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《Gaussian培训》课件

《Gaussian培训》课件

Gaussian软件的发展历程
• Gaussian软件的发展历程可以追溯到上世纪80年代,自1980年代中期以来,Gaussian软件不断推出新的版本,并逐渐实 现了从单一的量子化学计算软件到计算化学综合平台的转变。目前,Gaussian软件已经成为全球使用最广泛的计算化学软 件之一。
Gaussian软件的主要功能和应用领域
06
参考文献
参考文献
Gaussian 09, Revision A.01, Mopac 2012, and associated
tutorials and examples.
Gaussian 09, Revision A.01, Mopac 2012, and associated
tutorials and examples.
依据。
金属表面的结构和性质研究
要点一
总结词
Gaussian软件可用于金属表面结构的研究,预测表面 形貌、电子结构以及化学反应活性等性质。
要点二
详细描述
借助Gaussian软件,科研人员可以模拟金属表面的电 子云分布、能带结构以及化学反应活性等性质,为催 化剂设计、能源存储与转化等应用提供理论支持。
Gaussian培训
2023-11-12
目录
• Gaussian软件概述 • Gaussian计算方法介绍 • Gaussian软件操作流程 • Gaussian软件应用实例 • Gaussian软件的优缺点及未来发展 • 参考文献
01
Gaussian软件概述
Gaussian软件简介
• Gaussian软件是一款广泛应用于计算化学领域的软件,由美国 Gaussian公司开发。它提供了一系列的计算化学工具,包括分 子建模、量子化学计算、分子动力学模拟等,被广泛应用于药 物设计、材料科学、能源研究等领域。

GaussView高斯软件教程PPT课件

GaussView高斯软件教程PPT课件
第22页/共38页
将鼠标放在分子上,按左键左右或前后移动,可以调节分子的角度;将鼠标放在分 子上,前后移动,可以将分子放大或缩小。Shift+Alt+鼠标左键组合可以在窗口内平 移分子当工作窗口内有多个分子时[在构建大的分子时,这种情况很容易出现]这时可 用以下命令可以用Shift+Alt+鼠标左键组合移动想要移动的分子,以调节各个分子间 的距离。可以用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度,以调节各个分子 间的角度。Ctrl+Alt+鼠标左键这个组合常和[将鼠标左键放在分子上,左右或前后移 动,可以调节分子的角度]这个功能连用。具体的好处需要自己去试
第6页/共38页
Result :显示计算的结果,包括电荷,静电势表示的表面,振动,频率,核磁,势能面 扫描,优化等。注意有些结果只能 用检查点文件才能显示。
第7页/共38页
பைடு நூலகம்
常用功能键的介绍
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第9页/共38页
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View 这里面的选项都是于分子的显示有关的,如显示氢原子,显示键,显示 元素符号,显示坐标轴等
第5页/共38页
可从Gview中直接向高斯提交计算。这是Gview作为高斯软件配套功能的重要体现。 从所给的对话框中可以选择工作类型Job Type(如优化,能量或频率等);计算方法 Method(如半经验方法,HF方法,DFT方法,MP方法等,还可以选定组);Title(对所 要做的计算给一个说明,以备以后的查看) Link 0(给检查点文件命名,还可以在此用 RWF命令设置临时数据交换文件的大小); General,Guess,(这两个选项主要是给出体 系中各原子的连接关系及如何给出初始猜测);NBO(可在此设定NBO计算),PBC (可在此设定晶体的有关计算), Solvation(可在此设定溶液中的计算,除了选择溶剂 外,还要选择模拟溶剂的理论模型)

