ebsco西文数据库使用说明
沈阳工程学院图书馆EBSCO西文全文数据库检索指南
《EBSCO西文数据库》
一、数据库介绍
EBSCO公司是世界上最大的提供期刊、文献定购及出版服务的专业公司之一，从1986年开始出版电子出版物，收录范围涵盖自然科学、社会科学、人文和艺术、教育学、医学等各类学科领域。
在校园网范围内，可以查询《Academic Search Premier》（学术期刊数据库）、《Business Source Premier》（商业资源数据库）、ERIC、Newspaper Source 、Professional Development Collection等数据库。
Academic Search Premier(学术期刊数据库)：当今全世界最大的多学科学术期刊全文数据库，专为研究机构所设计，提供丰富的学术类全文期刊资源。Academic Source Premier 提供了近4,700 种出版物全文，其中包括3,600 多种同行评审期刊。它为100 多种期刊提供了可追溯至1975 年或更早年代的PDF 过期案卷，并提供了1000 多个题名的可检索参考文献。大多数期刊有PDF格式的全文；很多PDF全文是可检索的PDF（Native PDF）和彩色PDF；1,000多种期刊提供了引文链接。这个数据库几乎覆盖了所有的学术研究领域，包括：人文社会科学、教育、计算机科学、生物学、工程学、物理、化学等。此数据库通过EBSCOhost 每日进行更新。
Business Source Premier (商业资源电子文献库) ：为商学院和与商业有关的图书馆设计，是行业中使用最多的商业研究型数据库；所收录的各类全文出版物达8800多种；学科领域包括：管理、市场、经济、金融、商业、会计、国际贸易等；全文回溯至1965年或期刊创刊年；可检索的参考文献回溯至1998年。以所收录的期刊排名统计，Business Source Premier数据库在各个学科领域中都优于其它同类型数据库；如：市场、经营管理、MIS（管理信息系统）、POM（生产与运营管理）、会计学、财政学、经济学等。这个数据库还提供了许多非刊全文文献，如：市场研究报告、产业报告、国家报告、企业概况、SWOT分析等。数据库每日更新。
注：要查看全文需安装Adobe Acrobat Reader。
二、进入数据库
入口一：图书馆主页——〉数字资源——〉EBSCO西文全文数据库
图书馆网址:
进入数据库选择页
入口二：进入网址
选择“BSCOhostWeb”或“BSCOhost Text Only(速度较快)”进入数据库选择页。
进入数据库选择页
三、选择数据库
选择单一数据库：直接点击该数据库的链接即可。
选择多个数据库：在数据库前打勾，然后点击「继续」按钮即可。
进入检索页面
单一数据库检索：直接点击数据库名称
数据库详细介绍
数据库期刊目录
多重数据库复选框
在选择数据库时，界面提供两种辅助功能，即：数据库详细介绍和期刊检索。数据库详细介绍：
数据库期刊目录：包含期刊刊名目录，还提供「期刊检索」功能。读者可按期刊刊名、年份、卷、期检索查询，直接检索到所需的文章。其使用步骤如下所示：
刊名检索输入框
字顺目录选择
四、检索方法
EBSCOhost 提供两大类检索方法：基本检索（Basic Search）和高级检索（Advance Search）。其中又分别提供“关键词”（Keyword）、“主题”（Subject Term）、“出版物”（Publications）、“索引”（Indexes）、“参考文献”（References）等多种检索途径。两大类检索方式除关键词检索功能不同外，其它检索功能均相同。
1、基本检索
（1）基本检索界面
（2）扩展选项：
搜索相关关键词选项（Also search for related words ）：勾选该项，会将检索词的同义词或单复数的文献一并检索。如：键入“car ” EBSCOhost 会检索到car 和automobile ；或键入“policy ” EBSCOhost 会检索到policy 和policies 。
在文章全文范围内搜索选项（Also search within the fulltext of the articles ）：若检索词较冷僻，可勾选该项，EBSCOhost 会检索每篇全文文章，只要该篇文章的全文中有所键入的检索词，就会被纳入检索结果清单。
自动“and ”检索词语（Include all search terms by default ）：勾选该项，检索系统会在每个检索词之间自动加入“and ”逻辑运算符。
2、高级检索
（1）高级检索界面
可选择多个字段输入不同检索词进行组配检索。其检索步骤示例如下： ? 在“查找”字段中输入欲检索的关键词；
? 从“位于”右边的下拉式列表中选择检索字段：如：TX All Text – 全文等； ? 选择下方逻辑运算符；
? 在下一个“查找”字段内键入另一个关键词；
? 再一次从“位于”右边的下拉式列表中选择检索范围，如：SU- 主题等； ? 在“选择”左边下拉式列表中选择数据库； ? 按下“检索”按钮开始检索。
基本检索
关键词检索参考文献检索
图像库
出版物检索
主题检索
索引检索
输入检索词
选择数据库
扩展选项
（2）限制检索项： 同基本检索相比，高级检索除具备了初级检索的所有功能外，还增加了“Cover Story ”，表示仅检索具有深度报道的封面故事文章。
可选择将检索范围限定于：有全文的文献，有参考的文献，学术性期刊，出版物种类，
多个关键词组配
选择数据库
输入关键词
限制检索项
扩展选项
文献类型，封面报导，出版日期等。
（3）扩展选项：同基本检索。
注：基本检索和高级检索的结果均可按不同主题进行二次检索，以提高检准率。
选择主题进行二次检索
关键字检索| 出版物检索| Subject Terms | Indexes | Cited References | Image Collection
3、其它检索途径
（1）关键词检索：检索界面见基本检索、高级检索。直接输入检索词并选择检索入口，同时可以对检索结果做限定或是扩展。
（2）出版物检索：同选择数据库时的刊名列表检索。
（3）主题（Subject Terms）检索：当检索者不能够确切选择检索词时，就可利用主题检索。输入主题，然后浏览相关检索词，进而选择检索主题词。
点击进入主题检索
输入检索词
输入主题词
浏览相关检索词
（4）索引（Indexes）检索
检索步骤如下所示：
步骤1：点击“Indexes”，进入索引检索；
步骤2：在下拉菜单中选择查询类型，如：“Author”；
步骤3：输入检索词，如：Smith ； 步骤4：点击“浏览”，检索结果将按字母顺序列出；
步骤5：点击所需要的关键词前的方框，如：SMITH ALLEN, J.，再点击“添加”按钮，使相应的关键词加入到检索栏中。重复步骤②-④，加入所有需要的关键词。 步骤6：点击“检索”，获得想要的结果。
（5）参考文献（Cited References ）检索
EBSCO 的部分数据库提供参考文献检索功能。检索步骤如下所示： 步骤1：点击“Cited References ” 进入索引检索。
