云南迪庆藏族自治州青稞种质资源亲缘关系的SSR标记分析
利用SSR标记法研究suwan1与我国温带玉米种质之间的遗传关系
科类：农学编号（学号）：本科生毕业论文（设计）利用SSR标记研究Suwan1种质与我国温带玉米种质的遗传关系宗绍俊指导老师：姚文华职称云南农业大学昆明黑龙潭650201学院：农学与生物技术学院专业：农学年级：2008级论文提交日期：2012年5月答辩日期：2012年5月云南农业大学2012年5月利用SSR标记研究Suwan1种质与我国温带玉米种质的遗传关系1 引言1.1 玉米起源与生产现状玉米(Zea mays L．)，在植物学分类上属于禾本科(Gramineae),蜀黍族(Maydeae)玉蜀黍属(ZeaL．)中的栽培玉米种，。
玉米起源于南美洲，同其它禾谷类作物一样，玉米也是一种驯化作物，驯化可能开始于7000～10000年以前（3）998年以后，全球玉米种植面积与总产都超过水稻和小麦，玉米总产量跃居第一位。
随着全球经济的发展，玉米的需求量也在持续增加。
我国是世界上第二大玉米生产国，近30年来玉米生产发展相当迅速。
就玉米育种水平而言，我国已跻身世界先进之列，单交种种植面积达85％，单产相对较高，继续提高单产难度较大。
国际玉米小麦改良中心的分析资料表明，我国玉米年增产率呈下降趋势。
1.2 SSR标记标记法：简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR),又称为微卫星DNA(Microsatellite DNA)。
微卫星通常是指以2~4个核苷酸为单位多次串联重复的DNA序列,也有少数以1~6个核苷酸为串联重复单位。
微卫星在基因组中的分布是随机的,它可以存在于内含子、外显子及染色体的其它任何区域。
在不同植物中,微卫星重复单位的碱基组成及拷贝数随物种的不同而有所差异,但人们发现微卫星两端的序列是保守的。
因此,可以设计出与微卫星两端保守序列互补的引物,通过PCR扩增重复序列本身并通过凝胶电泳检测其多态性。
SSR序列多态性的出现是由于同一物种中不同基因型的寡核苷酸重复次数不同以及重复序列在染色体复制时的滑动或染色单体的不等交换造成的。
香格里拉青稞
香格里拉青稞种植区有金沙江和澜沧江两大水系；主要河流有硕多岗河、永春河、朱巴洛河、岗曲河、格咱 河、春多洛河、洛吉河等。其中：永春河流入澜沧江，其它河流流入金沙江。
香格里拉青稞香格里拉青稞种植区属寒温带山地季风气候。复杂多样的山行地貌是构成立体气候的主要因素， 依次有河谷北亚热带、山地暖温带、山地温带、山地寒冷温带、高山亚寒带六个气候带。气候幅宽，气候带窄， 形成“一山分四季”的典型立体气候。是一个具有独特地理环境和自然条件的低纬度高海拔地区。极端最高气温 36.5℃，极端最低气温－7.4℃，年平均气温7.3℃，年降水量513.7-606.4毫米，日照9小时，年平均日照 2206.27小时，活动积温900-3700℃，其中6-9月份是主要降雨季节，同时迪庆州地下水资源丰富，静水位30米 左右，有利于香格里拉青稞种植。
2013年12月30日，原中华人民共和国农业部批准对“香格里拉青稞”实施国家农产品地理标志登记保护。
产品特点
外在特征
品质指标
香格里拉青稞香格里拉青稞种植基地的青稞在长期的栽培和自然选择下，形成了自己的产品特征，其品种以 云青-1号、云青-2号、长黑、短白等品种为主，青稞株高70-120厘米，穗长80-120毫米，穗形纺锤形、椭圆形、 菱形等，铓长50-100毫米，粒数40-80粒/株，颜色、有白色、褐色、紫色、绿色及黑色等。茎秆直立、光滑无毛。 叶鞘无毛，有时基生叶的叶鞘疏生柔毛，叶鞘先瑞两侧具弯曲沟状的叶耳；叶舌小，长l-2毫米，膜质；叶片扁 平，长披针形，长8-18厘米，宽6-10毫米，叶面较为粗糙，叶背面较平滑。穗状花序，长4-10厘米，分为若干节， 每节着生3枚完全发育的小穗，小穗长约2厘米，通常无柄，每小穗有花1朵，内外颖均为线形或线状披针形，先 瑞延长成短芒，长8-14毫米；外稃长圆状披针形，光滑，具5条纵脉中脉延长成长芒，极粗糙，长8-13厘米，外 稃与内稃等长；雄蕊3枚；子房1枚，花柱分为2枚，花期3-4月。
不同生长条件青稞的产量·品质分析
不同生长条件青稞的产量品质分析孟晶岩;栗红瑜;张倩芳;李敏;刘森【摘要】[目的]研究不同生长条件对青稞产量、品质的影响.[方法]采集4个青稞品种,分别在西藏、甘肃、山西3个地区进行对比种植,对青稞中的水分、灰分、淀粉、粗蛋白、粗纤维、粗脂肪、可溶糖、碳水化合物、β-葡聚糖以及砷、铅、汞12项指标进行检测.[结果]与原产地青稞种植产量相比,在山西省种植的青稞产量仅占其44%~73%;在同一地区种植的品种,其粗蛋白、粗纤维、水分、灰分、粗脂肪、可溶糖、碳水化合物等各项指标没有明显的变化;不同地区同一品种粗蛋白含量差异显著;喜马拉22中β-葡聚糖含量与昆仑12以及昆仑15差异显著,同一地区差异不大;原产地的品种各项重金属指标都低于在山西种植的品种.[结论]该研究可为今后青稞引进种植提供理论依据.%[Objective]To study the effect of growth conditions on the yield and nutrient qualities.[Method]Four varieties of hulless barley were planted in three areas of Tibet, Gansu and Shanxi Province.The water,ash,starch,crude protein,crude fiber,solublesugar,carbohy-drates,β-glucan and heavy mental were detected.