基因工程作业(引物设计)

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基因工程作业

基因工程作业

1、DNA载体经HindⅢ切割后产生粘性末端,能发生载体自连,影响载体与外源DNA的连接效率,常用的防止载体自连的方法有碱性磷酸酶处理使5’磷酸基团羟基化。

2、切口平移是指在DNA聚合酶Ⅰ的作用下,使5’磷酸基团带上放射性标记。

在酶切缓冲液中,一般需加入BSA,请问加入BSA的作用是提高蛋白质浓度防止酶失活。

3、下列哪一种酶作用时需要引物(B)反转录酶在作用时需要DNA聚合酶,而后者需要引物A、末端转移酶B、反转录酶C、DNA 连接酶D、限制酶4、下列DNA片段,最可能含有SstI 酶切位点的是(A)AGGAGAGCCTCT BGAGCACA TCT CCCCTGTGGGADA TCCTACATG EAACCTTGGAADNA连接酶的作用特点有哪些?1、DNA 3’端有游离的-OH,5’端有一个磷酸基团(P)2、需要能量、Mg2+3、被连接的DNA链必须是双螺旋的一部分4、只封闭双螺旋DNA骨架上的nick大肠杆菌DNA聚合酶I有哪些不同的酶活力特性,各有何利用价值。

1、5’—3’聚合酶活性:以DNA为模板利用四种dNTP合成DNA链2、3’—5’外切酶活性:主要起校对作用3、5’—3’外切酶活性:从5’端降解DNA分子何谓Star activity?简述Star activity 的影响因素及克服方法?限制性内切酶的识别和酶切活性一般在一定的温度、离子强度、pH等条件下才表现最佳切割能力和位点的专一性。

当条件改变时,许多酶的识别位点会改变,导致识别与切割序列的非特异性,称为星号(*)活性。

(1)高甘油含量(>5%, v/v);(2)限制性内切核酸酶用量过高(>100U/ugDNA);(3)低离子浓度(<25 mmol/L);(4)高pH(8.0以上);(5)含有机溶剂,如DMSO(二甲基亚砜),乙醇等;(6)有非Mg2+的二价阳离子存在(如Mn2+,Cu2+,Co2+,Zn2+等)。

基因工程作业(引物设计)讲解

基因工程作业(引物设计)讲解

口腔鳞癌组织中肿瘤转移相关基因1(MTA1)一、选择原因及应用口腔鳞癌组织中肿瘤转移相关基因1(MTA1)在蛋白和mRNA的表达水平,揭示其与口腔鳞癌(OSCC)发生、发展的关系。

方法采用免疫组织化学法和原位杂交技术检测46例OSCC标本、15例口腔黏膜白斑与20例正常口腔黏膜标本中MTAl 基因的表达水平,并分析其与OSCC临床病理学参数的关系。

结果MTA1蛋白和MTA1mRNA在OSCC组织中的表达水平显著高于口腔黏膜白斑和正常口腔黏膜(P 〈0.05),口腔黏膜白斑中MTA1蛋白和MTA1mRNA表达水平显著高于口腔正常黏膜(P〈0.01),MTA1蛋白和MTA1mRNA表达与肿瘤浸润深度和淋巴结转移密切相关(P〈0.05)。