步骤2：在Author 、Title 、Source 、Year 或是All 各检索栏內输入关键词，如：在 “Author ” 检索栏中输入Samuelson, Paul A.，然后点击“检索”按钮。
1.点击进入索引检索
3.输入检索词
2.在下拉菜单选
择查询类型
5.选择所
需关键词 6.点击“添加”
7.最后点击“检索”
4.点击“浏览”
（6）图像（Images Collection）检索
检索步骤如下所示：
步骤1：点击“Images Collection”进入图像检索。
步骤2：选择图片的类型，包括：全部、人物、自然科学、风景、历史照片、地图、旗帜等，如：Photos of people。
步骤3：在检索框內输入关键词，如：在输入Mao，（即检索毛泽东的照片）然后点击“检索”按钮。
1.点击进入参考文献检索
2.在选定字段输入检索词
3.最后点
击“检索”
1.点击进入图像库
2.输入检索词
3.选择检索类型
4.最后点击“检索”
五、检索结果处理 检索结果界面
1、 查看文章详细信息
点击某一文章题名，显示该文章的详细外部特征。如下图所示：
结果显示
检索结果数
检索结果排序选择
文章题名及详细出处
相关引文链接
点击查看文章详细信息
点击查看PDF 格式全文
2、查看文章全文
点击或就会显示某一文章全文。如下图所示：PDF全文（需安装Adobe Acrobat Reader）：
HTML全文：出处
作者
题名
主题词
作者单位摘要
存盘和打印查找
文本选择
显示格式选择
翻页
3、PDF格式转换为word格式
点击图标，用鼠标选定某些PDF格式的全文，单击鼠标右键，复制，然后可以以
word格式粘贴到文档中。
4、“我的EBSCOhost”——文件夹功能
“我的EBSCOhost”文件夹是EBSCO数据库为读者免费提供的一个私人的存储空间，用于储存在EBSCO数据库中查阅的文献以备再次使用，再次使用时不需要重新进行检索。只要在有权限可以访问EBSCO数据库的地方均可以使用我的EBSCOhost文件夹。
注：需先注册用户，登录后方可使用此功能。
（1）注册演示：
1.点击登录至“我
的EBSCOhost”
2.选择“我是一
个新用户”
3.输入个人信息
4.设置用户
名和密码
5.点击
“提交”
6.点击“确定”，
完成注册
（2）将检索结果添加至文件夹
将检索题录保存至个人文件夹：
途径1：选择“添加对象（1－10）”即可，将本页面检索结果全部保存至个人文件夹；
途径2：先单击文献题录后面的勾选框，选出所需要的文献，然后单击上方的“更新”按钮，即可将所需检索结果保存至个人文件夹。
途径1
途径2
将文章详细信息或全文保存至个人文件夹：
点击检索界面上方的按钮即可。
将结果保存
至文件夹
将全文保存
至文件夹
SCI检索数据库使用技巧
应用技巧(一)： 如何了解您的论文被SCI收录的情况？ 1．访问Web of Science数据库检索论文 请访问：https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,，进入ISI Web of Knowledge平台；选择Web of Science数据库，(以下图示为WOK4.0版新界面)。 示例：如果我们希望检索“中国科技大学” “侯建国”院士在Science Citation Index (SCI)中收录文章的情况。 2．检索结果及输出 检索结果告诉我们找到了152篇“侯建国”院士的文章。（如果有重名的现象，请参考我们随后提供的有关作者甄别工具的应用技巧。）
我们可以选择先做Mark标记所有相关文章，再选择打印输出的方式，见下图： 下图是可打印的检索到的152篇侯建国院士所发表文章被SCI收录的记录。
结论：通过在Web of Science中用作者、及机构名称或地址的限制，检索到某一作者的文章，并做Mark标记后，选择打印输出，就可以了解您的论文被SCI收录的情况了。
应用技巧(二)： 如何了解国际上都有哪些科学家在关注您的课 题？ 通过Web of Science的引文跟踪服务（Citation Alerts），您可以及时地跟踪您的一篇论文被新发表论文引用的情况，从而了解国际上都有哪些人在关注您的研究工作，他们为什么要引用您的论文，是否在您的课题基础上做了新的改进，是否对您的假说或理论提出了事实证据，是否指出了您研究工作的不足，他论文中的工作展望是否对您的下一步工作有借鉴意义，引文跟踪服务会直接将跟踪结果发到您的邮箱中。 1．注册个人帐号 为了让Web of Science知道您的邮箱地址，在做引文跟踪之前，首先要用您已有的email邮箱在ISI Web of Knowledge中进行注册，注册方式如下： 登陆：https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,进入ISI Web of Knowledge 4.0 （*注意：https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,是现在ISI Web of Knowledge 4.0的网址，以后都会统一换成https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,。） 注意： （1）如果您已在EndNote Web上注册过，就不用再次在ISI Web of Knowledge中再注册了，可以使用同样的email和password登陆。 （2）Password必须大于、等于8位，并至少包含：一位0-9的数字，一位字母，及一位特殊符号：！@ # $ % ^ *()~{ }
ebsco西文数据库使用说明
沈阳工程学院图书馆EBSCO西文全文数据库检索指南 《EBSCO西文数据库》 一、数据库介绍 EBSCO公司是世界上最大的提供期刊、文献定购及出版服务的专业公司之一，从1986年开始出版电子出版物，收录范围涵盖自然科学、社会科学、人文和艺术、教育学、医学等各类学科领域。 在校园网范围内，可以查询《Academic Search Premier》（学术期刊数据库）、《Business Source Premier》（商业资源数据库）、ERIC、Newspaper Source 、Professional Development Collection等数据库。 Academic Search Premier(学术期刊数据库)：当今全世界最大的多学科学术期刊全文数据库，专为研究机构所设计，提供丰富的学术类全文期刊资源。Academic Source Premier 提供了近4,700 种出版物全文，其中包括3,600 多种同行评审期刊。它为100 多种期刊提供了可追溯至1975 年或更早年代的PDF 过期案卷，并提供了1000 多个题名的可检索参考文献。大多数期刊有PDF格式的全文；很多PDF全文是可检索的PDF（Native PDF）和彩色PDF；1,000多种期刊提供了引文链接。这个数据库几乎覆盖了所有的学术研究领域，包括：人文社会科学、教育、计算机科学、生物学、工程学、物理、化学等。此数据库通过EBSCOhost 每日进行更新。 Business Source Premier (商业资源电子文献库) ：为商学院和与商业有关的图书馆设计，是行业中使用最多的商业研究型数据库；所收录的各类全文出版物达8800多种；学科领域包括：管理、市场、经济、金融、商业、会计、国际贸易等；全文回溯至1965年或期刊创刊年；可检索的参考文献回溯至1998年。以所收录的期刊排名统计，Business Source Premier数据库在各个学科领域中都优于其它同类型数据库；如：市场、经营管理、MIS（管理信息系统）、POM（生产与运营管理）、会计学、财政学、经济学等。这个数据库还提供了许多非刊全文文献，如：市场研究报告、产业报告、国家报告、企业概况、SWOT分析等。数据库每日更新。 注：要查看全文需安装Adobe Acrobat Reader。 二、进入数据库 入口一：图书馆主页——〉数字资源——〉EBSCO西文全文数据库 图书馆网址:
