基于线粒体DNA控制区的新疆北鲵种群遗传多样性分析

新疆北部地区蜉蝣目昆虫种类及多样性研究

新疆北部地区蜉蝣目昆虫种类及多样性研究引言：蜉蝣类昆虫属于昆虫门，是相对较为独特的昆虫群体，在生态系统中发挥着重要的角色。

然而，对于新疆北部地区蜉蝣目昆虫种类及多样性的研究相对较少。

因此，本文旨在对新疆北部地区蜉蝣目昆虫的种类以及多样性进行研究，希望能为了解该地区昆虫的生态特征提供一定的参考。

方法与材料：本研究选取新疆北部地区作为调查研究区域，采用田间调查和标本采集相结合的方法，对蜉蝣目昆虫进行样本采集。

样本采集地点包括高山、草地、沙漠和湖泊等不同类型的生态环境。

采集过程中，特别注意昆虫的分类特征、生活习性以及栖息地信息的记录。

采集到的样本用显微镜检测，通过观察和鉴定计算不同种类的昆虫数量和频率。

结果：经过对新疆北部地区蜉蝣目昆虫样本的采集和鉴定，我们发现了多个昆虫种类。

首先，根据采集到的样本特征，我们将蜉蝣目昆虫分类为若干个科，包括蜉蝣科、蟓螂科、垂翅目科、腹蝇科等。

其次，对不同科的昆虫样本进行统计和计算，我们发现新疆北部地区的蜉蝣目昆虫种类相对较为丰富，其中以蜉蝣科和蟓螂科占主导地位。

此外，不同类型的生态环境对昆虫种类和多样性也产生了显著影响，例如高山地区的蜉蝣目昆虫种类较为单一，而湖泊地区的种类较为丰富。

讨论：新疆北部地区蜉蝣目昆虫种类及多样性的研究结果显示，该地区的蜉蝣目昆虫种类相对较为丰富，其中以蜉蝣科和蟓螂科为主。

这与该地区的生态环境有密切的关系，不同生态环境对昆虫种类和多样性产生了显著影响。

此外，蜉蝣目昆虫在生态系统中发挥着重要的角色，不仅是食物链中的层级重要成员，还参与了花粉传播和生物降解等生态过程。

结论：通过对新疆北部地区蜉蝣目昆虫种类及多样性的研究，我们对该地区昆虫群体以及生态特征有了更深入的了解。

该研究结果对于保护和维护该地区生态系统的稳定性具有一定的参考意义。

然而，本研究还存在一些局限性，例如样本采集范围有限以及鉴定误差可能存在等方面。

因此，后续的研究需要进一步完善和扩大样本采集范围，以提高研究结果的准确性和可信度。

基于线粒体dna标记对3个华鳈群体的遗传结构分析

１材料与方法
１．１样本采集及ＤＮＡ抽提课题组于２０１５年４月至２０１７年８月在洪泽湖
（江苏省淮安市淮阴区韩桥乡）、千岛湖（浙江省杭州市淳安县富溪乡）和西湖（浙江省杭州市西湖北里湖）３个采样点各采集华样本１５尾。剪取每尾个体的尾鳍组织后浸泡于无水乙醇中，并于４℃冰箱中保存备用。采用传统的苯酚－氯仿法对各样本基因组ＤＮＡ进行抽提，ＤＮＡ质量采用Ｎａｎｏｄｒｏｐ２０００微量紫外分光光度计进行检测。
ＰＣＲ扩增体系总体积为５０μＬ，其中包含１０× ｒｅａｃｔｉｏｎｂｕｆｆｅｒ５μＬ，ＴａｑＤＮＡ聚合酶４Ｕ（大连宝生物），ｄＮＴＰ（２．５ｍｍｏｌ／Ｌ）１．６μＬ，上下游引物混合液（２．５μｍｏｌ／Ｌ）１．６μＬ，ＤＮＡ模板８０～２００ｎｇ，灭菌超纯水３６．５μＬ。ＰＣＲ反应在ＢｉｏＲａｄ公司的Ｔ－１００型ＰＣＲ仪中进行，ＰＣＲ反应程序为：９４℃预变性５ｍｉｎ；９４℃变性４５ｓ，５２℃退火４５ｓ，７２℃延伸１ｍｉｎ，运行３７个循环；７２℃终延伸２０ｍｉｎ。ＰＣＲ产物通过１．５％琼脂糖凝胶电泳后，利用回收试剂盒ＧｅｌＥｘｔｒａｃｔｉｏｎＫｉｔ（北京康为世纪）对目的片段进行回收和纯化，纯化后的产物送往武汉艾康健生物科技有限公司，利用ＡＢＩ３７３０测序平台进行测序。１．３数据分析
朱传坤１，潘正军１，常国亮１，吴楠１，王辉１，丁怀宇１，强晓刚２，余祥胜２
（１．淮阴师范学院生命科学学院／江苏省特色水产繁育工程实验室／江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心，江苏淮安２２３３００；２．江苏省淮安市水产技术指导站，江苏淮安２２３００１）
摘要：华（Ｓａｒｃｏｃｈｅｉｌｉｃｈｔｈｙｓｓｉｎｅｎｓｉｓ）是一种兼具食用和观赏价值的小型鲤科鱼类。采用Ｃｙｔｂ和Ｄ－ｌｏｏｐ２个线粒体ＤＮＡ序列对洪泽湖、千岛湖和西湖３个群体的４５尾华样本进行了遗传变异与遗传结构分析。结果显示，在长度为４０４ｂｐ的Ｃｙｔｂ序列中，共检测出变异位点２２个（５．４％），定义了１０种单倍型；在９９８ｂｐ的Ｄ－ｌｏｏｐ序列中，变异位点有４０个（４．０％），构成了７种单倍型。２个标记在华群体中的平均单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为０．８４０±０．０３３、０．０１２±０．００２、４．７５９±１．６６０（Ｃｙｔｂ）和０．７５５±０．０３６、０．００６±０．００２、６．４３０±２．２４１（Ｄ－ｌｏｏｐ），表现了较高的遗传多态性。遗传多样性大小顺序为洪泽湖＞西湖＞千岛湖，３个群体间基因交流较少，表现出极大的遗传分化，此外，分子变异分析结果表明华变异的主要来源为群体内变异。本研究结果将为了解我国东部地区华的遗传多样性现状提供基础资料，同时为华种质资源保护与合理利用提供参考。关键词：华；线粒体ＤＮＡ；Ｃｙｔｂ；Ｄ－ｌｏｏｐ；遗传多样性；遗传分化中图分类号：Ｓ９１７．４文献标志码：Ａ文章编号：１００２－１３０２（２０２０）０５－００５０－０７