[ Result] Compared with the hulless barley production in the original production area,the yield was only 44% to 73% in Shanxi Province.There were no obvious changes in the indexes of crude protein, crude fiber, moisture, ash, crude fat, soluble sugar, and carbohydrate in the same area.The difference of crude protein content of the same variety in different regions was significant.The β-glucan content of Ximala 22 was significantly lower than that in Kunlun 12 and Kunlun 15.There was no big difference of the β-glucan content in different varieties.All kinds of heavy metals from originalarea was lower than that from Shanxi Province.[ Conclusion] This study can provide theoretical basis for the introduction of hulless barley in future.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2017(045)028【总页数】3页(P30-31,38)【关键词】青稞;播期;品质分析;β-葡聚糖【作者】孟晶岩;栗红瑜;张倩芳;李敏;刘森【作者单位】山西省农业科学院农产品加工研究所,山西太原030031;山西省农业科学院农产品加工研究所,山西太原030031;山西省农业科学院农产品加工研究所,山西太原030031;山西省农业科学院农产品加工研究所,山西太原030031;山西省农业科学院农产品加工研究所,山西太原030031【正文语种】中文【中图分类】S512.3Abstract [Objective]To study the effect of growth conditions on the yield and nutrient qualities.[Method]Four varieties of hulless barley were planted in three areas of Tibet, Gansu and Shanxi Province.Thewater,ash,starch,crude protein,crude fiber,soluble sugar,carbohydrates,β-glucan and heavy mental were detected.[Result]Compared with the hulless barley production in the original production area，the yield was only 44% to 73% in Shanxi Province. There were no obvious changes in the indexes of crude protein, crude fiber, moisture, ash, crude fat, soluble sugar, andcarbohydrate in the same area.The difference of crude protein content of the same variety in di fferent regions was significant.The β-glucan content of Ximala 22 was significantly lower than that in Kunlun 12 and Kunlun 15.There was no big difference of the β-glucan content in different varieties.All kinds of heavy metals from original area was lower than that from Shanxi Province.[Conclusion] This study can provide theoretical basis for the introduction of hulless barley in future.Key words Hulless barley;Sowing time;Nutrient qualities analysis;β-glucan 青稞(Hordeum vulgare L.var.nudum Hook.f.)是我国青藏高原地区对多棱裸粒大麦的统称，别名元麦、淮麦、米大麦或裸大麦，是大麦的一种特殊类型[1-3]。
几个青稞主产区不同青稞品种的微量成分差异分析
几个青稞主产区不同青稞品种的微量成分差异分析车富红; 冯声宝; 李善文; 陈占秀; 牛姣; 祁万军; 孔令武【期刊名称】《《酿酒科技》》【年(卷),期】2019(000)011【总页数】6页(P113-118)【关键词】青稞; 微量成分; 健康功能; 总酚; 总黄酮; β-葡聚糖; 母育酚【作者】车富红; 冯声宝; 李善文; 陈占秀; 牛姣; 祁万军; 孔令武【作者单位】青海互助青稞酒股份有限公司青海互助810500【正文语种】中文【中图分类】TS261.2; TS262.3青稞主要分布在我国西藏、青海、四川的甘孜州和阿坝州、云南的迪庆、甘肃的甘南等地海拔4200～4500 m的高寒地带，是高寒高海拔地区唯一能正常成熟的谷物[1]。
青稞是禾本科大麦属，在植物学上属于栽培大麦的变种，因其籽粒内外稃与颖果分离，籽粒裸露，故称为裸大麦[2]，青稞耐寒性强，生长周期短，比大麦早熟快。
青稞籽粒中淀粉平均含量为59.25%，其中74%～78%为支链淀粉[3]。
