PubMed生物医学数据库检索方法与技巧
pubmed检索方法
pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆（National Library of Medicine）所开发的一个免费的生物医学文献库，包含了全球几乎所有的生物医学文献，是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。
本文将介绍Pubmed 的检索方法。
一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式，通过输入关键字搜索相关的文献。
在检索时需要注意以下几点：（1）关键词要准确。
Pubmed 检索采用布尔操作符（AND、OR、NOT）连接多个关键词，关键词之间要使用英文逗号（，）隔开。
使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。
（2）参数设置。
可以根据需求调整相关参数，例如年份、文献类型（Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等）、文章作者、机构等。
（3）英文文献。
Pubmed 绝大部分都是英文文献，所以检索时需要使用英文关键词。
（4）筛选性强的关键词。
例如疾病名称、独特的药品名称等。
Pubmed 支持多种文献类型检索，例如：（1）临床试验在 Pubmed 首页上，勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。
（2）随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。
（3）综述勾选文章类型为系统综述或综述，可以检索到该领域最新的文献综述。
三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号（MeSH Terms），用户可以通过选择学科分类号进行检索。
在检索时需要注意以下几点：（1）科学性强的关键词。
例如，临床试验、人类、治疗法等。
（2）与所需内容相关的关键词。
例如，药物作用机制、剂量方案等。
（3）使用适当数量的关键词。
使用过少的关键词会导致检索结果过多，使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。
Pubmed 中的文献都会有一个分值，通过分值和其他指标来对文献进行评价。
PubMed使用教程指南
获取原文及相关资源
1.联机获取原文（ free full text article） 2. link out 3.向有关图书馆索要 4.其他数据库资源（生物信息学等）
文摘中的期刊图标链接
Linkout链接
点击获取原文
检索实例
1.哮喘的药物治疗（asthma, drug therapy） asthma/drug therapy
一、基本检索
1.词语检索
自动匹配转换.
自动匹配转换功能
主题词索引 作者索引 期刊索引
自动匹配转换过程.
一、基本检索 2.精确检索
强制将其作为 一个词组检索
3.截词检索
一、基本检索
无限截词检索
3.截词检索
一、基本检索
有限截词检索
4.逻辑组配检索
一、基本检索
逻辑组配检索
5.作者检索
一、基本检索
Abstract :来源期刊、标题、著者、著者地 址、记录性质、文献类型、勘误、评论、 PMID或UI、摘要。 Summery：作者 Citation : 显示除上述内容外，加MeSH叙 词、化学物质名称、资助项目号等字段。 MEDLINE : (最完整，有标识符）
显示字段选择（Display)
PUBMED检索途径 一、基本检索区 二、辅助检索区 三、个性化检索区
PubMed主页
基本检索区 辅助检索区提供 辅助检索功能
个性化检索区
一、基本检索
可对任何具有实质意义的词都可以进行检索，如: 1.词语检索 自动匹配功能 2.精确检索 用“ ”进行强制短语检索 3.截词检索 用通配符 ？，*检索 4.逻辑组配检索 AND OR NOT 5.作者检索 6.期刊检索
Pubmed检索攻略大全（一）
Pubmed检索攻略大全（一）引言：pubmed是大家最爱用的文献检索网站了，喝水不忘挖井人，pubmed就由美国国立医学图书馆下属的美国生物技术信息中心研制的基于Web的文献数据库，收录全世界包括美国在内80多个国家的5000多种生物医学期刊的文摘及题录数据。
在后面的日子里，我们会一点点仔细来讲pubmed的一些用法。
科研高手请绕道哈，我们这是写给刚入门的小白们看的。
今天讲4个知识点，检索人名、检索期刊名、单篇引文匹配器以及检索临床研究。
如何检索人名？检索格式：姓（last name, 全称），名（initials，单字母缩写）。
如检索“Watson JD”，以此格式进行名字的检索，PubMed会自动地将其识别为作者名（author field）检索。
问大家一个问题，如果作者叫Bonnie W. Ramsey，检索框里面应该写什么呢？对的，检索Ramsey BW.如果检索作者的全名，Bonnie W. Ramsey，大家可以试试看，会少很多文献，可能的原因是2002年之前的很多文献里没有提供作者的名字全称。
如果你只知道作者的名字的一半，比如只知道Watson，那么可以直接检索Watson [au]，或者用advanced search，就是大家最爱用的高级检索。
