materialstudio软件的使用经验分享
感受对于Materials Studio 实际应用的一些看法

对于Materials Studio 实际应用的一些看法材料032 杨显“Materials Studio是Accelrys公司针对材料科学研究而开发的新一代材料模拟软件,它可以帮助解决当今化学、材料工业中的一系列重要问题。
”这是在该软件介绍资料扉页上的对于此软件的描述。
通过浏览从老师那获得的有关Materials Studio的光盘,介绍资料和书籍,并结合自己在网页和论坛上看到的对于该软件的一些介绍和评价,我了解到Materials Studio着实是一个功能极其强大而又全面的软件,因此,这样的软件如果能够恰当的应用在我们的学校科研、教学和学习生活中,给我们带来的益处将是无法预计的。
首先,在科研方面,作为目前全球范围内唯一能够提供分子模拟、材料设计以及化学信息学和生物信息学全面解决方案和相关服务的软件供应商,Accelrys公司提供的不仅仅是一个能综合运用量子力学、Monte Carlo、分子力学、分子动力学、介观动力学和耗散粒子动力学、统计方法QSAR等多种先进算法和X 射线衍射分析等仪器分析方法的强有力的模拟工具,Materials Studio软件还采用灵活的Client-Server结构。
其核心模块Visualizer运行于客户端PC,支持的操作系统包括Windows 98、2000、NT;计算模块(如Discover,Amorphous,Equilibria,DMol3,CASTEP等)运行于服务器端,支持的系统包括Windows 2000、NT、SGIIRIX以及Red Hat Linux。
浮动许可(Floating License)机制允许用户将计算作业提交到网络上的任何一台服务器上,并将结果返回到客户端进行分析,从而最大限度地利用了网络资源。
任何一个研究者,无论是否是计算机方面的专家,都能充分享用Materials Studio 软件所带来的先进技术。
Materials Studio生成的结构、图表及视频片断等数据可以及时地与其它PC软件共享,方便与其他同事交流。
material_studio个人经验讲解

Materials Studio是Accelrys专为材料科学领域开发的可运行于PC机上的新一代材料计算软件,可帮助研究人员解决当今化学及材料工业中的许多重要问题。
Materials Studio软件采用Client/Server结构,客户端可以是Windows 98、2000或NT系统,计算服务器可以是本机的Windows 2000或NT,也可以是网络上的Windows 2000、Windows NT、Linux 或UNIX系统。
使得任何的材料研究人员可以轻易获得与世界一流研究机构相一致的材料模拟能力。
Materials Studio是ACCELRYS 公司专门为材料科学领域研究者所涉及的一款可运行在PC上的模拟软件。
他可以帮助你解决当今化学、材料工业中的一系列重要问题。
支持Windows98、NT、Unix以及Linux等多种操作平台的Materials Studio使化学及材料科学的研究者们能更方便的建立三维分子模型,深入的分析有机、无机晶体、无定形材料以及聚合物。
任何一个研究者,无论他是否是计算机方面的专家,都能充分享用该软件所使用的高新技术,他所生成的高质量的图片能使你的讲演和报告更引人入胜。
同时他还能处理各种不同来源的图形、文本以及数据表格。
多种先进算法的综合运用使Material Studio成为一个强有力的模拟工具。
无论是性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟,我们都可以通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。
灵活方便的Client-Server结构还是的计算机可以在网络中任何一台装有NT、Linux或Unix操作系统的计算机上进行,从而最大限度的运用了网络资源。
ACCELRYS的软件使任何的研究者都能达到和世界一流工业研究部门相一致的材料模拟的能力。