基于线粒体COI序列分析对紫贻贝群体遗传多样性的研究分析

基于线粒体COI序列分析对紫贻贝群体遗传多样性的研究分析沈玉帮;张俊彬;冯冰冰;李家乐【期刊名称】《海洋通报》【年(卷),期】2011(030)004【摘要】本文采用线粒体COI基因序列分析对我国沿海6个紫贻贝群体124个个体的遗传多样性和群体结构进行了初步研究.在紫贻贝6个群体中共发现13个单倍型和33个核苷酸多态位点.青岛群体单倍型数目是最多的,温州群体、丹东群体和宁德群体次之.6个紫贻贝群体的基因多样性为0.569～0.821,核苷酸多样性为0.015 5～0.051 0,表现出较低的遗传多样性.紫贻贝不同群体之间的遗传分化较小,所有群体之间没有发生显著的遗传分化.分子方差分析表明,紫贻贝的变异主要存在于群体内.该研究为紫贻贝的可持续开发和资源保护提供了一定的理论依据.%Genetic biodiversity of Mytilus galloprovincialis was estimated, based on sequence analyses of the mitochondrial cytochrome oxidase I (mfDNA COI) gene, employing 124 individuals of 6 groups along the coast of eastern and southern china. 13 haplotypes and 33 variation sites were observed in the sequences of the 124 individuals. QD population had the greatest number of haplotypes, while secondary for WZ population, DD population and ND population. Among all six populations, gene diversities ranged from 0.569 to 0.821, and the nucleotide diversities from 0.0155 to 0.0510, suggesting that M. Galloprovincialis has low genetic diversity. The pairwise estimates of FST between M. Galloprovincialis populations weresmall, and no significant genetic differentiation was observed between populations. AMOVA analysis showed that a large proportion of variation was attributed within population of M. Galloprovincialis. This study provides objective data for the sustainable exploitation and fishery management of M. Galloprovincialis.【总页数】6页(P435-440)【作者】沈玉帮;张俊彬;冯冰冰;李家乐【作者单位】上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306【正文语种】中文【中图分类】S917.4【相关文献】1.紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COI基因的遗传比较分析 [J], 庞宇杰;李继姬;郭宝英2.基于线粒体COⅢ基因分析厚壳贻贝（Mytilus coruscus）养殖群体遗传多样性[J], 周超;郭宝英;吴常文;叶莹莹;李继姬;冯广朋3.基于线粒体D-loop区和COI基因序列研究2个禾花鲤群体和野生鲤群体的遗传多样性与系统进化关系 [J], 潘贤辉; 罗辉; 叶华; 林勇; 周康奇; 陈忠; 杜雪松; 黄姻; 覃俊奇; 文露婷; 潘志忠; 邓潜4.基于线粒体COI序列的中华绒螯蟹养殖群体与野生群体遗传多样性与遗传结构分析 [J], 轩中亚;薛竣仁;陈修报;姜涛;刘洪波;杨健5.基于线粒体COI序列的矛尾复虾虎鱼5个野生群体的遗传多样性分析 [J], 祝斐;应博凯;贾超峰;孟乾;高波;孙瑞健;宋双双;徐大凤;卢瑶瑶;张志伟;陈淑吟;张志勇;陈心因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析