目前常见的有色青稞品种有黑老鸦（wa）青稞（呈黑色）、白浪散青稞（呈浅黄白色）、瓦蓝青稞（呈墨绿色）、肚里黄青稞（呈浅黄色）等4种[4]。
不同品种的青稞除了种皮颜色有差异外，在营养价值、食用口感和酿酒适宜性上也有一定的差异。
1 不同青稞品种的营养成分差异1.1 不同青稞品种的主要营养成分龚凌霄等[5]对西藏、青海、甘肃、四川、云南等5个藏族地区共68个青稞品种进行分析，蛋白质含量平均为12.4%（6.4%～18.0%），高于小麦、水稻、玉米的含量。
王恒良等[6]研究表明，青稞籽粒中粗脂肪1.18%～3.09%，平均为2.13%，比玉米和燕麦低，但远高于其他谷类作物。
青稞淀粉成分独特，含有74%～78%的支链淀粉，有些甚至接近或达到100%。
支链淀粉含大量凝胶黏液，加热后呈弱碱性，对胃酸过多有抑制作用，对病灶可起到缓解和屏障保护作用。
青稞中还富含各种氨基酸，其中赖氨酸高达0.469%[1-7]。
藜麦种质资源遗传多样性SSR标记分析
植物遗传资源学报2021，22 (3 ):625-637Journal of Plant Genetic Resources DOI： 10.13430/ki.jpgr.20200911001藜麦种质资源遗传多样性SSR标记分析孙梦涵\邢宝2,崔宏亮3,周帮伟4,张琴萍h2,任贵兴K2,秦培友2(1成都大学农业农村部杂粮加工重点实验室，成都610106;2中国农业科学院作物科学研究所，北京100081;3伊犁哈萨克A治州农业科学研究所，伊宁835000;4东北师范大学草地科学研究所/植被生态科学教育部重点实验室，长春130024 )摘要：为研究黎麦（C/ienopoA+w/w gm+noa Willd.)种质资源的遗传多样性，分析中国黎麦种质遗传背景，本研究利用65对 简单重复序列（SSR >标记对163份藜麦种质和3份台湾红藜（Koidz.)种质进行分子标记，分析了 该种质群体的多态性和亲缘关系数据显示，65对S S R标记在166份供试种质材料中检测到327个等位位点，平均每个标记5.03丨个等位位点，平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.387和0.588,平均多态性信息含量为0.524用类平均法将166份材料聚为3个类群,其中第丨类群仅包括3份台湾红藜，第I I类群包括以来源于美国国家种质库和智利种质为主的103份 种质材料，第m类群包括以来源于玻利维亚和秘鲁种质为主的60份种质材料.群体结构分析和主成分分析将藜麦群体划分为2个亚群，亚群之间有基因交流。
结果表明，玻利维亚和秘鲁种质与美国和智利种质的遗传信息存在明显区分，来自中国青 海和中国云南的藜麦种质在亲缘关系上更接近安第斯高原型，来自中国河北、中国山西的藜麦种质更接近智利低海拔型。
台湾红藜为中国台湾本土种质.，藜麦种质的S S R标记遗传多样性分析，能够推测其进化途径和遗传背景，为藜麦的生物学研究和育种提供科学依据关键词：藜麦；S S R标记；遗传多样性；聚类分析；群体结构Genetic Diversity Analysis of Quinoa by SSR MarkersSUN Meng-han1, XING Bao2, CUI Hong-liang3, ZHOU Bang-wei4,ZHANG Qin-ping1.2, REN Gui-xing1.2, QIN Pei-yoif(1Key Laboratory o f M inor Cereal Processing, Ministry o f A griculture and Rural Affairs, Chengdu University, Chengdu 610106 \ Institute o f C rop Sciences, Chinese Academy o f A gricultural Sciences, Beijing 100081；y I nstitute o f A gricultural Sciences o f I li Kazak Autonomous Prefecture, Yining 835000；4Institute o f Grassland Sciences,Northeast Normal University /Key Laboratory o f Vegetation Ecology, Ministry o f E ducation ,Changchun 130024 )A bstract：In order to study the genetic diversity and the genetic background of quinoa( C h en o p o d iu m quinoa Willd. )germplasms distributed in China, molecular markers research was carried out based on 163 quinoa accessions and 3 djulis( C henopodium form osanum Koidz. ) accessions by using 65 simple repeat sequence ( SSR ) markers, to analyze the polymorphism and inter-species relationship. According to the data, a total of 327 alleles were amplified from 65 SSR markers, with an average of 5.031 alleles per marker. The mean values of observed and expected heterozygosity were 0.387 and 0.588, respectively，while the mean values of the