模拟的内容囊括了催化剂、聚合物、固体化学、结晶学、晶粉衍射以及材料特性等材料科学研究领域的主要课题。
Materials Studio采用了大家非常熟悉Microsoft标准用户界面,它允许你通过各种控制面板直接对计算参数和计算结构进行设置和分析。
materials studio操作手册

materials studio操作手册Materials Studio是一款功能强大的材料模拟软件,广泛应用于材料科学、化学、物理等领域。
本手册旨在向初学者介绍Materials Studio 的基本操作方法,帮助读者快速上手和熟练使用该软件。
一、软件介绍Materials Studio是由Accelrys公司开发的一款材料模拟软件,提供了多种计算和模拟工具,包括材料结构建模、分子动力学模拟、密度泛函理论计算等。
软件界面简洁直观,操作相对简单,适合初学者学习和使用。
二、软件安装1. 下载Materials Studio安装包,双击运行安装程序。
2. 按照安装向导的提示进行安装,并选择安装路径。
3. 安装完成后,打开软件,输入许可证信息进行激活。
三、材料结构建模1. 打开Materials Studio,点击菜单栏的“建模”选项。
2. 在“建模”界面中,选择所需的建模工具,如“晶体构建”、“分子段构建”等。
3. 根据需要输入所需的参数,如晶体的晶面、晶格常数等。
4. 完成结构建模后,保存并命名该模型。
四、模拟计算1. 在Materials Studio主界面,点击菜单栏的“计算模拟”选项。
2. 在“计算模拟”界面中,选择所需的计算方法,如分子动力学模拟、能带计算等。
3. 根据需要输入所需的参数,如温度、压力、模拟时间等。
4. 点击“开始计算”按钮,等待计算结果的生成。
五、数据分析与可视化1. 根据计算结果,在Materials Studio主界面选择“后处理与分析”选项。
2. 在“后处理与分析”界面中,选择所需的分析工具,如晶体结构分析、能带分析等。
3. 输入相应的参数和选择所需的分析方法。
4. 运行分析工具后,生成分析结果,并通过可视化方式展示。
六、参数优化1. 在Materials Studio主界面,选择“参数优化”选项。
2. 在“参数优化”界面中,选择所需的优化算法,如遗传算法、全局优化算法等。
materials studio 离子 吸附 计算

materials studio 离子吸附计算
Materials Studio是一款材料科学模拟软件,可以用于计算离子吸附等过程。
下面将提供一个简要的离子吸附计算流程,但请注意,具体的操作步骤可能因软件版本、模型选择以及计算目标的不同而有所差异。
模型准备:首先,需要创建一个合适的模型来描述吸附剂(比如表面或孔道)和吸附质(离子)。
这可能涉及到构建晶体结构、切割表面、添加真空层等步骤。
力场选择:离子吸附过程通常涉及到静电相互作用,因此需要选择一个合适的力场来描述体系中的原子间相互作用。
常用的力场包括COMPASS、UFF等。
设置吸附条件:根据实验或理论条件,设置离子的浓度或压力,这可以通过将浓度转化为压力来实现。
模拟方法选择:根据体系的大小和复杂性,选择合适的模拟方法。
例如,对于简单的体系,可以使用Metropolis方法;对于链状分子,可以考虑使用configurational bias方法。
参数设置:设置模拟的步长、温度等参数,以及静电力和范德华力的计算方法。
注意截断半径的设置不能超过模型所在盒子短边边长的一半。
运行模拟:设置好所有参数后,可以开始运行模拟。
结果分析:模拟完成后,可以对结果进行分析,比如查看离
子的吸附构型、计算吸附能等。
请注意,以上步骤仅提供了一个大致的计算流程,具体的操作可能会因体系和目标的不同而有所调整。
在进行离子吸附计算时,建议参考Materials Studio的官方文档或相关教程以获取更详细的信息和指导。
material_studio个人经验

Materials Studio是Accelrys专为材料科学领域开发的可运行于PC机上的新一代材料计算软件,可帮助研究人员解决当今化学及材料工业中的许多重要问题。