高斯软件入门PPT课件

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12
c.g98运行过程的控制:
不要随意点击!
最上行按钮的功能从左至右依次为: 开始运行g98;暂停进程;运行至下一模块(link)时暂停进程; 重新启动进程;清除进程(停止运算);编辑批作业;运行完 当前任务后,暂停批作业;停止批作业的运算;观看计算结 果;打开文本编辑器;
2021/7/24
13
(2). Linux平台:
2021/7/24
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说明:
1.根据不同的任务,某些模块需重复调用多次; 2.通常耗时较多的模块有:L5,L7,L8,L9,L10,L11等,此外,
L8~L11这些模块的执行对内存和硬盘的需求较大; 3.若L9999未能正常执行完毕,则表明计算过程存在问题,需
检查之;
4.可根据各个模块的功能,对g98程序进行简化,例如如果用 户通常只用g98进行能量计算,则可只保留L1~6和L9999模块 其它模块可以删除去。
直接运行setup.exe,其余步骤按提示操作即可;也可将其它机 器上将已安装好的G98直接拷贝到本机,但需设置运行环境。 对Linux平台: a.若G98是经过压缩过的(文件结尾为gz),用gunzip命令解压: 例如: gunzip g98.linux.tar.gz b.若G98是打包的(文件结尾为tar),用tar命令将其释放: 例如: tar xvf g98.linux.tar c.设置环境变量,以c shell为例,在用户根目录下的.cshrc文件 添加下列内容:(也可在执行g98前逐条运行) setenv g98root /home/test/src(设置g98所在目录,根据实际情况修改)
量子化学计算方法
章永凡 福州大学化学系
2003年3月
2021/7/24

高斯简介Introduction_to_GaussView

高斯简介Introduction_to_GaussView
查看计算结果【Results】
GaussView简介
GaussView 的窗口组成
GaussView简介
独立工具条视图
-----分子工具栏
-----计算工具栏
构 建 工 具 面 板
-----文件工具栏
-----坐标工具栏
-----视窗工具栏
----文件窗口工具栏
GaussView简介
GaussView 的窗口组成
每个文件一个 分子集合
所有文件做成 一个分子集合
用所有文件创 建一个分子
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File菜单:文件打开保存
【New】 新建分子模型,有两种创建形式: (1)创建新的分子集合; (2)在当前分子集合中添加新的分子。
打开已有模型和其他输出文件 快速打开最近打开过的文件; 快速打开与当前活动分子相关的文件
按住【Alt】+【Shift】键,用鼠标左键点击你要转动的 分子并按住,只有被点击的分子会跟随鼠标移动
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练习1
使用刚才讲述的键盘鼠标操作知识 将三个苯环摆到相互重叠的位置
GV_exercise_1.gjf
GV_exercise_1_OK.gjf
GaussView简介
调出独立的Builder面板
3. 分子集合中的每个分子从1开始连续编号,如果某个分子 被从分子集合中删除,分子将重新编号以保持其连续性。
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标题栏识别
Group 3 Molecule 2 View 1
GaussView简介
视图显示设置
GaussView简介
文件工具栏【File】
1. 从浏览器中拖入GV窗口 可以次选择多个文件用鼠标左键直接拖入GV窗口中,此 时默认是为每个文件创建一个分子集合窗口; 用鼠标右键拖入GV窗口,松开右键时可以选择打开模式

高斯简介Introduction_to_GaussView讲解

高斯简介Introduction_to_GaussView讲解
4. 如果有多个窗口打开同一分子,可能涉及不同 的观察视图。因此,可以按不同视图观察、显 示同一分子的不同取向和不同性质。
GaussView简介
标题栏的识别信息
每个视图上的标题栏也显示当前分子集合、分子 模型及模型视图的信息
1. 每一个分子集合用不同颜色加以区别,与某分子集合相关 的其他视图都将采用与分子集合相同的图标颜色,即用颜 色识别分子集合。
练习
GaussView简介
• 从头构建二茂铁分子,并 将分子对称化到D5d。推荐 步骤如下:
1. 搭建茂环(D5h C5H5)
2. 将搭建好的茂环append一份到窗 口中,然后将两个茂环放置为堆积 状态,调整环间距离约3.3埃
3. 旋转其中一个环,使两个茂环处于 交叉构象,并使用点群对称化。
4. 用在质心加入原子的方法加入铁原 子并对称化。
标题栏识别
Group 3 Molecule 2 View 1
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视图显示设置
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文件工具栏【File】
1. 从浏览器中拖入GV窗口 可以次选择多个文件用鼠标左键直接拖入GV窗口中,此 时默认是为每个文件创建一个分子集合窗口; 用鼠标右键拖入GV窗口,松开右键时可以选择打开模式
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计算工具栏【Calculate】
◆创建 Gaussian 作业
【Calculate】→【Gaussian Calculation Setup】
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【Job Type】选项卡
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【Method】选项卡
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【Title】选项卡
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《高斯软件的介绍》课件