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江苏农业科学２０２４年第５２卷第３期
性较低（Ｈｄ：０．６０４８，Ｐｉ：０．００１６３）［１７］。伊西庆基于ＮＤ２序列探究了我国东部６个湖泊翘嘴遗传多样性和遗传结构，结果表明部分群体间出现高度遗传分化［１８］。江淮下游是我国淡水湖泊的集中分布
群体太湖蟢湖长荡湖高邮湖白马湖洪泽湖总体
样本数４８３１３９４７４７５０２６２
表１翘嘴群体的遗传多样性参数
多态位点数２２１７２１１９１９１８４２
单倍型数２０１４１８１７１５１４４６
单倍型多样性０．９２７±０．０１９０．８６０±０．０５３０．９０１±０．０３２０．７９２±０．０５９０．８６１±０．０３６０．８１６±０．０４８０．９１５±０．０１０
由表１可知，２６２条Ｃｙｔｂ序列检出４２个变异位点，其中，有３３个简约信息位点和９个单一信息位点，没有插入或缺失位点。２６２条序列定义４６种单倍型，整个群体的单倍型多样性和核苷酸多样性分别为０．９１５±０．０１０和０．００２５４±０．００００８；６个群体的单倍型多样性为（０．７９２±０．０５９）～（０．９２７± ００１９），核苷酸多样性为（０．００２２０±０．０００２１）～（０００２８５±０．０００１８），其中，太湖群体的单倍型多样性和核苷酸多样性最大，高邮湖群体的单倍型多样性最小，蟢湖群体的核苷酸多样性最小。
翘嘴（Ｃｕｌｔｅｒａｌｂｕｒｎｕｓ）俗称白鱼、翘嘴白丝、大白鱼，隶属鲤形目（Ｃｙｐｒｉｎｉｆｏｒｍｅｓ）鲤科（Ｃｙｐｒｉｎｉｄａｅ）亚科（Ｃｕｌｔｅｒｉｎａｅ）属（Ｃｕｌｔｅｒ），广泛分布于我国各江河湖泊［１］。翘嘴为凶猛肉食性鱼类，它能有效控制小型鱼类种群数量，减轻小型鱼类对浮游生物的压力，在优化鱼类群落机构及维持水域生态系统稳定方面发挥了重要作用［２］。翘嘴肉味鲜美、肉质细嫩洁白、营养丰富、经济价值高，且生长迅速，是我国常见的淡水养殖品种之一［３］。多年来，由于过度捕捞、生态环境污染及栖息地破坏多种因素的影响，翘嘴野生资源遭到严重破坏，种群数量急剧衰退，遗传多样性下降，个体小型化、低龄化趋势严重，因此加强翘嘴种质资源保护成为亟待解决的问题［４］。

一种基于线粒体DNA序列的中国大鲵群体划分方法[发明专利]