蛋白质数据库
生物芯片北京国家工程研究中心 湖南中药现代化药物筛选分中心 暨湖南涵春生物有限公司 常用数据库名录 1、蛋白质数据库 PPI - JCB 蛋白质与蛋白质相互作用网络 ?Swiss-Prot - 蛋白质序列注释数据库 ?Kabat - 免疫蛋白质序列数据库 ?PMD - 蛋白质突变数据库 ?InterPro - 蛋白质结构域和功能位点 ?PROSITE - 蛋白质位点和模型 ?BLOCKS - 生物序列分析数据库 ?Pfam - 蛋白质家族数据库 [镜像： St. Louis (USA), Sanger Institute, UK, Karolinska Institutet (Sweden)] ?PRINTS - 蛋白质 Motif 数据库 ?ProDom - 蛋白质结构域数据库 (自动产生) ?PROTOMAP - Swiss-Prot蛋白质自动分类系统 ?SBASE - SBASE 结构域预测数据库 ?SMART - 模式结构研究工具 ?STRING - 相互作用的蛋白质和基因的研究工具
?TIGRFAMs - TIGR 蛋白质家族数据库 ?BIND - 生物分子相互作用数据库 ?DIP - 蛋白质相互作用数据库 ?MINT - 分子相互作用数据库 ?HPRD - 人类蛋白质查询数据库 ?IntAct - EBI 蛋白质相互作用数据库 ?GRID - 相互作用综合数据库 ?PPI - JCB 蛋白质与蛋白质相互作用网络 2、蛋白质三级结构数据库 ?PDB - 蛋白质数据银行 ?BioMagResBank - 蛋白质、氨基酸和核苷酸的核磁共振数据库?SWISS-MODEL Repository - 自动产生蛋白质模型的数据库 ?ModBase - 蛋白质结构模型数据库 ?CATH - 蛋白质结构分类数据库 ?SCOP - 蛋白质结构分类 [镜像: USA | Israel | Singapore | Australia] ?Molecules To Go - PDB数据库查询 ?BMM Domain Server - 生物分子模型数据库 ?ReLiBase - 受体/配体复合物数据库 [镜像： USA] ?TOPS - 蛋白质拓扑图 ?CCDC - 剑桥晶体数据中心 (剑桥结构数据库 (CSD))
生物信息研究中常用蛋白质数据库的总结
生物信息研究中常用蛋白质数据库简述 内蒙古工业大学理学院呼和浩特孙利霞 2010.1.5 摘要：在后基因组时代生物信息学的研究当中，离不开各种生物信息学数据库。尤其在蛋白质从序列到功能的研究当中，目前各种行之有效的方法都是基于各种层次和结构的蛋白质数据库。随着计算机技术及网络技术的发展，目前的蛋白质数据库不论是所包含数据量还是功能都日新月异，新的数据库层出不穷。一个新手面对如此浩瀚的数据量往往无从下手。本文粗浅地为目前蛋白质数据库的使用勾画出一个轮廓，作为自己蛋白质研究入门的一个引导。 关键词：蛋白质；数据库 0 引言 随着科技的发展，个人的知识往往赶不上快速膨胀的信息量，人们为了解决这个问题，便创建了形形色色的数据库。蛋白质数据库是指：在蛋白质研究领域根据实际需要，对蛋白质序列、蛋白质结构以及文献等数据进行分析、整理、归纳、注释，构建出具有特殊生物学意义和专门用途的数据库。蛋白质数据库总体上可分为两大类：蛋白质序列数据库和蛋白质结构数据库，蛋白质序列数据库来自序列测定，结构数据库来自X-衍射和核磁共振结构测定（详见图1）。这些数据库是分子生物信息学的基本数据资源。上世纪90年代，我国从事蛋白质研究的学者使用的蛋白质数据库储存介质还是国外实验室发布的激光光盘[1]。信息的传播储存甚为不便。随着蛋白质研究的发展飞快，同时伴随着计算机和因特网发展，蛋白质数据库的储存传播方式也发生的巨大的变化。进入21世纪后，我们所用的各种蛋白质数据库都发展成为存储在网络服务器上，基于“服务器—客户机”的访问查询方式。伴随着计算机及物理测试技术的发展数据库的容量和功能成数量级膨胀。但是面对如此浩瀚的数据，新手往往感到无从下手，在需要时找不到自己需要的合适数据库。 本文从目前蛋白质数据库建立的的逻辑层次出发，系统地简绍了常用蛋白质数据的概况，它们的查询方法以及它们相互之间的联系。同时尽量不涉及数据库建设和维护方面的计算机和网络这些数据库底层的技术，为蛋白质研究的入门者及对蛋白质感兴趣的人员的一个引导。
EBSCO数据库使用指南
EBSCO数据库使用指南 1、登陆网址。链接地址:https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,，在我校IP范围内按地址自动登录。 2、检索方法 2.1 检索界面 基本检索界面，如图1 高级检索界面，如图2 2.2 检索途径 2.2.1 关键词检索 点击关键词检索键,进入关键词检索界面。在检索框中输入检索式。基本检索和高级检索均默认为关键词检索。 (1)有关项目说明 检索式检索式可以是一个词,也可以由检索字段标识符、检索词、逻辑算符以及位置算符等联合构成。
关键词关键词可以是一个完整的词,也可以使用通配符和截词符。通配符主要用于拼写多变的单词,用问号“?”表示,只代替一个字符,可以输在词中或词尾,但不能用在词首。截词符主要用于词根多变的词,以便扩大检索范围。用星号“*”表示,可以代替一个或多个字符。 字段代码字段代码用两个字母表示,用于限定关键词检索的字段,输在检索词的前面。缺省状态下在全文范围内检索。其代码含义如下:AU为责任者、TI为题名、SU为主题词、AB为文摘、AN为登记号、IS为国际标准刊号、SO为刊名、AS作者自作文摘等。根据数据库的不同,有的还有其它字段代码。在高级检索界面下检索指导框的下拉菜单中都列了出来,可以参看。 逻辑算符该检索系统支持“and”、“or”、“not”三种逻辑运算,也可以用括弧括起来进行优先运算。 位置算符位置算符用于计算检索词之间能容纳的最大单词数。它由一个字母和一个数字组成。字母共有两个:N和W。N是near的缩写,只限定检索词之间的单词数,而不限制检索词的顺序;W是within的缩写,既限定检索词之间的单词数,又保证检索词的顺序与输入的完全一致。输入时放在检索词之间,如:taxn3reform或taxw5reform。 双引号“” 使用双引号,表示检索结果要与引号内的检索词完全匹配。即检中的文献包含引号内的检索词,并且词序、词的位置都不变。 (2)逻辑关系的输入和选定 在高级检索窗口下,逻辑关系可以直接输入,或者在检索指导框中选定逻辑算符,再点击检索指导框后的添加即可。在基本检索窗口下,逻辑关系可直接输入也可选择逻辑关系符。 (3)检索范围的限定或扩大 为了更精确地检到需要的结果,该系统在检索框的下面设置了限定检索和扩大检索框。该框中有多个条件,可选用其中的一个条件或多个条件,也可不选。该条件根据数据库和检索窗的不同有所变化。一般有如下一些内容: 限定框中为全文限定、有参考、评审期刊、出版物项等；扩展框中为相关关键词、全文范围内搜索、自动“and”检索词。 (4)点击检索框后的检索键,即可出现检索结果。 2.2.2 主题词检索 在高级检索或基本检索窗口下点击subject Terms键,进入主题词词检索界面，如图3。