Materials Studio软件采用Client/Server结构,客户端可以是Windows 98、2000或NT系统,计算服务器可以是本机的Windows 2000或NT,也可以是网络上的Windows 2000、Windows NT、Linux 或UNIX系统。
使得任何的材料研究人员可以轻易获得与世界一流研究机构相一致的材料模拟能力。
Materials Studio是ACCELRYS 公司专门为材料科学领域研究者所涉及的一款可运行在PC上的模拟软件。
他可以帮助你解决当今化学、材料工业中的一系列重要问题。
支持Windows98、NT、Unix以及Linux等多种操作平台的Materials Studio使化学及材料科学的研究者们能更方便的建立三维分子模型,深入的分析有机、无机晶体、无定形材料以及聚合物。
任何一个研究者,无论他是否是计算机方面的专家,都能充分享用该软件所使用的高新技术,他所生成的高质量的图片能使你的讲演和报告更引人入胜。
同时他还能处理各种不同来源的图形、文本以及数据表格。
多种先进算法的综合运用使Material Studio成为一个强有力的模拟工具。
无论是性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟,我们都可以通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。
灵活方便的Client-Server结构还是的计算机可以在网络中任何一台装有NT、Linux或Unix操作系统的计算机上进行,从而最大限度的运用了网络资源。
ACCELRYS的软件使任何的研究者都能达到和世界一流工业研究部门相一致的材料模拟的能力。
模拟的内容囊括了催化剂、聚合物、固体化学、结晶学、晶粉衍射以及材料特性等材料科学研究领域的主要课题。
Materials Studio采用了大家非常熟悉Microsoft标准用户界面,它允许你通过各种控制面板直接对计算参数和计算结构进行设置和分析。
MaterialsStudio快速入门教程

1. 输入一个结构
File / Import,打开输入文件对话框
(注意,此对话框也可用工具栏上的输入按钮
打开)。
选择 Examples / Documents / 3D Model / TON.msi,单击 Import 按钮。
来选择相应的对象。单击
* 在TON 结构上单击选中的原子,此原子颜色改变,说明被选中。
* 单击一个键,此键的颜色改变,说明被选中。
键被
选中
原子被选中
* 按住鼠标左键,沿斜线托拽,可以选择一定区域内的所有对象,包括原子和键。
此区域的 原子和键 都被选中
* 在结构中的某个原子或键上双击鼠标可以选择整个结构。 * 在3D Viewer 上无TON 结构的地方单击或双击鼠标,则取消对象的选择。 * 需要将结构保存为project的一部分时,单击3D Viewer 的 ,再按 Yes 按钮。 * File / Save Project ,Windows / Close All
点击Modify Element 按钮 右侧的箭头,在下拉选项中选择 Nitrogen,则碳 原子变为氮原子。
在3D Viewer的任意位置点击左键,取消原子选择。
C
N
一般选中某个原子后,在Modify 菜单下的Modify Element 中选择Oxygen 或其它原子来改变原子类型。
6. 编辑键的类型
在 3D Viewer 工具栏上,单击 3D Viewer Selection Mode 按钮 。
如果 3D Viewer 工具栏
没有出现, 在View /
materialsstudio键长单位__概述说明以及解释

materialsstudio键长单位概述说明以及解释1. 引言1.1 概述:本文将对Material Studio键长单位进行详细介绍和解释。
键长单位是材料科学中一个重要的概念,用于描述材料中原子之间的距离。
Material Studio是一款广泛应用于材料研究领域的软件,其中包含了一套独有的键长单位体系。
本文将探讨键长单位在Material Studio中的使用方法以及其对材料研究的重要性。