结论MTA1基因在蛋白和mRNA的表达水平在OSCC发生、发展及浸润转移过程中起一定促进作用,有望成为判断OSCC预后及选择治疗方案的一个新肿瘤标志物。

二、2查阅NCBI得到MTA1相关信息并获得目的基因PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla metastasis associated 1 (MTA1), mRNANCBI Reference Sequence: XM_004055801.1FASTA GraphicsLOCUS XM_004055801 2872 bp mRNA linear PRI 03-DEC-2012DEFINITION PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla metastasis associated 1 (MTA1),mRNA.ACCESSION XM_004055801VERSION XM_004055801.1 GI:426378238KEYWORDS .SOURCE Gorilla gorilla gorilla (western lowland gorilla) ORGANISM Gorilla gorilla gorillaEukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;Catarrhini; Hominidae; Gorilla.COMMENT MODEL REFSEQ: This record is predicted by automated computationalanalysis. This record is derived from a genomic sequence(NW_004005914) annotated using gene prediction method: GNOMON,supported by mRNA and EST evidence.Also see:Documentation of NCBI's Annotation Process##Genome-Annotation-Data-START##Annotation Provider :: NCBIAnnotation Status :: Full annotationAnnotation Version :: Gorilla gorilla Annotation Release 100Annotation Pipeline :: NCBI eukaryotic genome annotation pipelineAnnotation Method :: Best-placed RefSeq; Gnomon Features Annotated :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA##Genome-Annotation-Data-END##FEATURES Location/Qualifierssource 1..2872/organism="Gorilla gorilla gorilla"/mol_type="mRNA"/sub_species="gorilla"/db_xref="taxon:9595"/chromosome="14"gene 1..2872/gene="MTA1"/note="Derived by automated computational analysis usinggene prediction method: GNOMON. Supporting evidence/codon_start=1/product="metastasis-associated protein MTA1"/protein_id="XP_004055849.1"/db_xref="GI:426378239"/db_xref="GeneID:101134898"/translation="MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVC FYRRRDISSTLIALADKHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQ LRHRELFLSRQLESLPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTL LADKGEIRVGNRYQADITDLLKEGEEDGRDQSKLETKVWEAHNPLTDKQIDQFLVVAR SVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQG GPVLCRDEMEEWSASEANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTD RYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYNKPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRA CESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSP HGLPARSSGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAI KAECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPA KVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGVDGNMKKRLLMPSRGLANHGQTRHMGPSRNLLLN GKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYMATEETRKIRKLLSSSETKRAAR RPYKPIALRQSQALPLRPPPPAPVNDEPIVIED" ORIGIN1 tcctcctctt cctctcccgc ccgcgccgcg gccctcccgt ccctgcgcgg cctcggcggc61 ctcggcggcg gcggcggcgg cggcggcagc agcgcggccc ctttaaacgc ctgcggcgccgcgccgagcg ccgcgcccgcaacatgtaca gggtcggaga241 ctacgtctac tttgagaact cctccagcaa cccatacctg atccggagga tcgaggagct301 caacaagacg gccaatggga acgtggaggc caaagtggtg