SCI的检索使用详细指南
SCI的检索使用详细指南（ISI Web of Knowledge） ISI Web of Knowledge【https://www.360docs.net/doc/0215892252.html, 】是一个基于Web而构建的动态的数字研究环境，通过强大的检索技术和基于内容的连接能力，将高质量的信息资源、独特的信息分析工具和专业的信息管理软件无缝地整合在一起，兼具知识的检索、提取、分析、评价、管理与发表等多项功能，从而加速科学发现与创新的进程。 l 在内容上，ISI Web of Knowledge 以 Web of Science( ISI著名的三大引文索引Science Citation Index Expanded?, Social Science Citation Index?, Arts & Humanities Citation Index?为核心，凭藉独特的引文检索机制和强大的交叉检索功能，有效地整合了学术期刊（ISI Web of Science）、技术专利(Derwent Innovations Index)、会议录(ISI Proceedings)、化学反应(ISI Chemistry)、研究基金(ISI eSearch)、 Internet资源、学术分析与评价工具（ISI Essential Science Indicators）、学术社区（https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,）及其它重要的学术信息资源，提供了自然科学、工程技术、生物医学、社会科学、艺术与人文等多个领域中高质量、可信赖的学术信息，从而大大扩展和加深了单个信息资源所能提供的学术研究信息； l 在功能上，ISI Web of Knowledge为不同来源的学术信息资源的整合提供了一个统一、开放而强大的平台，实现了不同时间、不同类型、不同来源信息资源之间的整合与沟通，最大限度地保持了知识体系的完整性，提供了科学研究的全方位信息，从而构成了一个以知识为基础的既集中又开放的信息体系。 ISI Web of Knowledge由诸多经过严格挑选的高质量学术信息资源组成： l 多学科综合性学术期刊信息— ISI Web of Science ISI Web of Science由ISI著名的三大引文索引组成：Science Citation Index Expanded, Social Sciences Citation Index, Arts & Humanities Citation Index，收录了全球自然科学、工程技术、生物医学、社会科学、艺术与人文等诸多领域230多个学科与专业内近8,500多种高质量的学术期刊。其中，Science Citation Index Expanded是全球覆盖学科最广泛的科学技术信息数据库，收录全球自然科学、工程技术等领域内6,000多种核心期刊的内容。其独特的引文索引有效地揭示了科学研究之间的内在联系，协助研究人员深入了解科学研究课题的过去、现在与将来，同时也揭示了各种不同学科、不同研究领域的交叉与互动，从而为科学研究的立项、规划、发展与深入提供了最有价值的信息资源。目前，全球越来越多的大学、机构、公司和政府都已经将ISI Web of Science作为一项非常重要的战略性信息资源投资。 l 每日更新的学术信息动态－ISI Current Contents Connect 通过Internet 按照学科分类检索ISI著名的Current Contents，其中包含世界上7,600多种学术期刊和2,000多种丛书/书籍中的文章、社论、会议摘要、评论及其它重要内容，每天更新，并提供期刊的完整目录、论文摘要以及作者的电子邮件地址。同时，Current Contents Connect还提供由专业人员精选和标引的学术网站，并按学科分类导航—Current Web Contents。
蛋白常用数据库
搞蛋白质的童鞋们，甭要只查NCBI了~蛋白质相关数据库启蒙~ ★ 小木虫(金币+1):奖励一下，谢谢提供资源 qinhy:恭喜，您的帖子被版主审核为资源贴了，别人回复您的帖子对资源进行评价后，您就可以获得金币了理由:资源贴2011-11-26 16:56 本来是带图的，可是弄过来就变成米图了，附件里面一个是PDF版、一个是WORD版均是带图的，童鞋们看带图的可能比较方便点哦~ 基于蛋白质序列的蛋白质相互作用位点预测（闲谈版） 这个不是论文不是论文啊~~这个是应某某的要求帮他找的，所以都是用现成的免费的网站数据库做的预测分析。无论文为依托，无原理为根据，纯粹就是流连各大网站作个的闲谈。 1、用这些网站先查查你要研究的蛋白质的底细。 这些网站的数据库大多数是实验或者一些相关文献报道的数据的组成。 ★String http://string.embl.de/ 输入你要搜寻的蛋白，它就把这个蛋白相关的数据反映给你，分confidence、evidence的数据可信度参考，同时还具有actions选项，反应它们之间可能是激活/抑制的关系。按按+、-号可以扩大缩小关联蛋白的数量范围。 往下拉一点点就是数据,哈哈，我们都要看数据吃饭啊~~ 分析的数据源自Neighborhood、Fusion、Occurrence、Coexpression、Experiments Database、Textminin及Homology，表示点得证明有数据，根据各项数据给出综合评分。评分越高相互存在关系可能性越高。点击下方各项图标等详细看到各项数据内容。 设条件确定筛选范围。 ★DIP https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/dip/Main.cgi 跟上面的大同小异的功能，装上它附带的软件可能操作性会好一点，不过我米有试过哦。倒是跟它有链接的几个数据库都很强大，大家可以点击看看。 ★BIND http://www.bind.ca 文献有介绍的网站，不过我不能理解为什么我注册就注不了……. 2、继续查，用这些网站将要研究的蛋白质的家庭背景，月收入也大起底。 这里的网站可能跟相互作用方面的关系不大，但是如果知道这些，可以对研究的蛋白有更深的了解。 ★PDB https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/pdb/home/home.do 要查3D结构就往这里查~通常说的PDB号为文献号末4位。 ★PIR https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/pirwww/index.shtml 在蛋白质方面如NCBI般强大的网站，去上面晃荡下吧，会有收获滴。 ★KEGG http://www.genome.jp/kegg/ 粉强大的一个网站，我只说说它的KEGG PA THW AY子项，能迅速掌握一个蛋白质的功能通路，对于小白的偶们来说，很有用，有木有。 3、正题正题，做完上面那些后，接着就是纯预测的成分。也因为如此，要找着这些网站是很悲催的一件事。就算你找着了，你不懂语言，不懂算法，到底结果的可靠性怎样，见人见智。 需要PDB号作分析： promate http://bioinfo.weizmann.ac.il/promate/