如果作者的名字包含了“禁用词”，挺多的，有下面这张大表。
挺多的，看得眼花，也没有必要了解那么多，所以出个主意，如果只知道作者名字的一半，本来就会检索出来好多好多结果，也不用管作者名字是不是包含停用词了，直接再加一个检索条件。
比如Smith是研究抽经的，那么再加上检索词。
比如：这样检索有7万多个结果，没法用。
加上其他检索词seizure,一下子缩减了很多。
如何检索期刊名？这个很简单，输入期刊的全称或者缩写，比如输入“molecular biology of the cell”或“Mol BiolCell”但是我们不太会为了找某本杂志的所有文献，如果要找到某本杂志的某个领域的，比如关于drosophila，可以用advanced search检索，或者直接在检索框里检索，两组检索结果差不多。
pubmed检索技巧
主题检索
主题检索
mad cow disease
主题检索
主题检索
主题检索
期刊检索
检索结果显示与输出
检索结果显示
显示格式 每页显示条数 排序
检索结果输出
通过页面右上方send to实现，包括： Send to File Send to Clipboard Send to Collections Send to Email
逻辑运算符：
逻辑与：AND，逻辑或：OR，逻辑非：NOT
截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后 面加上一个截词符，chem*表示用词根进行 检索。
双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行 检索。
检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。
[ti]，[au]，[ta]， [la]，[pt]。
Pubmed 数据库
主要内容
概况 检索机制 检索途径 检索结果显示与输出 全文获取
PubMed概况
美国国家医学图书馆下设的国家生物技术 信息中心(NCBI)开发，是目前国际上公认 的检索生物医学文献最具权威、利用率最 高、影响最广的数据库
PubMed检索机制
自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)
个人绑定邮箱
全文获取
pubmedfw@ xxmu03m99 xx@
谢谢！
出版类型
PubMed登陆
http://www. 或者 /pubmed/ 或者通过图书馆的外文数据库（pubmed文
献服务系统）进入：
PubMed检索界面
使用pubmed进行检索的方法
使用pubmed进行检索的方法使用Pubmed进行文献检索的方法摘要：本文介绍了使用Pubmed进行文献检索的方法。
Pubmed是一个免费的、全球最大的生物医学文献数据库，提供了大量的生物医学文献资源。
通过合理使用关键词、筛选条件和检索策略，可以高效地找到所需的文献信息。
本文将从以下几个方面介绍如何使用Pubmed进行文献检索：关键词选择、搜索策略、结果筛选和文献阅读。
一、关键词选择在进行文献检索之前，首先要确定适当的关键词。
关键词应该与所研究的主题相关，并且能够准确地描述研究内容。
一般来说，关键词应该是具体的、明确的，避免使用过于笼统的词汇。
同时，可以考虑使用同义词或相关词汇来扩大检索范围。
在选择关键词时，可以参考相关文献或专业术语词典，确保关键词的准确性和完整性。
二、搜索策略在Pubmed的主页上，可以找到搜索框。
在搜索框中输入关键词，然后点击搜索按钮即可进行文献检索。
Pubmed提供了多种搜索界面，如简单搜索、高级搜索和专项搜索等，可以根据需要选择合适的搜索界面。
在进行高级搜索时，可以根据文献类型、发表日期、作者、期刊等条件进行筛选。
此外，还可以使用布尔运算符（如AND、OR、NOT）来组合关键词，以进一步缩小或扩大检索范围。
三、结果筛选Pubmed的搜索结果页面会列出符合检索条件的文献列表。
为了准确地找到所需的文献，可以根据以下几个方面进行结果筛选。
首先，可以根据发表日期范围来筛选文献，以获取最新的研究成果。
其次，可以根据文章类型进行筛选，如原始研究、综述、临床试验等。
此外，还可以根据作者、期刊等信息进行筛选，以找到权威的研究成果。
四、文献阅读找到符合要求的文献后，可以点击文献标题或摘要，进而查看详细信息。
Pubmed提供了文献的摘要、作者、期刊、关键词等信息，可以帮助读者快速了解文献内容。
如果需要获取全文，可以查看文献的链接或通过图书馆等渠道获取。
在阅读文献时，要注意文献的质量和可信度，同时可以根据需要进行进一步的文献检索和引用查找。
PubMed使用教程指南
引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库，由美国国家医学图书馆（NLM）开发和维护。
这个教程指南是第二部分，旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献，并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH（医学主题词）进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed检索步骤 -回复
pubmed检索步骤-回复Pubmed是世界上最大的医学文献数据库之一，提供了大量的生物医学文献资料，包括期刊文章、会议摘要、学位论文等。