tgcttctacc ggaggcggga361 catctccagc accctcatcg ccctggccga caagcacgca accctgtcag tctgctataa421 ggccggaccg ggggcggaca acggcgagga aggggaaata gaagaggaaa tggagaatcc481 ggaaatggtg gacctgcccg agaaactaaa gcaccagctg cggcatcggg agctgttcct541 ctcccggcag ctggagtctc tgcccgccac gcacatcagg ggcaagtgca gcgtcaccct601 gctcaacgag accgagtcgc tcaagtccta cctggagcgg gaggatttct tcttctattc661 tctagtctac gacccacagc agaagaccct gctggcagat aaaggagaga ttcgagtagg721 aaaccggtac caggcagaca tcaccgactt gttaaaagaa ggcgaggagg atggccgaga781 ccagtccaag ttggagacca aggtgtggga ggcgcacaac ccactcacag acaagcagat841 cgaccagttc ctggtggtgg cccgctctgt gggcaccttc gcacgggccc tggactgcag901 cagctccgtc cgacagccca gcctgcacat gagcgccgca gctgcctccc gagacatcac961 gctgttccac gccatggata ctctccacaa gaacatctat gacatctcca aggccatctc1021 ggcactggtg ccgcagggcg ggcccgtgct ctgcagggac gagatggagg agtggtctgc1081 atcagaggcc aaccttttcg aggaagccct ggaaaaatat gggaaggatt tcacggacat1141 tcagcaagat tttctcccgt ggaagtcgct gaccagcatc attgagtact actacatgtg1201 gaagaccacc gacagatacg tgcagcagaa acgcttgaaa gcagctgaag ctgagagcaa1261 gttaaagcaa gtttatattc ccaactataa caagccaaat ccgaaccaaa tcagtgtcaa1321 caacgtcaag gccggtgtgg tgaatggcac gggggcgccg ggccagagcc ctggggctgg1381 ccgggcctgc gagagctgtt acaccacaca gtcttaccag tggtattctt ggggtccccc1441 taacatgcag tgtcgtctct gcgcatcttg ttggacatat tggaagaaat atggtggctt1501 gaaaatgcca acccggttag atggagagag gccaggacca aaccgcagta acatgagtcc1561 ccacggcctc ccagcccgga gcagcgggag ccccaagttt gccatgaaga ccaggcaggc1621 tttctatctg cacacgacga agctgacgcg gatcgcccgg cgcctgtgcc gtgagatcct1681 gcgcccgtgg cacgctgcgc ggcaccccta cctgcccatc aacagtgcgg ccatcaaggc1741 cgagtgcacg gcgcggctgc ccgaagcctc ccagagcccg ctggtgctga agcaggcggt1801 acgcaagccg ctggaagccg tgcttcggta tcttgagacc cacccccgtc cccccaagcc1861 tgaccccgtg aaaagcgtgt ccagcgtgct cagcagcctg acgcccgcca aggtggcccc1921 cgtcatcaac aacggctccc ccaccatcct gggcaagcgc agctacgagc agcacaacgg1981 ggtggacggc aacatgaaga agcgcctctt gatgcccagt aggggtctgg caaaccacgg2041 acagaccagg cacatgggac caagccggaa cctcctgctc aacgggaagt cctaccccac2101 caaagtgcgc ctgatccggg ggggctccct gcccccagtc aagcggcggc ggatgaactg2161 gatcgacgcc ccggatgacg tgttctacat ggccacagag gagaccagga agatccgcaa2221 gctgctctca tcctcggaaa ccaagcgtgc tgcccgccgg ccctacaagc ccatcgccctgcgcccgtca acgacgagccgccccccgcc cctcgcccgc2401 ccacacggcc ccttcccagc cagcccgccg cccgcccctc agtttggtag tgccccacct2461 cccgccctca cctgcagaga aacgcgctcc ttggcggaca ctgagggagg agaggaagaa2521 gcgcggctaa cttattccga gaatgccgag gagttgtcgt ttttagcttt gtgtttactt2581 tttggctgga gcggagatga ggggccaccc cgtgcccctg tgctgcgggg ccttttgccc2641 ggaggccggg ccctaaggtt ttgttgtgtt ctgttgaagg tgccgtttta aattttattt2701 ttattacttt ttttgtagat gaacttgagc tctgtaactt acacctggaa tgttaggatc2761 gtgcggccgc ggccggccga gctgcctggc ggggttggcc cttgtctttt caagtaattt2821 tcatattaaa caaaaacaaa gaaaaaaatc ttataaaaag gaaaaaaacc aa//三、表达载体的选择我所选用的原核表达载体为质粒pBR322;pBR322 是一种常用的E. coli 克隆载体(1),为4,361 bp 的环状双链DNA(2)。

