(信息检索)生物医学文献主题标引基础
医学文献检索基础知识

医学文献检索基础知识
文献检索工具
2、文献检索工具的作用 存贮作用 检索作用
报道作用
医学文献检索基础知识
文献检索工具
3、检索工具的特点 收录文献的有限性 报道文献的时滞性
文献标引深度的有限性
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文献检索工具
4、检索工具的种类 (1)按照对文献收录的范围可分为 综合性检索工具 专业性检索工具 专题性检索工具 单一性检索工具
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举例
如: R5 内科学 R51 传染病 R52 结核病 R53 寄生虫病 R531 原虫病 R532 蠕虫病 .1 线虫病 .2 吸虫病 .3 绦虫病和囊虫病
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文献检索语言
②主题描述语言 A、主题词法: 主题词(subject headings)又称为叙词,是 代表文献内容的确切的规范化的名词术语,它受 词表的限制。采用主题词法编制的索引一般称为 主题索引(subject index)。 最具代表性的是美国的《医学主题词表》
医学文献检索基础知识
医学主题词表
医学主题词表(Medical Subject Headings)
医学主题词表是随IM由NLM出版的,目的
是确保作者、主题标引者和检索者在用语上保
持一致,避免因主题词选择失误而造成漏检、
误检和空检。
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(一)结构
•导言 •字顺表、树状结构、副主题词的编排及 使用说明 •主题词变更表 •弃用主题词和其继用词对照表
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文献检索途径
五、医学文献检索途径 篇名途径 著者途径 姓在前,名在后 著者地址 刊名途径 主题词途径 关键词途径 分类途径 序号途径
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医学文献检索基础知识 PPT

Nutritional and Metabolic Diseases(Non MeSH) C18
Metabolic Diseases
C18.452
Achlorhydria
C18.452. C6.405.748
Acidosis
C18.452.76.176
Acidosis,Lactic C18.452.76.176.180
•新增主题词和其前用主题词对照表 •原用主题词和其新增主题词对照表
医学主题词表
1、字顺表的结构 字顺表是MeSH的核心部分,它是将IM使用
的1.8万个主题词及款目词(主题词的同义词、 近义词等,为非主题词),按字顺排列组成 的词表。
医学主题词表
2、字顺表中的参照系统
第一组 用代参照: 反映词与词的同义或近义关系, 主要用于读者查找规范化的主题词。See X
(发热 反参 体温)
医学主题词表
(三)树状结构(Tree Structure)
又称范畴表,是将字顺表中的主题词按每 个词的词义范畴和学科属性分门别类地归入15 个大类之中,分别用15个英文字母标示。每个 大类下又要据需要划分为若干一级类、二级 类…….最小的类可分至9级。
医学主题词表
结构示例如下:
文献检索工具
3、检索工具的特点 收录文献的有限性 报道文献的时滞性 文献标引深度的有限性
文献检索工具
4、检索工具的种类 (1)按照对文献收录的范围可分为
综合性检索工具 专业性检索工具 专题性检索工具 单一性检索工具
文献检索工具
(2)按载体或出版方式可分为 书本式检索工具 机读式数据库
文献检索工具
检索
No
检索结果是否满意
中国生物医学文献数据库检索sinomed

2.3 分类检索
通过分类导航逐级展开来实现 在类名、类号输入框输入学科类名或类号
分类号扩展检索 :对该类号及其下位类号进行查找 复分组配检索 :对于可复分的类号,选择复分组配 检索(可选择多个复分号)
2.3 分类检索
例3. 查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的 文献