polymorphism information index was 0.524. The method of UPGMA clustered all the accessions into three groups. Group I included 3 djulis accessions only. Group II included 103 accessions, most of which were derived from USDA- NPGS and Chilean types. Group III included 60 accessions, most of which were derived from Bolivian and Peru types. The quinoa population was divided into two groups by population structure analysis and principal收稿日期：2020-09-11 修回日期：2020-09-24 网络出版日期：2020-10-15URL： /10.13430/kijpgr.20200911001第一作者研究方向为藜麦种质资源遗传多样性分析及其农艺和品质性状鉴定评价，E-mail:****************通信作者：秦培友，研究方向为黎麦种质资源鉴定评价和创新利用，E-mail:*****************基金项目：中国农业科学院科技创新工程专项经费（CAAS-ASTIP-2017-ICS )Foundation project： Agricultural Science and Technology Innovation Program of the Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS-ASTIP- 2017-ICS )626植物遗传资源学报22卷component analysis,and there was gene exchange between the two groups.The r e s ults indicate t h a t there i s a clear distinction between Bolivian,Peru accessions and American,Chilean accessions i n genetic information,and the genetic relationship of the accessions from Qinghai,and Yunnan i n China are closer t o Andean highland type, while the accessions from Hebei and Shanxi i n China are closer t o Chilean lowland type.Djulis i s a native plant i n Taiwan.Genetic diversity analysis of quinoa germplasm by SSR markers can predict i t s evolutionary pathway and genetic background,which provides a s c i e n t i f i c basis for biological research and breeding of quinoa.Key words：quinoa；SSR marker；genetic diversity；c l u ster analysis；population structure黎麦（Chenopodium quinoa Willd.)又称黎谷、南美藜、奎奴亚藜或昆诺阿藜，原产于南美洲安第 斯山[1]。
云南及不同地理分布粳稻的SSR遗传多样性分析
分子植物育种，2016年，第14卷，第12期，第3577－3587页Molecular Plant Breeding,2016,Vol.14,No.12,3577－3587研究报告Research Report云南及不同地理分布粳稻的SSR遗传多样性分析樊传章1,2*李娟1,3*伍腾飞1,5董陈文华1,3谭学林1,3文建成1,3褚启人4陈丽娟1,3**1云南农业大学稻作研究所,昆明,650201;2昆明学院生命科学与技术系,昆明,650214;3云南省高校滇型杂交粳稻分子育种重点实验室,昆明,650201;4Rice Technology Solutions,Inc.RTS,1925FM2917,Alvin;5湖南桃花源农业科技股份有限公司,长沙,410000*同等贡献作者**通讯作者,964136487@摘要亲本遗传背景狭窄是目前国内外粳稻育种面临的瓶颈问题，本研究旨在分析比较云南及国内外不同地理分布粳稻的遗传多样性及其差异。
结果表明：196份供试材料基于77个SSR标记可以划分为13个亚群，来自云南的125个材料在13个亚群中均有分布，来自华中单双季稻稻作区的材料大部分聚在了第11亚群，来自东北早熟单季稻稻作区的材料大部分聚在了第3亚群，来自台湾的材料大部分聚在第10亚群，来自美国的5个材料分别聚在第1、第4和第11亚群；根据地理分布6大类群的遗传多样性参数多重比较和聚类类型分析，云南材料的整体遗传多样性较高，其次是美国材料和华中稻作区材料，遗传多样性较低的是台湾材料；供试材料SSR标记的聚类与其地理分布具有很好的相关性，其中云南不同生态稻作区和不同育种系列粳稻相互关联、但高寒粳稻也有独立成亚群的趋势。
该研究为拓宽粳稻育种亲本遗传背景、创制新种质提供重要参考。