蛋白质相互作用数据库和分析方法
蛋白质相互作用数据库和分析方法 1. 蛋白质相互作用的数据库 蛋白质相互作用数据库见下表所示： 数据库名 说明 网址 BIND 生物分子相互作用数据库 http://bind.ca/ DIP 蛋白质相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/ IntAct 蛋白质相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/intact/index.html InterDom 结构域相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,.sg/ MINT 生物分子相互作用数据库 http://mint.bio.uniroma2.it/mint/ STRING 蛋白质相互作用网络数据库 http://string.embl.de/ HPRD 人类蛋白质参考数据库 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/ HPID 人类蛋白质相互作用数据库 http://wilab.inha.ac.kr/hpid/ MPPI 脯乳动物相互作用数据库 http://fantom21.gsc.riken.go.jp/PPI/ biogrid 蛋白和遗传相互作用数据，主要来自于酵母、线虫、果蝇和人 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/ PDZbase 包含PDZ 结构域的蛋白质相互作用数据库 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/services/pdz/start Reactome 生物学通路的辅助知识库 https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/ 2. 蛋白质相互作用的预测方法 蛋白质相互作用的预测方法很非常多，以下作了简单的介绍 1) 系统发生谱 这个方法基于如下假定：功能相关的(functionally related)基因，在一组完全测序的基因组中预期同时存在或不存在，这种存在或不存在的模式(pattern)被称作系统发育谱；如果两个基因，它们的序列没有同源性，但它们的系统发育谱一致或相似．可以推断它们在功能上是相关的。
第三讲：Uniprot蛋白数据库及其他蛋白质分析工具
第三讲 Uniprot蛋白数据库及其他蛋白质 分析工具
2013/03/19
Uniprot数据库
? Uniprot（Universal?protein?resource)是蛋白 质序列的联合数据库。
– SIB:?Swiss?Institute?of?Bioinformatics – EBI:?European?Bioinformatics?Institute – PIR:?Protein?Information?Resource – 2002年三家联合形成了Uniprot
Swiss‐Prot
? 1986年建立 ? 低冗余度 ? 功能导向 ? 由Swiss?Institute?of?Bioinformatics?和EBI共同 建立并维护
TrEMBL
? TrEMBL=Translation?from?EMBL ? EBI建立并维护 ? 是一个自动数据库 ? 冗余度高，可信度低
UniprotKB
? 部分经过专家注释的数据库 ? 具有很高的可信度 ? 包括两部分UniprotKB/Swiss‐Prot和 UniprotKB/TrEMBL ? UniprotKB/Swiss‐Prot包括539,165条序列 ? UniprotKB/TrEMBL包括29,769,971?条序列 ? 具有非冗余性
Uniparc
? 非冗余性 ? 给予序列的特异性，非同一物种的相同序 列被认为是同一个蛋白质 ? 每一条序列被給予一个特异的编号
蛋白质序列PIR和PDB使用方法
随着核酸数据库不断发展以及数据库的建立，蛋白质序列、结构、功能不断引起人们的重视，生命科学的研究中蛋白质的研究显得尤为重要，一系列的蛋白质序列数据随之产生，数据库也在研究蛋白质的过程中有着不可或缺的地位。本文主要通过实验说明蛋白质序列数据库PIR及蛋白质结构数据库PDB的使用方法，返回结果的含义，以及如何下载数据和批量下载数据。
由于蛋白质序列测定技术先于DNA序列测定技术问世，蛋白质序列的搜集也早于DNA序列。蛋白质序列数据库的雏形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初，美国国家生物医学研究基金会(National Biomedical Research Foundation，简称NBRF)Dayhoff领导的研究组将搜集到的蛋白质序列和结构信息以“蛋白质序列和结构地图集”(Atlas of Protein Sequence and Structure)的形式发表，主要用来研究蛋白质的进化关系。 时至今日，国际上已建立了许多关于生物分子的数据库，主要包括基因组图谱数据库、核酸序列数据库、蛋白质序列数据库、蛋白质结构数据库、生物大分子结构数据库等。这些数据库均为公共数据库，由特定的组织维护、以及发布相关序列信息，供生物研究学者使用，称为生物研究中的必要工具之一，随着科学技术的发展，这些数据库不断壮大，也为研究人员提供了大量有用的数据。 本文主要通过课程实验，展示蛋白质序列数据库PIR及蛋白质结构数据库PDB的相关使用方法。