分类检索界面,选 择“类名”检索字 段并输入检索词 “麻疹”
例1:腹痛的并发症
检索策略: #1 主题词=="腹痛/CO/全部树" #2 (腹痛 OR 腹疼)AND 并发症 #3 #1 OR #2
检索结果显示、打印和保存
结果显示格式:“题录格式”、“文摘格式”、 “详细格式” 结果输出方式: 打印、保存和E-mail 排序方式:“年代”、“作者”、“期刊”、 “相关度” 全文获取 :
CBM数据库与维普科技期刊全文数据库链接 提供北京协和医学院博硕学位论文的在线原文 阅读功能
原文索取 :
通过填写“全文申请表”、“文件导入”等方 式申请所需要的文献
2.2 主题检索
例1. 在《中国生物医学文献数据库(CBM)》 中利用主题途径检索有关“骨关节结核治疗” 的文献。
选择恰当的主题词 “结核, 骨关节” 后,点击进入该主 题词的注释信息显 示界面
加权检索:仅对加星号(*)主题 词(主要概念主题词)检索 扩展检索:对当前主题词及其下位 主题词进行检索
2.2 主题检索
主题检索是基于文献内容的主题概念进行 检索,有利于提高查全率和查准率。 主题检索的依据 : 《医学主题词表(MeSH)》中译本 《中国中医药学主题词表》
规范化处理之前
标题:艾滋病并发结核致免疫重建炎性综合征的临床及影像 表现 著者:袁春旺; 赵大伟; 梁连春; 李在村; 陈枫; 段勇; 王微 著者单位:首都医科大学附属北京佑安医院放射科, 100069 文摘:目的:探讨艾滋病(AIDS)并发结核患者在高效抗逆转录 病毒治疗(HAART)中发生免疫重建炎性综合征(IRIS)的临床特 征及影像表现。方法:回顾分析4例AIDS并发结核患者在 HAART中发生IRIS的临床及影像资料。结果:以上临床及影像 表现均具有临时性及白限性特征,随着抗结核及HAART联合治 疗的继续,病情均出现好转。结论:AIDS并发结核患者在 HAART中均有可能发生IRIS,影像检查对IRIS的早期诊断、病 情监测、疗效评价及治疗具有重要的作用。 出处:中华放射学杂志 2008; 42(2) : 149-151
中国生物医学文献系统采用《医学主题词表》和《中医药学主题词表》进行标引与分类

中国生物医学文献系统采用《医学主题词表》和《中医药学主题词表》进行标引与分类
,介绍其原理和作用
中国生物医学文献系统是一个重要的国家级的医学文献数据库,
为了解决存在的文献管理和分类问题,采用了《医学主题词表》和
《中医药学主题词表》进行标引与分类。
《医学主题词表》是国家质量技术监督总局质量安全技术研究中
心根据中国临床医学、实验医学、公共卫生、基础医学、药学、护理
学等医学专业和医学各学科分别编制而成的一部领域主题词表,包括
350多种核心主题词,4000多个主题词及单位语义意义,涵盖各学科
的1-7层次的核心概念,旨在为医学方面的文献检索、索引、分类提
供支持。
《中医药学主题词表》是国家质量技术监督总局质量安全技术研
究中心依据中医药学专业编制而成的一部领域主题词表,涵盖中医药
学9层次的核心概念,包括中医药学专业的核心概念、临床概念、中
医学理论、诊断方法、治疗方法及健康促进的概念等,旨在为中医药
文献检索、索引、分类提供支持。
通过采用《医学主题词表》和《中医药学主题词表》,不仅可以
实现对文献的有效信息检索和索引,还能够更好地有效地实现文献的
分类,从而使用户更加方便快捷地获取所需要的信息。
由此可见,采
用《医学主题词表》和《中医药学主题词表》作为国家级医学文献系
统的标引与分类方法有其十分重要的意义,是当前国内医学文献信息
化的一个重要的步骤。
第三章文献检索常用中文数据库

医学信息检索练习题主编:华北煤炭医学院医学信息检索教研室第三章常用中文数据库一、名词解释1. 二次检索2. 加权检索二、填空题1.中国生物医学文献数据库的主题标引依据、________________。
2.中文科技期刊数据库的回溯期是年。
3.中国学术期刊网络出版总库中的检索项“主题”包括、、。
4.万方数字化期刊的回溯是年。
三、判断题:( ) 1. CNKI是中国期刊全文数据库的缩写名称。
( ) 2. 在CBM数据库中,若要了解某一期刊的相关信息,可以在基本检索界面选择“刊名”字段,进行检索。