引物设计

引物设计

无任何特异性
03
目的基因的获取-PCR引物设计
特异引物设计:
通用引物设计:
1、扩增的完整序列完全已知 1、扩增保守的同源基因
2、扩增序列长度要≥CDS
2、扩增序列长度一般<CDS
3、引物长度18-22,得分高
3、一般测序用
4、要blast
4、不用个人设计
5、测序时要提供引物,连到T载 5、测序不需要提供引物
03
PART THREE
引物设计原则和方法
03
目的基因的克隆
基因工程的主要目的是把经过遗传学和分子生物学前期 研究探明了结构与功能的靶基因(target gene)转导 宿主细胞中表达,以大量获取该基因的产物或改变宿主 性状。由此可见,如何分离得到靶基因是基因工程操作 的关键步骤之一,否则“巧妇难为无米之炊”。
序不好进行
3、 随机6或9个mers
4、要获得完整基因要做步移
PCR或反向PCR或测完整基因组
03
目的基因的获取-PCR引物设计
引物设计软件: 1、Oligo 6 2、Primer premier 5/6 3、Dnastar 4、Primer 3plus(在线)
03
目的基因的获取-PCR引物设计
引物二聚体
发夹结构
03
目的基因的获取-PCR引物设计
引物设计种类:
引物
克隆引物 表达引物
特异引物Specific
primers
只扩增某一类基因或生物
通用引物Universal 与基因两端基因匹配(载体)
Primers
兼并引物Degenerate 可以扩增某一类相似基因
Primers
随机引物
Random primers

基因工程实验操作作业指导书

基因工程实验操作作业指导书

基因工程实验操作作业指导书前言:在进行基因工程实验操作之前,请确保已经具备相应的实验知识和技能,并遵守实验室的安全规定。

本实验操作指导书将详细介绍基因工程实验的步骤和注意事项,以确保实验顺利进行。

一、实验前准备1.确认实验的目的和所需材料:确定需要进行的基因工程实验目标,并准备所需的各种试剂、细胞培养物和实验器材。

2.实验室安全措施:穿戴实验室要求的个人防护装备,遵守实验室的规章制度。

确保实验室电源和排风系统正常运行。

二、实验步骤1.基因克隆a) DNA提取:从源生物体中提取DNA样本,利用适当的提取方法将DNA纯化并获得高质量的DNA。

b) PCR扩增:设计引物,进行PCR扩增反应,使目标基因扩增到所需的浓度。

c) 酶切:使用限制性内切酶对目标基因和载体进行酶切,创建黏性末端适配体。

d) 连接:将目标基因与载体连接,形成重组DNA。

e) 转化:将重组DNA转化到适宜的宿主细胞中,使其能够被宿主细胞内的酶复制和表达。

2.细胞培养a) 培养基准备:根据实验需求制备适宜的培养基。

b) 细胞传代:将宿主细胞进行传代,以保持活性和生长状态。

c) 质粒提取:从转化后的细菌中提取质粒DNA,作为后续实验的样本。

d) 菌液预处理:将细菌培养物进行适当的处理,如离心、洗涤等。

3.基因表达a) 表达培养条件控制:设置适宜的温度、培养时间和培养基成分,以获得高效的基因表达。

b) 转录与翻译:利用适当的启动子和加入适量的诱导剂,实现基因转录和翻译。

c) 蛋白质纯化:根据需要,对表达的蛋白质进行纯化,确保其纯度和活性。

4.实验结果分析a) 凝胶电泳:使用凝胶电泳分析方法,判断基因工程实验的成功与否。

b) 荧光检测:通过荧光标记的方法检测基因表达程度。

c) 其他分析方法:根据实验目的及需求,选择适当的分析方法进行结果分析。

三、实验操作注意事项1.实验室安全:佩戴手套、实验外套、护目镜等个人防护装备,避免实验材料和试剂对人体造成伤害。

基因工程pcr引物设计原则

基因工程pcr引物设计原则

基因工程pcr引物设计原则### PCR Primer Design Principles for Gene Engineering.PCR primer design is critical for successful gene engineering experiments. Well-designed primers ensure efficient and specific amplification of the target DNA sequence. Here are some key principles of PCR primer design:1. Specificity: Primers should be designed to bind specifically to the target DNA sequence. This is achievedby choosing primers with sequences complementary to theends of the target region. Mismatches between the primerand target sequence can lead to non-specific amplificationor primer-dimer formation.2. Melting Temperature (Tm): The Tm is the temperatureat which half of the primer molecules are bound to thetarget DNA sequence. Primers with Tm values close to the annealing temperature (Ta) ensure efficient primer binding without compromising specificity. Generally, the Tm shouldbe between 55-65°C.3. Length: Primers should be around 18-25 nucleotides long. Longer primers provide more specificity but can be difficult to synthesize. Shorter primers are easier to synthesize but can have lower specificity.4. GC Content: Primers with a GC content of 40-60% are optimal. Higher GC content can increase Tm, while lower GC content can decrease Tm.5. Avoid Secondary Structures: Primers should be designed to minimize the formation of secondary structures such as hairpins or dimers. These structures can interfere with primer binding and amplification efficiency.6. Use Degenerate Primers for Mismatched Targets: If the target DNA sequence has mismatches or is unknown, degenerate primers can be used. Degenerate primers contain ambiguous nucleotides (e.g., N or I) that can bind to multiple target sequences.### 中文回答:基因工程 PCR 引物设计原则。