专利名称：一种基于线粒体DNA序列的中国大鲵群体划分方法
专利类型：发明专利
发明人：汪登强,梁志强,危起伟,伍远安
申请号：CN201610528281.7
申请日：20160706
公开号：CN106048038A
公开日：
20161026
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种基于线粒体DNA序列的中国大鲵群体划分方法，包括：(1)采集大鲵样本，并提取基因组DNA；(2)合成大鲵特异线粒体DNA引物；(3)对大鲵样本进行PCR扩增并对PCR扩增产物测序；(4)对获得的序列与参考序列进行比对；(5)根据相应位点的序列特征，判断样本所属的群体。

本发明以大鲵线粒体DNA序列作为区别中国大鲵种群的序列标记，通过与参考序列的序列特征进行比对，能够快速准确的对目标种群进行鉴定。

可用于对大鲵养殖场的大鲵个体进行鉴定，确定个体来源；在亲本繁殖时可辅助育种选择。

还可应用于增殖放流样本的鉴定，确定其所属的群体，然后放流到适合的区域，避免放流群体对野生群体的种质混杂。

申请人：中国水产科学研究院长江水产研究所,湖南省水产科学研究所
地址：430223 湖北省武汉市东湖新技术开发区武大科技园武大园一路8号
国籍：CN
代理机构：北京国昊天诚知识产权代理有限公司
代理人：许志勇
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新疆巴州牦牛种群线粒体DNA遗传多样性及其系统发育分析

新疆巴州牦牛种群线粒体DNA遗传多样性及其系统发育分析王兰萍;耿荣庆;常洪;冀德君;李永红;常春芳【摘要】In the present study,the mitochondrial cytochrome b gene sequences of Xinjiang Bazhou yak population were sequenced and the phylogenetic trees were constructed to analyze genetic status.The results showed that four total haplotypes were detected of seventeen samples with the haplotype diversity 0.0331 and the nucleotide diversity0.00102.The phylogenesis revealed there were two obvious branches of cytochrome b gene haplotypes,one was clustered with domestic yaks and the other was clustered with wild yaks.It illustrated that there may be two maternal origin for Bazhou yak.%研究测定新疆巴州牦牛种群线粒体DNA细胞色素b基因全长序列,在此基础上构建系统发育树,分析种群的遗传现状.结果表明,在17头巴州牦牛个体中检测到4种Cyt b基因单倍型,单倍型多样性为0.331,核苷酸多样性为0.00102；系统发育关系显示,巴州牦牛Cyt b基因单倍型明显有两个分支,一支与家牦牛单倍型聚在一起,另一支与新疆野牦牛单倍型聚在一起,表明巴州牦牛可能有2个母系起源.【期刊名称】《家畜生态学报》【年(卷),期】2013(034)008【总页数】4页(P17-20)【关键词】野牦牛;家牦牛;线粒体DNA;渐渗杂交【作者】王兰萍;耿荣庆;常洪;冀德君;李永红;常春芳【作者单位】盐城师范学院生命科学与技术学院,江苏盐城224051;盐城师范学院生命科学与技术学院,江苏盐城224051;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009【正文语种】中文【中图分类】S811.6牦牛是高寒地区特有牛种，主要繁衍生息在我国青藏高原及周围3 000 m以上的高寒地区，善走陡坡险路和雪山沼泽，能游渡江河激流，有“高原之舟”之称。