Pubmed的使用可以帮助研究人员快速检索到相关的医学文献，有效地支持他们的科研工作。
本文将介绍使用Pubmed进行文献检索的步骤，并以"乳腺癌治疗的最新进展"为例进行说明。
第一步：进入Pubmed网站首先，我们需要打开网页浏览器，输入"第二步：选择搜索关键词在Pubmed的首页上，我们可以看到一个搜索框。
输入"乳腺癌治疗的最新进展"作为关键词进行搜索。
在这里，我们需要注意的是，关键词的选择应该准确反映我们所关注的研究主题，以便能够检索到相关的文献。
第三步：筛选搜索结果点击搜索按钮后，Pubmed会根据关键词进行检索，并列出包含这些关键词的文献列表。
在这里，我们可以看到大量的搜索结果。
为了筛选出最相关的文献，我们可以使用Pubmed的搜索筛选工具。
在搜索结果页面的左侧，有一栏搜索筛选工具。
我们可以根据不同的筛选条件，比如出版日期、文章类型、研究主题等进行进一步的筛选。
以乳腺癌治疗的最新进展为例，我们可以选择筛选条件为"出版日期"，选择"最近五年"，以获取最近的研究进展。
第四步：查看摘要和全文在筛选出相关的文献后，我们可以点击文献标题或摘要，进一步查看文献的详细信息。
在这里，我们可以通过查看摘要了解到文献的研究内容、方法和主要结论。
如果我们对某篇文献特别感兴趣，想要获取全文信息，可以通过点击链接或按钮，获取全文或者转至相关网页。
然而，需要注意的是，Pubmed并不提供所有文献的全文，有些文章可能需要通过其他渠道获得。
第五步：导出文献信息在Pubmed上查到的文献信息可以方便地导出到其他文献管理软件，如EndNote等。
在详细信息页面，Pubmed提供了一个"导出"按钮，点击后可以选择导出格式，然后将文献信息导出到所选的文献管理软件中。
PubMed生物医学数据库检索方法与技巧
人重组三叶因子（human recombinant trefoil factor）
("humans"[MeSH Terms] OR "humans"[All Fields] OR "human"[All Fields]) AND recombinant[All Fields] AND ("trefoil factor"[Supplementary Concept] OR "trefoil factor"[All Fields])
输入：ma dl
Peking university
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
5.3 主题检索
点击MeSH Database打开主 题检索界面
根据medline数据主题标引的 规范性，利用主题词进行的研 究，对提高查全率、查准率会 有相当的帮助。
基本检索
高级检索 主题检索
4. PubMed检索运算符
逻辑运算符
逻辑运算符
①逻辑“与”运算AND： 检索式写成A and B，表示文献中同时包含检索词A和检索词B 的文献才是命中文献。 AIDS and therapy ②逻辑“或”运算OR： 检索式写成A or B，表示包含检索词A的文献或者包含检索词 B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。 AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome ③逻辑“非”运算NOT： 检索式写成A not B，表示包含检索词A同时不包含检索词B 的文献为命中文献。 Hepatitis not Animal
62检索结果的保存62检索结果的保存71检索策略的存储和调用72全文链接73相关文献链接71检索策略的存储和调用使用myncbicubby定期浏览新的检索结果72全文链接摘要格式显示72全文链接打开单篇详细页73相关文献链接73相关文献链接综合检索实例检索课题中包含两个主要概念
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5.1 基本检索
默认检索字段 为主题、作者、 期刊
5.1 基本检索
➢ 关键词、词(词组)或短语： ⑴ 输入任意关键词：liver cancer、Lung cancer； ⑵ 带有双引号” ”作为短语检索：”cancer therapy”； ⑶ 带 有 连 接 号 ” -” 作 为 一 个 词 组 检 索 （ 英 文 可 以 ， 中 文 不 行 ） ： interleukin-6。
➢ 复杂表达式：liver cancer AND therapy ➢ 带有摘要文献的检索 ：liver cancer AND hasabstract
基本检索举例：肝癌和酒精的关系
分析该检索课题，包含两个方面： 肝癌：liver cancer； 酒精：alcohol
两个主题之间的逻辑关系是AND，即
③逻辑“非”运算NOT： 检索式写成A not B，表示包含检索词A同时不包含检索词B
的文献为命中文献。 Hepatitis not Animal
PubMed 网址
IP地址：
基本检索 临床咨询
主题检索
高级检索
临床实验
5. PubMed检索方法
5.1 基本检索 5.2 高级检索 5.3 主题检索 5.4 临床咨询
"leukemia"[MeSH Terms] OR "leukemia"[All Fields]
3.1 自动转换匹配功能