本论 蛋白质序列数据库PIR介绍 1984年，“蛋白质信息资源”(Protein Information Resource，简称PIR)计划正式启动，蛋白质序列数据库PIR也因此而诞生。与核酸序列数据库的国际合作相呼应，1988年，美国的NBRF、日本的国际蛋白质信息数据库(Japanese International Protein Information Database，简称JIPID)和德国的慕尼黑蛋白质序列信息中心(Munich Information Center for Protein Sequences，简称MIPS)合作成立了国际蛋白质信息中心(PIR-International)，共同收集和维护蛋白质序列数据库PIR。 PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)三维结构的数据库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。随着晶体衍射技术的不断改进,结构测定的速度和精度也逐步提高。90年代以来,随着多维核磁共振溶液构象测定方法的成熟,使那些难以结晶的蛋白质分子的结构测定成为可能。蛋白质分子结构数据库的数据量迅速上升。据2000年5月统计，PDB数据库中已经存放了1万2千多套原子坐标,其中大部分为蛋白质，包括多肽和病毒。此外,还有核酸、蛋白和核酸复合物以及少量多糖分子。近年来,核酸三维结构测定进展迅速。PDB数据库中已经收集了800多套核酸结构数据。 PDB数据库允许用户用各种方式以及布尔逻辑组合(AND、OR和NOT)进行检索，可检索的字段包括功能类别、PDB代码、名称、作者、空间群、分辨率、来源、入库时间、分子式、参考文献、生物来源等项。用户不仅可以得到生物大分子的各种注释、坐标、三维图形、VAML等,并能从一系列指针连接到与PDB有关的数据库，包括SCOP、CATH、Medline、ENZYME、SWISS-3DIMAGE等。可通过FTP下载PDB数据。所有的PDB文件均有压缩和非压缩版以适应用户传输需要。PDB的电子公告版BBS和电子邮件兴趣小组(Mailing List)为用户提供了交流经验和发布新闻的空间。在PDB的服务器上还提供与结构生物学相关的多种免费软件如Rasmol、Mage、PDBBrowser、3DB Brower等。 PIR应用 首页介绍：主要包含以下几项： 1、About PIR：对网站历史、发展、及各类刊物的介绍； 2、Database：包括PIR-PSD、PIR-NREF、Uniprot等数据库； 3、Search/Analysis：对蛋白质序列分析的多种途径； 4、Download：网站提供的蛋白质下载； 5、Surpport：一些其他链接，包括支持等； 6、其他一些与PIR相关的介绍链接；
整理(蛋白质序列数据库)
蛋白质序列数据库 我们可以根据基因组序列预测新基因，预测编码区域，并推测其产物（即蛋白质）的序列。因此，随着基因组序列的不断增长，蛋白质序列也在不断增加。 PIR 历史上，蛋白质数据库的出现先于核酸数据库。在1960年左右，Dayhoff和其同事们搜集了当时所有已知的氨基酸序列，编著了《蛋白质序列与结构图册》。从这本图册中的数据，演化为后来的蛋白质信息资源数据库PIR（Protein Information Resource）。 PIR是由美国生物医学基金会NBRF（National Biomedical Research Foundation）于1984年建立的，其目的是帮助研究者鉴别和解释蛋白质序列信息，研究分子进化、功能基因组，进行生物信息学分析。它是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库。所有序列数据都经过整理，超过99%的序列已按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。PIR提供一个蛋白质序列数据库、相关数据库和辅助工具的集成系统，用户可以迅速查找、比较蛋白质序列，得到与蛋白质相关的众多信息。目前，PIR已经成为一个集成的生物信息数据源，支持基因组研究和蛋白质组研究。至2004年，PIR 有近30万个蛋白质的登录数据项，包括来自不同生物体的蛋白质序列。 除了蛋白质序列数据之外，PIR还包含以下信息： （1）蛋白质名称、蛋白质的分类、蛋白质的来源； （2）关于原始数据的参考文献； （3）蛋白质功能和蛋白质的一般特征，包括基因表达、翻译后处理、活化等； （4）序列中相关的位点、功能区域。 对于数据库中的每一个登录项，有与其它数据库的交叉索引，包括到GenBank、EMBL、DDBJ、GDB、MELINE等数据库的索引。PIR中一个具体的登录项如图4.4所示。
EBSCO数据库及检索方法介绍
EBSCO数据库及检索方法介绍 一、数据库简介 1 Academic Source Premier 提供了近 4,700 种出版物全文，其中包括 3,600 多种同行评审期刊。它为 100 多种期刊提供了可追溯到 1975 年或更早年代的 PDF 回溯资料，并提供了 1000 多个题名的可检索参考文献。此数据库通过 EBSCOhost 每日进行更新。 2 Business Source Premier 该库是行业中使用最多的商业研究数据库，提供 2,300 多种期刊的全文，包括 1,100 多种同行评审标题的全文。此数据库提供的全文可追溯至 1886 年，可搜索引文参考可追溯至 1998 年。Business Source Premier 相比同等数据库的优势在于它对所有商业学科（包括市场营销、管理、MIS、POM、会计、金融和经济）都进行了全文收录。此数据库通过 EBSCOhost 每日更新。 3 Student Research Center 使用手册 该库主要的用途是供师生查找不同等级的原版英文资料和循序渐近地提高英文阅读能力。SRC平台下可挂接20多个数据库，主题涉及：自然科学、人文历史、社会科学、艺术等各个方面。SRC最独特的地方就是包含了800万篇文献已经标识蓝思(Lexile)难度分级。 EBSCO还提供下列免费数据库：
1、ERIC ERIC (Educational Resource Information Center) 包含有可追溯至 1966 年的 1,300,000 多条记录和指向超过 317,000 篇全文文档的链接。 2、GreenFILE GreenFILE 提供人类对环境所产生的各方面影响的深入研究信息。其学术、政府及关系到公众利益的标题包括全球变暖、绿色建筑、污染、可持续农业、再生能源、资源回收等。本数据库提供近 384,000 条记录的索引与摘要，以及 4,700 多条记录的 Open Access 全文。 3、Library, Information Science & Technology Abstracts Library, Information Science & Technology Abstracts (LISTA) 对 500 多种核心期刊、500 多种优选期刊和 125 种精选期刊、以及书籍、调查报告及记录等进行了索引。此数据库还包括 240 多种期刊的全文。主题涉及图书馆长的职位资格、分类、目录、书目计量、在线信息检索、信息管理等。数据库中的内容可追溯到 20 世纪 60 年代。 4、MEDLINE MEDLINE 提供了有关医学、护理、牙科、兽医、医疗保健制度、临床前科学及其他方面的权威医学信息。 MEDLINE 由 National Library of Medicine 创建，采用了包含树、树层次结构、副标题及激增功能的 MeSH（医学主题词表）索引方法，可从 4,800 多种当前生物医学期刊中检索引文。
蛋白质数据库应用swiss-port和PPD
摘要 本文对SWISS-PROT和PDB两个数据库进行了简要介绍以及如何进行序列的单个下载和批量下载进行了说明。 关键词：SWISS-PROT PDB 下载