《高斯软件的介绍》课件

通过这个课程,我们对 高斯软件有了更深入的 了解,希望大家能够在 实际应用中灵活运用这 一强大工具。
《高斯软件的介绍》PPT 课件
欢迎大家来到这个关于高斯软件的介绍课件。通过这个课件,我将详细介绍 高斯软件的背景、功能、应用和发展趋势。
高斯软件的背景和起源
背景
高斯软件是通过数学方法解决问题的工具,在科学和工程领域广泛应用。
起源
高斯软件最早由数学家高斯于18世纪末开发,经过多年演化和改进,现已成为重要的数学工 具。
2
高斯软件的使用环境与配置
运行高斯软件需要在计算机上配置适当的数学库和其他依赖项。
3
高斯软件的基本操作与功能介绍
学习高斯软件的基本操作,包括数据输入、运算符号和数据可视化等。
高斯软件的发展趋势
未来应用方向
高斯软件将继续在人工智能、 大数据分析和物联网等领域发 挥重要作用。
技术创新件的分类
高斯分布软件
用于分析和模拟符合高斯分布的随机变量, 广泛应用于统计学和金融领域。
高斯模型软件
用于建立数学模型,并进行数据拟合和曲线 拟合。
高斯消元法软件
用于解线性方程组,帮助工程学家解决复杂 的物理问题。
高斯过程软件
用于建立和分析随机过程,对生物科学领域 中的数据分析和模拟具有重要意义。
高斯软件的比较
1 与其他数学软件的对比
2 在不同领域中表现的优缺点比较
高斯软件相比其他数学软件,具有更高的 计算精度和更强的数据分析功能。
高斯软件在统计学领域具有强大的分析能 力,但在工程领域中可能不如一些专业工 程软件。
高斯软件的使用
1
高斯软件的下载和安装
从高斯官方网站下载软件安装程序,按照指示完成安装过程。

【培训课件】Gaussian软件的使用(频率分析+维里定理+计算模型+化学模型)46页PPT

【培训课件】Gaussian软件的使用(频率分析+维里定理+计算模型+化学模型)46页PPT

估计计算的内存需求
• M + 2NB2 其中NB是计算中使用的基函数数量,M是和工 作任务类型有关的最小值,如下表所示:
注:1MW=8MB
输出文件中的信息
• 标准几何坐标 • 能量 • 分子轨道和轨道能级 • 电荷分布 • 偶极矩和多极矩 (联系e2-01)
练习文件e2-01
# RHF/6-31G(d) Pop=Full Test
0.000
2.981
36.130
2.981
15.921
0.294
0.049
改变热力学参数
• 计算中可以设置温度和压力参数。 采用Freq=ReadIsotopes 关键词, 并在分子结构输入完毕后,输入参 数,包括温度,压力和同位素 temp pressure [scale] isotope for atom 1 ……… isotope for atom N
零点能(Zero Point Energy) 内能(Thermal Energy)
零点能是对分子的电子能量的矫正 ,计算了在0K温度下的分子振动 能量。
极化率和超极化率
• 频率分析还可以计算极化率和超极 化率,一般在输出文件的末尾出极 化率的输出是
Exact polarizability: 6.478 0.000 12.979 0.000 0.000 17.641
收敛标准
• 力的最大值必须小于0.00045 • 均方根小于0.0003 • 为下一步所做的取代计算为小于
0.0018 • 其均方根小于0.0012
几何优化的输入
• Opt 关键字描述了几何优化 #R RHF/6-31G(d) Opt Test
检查优化输出文件
• 在得到最优构型之后,在文件中寻 找 --Stationmay point found。

