋白质结构和功能，其开发了EMOTIF、EMATRIX和3MOTIF软件应用于非鉴定的基因组序列的功能确定，另外还开发了LOCK和3DSEARCH软件用于比较蛋白质结构和蛋白质结构数据库的搜索。
生物GBF信息学小组主页：http://transfac.gbf.de/生物信息学小组主页是德国生物技术研究中心的生物信息组的主页。
其提供的资源十分丰富，包括出版物、研究计划、研究组介绍、五个重要数据库、十二个工具软件和资源链接等。
Pune大学生物信息学中心：http://bioinfo.ernet.in/Pune大学生物信息学中心成立于1987年，是生物技术系统的九大中心之一。
提供生物工程领域的信息,侧重病毒学,蛋白质和核酸序列与结构。
其提供的资源丰富，包括数据库、微生物菌株数据网络系统、生物信息学中心图书馆、Alpha服务器的软件包、生物信息学的有用网址、EBI和PDB的数据库镜像等。
北京大学生物信息学中心：/北京大学生物信息中心（CBI）成立于1997年，是欧洲分子生物学网络组织EMBnet的中国国家接点。
几年来，已经与多个国家的生物信息中心建立了合作关系。
目前是国内数据库种类最多，数据量最大的生物信息站点。
在基因预测、基因组、蛋白质结构等领域都有相应的研究项目。
加拿大生物信息学资源：http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/index_e.php这是加拿大生物信息学资源(CBR)的网站。
该网站由加拿大国家研究委员会(NRC)创建，旨在为国家研究委员会与其它政府、学术部门的科学家提供广泛使用的生物信息学工具和共享数据。
加拿大生物信息学资源部分由一个专门使用该资源的委员会管理，而且其资源在用于教育和非盈利研究时只需注册均可免费作用。
网站还提供有关新闻、服务与下载等信息。
结构生物信息学公司：/结构生物信息学公司是世界上占领导地位的、蛋白质组学推动的药物发现的公司，他们大规模地产生和使用蛋白质结构信息，以期加速发现和优化过程。
它提供的软件主要针对加速药物发现和优化过程、提高筛选效率和降低成本、极大地重视知识产权的地位、提高药物性能和增加技术和市场成功的可能性。
此外，还提供三个药物数据库。
林奈斯生物信息学中心：http://www.lcb.uu.se/这是林奈斯生物信息学中心(LCB)的网站。
林奈斯生物信息学中心研究非常活跃，隶属于瑞典Uppsala生物医学中心。
作为一个由Uppsala大学与瑞典农业大学的联合研究机构，确保了高质量的尖端的研究与教育，其研究范围从微生物与哺乳动物基因组学经计算机的功能基因组学到分子进化。
网站还提供有关入学、新闻时事、研讨会、工具、学生计划等方面的信息。
曼彻斯特大学生物信息学教育与研究：/曼彻斯特大学生物信息学教育与研究是欧洲分子生物网络的节点之一，负责维护一些数据库（如蛋白质模体指纹数据库，PRINTS）。
站点提供蛋白质同源性分析，蛋白质模体指纹分析，系统发生和序列进化分析，以及微阵列分析，并提供生物信息学和PRINTS数据库数据下载。
《生物信息学》：/jnls/list/bioinformatics/etoc.html生物信息学》是由英国牛津大学出版社出版。
其主要刊登生物信息和计算生物学方面的研究论文、书评、综述、读者来信和述评等文章。
其刊载的文章在两年内供给学术界免费使用。
生物信息学：/pages/bioinfo.html生物信息学是印第安纳大学分子和细胞生物学研究所提供的生物信息学资源。
此资源包括数据库、基因发现程序、蛋白质模建、生物信息学在线教程、研究基金的来源、研究项目和生物信息学工具软件等。
生物信息学的网络资源：/~cleslie/cs4761/resources.html 生物信息学的网络资源是美国哥伦比亚大学的Bill Noble教授建立的有关生物信息学的网络资源总集。
其涉及面广，包括基因组学和生物信息学中心、生物信息学工具和基因组计划索引、DNA和蛋白质分析工具、生物信息学课程主页、生物信息学和生物技术的学术项目、生物信息学文献参考，以及网上引物。
生物信息学趋势导向：/genpedscrr/Trends.htm生物信息学趋势导向主要提供《今天免疫学》杂志的增刊有关生物信息学的内容。