( ) 3. 我们可以利用CBM的“E-mail”功能将检索结果发送至自己的邮箱,但是发送的结果最多不能超过500条。
( ) 4. 中国学术文献网络出版总库的检索首页默认为跨库检索,即在系统默认的多个数据库中同时检索。
( ) 5. 万方数字化期刊中的全文有PDF和CAJ两种格式。
( ) 6. 中国学术期刊网络出版总库和中文科技期刊数据库(全文版)的全文都不能批量下载。
四、选择题( ) 1.下列关于中国学术文献网络出版总库检索结果下载的说法正确的是a. 题录可以批量下载,但每次不能超过50条。
b. 题录可以批量下载,但每次不能超过200条。
c. 全文可以批量下载,但每次不能超过50篇。
d. 全文每次只能下载1篇。
( ) 2. 从中国学术期刊网络出版总库中检索得到的全文可以用下列哪种(些)阅读器阅读?a. CAJViewerb. Adobe Readerc. SSReaderd. Apabi Reader( ) 3.下列数据库中,回溯期最早的是a. 中国生物医学文献数据库b. 中文科技期刊数据库c. 中国博士学位论文全文数据库d. 中国重要会议论文全文数据库( ) 4. 在我们所学数据库中的“二次检索”和“在结果中检索”是指:a. 在已检出文献的基础上,再加入新的词进行进一步的检索,相当于逻辑组配符ANDb. 在已检出文献的基础上,再加入新的词进行进一步的检索,相当于逻辑组配符ORc. 在已检出文献的基础上,再加入新的词进行进一步的检索,相当于逻辑组配符NOTd. 在已检出文献的基础上,再加入新的词进行进一步的检索,逻辑组配符可任意选择AND、OR、NOT( ) 5. 以下中文数据库中,哪个具有主题词检索功能a. 中国生物医学文献数据库b. 中国学术期刊网络出版总库c. 中文科技期刊数据库d. 万方数字化期刊五、简答题1.简述中国生物医学文献数据库的检索途径。
医学文献信息检索--第一章 文献信息检索基础

零次文献
一次文献
科技文献层次结构
三次文献(浓缩的新的信息产品) 将知识重新组合,使知识序列化
二次文献(一次文献的替代品) 将分散的文献序列化 一次文献(初始的知识产品) 将知识以文字等形式固化 零次文献(创造知识的素材) 信息的直接记录或传递 研究活动(实验、观察、思考)
3.认识不同载体的文献
印刷型文献:纸质
实例:
中国核科技报告 China Nuclear Science and Technology Report 主办:《中国核科技报告》编辑部 周期: 半年 出版地:北京市 语种: 中英 开本: 16开 ISSN 1671-7430 CN 11-9253/TL 创刊年:1985
主题词检索途径
序号:N2
序号:N1 主题词:S1 著者:Au1 标题:t1 ……
著者倒排档
Au1:N1,N4 Au2:N3 Au3:N4 ……
著者检索途径
……
主文档和倒排文档的关系示意图
其它检索途径
四、文献信息检索系统的分类 1.书目型数据库
2.事实数值型数据库
3.全文型数据库
文献信息数据库
(4)三次文献(Tertiary Document):是科技人员围 绕某一专题,借助于二次文献,在充分研究与利用大量一 次文献的基础上,经过阅读、分析、归纳、概括,撰写而 成的新的文献。 表现形式主要有:综述(Review)、述评 (Comment)、进展(Progress、Advance)、现状 (Update)、发展趋势(Trend)等期刊文献和百科全 书、年鉴、手册等参考工具书。
⑤政府出版物
政府出版物:这是各国政府部门及其设立的专门
机构发表、出版的文件,分为行政性文件(如法 令.统计等)和科技文献(30%~40%)。
医学主题词表(信息检索)

(Medical Subject Headings, MeSH)
P15
一. 概 况
由美国国立医学图书馆(NLM)编制,用于对生物医学 文献进行标引和检索的权威性术语控制工具。 MeSH 能使文献资料的标引者和检索者之间在用词上 保持一致,即指引检索者查到 IM 使用的主题词、副 主题词;了解主题词的学科类属关系、历史变化情况
构号越短,表示概念越泛指;号码越长,表示概念越专 指。
树状结构表
Digestive System Disease(消化系统疾病) Liver Disease(肝病) Hepatitis(肝炎) Hepatitis,Alcoholic(乙醇性肝炎) Hepatitis,Animal(动物性肝炎) C6 C6.552 C6.552.380 C6.552.380.290 C6.552.380.315