关键词水稻,粳稻,SSR,遗传多样性,种质创新SSR Analysis of Genetic Diversity in Japonica Rice(Oryza sativa L.) Collected from Yunnan and Various Geographical DistributionsFan Chuanzhang1,2*Li Juan1,3*Wu Tengfei1,5Dongchen Wenhua1,3Tan Xuelin1,3Wen Jianchen1,3Chu Qiren4Chen Lijuan1,3**1Rice Research Institute,Yunnan Agricultural University,Kunming,650201;2Biology and Technology Department of Kunming University,Kun-ming,650214;3Key Lab of Molecular Breeding for Dian-Type Japonica Hybrid Rice of Yunnan Education Department,Kunming,650201;4Rice Technology Solutions,Inc.RTS,1925FM2917,Alvin;5Hu Nan Taohuayuan Agricultural Technologies Co.LTD,Changsha,410000*These authors contributed equally to this work**Corresponding author,964136487@DOI:10.13271/j.mpb.014.003577Abstract The narrow genetic background of parental materials have become a bottle-neck problem in japonica breeding currently.This study was aimed to clarify and compare genetic diversity based on analysis of SSR makers in japonica rice collected from Yunnan and other areas of China as well as some foreign countries.The experimental results indicated that196study materials were divided into13sub-groups based on77pairs of SSR primers,among which125materials from Yunnan were separated into13sub-groups,whereas most materials coming from the single/double-cropping rice area of Central China were divided into11th sub-group,the materials coming from the early maturity single-cropping rice area of Northeast China were divided into3rd sub-group,the materials coming from Taiwan were divided into10th sub-group,the materials coming from America were divided into1st,4th and11th sub-group,respectively.By comparing the genetic diversity parameters and clusters of6groups based on geographical distribution,it was found that the highest genetic diversity of materials were come from基金项目：本研究由国家重点研发计划项目(2016YFD0101101)、NSFC－云南联合基金重点项目(U1136604)、国家重点基础研究973项目(2011CB100401)和云南省水稻产业技术体系(A3006516)共同资助分子植物育种Molecular Plant BreedingYunnan,the following materials were come from Central China and Northeast China,while the lowest genetic diversity of materials were come from Taiwan.Noticeably,sub-group classification of all study materials was highly consistent by cluster analysis of SSR molecular markers and geographical distributions,in which Yunnan japonica rice from different ecological zones and breeding series showed to be associated each other,but japonica rice from severe cold zone was tended to be divided into an independent sub-group.The present study offered an important reference for broadening the genetic background and innovation of new germplasms for japonica rice breeding.Keywords Rice(O.sativa L.),japonica rice,SSR,Genetic diversity,Innovation of germplasm水稻是世界上最重要的粮食作物之一，约三分之一的人口以水稻作为主食(朱昌兰等,2004)。