1.2 文章结构:本文共分为五个部分。
首先,引言部分将概述文章的主题和组织结构。
其次,第二部分将解释键长单位的概念,并介绍在Material Studio中如何使用这些单位进行计算和分析。
第三部分将通过实际应用举例来说明键长单位在材料研究中的作用和意义。
接着,第四部分将探讨Material Studio 键长单位与其他计算软件之间进行转换时需要考虑的问题和误差来源。
最后,在结论部分总结Material Studio 键长单位的优势和局限性,并展望未来发展方向并提出相关建议。
1.3 目的:本文旨在帮助读者全面了解并掌握Material Studio中键长单位的应用。
通过对键长单位的解释和使用方法的介绍,读者将能够更好地理解材料中原子之间的距离,并能够在Material Studio软件中进行相关的计算和研究。
此外,本文还将探讨键长单位在其他计算软件中的转换问题,以便读者在不同软件之间进行数据共享和比较时有所依据。
通过阅读本文,读者将能够充分认识到键长单位在材料科学研究中的重要性,并为未来相关研究提供一定参考和指导。
2. Material Studio 键长单位:2.1 解释键长单位的概念:键长单位是指用于描述化学物质中原子之间相对距离的计量单位。
通过测量连接两个原子之间的键长,可以获得化学物质的结构信息。
键长单位通常以埃(Angstrom,简记为Å)作为表示,在Material Studio中也采用这一常见的计量单位。
materials studio操作手册

:【序】介绍众所周知,材料工程是一门非常重要的学科,它研究的对象是材料的性能、制备、加工和应用。
一直以来,科学家们致力于寻找更好的材料,并开发出各种工具来帮助他们更好地理解和研究材料。
在材料研究领域中,Materials Studio(材料工作室)无疑是一个非常重要的软件工具,它能够帮助研究人员进行材料建模、仿真和分析,以更好地理解材料的性能和行为。
【一】Materials Studio的基本概念让我们来介绍一下Materials Studio的基本概念。
Materials Studio 是由Accelrys公司开发的一款集成的材料建模软件评台,它包括多个模块,可以用于原子建模、晶体学分析、分子建模、材料性能预测和材料工程等领域。
使用Materials Studio,研究人员可以对材料的结构和性能进行全面的分析和预测,这对于新材料的设计和开发非常有帮助。
【二】Materials Studio的操作手册接下来,让我们来详细了解一下Materials Studio的操作手册。
在使用Materials Studio进行材料建模和仿真时,研究人员需要掌握一系列的操作技能,包括建立原子模型、进行能带计算、进行分子动力学模拟等。
在操作手册中,会详细介绍每个操作步骤,并提供相关的实例和案例,帮助研究人员更好地掌握这些操作技能,从而更好地应用Materials Studio进行材料研究。
【三】对Materials Studio操作手册的个人理解在我看来,Materials Studio操作手册是非常有价值的。
通过学习和掌握这些操作技能,我可以更好地进行材料建模和仿真,更好地理解材料的性能和行为,从而为新材料的设计和开发提供有力的支持。
Materials Studio操作手册还可以帮助我更好地应用软件工具进行科研工作,提高工作效率和研究质量。
【结语】总结和回顾经过对Materials Studio的基本概念和操作手册的介绍,我对这个材料研究工具有了更深入的了解。
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绘图实例
Origin7.5简析
2015/10/31
9
数据图形绘制
图形类型
二维图形 三维图形 多坐标轴
绘图数据来源
工作表或Excel工作簿 矩阵数据 多组关联数据
版面设计
数据及图形组合
2015/10/31
10
二维图形绘制
二维绘图工具栏
二维图形绘制常用方法
选择工作表中 所需绘制图形 的数据列,选 择相应的图形 选择工作表中 所需绘制图形 的数据列,拖 放到绘图窗口