高斯的介绍和使用资料课件

高斯的介绍和使用资料课件
高斯的介绍和使 用资料课件
目录
• 高斯简介 • 高斯定理 • 高斯公式 • 高斯函数 • 高斯分布 • 高斯软件
01
CATALOGUE
高斯简介
高斯生平
01
02
03
04
1777年4月30日:高斯出生 于德国不伦瑞克市的一个农民
家庭。
1790年:高斯进入小学,展 现出数学天赋,自创算法解决
老师出的数列求和问题。
高斯在物理学领域也有所建树,他研 究了地球的磁场和电场,提出了地磁 学的理论。
高斯名言
01
“数学是科学的皇后,而数论是 数学的皇后。她充满魅力,引诱 着我们去征服她。”
02
“我总是尽我所能把每一件事做 到最好,若要问我为什么有如此 骄人的成绩,我只能说是上天给 予的恩赐。”
02
CATALOGUE
01
02
03
代数计算
高斯软件提供了丰富的代 数计算功能,包括方程求 解、矩阵运算、多项式运 算等。
几何计算
高斯软件支持二维和三维 几何计算,可以进行几何 图形的绘制、测量和计算 。
概率统计
高斯软件提供了概率统计 计算功能,可以进行数据 分析和统计检验等。
软件使用
安装与启动
用户可以下载高斯软件的 安装包,按照提示进行安 装和启动。
04
CATALOGUE
高斯函数
函数定义
总结词
高斯函数也称为正态分布函数,其函 数形式为f(x) = A * e^(-(x-μ)^2 / (2σ^2)),其中A是峰值,μ是均值, σ是标准差。
详细描述
高斯函数是一种连续概率分布函数, 其函数图像呈现钟形,具有对称性、 有界性、单峰性和方差恒定性的特点 。
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由一行文本组成,该内容是必需的。 (4)电荷及自旋多重度:
体系所带电荷以及自旋多重度S=2s+1=成单电子数+1 例如H2O,S=1;Ti原演子示课的件基态S=3
(5)分子构型描述部分: 有三种描述分子构型的方法:
a.直角坐标系方法:(适用于全自由度优化情况) 格式为:元素符号 x y z 例如:
内存,chk以及rwf文件名,其典型内容是: %mem=100mb(计算所需内存,若无,由Default.Rou指定) %chk=h2o(chk文件的名称为h2o.chk) %rwf=h2o(中间结果文件名称为h2o.rwf) (2)关键词部分:
该部分内容由一个或多个关键词组成,用于指定了计 算类型和计算输出的控制等。 (3)标题部分:
180deg之间,但二根键不能共线,即键角不能等于0和
±180deg。 3)二面角:(需用四个原子描述)
二面角加上键长和键角就确定了四个原子的位置,其默认 单位为deg,范围为-360~360deg,可以为±360deg。当二 面角等于0,±180和±360deg时四个原子共面。
键长、键角和二面角数目的总和=3N-6
个选项时,书写方式有如下几种:
电荷和电荷密度 •其它功能 偶极矩和超极矩
热力学参数
适用体系:气相和溶液
演示课件
2.程序结构:
演示课件
常用模块的功能:
•L0—初始化模块; •L1—读入输入,根据所给关键词确定将要使用的模块; •L101,102,…—与构型优化和反应过渡态相关的模块; •L202—输出距离矩阵、判断化合物点群及确定新的坐标系; •L301,302…309—与基组和赝势有关模块; •L310,…319—计算单及双电子积分模块; •L401,402—SCF初始猜测模块; •L502,503,508—SCF模块; •L601,608—Mulliken布居以及自然键轨道分析模块; •L701,702…—计算能量一阶和二阶导数模块; •L9999—进程结束模块;
演示课件
内坐标的输入格式为: 原子1,原子2,键长,原子3,键角,原子4,二面角
键角 2
二面角 4
3 1
键长
演示课件