ABSTRACT In this paper,I make a brief introduction about SWISS-PROT and PDB and how to make a single download and batch download about sequence. Key words：SWISS-PROT PDB download
摘要 (1) ABSTRACT (2) 一Swiss-Port的使用方法 (4) 1.1网站简介 (4) 1.2数据下载： (5) 二PDB的使用方法 (5) 2.1网站简介 (5) 2.2数据下载 (9)
一 Swiss-Port的使用方法 SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。数据库由蛋白质序列条目构成，每个条目包含蛋白质序列、引用文献信息、分类学信息、注释等，注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关系、序列变异体和冲突等信息。SWISS-PROT中尽可能减少了冗余序列，并与其它30多个数据建立了交叉引用，其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索SWISS-PROT和其它EBI的数据库。SWISS-PROT只接受直接测序获得的蛋白质序列，序列提交可以在其Web页面上完成。Swiss-Port的网址为http://www.expasy.ch/sprot。 1.1网站简介 打开网站后可以找到如下所示部分： 在处可以查询序列。点击后会有如下界面： 在输入区输入序列：MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG，点击按钮可以进行查找（查找时还可以在其下方进行一系列的筛选条件控制）。 查询后会看到如下界面，在这里可以看到你进行查询的时间，查询所用时间，
UniProt：蛋白质的全信息数据库
Nucleic Acids Research, 2004, Vol. 32, Database issue D115-D119? 2004 Oxford University Press UniProt：蛋白质的全信息数据库 摘要 为了给科学界提供一个专门，集中，权威的蛋白质序列和功能的信息资源，瑞士－Prot，TrEMBL 和PIR蛋白质数据库已经合作组成了蛋白质的全信息数据库 (UniProt)。我们的目的是用广泛的对照和询问接口来提供一个全面的，分类完全的，丰富并且准确的蛋白质序列信息。中心数据库将有两个部分：符合熟悉的瑞士－Prot(完全手工操作入口)和TrEMBL(使用丰富的自动化的分类，注释和广泛的对照)。为方便序列查寻，UniProt也提供几个无冗余的序列数据库。 UniProt NREF(UniRef)数据库为高效率的搜寻提供适当的蛋白质的全信息数据库的代表性的子集。全面的UniProt 档案(UniParc)每天从很多公共来源数据库更新。 数据库那些UniProt接口可在线访问(https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,)或者以几个形式下载(ftp：//https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/pub)。我们鼓励科学界人士向UniProt 提供数据。 介绍 近来，瑞士-Prot + TrEMBL和PIR-PSD如同蛋白质数据库不同的序列信息覆盖面和注释优势共存。 2002年，在生物信息科学(SIB)的瑞士研究所和欧洲生物信息科学研究所的瑞士-Prot + TrEMBL 组 (EBI)和蛋白质信息资源(PIR)组织在乔治敦大学医学中心和国家生物医学的研究基金会联合协作。新联合的组织的主要任务是通过建立一个综合，详细分类，丰富并且准确注释蛋白质序列的优质的数据库和广泛序列对比和询问服务的到科学团体免费接口
KEGG数据库的使用说明
KEGG的数据 KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系；基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的，除了有完整的基因序列外，还有没完成的草图；另外KEGG中有一个“专有名词”KO（KEGG Orthology），它是蛋白质（酶）的一个分类体系，序列高度相似，并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组，然后打上KO（或K）标签。下面就首先来讲一下KEGG orthology。 任找一个代谢通路图，在上方有pathway meue|payhway entry |Show(Hide)description|这3个选项，点击pathway entry,出现了一个页面，这个随时被连接出来的页面相信大家一定再熟悉不过了。在这个页面中的pathway map项中点击按钮状的链接Ortholog table。就进入了Ortholog table如下的页面： 在这个表中，行与物种对应，3个字母都是相应物中的英文单词缩写，比如has表示Homo sapiens，mcc表示Macaca mulatta；列就表示相应的Ortholog分类，比如K00844就表示生物体内的己糖激酶hexokinase这一类序列和功能相似的蛋白质类（酶类）。如上图has后有3101，3098，3099这3个条目，它表示在人类细胞中中存在3中不同的己糖激酶，它们分别由以上这3组数字代表的基因所编码，这3组数字应该是这3个基因的登录号。空白则表示在该物种中不存在这种酶。
点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来；点击has则链接到物种（人类）基因组去了；点击P，则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101，如下： 如上图，就是我们常见的一个页面，3101是KEGG中的基因ID（登录号），H.sapiens表示物种，然后是基因的名称，表达的酶，属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径；下面还有结构、序列信息等等。 所以从Ortholog table中可以很容易地知道一张代谢通路上有哪些KO分类（酶类），并且这些酶类的成员在各物种中分配存在的情况以及特定的名称。 怎么看KEGG中代谢通路图
SCI《 科学引文索引》数据库使用指南