Hepatitis,Toxic(中毒性肝炎)
Hepatitis A(甲型肝炎)
C6.552.380.615
C6.552.380.705.422
Hepatitis,Viral,Human(人类病毒性肝炎)C6.552.380.705
Hepatitis B(乙型肝炎)
C6.552.380.705.437
字顺表的著录格式
DOWN SYNDROME① 唐氏综合征 C10.496.259 C16.131.77.327 F3.709.346.200② 75③,63-64;was MONGOLISM 1965~1974 See related④ AMYLOID BATE-PROTEIN AMYLOID BATE-PROTEIN PRECURSOR X MONGOLISM X TRISOMY21
收词数量
中国生物医学文献数据库

检索结果
(四)期刊检索
提供“分类导航”或“首字母导航”逐级查 找浏览期刊
提供用户从刊名、出版地、出版单位、期刊 主题词或者ISSN直接查找期刊
期刊表列出了数据库中收录的期刊名称及其 有关编辑部的详细信息
(四)期刊检索
例4:用期刊检索途径查找北京大学学报.医学 版的通讯地址,并检索该刊涉及研究近视的 全部文献
综合案例
课题包含的主要概念、概念的分支
诱导因素: 是针对该疾病的具体研究方向。可在主要
概念“子宫内膜异位症”找到规范化主题词形式 后,选取与“诱导因素”对应的副主题词。
同义词:诱发因素、诱因 分支概念:遗传因素、化学诱导、病因学
综合案例
课题包含的主要概念、概念的分支
研究进展: 太泛指的词。很多文献中可能不出现“研究
式:如 #1 and #2 登录用户可“保存策略”,用于定题检索 最多允许保存100条检索式 系统退出后,检索历史自动清除
(六)检索历史
作者=王福生 AND 缺省=胰腺 癌;
#9 AND #10
四 检索结果处理 1、 结果显示
四、检索结果处理 2、结果保存
3、结果分析:
中国生物医学文献数据库 (CBM)
授课内容
1
简介
2
பைடு நூலகம்
数据库入口
3
检索途径及技术
4
检索结果处理
5
其他功能小结
一、数据库简介
§ 发行: 中国医学科学院医学信息研究所
§ 收录范围: - 年限:1978-今 - 学科范围:基础医学、临床医学、预防医学、
药学、中医学及中药学等生物医学各个领域。 - 数据量:2695种期刊种中国期刊、以及汇编、会 议论文的文献题录,均进行主题标引和分类标引等 规范化加工处理。文献量800万篇。年更新文献60 余万篇。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
现单一性、动态性两个特点
单一性: (1)规定概念与主题词的单一对应,即一个主题词
只能表达一个概念,决不允许一词多义或一义多词; (2)目的是使讨论同一概念的文献不至于分散,保
④组配(Cooperation)
⑤语义关系(semantic relation):指主题词之间的内在联系。 主要包括等同关系、等级关系和相关关系
⑥动态性(Dynamic):指主题词表中的词的更新变化。
(2)主题词法(叙词法)
是直接以代表事物名称或概念的规范化的名词术语, 作为表达文献主题内容的标识符号,并依据这些标 识符号的语义和字顺,编排和组织文献检索工具的 一种方法。简言之就是利用主题词的原理建立检索 系统的一种方法。
二、主题标引(Subject Indexing)
1、中国生物医学文献标引系统 中国医学科学院、中国中医研究院联合设计 以 NLM MEDLARS及《汉语主题词表》为依托 标引依据:《MeSH》、《中医药学主题词表》 2、医学主题词表(Medical subject Headings, MeSH) NLM编制,21,000个主题词,83个副主题词(Subheadings) 严
Interleukin-13
白细胞介素7
Interleukin-15
白细胞介素8 白细胞介素9 白细胞介素10
Interleukin-16 Interleukin-17 Interleukin-18 Interleukin-2
叙词法的基本特征:
① 按文献所论述的事物(即主题)集中文献;
② 用人们日常使用的名词术语经过规范化后直接表 达文献所论述的事物;
③ 用参照系统等间接显示事物概念之间(即主题之 间)的关系;
④ 用字顺序列直接提供按事物名称检索文献的途径 (即主题检索途径)。
(3)主要主题词(Major MeSH Headings, Mjme) 对文献核心主题概念的标识。 某种实验研究的直接目的和结果; 临床疾病的预防、诊断、治疗等主要手段、 方法和创新; 一篇文献中占篇幅较多的内容等。
(信息检索)生物医学文献主题标引基础
②规范化(Normalize):指对自然语言的词形和词义进 行限制,使一个词只能表达一个概念,或一个概念只 能用一个词来表达,即词和概念是一一对应的关系。 通过词表来控制。
③优选处理(Priority):词表收词有限,不是所有的自然 语言词汇都可以作用主题词。通过词频统计确定。
病毒性心脏病+心肌炎 病毒性心肌炎
(B)主题词/副主题词 限定组配 锰/中毒 锌/缺乏
4、标引与检主题概念
转换
规范语
标引过程 检索过程
词表
检索 系统
课题
主题概念
主题分析
转换
检索提 问式
标引和检索关系图,即检索原理图
检索 结果
标引是手段 检索是目的 标引为检索服务
5、学习文献标引的意义:
Cardiovascular Diseases (树状结构表) Vascular Diseases Hypertension Hypertension, Malignant Hypertension, Pregnancy-Induced Hypertension, Renal Hypertension, Renovascular
(1)方便检索,提高检索效率,使查准率与 查全率保持合理的水平;
(2)了解标引知识,便于专业研究
如发表文章 标识“中图类号” 标识关键词(尽量使用规范化的主题词, 提高文章被检索出来的概率,从而提高被引 用率)
6.目前常用的几种文献分类法
(1) 《中国人民大学图书馆图书分类法》 (2) 《中国科学院图书馆图书分类法》 (3) 《中国图书馆分类法》 (4) 《杜威十进分类法》(DC) (5) 《美国国会图书馆图书分类法》(LC) (6) 《美国国立医学图书馆图书分类法》(NLMC)
注:主题词采用倒置形式的主要目的,是使同属某一概念的文献能按字顺相 对集中在一起;也方便在检索过程中选词。
免疫和生物因子 (树状结构表) Biological Factors
生物因子 生长物质
Intercellular Signaling Peptides and Proteins Cytokines Interleukins
白细胞介素类
Interleukin-1
白细胞介素1 白细胞介素2 白细胞介素3
Interleukin-1alpha Interleukin-1beta Interleukin-10 Interleukin-11
白细胞介素4 白细胞介素5 白细胞介素6
“扩展”的概念
Interleukin-12 Interleukin-12 Subunit p35 Interleukin-12 Subunit p40
3、主题词的基本形式:
(1)单个词:Brain、Electrocardiography
(2)词组:
直接形式:Blood Chemical Analysis, Lung Neoplasms
倒置形式:
Kidney Failure
(字顺表)
Kidney Failure, Acute
Kidney Failure, Chronic
在MEDLARS-MEDLINE系统中,用加权符号 “*”表示 如: *Aspirin / therapeutic use 注:主要主题词对应主题检索中的加权概念
(4)组配(Cooperation) 按一定规则,用两个或两个以上的主题词 (或主题词与副主题词)构成逻辑关系组合 来表达一个专指概念的方法。 形式: (A)主题词+主题词 交叉组配
证检索方便、准确和全面。 如:乙酰水杨酸 见 阿司匹林;
Kidney Cancer / Kidney Tumor / Kidney Carcinomor / Neoplasms, Kidney
see Kidney Neoplasms 动态性: 指词表的每年增删修订。主题词及副主题词随学科研
究的不断深化加以补充和新旧更替