基于SSR分子标记吉安地区的水稻亲缘关系鉴定分析
基于SSR分子标记吉安地区的水稻亲缘关系鉴定分析郑卓;张天舒;李华;王莉莉;吴杨;贺卫东;孙惠敏【期刊名称】《井冈山大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2024(45)1【摘要】稻种亲缘关系分析是生产优质杂交水稻的必要条件。
本研究选取均匀分布于水稻基因组12条染色体的SSR分子标记,对8份水稻样品进行SSR分子标记分析,通过聚类分析法将其归类并计算得出遗传相似系数后,对8份水稻样品的亲缘关系进行了鉴定。
结果表明:所选取的8份水稻样品中,其相似系数为0.65~1.00,在遗传相似系数0.65处,8份水稻样品聚为两大类群,其中5号‘赣迟A04’单独为一类,其他水稻样品聚为一类。
在遗传相似系数0.80处,可划分为三大类群:第一类囊括了6种样品,表明这6个品种亲缘关系较近,其中6号‘赣早A02’与7号‘吉安早A07’疑似同一样品,3号‘井冈山迟A03’与4号‘井冈山早A05’的亲缘关系最近,而6号、7号同时与8号‘吉安迟A09’保持有最近的亲缘关系;第二类只含有2号‘迟-2’样品株;第三类则仅有5号稻株‘赣迟A04’,说明其与其他7份水稻样品的亲缘关系最远。
本研究结果为杂交水稻的应用提供重要信息。
【总页数】6页(P48-53)【作者】郑卓;张天舒;李华;王莉莉;吴杨;贺卫东;孙惠敏【作者单位】井冈山大学生命科学学院;吉安市青原区农业农村局;井冈山大学医学部【正文语种】中文【中图分类】S330.25;S511【相关文献】1.利用SSR分子标记鉴定若干玉米自交系的亲缘关系2.基于EST-SSR标记的南方型黑杨主栽无性系鉴定及亲缘关系分析3.基于SSR分子标记的三组水稻品种真实性鉴定分析4.基于荧光标记SSR基因分析技术的绿海龟人工繁育群体亲缘关系鉴定5.利用SSR分子标记鉴定若干玉米自交系的亲缘关系因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
青稞籽粒表型性状和品质性状遗传多样性分析
青稞籽粒表型性状和品质性状遗传多样性分析作者：王小强徐齐君曾兴权羊海珍来源：《安徽农业科学》2024年第02期摘要以328份來源不同区域的青稞种质资源为材料，对5个籽粒表型性状（长均值、宽均值、长/宽、直径和千粒重）和4个品质性状（总淀粉、直链淀粉、蛋白质和β-葡聚糖）进行了测定和遗传多样性分析。
结果显示，测定的9个性状在供试种质资源间均存在不同程度的差异。
青稞籽粒表型性状的变异系数变幅为6.23%～17.22%，品质性状的变异系数变幅为10.60%～27.34%。
9个性状遗传多样性指数均高于1.8，表明供试材料具有丰富的遗传多样性。
从区域上看，平均遗传多样性指数从高到低依次为国外、西藏山南、国内其他地区、西藏昌都、西藏日喀则、西藏拉萨、西藏林芝、西藏阿里。
关键词青稞；籽粒；表型性状；品质性状；遗传多样性中图分类号 S512.3 文献标识码 A文章编号 0517-6611（2024）02-0024-05doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2024.02.006开放科学（资源服务）标识码（OSID）：Genetic Diversity Analysis of Phenotypic and Quality Traits of Hulless Barley GrainsWANG Xiao-qiang1，2， XU Qi-jun1， ZENG Xing-quan1 et al（1.State key Laboratory of Hulless Barley and Yark Germplasm Resources and Genetic Improvement，Lhasa，Xizang 850002;2.Tibet Agricultural and Animal Husbandry University，Linzhi， Xizang 860000）Abstract With 328 hulless barley germplasm resources from different regions as test materials，5 grain phenotypic traits （including thousand grain weight， length/width， length mean， width mean and diameter）and 4 quality traits （including total starch， straight-chain starch， protein and β-glucan）were measured and genetic diversity analysis was carried out. The results showed that the test nine traits of hulless barley grains were significantly different. Variation coefficients of phenotypic traits ranged from 6.23% to 17.22%， where quality traits ranged from 10.60% to 27.34%. The genetic diversity index of nine traits were greater than 1.8， indicated that extensive genetic diversity were presented among the hulless barley germplasm. Regionally， the average genetic diversity index of nine traits was in the order of foreign area> Shannan of Xizang> the rest of the China> Chamdo of Xizang> Shigatse of Xizang> Lhasa of Xizang> Linzhi of Xizang> Ali of Xizang.Key words Highland barley;Grain;Phenotypic traits;Quality character;Genetic diversity基金项目国家自然科学基金联合基金项目（U20A2026）；重大科技专项（XZ2019NA01）；国家大麦青稞产业技术体系建设专项（CARS-05-01A-08）。