对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序 进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转 换顺序是：
MeSH表 期刊刊名表 短语表 作者索引
如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed 将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的 过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍 找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找， 各个词之间也是AND逻辑关系。
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
输入：ma dl 输入：peking university
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
5.3 主题检索
点击MeSH Database打开 主题检索界面
根据medline数据主题标引的 规范性，利用主题词进行的研 究，对提高查全率、查准率会 有相当的帮助。
4. PubMed检索运算符
逻辑运算符
逻辑运算符
①逻辑“与”运算AND： 检索式写成A and B，表示文献中同时包含检索词A和检索词B
的文献才是命中文献。 AIDS and ther的文献或者包含检索词
B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。 AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome
基本检索
主题检索
高级检索
5.3 主题检索
主题检索举例： 长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献
分析该检索课题，有2个概念：长春新碱 （Vincristine ） 、白血病（leukemia）： 对长春新碱来说是利用其治疗疾病，故其应 组配副主题词“治疗应用（therapeutic use）”； 对白血病来说是利用药物来治疗，故其应组 配副主题词“药物疗法（drug therapy）”。
liver cancer AND alcohol
基本检索举例：肝癌和酒精的关系
输入：liver cancer AND
alcohol
“肝癌和酒精的关系”的基本检索结果
5.2 高级检索
高级检索
5.2 高级检索
5.2 高级检索
高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献
分析该检索课题，包含两个方面： 作者为：马大龙（ma dl）； 作者单位为： 北京大学（peking university）。
➢ 限制检索字段：如liver cancer[ti] ➢ 作者：Smith J 、
➢ 仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如： Smith[au] ➢ 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索
➢ 如：Joshua Lederberg
5.1 基本检索
➢ 期刊刊名： ⑴可用期刊全称：GENE THERAPY[TA]； ⑵ 可 用 期 刊 简 称 ： JAMA[TA] ； (The Journal of the American Medical Association)
Publisher-Supplied Citations：由出 版商提供的电子文献，每条记录标有 [PubMed-as supplied by Publisher]。
3. PubMed检索机制
自动转换匹配功能
(Automatic Term Mapping)
Leukemia "leukaemia"[All Fields] OR
PubMed生物医学数据库检索方法与技巧
主要内容
PubMed概况 PubMed数据来源 PubMed检索机制 PubMed检索运算符 PubMed检索方法 结果的显示、打印、保存 其他辅助功能
1. PubMed概况
创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI)
1997年6月开始向全球开放
特色：具有收录范围广（免费）、内容全、 检索途径多、检索体系完备等特点，部分文 献还可在网上直接免费获得全文。
2. PubMed数据来源
MEDLINE： [pubmed-indexed for medline]
In Process Citations：每天收录，尚 未经规范处理的数据。[pubmed-in process]
人重组三叶因子（human recombinant trefoil factor）
("humans"[MeSH Terms] OR "humans"[All Fields] OR "human"[All Fields]) AND recombinant[All Fields] AND ("trefoil factor"[Supplementary Concept] OR "trefoil factor"[All Fields])