引物设计的详细步骤

引物设计的详细步骤

引物设计的详细步骤引物设计是一项关键的实验技术,用于在分子生物学实验中扩增目标DNA片段。

该技术的成功与否直接影响到实验结果的准确性和可靠性。

以下是引物设计的详细步骤:1.确定目标DNA序列:首先,确定需要扩增的目标DNA序列。

这可以通过已知的参考序列、文献调研或基因数据库进行。

2.定位扩增区域:根据目标DNA序列,确定需要扩增的特定区域。

通常选择在该区域中的保守性较高的片段,以确保引物的特异性。

3. 确定引物长度:引物长度通常为18-25个核苷酸(nt),最好不超过30nt。

引物长度的选择是为了确保引物在反应温度下的特异性和稳定性,同时不会引起非特异扩增。

4.碱基组成与G/C含量:引物的碱基组成应平衡,避免过多的同质二聚物和结构异常。

G/C含量一般在40-60%之间,过高或过低的G/C含量可能会导致引物与模板DNA结合的效力降低。

5.特异性:使用基因序列数据库或引物设计软件进行引物BLAST比对,确保引物与目标DNA序列的独特性。

6. 避免互补引物间的二聚体形成:引物间不能有太多相互衔接的序列,以免引物自身形成二聚体。

通常应避免引物间的结合自由能低于-9 kcal/mol。

7.避免引物内部二聚体的形成:通过引物设计软件计算引物的内部二聚体结合自由能,避免过多的二聚体形成。

8.引物末端设计:通常引物的末端应设计在较保守的区域,以确保扩增的特异性。

9.引物的副产物与杂交:避免引物自身产生副产物以及与其他非特异目标DNA序列杂交。

10.引物设计验证:使用引物设计软件对设计的引物进行验证,包括引物特异性、二聚体和杂交等。

11.引物合成:通过合成引物的商业公司进行引物合成,选择信誉好的厂家。

12.引物纯化:使用聚丙烯酰胺凝胶电泳等方法对引物进行纯化。

13.引物浓度测定:使用紫外分光光度计等方法测定引物的浓度。

总之,引物设计是一项细致而复杂的步骤,需要考虑多个因素,如目标DNA序列,引物长度,碱基组成,特异性和二聚体等。

基因工程选引物的典型例题及解析

基因工程选引物的典型例题及解析

基因工程选引物的典型例题及解析基因工程是一门前沿的生物学技术,它涉及到对生物体的基因进行改造和调控。

在基因工程中,选取合适的引物是至关重要的一步,因为引物的选择直接影响到基因工程的成功与否。

下面我们将以典型例题及解析的方式来讨论基因工程选引物的重要性和方法。

典型例题:假设你需要在实验室中进行一项基因工程实验,要求你设计引物来扩增目标基因。

目标基因的序列如下:5'-ATGCTAGCTAGCTAGCATG-3'。

请设计适合的引物序列。

解析:在设计引物时,需要考虑引物的长度、GC含量、配对性和特异性。

在这个例题中,我们需要设计一对引物来扩增目标基因。

首先,我们需要选择两个合适长度的引物序列,通常引物的长度在18-25个碱基对之间。

其次,引物的GC含量应该在40-60%之间,以确保引物的稳定性和特异性。

最后,引物的配对性和特异性也是非常重要的,避免引物与非目标序列产生杂交反应。

根据上述要求,我们可以设计如下两个引物序列:引物1,5'-ATGCTAGCTAGCTAGC-3'。

引物2,5'-CATGCTAGCTAGCTAGC-3'。