2015/10/31 16
根据所得点阵图是否规 则来选择如何转化矩阵
Origin内置三维图
绘图类型按钮 帮助文件提供图样
2015/10/31
17
三维彩色表面图
选中矩阵中 的所有数据 在Plot菜单 中选择三维 彩色表面图
三维绘图默认的显示模式是加速模 式,如需要精细的结构按下页操作
2015/10/31
2015/10/31 29
多峰值拟合 非线性拟合
非线性最小平方拟合
非线性最小平方拟合 NLSF 基本模式 提供近200个表达式用于拟合 高级模式
2015/10/31
30
NLSF向导拟合
NLFS拟合向导
第一页选 择需要拟 合的数据 第二页选 择需要拟 合的函数 第四页为 函数拟合 结果,可 选择迭代
经过加强的2D和3D绘图效果,更为合理的绘图管理模块
2015/10/31
4
基本操作
Origin7.5简析
2015/10/31
5
工作界面介绍
菜单栏
工具栏 绘图区 管理器 状态栏
与 Office类似多 提供常用的快捷 主要工作区,绘 类似于 Windows 标出当前工作状 文档界面选项, 工具按钮,同时 图及数据处理都 下资源管理器, 态,对鼠标所指 几乎能够实现 可以自定义添加 在这个区内进行 方便多窗口切换 按 钮栏 进 行附 说件 明 Origin 所有功能 工 具 的
手工输入参数尝试 将参数贴入结果窗口
Step6
显示粘帖拟合结果
将多余拟合线去除
选择迭代次数
绘出拟合曲线 直到基本相近
32
2015/10/31
自定义函数拟合
与内置函数拟合的唯 一区别在于要手工输 入表达式和定义参数
定义函数步骤
定义变量,逗号分割 输入函数表达式 编辑完成保存函数 函数名 此处 打勾
变量名 表达式
14
2015/10/31
创建和复制主题
选择需要保存的格式选项
打开高级选项
保存完后可 可进行更为 在主题画廊 可以选择性 详细的设置 中找到主题 地复制现有 图案的格式
在绘图窗口空白区域单击右键 通过粘帖键 可粘帖格式
15
2015/10/31
三维图形绘制
三维绘图工具栏 数据需转换成矩阵数据表
选择X与Y列做点阵图 数据已经转化为矩阵
47
平滑, 归一化, 排序
Savitzky-Golay Adjacent Averaging FFT Filter 排序 对每个点用局部多元回归算法 对n个点数相邻数据求平均
对数据进行FFT处理,除去高频成分
Custom可以选择排序选项
归一化
默认值为本列最大值
图片窗口 激活状态 点击右图中的峰值,单击后可 选择需要拟合峰的数量 选择大致的半高宽 以用左右键移动精确调整,同 时可按空格键调整十字星大小 以右图高斯函数拟合为例
R^2一般可达到 0.99以上 峰值点的数据会显示出来
2015/10/31 34
峰值拾取
在矩形范围内曲线的最大 值和矩形宽度两端曲线值 的高度差大于矩形高度, 因此与取的矩形大小有关 搜索矩 形设置
Origin7.5简析
赖祖亮
2015/10/31
1
Origin软件简介
Origin系列软件是美国 OriginLab公司推出的 数据分析和制图软件, 是公认的简单易学、操 作灵活、功能强大的软 件,既可以满足一般用 户的制图需要,也可以 满足高级用户数据分析、 函数拟合的需要。
视频介绍 官方主页:
在空白区域单击鼠标右 键可打开向导设计模式
2015/10/31 31
可增减拟 合的步骤
自带函数拟合
Step1 Step2 Step3 Step4 Step5 选择适当的内置函数 编辑函数的形式参数 设置X轴与Y轴数据 手工调试基本参数 进行数据迭代拟合
选择X轴与Y轴数据 将参数贴入图中 迭代最终结果及误差值
2015/10/31
46
简单数学运算
简单数学符运算 减去参考数列 可输入数字 减去参考直线
微分 smooth 积分
运算后原 数据改变
选定曲线沿坐标轴垂直或水平移动 多条曲线平均
求激活所有数据Y轴的平均值
插值和外推:利用已有数据 估算出新的数据点
傅立叶变换
插值运算最小值 插值运算最大值 插值点数
2015/10/31
Step1 Step2 Step3
如以后需要 用此函数别 忘了保存哦
2015/10/31
33
