生物化学—名词解释

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核苷nucleoside:是嘌呤或嘧啶碱通过共价键与戊糖连接组成的化合物。核糖与碱基一般都是由糖的异头碳与嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之间形成的β-N-糖键连接

核苷酸nucleotide:核苷的戊糖成分中的羟基磷酸化形成的化合物

cAMP cycle AMP:3ˊ,5ˊ-环腺苷酸,是细胞内的第二信使,由于某部些激素或其它分子信号刺激激活腺苷酸环化酶催化ATP环化形成的

磷酸二脂键phosphodiester linkage:一种化学基团,指一分子磷酸与两个醇(羟基)酯化形成的两个酯键。该酯键成了两个醇之间的桥梁。例如一个核苷的3ˊ羟基与别一个核苷的5ˊ羟基与同一分子磷酸酯化,就形成了一个磷酸二脂键

脱氧核糖核酸DNA:含有特殊脱氧核糖核苷酸序列的聚脱氧核苷酸,脱氧核苷酸之间是通过3ˊ,5ˊ-磷酸二脂键连接的。DNA是遗传信息的载体

核糖核酸RNA:通过3ˊ,5ˊ-磷酸二脂键连接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸

转化transformation:一个外源DNA 通过某种途径导入一个宿主菌,引起该菌的遗传特性改变的作用

转导transduction:借助于病毒载体,遗传信息从一个细胞转移到另一个细胞。

碱基对base pair:通过碱基之间氢键配对的核酸链中的两个核苷酸,例如A与T或U,以及G与C配对

夏格夫法则Chargaff’s rules:所有DNA中腺嘌呤与胸腺嘧啶的摩尔含量相等(A=T),鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔含量相等(G=C),既嘌呤的总含量相等(A+G=T+C)。DNA的碱基组成具有种的特异性,但没有组织和器官的特异性。另外,生长和发育阶段`营养状态和环境的改变都不影响DNA的碱基组成

拓扑异构酶topoisomerse:通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键,然后重新缠绕和封口来改变DNA连环数的酶。拓扑异构酶Ⅰ、通过切断DNA中的一条链减少负超螺旋,增加一个连环数。某些拓扑异构酶Ⅱ也称为DNA促旋酶

染色质chromatin:是存在与真核生物间期细胞核内,易被碱性染料着色的一种无定形物质。染色质中含有作为骨架的完整的双链DNA,以及组蛋白`非组蛋白和少量的DNA

染色体chromosome:是染色质在细胞分裂过程中经过紧密缠绕、折叠、凝缩和精细包装形成的具有固定形态的遗传物质存在形式。简而言之,染色体是一个大的单一的双链DNA分子与相关蛋白质组成的复合物,DNA中含有许多贮存和传递遗传信息的基因

退火annealing:即DNA由单链复性、变成双链结构的过程

增色效应hyperchromic effect:当双螺旋DNA熔解(解链)时,260nm处紫外吸收增加的现象

减色效应hypochromic effect:随着核酸复性,紫外吸收降低的现象

反向重复序列inverted repeat sequence:在同一多核甘酸内的相反方向上存在的重复的核甘酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成

Tm值:再利用升温进行DNA双链解链过程中,当吸光度A260的变化值达到最大变化值的一半时所对应的温度定义为DNA的解链温度Tm

DNA变性denaturation of DNA:由于某些理化因素导致DNA双联互补碱基对之间的氢键发生断裂,使双链DNA解离为两个单链

核酸分子杂交hybridization of nucleic acids:不同DNA与DNA之间,RNA与RNA之间,DNA 与RNA之间通过复性形成碱基配对关系

核酸酶ribozyme:所有可以水解核酸的酶,可分为DNA酶和RNA酶。DNA酶还可以分为核酸内切酶和核酸外切酶。核酸酶能够催化细胞内外核酸的降解

基因组genome:一个生物体全部的遗传信息,即DNA的全部核苷酸序列

核小体nucleosome:染色质的基本组成单位,由DNA和组蛋白共同构成

从头合成de novo synthesis:利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及CO2等简单物质为原料合成嘌呤或嘧啶核苷酸的过程

补救合成salvage synthesis:利用体内游离嘌呤或嘧啶碱基和游离嘌呤或嘧啶核苷,经简单反应过程生成嘌呤或嘧啶核苷酸的过程

痛风gout:是尿酸过量生产或尿酸排泻不充分引起的尿酸堆积造成的,尿酸结晶堆积在软骨,软组织,肾脏以及关节处。在关节处的沉积会造成剧烈的疼痛

Lesch-Nyhan综合症Lesch-Nyhan syndrome:也称为自毁容貌症,是由于次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶的遗传缺陷引起的。缺乏该酶使得次黄嘌呤和鸟嘌呤不能转换为IMP和GMP,而是降解为尿酸,过量尿酸将导致Lesch-Nyhan综合症。

半保留复制semiconservative replication:DNA复制的一种方式。每条链都可用作合成互补链的模板,合成出两分子的双链DNA,每个分子都是由一条亲代链和一条新合成的链组成

复制叉replication fork:Y字型结构,在复制叉处作为模板的双链DNA解旋,同是合成新的DNA链。

DNA聚合酶DNA polymerase:以DNA为模板,催化核苷酸残基加到已存在的聚核苷酸3ˊ末端反应的酶。某些DNA聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用来校正新合成的核苷酸的序列。

Klenow片段Klenow fragment:E.coli DNA聚合酶I经部分水解生成的C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性

前导链leading strand:与复制叉移动的方向一致,通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA 链

后随链lagging strand:与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA 链

冈崎片段Okazaki fragment:DNA复制时,随后链复制中的不连续片段

互补DNA cDNA:通过逆转录酶由mRNA模板合成的双链DNA。

端粒telomere:真核生物染色体线性DNA分子末端的结构,由DNA简单重复序列以及同这些序列专一性结合的蛋白质构成

框移突变:三联体密码的阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变,其结果是翻译出的蛋白质可能完全不同

切除修复excision repair:细胞内最重要的修复机制,主要由DNA聚合酶Ⅰ及连接酶执行

直接修复direct repair:是通过一种可连续扫描DNA,识别出损伤部位的蛋白质,将损伤部位直接修复的方法。该修复方法不用切断DNA或切除碱基

错配修复mismatch repair:在含有错配碱基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式。这种修复方式的过程是:识别出下正确地链,切除掉不正确链的部分,然后通过DNA 聚合酶和DNA连接酶的作用,合成正确配对的双链DNA

反转录:以RNA为模版在反转录酶的作用下合成DNA的过程

引发体primosome:复制起始时形成的,原核生物DnaB、DnaC、DnaG等蛋白质结合到DNA 起始复制区域形成的复合结构

转录transcription:在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复合物的催化下,从双链DNA 分子中拷贝生物信息生成一条RNA链的过程

转录启动子:位于转录起始5’上游端,由RNA-pol识别并结合的DNA序列

不对称转录asymmetric transcription:转录以基因的一条链为模版,另一条为编码链(不转录),染色体DNA的各种基因转录并不都在同一条链上,故称为不对称转录

编码链coding strand:转录中与模版链互补的DNA链,因其碱基序列、走行方向与转录产

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