这两个引物序列分别位于目标基因的起始和终止序列上,长度适当,GC含量合适,并且具有良好的特异性和配对性。

在基因工程实验中,选取合适的引物是成功的关键之一。

通过合理的引物设计,可以有效地扩增目标基因,为基因工程实验的顺利进行提供了重要保障。

总结:基因工程中选取合适的引物是至关重要的一步,它直接影响到基因工程实验的成功与否。

在设计引物时,需要考虑引物的长度、GC含量、配对性和特异性等因素,并且要根据目标基因的序列特点来进行合理的选择和设计。

只有通过精心设计的引物才能确保基因工程实验的顺利进行,为相关研究和应用提供坚实的基础。

基因引物的设计

基因引物的设计

四、引物与PCR
引物浓度:一般为0.1-0.5umol/L(公司合成以后, 干粉状,先离心,按照说明上加入无菌水溶解)
PCR程序中退火温度:一般采用引物Tm值低5度作 为PCR退火温度
五、引物设计软件
最常用的软件是Primer Premier 网站设计软件 手动设计
NCBI网站设计引物
6、引物5’端
引物的5’端可以有与模板DNA不配对碱基 因此5’可以引入一段非模板依赖序列
加上限制性核酸内切酶位点序列 修改某个碱基,引入该位点的点突变以作研究 标记放射性或者非放射性物质(地高辛等)
7、扩增区域的二级结构
如果模板DNA的某些区域具有高度复杂的二级 结构,在选择引物时,应使引物设计区域避开 DNA这些区域
手动设计引物
六、引物同源性分析
用BLASTn软件进行同源性比较
✓尽可能选择与非目的基因同源性小的序列作为引物 ✓选择3’端与非目的基因不同源的序列作为引物 ✓选择两个引物3’端与同一非目的基因不同源的序列
作为引物
练习: 以人类PIWIL2的mRNA序列为例,设计 RT-PCR引物2对,产物大小为150-250bp
综合练习: 在NCBI网站上查找人类BRCA2基因的DNA 序列和mRNA序列,并查找该基因序列多 态性与乳腺癌、卵巢癌的关系相关论文, 针对论文报道的多态性区域进行引物设 计。
Thanks!
4、引物二级结构
引物二聚体 ------尽可能避免两个引物之间3’端有较多碱基互补 发夹结构 -------尤其要避免引物3’端形成发夹结构,否则将 严重影响DNA聚合酶的延伸
5、引物3’端
引物的延伸从3’端开始,因此3’端的几个碱基与 模板DNA均需严格配对,不能进行任何修饰, 否则不能进行有效的延伸,甚至导致PCR扩增 完全失败
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口腔鳞癌组织中肿瘤转移相关基因1(MTA1)一、选择原因及应用口腔鳞癌组织中肿瘤转移相关基因1(MTA1)在蛋白和mRNA的表达水平,揭示其与口腔鳞癌(OSCC)发生、发展的关系。

方法采用免疫组织化学法和原位杂交技术检测46例OSCC标本、15例口腔黏膜白斑与20例正常口腔黏膜标本中MTAl 基因的表达水平,并分析其与OSCC临床病理学参数的关系。

结果MTA1蛋白和MTA1mRNA在OSCC组织中的表达水平显著高于口腔黏膜白斑和正常口腔黏膜(P 〈0.05),口腔黏膜白斑中MTA1蛋白和MTA1mRNA表达水平显著高于口腔正常黏膜(P〈0.01),MTA1蛋白和MTA1mRNA表达与肿瘤浸润深度和淋巴结转移密切相关(P〈0.05)。