多峰分析及拟合
多峰拟合主要采用Gaussian和Lorentzian函数进行拟合
Origin提供操作简单的自动拟合工具,所得拟合曲线误差极小
4个峰值点定位完成后自动拟 合数据,并给出拟合数据表 峰值点确定后会显示为绿色虚线
另三个选项卡用来设置字体和颜色
2015/10/31
26
图形版面设计
工作表数据与图形一起展示 打开方式
对象排版工具栏
2015/10/31 27
函数拟合
Origin7.5简析
2015/10/31
28
拟合菜单
高级拟合工具 线性拟合工具 多项式拟合工具 S曲线拟合工具 拟合对比数据 多峰拟合工具 拟合比较工具安装 初级拟合菜单 线性拟合工具 多项式拟合工具 一阶指数衰减拟合 一阶指数增长拟合 S曲线拟合工具 Gaussion拟合 Lorentzian拟合 高级拟合工具需要设置参数, 初级拟合菜单较适合初学者
拟合图
数据表
2015/10/31
44
数据分析
Origin7.5简析
2015/10/31
45
数据选取工具
图例 名称 屏幕坐标读取工具 数据读取工具 数据段选取工具 自由画点工具 作用 读取屏幕内任意一点坐标 读取数据线上一点坐标 选择数据线上一段数据 在屏幕上任意画点
可用鼠标左右键移动
Ctrl+鼠标左右键移动 选取数据会显示在数据框中
2015/10/31
13
主题绘图
主题概念 主题画廊 Origin内置或用户定义图形格式信息集合合称为主题 Gallery Themes Format-Gallery Themes 或 F7
选中一个主题, 单击右键弹出菜 单可以进行编辑
点击 Apply 即 应用此主题, Undo Apply 则取消应用
利用函数绘图
利用Plot Setup对话框 工作表中数据 添加到图形中
2015/10/31
11
函数绘图
新建一个函数
定义函数数据表
调整坐标 系以显示 整个函数 图像区域再 次单击右键
选择或者输 入一个函数
图像区域 单击右键
12
2015/10/31
Origin内置二维图
绘图类型按钮 帮助文件提供图样
2015/10/31
36
PFM多峰模块
装载PFM模块
工具栏 C:\Program Files\OriginLab\OriginPro75\PFM
2015/10/31
37
PFM向导与页面
向导栏
选择拟合范围
峰分析按钮 数据选择栏
向导进程按钮
2015/10/31
38
基线点选取
以某条Y轴作为基线
预处理页面 基线校正 自动寻找基线点 选择平滑模式 自定义拾取基线点 局部多元回归算法 相邻平均值法 用某列数据作基线 傅立叶变换法 拾取点数据
2015/10/31
6
工具栏的添加
该类工具栏 所包含按钮
可选择你需 要的工具栏
该按钮功能
2015/10/31
7
窗口类型
工作表窗口 绘图窗口 版面设计窗口 Excel工作簿窗口 矩阵窗口 记事窗口 结果显示窗口 代码编辑器窗口 对应工具栏
2015/10/31 8
存放和组织 相当于图形编辑器,可包含图层, 将工作表和图形结合起来的显示窗 Origin Origin 运行 支持矩阵工作表的做图,矩 可以调用 Origin Analysis Excel 中的数据,并利 菜单命令后自 的工具和工 用 O r于记 igin 录用户 C编程 使用 语言 过程中 代码编 的信 辑息 器 用这些数据进行统计、分析和绘图 轴,注释,数据标注等图形对象 口 作表,方便地实现两个软件的切换 阵 动 ,可设置自定义版面设计窗口 运产 生 算的 和数 工据 作拟 表合 转等 变的 为结 矩果 阵
Step3 将数据依次添加到各图层
弹出的Plot Setup对话框尤为重要up窗口详解
选择Data1 中的数据
勾选相应 的坐标轴
选择相 应图层
数据已经在图层1 中添加,而后再 添加各图层数据
此处会弹出 相应的数据
点Add键
数据已经添加 选择关联坐标轴 点OK键
41
自动寻峰
峰函数设定
自动寻峰,求曲线二阶导数, 所得值大于设定阈值即为峰 曲线二阶导数排前10位的峰
从文件中读取峰 位置和峰高数据
2015/10/31
42
峰定义,编辑页面
点击Add峰预览框 手 动添加峰 峰位置 峰高