中国大鲵5个野生种群的AFLP分析

ｖｒｉｆＡ．ｄｖｄａｕｇｅｄｗｉｈｉｓｌｅｈｓｏｒｉｎｅｇａｈｃｌｄｓｒｂｔｏ．Ｍｏｔｏｅｔｃｄｉｅｓｔｏｙａｉｉｎｓａｒｅｔｔｉｉｔｒｔａｔａｄｇｏｒｐｉａｉｔｉｕｉｎｆｙｓｓｆｇｎｅｉ —
摘要：采用ＡＬ技术对中国大鲵四川、贵州、湖北、陕西及河南五个野生种群的遗传多样性和遗传分化水ＦＰ
平进行了评估。９对引物组合在５个野生种群中共扩增出５７条带，其中多态性条带为３４０５。多态位点比例（９８％）６．２、香农信息指数（．６）和基因多样性指数（．４）等参数均较高，显示中国大鲵遗传多样性０３２９０２１４水平较为丰富。ＡＶＭＯＡ分析发现，中国大鲵遗传多样性绝大部分位于种群内（７９％）９．４。种群间遗传分化较弱（）（ｓ／ｔ＝００１．２，Ｐ＜．０）００１。根据种群间遗传距离构建的ＵＧＰＭＡ树基本依照流域进行聚类，结合化石证据，推
４ｃａｏｅｅＨｉａｎｖｒｉ，ａｋｕ５０２，ｈｎ）．ＯｅｎＣｌｇ，ａｎｎＵｉｓｙＨｉｏ７２８Ｃｉａｌｅｔ
Ａｂｓｒｃｔａｔ：ＧｅｅｉｖｒｉｎｉｅｅｔａｉｎｏａｕａｏｕａｉｎｆＡｎｉｓｄｖｄａｕｎＳｃａｎｔｄｉｅｓｔａｄｄｆｒｎｉｔｏｆｎｔｒｌｐｐｌｔｓｏｄｒａａｉｉｎｓｉｉｈｕｎ．ｃｙｆｏＧｕｚｏｉｈｕ，Ｈｕｅ，ＳａｘｎｎｎｗａｏｒｈｅｓｖｌｅｅｍｉｄｕｉｂｉｈｎｉａｄＨｅａｓｃｍｐｅｎｉｅｙｄｔｒｎｅｓｎｇＡＦＬＰｍａｋｒ．Ｓｉｔｎｖｄｒｅｓｘｙｉｄｉｉ — ｕｌｒｍｖａｕａｐｌｔｎｒｅｎＡＦＬＰａａｙｅ．ＮｉｅｐｉｅｉｓｉＬＰａａｙｅｒ．ａｓｆｏｆｅｎｔｒｌｐｏｕａｉｓｗｅｅｕｓｄｉｉｏｎｌｓｓｎｒｍｒｐａｒｎＡＦｎｌｓｓｐｏｄｃｄ５ｃｒｂｅｂｎｓ，ｏｉｈ３４ｗｅｅｐｌｍｏｐｉ．Ｔｈｅｅｅｉｉｅｓｔｒｍｅｅｓ：ｔｅ－ｕｅ０７ｓｏａｌａｄｆｗｈｃ５ｒｏｙｒｈｃｒｅｇｎｔｃｄｖｒｉｐａａｔｒｙｈｅｐｒ

鱼类线粒体dna及其在分子群体遗传研究中的应用

鱼类线粒体DNA及其在分子群体遗传研究中的应用鱼类，作为地球上最大的脊椎动物群体之一，其遗传多样性研究对于理解生物进化、生态适应以及保护濒危物种等方面具有重要意义。

近年来，随着分子生物学技术的飞速发展，线粒体DNA（mtDNA）已经成为鱼类群体遗传研究中的重要标记。

一、鱼类线粒体DNA的特点线粒体DNA是一种存在于细胞线粒体内的遗传物质，具有母系遗传、高突变率、无重组等特点。

这些特点使得mtDNA成为研究鱼类群体遗传结构和进化历史的理想标记。

母系遗传：mtDNA只能通过母系传递，因此可以有效地追踪母系群体的迁移和扩散。

高突变率：mtDNA的突变率远高于核DNA，这使得mtDNA在短时间内积累大量的遗传信息，有助于揭示近期的进化事件。

无重组：mtDNA在遗传过程中不发生重组，因此其遗传信息具有高度的稳定性，有助于准确推断群体遗传结构。

二、线粒体DNA在鱼类群体遗传研究中的应用群体遗传结构分析：通过比较不同地理群体间mtDNA序列的差异，可以揭示鱼类的群体遗传结构、迁移扩散以及种群历史。

物种鉴定和分类：mtDNA序列差异可以作为物种鉴定和分类的重要依据，有助于发现新物种和解析物种间的亲缘关系。

保护生物学：通过分析濒危物种的mtDNA序列，可以评估其遗传多样性水平，为制定保护策略提供科学依据。

进化生物学：通过比较不同物种间mtDNA序列的差异，可以揭示鱼类的进化历程、分化时间以及祖先群体等信息。

生态学：通过分析鱼类mtDNA与生态环境因子的关系，可以探讨鱼类对环境的适应机制和生态位分化。

渔业资源管理：通过分析渔业资源的mtDNA多样性，可以评估其种群健康状况和种质资源价值，为渔业资源的可持续利用提供科学依据。

三、前景展望随着分子生物学技术的不断进步和成本的不断降低，线粒体DNA在鱼类群体遗传研究中的应用将越来越广泛。

未来，我们可以期待线粒体DNA在揭示鱼类进化历程、保护濒危物种以及渔业资源管理等方面发挥更大的作用。