结论MTA1基因在蛋白和mRNA的表达水平在OSCC发生、发展及浸润转移过程中起一定促进作用,有望成为判断OSCC预后及选择治疗方案的一个新肿瘤标志物。

二、2查阅NCBI得到MTA1相关信息并获得目的基因PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla metastasis associated 1 (MTA1), mRNANCBI Reference Sequence: XM_004055801.1FASTA GraphicsLOCUS XM_004055801 2872 bp mRNA linear PRI 03-DEC-2012DEFINITION PREDICTED: Gorilla gorilla gorilla metastasis associated 1 (MTA1),mRNA.ACCESSION XM_004055801VERSION XM_004055801.1 GI:426378238KEYWORDS .SOURCE Gorilla gorilla gorilla (western lowland gorilla) ORGANISM Gorilla gorilla gorillaEukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;Catarrhini; Hominidae; Gorilla.COMMENT MODEL REFSEQ: This record is predicted by automated computationalanalysis. This record is derived from a genomic sequence(NW_004005914) annotated using gene prediction method: GNOMON,supported by mRNA and EST evidence.Also see:Documentation of NCBI's Annotation Process##Genome-Annotation-Data-START##Annotation Provider :: NCBIAnnotation Status :: Full annotationAnnotation Version :: Gorilla gorilla Annotation Release 100Annotation Pipeline :: NCBI eukaryotic genome annotation pipelineAnnotation Method :: Best-placed RefSeq; Gnomon Features Annotated :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA##Genome-Annotation-Data-END##FEATURES Location/Qualifierssource 1..2872/organism="Gorilla gorilla gorilla"/mol_type="mRNA"/sub_species="gorilla"/db_xref="taxon:9595"/chromosome="14"gene 1..2872/gene="MTA1"/note="Derived by automated computational analysis usinggene prediction method: GNOMON. Supporting evidence/codon_start=1/product="metastasis-associated protein MTA1"/protein_id="XP_004055849.1"/db_xref="GI:426378239"/db_xref="GeneID:101134898"/translation="MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVC FYRRRDISSTLIALADKHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQ LRHRELFLSRQLESLPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTL LADKGEIRVGNRYQADITDLLKEGEEDGRDQSKLETKVWEAHNPLTDKQIDQFLVVAR SVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQG GPVLCRDEMEEWSASEANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTD RYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYNKPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRA CESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSP HGLPARSSGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAI KAECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPA KVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGVDGNMKKRLLMPSRGLANHGQTRHMGPSRNLLLN GKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYMATEETRKIRKLLSSSETKRAAR RPYKPIALRQSQALPLRPPPPAPVNDEPIVIED" ORIGIN1 tcctcctctt cctctcccgc ccgcgccgcg gccctcccgt ccctgcgcgg cctcggcggc61 ctcggcggcg gcggcggcgg cggcggcagc agcgcggccc ctttaaacgc ctgcggcgccgcgccgagcg ccgcgcccgcaacatgtaca gggtcggaga241 ctacgtctac tttgagaact cctccagcaa cccatacctg atccggagga tcgaggagct301 caacaagacg gccaatggga acgtggaggc caaagtggtg tgcttctacc ggaggcggga361 catctccagc