c.直角坐标和内坐标混合输入方法: 对于该方法,只需在采用直角坐标方法输入的原子的元素 符号后加一个整数0即可,例如:
X 0 1.0 1.0 1.0 N 1 2.0 H 1 1.0 2 90.0 H 1 1.0 2 90.0 3 120.0 H 1 1.0 2 90.0 3 -120.0
演示课件
说明: 1.根据不同的任务,某些模块需重复调用多次; 2.通常耗时较多的模块有:L5,L7,L8,L9,L10,L11等,此外,
L8~L11这些模块的执行对内存和硬盘的需求较大; 3.若L9999未能正常执行完毕,则表明计算过程存在问题,需
检查之; 4.可根据各个模块的功能,对g98程序进行简化,例如如果用
d.分子构型的输入准确性是保证计算结果可靠性的前提,对
于复杂体系,在计算前均需对所输构型进行检查,具体包
括: 可视化处理,即采用一些分子构型软件观察所给构型是 否合理; 在g98运行到L2模块,会给出所输入分子所属点群,此 时,可检查点群是否合演示理课件。
(6) g98输入文件编辑时的注意事项: 除了可采用g98所提供的输入文件编辑器来编写
计算机在化学中的应用 课程作业
题 目:高斯软件的简介 指导老师:徐畅老师 姓 名:马乃宇 学 号:C13201045 专 业:高分子化学与物理专业
演示课件
Gaussian是一个量子化学软件包,它是目前 应用最广泛的计算化学软件之一,Gaussian 软件的出现降低了量子化学计算的门槛, 使得从头计算方法可以广泛使用,从而极 大地推动了其在方法学上的进展。
户通常只用g98进行能量计算,则可只保留L1~6和L9999模块 其它模块可以删除去。
演示课件
G98输入文件的编写与使用
1.G98输入文件的组成:
L0命令部分(可无) 关键词部分 标题部分 体系电荷和自旋多重度 分子构型
演示课件
(1) L0命令部分: 该部分内容均以%打头,主要用于指定计算过程所需
演示课件
G98的功能和程序结构
1. 主要功能: 基态(Ground state)
•分子构型的优化 激发态(Excited state)
反应过渡态(Transition state)
基态和激发态能量
•能量计算
化学键的键能 电子亲合能和电离能 化学反应途径和势能面
演示课件
•光谱计算
IR光谱 Raman光谱 电子光谱 NMR
输入文件外, 在更多场合下,是采用其他文本编辑器来编写,
此时应注意 到,在标题部分的前后各有一空行。
演示课件
2.g98主要功能的使用: g98功能的使用主要由用户所给的关键词(keyword)内容而定, 在输入关键词时注意以下事项:
1).关键词的输入是自由格式,且不区分大小写; 2个关键词有多个选项(option),若要选择单个或多
3)x,y,z数值必须以小数格式输入:
O -0.464 0.177 0 ()
O -0.464 0.177 0.() 4)g98的数据输入均为自由格式,即除了用空格来分隔
数据外,也可用逗号或混合使用;
演示课件
b.内坐标(z-matrix)方法:(适用于构型的局部优化) 内坐标与直角坐标之间的区别在于,它侧重于从原子之间的 键连角度来描述原子间的相对位置,具体参数包括: 1)键长:( 需用两个原子描述) 即两个原子间的距离,注:该两个原子并非要具有化学直 观意义上的成键。此外,在默认情况下,键长单位为埃。 2)键角:(需用三个原子描述) 确定了二根键之间的夹角,默认单位为度,范围为-180~
O -0.464 0.177 0.0
H -0.464 1.137 0.0
H 0.441 -0.143 0.0 说明:1)元素符号大小写均可,也可直接用原子序数;
2)有时为了便于区别,可在元素符号后加一整数,如:
O -0.464 0.177 0.0
H1 -0.464 1.137 0.0
H2 0.441 -0.143 0.0
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