SCI《科学引文索引》数据库使用指南 一、数据库简介 科学引文索引（Science Citation Index，SCI）创刊于1963年，是美国科学情报研究所（ISI，http：／／www．isinet．com）出版的一部世界著名的期刊文献检索工具。SCI 收录全世界出版的数、理、化、农、林、医、生命科学、天文、地理、环境、材料、工程技术等自然科学各学科的核心期刊约3500种；扩展版收录期刊5800余种 由于SCI数据库具有学科全面、学术影响大、覆盖国家广泛等特点，因而被其收录检索的期刊和论文常分别被称作国际主流期刊和国际主流科学。刊物或论文被SCI收录和引用在一定程度就反映了该刊物或论文具有较高的学术水平和较大的国际影响力。 二、检索指南 进入图书馆主页，点击“资源推介”里的“SCI－科学引文索引”数据库栏目，即可进入Web of Knowledge的主界面。（见示意图1）然后,点击浅蓝色的“Web of Science”标签，即可进入“Web of Science”的主页面。（见示意图2） 1．选择数据库 点击图中“引文数据库”前的展开设置按钮，选中下拉列表中的“Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) --2000-至今”选项。 2．检索步骤 检索界面的默认选择即为普通检索界面（见示意图2），可输入三组检索条件, 分别在检索框中输入检索词后，再点选检索框后的检索范围选项，然后用“AND”、“OR”、“NOT”进行连接，选择“入库时间”，最后点击“检索”按钮，即可浏览检索结果（见示意图3）。 输入检索词检索 切换标签 选择检索范围 图1 Web of Knowledge检索平台 三、检索结果处理 1．浏览检索结果 以普通检索为例，检索条件为（“jiang ds”in “作者”）“AND”（“wuhan”in“地址”），检索结果分页（每页10条或自选显示条目数）显示，每条检索结果显示题录信息。点击文献标题，可以看到该条结果的全记录（full record）（见示意图3）。
ANTHEPROT5.0简单使用说明.
ANTHEPROT 5.0简单使用说明 生物技术2002 房磊021402144 生物的化学，就是蛋白质与核酸的化学。对蛋白质的研究是生物化学领域一个非常重要的部分。但是众多蛋白质的复杂序列数据，其分析工作是一个非常困难的工作。用人工的方法是很难完成如此大量的分析工作的。运用计算机，利用一定的运算规则，对众多的蛋白质序列数据，进行蛋白序列分析就是最好的解决方法。蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 5.0正是这样的一个程序包。 蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 5.0是法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）开发的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容，功能非常强大。应用此软件包，使用个人电脑，便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。包括：进行蛋白序列二级结构预测；在蛋白序列中查找符合PROSITES数据库的特征序列；绘制出蛋白序列的所有理化特性曲线；在Internet或本地蛋白序列数据库中查找类似序列；计算蛋白序列分子量，比重与各蛋白残基百分组成；计算蛋白序列滴定曲线与等电点；选定一个片段后，绘制Helical Wheel图；进行点阵图（Dot Plot）分析；计算信号肽潜在的断裂位点等功能。更重要的是此软件包为免费软件。 软件分为三个版本，分别用于Unix系统，DOS系统与WINDOWS95或98系统，以用于WINDOWS系统的版本为例，介绍一下这个软件的基本用法。 软件包为一个自解压执行文件，文件名Anthe_5_0.exe，大小为2,013,184 字节。执行此文件，输入解压后存放的目录名，便可将所有文件解压在此目录 下。 其文件如下图 软件运行后的主程序中按钮是极其简单的相关介绍，基本无任何用处。但是在软件目录中的自解压压缩文件doc_ant.exe文件，可以解
蛋白质分析相关数据库及网站
表1蛋白质相互作用分析相关数据库及网站 蛋白质序列分析和结构预测 【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。 【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（adiponectin）蛋白质序列； 2、使用BioEdit软件对上述蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成、和疏水性等基本性质分析； 3、对人脂联素蛋白质序列进行基于NCBI/Blast软件的蛋白质同源性分析； 4、对人脂联素蛋白质序列进行motif结构分析； 5、对人脂联素蛋白质序列进行二级结构和三维结构预测。 【实验方法】 1、人脂联素蛋白质序列的检索：
（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（https://www.360docs.net/doc/0215892252.html,/Entrez）； （2）在Search后的选择栏中选择protein； （3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin； （4）点击go后显示序列接受号及序列名称； （5）点击序列接受号NP_004788 （adiponectin precursor；adipose most abundant gene transcript 1 [Homo sapiens]）后显示序列详细信息； （6）将序列转为FASTA格式保存（参考上述步骤使用SRS信息查询系统检索人脂联素蛋白质序列）； 2、使用BioEdit软件对人脂联素蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成和疏水性等基本性质分析： 打开BioEdit软件→将人脂联素蛋白质序列的FASTA格式序列输入分析框→点击左侧序列说明框中的序列说明→点击sequence栏→选择protein→点击Amino Acid Composition→查看该蛋白质分子质量和氨基酸组成；或者选择protein后，点击Kyte & Doolittle Mean Hydrophobicity Profile→查看该蛋白质分子疏水性水平； 3、人脂联素蛋白质序列的蛋白质同源性分析： （1）进入NCBI/Blast网页； （2）选择Protein-protein BLAST （blastp）； （3）将FASTA格式序列贴入输入栏； （4）点击BLAST； （5）查看与之同源的蛋白质； 4、人脂联素蛋白质序列的motif结构分析： （1）进入http://hits.isb-sib.ch/cgi-bin/PFSCAN网页； （2）将人脂联素蛋白质序列的FASTA格式序列贴入输入栏； （3）点击Scan； （4）查看分析结果（注意Prosite Profile中的motif information）； 5、人脂联素蛋白质序列的二级结构预测： （1）进入下列蛋白结构预测服务器网址http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein//predictprotein.html