accctcatcg ccctggccga caagcacgca accctgtcag tctgctataa421 ggccggaccg ggggcggaca acggcgagga aggggaaata gaagaggaaa tggagaatcc481 ggaaatggtg gacctgcccg agaaactaaa gcaccagctg cggcatcggg agctgttcct541 ctcccggcag ctggagtctc tgcccgccac gcacatcagg ggcaagtgca gcgtcaccct601 gctcaacgag accgagtcgc tcaagtccta cctggagcgg gaggatttct tcttctattc661 tctagtctac gacccacagc agaagaccct gctggcagat aaaggagaga ttcgagtagg721 aaaccggtac caggcagaca tcaccgactt gttaaaagaa ggcgaggagg atggccgaga781 ccagtccaag ttggagacca aggtgtggga ggcgcacaac ccactcacag acaagcagat841 cgaccagttc ctggtggtgg cccgctctgt gggcaccttc gcacgggccc tggactgcag901 cagctccgtc cgacagccca gcctgcacat gagcgccgca gctgcctccc gagacatcac961 gctgttccac gccatggata ctctccacaa gaacatctat gacatctcca aggccatctc1021 ggcactggtg ccgcagggcg ggcccgtgct ctgcagggac gagatggagg agtggtctgc1081 atcagaggcc aaccttttcg aggaagccct ggaaaaatat gggaaggatt tcacggacat1141 tcagcaagat tttctcccgt ggaagtcgct gaccagcatc attgagtact actacatgtg1201 gaagaccacc gacagatacg tgcagcagaa acgcttgaaa gcagctgaag ctgagagcaa1261 gttaaagcaa gtttatattc ccaactataa caagccaaat ccgaaccaaa tcagtgtcaa1321 caacgtcaag gccggtgtgg tgaatggcac gggggcgccg ggccagagcc ctggggctgg1381 ccgggcctgc gagagctgtt acaccacaca gtcttaccag tggtattctt ggggtccccc1441 taacatgcag tgtcgtctct gcgcatcttg ttggacatat tggaagaaat atggtggctt1501 gaaaatgcca acccggttag atggagagag gccaggacca aaccgcagta acatgagtcc1561 ccacggcctc ccagcccgga gcagcgggag ccccaagttt gccatgaaga ccaggcaggc1621 tttctatctg cacacgacga agctgacgcg gatcgcccgg cgcctgtgcc gtgagatcct1681 gcgcccgtgg cacgctgcgc ggcaccccta cctgcccatc aacagtgcgg ccatcaaggc1741 cgagtgcacg gcgcggctgc ccgaagcctc ccagagcccg ctggtgctga agcaggcggt1801 acgcaagccg ctggaagccg tgcttcggta tcttgagacc cacccccgtc cccccaagcc1861 tgaccccgtg aaaagcgtgt ccagcgtgct cagcagcctg acgcccgcca aggtggcccc1921 cgtcatcaac aacggctccc ccaccatcct gggcaagcgc agctacgagc agcacaacgg1981 ggtggacggc aacatgaaga agcgcctctt gatgcccagt aggggtctgg caaaccacgg2041 acagaccagg cacatgggac caagccggaa cctcctgctc aacgggaagt cctaccccac2101 caaagtgcgc ctgatccggg ggggctccct gcccccagtc aagcggcggc ggatgaactg2161 gatcgacgcc ccggatgacg tgttctacat ggccacagag gagaccagga agatccgcaa2221 gctgctctca tcctcggaaa ccaagcgtgc tgcccgccgg ccctacaagc ccatcgccctgcgcccgtca acgacgagccgccccccgcc cctcgcccgc2401 ccacacggcc ccttcccagc cagcccgccg cccgcccctc agtttggtag tgccccacct2461 cccgccctca cctgcagaga aacgcgctcc ttggcggaca ctgagggagg agaggaagaa2521 gcgcggctaa cttattccga gaatgccgag gagttgtcgt ttttagcttt gtgtttactt2581 tttggctgga gcggagatga ggggccaccc cgtgcccctg tgctgcgggg ccttttgccc2641 ggaggccggg ccctaaggtt ttgttgtgtt ctgttgaagg tgccgtttta aattttattt2701 ttattacttt ttttgtagat gaacttgagc tctgtaactt acacctggaa tgttaggatc2761 gtgcggccgc ggccggccga gctgcctggc ggggttggcc cttgtctttt caagtaattt2821 tcatattaaa caaaaacaaa gaaaaaaatc ttataaaaag gaaaaaaacc aa//三、表达载体的选择我所选用的原核表达载体为质粒pBR322;pBR322 是一种常用的E. coli 克隆载体(1),为4,361 bp 的环状双链DNA(2)。

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