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基因组学与应用生物学,2011年,第30卷,第1174-1181页 Genomics and Applied Biology, 2011, Vol.30,1174-1181 http://gab.chinese.sophiapublisher.com
- 1174 - 研究报告 A Letter
云南迪庆藏族自治州青稞种质资源亲缘关系的SSR标记分析 郭钰1,2 李亚莉1,3 黄媛1 Devra Jarvis 4 Kazuhiro Sato 5 Kenji Kato 6 陈丽娟2 龙春林1,7 1中国科学院昆明植物研究所, 昆明, 650204; 2云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201; 3中国科学院研究生院, 北京, 100049; 4国际生物多样性中心, 罗马, 00057; 5冈山大学生物资源研究所,仓敷, 710-0046; 6冈山大学农学院, 冈山, 700-8530; 7中央民族大学生命与环境学院, 北京, 100081 通讯作者: long@mail.kib.ac.cn; 作者 基因组学与应用生物学, 2011年, 第30卷, 第27篇 DOI: 10.5376/gab.cn.2011.30.0027 收稿日期：2011年4月21日 接受日期：2011年5月25日 发表日期：2011年6月3日 这是一篇开放阅取的论文，其论文发布和传播接受《Creative Commons Attribution License》所有条款。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用、传播以及任何媒介的复制或再制作。 建议的引用格式如下： 郭钰等, 2011, 云南迪庆藏族自治州青稞种质资源亲缘关系的SSR标记分析, 基因组学与应用生物学, Vol.30 No.27 (DOI: 10.5376/gab.cn.2011.30.0027)
摘 要 为深入了解云南迪庆藏族自治州青稞的种质资源，用48对SSR引物研究了64份迪庆当地品种的遗传多样性。19
对引物表现出了良好的多态性，共扩增出70个等位基因，每对引物等位基因数目从2个到10个不等，平均值为3.68个。PIC值从0.03到0.87不等，平均值为0.30。64个青稞样品群体的He值为0.153 3。这表明迪庆州青稞具有较高的遗传多样性。所有64份青稞当地样品之间的遗传相似系数从0.102 6到1.000 0不等，平均值为0.696 7。64份样品与迪庆州引进的4份现代育成品种的遗传相似系数的平均值为0.725 3、0.743 8、0.723 7和0.7130。聚类分析表明在相似系数为0.632处将所有68份样品归为4类。聚类结果与材料来源、棱型和冬春性均无明显关系。有8份材料与4份测试品种未聚在一支，亲缘关系较远，可为杂交育种提供资料。本文首次对迪庆藏族自治州的青稞种质资源进行了较为全面的研究，并认为迪庆州具有丰富的青稞种质资源与当地复杂的环境以及当地藏族人民的生活文化习惯有关。 关键词 迪庆藏族自治州; 青稞; SSR; 遗传多样性
The Genetic Relationship Analysis of Naked Barley Germplasm Resources from Diqing Tibetan Autonomous Prefecture in Yunnan Province Revealed by SSR Markers
Guo Yu 1,2 Li Yali 1,3 Huang Yuan 1 Devra Jarvis 4 Kazuhiro Sato 5 Kenji Kato 6 Chen Lijuan 2Long Chunlin 1,2 1 Key Laboratory of Economic Plants and Biotechnology, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, 650204; 2 College of Agronomy and Biotechnology, Yunnan Agricultural University, Kunming, 650201; 3 Graduate University, Chinese Academy of Sciences, Beijing, 100049; 4 Bioversity International, Via dei Tre Denari, 472/a, Rome, 00057; 5 Research Institute for Bioresources, Okayama University, Kurashiki 12 710-0046; 6 Faculty of Agriculture, Okayama University, Okayama 700-8530; 7 College of Life and Environmental Sciences, Minzu University of China, Beijing, 100081 Corresponding author: long@mail.kib.ac.cn; Authors
