电子实验记录本研究

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电子实验记录本研究

作者:李丹

来源:《无线互联科技》2019年第13期

摘; ;要:电子实验记录本是一种安全、可靠的软件系统,它汇聚多种来源的实验数据,支持记录实验的完整过程和结果,并将其打包成法律法规认可的文件,支持搜索、协作和数据挖掘。由于满足法规要求和电子数据易搜索和协作的优势,ELN引起了企业、高校科研和管理人员的广泛关注。文章从ELN的基础知识入手,详细介绍了ELN的定义、历史、品牌(如InELN)和现状,及对未来的展望。

关键词:ELN;LIMS;实验室数据;数字化实验室

随着技术的进步,电子化数据急剧增加,特别是搜索、协作需求的不断增长,不易协作的纸质实验记录本正在消失,电子实验记录本(Electronic Lab Notebook,ELN)正在快速发展,实现了实验数据电子采集、搜索、共享、轻松备份、访问和数据挖掘等。电子实验记录本可作为法律文件,在法庭上用作证据,用于解决知识产权纠纷,被各国制药监管部门认可。制药行业是电子实验记录本研发和使用的早期推动者,2007年国际主流制药公司均已经上线电子实验记录本[1],农业、精细化工和石化公司也纷纷加入。本文系统地介绍了ELN的定义、用途、分类、组成、合规性和主流ELN供应商,如InELN,E-notebook等,分析了ELN与实验室信息管理系统(Lab Information Management System,LIMS)的不同,最后对ELN的历史和未来进行了总结和展望。

1; ; 电子实验记录本的定义

根据美国欧洲和日本国家船东协会委员会的定义,电子实验记录本为“满足所有法律、法规、技术和科学专业性要求,用于创建、存储、检索和共享完整数据的电子实验记录系

统”[2]。

2; ; 电子实验记录本的用途

Michael等[3]调研发现,94%的科学家认为传统的纸质数据管理存在挑战,20%的人在“需要时找不到想要的数据”,10%的人在“分享数据和信息时有困难”,9%的人在“协作、更新数据时有问题”。

ELN能促进实验记录及时、准确、完整地记录,ELN避免了低效的手写,可被身处不同国家和地区的研究团队同时在线使用[4]。

ELN的使用显著提高了科研人员、同行评审员和研发主管的工作效率[5]。ELN用户可以迅速整理和提交电子记录。食品药品监督管理局不再需要翻阅数千页文件,而是直接搜索,加速了审评效率,加速药物快速上市,有助于提前占领市场。

2011年Atrium Research[6]的报告显示,科学家使用电子实验记录本,促进了信息的查找和重复使用以及更有效的协作。相较于纸质记录流程,可以有效提升20%的研发效率。这意味着如果有100人的研发团队,将可空余出20人的研发力量,用于投入更多的研发项目或更深入的研究。

据Vines等[7]研究,使用纸质实验记录本时,由于人员流动、潮湿污染、发霉虫蛀等影响,每年平均数据流失率高达17%。

3; ; 电子实验记录本的分类

ELN以复杂程度来区分,可分为基础版、专业版和高端版[8]。基础版ELN是一种文字处理器或文字记录系统,如Word。由于缺乏审计追踪功能,不能作为证据使用,不能保护知识产权。

专业版ELN必须包含合规的电子签名和审计追踪等功能[9],以保护知识产权或满足监管层的要求,代表品牌有InELN专业版、IDBS等。

高端版ELN除了包括其他版本ELN的所有功能外,还要满足化学、生物等各类型实验的专业要求,如具备ChemDraw或InDraw结构式编辑器(兼容cdx文件)、多功能电子表格、自定义模板、与其他系统如LIMS,SDMS,CDS对接(需个性化定制,预算高)、仪器对接(需个性化定制,预算高)等功能。代表品牌有InELN高端版、E-notebook等。

4; ; 电子实验记录本的产品形式

ELN有2种产品形式:客户/服务器模式(Client/Server,C/S)架构和浏览器/服务器模式(Browser/Server,B/S)架构。传统的C/S架构:客户端+本地服务器,要求在個人电脑上安装ELN的客户端软件,同时,也要在客户服务器上安装ELN服务器端软件和数据库。

现代的B/S架构:本地服务器或云服务器部署,只需用户电脑上安装了浏览器,即可使用ELN,可以跨平台,支持在台式机、平板电脑、手机或其他移动设备上使用。

5; ; 电子实验记录本的产品组成

ELN主要由以下模块组成:人员和权限模块、记录模块、文本和表格编辑、文件管理、模板管理、协作模块、审核管理、审计追踪(Audit trail)、电子签名、导入导出管理、存档备份管理、安全模块、项目管理等。

6; ; 电子实验记录本的合规性

ELN要合规,需主要满足FDA、国家药品监督管理局(National Medical Products Administration,NMPA)、欧盟药品生产质量管理规范(Good Manufacturing Practices,

GMP)相关的法规,如:(1)FDA 21 CFR Part 11。(2)《药物非临床研究质量管理规范》(国家食品药品监督管理总局令第34号)。(3)中国GMP中计算机化系统相关电子数据条款。(4)欧盟GMP条款中电子记录条款Annex 11。

7; ; ELN与LIMS的区别

ELN系统是知识管理的解决方案,不是工作流程解决方案。ELN适用于创新、多变的方法发现或样品数据记录和管理,处于拟生产或生产阶段之前[10]。

LIMS是一种实验室工作流程解决方案,以样品数据质量和合规性为核心。此处的样品指拟生产或生产中抽样的样品。

簡而言之,ELN更适合于研发阶段的价值发现和创新发现,LIMS更适合于生产或拟生产阶段的质量管理。国际主流的制药企业,ELN和LIMS均会独立采用,分别用于研发和生产(或试生产)阶段的数据管理。因为二者研究内容迥异,研究人员不同,数据互通的需求不高,二者一般独立使用。在个案中,二者数据可以通过应用程序编程接口对接。

8; ; 挑选电子实验记录本的方法

电子实验记录本在全球有近50家活跃的供应商,中国境内活跃的供应商不超过10家,主要包括Integle鹰谷电子实验记录本(InELN),PE E-notebook,IDBS,达索BIOVIA Workbook等。

如何挑选适合自己的电子实验记录本,需要确定以下问题:(1)公司对电子实验记录本的核心需求是什么,如合规、数据规范、数据搜索和分享等。(2)需要ELN具备什么样的专业属性,如化学结构式编辑器(是否与cdx兼容)、兼容多学科要求等。(3)ELN软件是否简单易用。(4)ELN软件是B/S(电脑上打开浏览器即可使用)还是C/S(每台电脑上安装软件后才能使用)架构。一般B/S易于维护,实施和维护成本低。(5)供应商是否有

GMP/GLP的ELN客户实施案例。(6)ELN软件是否部署在公有云,还是公司内部服务器上。(7)公司的预算是多少,能否承担昂贵的个性化需求定制费用。

9; ; 电子实验记录本的使用历史

弗吉尼亚理工大学Raymond E.Dessy博士在20世纪80年代中期开始设想电子记录本的概念,到1994年他提供了ELN的第一个工作实例。直到2000年6月的“全球和国家商业电子签名法案”(ESIGN)出台,意味着电子签名具有法律约束力,从而确认了ELN的合法地位。

在2017年7月,中国NMPA颁发了《药物非临床研究质量管理规范》,确定了电子数据可以代替纸质数据,电子签名与手写签名具有相同的法律效力。从那时起,中国的ELN开始快速发展。

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