Abstract To understand the naked barley germplasm resources from Diqing Tibetan Autonomous Prefecture in Yunnan Province,
the genetic diversity of 64 naked barley landraces from Diqing were studied by 48 pairs of SSR primers. Nineteen pairs of SSR markers showed polymorphism and a total of 70 alleles were detected. The number of alleles of each pair of primers ranged from 2 to 10 and the average was 3.68. The PIC value ranged from 0.03 to 0.87 and the average was 0.30. The value of He of the 64 barley population was 0.153 3.The results showed that naked barley of Diqing had a high genetic diversity. The similarity coefficient among 64 naked barley landraces ranged from 0.102 6 to 1.000 0 and the average was 0.696 7. The averages of similarity coefficient among 64 naked barley landraces and 4 modern cultivars were 0.725 3, 0.743 8, 0.723 7 and 0.713 0. The cluster analysis revealed that the 68 samples were divided into 4 groups. The characters of collection origins, row type and spring/fall type had not related to groups from cluster analysis. Eight samples were not congregated with 4 test cultivars, which indicated that they were distant from 4 test cultivars in genetic relationship and had the value in further breeding. This paper gave a detailed research in the naked barley 基因组学与应用生物学,2011年,第30卷,第1174-1181页 Genomics and Applied Biology, 2011, Vol.30,1174-1181 http://gab.chinese.sophiapublisher.com
- 1175 - germplasm resources from Diqing Tibetan Autonomous Prefecture for the first time and indicated that the abundant the naked barley germplasm resources were caused by the complicated environment and the Zang’s customs of daily life and culture. Keywords Diqing Tibetan Autonomous Prefecture; Naked barley; SSR, Genetic diversity
研究背景 青稞(Hordeum vulgare L. var. nudum Hook. f.)在分类学上属于禾本科(Poaceae)、大麦属(Hordeum)、多棱裸粒大麦变种。在藏族地区称为青稞，在其它地区称为裸大麦、米大麦、元麦等。青稞与皮大麦最大的区别在于成熟后，青稞的籽壳与颖果易分离，而皮大麦的籽壳与颖果不易分离。
青稞一般具有食用、饲用、酿酒等用途。青稞炒面，俗称糌粑，是藏族人民的主食。青稞也是一种很好的饲料作物，营养丰富、饲喂品质好，使它在谷物饲料中的地位仅次于玉米。另外，以青稞为原料酿造而成的青稞酒也具有悠久的历史。近年来，随着人们生活水平的提高以及对健康的日益关注，青稞也被加工成保健品进入市场(江春艳等, 2010, 西藏科技, 203(2): 14-16)。
青稞在中国主要分布于青藏高原地区，包括西藏、青海、甘肃、云南和四川这5个省的全部或部分地区。前人对中国青稞种质资源的研究主要集中在西藏、青海及四川地区。Zeng等(2002)用RAPD标记分析了23份西藏大麦品种，用5对引物扩增出44条多态性带，表明这些大麦品种存在着丰富的遗传变异。Feng等(2006)用35对SSR引物研究了来自西藏、青海和四川这3个省的65份青稞当地品种，结果表明西藏青稞显示了最高的多样性。潘志芬等(2007)用淀粉粒蛋白组成评估了青藏高原栽培青稞的遗传多样性，结果表明西藏地区青稞的遗传多样性很丰富。杨平等(2008)利用SRAP标记对25份来自四川的青稞育成品种进行了遗传多样性分析，结果显示这些青稞遗传基础较为狭窄。段瑞君等(2010)测定了青海省主要种植的青稞品种的染色体核型，结果表明这这些品种在核型存在一定分化。仅张建华等(2009)对云南各个地区青稞的品种亲缘关系做了SSR分析，其中包括云南西北部迪庆州的少部分青稞品种。